2VXR | Genus

Total Genus 117

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	117
sequence length	431
structure length	428
Chain Sequence	NAILSLSYRGGRLIDSSGYGATMNVGSDVIFNDIGNGQFKLNNSENSNITAHQSKFVVYDSMFDNFSINFWVRTPKYNNNDIQTYLQNEYTIISCIKNDSGWKVSIKGNRIIWTLIDVNAKSKSIFFEYSIKDNISDYINKWFSITITNDRLGNANIYINGSLKKSEKILNLDRINSSNDIDFKLINCTDTTKFVWIKDFNIFGRELNATEVSSLYWIQSSTNTLKDFWGNPLRYDTQYYLFNQGMQNIYIKYFSKASMGETAPRTNFNNAAINYQNLYLGLRFIIKKASNSRNINNDNIVREGDYIYLNIDNISDESYRVYVLVNSKEIQTQLFLAPINDDPTFYDVLQIKKYYEKTTYNCQILCEKDTKTFGLFGIGKFVKDYWDTYDNYFCISQWYLRRISENINKLRLGCNWQFIPVDEGWTEL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Crystal Structure of the Botulinum Neurotoxin Type G Binding Domain: Insight Into Cell Surface Binding. pubmed doi rcsb
molecule keywords	BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE G
molecule tags	Toxin
source organism	Clostridium botulinum
total genus	117
structure length	428
sequence length	431
ec nomenclature	ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date	2008-07-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07951	Toxin_R_bind_C	Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A	PF07953	Toxin_R_bind_N	Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	2vxrA01
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	2vxrA02

1V6MA 4GKXA 1DJSB 1AFCA 3HR9A 3ZYRA 1WUVA 4W65A 2ET2A 4JQ0A 2D23A 2MC2A 1FQ9A 2P3KA 3WG1A 3UL2A 1WBAA 3B01A 4AVVA 5HCAA 4BMBA 4FOQA 2W08A 1T4QA 1LHNA 3WVJA 3T8SA 2GNMA 5GLUA 5GZGA 4I3NA 2R0FA 2NP0A 5BOWA 4AN7B 3MW2A 1GLHA 3AZYA 1ISWA 1IT0A 3A0NA 4OWKA 4Q1PA 3VSZA 4XMAA 2F8XC 1LHVA 2E6VA 2WNEA 4QC4A 3RMXA 4YG3A 4LO1A 9ILBA 1OQLB 4A7ZA 2WT0A 2A71A 2ZKNA 1GZ9A 2DS0A 2ZHNA 2FFUA 1V6UA 4R9CA 3ZSJA 2A3XA 4YM2A 1LEMA 4X37A 2ZMLA 3AKGA 