2VUAA

Crystal structure of the botulinum neurotoxin serotype a binding domain
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
425
structure length
423
Chain Sequence
HMDTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of Botulinum Neurotoxin Type a in Complex with the Cell Surface Co-Receptor Gt1B- Insight Into the Toxin-Neuron Interaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN A HEAVY CHAIN
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
total genus 115
structure length 423
sequence length 425
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2008-05-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2vuaA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2vuaA02
4BOWA 5DXDA 3PG0A 4FP3A 1Q8PA 5H9PA 2YV8A 3P6IA 4LO8B 4C1WA 4FQ4A 4KBBA 2E7TA 5DZEA 3USUB 2D7RA 2GO2A 4OEEA 1FNZA 1JUIA 2EXHA 4LO1C 2VY0A 4EKXB 3IIRA 1HCDA 5JDBA 3AP6A 4I8MA 1WUVA 2RHPA 2P23A 2X2TA 1PWAA 3NBEA 4FPLA 3POKA 3FGMA 4FOQA 3NV2A 3UD7A 3UJ0A 1S1AA 4LBQB 1GZWB 1G86A 4IZXA 4Y1XA 3HALA 2WBCA 5T54A 1ITBA 3UDAA 3IM6A 4ZFWB 4P0KA 3N3HA 4XJAA 3AYDA 2D6KA 4PF5A 2A75A 3H6SE 2ERFA 4Q27A 3AYCA 3WG4A 5H9SA 4G9NA 3WG3A 3V0BA 4L4HA 4I4XA 1RIRA 3WUDA 2F2FA 4A7KA 3WO3A 2AXMA 1AX1A 2GN7A 4GP3A 3PVOA 2XOAA 1GNZA 2GNTA 3OYWB 2ZGMA 2A6ZA 4ZLBB 4G9MA 4Y22B 1LESA 1EPWA 1UN1A 2NYYA 5D63A 5EWSA 1Q8QA 1SR4A 3A07A 4L8QA 2D3RA 3BA5A 2YUGA 4ZBVB 4I7IA 4K1ZA 1S0EA 3SLIA 1YI7A 1LHVA 3ZC9A 3BODA 1YXWA 1LOEA 3GALA 3AYAA 4G6JA 4TYSA 3NWKA 4OWKA 1Q1UA 2E53A 2R0FA 1BXHA 3ZXGA 2MLLB 1ISWA 2R16A 3BB2A 1IKQA 2DVAA 3VV1A 4QO3A 6I1BA 2DU1A 4YM1A 3QYDA 1W6QB 5H9QA 3O4AA 3M3CA 1GKBA 2KM2A 3VUOA 3WA1A 2ZR1B 2BEAA 1H9PA 2GMEA 3A22A 3SITA 5FZZA 1V6JA 4NO4A 4L4IA 3VSZA 3AZXA 1LOAA 2D24A 2VUAA 1W3AA 4FGFA 2MIBA 5EXOA 3FUOA 2KKIA 3VKMA 1IJTA 5BQUA 3AFKA 5E8AA 3UK9A 1VAVA 4USPA 4Y20B 1W3FA 3QR5A 4I4RA 3CAHA 1II4A 4U36A 2EALA 3OPZA 1MS5A 3A23A 1IOAA 2HYKA 3B9CA 1GGPB 3AXDA 2ARBA 1JYIA 3D5OA 2BEBA 2D6NA 1ONKB 1CE7B 2IHOA 1YIFA 1V6KA 3AKHA 2VU9A 2YROA 2WSVA 5EHAA 4WBCA 