2NM1A

Structure of bont/b in complex with its protein receptor
Total Genus 103
50100150200250300350400020406080100
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
436
structure length
430
Chain Sequence
SEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTEPP
50100150200250300350400400300200100
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin,hydrolase
source organism Clostridium botulinum
publication title Botulinum neurotoxin B recognizes its protein receptor with high affinity and specificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
total genus 103
structure length 430
sequence length 436
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2006-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2nm1A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2nm1A02
3AYEA 3FJFA 4GXLA 5FNWA 2DTYA 4XILA 1TFMB 1ONAA 1WBAA 1IJTA 3AZVA 2R1BA 1YI7A 3T1MA 3H0OA 1W3GA 2Z42A 1ISYA 1DZCA 3ZSJA 4FOVA 4LO7B 1V6JA 41BIA 4M00A 2Y9WC 2ZAAA 4LO8B 2X2SA 4FPKA 3QCWA 3H6RA 1F5FA 4YM1A 4XJ9A 1Z2VA 4Q91A 4YG3A 1IKQA 1IS6A 1DZQA 4NO4A 2D24A 4QKRA 5BP5A 1MC9A 2FO1A 4LBQA 4YW4A 3AJ5A 3ZXKA 1ONKB 2QYIB 4J23B 4X3AA 2LTNA 5GM0A 4ASMB 2FFUA 2TEPA 4YZ3A 4GAIA 1S1AA 1L2HA 1UMZA 2ZR1B 3RRDA 2ZQNA 1S0FA 3GALA 3UK9A 4GAFA 2Q5TA 3O4BA 1QU0A 1JT3A 3ATGA 3JUTA 3UDAA 5EXOA 1VAMA 4IHZA 1MVEA 3BA4A 5JOXA 2Q3NB 1S0DA 5EG6C 1ABRB 4LBNA 2HYKA 2L5XA 1AJOA 2WRYA 3TAYA 2PHUA 1SLCA 2A6WA 2AXMA 2M49A 1AVUA 3ZXLA 2W39A 5JVVA 4LBKA 3TB0A 2R0FA 4DS0A 4I1BA 1Z0HA 2ZBJA 4ZFWB 1QKQA 4PBOA 2ARXA 1DHKB 2EF6A 2PHTA 1WW7A 3BAQA 2BQPA 1W6QB 1W6NA 5IUQA 4ISRA 3FFZA 4M3CE 4ZKTB 3VT2A 1JOJA 3ZYPA 2GNTA 3IM7A 3M3EA 2ZGQA 2AFGA 3UJOA 4DQAA 4LO3A 1QXMA 3WO3A 2CY6A 4I8MA 2JJ6A 5H9QA 3WDUA 2DVBA 2CTVA 4Y1UA 3IAGC 2GMMA 2DUPA 1NZKA 4GP0A 4I30A 5T54A 1X50A 2ZHKA 4EEEB 5H9RA 3RMYA 1UPSA 1LU2A 2YROA 1DIWA 1GV9A 1V6MA 1RIRA 2BEAA 3AXDA 1WLCA 4XBQA 3CRIA 3BA7A 1MACA 5GZFA 4KEIA 4DENA 1K5UA 1N1YA 1V6VA 4HANA 2NP0A 2ZGKA 4MYEA 3JUUA 4DRVA 5DZUA 1C57A 5DUUA 3FJ9A 1V00A 4XXAA 5H9SA 4XIKA 