2VU9A

Crystal structure of botulinum neurotoxin serotype a binding domain in complex with gt1b
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
425
structure length
425
Chain Sequence
HMDTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of Botulinum Neurotoxin Type a in Complex with the Cell Surface Co-Receptor Gt1B- Insight Into the Toxin-Neuron Interaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN A HEAVY CHAIN
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
total genus 119
structure length 425
sequence length 425
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2008-05-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2vu9A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2vu9A02
4G9NA 3MW4A 4ZOTA 4I2SA 5BP5A 1XG6A 3H6RA 1TP0A 3AH4A 3UJ0A 1AVUA 1S0LA 3JU9A 1UL9A 4YG3A 1IS5A 4ZLBB 4AN7B 3OPZA 1GANA 2Q9XA 5GLTA 4M00A 4Y1ZA 5BQUA 4AVTA 1LTEA 3ZXLA 4YM2A 2EXJA 5AVAA 3HALA 2DREA 4OEGA 2FMDA 2GMMA 1YYNA 3SH3A 3AYEA 4PF5A 4UW4A 1S0CA 5CA6A 1NZKA 1AVWB 3I2XA 3FJBA 2KH2A 1HKNA 1IT0A 1HCEA 1LOBA 2ZBJA 1VAVA 4GAIA 3T2TA 3FFZA 2GNMA 4JAWA 4YG0A 1YBIA 3RMXA 1DZQA 4A7KA 2D6LX 3UJOA 5DVHA 1Q8PA 2YMZA 1LHWA 2A71A 1SFYA 3O0XA 4DRRA 1UZZA 2A6XA 1I3HA 3WG4A 3O0WA 2AQZA 4DQAA 2YV8A 3O5WB 3AP4A 4FQ4A 1HDKA 2BEAA 1T4QA 3IIRA 4AN6A 2D6NA 2Q3NB 4YM1A 4I7IA 2ZKNA 1S0BA 1LCLA 4KEIA 3AJ5A 2AENA 3WUDA 3S8JA 1SBFA 2KI4A 3FJEA 1N1YA 4HJJA 3W58A 3RG0A 2ZZJA 4WVWA 4JKQA 2DVAA 1DQ0A 3BODA 2FDBM 1ENRA 3POKA 3NV3A 4QBVA 4P9YA 1WLCA 6I1BA 2F2FC 2P3KA 1UAIA 4UW3A 4ZGRB 3NBDA 1KJRA 3NBEA 2K4AB 5D61A 3ATGA 1RZOB 2ZGOA 1LESA 4P0KA 5BOWA 1HWMB 1JT5A 3QYDA 3IMNA 1A8DA 3BTAA 1N47A 1MS0A 3AZYA 1AZDA 3LCPA 4XHXA 2WNEA 3VKMA 1N3PA 2R49A 1DQGA 1G82A 1H9PA 2GNTA 4EFQA 5BXRA 2D1ZA 4FPKA 1H30A 2A5ZA 5DG1A 1CQ9A 1MACA 1V6LA 2WLQA 5LK5A 3BRFA 2ZMKA 1FATA 2A75A 5DXDA 4YZ3A 3HSMA 4WBCA 4XOGA 2GO2A 4GALA 3H6SE 1GV9A 1FNZA 4HR6C 5E89A 4I4VA 1YTOA 1JTCA 3FJIA 2VUAA 4QC4A 1GSLA 2QYIB 4I1BA 4XFSA 1DFCA 1IRPA 3IPVB 3CAHA 2D6KA 1J1TA 2W39A 3V0AA 4XMAA 