4ATEA 4XILA 2DREA 4UW6A 3M3EA 3FJBA 3F62B 2A6ZA 1V6VA 2ZA9A 4GAIA 4FOYA 1QOTA 1V6IA 1HWOB 5B2HA 1CVSA 3BRFA 3WG4A 1QOOA 2A75A 3BAQA 2ZAAA 2JKBA 1WBFA 2WRYA 5G00A 2KI4A 1DQGA 1N1YA 5JOXA 1AXKA 5L73A 2ZMKA 1HIBA 1SACA 3NV3A 2P3IA 3BIWE 2HWMA 3N0KA 4I7IA 2DURA 3GNEA 2XG3A 1CE7B 2PHFA 1S0GA 1II4A 4OEEA 1LHOA 5JOWA 1QU0A 5FZZA 2RSTA 1JOJA 4FPKA 3P6IA 5CAZA 3KQRA 1Q8VA 3SISA 4GALA 3JUUA 1LU1A 4Q1RA 3RQ0A 3ZPYA 4XOGA 1WLCA 2YROA 4USPA 4EKXB 4WV8A 2EXKA 2NN8A 1OQ1A 1IOBA 4EFQA 3M2MA 4Y22A 4PF5A 3WV6A 2NYYA 1GANA 3FFZA 5JOYA 3VKOA 3WO2A 5GZEA 1DGLA 2P2KA 4X38A 4XXPA 1FV3A 2P37A 5DZFA 3WMVA 3N3HA 3BODA 1DZDA 3H6SE 3ILRA 3TAYA 5CBLA 4QKSA 1APNA 5F8YA 4K21A 5T55A 4YW5A 3AH1A 3FBYA 3IM0A 1JLXA 4FPOB 2K8RA 3USUA 2H0BA 2E4MC 3HMYA 2UWBA 1WD3A 3AJ6A 3AZZA 2D3PA 2XOAA 5T5PA 1GGPB 2D6KA 2R1DA 3BAHA 2PHWA 4FPFA 2Q3NB 3BB2A 3CRGA 1HDKA 1G82A 3IPVA 1UN1A 1V6OA 5DG2A 1DHKB 4YZ5A 2F2FC 5F5QA 3B69A 2A6YA 1BLDA 2ZABA 4XJAA 3N35A 5FREA 1N1SA 5BVPI 2EF6A 7I1BA 2VW2A 4IZXA 3FUQA 5T5JA 1PZ9A 4XJ9A 3ZX7A 4YG6A 2D6MA 3JU9A 1HQWA 5BXPA 2FGFA 1SLTA 1XG6A 5EHAA 5DVHA 3QYDA 1HWNB 1IKPA 1WW4A 1Q8SA 1W3FA 4XJWA 3VWCA 1XHBA 4KEIA 4UW4A 1HWMB 4GP0A 4IY9A 5GLVA 2Y9GA 1LHUA 1IS6A 1QDCA 1BFGA 3R4UA 2UWCA 2EXJA 1ULFA 3A21A 2EIGA 4BM8A 3A0KA 4U2AA 4BQ1A 2KLLA 1JT7A 4ZOTA 3O4DA 2RG9B 4R6UB 1CQ9A 1A78A 1TFMB 3OJMA 3SLIA 1RMLA 3WOGA 1WW7A 2LALA 3V0AA 2PHTA 1S0DA 1X50A 1S0JA 1YIFA 2LIEA 1BFBA 3WHTA 4J2YA 2ZMNA 3ZXLA 1TIEA 4LBLA 1YBIA 4Y22B 5DUYA 5HPZA 5GJ6A 4Y26A 1ILR1 1SLBA 5DUVA 4L4IA 1V6JA 4M00A 3T1MA 3AYCA 2E4MA 3ILAA 2YMZA 3LSDA 4UW3A 4DPNA 1GBGA 1AZDA 1GZWA 4EFPA 3QCWA 3IM7A 5DUWA 3BAGA 1FX5A 2Z49A 2ZGPA 4XFTA 4II0A 3O5WB 3AFKA 4GXLA 1R8OA 4QALA 1N3OA 3USUB 3ATGA 1HKNA 4LBOA 4YOLA 1VAVA 2DRZA 4PCRA 5T5OA 3AP5A 4R9AA 3CA0A 3OY8A 2F2FA 4USOA 1UX6A 