2VU9A

Crystal structure of botulinum neurotoxin serotype a binding domain in complex with gt1b
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
425
structure length
425
Chain Sequence
HMDTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of Botulinum Neurotoxin Type a in Complex with the Cell Surface Co-Receptor Gt1B- Insight Into the Toxin-Neuron Interaction.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN A HEAVY CHAIN
total genus 119
structure length 425
sequence length 425
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2008-05-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2vu9A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2vu9A02
2UWCA 4OEEA 3WVJA 1PUUB 3L2YA 1PZZA 2TEPA 4BPZA 3ZXGA 1HWNB 2DTWA 3W59A 1JQZA 1V6OA 1MACA 5BYNA 4XHXA 5CAZA 5EYXA 3WO4A 1AJOA 4OWKA 2R0HA 5JOYA 2F2FA 4HR6C 4YG6A 1QU0A 1LEMA 3LLPA 4YG3A 5IT6A 3H6RB 4XJ9A 2JD4A 4G9NA 2VXTI 1CR7A 1DYKA 3PUBA 1FX5A 3AYCA 4P14A 4LBMA 4YZ4A 2FFUA 5GLVA 3WMVA 1WD3A 3VKNA 2E6VA 1HCDA 1JT4A 2WKKA 3CRHA 1HWMB 1IOBA 5GZGA 3AZVA 4II0A 1MVQA 4KBBA 2K8RA 1ONAA 3BAUA 2X2TA 1FV2A 3WV6A 1FATA 3OJMA 2WNEA 4P0LA 4FQ4A 4FOQA 1DQ2A 1S0FA 3BRFA 2P23A 1JXNA 3O49A 5T5JA 2J3PA 1IKPA 2KLLA 2A71A 2PHRA 3WINC 4XXAA 2ZQOA 5T50A 2JJ6A 5DZUA 3PVEA 2I2SA 1IT0A 1FQ9A 2IHOA 1LGCA 4HL0A 4GKYA 3JU9A 2FO1A 2DUQA 5D61A 2XG3A 3AKHA 3FJAA 4YM0A 3AH4A 2A6ZA 3AZYA 2P3KA 1AVXB 5F8WA 2BEAA 4QD2B 2D6PA 2DVGA 5GALA 4PCRA 1EPWA 1G8WA 3BAQA 4ISQA 1DLLA 2E4MC 1QKQA 3IN9A 3INAA 4FQZA 3I29B 3HSMA 1GKBA 4I3NA 1BASA 1MS3A 1P63A 3NBEA 1F5FA 1AXZA 3ATGA 2PHFA 2BFHA 2VSEA 4XMAA 2YUGA 2ZMKA 3PHZA 3CNAA 4XE9A 4Y22A 3HMYA 1UX6A 3AJ5A 3TAYA 3KM5A 1NXD1 1UZZA 3OJVA 4HA2A 3IMNA 5HCFA 1KJLA 4I4QA 3VKLA 1ULGA 4KEIA 4YM2A 1ONKB 4FPJA 4XILA 4GAFA 1M16A 5EXOA 3WDVA 3H0OA 4KEJA 2VUAA 5KXEA 9ILBA 4IHZA 4L4HA 2DU0A 5H9PA 1C1LA 4ATEA 1SBEA 1Q8SA 4NO4A 2YMZA 3QR5A 3CU1B 1ENSA 5DZFA 4Y26A 1V6VA 1V00A 4YG0A 3ILAA 3H6RA 2D3PA 3SH3A 2ZHNA 1SACA 4GP3A 2EALA 2D7FA 5T55A 3B9UA 1YI7A 3BAVA 4P9WA 