2E4MA 4H04A 2XB6C 4GP0A 1JN2P 1BA7A 3F1RA 1R8NA 2X2TA 5T54A 1GBGA 3POYA 5HCBA 4BM8A 3QLQA 2VSAA 2UWAA 4Q8KA 5CBLA 2HYKA 1KDKA 1ONAA 3ASIA 1EV2A 2KM2A 2VY0A 4FPGA 3UD7A 2DUPA 4LBQB 3BAUA 4JKXB 2Z49A 4DFSA 3IM6A 1YXWA 3RMYA 1JOJA 5T5LA 4GA9A 1GZCA 1BKZA 3HR9A 2D22A 3PVNA 4YW2A 3WDUA 2HWAA 1Q03A 3B3QE 2KKIA 5BYNA 5F9TA 3ILAA 3IM7A 3D5OA 1V6OA 5GLZA 2NMNA 2VU9A 3AKFA 31BIA 1QGLA 3BOPA 3AZXA 5DUUA 1AJKA 3USUB 1Z0HA 5GZGA 1CR7A 3I8TA 1TEIA 1ZA4A 4JC1A 4BQ1A 1IS4A 2AH2A 4CJMA 2UWCA 4QKSA 3RTIB 2FHRA 4FPEA 2A3WA 5IT6A 2WQZC 2GZBA 3OBRA 4USPA 1LU1A 2W08A 4DENA 2X2SA 4L8QA 2JE7A 3B69A 3A07A 1S0GA 4Y22B 1SBDA 3OYWA 2K43A 3AK0A 4AYUA 1HWOB 1K5UA 1GICA 2FGFA 1HCDA 5T55A 2RG9B 3VSZA 3N7LA 4LO2A 3INAA 3WA1A 2XOAA 1J0SA 1JBCA 1SZ6B 4IQPA 4H9WA 2YZ4A 4JP0A 3CA1A 2MLLB 4GOYA 5HCAA 3I29B 1QMJA 1HKDA 4M3CB 4I3NA 1QQLA 1LULA 3A21A 4R9BA 1CVNA 1DQ2A 3OY8A 1LOFA 1XZZA 1LEDA 4II0A 1BYHA 3AP9A 3L2YA 1WW6A 1GNZA 1DQ1A 2AAIB 3WINA 2C5DA 3FJFA 4Z9WB 4D0ZA 4YW3A 5IK5A 2PHWA 1CVSA 2D7FA 2A6ZA 1WW7A 4XJZA 3T8SA 3O4DA 3UDAA 3CRGA 3BAOA 2FO1A 2IHOA 1LHUA 2CYFA 1Z2VA 4XBNA 4XBLA 5CAZA 5BVPI 2ZGPA 3ZXKA 1W6NB 4RL7A 4OEFA 4GKXA 3AYDA 3D7WB 1KRIA 1UPSA 2WT2A 1ABRB 3VKFC 3HN1A 2VLCA 3H6RB 4EFPA 4LBNA 1VALA 3WG2A 1JW6A 2L5XA 4LO8B 4DRVA 2ARBA 1MZ5A 1YI7A 1UZYA 2VXRA 1JLXA 4H55A 5GAQA 2K8RA 5GZCA 3VWCA 4KEJA 5GJ6A 3VV1A 1G9FA 1PWAA 3AXDA 4LO0C 3IAGC 2D7RA 1TWMA 2PHUA 3AJZA 4M01A 5FNXA 3FJAA 3KQRA 3UL2A 1BZWA 2DVGA 1G8WA 1AVXB 2P23A 4I4RA 1YF8B 3ZYPA 3FJDA 4YGEA 1BFCA 2EF6A 3CA0A 1AXZA 2P3JA 3E8LC 1VIWB 5D63A 3T1LA 4G6JA 2UUSA 2R1DA 2P2KA 4P0LA 5DZFA 4XTPA 5E8AA 2TEPA 4YW5A 4IHZA 2UURA 3PJQA 2ZGNA 3WDWA 1Q04A 5BQUC 1C57A 2DU1A 4EEEB 4EB2B 3K1XA 5GM0A 1CONA 5KXEA 3TAYA 3FJ8A 2D3RA 2ZACA 2ZGTA 4LBJA 4J23B 4UW5A 4IZXA 1LHNA 4ZFUB 2AFGA 2OW4A 2UU8A 1S0FA 1UKGA 3M1HA 1V6UA 4YZ1A 3WDTA 1IHKA 3LLPA 5FREA 4FPYA 3OBTA 1DHKB 4FP3A 3LSDA 2VW0A 3WG1A 1PZ8A 5IK8A 1RY7A 2GDFA 3P6IA 1LHVA 1BFFA 1QOOA 3SH4A 4C1XA 1Z78A 4OEEA 3CU1B 2GNDA 3HOMA 2E53A 3BB2A 3WDXA 2DTYA 1JT3A 3ZSJA 