4OWLA 2VH9A 3UJ0A 1YI7A 5IUQA 1S0FA 2DVFA 1DYKA 5SV8A 2VSAA 2ERFA 3MPPG 3IPVB 3HALA 2E7TA 2D3RA 3AZWA 2UU8A 3B00A 4FOVA 1MS0A 1TEIA 4I4YA 2GNTA 2R1BA 4XHBA 4D69A 4XYXA 5F8WA 3ZXDA 3NV2A 3O4CA 2P3JA 3NBDA 1N3PA 4YG0A 1W3GA 5FNWA 4YFWA 4AGVA 5JOZA 2GMEA 4HR6C 2SLIA 2EALA 3FJEA 1J0SA 4D0TA 4BMEA 2W39A 1VLNA 1O4YA 3CRHA 2X2TA 5KXEA 1S0IA 4DFSA 4KBBA 4YZ1A 3ZYPA 2ZGTA 4HANA 4ISQA 4KC3A 1AVXB 3AP9A 4JPZA 2KH2A 3AYAA 4Y1YA 2NZ9A 2VUAA 1YRZA 1G9BA 3AJYA 4XFSA 2ZGRA 2YXSA 5D61A 4JRAA 3AYEA 4DQAA 3V0AB 2R16A 1Q8OA 2Y9WC 5EC5A 3CQAA 2D6LX 4DEPA 5DUXA 4A7KA 4I1EA 3I29B 5FZYA 2BEBA 4X39A 1PC8B 1V00A 4NOTA 1TOOA 1QKQA 4PBOA 1V6WA 2A7AA 1GZWB 2D7FA 4J23B 4ZFYB 3AP4A 3NWKA 1ONAA 1FATA 3CA6A 3FJFA 4XJZA 3IM5A 4FPEA 2GO2A 4XE9A 5F90A 3BA4A 1LOFC 1WBLA 1LESA 1YO8A 3D4KA 1LCLA 5H9SA 3AZVA 5DZGA 1TTUA 3RS6A 4AVTA 2FHRA 4DCKC 3SH4A 3OY8B 1UKGA 2A6WA 4ZKTB 2AR6A 2EXHA 4G6JA 2ZGNA 2K43A 4LBJA 5IK8A 3FJIA 3PVNA 2D6PA 1H9PA 1W0PA 1YTOA 3OJBA 3OBRA 3N7JA 1KDMA 3AP6A 2Y9FA 1UAIA 1P63A 1IS5A 1YYNA 3I2AA 3T2TA 1QXMA 4SLIA 1FYUA 2WQZC 4JAWA 3ZSLA 4J2SA 1O4ZA 3MALA 2FMDA 4QO3A 4DRRA 1LU2A 2W68A 3PG0A 1W6PA 3WDVA 3M3OA 4LO3C 4P0KA 3ZXKA 4AVSA 4JKQA 4I30A 2YUGA 1I1BA 3ZC8A 3IKWA 1AVAC 4OWJA 1N3QA 1ULCA 3WCRA 3A4UA 3P53A 3NBCA 1RITA 1JT4A 3ZVXA 5IK5A 2VW0A 2J3PA 3UJOA 4XJUA 1AX1A 1ULGA 1F9KA 3VKNA 4XTPA 4HL0A 4GA9A 3POYA 1IS3A 4P14A 4WVWA 4C1WA 1HWPB 2DVBA 2ZACA 1AVUA 1G9FA 2V73A 1CR7A 1LOFA 2CWSA 4YFZA 5I1BA 1CESA 5BXTA 4PC4A 2K4AB 1G7YA 1AJOA 1FV2A 3RMYA 1LGBA 3WUCA 1MR5A 1SBFA 2AYHA 3WG2A 3INAA 3SNMA 1DZQA 1G8WA 1SR4C 3IIRA 1MS1A 1MC9A 2YZ4A 3OGFA 3SH5A 2ZHKA 5JVVA 2ZGKA 1S1AA 1DQ4A 2D24A 2FO1A 3IN9A 4DENA 3GALA 3I4IA 3N36A 4OEGA 3V79C 1TP0A 1AXZA 2PHXA 4FVVA 1T9FA 4LO0A 1J1TA 1MS9A 4YW2A 4GP3A 5IK4A 4Y1XA 2ZZJA 4WBCA 4LO8B 3WUDA 