2NM1A

Structure of bont/b in complex with its protein receptor
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
436
structure length
430
Chain Sequence
SEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTEPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Toxin,hydrolase
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
publication title Botulinum neurotoxin B recognizes its protein receptor with high affinity and specificity.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 103
structure length 430
sequence length 436
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2006-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2nm1A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2nm1A02
3BAUA 2I1BA 4FPGA 3I2XA 1SBEA 1VAVA 4FOWA 1HKNA 4XYXA 4XXPA 2D7IA 3RTJB 1R8OA 2YXSA 1N3OA 4CRQA 2ZMNA 1LOGA 4DRRA 3BB2A 3B9CA 4GOYA 1AX2A 1SLIA 2AH2A 2PHFA 1Q8OA 5IK7A 1Y7BA 1LULA 2KKIA 3BAHA 3WCSA 1V6NA 1JHNA 5G00A 2B7YA 2WLQA 5BP5C 2E51A 2ZGLA 5LK5A 4C1WA 5JOZA 4BLJA 1LENA 1QKQA 3PVNA 4PQ9A 2D7FA 1WBFA 4G6MA 1WLDA 1GZWA 3PG0A 1MZ6A 3HBWA 2R16A 4YG0A 3SITA 3VKFC 2A71A 4XHBA 2K8RA 1W0PA 3ILFA 1SLCA 5BOWA 4AGRA 4XJAA 1XHBA 3HOMA 1GV9A 1KQRA 1BZWA 4LO3A 2GNBA 1IRPA 3E8LC 3BOPA 4XTMA 4TZDA 2HWAA 1JOJA 5F8SA 1HQLA 2Y9WC 1AXKA 4YGCA 3OJBA 1BFFA 2F8XC 4FOVA 1WUVA 4YW2A 4PC4A 1TFMB 4GXLA 1ISXA 4USPA 1GZ9A 1G8WA 3B69A 3D7WB 2DU1A 3IPVB 5IK5A 3NJ5A 1LECA 1ABRB 1MR5A 1IS3A 9ILBA 1OQLB 5FZYA 4BM8A 1WBAA 4DEPA 1TIEA 5BXTA 4NO4A 1GNHA 2D20A 2P39A 5HPZA 4WV8A 2WT1A 1CR7A 2ET2A 5B2HA 3WDTA 2Y9GA 2GMEA 2VH9A 1LOEA 4U36A 4ZOTA 2VXRA 2AR6A 3I29B 1IJTA 1UPSA 2CNAA 1IKPA 3WINC 1E0OA 2KH2A 4I2SA 1V6VA 3ATGA 5JVVA 4KC3A 4I7IA 1IS5A 1FNZA 2ZGSA 3DGTA 4AGVA 2J3PA 1BFGA 3MW3A 4GOVA 4WBCA 4GWNA 1IILA 2DWRA 3N0KA 3R05A 2P2KA 1DFQA 3PJQA 4LBQD 4XIOA 3VWCA 2Q3NB 4XJWA 1CESA 5L73A 2EXJA 3V0AB 4FPLA 1H9WA 1PC8B 4AWDA 4JPZA 3NV2A 2X2SA 4RA0A 3NV3A 2H0BA 3V0BB 1WD4A 1V6KA 1BXHA 1SLBA 1PUUB 3WDVA 2ZGPA 2AFGA 4LO0C 5CAZA 3WNXA 2D6OX 2ZHMA 1GBGA 1C57A 