1BFFA 4XBNA 4QKSA 3VSFA 4DRVA 2NTDA 2JE9A 1GZWB 1SR4C 4GWMA 1F31A 2DVFA 1MD6A 2ZZJA 2V5YA 4LO2A 4FVVA 1FNYA 1SCSA 3AP6A 1DBNA 3AYDA 4QBVA 3RMYA 2FFVA 1S0JA 3RTIB 3VT1A 2A6VA 1QQLA 5GAQA 4P0JA 2ZQNA 5CA6A 3AJ6A 5DG2A 1DGLA 4ATFA 3P53A 3OY8B 4XJUA 4I1BA 5FNXA 4YW1A 1XYFA 2ES3A 4FOWA 2ERFA 1R8NA 1WBLA 2NMOA 2AQZA 3N0KA 2ZHLA 4U36A 2F2FC 2P34A 4GXLA 4I4OA 2DWRA 1WW5A 2HYKA 2Q3NB 4TLPA 3N7MA 5DUVA 4FPGA 4Z8BA 2AGSA 4R9CA 4AN7B 4D0TA 3QYDA 1GANA 1BFCA 3BOPA 2IWTB 5JVVA 2ZBJA 2VSAA 3WG2A 3W9TA 4AVTA 2AH2A 1DQ0A 1CPMA 3BA4A 1W6OA 4Q9GA 1V6KA 4XZPA 3T8SA 2ZAAA 1ABRB 3F62B 1VAVA 3OGGA 1VALA 4I37A 3ILRA 4ASMB 1IS3A 1GSLA 1G9BA 1HQLA 5DZGA 1I1BA 2AYHA 2ZGLA 5BOWA 4PF5A 3JUUA 3VSZA 2Q9XA 3A23A 1SCRA 1WLCA 1IS4A 1CE7B 5E24E 1N1YA 4DRRA 2Z48A 1UL9A 5IK5A 5H9RA 1FWVA 1LENA 1MS5A 2D6LX 4JRAA 1IKQA 2AUYA 4FPCA 3IM0A 1BFGA 4IZEA 1VLNA 5KXCA 4I4VA 3POSA 4LO0A 3E8LC 2D7RA 2PHXA 2XB6C 2MC2A 1LODA 1BJQA 1QXMA 1FN0A 1FWUA 2R9KB 5F8SA 3P6JA 4GALA 1ISXA 4DFSA 4Y20A 2ZHKA 4KC3A 1QNWA 2ZGMA 1NUNA 4M3CA 3SLIA 3N3HA 4OWLA 1YXWA 1KQRA 4XJAA 1RIRA 1AVBA 3NV3A 1MS0A 1N1SA 3D4KA 1I3HA 1N1VA 1C1FA 2DU1A 3DUIA 4Q8LA 3N35A 2FGFA 1CONA 1Q03A 1C57A 1V6WA 1JTCA 1JYIA 3HOMA 4YGDA 2ZGUA 1UN1A 1ILR1 1JBCA 1NZKA 4GP0A 1JT7A 2WT2A 2GMPA 3I4IA 3FUQA 3AFKA 4IYBA 1EV2A 4YZ5A 1AX0A 4I4UA 1LJ7A 1FNZA 4XFUA 4Q26A 2ZGKA 1Z78A 4BLJA 3FBYA 1N3QA 3B3QE 2VW1A 1WBFA 4Y1UA 1H9PA 4X37A 4XXPA 4ZFWB 1Q8QA 5GLUA 1UZYA 3PJQA 1HIBA 2A6YA 2D7IA 3BADA 1FMMS 4EB2B 3RTJB 1YYNA 1BLDA 2ZGQA 2W68A 3NWKA 2ZMNA 4FPKA 3UJOA 3M3EA 1LHNA 4DPNA 2CY6A 2YROA 3ZXDA 2ENRA 1GZ9A 4Y22B 5JDBA 1IJTA 1LOGA 5DUYA 1DQGA 3C2UA 2DTYA 3IM7A 4BMBA 4FPLA 4FPYA 1RMLA 1Y7BA 2D44A 2VLCA 3Q7YA 1SLAA 5FZYA 4Z9WB 4LO2C 4YZ3A 3FJBA 5BQUA 1QDCA 4QO3A 3V79C 1DZCA 4JCKA 4X3AA 1G9DA 1D0HA 5CB7A 2A6WA 3WHTA 3ZSLA 3LSEA 3HN1A 4AGVA 2OUHA 4KEKA 2NM1A 3N7KA 3PG0A 2UURA 5F5QA 4I7IA 1G9FA 2P3IA 4Q9PA 5BXTA 2K4AB 5CNAA 4I96A 2PHUA 2L5XA 3AK0A 2DREA 3IM5A 2D3SA 2M49A 2CYFA 5DZEA 4LBLA 4F34A 4K21A 3WDXA 4OW4A 1LOCA 3OJ2A 2AENA 