2VU9A

Crystal structure of botulinum neurotoxin serotype a binding domain in complex with gt1b
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
425
structure length
425
Chain Sequence
HMDTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of Botulinum Neurotoxin Type a in Complex with the Cell Surface Co-Receptor Gt1B- Insight Into the Toxin-Neuron Interaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN A HEAVY CHAIN
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
total genus 119
structure length 425
sequence length 425
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2008-05-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2vu9A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2vu9A02
4IYBA 5E8AA 3OJVA 2ZABA 5T55A 5F5QA 4FOQA 4IY8A 1QOSA 3AP9A 2G4IA 1BASA 2XG3A 5GLUA 4R6UB 1IOAA 4AGRA 1WLCA 4LO2C 2DS0A 2DTWA 1F31A 2P34A 1RY7A 3POKA 5EYXA 1FMZA 5F8SA 1VLNA 3PHZA 2R0HA 2DU1A 2SBAA 4XFUA 4R9CA 1V6JA 3RRDA 3AYEA 4TLPA 2JECA 1ZA4A 4OWLA 4P9XA 2W39A 4R9AA 1LOGA 4YGDA 4GP3A 1LGBA 4LO2A 4IHZA 3AKHA 2VY0A 5FZYA 3AZYA 1SLCA 3WLUA 3AP6A 1TOOA 3WDWA 2KH2A 5F9TA 4FP3A 3MPPG 1OQLB 3SH4A 4DRVA 2ENRA 3WG3A 4FPGA 5CB7A 1IS5A 5DZGA 3QYDA 1G9AA 1JUIA 1GBGA 2D3PA 1DQ5A 4EEEB 3OY8B 3WDVA 3FGMA 3JRRA 5GLTA 2VH9A 2R49A 1DQOA 3AKGA 4X38A 4GKXA 2ZZJA 5H9PA 1BXHA 1TIEA 3NV1A 1U0AA 2NZ9A 3WHTA 3FLTA 4EFQA 3KQRA 4F34A 1ILR1 4AN7B 4XHBA 3VKOA 1FGAA 5CAZA 2KLLA 3AKFA 3BTAA 1W0PA 5AVAA 3WG2A 2IHOA 3LSEA 3USUA 1CVSA 4I4VA 4SLIA 4Y1XA 2VSEA 5I1BA 3IM0A 1D2SA 3V0BA 3S8KA 4Y22B 1ULGA 3WINA 3N7LA 3AK0A 2GZBA 1FATA 2PHRA 4YZ3A 5FZZA 2RG9B 2FDBM 1DYKA 4AYUA 3HMYA 4I30A 2F8XC 1KITA 2JDZA 4P9WA 1W3AA 4I1BA 4P0KA 2VW0A 4XJWA 3BAHA 4PBOA 3M1HA 3NBDA 4XILA 1CONA 3AYAA 2ZMLA 3A22A 3AZXA 5GAQA 1G9BA 1AVBA 1MC9A 5DG1A 1AJKA 5EXOA 3MALA 5G00A 2GMEA 1AVAC 2ZGLA 4I2SA 1TWEA 3POWA 3QR5A 4P14A 2YY1A 1G9CA 5BQUC 1R8NA 3CA3A 1UKGA 1EVTA 3ZVXA 4Q9GA 2DVBA 1GICA 2TEPA 3FLPA 3NWKA 5D63A 1XYFA 2EXHA 3A23A 1DHKB 3AXDA 2ZA9A 4U36A 2VLCA 3CRIA 1AVUA 1A8DA 