3UJ4A 1CVNA 41BIA 1ISVA 3WDXA 1WD4A 2GMPA 5BQUC 1L2HA 3U4XA 4LO7C 2X2SA 4LO3A 4YM0A 2E53A 3OJ2A 1S0EA 2GZBA 1FMMS 1KDKA 3POKA 1IS4A 5DZEA 1SLIA 1SFYA 3OYWA 1W6PB 1FNZA 4AGGA 3S8KA 3K1XA 3ZXJA 3O0WA 1BXHA 4XJ8A 2D7IA 4ZA3B 1Y7BA 5EYYA 3HN1A 1CPMA 4K1YA 4P6AA 3WA1A 4I37A 1C1FA 1DQ5A 1FMZA 3T1LA 3WZ1A 4ATFA 1EVTA 1LECA 3APBA 3HSMA 3O44A 2JE7A 2OVUA 2JJ6A 1MZ6A 1ISXA 2B7YA 3WLUA 3MEPA 5D62A 4I4SA 4P9XA 1SR4A 3F1RA 1MS4A 2AQZA 4G1RA 4ZGRB 3M3CA 1Q03A 1LEDA 2MIBA 2C5DA 1F31A 3VSFA 5IK7A 4HJJA 3AKIA 2YY1A 3SH3A 4EB2B 3ILFA 1YF8B 2VSEA 1AX0A 3BRGC 1WW6A 1EYLA 4QBVA 2V5YA 2ERMA 2Q9XA 1S0LA 3AZXA 3JUTA 1JN2P 1JBCA 4DS0A 4EEEB 2HYKA 1Q04A 3AX4A 2NMOA 5HCFA 1GKBA 1CN1A 3L2YA 2SBAA 1D0HA 5BQUA 1WLWA 4JCKA 3O0VA 1MVEA 3H6RA 1V6XA 3AK0A 3UDAA 1JUIA 2D44A 1FWVA 4M3CE 2QN4A 3PJQA 2JE9A 1CONA 1FGAA 3VKMA 4Y1VA 2ZQOA 4ZBVB 1RY7A 3UK9A 1DFQA 1SBDA 1JYIA 1ENSA 2WSUA 2ZGSA 4KEJA 4DRVA 2AFGA 1YXWA 3TC2A 1RIRA 1S0BA 3RSJA 3CU1B 5DUUA 5CB7A 4M01A 4LBQA 3FLPA 3KM5A 1RZOB 3WMUA 4Y1ZA 4OEFA 5LK5A 3OYWB 4YM3A 2VU9A 3PVEA 4Y1UA 3H6QA 3ILNA 1BLAA 3CA4A 1HCEA 4XFUA 3B9UA 4GOYA 3V65A 1LGCA 1FN0A 2RHPA 4JP0A 1JQZA 1BASA 2AH2A 2FDBM 3WDUA 2DVDA 3BA5A 3BADA 3VT1A 1DQ0A 4IY8A 1TWMA 1SLCA 5T54A 1AJKA 3W9TA 5JMCA 3N7LA 4D8HA 2ZQNA 5GLZA 1G9CA 3FLTA 4G6MA 4AGRA 2LIQA 5EG6C 3R4SA 3WDWA 4QD2C 3WHUA 4I4RA 1PUMB 1LHWA 3FJCA 1AF9A 3FJHA 5BP5C 1VIWB 2KI6B 2I2SA 3NJ5A 4ITCA 1KRIA 2BFHA 4WVVA 1LOCA 1JT5A 2VXRA 3WCSA 5FRAA 2NM1A 3O0XA 1W0OA 2Q5TA 1JXNA 4XHXA 1QF3A 1PZZA 4LBMA 1ITBA 2D22A 4XDQA 1UZZA 3H6RB 4LO7B 3QR5A 2PELA 2GMMA 4G9MA 4F83A 5GAQA 4I4OA 1HKDA 3BAOA 4FPCA 2DRYA 3CRIA 1PZ8A 2DTWA 2D1ZA 1QQKA 4I0YA 1I3HA 2W52A 3ZSMA 3PHZA 2KM2A 1XYFA 1V6LA 4P9YA 4YZ2A 5HCBA 2ZGMA 1XQNA 4BPZA 5DSSB 2WJSA 3HOMA 5D63A 2AXMA 2CNAA 5H9QA 4LBQB 3VKFC 2DU0A 4YZ4A 