5IT6A 1R8NA 3O4AA 3WCSA 1Q8VA 2IHOA 3NBEA 1SACA 4GWNA 4TLPA 5JOWA 3WDXA 2D7IA 1E0OA 3L2YA 1EYLA 5BXSA 2VUAA 4DRRA 1YF8B 2VW0A 2KKIA 2DU1A 3CA5A 3AJYA 2ERFA 1RZOB 4U2AA 3LCPA 2BFHA 4YG0A 4AN6A 3WG4A 2YXSA 3BAOA 1N4KA 1ULDA 3CRGA 1WLDA 4W65A 3BAVA 3SNMA 2R1DA 2AYHA 1GNZA 2VH9A 3FUQA 1MVQA 2QN4A 2E53A 1WW4A 2JECA 31BIA 1LOGA 1CE7B 2FDBM 1TTUA 3WMVA 1ULGA 4LO0A 4F34A 1YO8A 1JW6A 2F2FC 1BYHA 3NV3A 5D63A 2W68A 4I4VA 4WZFA 3ILNA 3VEQA 2OUJA 3BADA 3OYWB 2ZA9A 4Y20A 1BA7A 5GLWA 1ULEA 1HCDA 4Y22B 2EAKA 2UUSA 3RTJB 4FVVA 1DQ4A 3OPZA 2UWAA 3VKFC 4LBMA 3VSFA 1UX6A 3RG0A 1II4A 4XBLA 1NUNA 3I2AA 1D2SA 4FPEA 5L73A 1CONA 4C1WA 2BEBA 1LHOA 1JT4A 4ZFUB 1QQLA 2OVUA 4YFWA 4FPGA 1LOEA 2EIGA 3C9ZA 1S0BA 1MS5A 2D7RA 4IYBA 1KDMA 2NMNA 1T9FA 5SV8A 3CA0A 1ISWA 4JKQA 1MS1A 5GZCA 5E89A 4DPNA 1KQRA 2J3PA 4IZXA 4K1YA 2D3SA 4Y1XA 3FJBA 4JQ0A 3WDYA 3SH4A 3ZYRA 2WJSA 3N3HA 1YIFA 1DFCA 1W6PA 3OBRA 3M2MA 4Z8BA 4YZ5A 4I37A 5D61A 4QC4A 4M3CA 4F83A 4FQZA 3ENRA 4ITCA 1TIEA 4LO2A 4ATEA 3VT0A 1LENA 3AK0A 2D3PA 2DS0A 4D0TA 4ZA3B 4I1EA 2ZHLA 2OW4A 2D6PA 1BFGA 4WVWA 1PUMB 2ZGPA 1XG6A 3ZXFA 3CA3A 1SLAA 3WCRA 2ZGLA 1YBIA 2VW2A 1DGLA 3UJ4A 2D1ZA 4P6AA 3ZSMA 3IIRA 1AX2A 2AH2A 4XJWA 4XYXA 5E8AA 4YLZA 5IK4A 3IM5A 2ERMA 3POKA 4L4IA 4JP0A 2Z48A 3OGFA 1MS0A 4KBBA 3NV4A 1G7YA 4G6MA 4K21A 4M01A 1AVAC 5EC5A 3ILAA 5JMCA 1BZWA 5BXRA 4I4PA 5FZYA 4BQ1A 3B9UA 1HIBA 3RS6A 3OJMA 2A3YA 3SNVA 2ZQOA 3CAHA 4AVVA 4YM0A 4ZLBB 2K43A 4I4RA 4OWLA 3MW4A 4YG6A 1Q1UA 3RTIB 1AJKA 4J2SA 8I1BA 1QDOA 2ZMNA 3O5SA 1JN2P 3AFKA 4XJ8A 1JLYA 3O0VA 4Q8KA 1W3FA 1Z4SA 2KI4A 1W0OA 4EKXB 3ILRA 1XZZA 5IK5A 1N1TA 3FJHA 2Q9XA 4LBJA 1Q04A 2DV9A 4I4XA 2R9KB 1SLBA 1GZ9A 2RSTA 4JAWA 4AWDA 4PCRA 3POSA 3H6QA 3WNXA 1OQ1A 3AP7A 4RA0A 1QGLA 1UN1A 3N7MA 3PMEA 2ET2A 1CN1A 3FJ8A 4XE9A 1FV2A 1VAVA 1R8OA 3D5OA 3NWKA 4D69A 3H6RB 4YM2A 1LCLA 3R05A 2ZABA 2JE7A 4FGFA 2UURA 4LBOA 1C1FA 1IILA 1ENQA 4R6UB 1OFSA 2FFVA 1D0HA 3UJ0A 4ATFA 4LBQB 3A21A 3PHZA 2YMZA 5GZDA 2XOAA 2GNBA 2D44A 5GLVA 1HQLA 3BAUA 4I4YA 2P3IA 1JQZA 4EB2B 2A75A 3PJQA 3IMNA 3CNAA 3R4SA 