2VUAA

Crystal structure of the botulinum neurotoxin serotype a binding domain
Total Genus 115
50100150200250300350400020406080100120
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
425
structure length
423
Chain Sequence
HMDTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPLQ
50100150200250300350400400300200100
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
publication title Crystal Structure of Botulinum Neurotoxin Type a in Complex with the Cell Surface Co-Receptor Gt1B- Insight Into the Toxin-Neuron Interaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN A HEAVY CHAIN
total genus 115
structure length 423
sequence length 425
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2008-05-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2vuaA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2vuaA02
4QALA 5FNWA 2AR6A 3WG4A 5F8YA 4II0A 1QOTA 3M3EA 2WT2A 1ULDA 1ULGA 5BXPA 3CNAA 1JTCA 3I29B 4X3AA 3E8LC 2Y9GA 2Q5TA 4M01A 4XFUA 1Z2VA 4G9NA 4FPKA 2JKBA 3N7MA 1CPNA 1FYUA 5CAZA 1W6NB 3Q9OA 5GZFA 4K20A 1AVUA 3WDWA 3AKIA 3SNMA 4GWMA 3GNEA 4OZXA 3N7KA 4FPHA 3IM5A 1YXWA 4GP0A 1M16A 2AXMA 3P53A 3BX1C 1BXHA 2G4IA 3IMNA 4R9DA 1V6OA 1YTOA 4GWNA 2A6YA 3D6EA 4FPEA 1FNYA 3B69A 2DUPA 2XG3A 2VW2A 4H9WA 3AX4A 1MS5A 3UD8A 3BAUA 3WDTA 3V0BB 1LOFA 5JLVA 2YROA 5T54A 2C5DA 1FN0A 3ZXDA 4XJZA 3WO4A 3ZPYA 1BJQA 2PHUA 1LHUA 1YIFA 1GNHA 3APBA 3M3CA 4FOYA 4OW4A 1QKQA 1HKNA 2DVDA 3MALA 3AP9A 1EPWA 5T5LA 2I2SA 3VT2A 1LOFC 3AP4A 2Z49A 1S0FA 3AZZA 3F62B 3IM7A 1LESA 2HZ9A 5GLTA 5EG6C 5E89A 2K4AB 1ULEA 4XHXA 4H55A 1Q56A 3VEQA 1AVXB 4QO3A 3H6RA 1C57A 2ES3A 3QCWA 5T52A 3BA7A 3RTJB 5FRAA 3BA5A 4Y1UA 1EYLA 2WKKA 1FX5A 2V73A 1UPSA 1WLCA 1T4QA 1VLNA 1DLLA 1XQNA 1IRPA 2ZGRA 3VKNA 1QU0A 1HWOB 2CWMA 4BMBA 3VWCA 1GV9A 3A4UA 1QDOA 2VY0A 3OJVA 1YO8A 3RMXA 2NMOA 1NLSA 1LHVA 1CESA 6I1BA 1V6VA 3POYA 2GN7A 3AP7A 4LO7C 1JQZA 5F5QA 4XBNA 4J2XA 4PBOA 3NBNA 3FJBA 3NV2A 3ZC8A 4JQ0A 5FZUA 1L2HA 5DZUA 5FNXA 4I2SA 41BIA 1JLYA 1S0JA 3CA1A 3AYEA 1QNYA 4AVTA 1TOOA 4I1EA 1NZKA 3N7JA 