2VUAA

Crystal structure of the botulinum neurotoxin serotype a binding domain
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
425
structure length
423
Chain Sequence
HMDTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structure of Botulinum Neurotoxin Type a in Complex with the Cell Surface Co-Receptor Gt1B- Insight Into the Toxin-Neuron Interaction.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN A HEAVY CHAIN
total genus 115
structure length 423
sequence length 425
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2008-05-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2vuaA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2vuaA02
1TWMA 2MIBA 2YY1A 3AZYA 1JT5A 4D0TA 3T1LA 3UD7A 2D6PA 3CRHA 1DQ6A 4USOA 2ZMLA 5IUQA 4KC3A 3ZVXA 2VSEA 3FLPA 1L2HA 4X39A 2LIEA 2RHPA 4G9NA 3SH5A 1GANA 3ZSLA 4FPFA 4Q8KA 1GV9A 2E7QA 1N3OA 4IONA 3W9TA 4R9BA 5F8WA 2ERMA 1GBGA 3JUUA 4LBQB 5G00A 2NYYA 4Y1YA 1SLTA 2KM2A 3AXEA 1PUMB 4Y24A 2F2FC 1LOFA 3N7JA 2ZQNA 4I4QA 5AVAA 3A22A 1ZM1A 4UW5A 4XJZA 1WLDA 4D8HA 1JYIA 3R4UA 4J2SA 3RMYA 4YM0A 4P9YA 1HLCA 3BTAA 4GA9A 4GWNA 2P23A 2EXHA 2VLCA 1C4RA 4AVVA 4J23B 2DREA 5E89A 2K8RA 3WMUA 4D0ZA 3I2XA 1HWOB 1DQ1A 3KQRA 5T5PA 4LBMA 5FZZA 2DRYA 4U36A 4KEJA 4I4UA 3IN9A 2LTNA 3WCRA 3PUBA 2J3PA 1UX6A 1ISYA 3ZYPA 3MALA 3WVJA 5GJ6A 2BEAA 1HWNB 3H6RB 1NZKA 3USUB 5CAZA 3WG1A 4WVVA 3AZXA 2JECA 1DYKA 3I29B 3BRGC 4FP3A 4J2YA 2P2KA 1K5UA 3PJQA 4AGGA 4FOWA 1V6KA 2AXMA 4IYBA 1VAVA 4XOGA 4GAFA 4TZDA 5BOWA 1A3KA 4XTPA 3UDAA 1DFCA 2ZR1B 4XHBA 3BAGA 2YZ4A 1I1EA 3FJEA 4Z8BA 1BKZA 3CRGA 1QXMA 4YGCA 4Q1RA 3NBCA 2I1BA 1E0OA 1GICA 1AX0A 4EB2B 3IIRA 1B09A 2Y9GA 1ONKB 1N4KA 3ZXKA 1MS5A 1IRAX 2R1BA 2OUJA 5BYNA 4HR6C 3FLTA 4L8QA 1WD4A 1WW4A 4XJ9A 3VKLA 2FFVA 2ZGMA 2DURA 1FWVA 1LJ7A 2DUPA 2GO2A 2D3SA 1TOOA 1KDMA 5BXSA 1GZWB 3ASIA 2EXKA 3GALA 4LO2C 2WJSA 5D63A 2D43A 4OW4A 1YXWA 1ULGA 2GDFA 2W52A 3BADA 4XBQA 4XMIA 3BA7A 2IHOA 2PELA 4YFZA 1DQ5A 4WV8A 1TWEA 4QBCA 5GLVA 3NV1A 3QLQA 1SBDA 4QC4A 1QQKA 2D6MA 4GP3A 