2NM1A

Structure of bont/b in complex with its protein receptor
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
436
structure length
430
Chain Sequence
SEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTEPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin B recognizes its protein receptor with high affinity and specificity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin,hydrolase
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
total genus 103
structure length 430
sequence length 436
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2006-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2nm1A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2nm1A02
4JRAA 1G82A 1EV2A 1BZWA 1N3PA 4I4XA 3AJZA 3TB0A 4WVVA 2CTVA 3N36A 3FJFA 5DSSB 4F34A 1AXZA 4Q9GA 2ZACA 3OJ2A 3AYCA 3WVJA 4M01A 1ITBA 1LHNA 3WCRA 1AVUA 2V5YA 3KMVA 1OQ1A 4UW6A 2VXRA 3UD8A 3DUIA 1SR4A 1LULA 4P0KA 3A23A 4IZEA 3TC2A 1LECA 2EXHA 3FFZA 4FP3A 1A3KA 3NV1A 3Q7YA 1FX5A 4BM8A 1EPWA 3AYEA 3BODA 1VLNA 4EFRA 4I4YA 1GANA 2D1ZA 1AJKA 3IN9A 1CN1A 4L4IA 2JD4A 3ENRA 2ZABA 1QU0A 3EF2A 1ISZA 4FOWA 3W58A 3AJ5A 3UJOA 4P9YA 1LOGA 2GO2A 9ILBA 1ABRB 4LBOA 4GALA 4EB2B 3VT0A 1UL9A 4EFQA 1FATA 4RA0A 4XJWA 1OKQA 2WLQA 5SV8A 3AKIA 5FZYA 1WBCA 2FO1A 3T8SA 2A3WA 3WZ1A 1JT4A 4Y1XA 3N7LA 2FFUA 3CAHA 1ULEA 2DVDA 4BMEA 1DBNA 5GLUA 4YG6A 4FQZA 5T5PA 1K5UA 1LTEA 1C4RA 4G9NA 1LGCA 2LTNA 1QOOA 1AX0A 4WVWA 1V6KA 1ISWA 3AKHA 5T50A 3WG1A 1WD4A 1LEMA 1KITA 5E8AA 3VT1A 2DYCA 1MVEA 1XQNA 4FVVA 3JUUA 1CONA 2ZQOA 3OJBA 3NJ5A 2DVAA 1W6QA 4X39A 3BRDA 3USUB 2WQZC 5DZUA 1AFCA 6I1BA 4F83A 1SLLA 1N1YA 1TOOA 1TFMB 1ISVA 3O0WA 4BMBA 1YO8A 4GKXA 3V79C 1AVBA 2ZAAA 1LHWA 4FQ4A 2D3RA 4FGFA 4FPHA 3CNAA 3O5SA 2GALA 2Y9XE 2ZA9A 2XOAA 2ZGUA 1FV2A 2WRYA 1LJ7A 3CA3A 1URXA 1U0AA 2CNAA 1AVXB 1ULGA 1IILA 4OWJA 4YG3A 4BPZA 2YY1A 5E88A 1ILR1 4GWNA 1YI7A 1JOJA 1HLCA 1ZA4A 2ET2A 5CA6A 5E24E 8I1BA 2ES3A 3O4BA 1UPSA 1AX2A 2GDFA 2ZMLA 2HW9A 1OQLB 2P23A 3IM5A 4R9AA 4YZ1A 2DS0A 4LO0C 3POKA 5EC5A 5FNXA 