2JE7A 3SITA 4CZSA 4QBVA 1Q1UA 31BIA 4YZ1A 4G6JA 4C1WA 1J1TA 4ASMB 5GZGA 3PJQA 5IK5A 2VLCA 2NM1A 1IOBA 2ZGNA 4FPOB 3R4SA 1S0BA 4SLIA 2Y9FA 3I8TA 3RMYA 1QMJA 2LIQA 2ZGSA 1A78A 4M3CE 4FOQA 4Y26A 1DJSB 5DUVA 1JT5A 3C9ZA 1UZYA 2R9KB 1S0EA 3O4OA 2ZHLA 3OJMA 2HWAA 3VSZA 1E0OA 3O4BA 1TIEA 3KMVA 1N1SA 4Z8SB 4XJ8A 4ZGRB 1ISXA 5FREA 1GZWB 1V6WA 5DUYA 4I96A 1Q8SA 2IWTB 1KJRA 4OEFA 3O49A 4AVVA 1VAMA 2VH9A 1PUMB 2JD4A 2BEBA 1G8WA 2ZA9A 1KRIA 2GALA 1MS4A 3PVOA 3LSDA 3PUBA 1SLTA 2PELA 1DIWA 3IPVB 2D7RA 1UKGA 1NXD1 3VUOA 4P6AA 1AXZA 4XTMA 4RA0A 1LOAA 3USUB 5BVPI 4I3NA 3B3QE 4ZA3B 1TWMA 1LODA 1GNZA 1FWUA 3MW2A 1BZWA 3BRFA 1QQLA 1JLXA 3B9UA 1HCEA 4RL7A 4GAIA 3BTAA 1MZ6A 4LBMA 2DWRA 3NV3A 3ZVXA 3JUUA 4WBCA 4K21A 2EF6A 2ARXA 4FGFA 3A23A 1IS4A 1LOEA 3ZXJA 2VW1A 1IS3A 1AVAC 2VXRA 3BOPA 3AH1A 2KI6B 2D23A 8I1BA 1MZ5A 2ZKNA 1S0LA 4JCKA 1BFGA 4G9MA 2A3XA 3OY8A 3O12A 1G9BA 2RQ9A 4Y22A 5T5PA 21BIA 1VALA 4AGRA 1RINA 5D62A 2GNMA 3LTQA 1V00A 2ET2A 2VUAA 2P23A 1URXA 4WV8A 2LALA 3RS6A 1IS6A 2EALA 3FJ8A 1G7YA 4ISRA 1CN1A 4YGBA 1WW7A 1GZCA 2WSUA 1KITA 4XXPA 1JT4A 2ARBA 4XIKA 2EXIA 2AUYA 4OEEA 3H6QA 4R9AA 1DZQA 4XYXA 4U36A 3BIWE 1AJOA 5H9RA 3MW3A 1H9PA 1N3QA 4GKYA 4R9BA 3ILFA 1WCSA 1AVBA 2W52A 1LECA 3Q7YA 4GKXA 4FPLA 3VKMA 5JMCA 2D6PA 1IHKA 3ZSJA 2GMPA 1SLBA 3FLTA 3HOMA 1BA7A 1G82A 2DVAA 4BM8A 3OBTA 4TZDA 2VW0A 3O5WB 1W6QB 4M00A 1LEDA 3UL2A 3ILAA 4W65A 4WVVA 5HCAA 1SBEA 1G9CA 5IK8A 3VT0A 3FUQA 4FP2A 4TLPA 5T55A 2HYKA 2D6KA 1ISYA 2PHFA 4I4YA 3WUDA 1JHNA 2Y9XE 1XG6A 4DQAA 3ASIA 1CVNA 3BAQA 3FLPA 2DS0A 3B00A 3NWKA 1W6MB 1V6NA 1IRAX 1CIWA 1I1EA 4P9WA 2F8XC 2NZ9A 3NJ5A 3ZYPA 4I30A 4LBQA 4GOYA 2J3PA 3QR5A 3V0AA 2Y9WC 4LBKA 5L73A 1GSLA 5DVHA 3HBWA 2AQZA 5EYXA 4L4HA 1GYKA 2DRYA 2D3PA 4BLJA 3FJIA 1WW4A 1OFSA 2RSTA 5BOWA 4OEGA 4ZXKA 4BPZA 4XIOA 4M3CB 1O4ZA 5KXDA 4YZ4A 1LULA 4NO4A 2AFGA 1RG8A 1W6PB 1LCLA 5E24E 1SLIA 2CY6A 3AH4A 3A07A 4Y1YA 2UWCA 2ZMKA 5GALA 1IJTA 4Y20B 1N1TA 5E88A 1JY0A 3FFZA 4Z9WB 4I4QA 4YM2A 5H9PA 2DYCA 2X2SA 4D8HA 3WVJA 3WO2A 3AJZA 2RHPA 5BQUA 4CTEA 4UW5A 4I4VA 2YUGA 5KXEA 4EFPA 