2NM1A

Structure of bont/b in complex with its protein receptor
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
436
structure length
430
Chain Sequence
SEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTEPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin B recognizes its protein receptor with high affinity and specificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
molecule tags Toxin,hydrolase
source organism Clostridium botulinum
total genus 103
structure length 430
sequence length 436
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2006-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2nm1A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2nm1A02
1ULEA 2I2SA 3ASIA 2EXIA 2R1DA 2DRYA 5D62A 3IAGC 3WCRA 2R0HA 3WG3A 4YW3A 2IWTB 3NBCA 4AGVA 4P14A 3O0VA 4BOWA 3AX4A 4XILA 5CBLA 2CWSA 2Y9FA 3WLUA 1JUIA 4FOWA 4HJJA 1YO8A 4I4UA 4XBQA 1LOCA 4LO8B 3WNXA 4CRQA 2PHUA 2UURA 4I3NA 1F31A 4I4OA 1YTOA 3UD8A 1LHWA 3USUA 5AVAA 2FO1A 1VCLA 1G82A 2DU0A 2UWAA 1V6WA 1EPWA 2D6PA 3U4XA 4HA2A 3QR5A 3IM0A 2P3KA 5GZEA 1WW5A 2CL2A 3SH4A 1ONKB 2WT0A 1O4ZA 1DQ1A 4YW1A 1FWUA 1AF9A 1AFCA 3D6EA 2ARBA 2ZGSA 3NV1A 3CU1B 3IM7A 1CVSA 3ZXKA 2F2FC 1IJTA 1LHUA 4I2SA 3Q7WA 3FFZA 1C1LA 4I0YA 4ATEA 3RSJA 3AZZA 3MALA 4TYSA 1QNYA 3W59A 2D22A 1LOBA 1DZDA 2GMEA 1YI7A 3BIWE 1GV9A 4X38A 1LOGA 1DYPA 3AP4A 3OJMA 4M00A 3ZSJA 4XBLA 1D0HA 3S8JA 4YGDA 3VT1A 4LBQD 1UX6A 1DLLA 2ZQNA 1YYNA 5BQUC 2X2SA 4U36A 2D6OX 4AVTA 1DYKA 3VSZA 4IONA 1V6KA 5DZEA 5L73A 2E7TA 4LO2C 2E51A 3EF2A 3V64A 3LSDA 5KXCA 2Z49A 2Q9XA 3IMNA 2D1ZA 1T9FA 1UZZA 1RY7A 2FDBM 4GP3A 1FV3A 4KEJA 1SBEA 4P0LA 3WDVA 3WZ1A 2R16A 5FREA 1W6OA 1IT0A 2A3WA 4Q91A 3LCPA 4DQAA 1MC9A 4FVVA 2D23A 2FHRA 4A7KA 4J2XA 4M3CA 1R8NA 1K5UA 1U0AA 4IY9A 3POWA 4UW3A 3OJBA 3A22A 1FV2A 1PZ8A 4I8MA 4QALA 2DUOA 2ZHMA 3PMEA 4YG6A 1Q1UA 1IOAA 3BAUA 1LODA 3RRDA 5EYYA 4J23B 1O4YA 1LOFA 4GWMA 4ZXKA 2A6ZA 1HCDA 1QOOA 5EYXA 4M3CF 4Y22B 5T5OA 3BX1C 2Z42A 4M01A 1KITA 3WUCA 3Q7XA 3MEPA 3D4KA 3PVNA 5JOWA 2A6VA 3FJAA 