5DZFA 1JYIA 3OYWB 1Q8VA 1RY7A 4Z8BA 1V6WA 1WLWA 3POYA 4XZPA 4YW1A 1L2HA 4ISRA 3SITA 2D7RA 2H0BA 4LO7C 1G9FA 1IS6A 3I4IA 2ZGRA 1BARA 3AZYA 3NV2A 1DZCA 1W3GA 2NN8A 3H0OA 2VXTI 4DS0A 5JOXA 5JVVA 3OPZA 3WDYA 1GZ9A 1DYPA 2EF6A 4XHXA 1TEIA 3HSMA 4HR6C 3IMNA 5EYYA 3AZVA 4Y22A 3OJMA 1S0FA 2PHFA 4YGCA 5GZEA 1GICA 4SLIA 3FJ8A 3V64A 4AWDA 3N7JA 1NXD1 2Z49A 4FPFA 2VW0A 4TLPA 2R0HA 3IM0A 2R16A 3M3EA 4I4QA 3RMXA 5D62A 1C1LA 5T5LA 1KJLA 1HCEA 4OWKA 2YUGA 1FN0A 3PHZA 2DTWA 1B09A 2AXMA 3ZSLA 3QLQA 2Y9WC 3R4UA 2SLIA 3HN1A 2OVUA 4LBQD 1BFFA 4LO1A 4FOYA 4UW3A 1DIWA 3AYDA 2WBCA 4GP0A 2P3IA 3ZXJA 2A3YA 4IONA 3M3CA 4JP0A 1Z4SA 2A6YA 4AVTA 1ONAA 1JY0A 3N3HA 3WO3A 4U2AA 1LOFA 2UWAA 5IK5A 1DGLA 1JLXA 5BXTA 2JE9A 1F31A 4XMAA 1GGPB 3SNVA 5IK4A 3WOGA 2BEBA 4FPCA 2P39A 5EXOA 1DZDA 3BB2A 1LESA 2FDBM 1Q8QA 3LCPA 5FZZA 1DZQA 4YM0A 3AZWA 4QKSA 3O4AA 5T5JA 3BTAA 3L2YA 1BLAA 3WNXA 4EEEB 2ARBA 3ATGA 2A70A 1GYKA 4OEEA 2D6LX 3MALA 41BIA 1ENRA 2KM2A 2D6NA 2JECA 1IOBA 1SR4C 2R49A 2L5XA 2C9AA 3UD9A 2DVGA 2WNEA 4P9WA 2WSUA 5B2HA 3FJ9A 4GKYA 3ZXLA 4M3CF 2DVFA 3IPVB 4GAFA 1UX6A 4QC4A 1NUNA 2HWMA 3TAYA 4Q26A 2IWTB 5JOWA 1FNZA 2Y9FA 1O4YA 1Z0HA 5DG2A 1UKGA 1JN2P 1IKQA 3VKFC 3ZX7A 4EFPA 1R8OA 1V6NA 4DPNA 2AGSA 1G9AA 3O3QA 4Y20B 4P0LA 3UJ0A 5T54A 3WA1A 2A6XA 4XBLA 4UW5A 5GALA 2ZGOA 5H9PA 4NO4A 1DYKA 1H30A 4FOVA 2K43A 4Q2FA 1DQ2A 1SLAA 3CA5A 2WT0A 4AGGA 5E89A 4XJ8A 3ILFA 4OUJA 4GP3A 1M16A 4D0ZA 4J23B 1SBEA 1YTOA 3VV1A 3FJCA 1GZCA 3CU1B 4GA9A 2NMNA 3ZYRA 4YZ3A 4ZXKA 5I1BA 4H04A 1N4KA 2PHWA 4BOWA 4JKQA 3GALA 4AGVA 3AJ6A 1KQRA 1FWUA 1HWPB 5F9TA 3H6QA 3FJJA 1W6OB 1F5FA 1CVSA 4FPLA 3SNMA 2OW4A 2WJSA 2JDZA 1A8DA 1M2TB 3JU9A 2GNTA 4DENA 1V6IA 5DUWA 4TYSA 2Q9XA 3IM7A 3NBDA 1NZKA 5FREA 2GNMA 3USUA 1C57A 3NV4A 3VUOA 3PVEA 2A75A 4DRVA 3AYAA 1FGAA 4XE9A 3Q7XA 4P6AA 3A22A 1CPMA 1G86A 3E8LC 3WHTA 2PELA 3BRFA 4XTMA 2D6OX 1Q56A 4J2XA 1PZ8A 3BAVA 2Z42A 1JT7A 2NYYA 3AKGA 1MS5A 3INAA 1RZOB 2TEPA 2RSTA 1I1EA 1SCSA 2PHUA 3MW3A 1BLDA 4C1WA 3ZC8A 4QD2B 1LHVA 4ZBVB 5EHAA 1GKBA 2VW1A 3D4KA 