4QD2B 4ZFYB 1IKQA 2DVFA 1ULFA 1VAMA 4LO3A 2QN4A 2RSTA 5FZZA 2DTWA 4XFUA 2ZHNA 1WUVA 1BASA 4TYSA 4I4YA 3FJ9A 3PMEA 4GXLA 2EXKA 2WSVA 2WBCA 4Y1XA 2ERFA 4JQ0A 4I30A 4RA0A 4P0JA 5DUXA 2JECA 2D6MA 7I1BA 1BARA 5GLVA 2A70A 2BFHA 3WDVA 1WW5A 1FAYA 1Q8SA 4ASMB 1AVAC 4LO7C 1EYLA 1ISXA 3NV4A 4XKIA 3BX1C 4TZDA 4XHBA 4F83A 2D3PA 3O4AA 1V6JA 3M3QA 1WBCA 3ZXDA 1LU2A 2JD4A 1W6PA 3V0AB 2ZGMA 1I1BA 1DYPA 4QKRA 1MZ6A 1IJTA 2AYHA 1QQKA 5EHAA 3LTQA 2A7AA 2D20A 1SR4A 4QD2C 3Q9OA 3ILRA 2LALA 1TIEA 4PCRA 1G9BA 4GOVA 1WLWA 4M3CF 2GMEA 4YM3A 5GZDA 3ZXGA 2DYCA 1NXD1 5GALA 4R6UB 5GZEA 4Z8SB 2NP0A 3GALA 3A0NA 2ARXA 1SBEA 4I96A 1JXNA 2R9KB 3D4KA 2ESUA 1GKBA 1PZ9A 3AFKA 3O5SA 3AKGA 3AXEA 4FPCA 4IYBA 4BLIA 1OQLB 1BFBA 1W6MA 3JUTA 1KDMA 4BPZA 1G7YA 3TB0A 4KEKA 4A7YA 1TOOA 5F8YA 2FFUA 3N3HA 4ZKTB 5BXTA 1MVEA 1GZ9A 5GLUA 2LIEA 1QKQA 3VT0A 1P63A 3ZXEA 4I6IA 3MW2A 5BXSA 3BRDA 1B09A 4ZXKA 1V6WA 41BIA 4FPFA 1QDOA 3OYWB 5F5QA 3N0KA 2ZABA 4AGGA 4LO1A 1BLAA 1PUUB 2I1BA 3ZXFA 2P37A 2YUGA 3FUQA 4DEPA 3SISA 2JDZA 4FPHA 1SLLA 1QU0A 4LBQD 3WLUA 1AXMA 4WVVA 3RQ0A 4C1WA 3CA4A 3O3QA 5H9PA 1KJLA 1Y7BA 3M2MA 9ILBA 5T52A 2B7YA 1PZZA 4YM0A 1RMLA 2RQ9A 1MR5A 1DFQA 2Q5TA 1GLHA 3WCSA 5GLWA 3WNXA 3OY8B 2ZGRA 1WBFA 3BA5A 4IONA 4ATEA 2SLIA 5E88A 3CRIA 2GALA 1AF9A 3QCWA 5T5OA 3APBA 2FFVA 2GNBA 2ZQOA 5GZFA 3I2AA 4I4PA 3FUOA 1BLDA 1MC9A 2CWSA 2OUHA 4IY9A 3C2UA 2I2SA 2NMOA 1ULEA 2D23A 3BAHA 4BMBA 3FLTA 3ENRA 1ULGA 3FLPA 1HQWA 4FP2A 2KI6B 4HANA 3AYCA 1G86A 2H0BA 4Y1YA 4W65A 1AVBA 2WJSA 4OWKA 2LIQA 1AXKA 4BOWA 5T5JA 3ZSKA 1WLDA 4Y1VA 1XYFA 5F8SA 3UK9A 1BJQA 3WMVA 4OZXA 1WD3A 2JE9A 1LOFC 2NZ9A 5DZGA 5JOWA 1E0OA 1M16A 3W59A 1DQ5A 1CE7B 4K1YA 4QALA 1F5FA 3VKNA 2WT1A 1Z4SA 1WBAA 1MS9A 1QOSA 4Q27A 1CPMA 2PHTA 3AH2A 2A6YA 4WZFA 1HIBA 4F34A 1N1VA 2EXIA 1II4A 4R9AA 1ULCA 3IM0A 3OJMA 2NN8A 4AGVA 1ISZA 3WMUA 1DYKA 1ENSA 3QR5A 2DURA 3AJYA 3PG0A 1V00A 1LOEA 1DLLA 3V65A 4D0TA 1S0IA 2E6VA 4YFWA 1DQ4A 3AYAA 3I4IA 1AX1A 4I4OA 3MPPG 5EG6C 1MS4A 2ZMNA 1S0EA 2ERMA 3AX4A 1AJOA 2E51A 2D6PA 3MEPA 4GP3A 4XJWA 1JHNA 