2WRYA 4G1RA 3ZSMA 2D43A 4XE9A 4XJZA 4CTEA 1C4RA 2DURA 1FGAA 1TOOA 2ZA9A 1S0LA 4YW2A 2RG9B 3OJ2A 1A3KA 1SLBA 3UL2A 1URXA 4QKSA 2ZHKA 3CQAA 2CY6A 4ITCA 1W0PA 3KQRA 2FFVA 1ENRA 2A6XA 1CQ9A 2CYFA 2ZGOA 1QQKA 4OEFA 4QBCA 2ZGUA 1HLCA 5FZZA 4OEGA 1HWOB 3AJ5A 2A70A 1BQPA 4Y1ZA 2GALA 2R1BA 3HN1A 2HWAA 2EIGA 3NWKA 1KJRA 3BTAA 3CA1A 2JDZA 1VALA 3USUB 5GZDA 2ZMNA 3MPPG 1LGCA 3IM6A 4R9AA 1EYLA 3WINA 2DYCA 4Z8SB 5BXTA 3PVEA 3ILFA 5BVPI 1G9FA 1ULGA 4DCKC 4RA0A 2W39A 4YZ4A 2DU1A 1GNHA 2P2KA 2WT1A 4EEEB 5EHAA 3P6JA 1LEDA 4YZ1A 3B69A 4XZPA 1A78A 1LOFC 1W6NA 1MS8A 3AK0A 1Q8QA 1SCSA 3RG0A 1AVBA 3WDXA 3V0BA 3FJJA 4GAFA 3OYWA 1S1AA 2JE7A 5GLVA 2ZKNA 4YM0A 1LEMA 2AQZA 2D3SA 3N36A 1HQWA 5H9QA 3SNVA 4WV8A 4R6UB 5JDBA 4Q9PA 2D6LX 3O5WB 3AZXA 5DG1A 3ZXJA 5JLVA 2OW4A 3IKWA 4I30A 2D6KA 1FN0A 1SR4C 3NJ5A 2QN4A 1RINA 4XBNA 1TWEA 5BXPA 1LTEA 3BRDA 3B00A 3HSMA 2MIBA 5GLTA 3B9UA 3IM5A 4YOLA 2PHFA 1WW7A 2DS0A 4J2KA 2FGFA 2EXHA 1GGPB 1FATA 1DBNA 2CTVA 2DTWA 2KH2A 3V79C 3AKFA 3S8KA 3ATGA 1AVWB 5EG6C 3VKOA 1E0OA 4USOA 1SLIA 1YBIA 2KKIA 2KM2A 1V6LA 4WVWA 3POSA 1LENA 2AENA 2XB6C 3T1MA 1IHKA 2ET2A 1FX5A 1GBGA 4OEEA 3ZX7A 1Q8PA 1S0BA 4Q1PA 3N7KA 4FPLA 3HOMA 1W6OB 3BA5A 3O4CA 1PZ9A 4YZ3A 3UD7A 5IT6A 2JD4A 1BJQA 4XHBA 1DQ2A 4JRAA 3T2TA 2LIQA 4M3CB 2NYYA 3MW2A 4EFQA 2C9AA 1JLYA 5F8SA 4D0ZA 4PF5A 4C1XA 1WD3A 1J1TA 4P0KA 3M3OA 4GP0A 1GLHA 1LECA 3E8LC 2ZAAA 1JTCA 4IQPA 2M49A 4KEIA 2PHRA 2AGSA 1LHVA 1JQZA 2AREA 1IRPA 3AYAA 2D7FA 3IN9A 1GKBA 4Y26A 4TZDA 4JKQA 5CB7A 2E6VA 2NM1A 4OW4A 4JPZA 1LOAA 3LTQA 5F8YA 5D61A 4DPNA 5DXDA 1VAVA 2R49A 2XOAA 1IILA 4EB2B 4GOYA 1IS4A 1S0EA 3BAQA 1IS6A 1UL9A 2NZ9A 4LBQB 4I1BA 5KXEA 3IPVA 1WBCA 5FNXA 1YF8B 2DVGA 1KJLA 2WJSA 2EAKA 5IUQA 3BA7A 3T8SA 5DUXA 5DZGA 1AX1A 3N35A 4YZ2A 4XXPA 1W6MA 4Z8BA 3APBA 1KDKA 1PUUB 4LBMA 1JLXA 3DUIA 5T5LA 5T55A 3OY8B 1RZOB 2A5ZA 3KMVA 4Q26A 4Y1YA 4FPGA 3CRIA 3QYDA 5DUVA 4JP0A 2RSTA 5BQUA 1LGNA 1S0FA 1G9DA 1W6NB 1DQ6A 3C9ZA 3RS6A 4X37A 1R1ZA 4BMEA 4LO2A 4AN7B 1IRAX 1DZCA 3V0BB 3OYWB 1V6MA 4LO1C 4RL7A 1FQ9A 