2D3SA 5JLVA 4JC1A 1JLYA 4ZFUB 5KXDA 2ZR1B 6I1BA 3BOPA 1C4RA 1Z2VA 2I1BA 4FPHA 1GNZA 2DVAA 4Q27A 1PZ7A 4YW1A 1MS3A 5FNXA 3N7KA 3SITA 5F8SA 3RG0A 2A3YA 1BQPA 5EYXA 2AAIB 2WKKA 2HZ9A 1QOSA 1DFCA 1KQRA 1Z0HA 1N47A 1SLAA 4TLPA 2DWRA 5KXBA 5T52A 4A7YA 3WNXA 2GNBA 4I4XA 4YM1A 5H9RA 2XB6C 4I8MA 1BKZA 3VUOA 2ZGLA 4AN6A 5BP5A 2PHRA 5DZUA 3I2XA 2Y9XE 4Q9GA 3S8JA 2IHOA 4CJMA 3KMVA 2A5ZA 3VV1A 1E0OA 1JT3A 2NVHA 5EXOA 4PBPA 4Q8KA 4TZDA 1HCDA 3CA5A 3D5OA 1JW6A 4XBLA 2EAKA 4YZ3A 3H0OA 4K1ZA 4IZEA 1LGNA 1MS8A 4OZXA 3RTIB 3C9ZA 1KJRA 4C1XA 3MW3A 1KJLA 3A23A 1W6MA 3Q7XA 2AGSA 3WO3A 1CJPA 4XBNA 2AREA 1QMJA 1R1ZA 1AXYA 3UD8A 2GN7A 1I1EA 1LJ7A 3O4OA 2ZHMA 2D20A 5GZCA 1AX2A 2E51A 4I4UA 4GWMA 1WCSA 31BIA 3PUBA 2GALA 3W58A 2NMNA 1QQLA 2RQ9A 2DUPA 2TEPA 4UW5A 1OFSA 1FAYA 3W59A 3LTQA 1UZYA 2JECA 4FPLA 1W6NA 3WO4A 2HW9A 1V6KA 4FPYA 3FGMA 3LCPA 3ZXGA 3UD9A 1BA7A 3D7WB 1WW5A 2E7QA 4GKYA 5IT6A 3AP7A 4CRQA 2GNDA 3C2UA 4G9NA 3O4AA 3IM6A 4AYUA 3CA1A 2IWTB 3EF2A 1ULDA 4JKXB 1W6QA 1NLSA 4YW4A 2KKIA 3MW4A 4GAFA 4H9WA 4ASMB 1N1TA 4QD2B 1CPNA 5EWSA 3HBWA 4I4QA 3AXDA 3V0BA 4HA2A 5KXCA 3WG3A 4BLIA 3FUOA 3N7MA 1URXA 2PHUA 1ENRA 2BEAA 1QDOA 2OUHA 4ISRA 4IHZA 2DUOA 2GN3A 5E24E 1VCLA 2VXTI 1Q1UA 4AWDA 1MVQA 2D6NA 4CZSA 5AVAA 1QGLA 1LTEA 4RL7A 4IONA 1NXD1 4Z8BA 1UMZA 1FWUA 1F5FA 1ZM1A 1DLLA 5E88A 1MS5A 4QBCA 4M3CA 3SNVA 5DXDA 4J2XA 3O12A 4FP3A 1SCSA 1ISYA 2C9AA 1W6MB 5BYNA 1G86A 2P34A 4M3CF 4WZFA 3QLQA 3AKFA 1MD6A 8I1BA 3FLRA 5H9PA 1DYPA 3NBNA 3VT0A 1N1VA 4U36A 2ENRA 1BJQA 4FPGA 4PQ9A 2WT1A 4FP2A 3TB0A 1S0CA 3BAUA 4OW4A 1IKQA 4KEKA 2M49A 4D0ZA 3AH2A 4BLJA 4P0LA 3ASIA 1W6OA 3WDTA 3V64A 3ZSKA 4GOVA 1LOAA 2ESUA 2VLCA 2DV9A 3FJDA 1W6NB 1ABRB 1Q8QA 3ZXFA 2R0HA 4R9BA 5GM0A 2A3WA 1GV9A 4P9WA 2LTNA 3Q7YA 3DGTA 1OKQA 3IMNA 1MACA 2UURA 2L5XA 1D2SA 2DUQA 