4QBVA 5BQUA 2D1ZA 3OJ2A 2ZGNA 4M00A 1QDOA 2D3SA 1GANA 1G8WA 2DU0A 5BOWA 4I8MA 3ZXEA 1BKZA 3FJFA 1OQ1A 1AXMA 1BA7A 1SACA 3APBA 5LK5A 1D0HA 5GM0A 1HCDA 3ZSMA 4OWJA 3UDAA 4LBKA 1WW6A 1BJQA 3FJBA 4UW4A 1VCLA 1AX1A 2DVGA 4EFPA 4J2YA 2GO2A 1MS0A 4YG6A 2W08A 1KNMA 1PZ7A 1LHOA 2WT0A 2WT2A 3AH1A 2A6YA 1OKQA 2ARBA 4D69A 4QD2C 4ZGRB 2P3IA 1G9FA 2D6MA 5BYNA 4YG0A 4Z8SB 3AFKA 1HWNB 4AGGA 3LCPA 2LIEA 4YGEA 4ZXKA 3HR9A 3WMVA 3WDTA 4BQ1A 2E7QA 1LODA 2GMPA 4M3CB 4IONA 5KXEA 1UMZA 4II0A 1QMJA 2OUHA 2Q3NB 2A6WA 3WZ1A 1GZWB 4WVWA 1J0SA 1FV2A 2WLQA 1YF8B 3WO2A 3M3EA 2P3KA 1QGLA 1C57A 1DZDA 2H0BA 2D23A 4GWMA 4LO3C 1QKQA 1XG6A 6I1BA 1LEMA 2ZGPA 4G9MA 2X2SA 2ESUA 3M3OA 2Q9XA 1FAYA 4JPZA 4QC4A 1AXZA 5GLZA 4GAFA 1YO8A 1ENSA 1W6QB 1O4ZA 4GAIA 1YI7A 4IZXA 3D4KA 2B7YA 3OYWB 1QQLA 2GN7A 4LO1C 3AYDA 3N36A 2VSAA 4FGFA 1BLAA 3ZYPA 4IY9A 2YMZA 5IK4A 2YROA 3NBCA 1PZZA 3UD8A 1L2HA 3IM5A 1LOAA 1ENQA 5DVHA 2ZGMA 4FVVA 4P6AA 2R1BA 3ZXKA 4ZFYB 2NM1A 3V64A 5T54A 1KJRA 1QDCA 2FFUA 2C5DA 3AYCA 2WKKA 2CTVA 1YIFA 2UWBA 4I4XA 3SH3A 4PC4A 3ZXFA 4WV8A 4ENDA 41BIA 1BZWA 4BOWA 1LOFA 2NVHA 1IRPA 2FMDA 5F90A 1HWPB 2VXTI 1S0DA 1S0GA 5IK5A 4JQ0A 5E88A 2DRZA 5EWSA 4EKXB 4USOA 2A6ZA 4R9BA 4XIKA 2DUOA 4J2XA 4W65A 3OBTA 3C9ZA 3CA6A 2A3XA 1IILA 2EF6A 1GZCA 2UUSA 2EXJA 4XBLA 4JKXB 1V6MA 4YW5A 2ZR1B 2A5ZA 1W0OA 3QLQA 4G6MA 2P23A 3SNMA 4BPZA 3PUBA 3F1RA 3OBRA 3Q7XA 2ZGOA 3TC2A 5FREA 2E53A 2E7TA 1BFGA 3FJDA 1MS5A 9ILBA 1W6PA 2D6NA 1JXNA 5SV8A 1T4QA 2DREA 3OY8A 3O5SA 3W9TA 3A07A 1WBFA 3BA5A 1Q56A 4YZ2A 3OGGA 2SLIA 1VALA 3CRGA 5B2HA 3NBNA 1E0OA 2EAKA 4DS0A 3WOGA 1ISYA 2OW4A 4L4HA 1AX2A 3H6QA 4GOVA 3M3CA 3WCSA 1URXA 2A3WA 2ZHKA 4X37A 1MR5A 1DFQA 2HW9A 1DZQA 4I4QA 1Q8QA 4LO0C 1V6WA 2WNEA 4Y22A 3VSFA 3A21A 4GXLA 1YXWA 3IM7A 4LO7B 1AX0A 1QU0A 1GKBA 5DZEA 3WDUA 1GZ9A 2VW1A 3POSA 1DLLA 3UL2A 1RZOB 3CRHA 3BA4A 4LO0A 2CWMA 3AXEA 1G7YA 2ZGSA 3TAYA 2D7IA 3CA1A 1S1AA 3HSMA 5FNXA 2AREA 3D6EA 4M3CF 4EB2B 3N35A 4FQZA 2VW2A 3VT2A 4I4YA 3VKNA 2D7RA 1DYPA 4XYXA 2Q5TA 1MS4A 3ZC9A 1O4YA 5BXSA 2ZKNA 4CRQA 