1CESA 1S0DA 4GKXA 3SNVA 3OGFA 2R1BA 4JAWA 3SNMA 4QD2C 1MS8A 4ZFYB 3O0XA 3TC2A 3ZXKA 1IS6A 1ULFA 3JUTA 5FRAA 1XHBA 4D8HA 2UWAA 3BIWE 3WUDA 2X2SA 4J23B 4NOTA 1GNZA 2RHPA 3PVNA 1W0PA 4X39A 3BRGC 1G9AA 5BXPA 3IIRA 3O5WB 3M3QA 1LOFA 3UJQA 1W3FA 2D3RA 3HBWA 4L4IA 3H6QA 1N3OA 3ASIA 1ISVA 3ZX7A 1FYUA 4JPZA 5D62A 4UW3A 3B69A 1N47A 3AJZA 3O44A 3VUOA 4Q2FA 2RQ9A 3BAGA 1TWMA 1YF8B 5DG1A 5BVPI 3VWCA 1WW7A 1LHVA 1TIEA 2GNTA 1PC8B 3A4UA 4A7ZA 5JOWA 4M00A 4YFWA 1GICA 1CVSA 4H55A 1KNMA 4ZFUB 3WMUA 3IPVA 4M01A 1IS5A 1AVUA 2FHRA 1MR5A 3O0WA 3FJDA 5BXRA 4J2SA 3PMEA 3O4AA 4LO0C 4Q1RA 3FJ8A 1W6QA 1O4YA 4CJMA 1CIWA 1DQ6A 1DQ1A 5JOZA 3ZVXA 5BXSA 2E7QA 1W6OB 3BA7A 3JRRA 3A22A 1MZ6A 4WVVA 4IY9A 4G6JA 1PZ7A 1AX1A 3RMXA 4FGFA 1WLDA 5GJ6A 4ZBVB 3WO3A 2P2KA 3BAOA 2A70A 4DS0A 4EFQA 3NBCA 2W08A 4ITCA 1ISZA 2YV8A 3UJ0A 1HKNA 1KRIA 1HDKA 2I1BA 3FFZA 1DFCA 5DUWA 1LESA 2NN8A 2CNAA 3RS6A 3KQRA 2GNDA 1LOEA 1C4RA 2W52A 2PELA 4RL7A 3FJFA 2YXSA 4SLIA 5T5LA 1QQKA 1G86A 4G6MA 2DURA 4DCKC 1ITBA 1TP0A 31BIA 2GN3A 4XJ8A 3UL2A 4Y20B 1AX2A 3IAGC 2Y9GA 4TYSA 4Y1XA 1WCSA 2WSVA 1YTOA 3OPZA 3WDYA 1IOAA 1J0SA 3FJEA 1VAMA 2GO2A 8I1BA 3SH5A 1DQ5A 5T52A 4M3CB 4M3CF 1IRPA 5F90A 1QF3A 2D22A 5EHAA 3BAHA 1LOBA 1A3KA 1MS4A 4YM1A 1A8DA 1E0OA 1DZDA 3TB0A 5HCAA 4OEFA 3I2XA 4Q91A 1HWOB 1V6LA 3N7JA 4ISRA 4PBOA 3ZXLA 4GA9A 4XBLA 2QYIB 1QMJA 2A75A 4YGCA 4OEGA 1S0EA 1HWPB 3WCRA 3OYWA 1H9WA 4UW6A 1YO8A 2ZGNA 5GZCA 1TTUA 1LHWA 2CWSA 4EFRA 2DVDA 2YY1A 3AJYA 2JE7A 3EF2A 5EC5A 5BQUC 2UU8A 2R1DA 1KITA 4CTEA 1M2TB 2WQZC 2ZACA 3CA3A 2HWAA 3IKWA 4PQ9A 4XJZA 2D43A 4A7KA 2VW0A 3N7LA 3NV1A 3FJHA 3LTQA 4USOA 1LCLA 3B01A 1JOJA 3MW3A 4YW3A 2EXJA 1ULDA 4AGRA 4LO8B 3KMVA 4XHBA 3RSJA 3ZYPA 2KI4A 4QC4A 3PVOA 2GMMA 1QNYA 4AYUA 2ERMA 2DV9A 3WDUA 3NBNA 3AKFA 3M3OA 1AXKA 3WOGA 2GNBA 2Z42A 1JLXA 3D6EA 1JN2P 4R9AA 5KXDA 4D0ZA 3LSDA 2GN7A 4YW4A 4XYXA 1V6NA 3V0AA 3U4XA 3WCSA 3CA4A 4GWNA 3A21A 1CN1A 1DZQA 1LULA 5JOXA 4EFPA 1HQWA 1W6NA 1L2HA 1AXYA 2DVAA 4ZLBB 1LOFC 4K1YA 2HW9A 2ZMLA 1W3GA 4Q27A 1AXMA 1Z0HA 4J2YA 