1ISZA 4H9WA 2EXKA 5EYXA 1OQLB 3O3QA 1UKGA 2A6VA 3WG1A 4FOWA 1JLXA 4XHXA 4J2XA 4XJUA 2CL2A 4XHBA 3JU9A 4Y24A 4WVVA 2F8XC 1G8WA 3WV6A 1LOBA 1U0AA 4BPZA 4FPJA 2AR6A 2LALA 4ZBVB 4XXPA 3AZZA 2DRZA 4U36A 1RY7A 2JE9A 1IOAA 2ARBA 4RL7A 3WO2A 1ZA4A 5BQUC 4R9BA 5KXDA 1WLWA 1SZ6B 5F8WA 5HPZA 1TWEA 1IT0A 4JRAA 3NBDA 5T55A 1BQPA 3RSJA 3AH4A 4IZEA 5DG1A 4QALA 3NBCA 3B00A 3Q7WA 2NZ9A 1W6NB 4IQPA 3OGGA 1GSLA 3VSZA 3VV1A 1YTOA 1G9FA 1C1LA 5HCAA 2CWSA 3BRGC 3ZSLA 1R1ZA 4FOYA 2WNEA 3V0BA 1GLHA 3M3OA 3PUBA 4YGCA 4I6IA 4P9XA 3V79C 3LTQA 3A0NA 1PC8B 4G1RA 3A4UA 3WA1A 2DVGA 1RITA 5B2HA 3FLRA 4FPHA 1UZZA 3ZXJA 1CR7A 3HBWA 5D62A 1GNHA 1JT5A 3B69A 5DUXA 3V0AA 3SH5A 1TOOA 1HWPB 2ZGOA 2K4AB 2DU0A 4CJMA 2XB6C 3C2UA 2DWRA 3ZC8A 3WINC 3V65A 3S8JA 2G4IA 1DFQA 1LHUA 2R0HA 3B9CA 1SR4C 2WBCA 3AYCA 4YZ2A 1DQGA 3FJCA 2HW9A 3FJAA 3O5WB 1VALA 4P9YA 1XHBA 3EF2A 4FP2A 1FAYA 4KC3A 1GICA 2R49A 4Y26A 1I1BA 4CTEA 4ISQA 2A6XA 1ISVA 4FPYA 2PHRA 1KDKA 4OEFA 2D6MA 6I1BA 4NOTA 3VT1A 3A07A 2V73A 3O4CA 1HLCA 4Q26A 2E4MC 1W3AA 1ILR1 1BFCA 3T1LA 9ILBA 3AZWA 4X37A 1QMJA 5BXPA 5FNXA 2RQ9A 4XKIA 1MZ6A 4ENDA 2EXHA 4HA2A 1BARA 3AKHA 4Y1ZA 1SR4A 2WT0A 4QBCA 1LEDA 1KRIA 3A22A 2WLQA 5GAQA 4Q9GA 2GNDA 4YW5A 2NTDA 2NYYA 4YFZA 3OJ2A 4XMIA 3R4UA 1KITA 4YW1A 3FJDA 1AX1A 2PHFA 3Q9OA 1LOAA 1N3OA 1G9CA 3T8SA 5T5PA 1KJLA 5BYNA 4AGRA 2AAIB 2FHRA 5BOWA 3M3CA 4XBNA 3IM6A 4OEEA 1HWOB 4Y20B 4QKSA 1LHWA 4JC1A 1LULA 3ZXGA 2UWBA 2SLIA 3M3QA 1APNA 1F9KA 4FOQA 1MD6A 4HR6C 2LIEA 3ZXEA 2D3RA 3CRHA 2FGFA 3AP5A 1XQNA 5HCFA 1DLLA 1DBNA 3VKOA 2DVFA 3O44A 4J2YA 2ZGSA 4J2KA 3V64A 1ULCA 4BM8A 2DVAA 3AYDA 1LECA 4LBLA 1HCEA 4XFSA 4XMAA 3BB2A 2JKBA 1CIWA 3WDWA 5F8SA 1CVNA 1BXHA 2ESUA 1LU1A 3O12A 3O4OA 1BFFA 4AVSA 3TC2A 3FGMA 1W6MA 1MR5A 1QOTA 2UU8A 4GALA 3BIWE 2F2FA 4GKYA 3I8TA 5KXBA 5JOZA 2PELA 1W6PB 2MLLB 1QQKA 1Q03A 4M3CB 4Q27A 2JDZA 3F62B 4ZFYB 3INAA 4OUJA 3QR5A 2YUGA 1HQWA 1GZWA 5DVHA 1IKPA 4BLJA 5F90A 1LODA 3E8LC 1DQ0A 3WG2A 4I4SA 1SLTA 2VY0A 4EFPA 4C1XA 1FN0A 3HALA 3OY8A 1FV3A 1O4ZA 4XTMA 2P39A 1A3KA 3OJBA 3BRFA 1BJQA 3A23A 