4MYEA 1LHUA 5E89A 3B69A 4OZXA 2NTDA 3C2UA 2C9AA 1IHKA 5DZFA 2ZAAA 3KMVA 3O3QA 2LTNA 3ZPYA 1GSLA 2ZBJA 2K4AB 4K1YA 1V6KA 3FJ9A 2K8RA 1FNZA 5DUYA 2A71A 2BEAA 4Q1PA 1JT7A 3IMNA 3ZSKA 1QOTA 1ZM1A 2D43A 3ZXJA 4JAWA 1MVQA 3WV6A 3T2TA 2YUGA 1PZ9A 5T5OA 4YW3A 4ATFA 4XHXA 2R16A 3RMYA 1XQNA 2DUPA 2D6KA 3FLRA 3UD9A 4DCKC 2OUJA 31BIA 2D22A 4Q2FA 3V79C 1H9WA 3WINC 1Z4SA 2KI4A 1CPMA 5T50A 2A3YA 3VT1A 5JMCA 2LALA 4KEIA 3RTJB 1I3HA 1YRZA 4A7YA 4XJAA 5CA6A 4I37A 2AR6A 2DTYA 2Y9GA 5HCFA 1ONAA 3NJ5A 3WCRA 4I6IA 1TP0A 3N7JA 2ET2A 2WRYA 3CU1B 1HQLA 1Q8PA 1LCLA 3BOPA 4LO8B 4M3CA 3WG4A 2Z48A 1HWMB 3IPVB 4I1EA 3AH4A 3I8TA 1GZWA 4ZLBB 3IN9A 2ZGUA 3ZX7A 7I1BA 1S0CA 1WBAA 1VAMA 5L73A 3GALA 3PMEA 2NN8A 1PC8B 3AJYA 4ZOTA 5GZFA 3RS6A 2BFHA 3AH2A 1M2TB 4CJMA 2KM2A 3PVEA 3CA4A 1DQGA 3BAQA 2J3PA 3V0AB 5D62A 4YW1A 4LBLA 1W6QA 4K21A 1UN1A 1JBCA 4HANA 3OYWA 4GWNA 2P37A 3I4IA 4K20A 4DQAA 4Y1VA 2D24A 1IOBA 3E8LC 4NOTA 3L2YA 2A6VA 3VUOA 4XTPA 2DVDA 3FUOA 1R1ZA 2HYKA 3CAHA 2AH2A 3FUQA 4U2AA 5T5JA 3BRDA 4DFSA 2WT1A 3UJ4A 3ZSJA 3O4AA 3BAGA 2V5YA 5H9SA 2GDFA 4G1RA 1M16A 2CL2A 2DURA 3O5WB 1SR4C 3FBYA 2ZQNA 5DXDA 1G86A 3I2XA 3VSZA 1MZ6A 5JLVA 1PUMB 3KM5A 3LLPA 4YOLA 3AJ5A 4XDQA 2E6VA 5T5PA 2E51A 4YM1A 1V6LA 1UZZA 2D6LX 3RTIB 3R4SA 5FZUA 1G9DA 3BX1C 1HLCA 1SR4A 1LTEA 2GN3A 3RMXA 1LOCA 3WA1A 2A6XA 2D7FA 4OEFA 2AYHA 4DENA 4I4PA 3IIRA 3N7MA 3SITA 4WVVA 2ZGQA 2UURA 1WW7A 1KQRA 1HCEA 1NZKA 3AZWA 5JOYA 1W6MB 1BYHA 1V00A 5GZEA 1BLDA 5IK8A 1FMMS 3JUTA 3P6JA 2IWTB 2R9KB 2UWCA 1TWMA 4TYSA 3RG0A 1WLWA 4UW6A 1A78A 1V6VA 4WBCA 3ZYRA 4FP2A 1KDMA 2CNAA 1N3OA 4GALA 1GGPB 1JYIA 4Q8KA 1Q03A 1PUUB 3DGTA 2D6OX 3BA7A 3HBWA 3ILAA 1HIBA 1JT4A 4QBCA 1UL9A 1CJPA 1NUNA 1W6OA 2Y9XE 4XFSA 2ZMNA 5HPZA 3I2AA 1SFYA 2AGSA 2JKBA 4LO7C 5E24E 2BEBA 3ILFA 2PHWA 3LSDA 4BLIA 3GNEA 4G6JA 3H6RB 3W58A 1LGNA 4JRAA 3WO4A 4D0ZA 3ZC8A 3O49A 1ONKB 3FJIA 3FJEA 1CESA 1LOFC 4Z9WB 4LBJA 2D44A 4XJZA 2LIQA 5BP5A 2F2FC 3QCWA 3WDYA 4FOVA 3BIWE 3VWCA 3AZZA 4HL0A 3ILNA 3AX4A 3AJ6A 3Q7WA 1SBEA 2EIGA 2NYYA 1W6NB 4YW4A 3MW2A 4BLJA 