1IOAA 3BA7A 3OGFA 4R9DA 1IS3A 3BA4A 3Q7WA 3UD9A 1WD4A 2EIGA 4FPOB 3WG3A 5EYYA 5SV8A 1TWEA 1ISYA 5FZUA 3VKLA 2VSEA 4Q26A 4X3AA 4YZ2A 1X50A 1W6QA 1DZCA 3KMVA 3WVJA 1O4ZA 2D24A 3O12A 1ISVA 3JUUA 4XJAA 3PVOA 3FJCA 2XG3A 1DIWA 1D0HA 2DWRA 3N7KA 3WZ1A 3BAQA 2OVUA 3CNAA 4AVVA 4OW4A 5JLVA 1FMMS 3OJ2A 4GWMA 2V73A 4Q91A 2V5YA 2D44A 4FOQA 3O44A 3UJ4A 1PC8B 4LBLA 4YGBA 4PC4A 4Y20A 3BAVA 3BIWE 1Q8OA 3VSFA 2OUJA 1HWNB 5G00A 5EYXA 2DVBA 1M2TB 3AKIA 1SLIA 5KXBA 1PUMB 1DQOA 4IZEA 4P14A 3OGGA 4KBBA 4A7ZA 4QO3A 2A6VA 1EVTA 1D2SA 1RG8A 4YGDA 1LEMA 4U36A 2JJ6A 1SLTA 3CA5A 1NLSA 1HLCA 1UX6A 3A0KA 1JY0A 2ZGKA 2A3XA 1QOTA 5JOZA 1ILR1 5JOXA 3ZXJA 1W6PB 5BP5C 3AP5A 4I4UA 2CY6A 3PVEA 1GZWA 1QNWA 3O0VA 3A23A 4K21A 1S0DA 4BMEA 2D43A 3AP7A 4YGCA 2AGSA 2NVHA 1PZ7A 4G6MA 4Q9PA 4Y26A 1S0JA 1YO8A 1IS6A 1F31A 1YIFA 1MS8A 1F9KA 4FPLA 4AVSA 2M49A 3RRDA 2BQPA 1O4YA 4LO0A 2WT0A 2NTDA 3POSA 3NJ5A 2JKBA 2J3PA 4G9MA 3NBNA 4Q2FA 3VT2A 1CESA 3V0BA 2MIBA 1V6VA 4X37A 2PHRA 1LHOA 3OJVA 1SLAA 3W9TA 4XIKA 5I1BA 1W6MB 3SITA 1DGLA 2W52A 2MC2A 4J2KA 3PHZA 3ZYRA 4YFZA 2BEBA 3SNMA 1EPWA 4WV8A 5JVVA 1AXYA 4PQ9A 5KXDA 4XIOA 1KNMA 4QBCA 1SR4C 4JCKA 1KQRA 4NO4A 3UJQA 4XMIA 3VKOA 1NUNA 2HW9A 3NBCA 4XFTA 1W6OA 1LOAA 1BFGA 2UWBA 3TC2A 4SLIA 5T5PA 4EFRA 4Z8BA 3FJHA 4P9XA 1JT4A 1U0AA 4ISQA 1T9FA 4OWLA 5DZUA 5EXOA 3B9UA 1H9WA 1XQNA 3FJKA 3N35A 1V6IA 3WO4A 3A22A 1RINA 1BQPA 1C4RA 1VCLA 4JRAA 5IK4A 3OJBA 4DCKC 1SACA 4YW1A 3R05A 2YY1A 1A78A 1LENA 1W3FA 2IWTB 1WBLA 4XZPA 4Q9GA 5E24E 1DZDA 4G1RA 2VW1A 1V6MA 1R8OA 3SNVA 1G9AA 1LGBA 5DUYA 2PELA 2YROA 2AUYA 8I1BA 4FQZA 3POWA 2DVDA 1JUIA 2ET2A 1CJPA 5DZEA 4U2AA 1ITBA 3NWKA 2KLLA 3BRGC 5H9QA 1R1ZA 3RTJB 4YW4A 1LJ7A 3F62B 3O4CA 4LO1C 2ZAAA 1QXMA 3M3EA 1FN0A 3DGTA 3U4XA 1DJSB 4AGRA 3FBYA 2AR6A 1FMZA 1HQLA 1RIRA 4I4XA 5H9SA 3VEQA 4D69A 4USOA 1MD6A 3BAGA 1CN1A 2ZR1B 4AWDA 1SLCA 2E4MC 4J2SA 5IUQA 3ILNA 4GAFA 5F90A 4CTEA 3O49A 5T50A 4NOTA 4XBQA 1V6NA 2ZHKA 2P39A 3WHTA 2ZGSA 5KXCA 5F8WA 3EF2A 2WKKA 1DQ6A 1MS3A 3WHUA 2DRYA 2P34A 3LSEA 1Q1UA 1MVQA 1S1AA 