5F8WA 2DTWA 3BODA 3O4DA 4DENA 4KEIA 3BB2A 2F2FA 1S0IA 3POSA 3WUCA 3AJYA 3SNVA 1K5VA 3H6SE 1KDMA 4YFZA 2H0BA 3WG3A 3LSEA 5BQUC 5EWSA 3WHUA 3OJ2A 1UL9A 5BXTA 1HQWA 1EVTA 4I7IA 3RQ0A 2ZMNA 4QD2B 4YG6A 1SR4A 2OUHA 4ISQA 4GALA 2D24A 5GLWA 4ITCA 1WBCA 2F2FC 1V6KA 1N3OA 3Q7WA 5EC5A 3W9TA 5GLUA 1LGCA 1LOBA 1LU2A 5KXCA 1AFCA 4OWLA 5HCBA 5GAQA 1ABRB 4G1RA 1CE7B 2GZBA 4A7YA 2D1ZA 2SLIA 1SR4C 1UZZA 5EYYA 1D2SA 4J2KA 3CA0A 2DVBA 1BQPA 4P9YA 1FV3A 1PZ8A 5EHAA 1U0AA 1F5FA 3BAGA 3I2AA 1FNZA 2FMDA 5BXSA 3BAHA 1B09A 2NMNA 4DRRA 2TEPA 1N47A 1SCRA 2D20A 4FQ4A 4I4RA 2PHRA 4CJMA 4YW5A 3FJ9A 1ONAA 2P2KA 2DREA 1G86A 1W6NA 1HWNB 1RMLA 2PHTA 5IUQA 3FJDA 2DUOA 4IZEA 4JC1A 3IN9A 3PVNA 3P6IA 2JJ6A 2DVFA 2CNAA 4LO3A 3AFKA 3R4UA 4EEEB 4ZKTB 3NV4A 1S0DA 3R05A 3AJ6A 4Q8LA 1DQ1A 5DSSB 4GP3A 2BQPA 3OYWB 4KEJA 4XDQA 1H9WA 4C1XA 1A8DA 2Q3NB 3UJQA 3V0BA 4QKRA 2A3WA 1KQRA 4MYEA 4LO3C 4Q2FA 2D6LX 1DBNA 1FWVA 4XXAA 5DZEA 1W6OB 2DVGA 4A7ZA 3FJCA 4P9XA 5DXDA 1VIWB 1W0OA 3JUTA 3SH5A 4J2YA 3WZ1A 1DGLA 3O0WA 4X38A 4ZFYB 4JAWA 4Y1ZA 1HLCA 5T5OA 5EXOA 3AZWA 4AWDA 5SV8A 1AX0A 1Q8QA 1Z0HA 3N35A 3JRRA 3WNXA 3WG1A 2HWMA 1DQ0A 4DRVA 4LBJA 1MS8A 4USOA 4HL0A 3BAOA 1ZM1A 3AP5A 1JOJA 1GKBA 1IS5A 1BFFA 1N4KA 1PUUB 1LHWA 1ULCA 3TB0A 4Y24A 4PQ9A 4I6IA 3QLQA 2ZGLA 2E51A 3ILRA 1QGLA 3KM5A 2GNDA 5GJ6A 2MIBA 2GNTA 4XFTA 1DFCA 3HSMA 2BFHA 2WSVA 2A6VA 1DQOA 1QXMA 1VAVA 1FGAA 3V64A 4LBLA 3U4XA 1V6JA 3FJHA 1GGPB 5HPZA 2DURA 1WBFA 3VV1A 1X50A 4H04A 1EV2A 1CQ9A 4X37A 4EB2B 1LGNA 3VKLA 3ZXEA 3AKFA 1WD3A 3JU9A 2K8RA 4AN7B 2GMMA 3WV6A 4BLIA 4YG3A 1ILR1 4OUJA 2WJSA 3AXEA 1G9FA 1UAIA 3WDUA 3B01A 2KLLA 1RZOB 4LBQD 2V5YA 3PVEA 1JBCA 1WW5A 3PMEA 3AZYA 3V79C 3O44A 4FPYA 4XMIA 1UMZA 3LLPA 1LOCA 4Z8BA 2PHWA 3FJEA 1WW6A 3P6JA 3NBCA 4LO8B 4XHBA 3T1MA 3LCPA 2NP0A 2DV9A 3IM0A 1MVEA 2ZHMA 4YW4A 2WT0A 3WDYA 3DUIA 1QQKA 1GZWA 1DQ2A 4YFWA 1HDKA 2SBAA 1MC9A 3B9CA 3TAYA 5IT6A 2VSAA 1LHNA 4ZOTA 1AXKA 1SCSA 3ILNA 3PG0A 4YM0A 4DPNA 4LBOA 3OJBA 3D5OA 1JYIA 2P37A 2M49A 2VSEA 4F83A 1PZ9A 2ZQNA 3KQRA 3TC2A 3IPVA 5F9TA 2NTDA 1W3FA 3ENRA 3UJOA 