1V6MA 3AH1A 4P9YA 4OW4A 1AVWB 1HWPB 4WVWA 4OEGA 1HWNB 2NZ9A 4Q27A 3AJYA 1YI7A 1PZZA 3W58A 3HMYA 4OEEA 3HSMA 4R9CA 4Q8LA 1WLWA 1MS8A 4LBOA 3VUOA 1KDMA 2OW4A 4I4RA 5GZFA 3EF2A 4M3CF 2LIEA 4AN7B 2A6YA 4YW1A 2VY0A 3POKA 2D3PA 3N7LA 2P3JA 3OBTA 1N3QA 3ILAA 2ZMKA 2DRZA 3VKOA 2JE9A 4YW4A 1WCSA 2FMDA 4FGFA 1GSLA 1ITBA 2R1BA 2WT2A 1W3FA 3BRDA 3NBCA 3A0KA 1AXYA 1LOAA 2A6XA 5BQUA 1FATA 3SH4A 4GKYA 2FO1A 3BRGC 1BFBA 2XOAA 3V0AA 3B3QE 5DZEA 2WSVA 1Z4SA 5KXBA 4KEIA 3KMVA 4ZGRB 4WVVA 2MIBA 3M1HA 4YGDA 3CA4A 4I37A 4XTPA 2ZACA 3V0BA 4G9MA 3WDUA 1DQ2A 3S8JA 3BAQA 1I3HA 1G86A 1KDKA 4P9WA 3ASIA 1SACA 4FPEA 3O4CA 2E7QA 4Q9PA 5GAQA 3RQ0A 2GN7A 4LBNA 4PBPA 2D3RA 1A3KA 1GNZA 2TEPA 3VT1A 4AVTA 4QKSA 5I1BA 5GLWA 4Q2FA 1URXA 3AH2A 4P6AA 3WG4A 2VW2A 1T9FA 1HCEA 3WLUA 2W68A 4BPZA 2P34A 4GALA 1YYNA 3BA5A 2C9AA 1Q1UA 2KI6B 4H55A 5BP5A 3V65A 1BFCA 1CQ9A 2SLIA 1O4ZA 1A8DA 1IRAX 3ZYRA 3AXDA 3I8TA 4UW6A 2RHPA 4ZXKA 1PUMB 1LHWA 2ZZJA 3ZXEA 5EYYA 4M00A 4L4HA 4ATEA 4YZ3A 1S0BA 4K21A 1O4YA 3OY8B 2DV9A 3O5SA 3UD7A 1VALA 2WNEA 4CZSA 5DZFA 3PHZA 3OGFA 3FJJA 4LBKA 3Q9OA 5JOXA 4XILA 3UJOA 5H9SA 2UWCA 4R9DA 2V5YA 2OUHA 3HALA 3IM0A 1TTUA 4X38A 1D0HA 3ZC9A 2YUGA 4G1RA 5F8WA 4AVSA 1FMMS 2PHUA 2PHXA 4HA2A 3VEQA 4UW4A 2R0FA 4IYBA 2ZGMA 3O4BA 5IUQA 4JQ0A 1H30A 3WZ1A 4G9NA 1KRIA 3CRGA 2UWBA 1S0IA 1HQWA 3ILRA 2WSUA 2JD4A 1S0DA 5EWSA 1EV2A 2GNMA 5BYNA 4EFPA 3FJEA 1S0FA 1V6UA 3WVJA 1DBNA 3SNVA 1Q04A 5CA6A 2BFHA 4OWLA 2JECA 3B01A 1JT3A 2DREA 4M01A 3WUCA 1CJPA 5DZGA 2D44A 3JRRA 5GZGA 1FMZA 5JOWA 3RTIB 2YMZA 2NM1A 5HCBA 4I4PA 4P0KA 4DCKC 3H6RA 3LTQA 3LLPA 4X37A 1ONKB 3T8SA 3R4SA 5H9RA 3WINA 3AFKA 3OY8A 3BRFA 4P9XA 2UURA 3AZZA 3WDXA 4HR6C 1V6OA 1P63A 4JP0A 1GANA 3V79C 3POYA 1LGBA 3O0WA 1RY7A 4LBQA 1QOOA 2EXIA 2X2TA 2R49A 3C9ZA 2OUJA 2RSTA 3NV4A 3FJKA 3H6SE 5BQUC 5GJ6A 1K5VA 2CWMA 3O4AA 4A7YA 1MS9A 1LESA 3A07A 1UAIA 2CTVA 5IT6A 3CA5A 1HKDA 4ZA3B 5T5PA 4FPYA 3IKWA 3OYWA 3USUB 4XE9A 2PHRA 1JLXA 1PZ9A 1QXMA 8I1BA 4YM0A 3N7JA 5GM0A 2QYIB 4QD2B 1OFSA 3WG3A 2WQZC 2Z48A 4LO0A 3D6EA 5E88A 