4I96A 1DQOA 4WVVA 5DVHA 4Z9WB 1LOCA 1XZZA 1V6IA 2HWMA 2P2KA 2D20A 2G4IA 3S8JA 3UD9A 5GZGA 3RS6A 1W0PA 3N35A 4TZDA 3AZZA 4ISRA 2I1BA 3AZVA 2GNDA 4XIKA 2JE7A 2A3WA 1TP0A 4USOA 2A5ZA 5BXPA 3FLRA 4QC4A 4XILA 5BVPI 2D6OX 1SLAA 1MS4A 2JKBA 4UW3A 1WD3A 2WQZC 3JUTA 4ENDA 4MYEA 5IUQA 1MC9A 2C5DA 2UWAA 4ATFA 3UJQA 3AP5A 1HKDA 1FAYA 4I4QA 4ATEA 3O5WB 1QF3A 3RMXA 2FDBM 1BFCA 2D23A 2XB6C 3AH1A 1I1BA 4XJ8A 4KEKA 3IMNA 3FJ9A 4YOLA 3BIWE 1LOGA 4LBOA 5EYXA 1Q56A 4LBKA 2DUOA 5BP5A 1S0LA 4FPFA 3PUBA 2XG3A 4YW5A 2Y9GA 4XOGA 1DFQA 4R6UB 3V0BB 2VW1A 1URXA 3ATGA 4FQZA 3C9ZA 5DZUA 1BJQA 5T50A 5HCFA 4P0JA 5F8YA 2GZBA 4GWNA 3L2YA 5FRAA 2ESUA 4Q26A 3B9UA 1FYUA 4C1XA 1DQ5A 5GZCA 2EXJA 1RMLA 3Q7WA 1W6MA 1A78A 3IN9A 1TWEA 3HSMA 3BRDA 1W6OA 1SLIA 2ZHLA 2P3JA 2WNEA 4JKXB 2D6MA 2Z48A 3RSJA 5LK5A 3HMYA 1JYCA 5GLUA 5KXCA 4XXAA 1V6OA 3AJ6A 4BPZA 5IK7A 2KI6B 5B2HA 3OBRA 4R9CA 1AVUA 1MS8A 4ZGRB 1WBFA 2D22A 2VW0A 2DVDA 4KEIA 3MW2A 1HDKA 1IHKA 2AGSA 2DRYA 4Y1UA 3CQAA 2CWSA 2NZ9A 2Q3NB 1CONA 2LIQA 3MEPA 1PUUB 1JLYA 3LTQA 1C1FA 3WCSA 1MVQA 4YG6A 1PUMB 3RTJB 1OQ1A 1XYFA 3C2UA 5GZEA 2GALA 1TIEA 4DS0A 3RTIB 4AYUA 2HZ9A 4FPOB 1E0OA 3ZSLA 4Q91A 3N36A 3BAQA 4R9DA 4BMBA 5JOXA 2P3KA 2QYIB 3PVEA 2GNMA 1RINA 4KC3A 4GP0A 4Q2FA 2WT1A 1V6LA 4ZKTB 3AH4A 1DQ1A 3ILFA 5DUVA 3UJOA 1G9CA 2ZGRA 1TEIA 4ZOTA 3K1XA 1KRIA 1RITA 4LO0A 3IKWA 1MR5A 2JDZA 3R05A 3WMVA 3BRFA 3AP4A 2ERMA 1SCRA 1IT0A 2DS0A 1FV3A 1W0OA 2D1ZA 4ITCA 1YTOA 4LBLA 1BARA 3TB0A 4QD2B 1R8OA 3I2XA 3V79C 2V73A 2B7YA 5F9TA 4FPCA 4IZEA 2AREA 4JPZA 4OEFA 4Y26A 3MW3A 2RQ9A 4LO2C 4H04A 4TLPA 2E4MC 4GOVA 3POSA 2EF6A 4DRRA 2R1BA 1JBCA 5D61A 1LHUA 4DEPA 1W6PA 2E7QA 2W08A 2P37A 2ZA9A 1WLWA 1V6NA 3SH5A 3CA0A 4D0ZA 1UX6A 1JXNA 2NM1A 2ZGOA 2Y9WC 3F1RA 4YG0A 3NJ5A 4QKSA 4YM2A 5IK5A 4I4SA 2EXKA 1S0IA 1T4QA 1QGLA 5G00A 3T2TA 4XFTA 1LGCA 1NXD1 3JUUA 1W6MB 1UAIA 4FPEA 4X3AA 4AGVA 1KDKA 1HWPB 1W6OB 5CNAA 3O4DA 2VH9A 1IRAX 2YXSA 1TFMB 2ZGQA 2D7FA 3AYEA 31BIA 4XXPA 3AJZA 1N1VA 2DREA 1Q04A 1GSLA 3MW4A 4F83A 1APNA 3BOPA 2LALA 3GNEA 1IS5A 4XJZA 