4FP3A 2R1DA 3FJKA 5CNAA 3USUA 4QKSA 1JUIA 3CA6A 4XJ9A 1FATA 4IHZA 3POKA 3AYCA 4Y1VA 2KM2A 4GXLA 5JDBA 4XTPA 3AKHA 3VSFA 3I4IA 5CA6A 4IY9A 3M1HA 5AVAA 2EAKA 2MLLB 4A7KA 5DZGA 4ZFUB 2ZGMA 5B2HA 3IIRA 4ENDA 2W68A 2A6XA 4Q1PA 3D7WB 4XBQA 2AREA 1I1BA 2JE9A 2EXKA 3SH3A 3S8JA 5LK5A 3W58A 3L2YA 4EFRA 3FJFA 4AGGA 1CVSA 3CA3A 2GO2A 3WA1A 2KH2A 1CJPA 1RITA 4XFSA 4KEKA 1DQ5A 3WHTA 1Q8PA 5JOYA 1TEIA 2YY1A 2WT1A 1YRZA 5F90A 3POWA 1N3PA 4ZFWB 4FPFA 2ZQOA 2ZGTA 1JN2P 3A0KA 2WLQA 5D63A 2FGFA 1ENSA 3WG2A 1ULFA 9ILBA 3F1RA 3HN1A 5I1BA 3ZX7A 1TWEA 5DG2A 1ITBA 1TP0A 1QDCA 3V65A 1Q8VA 3OGFA 3FJJA 3ZC9A 4D0TA 2GDFA 5E8AA 2DRZA 3W59A 4XJUA 3INAA 2ZR1B 4AYUA 3ZXKA 3WCSA 3QYDA 4HJJA 1K5UA 2P3IA 4P14A 4M3CF 3HALA 4AN6A 4OWJA 2P39A 2GMEA 2UU8A 1W6QA 3ZYRA 1IKQA 1PC8B 2ZZJA 1CR7A 4DCKC 3MEPA 1N1VA 1FMZA 3CQAA 1G9DA 1YI7A 3H0OA 2P34A 1YF8B 4I4OA 1JT3A 1O4YA 4I1BA 1DHKB 2AAIB 1BFCA 1UX6A 4EKXB 1HWPB 3C2UA 4X39A 1HKDA 1PZZA 3IKWA 1DYPA 4JKXB 4XZPA 4ATEA 3AZVA 4JKQA 1W6MA 2R49A 1II4A 1H30A 4Q8KA 1ZA4A 3AXDA 3IAGC 3AH2A 2DUQA 4FOWA 4L4IA 3H6RB 4DFSA 3OGGA 2D3SA 3WDXA 1IT0A 1Q8OA 2R0HA 3SLIA 4LO7B 1R1ZA 2YZ4A 5CB7A 2D7FA 1SFYA 2E53A 2NYYA 3O5SA 2D6NA 4IY8A 5JOWA 2ZACA 4XOGA 1AZDA 5CBLA 5FZYA 1LOGA 1BKZA 2KKIA 2W39A 3ZXLA 2E7TA 4XJAA 4JPZA 4YW3A 2QN4A 2JDZA 3VKOA 2ZGUA 4M3CA 5GZDA 3UD9A 1Y7BA 1TFMB 2LTNA 3WMUA 2ZGQA 4YGEA 5GZEA 1MACA 4P0LA 2A71A 1W6PA 1D0HA 2NN8A 4XBLA 1SLAA 1HWMB 5G00A 3ZXGA 3N7LA 1S0GA 2E4MA 2R16A 4GA9A 3AJ5A 5JOXA 4DEPA 2W08A 2DU1A 2P3JA 4I4UA 4Y20A 1RY7A 3M3QA 3O3QA 4Q91A 1BYHA 4EFQA 1LENA 4YZ5A 1NUNA 1SZ6B 2HW9A 3MW4A 1SLLA 1MS3A 2E4MC 2A6ZA 3ZSKA 5T50A 4DS0A 2ZGPA 3A0NA 1R8OA 4HA2A 3RTIB 5KXBA 2B7YA 2EXHA 4HANA 4K1YA 1Q03A 1XYFA 1XHBA 4L8QA 1DQGA 4IONA 3HR9A 4P0KA 3UD7A 4YGCA 4F34A 3CRHA 3NV1A 4XJWA 1MS9A 1W0PA 3ZXFA 1IOAA 1MR5A 1VCLA 5GZCA 1BFBA 4FPGA 1T9FA 1N1YA 4ZLBB 4QD2C 4LO0A 1C1LA 4XKIA 2EXJA 3O0VA 3AYDA 4I8MA 2A3YA 2Z48A 3NBDA 2FDBM 2ZAAA 3T1LA 1MD6A 1JYCA 2ESUA 1AXYA 1W3AA 1DZDA 1WLDA 1OKQA 1QOOA 5H9QA 5DUWA 1CPMA 2AGSA 4I37A 2C9AA 5T5JA 2ERFA 1HCDA 