3ZVXA 2ZAAA 3CU1B 3O49A 4XJ8A 1Z78A 3AK0A 3WO2A 4JKQA 1LOCA 1RINA 4ZFYB 1UZYA 3FLPA 1W3GA 1RMLA 5AVAA 3D4KA 5DUWA 1TWEA 4KEKA 3N36A 2D6NA 4Y22A 4Y1ZA 4Y26A 2HYKA 5D61A 4I1EA 3MW2A 3D5OA 3R4UA 2VW1A 4XHXA 4Y1XA 2ZA9A 1DLLA 3OBRA 3AZXA 1MACA 4ZLBB 1BARA 2A75A 5E24E 2NYYA 1MD6A 3AX4A 5D62A 1BJQA 3FJIA 1I1EA 3N35A 4XZPA 4Y1YA 2P3KA 4P0LA 3JUUA 1I1BA 3USUA 1RZOB 4FPOB 1C1LA 2GDFA 4FPJA 3UD8A 1T4QA 1ULFA 1G9BA 3QR5A 1DQGA 4I6IA 2XB6C 1WW7A 41BIA 3MEPA 1DZDA 3AP9A 2GNDA 4Y20A 1JYIA 3IAGC 3FJDA 2AYHA 3WDYA 5T54A 3APBA 1JW6A 1FX5A 1B09A 5JMCA 2M49A 4JCKA 1DZCA 4XFTA 2Y9FA 4DQAA 3OJ2A 1JLYA 4I4QA 3AZYA 5T50A 2YROA 2DVBA 4YG6A 1FYUA 2LIQA 1GYKA 3M3OA 2D23A 1V6LA 4JRAA 2EXHA 3SNMA 5DUXA 1JT4A 4AN6A 5IK4A 3FUQA 1S0LA 5DG2A 3KQRA 1V6IA 3H0OA 4AVVA 4FOYA 3FLRA 4FPFA 2DUOA 4XBNA 2Q5TA 4FVVA 1AVAC 4R6UB 5EXOA 4ISQA 1YIFA 4XBQA 2RG9B 4OUJA 1QOSA 7I1BA 3SISA 3FGMA 3UDAA 3VKMA 2ZGKA 3INAA 2AXMA 1F5FA 1EVTA 5EC5A 1WD3A 1IHKA 2OVUA 1W6PA 4II0A 5T5LA 1WBLA 1ILR1 2HZ9A 4FPHA 4DENA 4J2YA 1IKQA 2W39A 1L2HA 1XYFA 3U4XA 4YFZA 3OPZA 4IONA 2EXKA 2DVDA 4XMAA 2JJ6A 2DTWA 3PVEA 4XFSA 4XBLA 1BLAA 1QNWA 3ZSKA 1W6OA 3WO4A 2DUPA 4LO1C 1AZDA 2W52A 1JY0A 2KI4A 3Q7YA 4I3NA 3BA7A 4FP3A 3WV6A 1JT5A 1N1TA 4TLPA 3NBEA 4C1XA 4XIKA 2D7RA 1J0SA 3AYAA 1U0AA 4P0JA 3VSZA 3O4OA 1Q8SA 1AXMA 3BAGA 4BQ1A 1XZZA 3P6IA 3A21A 1ULEA 3WMUA 1VLNA 1W6NB 3POWA 3FJAA 3H6QA 3LCPA 5DZUA 1V6XA 3CAHA 3GNEA 1PZ7A 2YZ4A 1DZQA 3TB0A 3VKNA 3W9TA 1LHOA 2ZGUA 2FDBM 1JN2P 1XQNA 4P14A 5DUVA 1SR4C 4D69A 1DQ1A 2JKBA 1DQ5A 2JDZA 2ZGQA 1NUNA 2VSAA 1ULDA 3QCWA 3LSEA 1NLSA 2CY6A 4YG3A 2BEAA 1D2SA 1W6MB 4QBCA 4EFRA 1FV2A 2ZGTA 2DURA 1QMJA 1MVQA 2R1DA 4H04A 1MS4A 2ARXA 4HJJA 1Q8PA 4Y1UA 4Z9WB 1BLDA 2K43A 1AVUA 1R8NA 1K5UA 2DVGA 2FGFA 2YY1A 3WA1A 1LU2A 4FOQA 1NXD1 4XMIA 2DU0A 3AXEA 5CNAA 1WLCA 4L8QA 3FUOA 2D6KA 3AP6A 1LU1A 1W6NA 3S8KA 1DJSB 2E6VA 3NV1A 2DS0A 1X50A 1LEMA 2KM2A 3UL2A 31BIA 2AUYA 2VLCA 1BYHA 4YGEA 4YZ2A 4MYEA 3KM5A 3A23A 1IOAA 5EYXA 3UD9A 2GZBA 4JAWA 1DFCA 3AYDA 2AENA 4A7ZA 4CJMA 3B00A 4RL7A 3H6RB 