2UURA 3FLRA 3KM5A 4Y24A 1X50A 4MYEA 3K1XA 2J3PA 1V00A 5IT6A 2P3JA 4K1ZA 4YZ4A 1JYCA 1G8WA 2F8XC 4K20A 4A7ZA 2GNDA 3CRHA 3QR5A 3BAGA 4GOVA 2FGFA 1IRPA 3LLPA 4I30A 3PMEA 3W59A 1FQ9A 4D69A 2YMZA 1S0JA 5DG1A 3FLTA 3UD7A 3BADA 2HZ9A 1S0CA 3ZSMA 2NTDA 3AKFA 21BIA 3WHUA 5F8SA 3O5WB 4WV8A 3Q9OA 2D7FA 2OUHA 2UU8A 4AYUA 3KQRA 4GAIA 2MIBA 1SACA 2ZGPA 3AH1A 2DU0A 4M00A 2VH9A 1S0IA 4LO1C 1SLIA 3S8KA 2CYFA 3UK9A 4OWLA 1Q04A 3P6IA 2WKKA 2WSVA 2ZR1B 4TZDA 2CL2A 2EAKA 1SZ6B 3ZPYA 1EVTA 4DRRA 5CAZA 2R1DA 1SLBA 3IM6A 3NBEA 1WW7A 4LBQB 1DJSB 1LOFC 1K5VA 3N0KA 2R0FA 4U36A 2NMOA 2ZHNA 4ATFA 1SCRA 2AFGA 1APNA 1G9CA 1VIWB 4IHZA 3SISA 1WLDA 4L8QA 4HA2A 1QNYA 1VCLA 1CJPA 1BYHA 3FBYA 3HOMA 4YGEA 4FOQA 4KEKA 3ZC9A 3JRRA 4I7IA 4FPOB 1RG8A 1LEDA 1S0EA 3F62B 1DHKB 3MPPG 5KXDA 1LOAA 2BFHA 2HYKA 1ULFA 4X3AA 4WBCA 1GV9A 4ZLBB 1S0DA 1JUIA 1YYNA 1BJQA 1MZ6A 2ZKNA 4P9XA 3FLPA 3T1LA 4JKXB 1V6XA 2ERMA 1BFGA 2IHOA 3BX1C 3SLIA 4IY9A 2MLLB 1LCLA 1P63A 3U4XA 4W65A 3A0KA 2Z48A 5HPZA 3WDWA 3FJHA 1PZZA 3A07A 4Q1PA 3OBRA 1AF9A 31BIA 1N3QA 4KBBA 3MW4A 3IPVA 2D22A 5EWSA 4ZA3B 4KEJA 5F8WA 1GLHA 1MS1A 2AENA 2UWCA 4J2YA 3AZZA 1JHNA 1IT0A 3A0NA 3OBTA 2VY0A 7I1BA 2XB6C 3WUCA 3WG2A 1V6JA 4I4RA 1BQPA 2ZHLA 4FPEA 4YGBA 1QNWA 4XJUA 3FJIA 5D61A 4PQ9A 4J2SA 4Q9PA 4Y20A 1TIEA 3O0XA 4CTEA 2Q3NB 1RMLA 1LOBA 2E51A 5L73A 4JQ0A 4ZFYB 4YW5A 4AVSA 5BQUC 3WO4A 3PG0A 4JAWA 3B00A 3HR9A 1DFCA 2UUSA 3H6SE 3V0AB 1GNHA 1EYLA 2ZMKA 3ILRA 1QMJA 3T2TA 2NP0A 1R1ZA 2ARXA 2K8RA 1ENSA 3BA5A 5BVPI 1FV3A 2ZGQA 5GM0A 3C2UA 4YM1A 2KLLA 2D43A 1G7YA 1LGNA 5FZUA 2P37A 2EALA 1W6OA 3WLUA 1ULCA 5BP5A 2P3KA 4DCKC 4QKRA 3CRIA 1SBDA 4XJZA 4WZFA 3NV3A 3I2AA 3HALA 3WDXA 3B01A 4XXAA 1DQ4A 1UZYA 2EXKA 4DQAA 2A6VA 1QXMA 2ZGTA 3UL2A 4QBCA 5AVAA 3OGGA 3A21A 3R05A 2NZ9A 4C1XA 2A71A 3ZXDA 4QBVA 3OGFA 1QOSA 4YFWA 2E4MA 1WD3A 5GLVA 2I2SA 2XG3A 1MS0A 4ENDA 1AVAC 3BAQA 2QN4A 2CWSA 2DRZA 1IRAX 1S0LA 1KJRA 1W3AA 3AP7A 4ITCA 5GZCA 1I1BA 2C5DA 4XFUA 4LBNA 2W52A 3CA1A 2KH2A 1ONKB 3POSA 1C1FA 2X2SA 2A6WA 4Y1UA 3FJAA 4LBMA 2E7TA 1KNMA 