3ZXEA 1DQ2A 3WOGA 1SBFA 4FPYA 1MZ5A 4WZFA 2ZBJA 1N1YA 1IILA 3AP7A 4BMEA 1AVBA 3MALA 3PJQA 4AVVA 2VXTI 4IYBA 2WSUA 1HQWA 2HW9A 3OGGA 4SLIA 1LCLA 1FMZA 3BADA 4JKQA 4XBLA 2F2FC 4M3CA 3NBNA 5DZFA 2GMMA 4XJWA 1NUNA 5GLWA 1DQ6A 1G9BA 1MS1A 3KM5A 4Y1ZA 3POYA 2FHRA 4IY8A 5GZDA 4X39A 5BYNA 4CJMA 3LSEA 3B01A 3AH2A 2X2SA 3Q7YA 1SR4C 1GNHA 3BX1C 4LO7B 4LBMA 1BFGA 2JD4A 4I4UA 3CRGA 3VSFA 3ZXDA 1A8DA 1EVTA 1QDCA 2PHWA 1SLCA 1FMMS 3B69A 1DZQA 1ISXA 3N7MA 2QN4A 3W59A 3I2AA 1Q03A 2Y9FA 2DTYA 1UZYA 3D4KA 4XFSA 2W68A 3CA5A 4CRQA 4YW1A 3FJJA 3ILAA 4UW6A 1QMJA 2ZGKA 1F9KA 4ZA3B 1UKGA 5IT6A 2AUYA 2JECA 3B00A 1Z2VA 1CR7A 3CRHA 2P34A 4P9YA 1LTEA 4M3CF 2YZ4A 4I3NA 1LENA 4G1RA 1V6VA 3VT2A 2OVUA 1MZ6A 3MPPG 4XBNA 1EV2A 2D7IA 3FJCA 3WINA 3AJYA 1SBDA 5SV8A 2WLQA 5BQUC 5DG2A 2A71A 41BIA 3E8LC 3WG2A 7I1BA 4WV8A 4H9WA 2GDFA 1D2SA 3FJAA 4D69A 1ULGA 2V5YA 5KXEA 2ZHKA 1DHKB 2YY1A 5F5QA 3R4SA 1W6PB 2DVFA 3IM5A 3AK0A 5E88A 1NLSA 1FV2A 2DURA 3RG0A 1QQKA 3EF2A 1GZ9A 1KDMA 3VKOA 3FJ8A 1Z0HA 2ZACA 1CVSA 4FPGA 4ASMB 3OGFA 1DJSB 2VSAA 1QKQA 4I37A 1LOBA 5KXBA 1QNWA 1VALA 2D3PA 4OWJA 3S8KA 2AH2A 2PELA 4Q8KA 4M00A 3CA3A 2A6WA 2D43A 3QLQA 5BXTA 1FGAA 3U4XA 3WDUA 1WW6A 2LTNA 1WW7A 2NMOA 3FJIA 4IY9A 3O12A 1S0GA 4P14A 1NZKA 1N47A 3O4BA 1G9FA 5GAQA 1YF8B 3NBCA 4K1YA 1W6NA 1ULDA 4I1BA 1T9FA 3VT1A 1I1EA 3WLUA 3IAGC 5T5JA 2ZGPA 3TAYA 1SZ6B 4I4OA 4RA0A 5AVAA 3ZX7A 4GAFA 2K8RA 2WKKA 4EB2B 4J2YA 1WCSA 4R9BA 3N7KA 5DUWA 1BLDA 3QCWA 1PZ9A 4LO3A 3V0AA 2ZHMA 4U2AA 4ZFUB 4WVWA 1QXMA 4PBPA 5BP5C 2WT0A 2A70A 3O0VA 2DRZA 3UJ4A 4M3CB 3O5SA 2SLIA 4PBOA 4FOWA 2D6PA 2I2SA 4OWLA 1AX2A 3UL2A 2E6VA 4YGDA 1ZA4A 2SBAA 1OKQA 1ULCA 3FJHA 1C57A 4II0A 3N7JA 1LEDA 3WG1A 2AYHA 3JRRA 1YO8A 4P0LA 4XHXA 1AZDA 1AXKA 4XIOA 1CN1A 3BTAA 1GICA 4P6AA 3ILNA 1IOBA 3CA6A 1J0SA 1ENSA 1WW5A 5DZGA 2ENRA 3N0KA 3DGTA 2PHXA 1QDOA 3A0KA 3BAOA 1KNMA 3AZWA 3PVNA 3BAGA 3OJMA 1GLHA 4J2SA 4ZFYB 1DQ4A 1TOOA 3ZVXA 4CTEA 3H6RA 1KJRA 1SLBA 2NP0A 3VKNA 3F62B 4H55A 1PZ8A 4Q1PA 4YGCA 4D0TA 1TWMA 3V65A 2VLCA 3KMVA 5JOYA 3M3QA 1KQRA 