4RL7A 4YZ4A 3UD7A 1K5VA 2F2FA 1S0FA 1MS3A 2MLLB 4AVTA 1R8OA 3R4UA 2AFGA 2VUAA 3ZXLA 1JT3A 3N7KA 4ZFWB 5DSSB 3M3QA 2ZGTA 4P9YA 3NV2A 4H55A 4OW4A 1VIWB 1SLBA 5HCBA 3VV1A 1S0BA 4G9NA 1AFCA 4HR6C 3MW4A 5F8YA 1XHBA 1JY0A 3AP7A 3W59A 2DYCA 5BXPA 4XMIA 4FPCA 1BFCA 4Q26A 5EHAA 1WW5A 3M2MA 1JOJA 4JP0A 1HKNA 2HZ9A 1LGCA 2PHXA 1V6OA 3SH5A 3FJHA 2A70A 3O0WA 3WUCA 3VT0A 5T52A 1BQPA 2QN4A 3AKIA 1DQ0A 4Y20B 3NV4A 1SCRA 4QD2B 4I4SA 1BFFA 5T5LA 3P53A 1H9PA 2FFVA 1AVXB 1DGLA 2NP0A 1WW4A 1WBLA 2XOAA 4QKRA 2ERFA 3OJMA 1T9FA 1SCSA 3ZXDA 3FJAA 2JE7A 1JQZA 3CQAA 2ZMKA 3U4XA 3IAGC 3H0OA 4X39A 1ISVA 1C1LA 4Y1ZA 4L4IA 1IT0A 21BIA 4D0TA 4FPLA 4C1XA 3DUIA 2GALA 2ARXA 3IPVA 1MD6A 1SBFA 3HOMA 4XTMA 1V6XA 3BB2A 1QQKA 5JVVA 1N3PA 1LU1A 5BVPI 4XJ8A 1ITBA 2JE9A 2Z42A 4YLZA 1UPSA 3AP4A 4IQPA 1ISZA 4PQ9A 4YM2A 2PHFA 3FJJA 1GYKA 1F5FA 4R9DA 3T1MA 2I1BA 4FPOB 3RQ0A 4QKSA 1V6IA 1S0IA 3ZSLA 3WNXA 4LBQB 5EG6C 2P39A 2MIBA 1LOEA 4AGVA 1LESA 4D8HA 3V65A 1MS1A 1B09A 1NXD1 3AJZA 4AWDA 4RA0A 3F62B 4GKYA 2JJ6A 4USPA 1QXMA 1RIRA 5BXTA 3I29B 1LEDA 2D6PA 2ZQOA 3IKWA 1AZDA 4ZFUB 4PF5A 5JOWA 1CE7B 4BM8A 3B9UA 3O0XA 4J23B 4J2KA 4Q8LA 4JCKA 2BQPA 2FHRA 3FJCA 1Z0HA 2WSUA 1JLXA 4YFWA 4F83A 1CVNA 4H04A 4PCRA 2GMMA 4OEEA 5GJ6A 2Y9FA 1DQ6A 1RINA 2A7AA 4FPJA 4HJJA 1CN1A 2YV8A 4PBPA 3BAUA 1W6PB 4YZ1A 4ISRA 3ASIA 1AJOA 3JU9A 3AZVA 1Q1UA 2R0FA 2E4MC 3Q7YA 2MC2A 1F9KA 2NMNA 3VKMA 1WD3A 5CNAA 3UJQA 4C1WA 4Q9PA 1CR7A 1W6MA 4BMEA 5DUWA 1IJTA 2YXSA 4L8QA 1DJSB 3BRGC 1H30A 4Y1UA 1APNA 2ZACA 3K1XA 1N3QA 2GNDA 1SLAA 3UK9A 4YGBA 4XJ9A 3WO3A 2GNBA 1XZZA 3ATGA 2E4MA 1JHNA 4X3AA 4Q91A 1FNYA 1MACA 3WDXA 2D3RA 2W52A 3MEPA 1LHWA 3BADA 1QF3A 1S0LA 3FFZA 1YBIA 2RHPA 3INAA 2V73A 1N1YA 3A0KA 4I3NA 4JKQA 1ULDA 1YTOA 3Q9OA 5JOZA 1V6UA 2CYFA 1FX5A 5IT6A 2P3JA 1IKPA 1FQ9A 4IZEA 4XKIA 2PHTA 1LHVA 4QALA 4YM0A 4FPKA 3PG0A 4Y1YA 5GLVA 4YW2A 3WHUA 1CIWA 2P2KA 1CQ9A 1W3FA 3UJOA 1A3KA 5DUUA 4GOYA 4HA2A 1BFBA 2YZ4A 2AUYA 1UX6A 1N1SA 3H6RA 3UJ0A 2FGFA 3HN1A 1I1EA 3O44A 1GNZA 4DPNA 1LU2A 4YGCA 1II4A 1IS4A 2I2SA 1LJ7A 