2D6KA 1AXKA 4M3CB 2X2TA 4LBLA 3I8TA 2YZ4A 1QDOA 3H6RB 3O44A 1HKDA 3WG3A 3OJVA 4YM3A 3AP6A 1W6PB 2E7QA 1SLCA 3GNEA 4GXLA 5EYXA 1UZZA 4LO2A 2ZHKA 2DRYA 3RRDA 3M3OA 1RINA 4X38A 2R1BA 3POWA 4XDQA 3WDVA 4Y1YA 3WINA 5DUYA 2ZHMA 4ZOTA 5IK7A 3AK0A 3HBWA 1PUMB 1XHBA 5HCFA 3MW2A 4LBKA 1CESA 2LIEA 1J0SA 2BQPA 4ZFUB 3VKOA 1LU2A 4IYBA 2UWBA 1TP0A 1DQ1A 2ZBJA 2HWAA 4R9DA 1ULDA 3RQ0A 2KKIA 4IY8A 3ZSKA 1W6MB 3VT2A 1FWVA 5CBLA 3NWKA 3WDUA 2DUQA 4ZKTB 1WBLA 4J2KA 1IHKA 1PC8B 5F8YA 1TTUA 2G4IA 1MC9A 5DZEA 4HL0A 5H9SA 4JPZA 2A6ZA 3CRGA 5BQUA 1QKQA 3ASIA 2AAIB 1TWEA 1FAYA 2VSAA 1H9PA 5KXCA 3I29B 1WCSA 1T4QA 1W6NB 2GN7A 2FHRA 1IKPA 1A78A 1UAIA 3APBA 1HKNA 3HMYA 1Q8OA 1MZ5A 4LBQA 1GBGA 2A7AA 2DWRA 1IOAA 4BLIA 4D8HA 5FRAA 4I0YA 4XFTA 1JXNA 3D6EA 4I4OA 4BQ1A 1R8NA 5T5OA 1JT5A 2ZGKA 1BFCA 1WW5A 2ERFA 3NBNA 4YG0A 3FJKA 3SH3A 4XBNA 1LHUA 3AXDA 4D0TA 1CPNA 2ZGLA 3AZXA 4Z8SB 2AUYA 4Q8LA 1CVNA 2ZGNA 1QDCA 2YROA 3M3QA 4XYXA 2JE7A 5FNWA 5F5QA 5HCAA 1J1TA 3PJQA 3B69A 2VU9A 1WLCA 2M49A 3AJYA 3CA4A 3VEQA 4UW4A 1BASA 1BKZA 5H9QA 4YFZA 4YGDA 1O4ZA 4XJAA 2VW2A 3O0VA 5JOZA 4II0A 3LSEA 1WBAA 1NLSA 4R9BA 2ZQNA 4A7KA 4FPYA 1CR7A 1GZWB 4K21A 1HDKA 2D24A 2K4AB 3OYWA 3BIWE 1MS8A 4I2SA 4Y1VA 3AH4A 3ILNA 5KXEA 2LIQA 1D2SA 1W0PA 5D63A 3QYDA 4HJJA 4GOYA 2F2FA 2D44A 4L4HA 2JJ6A 1VAVA 2AQZA 3BAOA 5JDBA 5BXPA 1DQGA 2D23A 4FPJA 2NVHA 5F90A 3WV6A 4G9MA 4R9CA 2NM1A 4YM2A 1YBIA 3RSJA 4PF5A 4YW4A 1S0BA 1CIWA 3N7MA 2CWMA 4FPGA 3ILAA 4I1EA 1N3OA 1BFBA 1LU1A 1Q8PA 1AZDA 1ISXA 3V0AA 1V6LA 3ZYPA 3JUTA 4XTPA 3ZVXA 2DURA 4LO7B 5HCBA 3V0BB 2PHRA 2B7YA 1V6OA 2WT1A 5BP5C 2PHXA 1SBFA 4M3CE 3IIRA 3WUDA 3MEPA 2GZBA 2EIGA 1AXMA 3D5OA 5DUUA 4OEGA 2DV9A 5JOYA 4ASMB 5JLVA 1IS3A 1KRIA 4YW3A 2GMEA 2ZGMA 4I8MA 3DGTA 2E4MC 4GWMA 2KI6B 4XKIA 1JT3A 4Q1RA 5BOWA 5DUXA 1ZM1A 4AGRA 2R9KB 5DUVA 3P6JA 1I3HA 3B9CA 4CRQA 1MR5A 4LBJA 3PVNA 4DEPA 3PUBA 4G6JA 3AX4A 3BRGC 1JW6A 1V6MA 1DQ0A 1FMMS 4IZXA 1DQ5A 3T1MA 2EXJA 4BLJA 4CZSA 4LO8B 2P34A 5T55A 2GN3A 4CJMA 1LENA 2VSEA 3WMVA 3OY8B 3CA6A 4QD2C 4XOGA 5JMCA 