2DUQA 3AKHA 1W3GA 2ES3A 2CWMA 3S8KA 4ENDA 4FGFA 1FWUA 3N36A 3CA3A 4EKXB 3T1MA 5L73A 4Y1UA 3B01A 4ATFA 3AJ6A 2F2FA 3FLRA 4L4HA 1C1LA 1FV3A 2WSUA 4YZ5A 5DUVA 3JRRA 1V6XA 2Y9GA 2CNAA 1GGPB 3MW3A 3ZX7A 1JYCA 4XILA 5BXPA 2RHPA 1W0PA 3D6EA 3ILFA 1G9CA 4XXAA 1APNA 2VW2A 2LTNA 3AH1A 1Q8VA 1DBNA 2NYYA 3Q7XA 3BADA 3M3CA 1OQ1A 4X39A 2DU0A 2Z48A 2Y9WC 1JQZA 4PBPA 1W6QB 1LOCA 3UD8A 1TTUA 4X38A 1RITA 4GKYA 2E7QA 4XE9A 2PHFA 4I4SA 4J2XA 1FV2A 1W0OA 4ISRA 1FX5A 2R16A 3P53A 4K1ZA 2Y9XE 3B9CA 4LO2C 2G4IA 1FWVA 2AREA 4FPJA 1VLNA 2P3IA 1FGAA 3WOGA 4LBMA 4FVVA 1URXA 5HCFA 3WUCA 4XTMA 21BIA 2WRYA 1A3KA 2W68A 3ZSLA 1Q8QA 4J2YA 2DRZA 1FYUA 2HWMA 5D62A 3FGMA 3DUIA 4Y20B 2ZA9A 4IY8A 2EALA 1LGCA 3AZVA 3R4SA 1G9DA 3AZZA 2A3YA 3WINC 1OFSA 4ZFWB 3NV2A 3IN9A 4XYXA 2NM1A 4D8HA 4HL0A 4P9WA 1N3OA 2VH9A 3H6QA 5FNWA 5H9RA 3P6JA 4I8MA 1ULDA 1XHBA 4UW6A 3IM5A 5DUWA 5FZYA 1N3QA 4YOLA 2Z42A 4YLZA 5DSSB 1UN1A 4I0YA 3SH5A 2EAKA 3RS6A 4BLJA 2ZGLA 3M3OA 1QDCA 2CL2A 3IKWA 4CZSA 1N1TA 4Q8LA 3ZC8A 3V79C 2SBAA 2DV9A 1SCRA 3VT1A 1SCSA 4OUJA 1QF3A 2PHXA 3IPVA 4LBKA 5JDBA 1GZWB 1ZM1A 4GWNA 2D6OX 4YZ4A 3ZSMA 3VUOA 1HWPB 2R0HA 1W3AA 2DUOA 3ZC9A 3RSJA 4XJ9A 3MALA 1MS1A 2YXSA 4KC3A 3HBWA 3N7MA 2ENRA 1IKPA 4XJ8A 4FOYA 4L4IA 4XXPA 1GNHA 3ZVXA 1BXHA 5HPZA 1N1SA 4JPZA 1ONKB 3GNEA 4TLPA 1JYIA 3HMYA 3Q7YA 1LODA 1K5VA 2R1BA 3WCRA 2E7TA 2ZGQA 3V0BB 3NV1A 4K20A 4LBQA 4HA2A 4OWJA 4MYEA 4DS0A 2VXTI 3CRHA 1QNYA 4ZA3B 1KITA 5CB7A 4R9CA 3AP6A 1OKQA 2DS0A 4Y24A 1SLBA 1AX2A 4LBOA 3PUBA 1IOBA 1AX0A 2CTVA 3H0OA 5IK7A 4I37A 4DPNA 1GYKA 3USUA 1CIWA 4XDQA 4Q1RA 3CQAA 1L2HA 2A6WA 3AZWA 3A4UA 2EXHA 1TFMB 2D7IA 1IRAX 1LGNA 5FRAA 1W6OB 4FOWA 5JMCA 1C1FA 1UMZA 4Y22A 1MS5A 1I1EA 1JLYA 3SLIA 4M3CE 2ZMLA 3WO3A 4I4QA 1JT7A 2D3SA 3FJJA 1ISWA 1YRZA 4CRQA 2ZHLA 5DG2A 3KM5A 1Q56A 5CNAA 4YG6A 3O4BA 2ZHMA 4ITCA 2F8XC 2GMPA 3R4UA 2ZGUA 1WW4A 3ZPYA 4LO3C 4M3CA 5EWSA 2ZQNA 4ZBVB 2GN3A 5JOYA 5EC5A 3CA6A 2C9AA 1CPNA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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