4L8QA 5JDBA 3AJ6A 4UW6A 4Z8SB 4LBQD 4PBPA 1CESA 4USPA 3AKGA 2D22A 4UW3A 4AVTA 2DVDA 1FNYA 4A7ZA 1EPWA 3FJKA 1J0SA 5T52A 3AP9A 4D0ZA 1PZ7A 1BKZA 1QF3A 3DGTA 4I3NA 3LSEA 4X38A 3W59A 1LOFC 1VCLA 1TWMA 4FQ4A 2JD4A 2V5YA 1Q56A 3FJEA 1JY0A 1PZ8A 5I1BA 3U4XA 3D4KA 4Y1YA 2YV8A 4XTPA 2P23A 4AGGA 4I4OA 1MS3A 2E7TA 3LLPA 1Z78A 3UD9A 4XJAA 2HZ9A 1YYNA 3N0KA 3RMXA 2NN8A 4FPLA 2ZHNA 4GOVA 4XFTA 3ZXDA 1SFYA 1ITBA 3NV2A 4LO1C 2P34A 3BTAA 4D8HA 3USUA 3O0WA 4YZ1A 5IK8A 1S0LA 2Y9XE 1DQ5A 3IPVA 4FPFA 2EXIA 3CA1A 2Y9GA 4JCKA 1JTCA 5JOYA 3AZYA 3AH2A 1G9DA 4I7IA 2I2SA 1P63A 2W08A 4HJJA 2K8RA 3OJVA 4TYSA 1YXWA 1HWNB 4Q1RA 4FPOB 2Z49A 5LK5A 1KJRA 5T5OA 1LGNA 2CWMA 4KEJA 3I4IA 5T5JA 3BA5A 1O4YA 2E6VA 4BLIA 1GANA 4Q1PA 4H55A 1Q8SA 3K1XA 2ES3A 2A3XA 2DYCA 3Q7XA 2ZACA 1MS9A 3QYDA 1MZ5A 2A71A 4QD2C 4GA9A 1W0PA 2WT2A 1CVSA 4OWKA 1LESA 2A6ZA 1FWVA 1WBCA 4DEPA 3SISA 4P14A 2GO2A 5BXTA 4Q9PA 2Y9FA 1I3HA 2KI6B 2ZMKA 3D7WB 3KQRA 3P6IA 3NV1A 4YM3A 3CU1B 2GDFA 5DUVA 5GJ6A 3VUOA 3N7JA 5DZEA 1W6OA 3FLTA 1LHVA 4FP3A 4BMBA 2YY1A 3WOGA 4USOA 4LO7C 3UL2A 3GNEA 2GNMA 3IKWA 3P6JA 1SLLA 2VXTI 2D6KA 2MC2A 3WO4A 2A5ZA 2OUHA 1SBDA 7I1BA 1UAIA 1GYKA 1OKQA 2XG3A 1LJ7A 4GP3A 5GLTA 3M1HA 2SBAA 1AVBA 4GOYA 3NBNA 5JLVA 4OZXA 3N36A 2ZKNA 2D6NA 4YGBA 4SLIA 1QOSA 5CB7A 1JYIA 1AXKA 3AJZA 3PVNA 5CNAA 1GZCA 4AN7B 4X39A 4XFUA 4YGEA 5DZGA 3UJQA 4PF5A 1DQ6A 1AXMA 3NJ5A 1PUUB 1DQ2A 3JRRA 3Q7YA 3KMVA 2HWMA 2AREA 3FBYA 2EALA 1WUVA 1F31A 2DURA 5HCBA 3O4DA 3V0BB 3W9TA 4A7YA 3IN9A 1GGPB 5EYYA 3RQ0A 4EFQA 2RG9B 4A7KA 4IONA 1PZ9A 1BASA 1WD4A 1SLIA 3FUOA 1JBCA 2D7FA 2P37A 1DYPA 4K1ZA 3V0AB 1FQ9A 5KXEA 2GN3A 4R9CA 4ZXKA 1G9AA 2NM1A 2MIBA 4LO3C 3KM5A 3T2TA 2DTWA 1FGAA 2E51A 3VKLA 3SITA 5BQUA 2LIQA 2AQZA 3B01A 3AKFA 4I4QA 1FNZA 1Y7BA 1AXZA 2ZZJA 3QLQA 1SBFA 2PHWA 4DFSA 2WSUA 5H9PA 3BAHA 5E24E 1URXA 1CQ9A 1Q8QA 4PC4A 3MEPA 3HN1A 2IWTB 5CA6A 1AF9A 3APBA 4Q2FA 1V6XA 1RG8A 1GBGA 3CQAA 5IK7A 4JPZA 2NMOA 1ULFA 3OBTA 5DG2A 1V6KA 1JYCA 2ZGRA 3ZSKA 3I29B 2EXJA 5F5QA 4AGVA 3WHTA 3WZ1A 1MS8A 3SH3A 5CBLA 4Z9WB 1WBLA 3F1RA 3MPPG 