1DQ0A 3M1HA 1RIRA 2ZGRA 3A21A 3AP5A 1LULA 3O44A 2ZZJA 4K1YA 1JOJA 5EXOA 3ZC9A 3OGFA 4R9DA 2V5YA 1N1VA 5KXDA 4ASMB 41BIA 3PVOA 2VU9A 5CA6A 1QQLA 1DQ4A 3CNAA 4PC4A 1WLDA 2D24A 1RITA 4BPZA 1S0GA 4YM1A 3UD9A 3JRRA 2LALA 4ISRA 2P3JA 5BYNA 2ZACA 3O3QA 1TTUA 3IIRA 3V65A 3KM5A 2WKKA 2A71A 3VKMA 1FAYA 4GWNA 4IZXA 3PG0A 4IZEA 4LO7C 1G7YA 5HPZA 4I37A 21BIA 2WBCA 1LJ7A 1WCSA 2DUQA 1AJOA 1ONAA 1JT7A 4XTPA 3ILAA 1AVXB 1APNA 3N7MA 2DVBA 1UPSA 3WMVA 4DEPA 2VH9A 4GXLA 4PBPA 1KNMA 3ZXDA 1FNYA 4LO0C 4OWJA 3N3HA 1MZ6A 2OUJA 5GZCA 1EVTA 5T5JA 2GN3A 4Y1VA 1GNZA 1M2TB 4LBNA 4OZXA 3A23A 1W6QA 4BMBA 1SFYA 2D3PA 2PELA 5E88A 4I96A 5GZGA 5DZFA 2DTYA 4IHZA 4I6IA 5LK5A 4ZLBB 4GALA 1ISYA 4GKXA 1Z78A 4WBCA 5GLWA 3A07A 3B9CA 3FJ8A 4FPFA 4Y24A 5E89A 4P6AA 1V6XA 1UMZA 3ILNA 7I1BA 5T54A 3CRGA 1W3GA 31BIA 3FJFA 4F83A 3CA0A 4QBVA 2P3IA 2DV9A 1HDKA 3AJYA 2P37A 1PZ7A 2DWRA 3VKLA 5DSSB 1G8WA 1QMJA 5FNWA 1BFFA 2RHPA 3VSFA 2ZGKA 1R8OA 4J2YA 4YW4A 4D69A 3OPZA 2ES3A 5GZFA 4L4HA 4YG0A 1ZA4A 4DFSA 1JT5A 1DGLA 5GAQA 2P39A 1MS1A 2D3RA 3TC2A 1ILR1 1UAIA 3ZC8A 4BLIA 3UK9A 1MACA 4AGGA 3IPVB 1RMLA 1AXYA 3O0XA 4YFZA 2QYIB 2WT2A 3WA1A 3VKFC 2AAIB 3AXEA 1C1FA 2E4MC 5DVHA 4HANA 4Q2FA 1QKQA 4YFWA 1SLLA 1WUVA 4YM3A 1MS3A 4D8HA 2CWMA 1W6MB 4R9CA 3D5OA 2CNAA 2D6NA 4TLPA 4YGBA 2A75A 4BM8A 3WDWA 1BZWA 3FLTA 4LBQA 1SR4A 3FLPA 4L8QA 2KI4A 1CESA 1AZDA 5E24E 3I8TA 2NMOA 1XG6A 3F62B 2GNBA 4WZFA 1LCLA 1P63A 2MC2A 3FJIA 1ZM1A 2DVFA 2VLCA 1V6UA 3UJOA 2TEPA 1OQLB 4JC1A 1W0OA 1ITBA 1CJPA 1H30A 5IK5A 3CA3A 1D2SA 1BKZA 1Q04A 1M16A 2VXTI 4DRRA 2ZQOA 2P23A 1MS9A 2I1BA 2FFUA 2X2TA 3OY8A 3BAOA 4XFTA 2AUYA 1IS3A 2UWBA 1IS5A 1QOTA 1LHOA 3VV1A 1AVUA 5HCAA 5T52A 1GICA 4CJMA 2JJ6A 2JECA 1ULDA 2KI6B 2WSUA 1HQLA 3R4SA 2ERFA 1G9CA 1QDOA 4P9XA 1Z2VA 3ZYPA 2DUPA 2H0BA 1GSLA 4X39A 4Z9WB 3N7JA 2RQ9A 3SH3A 2D6MA 1SACA 1RG8A 4QD2C 4XKIA 4GOVA 1VAMA 2ZR1B 4XJAA 2OVUA 5F5QA 1H9PA 1SBDA 1XYFA 1LOEA 1BFCA 4X3AA 3QCWA 4YW5A 1JW6A 1C57A 3SLIA 3AJZA 2YMZA 2YV8A 1DZQA 1ABRB 4JKXB 1VLNA 2A3YA 2ZBJA 4YGEA 2ZMLA 3HMYA 2EF6A 