1HWMB 4LO2C 1AXYA 3ZSJA 4JC1A 4XMIA 4OW4A 4YOLA 4M3CA 3CA0A 1Z78A 2GMMA 1LOCA 3WINC 3H6RA 2I1BA 4LO3A 3UDAA 2Y9GA 1W6PA 4G6MA 1MS9A 4Q8KA 3AP5A 1N47A 1F9KA 1XYFA 1JLYA 1HWOB 4JCKA 1HWNB 3M2MA 3VWCA 1V6VA 3ZXEA 4H9WA 3V65A 3VKNA 1QGLA 1CE7B 4ISQA 3LTQA 4I6IA 3FUQA 2D3SA 1G9DA 2DVBA 1MS3A 4I4VA 5DXDA 3BOPA 4YZ2A 1AX1A 1G9BA 3M1HA 3UJQA 4XILA 5DZGA 1N1TA 4PBPA 1AJOA 5DVHA 1S1AA 4Z9WB 2VUAA 1S0GA 1JBCA 2GMPA 1W6MA 5BYNA 2E53A 4AVVA 2SBAA 1VALA 5IK8A 3BAHA 3B9UA 5KXBA 3IKWA 1QF3A 2Q5TA 3AP4A 2VLCA 4I4SA 1II4A 1PZ9A 4A7YA 1MS4A 1PZ7A 2D6MA 2D7IA 4XJ9A 3O49A 4PC4A 2OUJA 1YXWA 2D3PA 1W6NA 3RMYA 4XIOA 1Q1UA 5CB7A 1BA7A 5BXSA 1DQOA 4Q27A 1RIRA 4ZFWB 2RQ9A 3BA4A 3WDTA 5GAQA 1Z2VA 1JTCA 5IUQA 1DQ6A 3SH5A 1DFQA 1FMZA 3N7KA 2PHTA 1HQLA 3RTJB 4K1YA 1SLTA 5GLZA 1N1VA 3VKMA 3Q7WA 1UN1A 1N1SA 5T52A 1W6QB 1HQWA 4Q91A 3S8JA 4QALA 4RL7A 2MC2A 4DFSA 4USPA 1WW4A 4I96A 1LODA 3WG4A 5GLTA 4I1BA 5H9RA 1WBFA 2D20A 1FNYA 2RHPA 4I37A 4I4UA 2RG9B 1LHOA 3WMUA 4XXPA 4AN6A 3AFKA 2W68A 2FFVA 1HCDA 2LALA 2P2KA 1W0OA 3O4OA 2CY6A 4YW2A 3RS6A 2YXSA 3IAGC 1HIBA 4Y26A 4QO3A 4R6UB 3VSFA 2F2FC 3I2XA 4FPKA 1GZWA 4G1RA 4YLZA 1FYUA 4P0JA 1SFYA 2KI4A 5GJ6A 1WW6A 1YIFA 3P53A 2W08A 4HANA 4PBOA 1YF8B 3RG0A 3FGMA 1IS4A 4EKXB 1DLLA 4OZXA 1QQKA 2A3XA 2ESUA 1KDKA 2WT2A 3B3QE 3QCWA 2DUOA 1QQLA 2DUPA 4XFSA 2DTYA 3FUOA 2YV8A 1MVQA 2FMDA 4LO0A 4P14A 4XBQA 3LSDA 5GLWA 5G00A 3VKLA 1KDMA 4XIKA 1VAMA 2AH2A 3F1RA 5GZGA 1IS5A 2AYHA 3R4SA 4ATEA 3FJDA 3WCSA 4NOTA 3FJBA 4Y22B 3V0BA 2W39A 2DU1A 2BEAA 2EXIA 1PWAA 1PUUB 1QOTA 4OEFA 2A5ZA 4KEIA 3O12A 1XZZA 5EG6C 1Q03A 1Q8SA 4USOA 1GSLA 3PVOA 4FP2A 4I4PA 3VSZA 2ZGSA 4I3NA 4ZGRB 4X37A 1AVWB 1CQ9A 1GNZA 3AXEA 4AN7B 5GZFA 1RITA 4KC3A 3O4CA 3AP9A 1LGBA 1LOEA 3ZXGA 3D7WB 1BXHA 2GNBA 2AREA 3FJEA 3N35A 3BAUA 2ZMNA 1MACA 4IQPA 3W9TA 3ZXFA 3WO2A 3NBCA 3CQAA 1V6UA 5CNAA 3AH2A 1TWMA 3RTIB 2D6PA 1T9FA 3O4DA 3ZXKA 2JKBA 5LK5A 3A4UA 1H9WA 3SH4A 4YZ5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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