1UZYA 1G82A 5T5LA 3FJJA 3SLIA 4XDQA 2PHXA 4WBCA 5CAZA 1IS3A 3PVEA 3ZVXA 1XYFA 3BAGA 3POWA 3BRDA 5BVPI 1W6QA 2W52A 1HKNA 1LOCA 2RHPA 4Q8LA 3A0KA 1WCSA 5GZEA 2D43A 1G86A 5AVAA 3PVOA 2GMPA 4YW2A 1FWUA 2UWCA 1BLAA 4QO3A 1QNYA 2ENRA 1M16A 1S0JA 3WUCA 1V6IA 5T50A 4I4UA 1GKBA 3WINA 1N3QA 2VU9A 2ZGNA 4XJZA 1AX0A 5DSSB 3VWCA 1VLNA 2ZHMA 3AP4A 3WDVA 3UD8A 3B3QE 3D6EA 3BODA 3WG3A 1UL9A 1JHNA 3P53A 2KH2A 4IY8A 1NLSA 3CA4A 1S0CA 1A8DA 1FMZA 1BLDA 1V6LA 3DUIA 3IM0A 3BX1C 3AH1A 4LO0C 4H04A 4UW4A 2A7AA 1M2TB 2VXRA 1HKDA 5EWSA 1MS4A 5DXDA 2KLLA 2WSVA 1IRPA 2GMEA 2E4MA 4XIOA 1IHKA 2ZGMA 1I1EA 4K20A 1S0IA 5FRAA 2AUYA 3I2XA 4KEKA 5GZGA 1V6NA 1W6MB 1QDCA 1AVXB 3AX4A 1CPMA 3WUDA 1WBFA 3WHUA 2GN7A 2AGSA 4PQ9A 4OEGA 1LTEA 4HL0A 5DUYA 1CJPA 5DUWA 1G9BA 4YOLA 4G9MA 1IS5A 1H30A 4L4HA 2CYFA 4R9AA 3VKMA 1GZWB 1B09A 2I1BA 1J1TA 2YZ4A 2ZGTA 1WW6A 1EVTA 3ZPYA 2ZMLA 3WMUA 2DREA 1FX5A 1Q8PA 1N47A 1AVWB 3H6SE 2CNAA 2ZGUA 3OY8B 3WLUA 2DUOA 3HMYA 5E88A 2GZBA 4YGDA 1JUIA 4GWMA 2P3KA 1DZDA 2DUQA 4ZOTA 4UW5A 2A3WA 3ILFA 4P0JA 2H0BA 1QNWA 4EFRA 3OYWA 4CZSA 4BMEA 2KM2A 1S0EA 2P2KA 1WD3A 4Y22A 4LO2C 4IY9A 1DQOA 3HR9A 2VW1A 5FZUA 1K5VA 4I96A 4BOWA 3LSDA 1FATA 1V6OA 1DJSB 5EHAA 1DQ1A 3BOPA 3WVJA 5G00A 1LGBA 2R16A 3UD7A 3HSMA 1AFCA 1JT7A 3MALA 1WW5A 1Q8OA 5FZZA 2NVHA 1ENSA 3ZC9A 4I2SA 1PZZA 1AZDA 4YZ4A 1V6WA 1LGCA 2A70A 3N7LA 1ZM1A 4WV8A 4JKXB 1CPNA 4R9DA 4M3CF 3W58A 3AZXA 3AKIA 3MW3A 1AXYA 1LHNA 1IOBA 4I0YA 4YW3A 4P0KA 5GLUA 3USUB 4DCKC 1SCRA 1FYUA 3CA6A 2VSAA 3IPVB 2VSEA 4AYUA 1TP0A 1BFBA 5GALA 4G9NA 5F9TA 5DZFA 3ASIA 3PG0A 1N1VA 3N7KA 1IRAX 4XOGA 3WDTA 1TEIA 1N3PA 1KNMA 2A6YA 1VIWB 1RINA 1H9WA 3AYAA 3FLPA 2GALA 2AENA 1SCSA 1LOFA 1HWMB 4TZDA 5KXCA 1HDKA 1T4QA 3VKNA 2D20A 2D6LX 5FREA 1H9PA 4FPCA 1A78A 3N35A 2D6OX 1EV2A 3AXEA 2E7QA 2DRYA 2VLCA 4ZGRB 1C4RA 2WKKA 3MW2A 4QBVA 4OW4A 3AP6A 1JXNA 1PWAA 1N1SA 1ENRA 1S0GA 3HOMA 1FMMS 21BIA 1LEMA 4LO1A 3FJIA 1W6OB 2X2TA 1YRZA 2B7YA 4II0A 3POYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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