2VUAA

Crystal structure of the botulinum neurotoxin serotype a binding domain
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
425
structure length
423
Chain Sequence
HMDTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of Botulinum Neurotoxin Type a in Complex with the Cell Surface Co-Receptor Gt1B- Insight Into the Toxin-Neuron Interaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN A HEAVY CHAIN
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
total genus 115
structure length 423
sequence length 425
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2008-05-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2vuaA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2vuaA02
4BLJA 2EAKA 3RS6A 2WT2A 2R1BA 1H9WA 1QXMA 4R9AA 4EFPA 4KEKA 3H6RA 1BJQA 1C4RA 4YLZA 2NN8A 4GOYA 1ULCA 1YF8B 3QCWA 3ATGA 1Z2VA 1JLXA 1C57A 4FOWA 2WT1A 3BADA 3OGFA 4XJAA 4U2AA 3C9ZA 3ZSKA 1LENA 1JYCA 3CAHA 3K1XA 5DVHA 1TWMA 2JJ6A 4YW1A 3I2AA 5FZUA 3USUB 3BRGC 2EIGA 1FV2A 4X39A 4L4HA 2QYIB 1SR4A 3IM6A 5GLZA 1DZCA 5H9QA 3O0VA 4YZ1A 2A6XA 5F8YA 1UPSA 2GO2A 4RL7A 1G82A 1SLIA 3WNXA 4TYSA 4UW4A 3NBDA 4KEIA 4UW5A 3CNAA 3WG4A 4P0KA 4KEJA 4UW6A 5SV8A 3O5WB 2DV9A 5JOXA 5G00A 4GA9A 2OUJA 4XILA 5GM0A 4LO8B 4OEGA 3T1MA 2OW4A 1GANA 3OY8A 1LHNA 1TIEA 2LALA 4GWNA 4LBMA 1W3FA 2ZHNA 3PVOA 1ZA4A 2ARXA 4PBOA 4A7YA 4PQ9A 3CA6A 4KC3A 4Q26A 2ZMNA 3FFZA 2A6ZA 2ZBJA 4DENA 1N4KA 4PF5A 4K21A 3LTQA 2JD4A 4DRVA 5JDBA 3NV3A 4AGGA 4D69A 3UD8A 1HQWA 3V0AA 2P23A 3UL2A 3NV4A 4P9XA 4BMEA 4ATEA 3WDYA 3WVJA 3AXEA 1N1YA 4AGVA 1S0FA 1BFCA 5F5QA 2XOAA 3CA4A 2WNEA 3AP7A 2VXTI 2H0BA 4XJ9A 5DG1A 1O4YA 4SLIA 3N7MA 2DYCA 2E4MC 1OQ1A 1ITBA 4PBPA 1IOBA 5D62A 3TC2A 5BOWA 3BB2A 3M2MA 5DUYA 3IM5A 1JTCA 4I4QA 1RITA 2R9KB 3VSFA 2AYHA 2NMOA 2ZA9A 3AZYA 4QC4A 5GALA 41BIA 3SH3A 3CA3A 1ISXA 2YUGA 3ZXGA 2ZZJA 1MD6A 2D7RA 5D61A 4AN6A 4I3NA 4K20A 3FJHA 5DG2A 4J2SA 3HOMA 3FLTA 3WMVA 1GYKA 3WOGA 4XIKA 4M01A 3FJJA 2ZMKA 2DREA 2Y9WC 4LO7B 4ZXKA 1AVWB 3A22A 1YTOA 3VV1A 1PZ8A 4GAFA 3BRFA 2ZGTA 4OWJA 2VUAA 1CPMA 3AZVA 4LBQA 2WSVA 1S0BA 5F8WA 1AVAC 1WBLA 4LBKA 5BYNA 1ENSA 4WV8A 3ILAA 5GZGA 1BARA 3OJBA 1LGCA 3O4OA 1JYIA 3BAGA 4AYUA 4JPZA 5BXRA 4YOLA 2KH2A 4Y24A 4P6AA 2ZACA 4Q1RA 1YYNA 4IZEA 2YZ4A 1SLAA 4OEEA 1HDKA 3JUTA 4GWMA 3AP6A 1MS3A 1I1EA 4YG3A 2FHRA 5DZGA 2WT0A 3LSDA 1AZDA 1GV9A 5FREA 4R9DA 4QBVA 1QMJA 3POWA 1W3AA 1A8DA 3WDUA 4DFSA 4H9WA 2EXJA 3WCRA 4LO3C 2YV8A 2ZQNA 4W65A 1JT5A 1GLHA 4NO4A 4ZLBB 1WW5A 4I4XA 2CWSA 4FPEA 2KKIA 1H9PA 2EALA 2WSUA 3PHZA 2PELA 2VH9A 2HWMA 3FJBA 3O4AA 