4QO3A 3LTQA 1DZCA 4DRRA 3T1LA 2EXKA 2GNTA 5JOXA 4XBQA 1SLIA 3WMUA 4XXPA 1GV9A 3BRFA 2ZGKA 4K1ZA 3S8JA 1W6NA 4Y24A 1ENRA 1IKQA 1I1BA 3TB0A 4CZSA 1J1TA 5BXRA 5IK7A 4KC3A 4LBQD 4P0JA 5H9QA 3ENRA 4KEJA 3WVJA 2D20A 4FQ4A 1BARA 4XXAA 1K5UA 3PVOA 1LECA 1JN2P 3VKLA 4I96A 4AVSA 1SZ6B 1FV3A 2DRYA 5FNWA 1GNHA 2DVFA 3MW3A 1CPNA 3CNAA 1P63A 1LENA 1KJLA 2DUQA 5D61A 1DBNA 4UW3A 1FN0A 1TTUA 5KXDA 2Y9WC 1G82A 4XJUA 4DEPA 3B00A 3USUB 4J2SA 2GNMA 4M3CE 1JT5A 1IS6A 3V0BB 2K43A 1WBCA 2QYIB 1DQ2A 1QOOA 3IM6A 1WLDA 5GLWA 1X50A 3OJBA 2PHUA 4Y20A 4AVVA 1DQ1A 1JYCA 2AENA 3ILRA 2DV9A 1EYLA 3O4BA 1WUVA 4FPFA 4M01A 3PJQA 3P6IA 4Y26A 2VXRA 1DIWA 4LBNA 2X2TA 3B9CA 2HWMA 3CA5A 2EXIA 1ULEA 5BP5C 4JC1A 4LBMA 4I0YA 3VKFC 4WZFA 2EALA 1JTCA 2KI6B 1ISWA 1S0JA 2L5XA 4Q1RA 2KKIA 2CY6A 4ATEA 1S0EA 8I1BA 2FO1A 2AAIB 4FOYA 5HCAA 4CTEA 1UZYA 4GA9A 1DQ4A 4LBOA 1NLSA 3POYA 5DZUA 1PWAA 4FPYA 2RSTA 4LO3A 3BODA 3B3QE 1HKDA 3CA0A 5KXBA 2NMOA 1EPWA 4TZDA 5DG2A 3O4DA 2WBCA 1ABRB 3N3HA 1MVEA 1SBDA 2WSVA 4FPEA 1TEIA 1HWOB 3O0VA 3WG1A 4XE9A 4BMBA 1LOBA 4LO1A 2R1DA 1C1FA 4LBQA 1ISXA 5CBLA 3RSJA 1AF9A 2DVAA 3A4UA 1Q04A 3VEQA 5GZCA 1UAIA 3NBEA 1HDKA 1KDKA 1N1TA 1MZ5A 4EFRA 4Q27A 4ZA3B 4ZBVB 1FWUA 3FJKA 2CWSA 1LULA 1Q8OA 2A75A 4KEKA 3ZXGA 2ZHLA 4FPHA 3HALA 1GLHA 1OFSA 4Z8BA 1AXKA 4XOGA 4XIOA 1FYUA 3AP5A 1ULFA 2W68A 1MS8A 4YZ5A 1QNYA 4KBBA 1C4RA 1DFCA 3EF2A 5DUXA 4A7ZA 2JD4A 2WQZC 2VU9A 4XFTA 3OGFA 4P0LA 1HQWA 1JLYA 1JW6A 4NO4A 3O12A 4ITCA 2ZGRA 4ZKTB 1N4KA 3T8SA 3O4OA 4H9WA 3WUDA 4OEGA 2UU8A 5DUVA 4I7IA 1IS3A 1ULCA 2RQ9A 3B01A 5H9RA 4YG3A 1AXYA 1FWVA 3NV3A 1N47A 3OPZA 3SNVA 3PVNA 5GZGA 3FJ8A 4UW5A 4OWKA 2OVUA 1Q8SA 1RMLA 2ZHNA 2AQZA 5IUQA 1RG8A 4YFZA 4YM3A 1PZ8A 1LHNA 3SLIA 2UWAA 1TFMB 4I4RA 5KXCA 3N0KA 2ZHMA 1V6NA 1Z2VA 2WJSA 3D5OA 1SLLA 5FRAA 3D7WB 4I4OA 4XMAA 5F8WA 4GP0A 1W6OB 5GALA 3A0NA 1IRAX 3H6SE 1Y7BA 1KRIA 1Q8VA 2XB6C 2Z49A 4XBNA 1QNWA 4AN6A 4XZPA 5EC5A 1N1VA 1VAVA 1RITA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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