1LODA 3V64A 4ZFWB 1IOBA 3WDWA 2FFVA 2K4AB 1JUIA 1AF9A 2PHTA 1N1SA 4ZFUB 1W6MA 3FJCA 3IM5A 4LBQB 4OWJA 1GLHA 1KNMA 3VV1A 1N1YA 3BADA 1CIWA 1QQKA 2ZGRA 5T55A 3ENRA 4LO7C 2CL2A 3CA1A 1JTCA 3A4UA 3AH4A 1S0EA 3FFZA 3FBYA 3HR9A 3OYWB 2D1ZA 4D8HA 4EKXB 3RS6A 2D24A 4J23B 1VAMA 1S0JA 1BASA 2L5XA 2NN8A 3LSDA 2Z49A 1AFCA 1LOFC 2ZGNA 1LEDA 4UW3A 3FJ8A 5H9PA 1LTEA 1SCSA 3Q7WA 4FQZA 3CRHA 4DRVA 4FPKA 5FZUA 3WHTA 1M2TB 4YZ4A 3FJHA 1SCRA 2ZBJA 3SLIA 1FWVA 2ARBA 21BIA 1WW4A 5JOYA 4USOA 4Y22B 1CPNA 3WO3A 4HL0A 1QDOA 1UMZA 1OKQA 4LO2C 4YM1A 1NZKA 3AJZA 1ISYA 1LHNA 4Q9GA 4YM2A 2VU9A 2GO2A 3CA3A 3WG2A 3WG1A 4WZFA 5DXDA 3O0XA 4JC1A 1DGLA 1YRZA 4I4OA 4K1ZA 4H9WA 2E4MC 1ISWA 2ZMLA 5E8AA 1EPWA 1M16A 1JBCA 3AYEA 1ENQA 3BAVA 4I1BA 2W08A 4LO8B 4JKXB 1DQOA 1IT0A 2MC2A 2P3IA 2VXTI 2GALA 1RITA 4R9BA 2WRYA 1C4RA 5D63A 2BEBA 4FPCA 2GMMA 1S1AA 4I8MA 4LO1A 1W3AA 1SBFA 1F31A 1IS6A 2WKKA 1MS5A 3AKIA 4GAFA 3K1XA 3UJQA 3ZXKA 1FGAA 4XJUA 4Y20B 4F34A 4ZBVB 2VSEA 1UKGA 5IK8A 4I30A 5FREA 3GALA 3A0NA 3ZXFA 2NTDA 3MW4A 3QYDA 3ZSLA 2UWAA 3BAOA 4I4YA 2NVHA 3A22A 2ZABA 3IIRA 1AXZA 3T1MA 1V6WA 5KXCA 2ZHKA 3BIWE 2ZKNA 2NMNA 3O4DA 4M3CE 4BMBA 1SFYA 1ZM1A 1II4A 3PUBA 1RIRA 3AJ5A 1IS4A 1EYLA 4UW5A 5EHAA 3VSFA 1G7YA 1SR4A 5KXEA 1DQ4A 1MC9A 4BOWA 1CE7B 3O3QA 1AJKA 4DFSA 4I4SA 2ES3A 1Q56A 5GZEA 3TC2A 3M3EA 3I2AA 2D6MA 1QNYA 4OZXA 4YGBA 1W0OA 3MALA 4LBLA 2Z42A 4KBBA 1HWOB 3M3QA 1BQPA 2WBCA 3MPPG 4K20A 3WHUA 3IN9A 1SLTA 3QLQA 4Q1RA 4R9AA 4GKXA 5DSSB 3NWKA 4X3AA 2LALA 3AKFA 3ZX7A 4J2KA 1UL9A 2R0HA 3IM6A 3IMNA 1W6PB 2V73A 5F5QA 2UUSA 1AVBA 2WT0A 4LO7B 4ISRA 4GAIA 4TYSA 3VT0A 1ISVA 1CVNA 4I0YA 4FQ4A 1KJRA 2EIGA 4ITCA 5EG6C 4YW3A 3OJVA 2AREA 2DTYA 1W6OB 3ZYPA 4W65A 2ERMA 2GNTA 4ZKTB 4FP2A 2F2FC 1LCLA 1GKBA 4IHZA 1DIWA 3ZSJA 2ZQOA 5BXRA 4QC4A 3N7MA 2P23A 1TEIA 3HN1A 1ISZA 3CRIA 4GP3A 4Q26A 1WW5A 1ZA4A 2CWSA 3AP4A 1UN1A 1JT7A 1WBCA 1CVSA 1YTOA 4YLZA 3AZVA 2HWMA 3RRDA 1AJOA 1LGNA 2FFUA 3P6JA 5DVHA 5T5JA 3OJMA 2AAIB 2BQPA 1JQZA 2D43A 1YF8B 1QF3A 1W6QB 1HWMB 2PHWA 3CNAA 4IZEA 4HANA 3P53A 