3AFKA 1GZWA 1Q8VA 4ISQA 2DREA 4FOYA 1WBLA 2VSAA 4MYEA 1ISXA 2VSEA 2HW9A 3BAHA 4XOGA 3ZXLA 3WO3A 3FBYA 1DQOA 3H6QA 1JBCA 1BLAA 3I29B 4FQ4A 1BFGA 3F1RA 4QKRA 3AZVA 3FJ9A 1W6QB 1BYHA 2VUAA 2ARXA 2A7AA 2Y9GA 3JUTA 1G86A 5BXRA 1MS5A 3WDUA 2ZMKA 3C2UA 3PHZA 1N3OA 4H04A 3AKIA 3N0KA 2JE9A 4AVVA 4YGCA 1KRIA 3O0WA 2FMDA 1K5VA 1CPNA 1NLSA 2HYKA 1TFMB 2HWMA 3AKGA 1JXNA 1SCRA 4LBOA 1N3PA 3UDAA 4EKXB 3ZSLA 2NMNA 2Y9XE 4XJ8A 2PHWA 1SLAA 3WHUA 3N7LA 3H6SE 1Q56A 5HCFA 2GNDA 4A7YA 4CZSA 2W68A 3ILRA 4FPEA 3SITA 4I4QA 1MZ5A 2DVAA 1SZ6B 2D20A 3MW4A 3DGTA 2LIEA 1DQ5A 4GA9A 3TAYA 3M3CA 3RQ0A 4FPKA 4PQ9A 2GO2A 2NVHA 3FUQA 1TEIA 5G00A 1MS4A 1WBFA 1V6IA 4Y1XA 2Y9WC 1AJKA 1DFCA 2G4IA 1ISVA 2MLLB 3NBEA 4Q9GA 1QOSA 1XZZA 3O4AA 2GNTA 2ZHLA 3NBDA 4ZKTB 2SLIA 1WBAA 4LO1A 3WG1A 1V00A 1DJSB 5JOYA 4K20A 1AXKA 1QXMA 4KBBA 1CIWA 3AP6A 1F9KA 2BEAA 5JOXA 3MW3A 2L5XA 2VW1A 3TB0A 1H9WA 3ENRA 1AX2A 3OBRA 3WOGA 3SNMA 4XMAA 5BOWA 3POYA 1N1YA 2YROA 1WW4A 4ZOTA 3QLQA 1S0JA 4K21A 4EFPA 4U2AA 1N1TA 3ZXEA 5CNAA 5F9TA 1PC8B 3OGGA 4LBKA 5FZUA 2J3PA 1W3FA 3CA4A 1HKDA 1PUMB 4LO3C 2GN7A 2K43A 1LGBA 2K8RA 5BP5C 4BLJA 4XJUA 3H6RB 1W6PA 3PJQA 4UW6A 2ZGNA 2JKBA 9ILBA 2EXJA 3FLRA 5EWSA 4P0JA 4LO0A 2GZBA 3O5SA 3ZXFA 1W3AA 1SLTA 3BA4A 3WCSA 6I1BA 3FJCA 2ZGPA 1II4A 3VKNA 1IKQA 4FOQA 1TIEA 3BB2A 2AYHA 2AR6A 5DUYA 1I1EA 1BFBA 3A0KA 3ZYRA 4FOVA 4FPYA 4XTMA 1JT4A 4ENDA 1QF3A 3M3EA 1QGLA 1GZWB 3LSEA 3FUOA 5FRAA 4UW5A 3WMUA 4P9YA 4JCKA 3GNEA 1PZZA 3SISA 5H9SA 2AFGA 2WQZC 2NN8A 4Y20B 1AX0A 2ZHNA 4WVVA 4YLZA 2VXRA 4K1ZA 3SH5A 5HCBA 1WLWA 2D7IA 5EC5A 1OQ1A 4LBLA 3O4BA 2V73A 1MS0A 3P6IA 1NUNA 3AKHA 2VW2A 4H9WA 1YRZA 1CR7A 1IKPA 3B01A 5JOZA 1MVQA 1UN1A 2D44A 4NO4A 4PCRA 1LESA 3NV2A 4JQ0A 2P34A 3P53A 2E4MA 5KXBA 3AH2A 5JVVA 3WO2A 2PHXA 4KC3A 3A0NA 3M2MA 1ISWA 5FZYA 3O4OA 3BODA 4PBOA 2ZGTA 4FP2A 5GLZA 1I3HA 4Q1RA 4I4PA 2F8XC 1JYIA 4P9WA 2ENRA 1OKQA 2E7QA 5T50A 4EFRA 1G9AA 2A3XA 3AP9A 3WG4A 3I2XA 1V6NA 1Z0HA 1NXD1 1CPMA 2VY0A 1FMZA 4IY8A 1NZKA 2VW0A 1HKNA 5IK4A 2YZ4A 3JU9A 2BEBA 1XHBA 1ULCA 