3FJKA 4LO2C 4LBKA 3O4BA 4J2KA 1RG8A 1C57A 4F34A 1QNYA 2OW4A 1H9WA 1K5VA 4H04A 5GZDA 1IJTA 1ONKB 1G9AA 1W6QB 1ULEA 2CL2A 1TWEA 2ZGOA 4Q26A 4YGEA 2FFVA 3P6JA 2DTYA 3V0BB 1UL9A 1NUNA 2A70A 3FJJA 4L4HA 1VAMA 1BFFA 1A8DA 4XXAA 1JHNA 1SBEA 5T5LA 1U0AA 4LBNA 1N4KA 3FJAA 1XZZA 3VKLA 2VY0A 1LENA 1DIWA 3D6EA 1JTCA 4ZXKA 4XTMA 4BOWA 1A3KA 1AVWB 2HWAA 4M3CB 1GSLA 4IQPA 4OUJA 3Q9OA 3BTAA 4ENDA 1KNMA 1UPSA 1SZ6B 3CAHA 4L8QA 3NV4A 2P39A 1WLDA 1PUUB 4Q9PA 5BXRA 1HQLA 1Z78A 2UUSA 4MYEA 2OUJA 1DQ6A 2CTVA 1IOAA 3UJQA 4I6IA 2CY6A 3R05A 2ARBA 1JYCA 2JD4A 4GWNA 1GNHA 3BA7A 3ZC9A 2ES3A 1KITA 1EV2A 3CNAA 4FQZA 3OBTA 5T50A 4ZLBB 2YV8A 4NO4A 3VT2A 1BYHA 5DG1A 5GZFA 4XIOA 4FPJA 5JDBA 3FJ9A 2WSVA 1DQ1A 2G4IA 1ZA4A 3M3QA 3DUIA 2A6VA 1DQOA 5BXSA 1W6OB 3Q7WA 3LLPA 2R9KB 4P0JA 1LOGA 4Q2FA 4Z9WB 1GYKA 4XBQA 3VEQA 4YGBA 4R9DA 3UD7A 1M16A 3BX1C 1CIWA 4LO2A 2NTDA 1AXMA 4FOWA 3WINC 2CWMA 3AH4A 4RA0A 2WT2A 4Y20A 2P23A 3PVOA 3NV1A 4Y24A 1G9DA 1DBNA 2DU1A 3AXEA 3AJ5A 4I1BA 2UWAA 1HLCA 1PWAA 2ZGQA 2ZBJA 3AYDA 4YGDA 1EPWA 2ZHLA 2AENA 2D7RA 1SCRA 2A6XA 2WBCA 1AVBA 4I4PA 2ZGUA 2ARXA 1IHKA 4ZFWB 3I8TA 3O5SA 3OPZA 2WLQA 21BIA 1DZCA 1B09A 1SLLA 1BZWA 2D43A 5E89A 5F9TA 3JRRA 2QYIB 1GICA 3LSEA 3AJZA 3E8LC 3A07A 3BAVA 4X3AA 3AKHA 1VALA 4XIKA 4FGFA 4XMIA 3BRDA 1W3AA 1LOEA 1RINA 2DVGA 5E8AA 2BQPA 4IYBA 3M1HA 4YGCA 1DQ2A 3O49A 1GZCA 1Z4SA 5FZUA 2GDFA 4EFRA 3O3QA 1C1LA 4H55A 3FJ8A 4LO1C 3ZXEA 4XZPA 1R8NA 1ENQA 2MLLB 1V6NA 3NBEA 1LULA 4QKRA 4YLZA 1IRPA 2AUYA 4I96A 1JY0A 5CNAA 1M2TB 3POSA 3B3QE 2D6OX 4Q91A 1IILA 1WBCA 2Z48A 4CTEA 4Z8SB 3B9CA 5GALA 1Q56A 3OJVA 2CYFA 2DYCA 1LOBA 4K20A 1FNYA 5GLWA 3WINA 2VW1A 4Q8LA 3IAGC 3RTJB 4I2SA 2EXIA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2VXRA

Total Genus

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