1W6MB 2WQZC 4WBCA 5IK7A 2ES3A 2MC2A 1SBEA 2V73A 3BA4A 1G9DA 1LTEA 4X3AA 1H9WA 1RY7A 3AP9A 3AP6A 5HCFA 1UN1A 1GZCA 1OKQA 3NV4A 3PHZA 1DBNA 2QYIB 4K20A 3WG3A 1HWMB 2ZGOA 2VXRA 1QNYA 2BFHA 2ZKNA 1V6XA 2D6KA 3Q7YA 4YZ3A 1JT3A 1CESA 5IK4A 3OYWB 1BQPA 4W65A 5GLTA 3M3CA 1QKQA 4C1XA 4II0A 2X2TA 3BB2A 4Z8SB 2KI6B 1W3AA 1IILA 2UWCA 5H9SA 4HANA 4I7IA 2VUAA 3FJFA 3AKIA 5GLZA 2C9AA 2CY6A 2YMZA 3WO4A 3ZSKA 2AR6A 4EFRA 1LOBA 1Q8PA 5BXTA 2D6LX 3PVNA 4ZFWB 4ZGRB 4DRRA 1PZ7A 1YO8A 1PZZA 3NV3A 4LO3A 1C57A 1SZ6B 4YFWA 4G6MA 2WLQA 2ESUA 1LGBA 1KJLA 21BIA 2EAKA 4H04A 1PUUB 4P0KA 4LO7B 4QO3A 3CA0A 1WLWA 1URXA 1Q56A 3ZXDA 1AVBA 4A7ZA 1JOJA 4CRQA 1IT0A 5BVPI 1TIEA 2Y9XE 1FNZA 4LBLA 3FJKA 3MEPA 1NUNA 3SH3A 4YW2A 3WINA 1JLYA 1AX1A 2BQPA 4M3CA 4BM8A 1AXKA 3WHTA 1JT7A 1IHKA 1AXZA 3O12A 1CR7A 3LSEA 3AYAA 4XFTA 1HCDA 3BRDA 1N3QA 4Y26A 5KXEA 2KLLA 4IY8A 4YW4A 2D3PA 4HL0A 1MD6A 3NJ5A 4NO4A 1JLXA 2CWSA 3T8SA 3ZPYA 4LBQD 1JXNA 4USPA 2VY0A 1MS3A 4MYEA 1JQZA 3H0OA 3O4DA 4EEEB 4FQZA 3WUCA 4XFUA 2R49A 1UMZA 3AH1A 4ZLBB 3FJDA 3MW4A 1Q1UA 3IPVA 3BAUA 2ZMKA 3ATGA 4YGBA 2KH2A 2DVFA 3UK9A 1W0PA 2ZGSA 1KRIA 3CAHA 2D23A 3O4AA 3CA3A 4I2SA 1C1LA 1SFYA 4ISRA 5GM0A 5IK8A 4XFSA 4WZFA 2CWMA 4I6IA 1ITBA 5I1BA 4ASMB 2EF6A 2ET2A 4X38A 3NBDA 1AJKA 3B9CA 1W6OA 3QCWA 4TYSA 1BFGA 3SLIA 2IWTB 1OFSA 3O0VA 4XXAA 3RSJA 4I3NA 4XJWA 4Q91A 4XKIA 3FJCA 2WNEA 3WOGA 1S0CA 1QOSA 4BMEA 5LK5A 3F62B 3BRFA 3D4KA 4OUJA 2P3IA 1WW5A 3ILNA 4GWMA 1LOCA 3SITA 1M2TB 1CVNA 2HW9A 1AVWB 1BLAA 4I4RA 4AGRA 3FJIA 1EPWA 1HKNA 1Q03A 1J1TA 1XYFA 3AK0A 1RITA 1ENRA 2UWBA 1UKGA 4YW1A 4P0LA 3KMVA 4FPKA 1WW6A 3O0WA 4XJUA 2ZGQA 2Z49A 3AYCA 3SH4A 5T5OA 2PHXA 4M00A 4LO1C 1UPSA 2E4MC 2A70A 4I4YA 3AYDA 2H0BA 3O4BA 1RINA 1GZ9A 2HYKA 4YM1A 3R4SA 2A6ZA 4Y22B 1MS9A 2P39A 2WSVA 4A7KA 4XBLA 2OUHA 3POYA 3POWA 1BA7A 1M16A 3V0AA 5DUYA 2D3RA 1ISVA 3IM7A 1OQLB 5L73A 3UJ4A 2ARXA 3T1MA 1JN2P 3AZWA 3ZC9A 3O4CA 2DTYA 4FPJA 1QGLA 1IS5A 3N3HA 4L4HA 4I1EA 1BFCA 1UZYA 4FOYA 2PHUA 2JKBA 5DUXA 1DQ2A 1ISXA 1AVUA 4DPNA 1TP0A 1IOAA 3ZXEA 