5CAZA 2ZGQA 3Q9OA 1XQNA 2E53A 3CAHA 5GJ6A 3AYCA 1JYCA 3I4IA 4ZA3B 3BAGA 4L4IA 2K4AB 4XFUA 3RTIB 4UW4A 3O49A 3R4UA 4ZFYB 2EXKA 3RTJB 2BQPA 3WUDA 4I1EA 1MD6A 3V0AA 4Y1UA 3OJVA 5GALA 1CE7B 1JT3A 4I4XA 3AZWA 1IOBA 1A8DA 4FPOB 3BOPA 1V6JA 1SLCA 1UZYA 2R0FA 5F90A 2GMMA 3LLPA 1I1BA 1WD4A 3HALA 1ENQA 4XIOA 1DQGA 2SBAA 1MVEA 2B7YA 4HL0A 4I4SA 4OWKA 3VUOA 2Z48A 1F5FA 4F34A 4DRVA 3D7WB 4DENA 3BRFA 3WDYA 4USPA 4LO7B 3FJKA 3CA5A 3WG2A 2HZ9A 1HWNB 3AZYA 5H9PA 4FPCA 4I7IA 4A7ZA 1V6VA 2KLLA 5DZUA 4ZBVB 1GANA 3AXDA 1ENSA 1N1SA 1UKGA 1KDMA 1ULFA 4FPJA 2BFHA 1W6PB 2PHTA 2A6YA 4XXAA 2W08A 4I4YA 1JHNA 1AXMA 3AH4A 5GLUA 4G9NA 3FGMA 4G9MA 2YY1A 1YIFA 3R05A 1VIWB 3H0OA 4XYXA 1YXWA 3VT2A 4Q8LA 3O12A 4D0TA 1Q8OA 5JMCA 2A6WA 2YUGA 4XJ9A 2AXMA 3AYDA 5D63A 4W65A 2WNEA 3WVJA 3FJEA 1S0IA 4ZGRB 4KEKA 1X50A 1J0SA 1T4QA 3H6RA 4AN6A 3HR9A 1N4KA 3ZSKA 4ATFA 1AVAC 3BADA 4ZFWB 3NV3A 1GZCA 1SBFA 2W52A 1HCEA 3A4UA 3POKA 3FJHA 1BASA 1FYUA 3HBWA 1ISZA 4BQ1A 3AH1A 3BRGC 5DUUA 5E8AA 4AGRA 4AWDA 3PUBA 5IK8A 4II0A 1LU2A 2GMPA 1Z4SA 3I2AA 5GM0A 3Q7YA 3WDTA 5BXSA 2NP0A 4OUJA 1BLDA 3WO4A 4DS0A 1WLCA 2UUSA 1FMMS 1QDCA 4JAWA 8I1BA 1LHNA 2AH2A 1N47A 4XJWA 3W58A 4AVSA 5I1BA 3RMYA 4FGFA 2YXSA 3ZPYA 2GNMA 2ZGMA 3BAVA 2R9KB 3UJ4A 4IYBA 5SV8A 4Y20A 3ZVXA 1Y7BA 1HIBA 2WLQA 5B2HA 1S0CA 5IK7A 1L2HA 2C5DA 4SLIA 1V6OA 1BA7A 1JY0A 5DG2A 1DFQA 5T5PA 2ZABA 4J2SA 4G6MA 5H9RA 1HWMB 3NV4A 2NTDA 4YZ5A 4OWLA 5F8WA 2UU8A 4HR6C 4LBJA 3GALA 3WINC 1WW6A 2GDFA 1B09A 4I4RA 3AYEA 1GYKA 2IHOA 4GAIA 3UJ0A 4I4VA 1TP0A 1FWVA 3VEQA 1KQRA 1HWPB 4LO3A 3UJQA 1BXHA 2OUHA 5BP5A 4XMIA 2XG3A 4Q8KA 1S0DA 1BARA 4YM2A 4XFSA 3RMXA 1GZ9A 5DUWA 1CONA 1QNWA 4XDQA 1EV2A 3K1XA 1CN1A 3V0AB 3NBNA 1QU0A 3FJBA 1G9BA 1FNZA 4M3CE 4QO3A 4ZFUB 3ZXGA 2D7RA 4C1WA 4QC4A 1AXZA 1N3QA 4QD2B 3AP7A 2UWCA 1Q03A 4NOTA 3WV6A 1OFSA 2ESUA 1Q8SA 4H55A 4G6JA 3M3QA 4FP3A 4YG3A 4Q27A 2EALA 4XHXA 1PWAA 3L2YA 1MR5A 3W9TA 1JN2P 4FPHA 3WHTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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