4XTMA 4I6IA 1A3KA 3Q9OA 3ZXLA 1N3QA 2DWRA 2VSEA 2AR6A 4QALA 4FVVA 3ZXJA 4XMIA 4YM0A 2ZZJA 3AP9A 4YW4A 2R49A 2FO1A 1ILR1 3OJVA 3P53A 1MD6A 1ONAA 1AXYA 4LO7C 2CYFA 1DZCA 3CU1B 1LU1A 1Y7BA 4QBCA 2ZAAA 3O0XA 3NV1A 2NVHA 1IS4A 3H0OA 2Q5TA 3IM0A 2EAKA 2LIEA 1LGNA 1F31A 3AKFA 3WDXA 4K21A 3A4UA 4XJ9A 1QQLA 5E89A 3FJKA 3O44A 1LECA 5KXDA 1HWNB 4BM8A 2OUJA 4P9WA 3WO2A 1GBGA 1LULA 5CB7A 1JQZA 2K4AB 4GAIA 4LO0C 5JLVA 1AJOA 2DVGA 5GM0A 4HA2A 3ENRA 4GXLA 1HLCA 1VIWB 3WCRA 4YZ3A 3APBA 3RQ0A 1DZDA 1UZZA 2WJSA 2FFUA 1FX5A 3M1HA 5L73A 1FQ9A 3O49A 1JN2P 1HCEA 1LHNA 1PZZA 2ZMKA 1KJLA 4YZ1A 1ZM1A 4R9AA 3SH3A 1IKPA 5I1BA 2PHUA 4P9XA 1W6NB 1GYKA 1QNYA 3LSDA 1M16A 3AKGA 4X38A 4Y24A 1F5FA 3PHZA 1DGLA 1ENQA 2KH2A 4J23B 3FBYA 4CZSA 1DYPA 5GZFA 4GOYA 2PHFA 2DTWA 1P63A 1ABRB 1K5UA 1AF9A 5IK8A 1HIBA 3VKLA 3V0AB 1DQGA 4I4PA 4JC1A 2UURA 3T1LA 2AENA 2DU0A 1DLLA 3RMYA 1MVEA 4DRVA 5D62A 4UW5A 1VLNA 3AKIA 1LOFA 1LODA 2ZGTA 1Q8OA 1X50A 1L2HA 3FJBA 1O4YA 5JOWA 1AX0A 4FOVA 1FWUA 5GLVA 3D6EA 3D7WB 3HOMA 2AFGA 1RZOB 1MS3A 1WD4A 4JRAA 1BA7A 1SBEA 3M3EA 2A6XA 2UUSA 1G82A 1EYLA 5CBLA 4LBQD 2L5XA 3ILRA 3Q7XA 4LO1A 5DUYA 3AJ5A 3BRGC 4PQ9A 1CESA 1HKNA 4NOTA 2ARXA 4XYXA 3O4CA 3R4UA 4XTPA 3BAVA 1I3HA 4GWMA 5T5LA 2UWCA 1U0AA 2EIGA 2DUQA 1UPSA 4YW3A 2R0HA 1OFSA 3ZYPA 1G9DA 1GV9A 1DIWA 3FFZA 1JLXA 4GKXA 4RL7A 1BLAA 4FP2A 4Y1YA 1H30A 5FNXA 3H6RB 3AXEA 5FNWA 1CVNA 5BXRA 1TTUA 1LU2A 3WV6A 2RSTA 1QU0A 1S0CA 4Z8SB 3WDTA 5GLTA 4GA9A 1OQLB 3M2MA 3W9TA 1AVWB 1R1ZA 1ENRA 5DG1A 3WUCA 3WZ1A 2GN3A 4ZXKA 2DYCA 2K43A 1R8NA 3HBWA 3O3QA 2Y9XE 3VEQA 4FPHA 2BQPA 3FJFA 3VWCA 1N4KA 2CL2A 4YW2A 3I4IA 1YBIA 1RG8A 3AZYA 2Z49A 2ZMNA 2GMPA 3ZYRA 4XFUA 1BYHA 1GZCA 5H9RA 1ISZA 3VT0A 3OJBA 3FLTA 1KITA 1QOTA 1ISVA 2M49A 4GALA 2A6YA 3WVJA 4I2SA 2JE9A 1MS9A 4XZPA 2H0BA 3IPVA 2A3YA 2EXIA 2ZABA 4XDQA 4DPNA 5EG6C 2DVBA 2UWBA 3UD8A 1N1TA 4XMAA 3V64A 3WDWA 3BA4A 1CPMA 2AAIB 4JCKA 1W3GA 1JT5A 2P39A 3WDYA 3CNAA 4EFQA 2J3PA 2CWMA 1PC8B 1O4ZA 1ULFA 2DV9A 4YLZA 1HWMB 9ILBA 3WNXA 1LJ7A 2D3SA 4AN6A 3NV4A 1BZWA 