1V6MA 4Y1ZA 3CQAA 1RMLA 2NMOA 2NVHA 4I0YA 1ISWA 4YZ4A 2EXIA 3S8JA 1IKPA 1R1ZA 2XG3A 4IZEA 3V79C 3UJ0A 4AVSA 2D44A 1LULA 1S0DA 2SLIA 2GMPA 1UAIA 1AF9A 1IJTA 3DUIA 3CU1B 3VKNA 1YIFA 3INAA 1KJRA 2RSTA 1O4YA 4ZBVB 5DVHA 3WDVA 2HWAA 3IMNA 5F9TA 4FPOB 3M3OA 3UD9A 1FGAA 3HMYA 1CE7B 5D62A 1G9AA 3IM0A 3WUDA 4FPYA 2ZABA 4YM2A 4IZXA 5DZGA 4P14A 1DIWA 2A3WA 4ZFUB 1DHKB 4GOVA 1MZ6A 1N1TA 1FX5A 3O49A 1DZDA 1ENSA 4DRVA 3FUOA 1QMJA 3O44A 5GZGA 1H30A 4ATEA 1ABRB 1GNZA 5DG1A 1Z4SA 1MVEA 3WZ1A 1JBCA 3VKMA 3LSDA 5IK5A 3BAOA 4YZ5A 5EYYA 2A3YA 3O5SA 2LALA 1VLNA 4P0JA 1S0FA 3H6SE 1D2SA 3ZC8A 3B69A 2GNMA 4A7YA 3B00A 1MVQA 5F8YA 1CIWA 5SV8A 4Y22A 7I1BA 3ILRA 2UURA 3MPPG 1BZWA 4DFSA 3E8LC 3QR5A 4PF5A 1J0SA 2GALA 2ZMNA 2MLLB 1LGCA 3VV1A 1FNYA 2R0HA 2ZGPA 4M01A 4H55A 4UW3A 1A78A 3C2UA 4YGDA 2W39A 2GNDA 3B01A 4DENA 3GNEA 2HWMA 2VH9A 4FOVA 4G6JA 1G8WA 1XHBA 4J2XA 1N47A 2I2SA 1W0OA 4C1WA 4BOWA 2F8XC 3HN1A 1PZ8A 4PCRA 1MS8A 2DVGA 4LBNA 2WKKA 1LHWA 1N1SA 1S0IA 1IS6A 1ISZA 4F34A 5CA6A 2Q9XA 2VW1A 1SR4C 5GALA 4Q2FA 3P53A 1X50A 2NN8A 2D24A 4KBBA 3ZSMA 2WT2A 3WDUA 4I30A 2YUGA 4M3CB 3UJQA 1CONA 4BPZA 3AX4A 2L5XA 2NZ9A 4RA0A 1KQRA 4JRAA 2P3JA 5EXOA 3O4OA 5BP5A 3B9UA 1S0JA 4PC4A 1G9BA 1Z78A 4CTEA 1Q8QA 4EKXB 1LHUA 2DTWA 3D5OA 4OWKA 2JE7A 1ULFA 2W68A 2D1ZA 1ZA4A 3AXDA 2E6VA 2V5YA 3VUOA 3SNVA 4XHXA 4YZ1A 4FP2A 1AFCA 2FMDA 3IPVB 2OW4A 1APNA 3AJZA 4UW4A 2TEPA 1LOGA 4FVVA 2FGFA 4OWLA 4GOYA 1AVAC 2ZQOA 3AFKA 1T4QA 2NTDA 1V6WA 4JC1A 5EHAA 3P6IA 4PBOA 1RIRA 3Q7XA 4KEKA 1FYUA 4AN6A 2EIGA 3AYEA 3M2MA 3ENRA 2YV8A 1WCSA 5JMCA 2VSAA 1W6OB 4EFPA 3A0NA 1QOOA 3LTQA 1DZCA 1DQGA 1Q8VA 1MS4A 1WD3A 2Y9FA 1H9PA 2A6XA 2HZ9A 4BMBA 1KNMA 4QD2B 4XJ8A 2AFGA 1S1AA 2DS0A 3WG2A 2BEBA 1YF8B 3PVOA 4HA2A 3BAQA 3VT2A 2FHRA 1ENQA 3SISA 4Z9WB 2Q3NB 4I4PA 1LU2A 2JJ6A 3CA5A 5JOWA 1EYLA 1LOAA 1W6QA 5F8SA 3VEQA 1LGNA 2FO1A 5KXCA 4I96A 3FJBA 2PHFA 3FJ9A 6I1BA 3NBEA 3VWCA 1XQNA 3A23A 2A71A 4ZXKA 5CNAA 3PG0A 1SBFA 4ZOTA 4Q9PA 1LEMA 3TC2A 4LO3C 1LESA 1HIBA 3P6JA 1FMZA 3V0BB 1BARA 1R8NA 2YXSA 