3UD8A 3UD7A 1QOOA 4A7YA 1RY7A 1T4QA 5JMCA 3VKMA 3AZWA 1HLCA 3BODA 2JKBA 4XIOA 4JKQA 4C1WA 1LU2A 2RG9B 2D6MA 4P9YA 3WHUA 4YGBA 2D6KA 4TZDA 3CRGA 1SLBA 3AP7A 3FJJA 1SLCA 3SH4A 3I2AA 4GOVA 3ILFA 4JP0A 1R8OA 3POYA 2AAIB 21BIA 4YLZA 4U2AA 1II4A 3ZPYA 3AP5A 2SLIA 3USUA 2H0BA 3ZSKA 3WNXA 4ZKTB 1WLWA 4H9WA 2EXHA 3VT0A 5E89A 3CA5A 1W6MA 2A3YA 4I4SA 1MS1A 3GNEA 3CRIA 1Q1UA 1B09A 3V65A 5GZEA 1HKDA 1G82A 1JUIA 3AZZA 4YFZA 2GMEA 5F8YA 1SZ6B 2ZGPA 3ZYRA 3FLRA 4J2XA 2R49A 2A7AA 1LGBA 4UW4A 4AVSA 1XQNA 5LK5A 1BZWA 3NBDA 2WLQA 5T5OA 3IPVB 1W6PA 1N4KA 5E88A 1Q8OA 4WBCA 3AXEA 1ISYA 4D69A 1ENQA 1W6QB 2ESUA 3FUOA 4LBOA 5DUUA 5EWSA 3NV2A 1N1TA 5FZUA 5KXBA 2CWMA 3F1RA 4P6AA 1QDOA 3MEPA 2GZBA 4XTPA 3M2MA 1X50A 1FGAA 1URXA 1HCEA 2GALA 1XZZA 2PHWA 4R9BA 2EF6A 3C9ZA 3VEQA 4FPOB 4UW5A 2JECA 4I30A 5DUXA 2A6XA 2DRYA 1G9CA 1S0IA 1YIFA 5BP5C 2UWBA 3WDWA 5IK4A 4I8MA 5F9TA 1PZ8A 3R4UA 4FPHA 3B9CA 3AYAA 4OUJA 3T1LA 3Q9OA 5HPZA 1GV9A 3O4DA 3V0BA 5G00A 4GAIA 1Q8PA 3WDTA 5GLTA 4ZOTA 4USPA 2LALA 1YBIA 3D7WB 4K20A 5GLZA 2JDZA 2DUPA 4Y1YA 1ULEA 2AREA 5GZFA 1PUMB 3IM6A 4WV8A 3OBRA 3UJ4A 2WRYA 3FLPA 1ISWA 4HJJA 1FAYA 4I4YA 3OJBA 4JC1A 3T1MA 1DQOA 4ZA3B 1BLAA 4QKRA 1S0CA 2DS0A 2AFGA 3RRDA 5DXDA 3A07A 1I1EA 2WT0A 4ZXKA 1SLLA 3CQAA 1GLHA 2Y9XE 2D20A 3O4BA 2Q5TA 4I2SA 4ZGRB 2WJSA 3W58A 4XFSA 2WT1A 2D6OX 2EAKA 1V6XA 3MW4A 4I1EA 3OYWB 1J1TA 2GDFA 2RSTA 4DQAA 1LHOA 1MS9A 1AF9A 4Z8SB 4FOYA 1K5UA 1Z4SA 1S1AA 3ZXFA 4XKIA 4G9MA 2ZGOA 2CL2A 1Q04A 2P37A 3ZXJA 2VXRA 5FREA 1KDKA 4AWDA 4AN6A 1KDMA 4LBQB 4PBPA 3O4OA 4I0YA 1OFSA 1GBGA 2W39A 5GZDA 3ZSMA 5CBLA 1JY0A 4PC4A 4Q1PA 2LIEA 5B2HA 1AJKA 1GNHA 1VCLA 1SBFA 3ZXEA 1JT5A 3VV1A 3CAHA 2E53A 1ULCA 3BA5A 2Z49A 3UK9A 2F8XC 3WG4A 4BLIA 5FZZA 2G4IA 3RQ0A 4LO1A 1LOAA 1UPSA 4Y24A 1IHKA 2D6NA 3M1HA 1WBAA 3V0AB 1BA7A 4I4RA 4AVVA 5JLVA 1WD4A 3DGTA 2ARBA 1WUVA 2KH2A 1W6NB 4LO3A 1ZA4A 4YZ1A 2WBCA 3O4CA 2KKIA 3S8JA 1N3PA 1RITA 3BTAA 1ZM1A 3A0NA 1WW6A 3D5OA 1TOOA 3WG3A 1H30A 2VY0A 1LU1A 1O4ZA 4LO7C 4P9XA 1V6UA 1DYPA 4XMIA 4X38A 4FOVA 3CA6A 