3WINC 4DENA 5HCBA 2ZKNA 1AVAC 4XHBA 5CAZA 3BAUA 3IM7A 1LHWA 2ZHNA 5JVVA 4I4YA 3WHTA 3T8SA 4J2KA 1QOOA 3KQRA 2VW2A 3OJ2A 1PZ7A 1G8WA 2ES3A 5IK4A 4XKIA 5FREA 3CRIA 1WLDA 3B3QE 4HL0A 5JOZA 2YMZA 1LHOA 2NN8A 2CY6A 3HN1A 1Z78A 2CNAA 1LEMA 4QBVA 4AWDA 1BQPA 5EYYA 2CTVA 4IHZA 4EEEB 3A21A 2DUPA 2ZQOA 3RRDA 2AQZA 4JAWA 5F8WA 1C4RA 2W39A 1JTCA 2BFHA 3NV3A 4Y1VA 4I0YA 4DCKC 1MACA 1WLCA 3WO4A 4YG3A 4PC4A 3M3OA 2W52A 1N1SA 5BOWA 2JJ6A 5JMCA 4Q8LA 1SACA 4YGEA 3FJEA 1BKZA 2ZQNA 4QD2C 3NBDA 4AVSA 4G6MA 1VAMA 1ULEA 2D44A 5GLZA 3SNVA 3INAA 3WMUA 1XQNA 1JT4A 4YZ4A 1CIWA 4FPKA 4YGBA 2FMDA 3OY8A 1Z4SA 4LO3C 4LBJA 1G7YA 1SLTA 3SNMA 4K20A 2WRYA 4AN7B 4Q9PA 5DUUA 1S0BA 3SH4A 4OW4A 4LBNA 1HWOB 4FOYA 2OUHA 4XE9A 1V6UA 3AX4A 4GKYA 3LCPA 5T52A 1AJKA 2VXRA 1YRZA 1B09A 3POWA 1CJPA 3T1MA 1HQLA 2KLLA 5T5OA 3BAHA 1IS3A 1V6WA 1JW6A 1SLLA 1DYKA 3USUA 5T55A 3FUQA 1XG6A 1GANA 4ISQA 2PHTA 3HR9A 1M2TB 2PHRA 3OBTA 4XJUA 2R1DA 3ASIA 4I30A 1LGBA 1SFYA 1FWVA 2GNBA 1JT7A 2A6VA 3IPVB 2HWAA 4A7YA 4LBQA 1GZWA 2F8XC 3TC2A 4PCRA 3ZPYA 1QOSA 1SCSA 5HPZA 3I29B 1N3PA 2E51A 4XBQA 1WBAA 1V6MA 3A0NA 5BXSA 2IWTB 2FGFA 1G9AA 2ZMLA 3ZXKA 4JP0A 2P3IA 1BFBA 1FATA 1BFFA 3O0WA 1UL9A 4Q9GA 4IONA 1FNYA 4J2XA 4Z8BA 5HCAA 2MC2A 4KEJA 2OW4A 4HANA 5FZYA 2WT2A 4YFWA 1XHBA 1S0JA 2NMNA 3OYWA 4YZ5A 1WW4A 4A7ZA 2RG9B 2Z42A 4Y22A 1RY7A 1AVXB 3WHUA 3DUIA 1DFCA 2D6LX 4F34A 3WDVA 1H9WA 5T5PA 5GALA 3ZSJA 4AGGA 2KI4A 2Q9XA 5DUXA 2ZGUA 3P6JA 4AGRA 4D8HA 1V00A 1UMZA 5FZUA 1AXMA 1K5VA 1IRPA 4YM3A 1V6XA 2A3XA 3JU9A 4Q1RA 4W65A 5E24E 2A7AA 4I4VA 4HJJA 1Q8VA 1D0HA 2ZGSA 3FJDA 1C1LA 3ZSMA 3O4OA 5GJ6A 5DSSB 3LLPA 4EFPA 2C9AA 1W6QA 2R9KB 4DQAA 4BQ1A 1FN0A 1AXZA 1CPNA 4M01A 4YFZA 8I1BA 4X37A 3ZSKA 4M3CE 4UW4A 1ISYA 4BLIA 5F90A 3CA1A 1WBLA 1N3OA 3CA4A 3FLPA 3ZXFA 3BA7A 1VCLA 4FPJA 4LO2A 4BLJA 4Y20A 2E4MA 2ZGNA 4IQPA 1IS6A 4HR6C 1MS0A 4OEGA 1JHNA 1JT3A 3SISA 1YYNA 1JOJA 4QKRA 5CA6A 1CQ9A 3OY8B 2NTDA 3PMEA 4JQ0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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