4IHZA 5CB7A 1N1YA 3CRIA 3AKHA 2ZZJA 4XYXA 1F31A 2ENRA 2DUOA 3S8KA 4SLIA 4U2AA 1DZQA 1JY0A 3WO3A 2GNBA 1GGPB 3ILFA 4ZA3B 4Q26A 3M1HA 1PZ9A 4Q27A 3V0AB 3PMEA 1SLCA 3UJOA 1Q04A 2D6OX 4I4SA 4JAWA 3WINC 1RZOB 1A8DA 3HBWA 8I1BA 2GZBA 4LO0C 2Z48A 3EF2A 3JRRA 3WMVA 3WO2A 1N3PA 1HKDA 1Q8SA 2VW2A 4YG6A 1JUIA 4JCKA 1AXMA 4IQPA 1K5VA 2ERFA 4Y1VA 1KITA 1BYHA 5DG2A 3OJ2A 2DV9A 4DS0A 5D61A 3CNAA 2NMNA 3AP7A 5BQUC 2A6VA 1YYNA 4Y20A 1VCLA 4XZPA 3N7MA 1BASA 1FAYA 1V6OA 4XIKA 1WBLA 2UWAA 1S0BA 2Z42A 3ZXJA 4GAIA 4FOQA 1MZ5A 1AXYA 5KXDA 5JLVA 3AP4A 3IAGC 2RQ9A 4YZ2A 2DVAA 3R05A 4ATFA 4DQAA 4GKXA 5GZCA 5KXBA 3WDXA 5HPZA 1CN1A 3FLRA 1QDCA 3MW2A 2AENA 4OWJA 1FV3A 1BFBA 5JOXA 4ZFYB 1VALA 1G7YA 3T2TA 5DZEA 4FGFA 4LO1A 2E4MA 4FPCA 5DXDA 4I8MA 2AUYA 5GZDA 3WHUA 1UZZA 4LBOA 3WV6A 5FNWA 5F90A 1JHNA 4KEIA 2SBAA 3DGTA 1W6NB 5DZFA 3U4XA 3BAVA 4X37A 2ARBA 1S0EA 4QKRA 1OQ1A 3RTIB 3V0BA 1DQOA 1TFMB 1W6PA 3AP5A 2E51A 1WBCA 1V6JA 3CA4A 2F2FA 2K4AB 1QU0A 4GKYA 3N7LA 4LO7C 1WUVA 3D7WB 3WCSA 3C9ZA 5DSSB 1G82A 1AJOA 4AGVA 5EG6C 4Q8LA 2LIQA 2D7IA 1AZDA 3I4IA 3UD8A 2DRZA 2FDBM 2AREA 4JKXB 3D6EA 3M3EA 1WBFA 5FRAA 3I2AA 1BFFA 1DGLA 3RS6A 2DU1A 1YRZA 4R9AA 1FN0A 3I8TA 1XZZA 1ULEA 4YG3A 1W3FA 1LENA 4XJAA 1QDOA 4WVWA 4AVTA 1FMMS 1HQWA 4NOTA 2A7AA 2ZGNA 4Q1PA 2EXJA 3N36A 2VW0A 1AVXB 4PBPA 4GALA 3FJHA 4H9WA 1CPMA 4F83A 1NXD1 1V6VA 5DZUA 1G9CA 2A5ZA 3Q7WA 1GNHA 1YBIA 1FV2A 1PWAA 1GSLA 3A21A 5EWSA 1LOFC 2R1DA 4AWDA 5GZEA 2P34A 1IS4A 3RG0A 4R9DA 3NBNA 4AN7B 5EYXA 1IKQA 2D20A 4JP0A 1SLLA 1ILR1 2P3KA 5JDBA 4YG0A 4XILA 1JW6A 5DUVA 1SCRA 3MW3A 2YROA 3OJVA 5HCBA 3ZXLA 2KKIA 3FGMA 4I4VA 1Q8OA 2ZGRA 3OGGA 3ZXGA 1R8OA 4YW5A 2K43A 5JOYA 1W6NA 3W58A 2ZHKA 1HCEA 3OY8A 3FUQA 2CTVA 3W59A 3LCPA 3FFZA 4M3CF 3AJ6A 2PHTA 2R9KB 2VXTI 2GN3A 3N7KA 4I1BA 3V65A 1HQLA 1QOTA 3VKFC 4YW3A 4D69A 2C5DA 5DUUA 2ZHLA 3A4UA 4BQ1A 2W08A 1I1BA 3O0XA 1G9FA 1GLHA 3VKOA 3WDYA 2WT0A 3FJJA 5JOZA 2GNTA 3NV2A 4Q9GA 4OZXA 2M49A 4Y1XA 2Y9WC 5T52A 4LBKA 4LO2A 5GLWA 1V6UA 3O5WB 1SLIA 2XB6C 2CL2A 1LEDA 2D7RA 4J2KA 