4XJWA 3UDAA 1BQPA 2V73A 3FJIA 3FJCA 4M3CE 1DHKB 1BFBA 3O12A 2LTNA 1PZ9A 2AR6A 1JW6A 3AXDA 3S8KA 3WA1A 1GYKA 2OUJA 1AVAC 1TFMB 1CVNA 5EYYA 4YGEA 1AZDA 2C9AA 5I1BA 1CJPA 3HALA 2MIBA 3AP9A 5IK8A 1AVWB 4JKXB 1JT3A 1Q56A 3POWA 1ENRA 4XTMA 3USUB 4XBQA 5BP5A 4MYEA 5E8AA 2YZ4A 4QBCA 3UD9A 2AXMA 1W6MB 4W65A 1APNA 1SLIA 2NYYA 4XFTA 7I1BA 4P0KA 1KJRA 1A78A 2ZGTA 5H9QA 4LO7B 5DVHA 1WW4A 1DFQA 2MLLB 4EKXB 3FLTA 3FGMA 3BX1C 3O3QA 2E7TA 2LIQA 2DVBA 4BM8A 2ZGSA 5EG6C 4I4XA 1CPNA 2DYCA 5L73A 5SV8A 1V6MA 2C5DA 2WSUA 3A0KA 1VIWB 4I4PA 3QLQA 4YM3A 5D63A 3WUCA 2GNMA 1W6PB 1K5VA 3GALA 4LBQA 4BOWA 1QGLA 1S0LA 2B7YA 1OQ1A 2DRZA 3V64A 1UKGA 4QALA 3AH2A 4IZXA 1EYLA 1BYHA 3BB2A 2D1ZA 3CA0A 3Q7XA 5GLWA 1RZOB 3POKA 1MC9A 3N36A 1UAIA 3WO2A 1SFYA 2Y9WC 2NVHA 2ET2A 3AZXA 3VT2A 1MZ5A 2BQPA 4FPEA 3NJ5A 1SBDA 5HCBA 1EVTA 2FMDA 1QOTA 3ILNA 1BXHA 3K1XA 3RG0A 4XDQA 2ZHMA 2EIGA 1BARA 1V6JA 1LHUA 4YW5A 4YW2A 2HZ9A 3WINA 5AVAA 1OQLB 1GZCA 4ENDA 2P39A 3ZC8A 3ZSJA 1FMZA 1BKZA 4AGGA 1TEIA 5DSSB 1GGPB 4H04A 4Y1VA 2VU9A 1WBCA 3AKIA 1SLTA 4DEPA 4LBKA 3V0BB 3R4SA 4F83A 4YOLA 2EXKA 5T5PA 2EXIA 3APBA 4YZ2A 2KI6B 3WG1A 4BMEA 2ZR1B 1Q8VA 2ARXA 2DUOA 2NZ9A 3ZC9A 2ZKNA 3T2TA 3MPPG 2KM2A 4FPFA 1JLYA 3AX4A 1MVEA 3VKOA 1RG8A 3O5SA 4J2KA 2A3XA 4IONA 2FDBM 3SITA 2E4MA 1DQ4A 1IILA 2OVUA 1OKQA 1JYCA 5GM0A 4CRQA 2NP0A 1F9KA 3LCPA 1T9FA 2Y9FA 1LEDA 2A3WA 3WLUA 3R05A 4OWJA 2D24A 1QOSA 2P3JA 1S0GA 5IK7A 4RA0A 1FV3A 3P6IA 41BIA 4I6IA 3O0VA 1XG6A 4WZFA 1W0OA 3I8TA 5H9SA 4Y1ZA 1GZWA 3M3CA 1LECA 2HWMA 4XOGA 2QN4A 2UUSA 4LO1C 1RINA 1R1ZA 2OW4A 1AFCA 3SISA 2ZGRA 1YRZA 2A5ZA 1W3AA 4C1XA 3NV4A 4DENA 2XOAA 3MALA 2NMNA 1LTEA 4JQ0A 4FP2A 6I1BA 4G1RA 3Q7WA 1DIWA 4LO3C 4L8QA 3MW2A 3AP4A 4LBNA 1IRAX 2ZABA 2D23A 4Q8KA 1V6IA 1CQ9A 1TWEA 1NLSA 3HR9A 4WVWA 5T54A 4OZXA 4IY8A 4HANA 2CTVA 2R16A 1D2SA 2ZA9A 3CA1A 3OY8A 1S0BA 3B00A 5IUQA 1LGNA 4LBQD 3BRDA 3VKFC 2VH9A 4BQ1A 3OBTA 1SR4A 1G7YA 1JHNA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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