2A7AA 3BA4A 3WO3A 2VXTI 4LO0C 1LTEA 4KC3A 3AKGA 3FLRA 2CTVA 1FMMS 2NVHA 3UDAA 5DZFA 1BLAA 1WD4A 5IK4A 3O0XA 2D22A 1SLCA 2X2TA 4D69A 2Q9XA 3O4AA 1RIRA 1Z78A 1LU1A 5DUXA 3HMYA 1C4RA 3CA4A 3A22A 5F8SA 1V6LA 4I0YA 4UW4A 5HCFA 3ATGA 1V6MA 2D7IA 2ERMA 3I2XA 2D6MA 1BASA 1ENRA 4Q1RA 3CA5A 1GANA 4FPCA 1KNMA 2GN3A 4YLZA 1PZ7A 3Q7XA 3A21A 4FPJA 2AH2A 3M3OA 2A6WA 1DZCA 5FZZA 1WLWA 4IYBA 4PF5A 3BRDA 3OYWA 2D6OX 2YXSA 2FFVA 2EIGA 3OY8B 3UK9A 2PHXA 4AVSA 5H9SA 2UWBA 4FOVA 4XILA 2A75A 4Q26A 3AK0A 1HQLA 1WBAA 1MS1A 4Y22B 1Q04A 1ONKB 1JXNA 3O4CA 4ATFA 2ZGOA 1W6OA 2Z42A 3K1XA 2CYFA 2GNBA 2OVUA 3UJ4A 5DUUA 4YM3A 5BXRA 1LJ7A 1GZ9A 3WLUA 4ZBVB 1JT7A 1GBGA 2ZHNA 5GLZA 1V6UA 1QOSA 3CAHA 4GOVA 2LIEA 4YZ3A 4WVWA 3DGTA 4UW6A 1WUVA 3RRDA 2AYHA 2KI4A 1ISZA 2RG9B 1J0SA 1V6XA 1XZZA 1WBLA 4YZ2A 3ZSLA 2D3RA 1I3HA 3N3HA 4YW1A 1FQ9A 1AX2A 1DYKA 1SACA 2OUJA 1DFQA 2QYIB 1ISWA 2BEAA 2WRYA 3WOGA 2FHRA 3FGMA 1AJKA 5BYNA 4IZXA 1YBIA 2DTYA 3GALA 3AYAA 3SH4A 3FJAA 1GICA 4D0ZA 4NOTA 1LEMA 3FBYA 4YW2A 4J23B 4P0JA 2XB6C 4QC4A 2WNEA 4BMEA 4Q27A 5JVVA 3VKFC 5JOZA 2A70A 2R0FA 4FVVA 3RSJA 4YM1A 3FUOA 2D43A 3N36A 4U2AA 3NBEA 1A3KA 4LBNA 2L5XA 4I4PA 3BRGC 1GLHA 5IK7A 1QF3A 1ISVA 5GLVA 4PBPA 1AVWB 4JRAA 4PC4A 4LO1A 1BARA 3CU1B 1S1AA 4I4SA 1BLDA 4IQPA 4LBQB 3WMVA 3WCRA 3V0AB 4GAFA 4JP0A 1MVQA 3EF2A 1R8NA 1LGBA 4BQ1A 1KDKA 4R6UB 2E6VA 3OBRA 1APNA 4LO1C 4I4XA 1G9AA 4CRQA 2WQZC 1V6IA 5DG1A 2R1BA 4YGDA 2ZBJA 2UUSA 1ENQA 2UURA 1LHOA 1OQ1A 4Q9GA 1IKPA 3IM6A 4YG0A 2XOAA 2YMZA 1TTUA 2CWSA 1OQLB 3RG0A 1DQ6A 4XE9A 1YYNA 2MC2A 3CRGA 4J2SA 2E7QA 3BAVA 3T2TA 5D61A 3VT1A 1P63A 4TYSA 1JW6A 1DQ4A 2DU0A 2ZGKA 1SBFA 2UWAA 4XMAA 3WINA 1FV2A 4LO2A 2FO1A 3D4KA 2ENRA 1F31A 3AZXA 1QNWA 1Z4SA 2K43A 4OWKA 3N0KA 1AF9A 3MPPG 4G6MA 3T8SA 3WDVA 3M2MA 1W3GA 1SBDA 2CL2A 4WZFA 3BADA 2ZHKA 5GM0A 3WINC 4FQZA 4BOWA 4LO2C 4K1ZA 2P3KA 2JECA 3CRIA 2ZMLA 3SISA 1S0CA 2D44A 4AGVA 3S8KA 1CONA 2FFUA 4Y1XA 5BP5A 2WBCA 4HR6C 3OPZA 1AXMA 2AENA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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