3BA5A 1WBAA 1U0AA 4XTMA 1EVTA 1SR4A 2PHRA 2KI4A 2UU8A 3OBTA 3WNXA 4LBQA 3Q9OA 4XXPA 1ULDA 1FQ9A 3LLPA 4OEGA 5IT6A 1F9KA 3QYDA 4FPGA 2ZHMA 4PQ9A 5GAQA 1LHNA 3AJ5A 5H9PA 2OVUA 2ZGUA 1W6QB 4QBVA 3PVEA 4FPLA 1IRPA 1W3GA 4K1YA 5F5QA 3WG4A 1FWUA 1TEIA 1GYKA 1LODA 3HOMA 4DCKC 1DQ4A 9ILBA 4XDQA 1CPNA 3WDTA 4XBNA 2WRYA 1SCSA 1WW7A 2D7FA 5B2HA 1TTUA 5T5LA 2RG9B 4R9CA 1D0HA 1HDKA 3SNMA 1YTOA 4EFQA 1HWPB 4K21A 2A6YA 3HR9A 2VU9A 31BIA 2AAIB 4LO8B 3BODA 3RTJB 1II4A 1MACA 3ZX7A 4I37A 3AH2A 2NM1A 4I4XA 3AKFA 4ISQA 4LBJA 3A07A 3WLUA 3H6RA 3OJBA 3USUA 1V6LA 5CBLA 5BXRA 3JU9A 3L2YA 2WT1A 1Z2VA 1QF3A 1LCLA 2UUSA 5H9QA 3VT0A 3ZXFA 3VSFA 2E7TA 3TAYA 4R6UB 1G86A 1LU1A 1S0LA 2CYFA 5BP5C 3CA6A 3HSMA 2GN7A 3OJMA 4DEPA 4XE9A 2DVBA 1MC9A 2AYHA 1QNWA 2PHWA 3BOPA 3A0KA 4XIOA 2EALA 4YM3A 4BLIA 4Y20B 5BXPA 3AZVA 1PC8B 3IM6A 3AKGA 5HCAA 1VIWB 1BLDA 1MR5A 3OGFA 1NLSA 2DVDA 2ZHNA 4XMAA 3KM5A 5T50A 1MS1A 1I3HA 2D6NA 3CA1A 3ZYRA 2P37A 3RRDA 3F1RA 3AZZA 4GXLA 1VAMA 1EV2A 2GMMA 2ZGKA 3UL2A 4FQ4A 1CVSA 1IS3A 1V6NA 1BJQA 2FFUA 1S0GA 4P6AA 2AQZA 1Z0HA 2CNAA 2JE9A 4G9MA 3BAHA 4JPZA 1DFQA 1F5FA 1V6IA 4I4OA 1GZWA 2G4IA 3B3QE 1SLAA 5FZUA 1LHVA 2X2SA 2JD4A 2ZAAA 3K1XA 5JVVA 5T55A 1WLCA 4LO0A 1W6PB 4JQ0A 1DLLA 4TLPA 1CJPA 5T5JA 3FJ8A 1DQ0A 4BLJA 1C1FA 2R0FA 1DJSB 3HALA 4GP0A 2WBCA 3VT1A 2AH2A 4ENDA 3AH4A 4OEEA 2GMEA 3ILAA 1UL9A 2R16A 1QQLA 1W6MA 2XOAA 4OEFA 3POKA 1SACA 1LECA 3FBYA 4G1RA 3RQ0A 5BQUA 2ZGTA 3NWKA 5E88A 3APBA 1YI7A 2DUQA 4AYUA 3IM5A 2A75A 2ZBJA 2ZGLA 3TB0A 4FPHA 4QALA 1CQ9A 2E53A 4JKQA 4RL7A 4YGEA 5E8AA 2NP0A 5H9RA 1LOEA 2DU0A 3OBRA 2AGSA 2DWRA 4K1ZA 2A6WA 1BXHA 3O3QA 1KDKA 4YLZA 3FJAA 3OYWA 1ULCA 4YOLA 2D22A 5FZYA 3JUTA 1IOBA 5GZFA 1AX2A 3M3QA 3N0KA 1N1VA 1JYCA 2B7YA 2ZACA 3AJYA 1O4ZA 4P9WA 3IKWA 2ZA9A 5E24E 5FNXA 1GKBA 1SLBA 3V64A 2DYCA 4IY9A 3H6QA 1Y7BA 1T9FA 1RG8A 5FREA 41BIA 3N35A 4QKSA 2WSUA 4M3CE 1DYPA 1XG6A 1JT4A 4UW6A 1FATA 3BX1C 4HJJA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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