1DQ0A 3PMEA 4YZ5A 1FQ9A 3POSA 5HCAA 2YV8A 3PVOA 1S0GA 1APNA 3AP7A 1GICA 4K1YA 3N7KA 1SLLA 4XKIA 1Z0HA 2Q9XA 4XJZA 5GALA 2AGSA 1JXNA 3AZWA 4D0ZA 5H9QA 1UZZA 1V00A 2JE7A 3JU9A 4J2XA 1LHUA 2ZHNA 5BXSA 2ESUA 2E53A 2A6VA 3I4IA 3RSJA 4Y24A 1LOFA 4IY8A 3L2YA 2EALA 5KXDA 2ZR1B 2VUAA 3IPVA 1YO8A 4XOGA 1QU0A 3CA6A 2WJSA 2QN4A 4XFUA 5CBLA 2DVAA 3C2UA 4Q8KA 2D6PA 3AP5A 4I4XA 1CN1A 4XJ9A 3UK9A 3WOGA 3W59A 4Y1VA 3TAYA 4KEJA 5DG1A 3BODA 2D3SA 1DYPA 1C1FA 4OWKA 3FJFA 1Q8VA 1FN0A 1DQ6A 1DYKA 1W6QA 5F8YA 1H9PA 4LO2A 5GLZA 4ENDA 1FV3A 5GLVA 5T52A 4LBMA 1R1ZA 1S0CA 1G9FA 4G6JA 2AQZA 1WW6A 1YXWA 3ZXJA 4QKRA 3ZPYA 5FNXA 2E4MA 3AKHA 1G9DA 1VIWB 4YFWA 5GZCA 4YM3A 2GMPA 3O44A 3WUDA 2ENRA 1AX1A 4SLIA 5JLVA 1JYCA 4PCRA 3M2MA 1UX6A 4F83A 1AVXB 3WMVA 1GZCA 4YOLA 3DUIA 5E89A 3NBDA 1CONA 4EB2B 1XG6A 4LBJA 4GP0A 1BKZA 1HLCA 2DVFA 1RG8A 3SH3A 5BXPA 1V6JA 4LO3C 4GA9A 2NP0A 1ONAA 4QD2C 5JDBA 1MS1A 2Y9XE 2DUQA 4IZXA 4YZ1A 1TP0A 1Z2VA 1LGCA 1PZ8A 2A3WA 4AGGA 4U2AA 2ZHLA 3BX1C 2GN3A 3O0VA 4IQPA 1HIBA 2P37A 2LTNA 5FZZA 1BA7A 1OQ1A 2HW9A 3ZXGA 2E7TA 3VT2A 3F62B 5GLTA 5FRAA 2A5ZA 4M3CB 3M3CA 4EFQA 3WCRA 1SLAA 3O12A 5DUUA 1LHVA 4A7KA 2ERFA 2A7AA 5SV8A 1N3PA 1FNYA 2RQ9A 4Q91A 3IM7A 3FJ9A 4ATFA 2I2SA 3SH5A 1GGPB 5F90A 4NOTA 3NBNA 3BA4A 3RMXA 2A6WA 5DUYA 1G9AA 1SBDA 4PF5A 3RG0A 2EF6A 1QGLA 4J2SA 5HCFA 1TWMA 4Z8SB 1N47A 4PBOA 5GLUA 4Q1PA 1J1TA 1YBIA 3AJ6A 2PELA 1HDKA 2SBAA 3AYCA 1VCLA 1MS0A 1QDCA 3ZXLA 1LOBA 4BLIA 4IY9A 2DRYA 1ULCA 2IHOA 3ZSMA 5BVPI 4X39A 1KJLA 1PWAA 1Q03A 2EAKA 4M3CA 2F2FA 2VW0A 3BTAA 2DYCA 1G9CA 5FNWA 2R9KB 1QOTA 3ILNA 1ENRA 1ENSA 4AYUA 4EEEB 4GWMA 4QO3A 3UJ4A 1N4KA 1AX0A 4I4UA 4I96A 5T5OA 4DS0A 1QQLA 3OGGA 2G4IA 1TOOA 1F9KA 2A70A 4L4IA 3JUTA 4D0TA 2UU8A 6I1BA 2D6LX 4YW5A 1DHKB 1CPMA 5CB7A 3RMYA 4BMEA 2CYFA 1FWUA 3F1RA 1KITA 5GZDA 3FLTA 4Z8BA 4CTEA 2IWTB 2KLLA 2C5DA 4XDQA 1ULGA 1MS3A 3UJ0A 3CA0A 4I4VA 1LJ7A 4DPNA 1GZWB 4QALA 3CQAA 3Q7XA 2A3YA 3FJBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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