1JY0A 3HN1A 4J2YA 2AH2A 3DGTA 2D7IA 3ZSMA 1QNWA 1DFCA 1QNYA 1QDOA 3KM5A 4BM8A 1JBCA 4I96A 2ZGOA 1Q8VA 1NXD1 4M3CE 3ZVXA 2D44A 3B69A 3BAUA 1N1SA 1SR4C 2ZKNA 4XHBA 5GZEA 4YW3A 3FUOA 1MS9A 4FOVA 1BLAA 3WA1A 3E8LC 3MALA 2DVFA 1RY7A 3BTAA 4I30A 3NV2A 1ISWA 1Q8SA 1GZWB 3M3QA 1IS5A 1QF3A 4YG6A 4I4SA 1DYKA 1VIWB 4XIOA 1MS4A 1S0JA 3ZYRA 3WV6A 1Q8PA 5D63A 2WKKA 3FJ8A 2MC2A 4XBQA 1LOEA 1GZCA 1QOSA 2E7QA 3T1LA 1UKGA 2FMDA 3N7LA 3AXDA 3M3OA 1SLTA 1IHKA 1W6PB 5CNAA 3UJOA 1JQZA 4U36A 2MLLB 3AP4A 4IONA 1DQ1A 4R6UB 3M3EA 4I4PA 4JKQA 4ATFA 3UJ4A 4XJUA 3TB0A 4AVTA 3IAGC 3P53A 2E4MA 5E89A 3BAQA 4XJ8A 1XZZA 4YM3A 2UURA 2D3SA 2KI6B 5GLVA 2Q5TA 1JUIA 5IK7A 2GZBA 4JKXB 2FDBM 3P6JA 3POKA 4FOYA 3SITA 5KXEA 1ULGA 2ZGSA 4FPHA 2B7YA 2A75A 1H30A 5EYXA 1T4QA 4XFTA 3PJQA 5E88A 1BQPA 2E51A 4FPFA 3O44A 1W3GA 5FZYA 2K8RA 3JU9A 1S0DA 2FO1A 3ILFA 4XYXA 1N3PA 1KDMA 3RTJB 4HA2A 2CY6A 2VSAA 3CRGA 1LHOA 2DS0A 4LBJA 5DUVA 4DS0A 4BMBA 5DSSB 3CA5A 1FX5A 4M00A 5JLVA 3W59A 2A3YA 2UWAA 2FFUA 1BXHA 3O0XA 4P9YA 4IY8A 3N35A 1BZWA 1PUUB 1SLBA 3M1HA 1J0SA 1MR5A 2ZGUA 2D3PA 1S0IA 2P3IA 2W52A 1PUMB 1KITA 3ZXFA 5FNWA 1F9KA 1L2HA 2DVGA 4XMAA 1S1AA 2X2TA 1IRAX 3USUA 4X37A 2ZGLA 2EF6A 1A3KA 1ENRA 1S0EA 3JUUA 3HALA 4DCKC 2VW1A 5BVPI 1WLCA 4RA0A 4YW4A 4Q91A 1WUVA 4I8MA 4XTPA 2GN7A 3M3CA 2VSEA 1M2TB 1DZQA 1LODA 1LECA 4II0A 4JP0A 1AJOA 4LO3A 1AXZA 3KMVA 2D6MA 2PHXA 1KDKA 5LK5A 4BLIA 1BASA 3BRDA 1LOGA 1TOOA 1WD4A 1DBNA 5B2HA 2XB6C 2AR6A 3VT0A 2ES3A 4IQPA 3SH4A 1QQLA 4Y22B 1JT4A 2A5ZA 4OUJA 4YGCA 3N3HA 5DUWA 5KXCA 1MS8A 1WBCA 2CTVA 3MPPG 2GMEA 4Y1XA 2W08A 4Q9GA 3EF2A 5EWSA 1K5VA 1HWPB 2F2FA 1LU2A 1LOBA 4ITCA 1LOCA 1MS1A 3KQRA 4G6JA 1UZYA 2D1ZA 3VKFC 3CA0A 3D6EA 3OJMA 1GGPB 2DUPA 2FFVA 1JLYA 5GLTA 3QYDA 4TZDA 1LHVA 1N3OA 4I6IA 5DZEA 2DU1A 2DVBA 2GNBA 4XFSA 1YXWA 3B01A 3UJQA 1G9FA 1WW6A 2D22A 1DQGA 4QBCA 2P3JA 4ZKTB 4QO3A 21BIA 1QU0A 4FQZA 1HKNA 4I1BA 2F8XC 3AH1A 2V5YA 3QLQA 5CAZA 4XE9A 1VAVA 3IM7A 1DQOA 4C1WA 3FJAA 3D5OA 4YFZA 2AXMA 4EFQA 5JVVA 3ZXJA 3AKGA 1FMMS 4AVVA 1IS3A 1V6NA 3O4CA 1LHUA 3N7KA 1TEIA 4ZBVB 1J1TA 3POSA 3BA4A 3NBEA 2VLCA 5CA6A 2A6YA 1RZOB 1KQRA 1G9CA 31BIA 1PZ7A 2GMMA 3LCPA 2KI4A 1II4A 3FUQA 5CB7A 5GZCA 3ZXKA 1QOOA 3H6SE 4G6MA 4PC4A 2EXHA 2MIBA 1DYPA 1FYUA 1YI7A 1EV2A 4K1YA 3WO4A 1Q04A 2W68A 4I2SA 2ZGPA 5EHAA 4XBLA 2P39A 2GALA 2UUSA 4ZGRB 3WDWA 1BYHA 1VCLA 1SLCA 4LBNA 1BKZA 4Y1UA 4QKRA 3I4IA 1ENQA 4ZFWB 1LHWA 4R9BA 3V65A 4WVVA 2K4AB 3SNVA 4NOTA 5F8SA 4BPZA 1XG6A 4HANA 1SBEA 1Z78A 3WLUA 4LBOA 3A4UA 4P0JA 2Z48A 2OVUA 4GAIA 4L4IA 4TLPA 1AXYA 3AJZA 2Z42A 3ENRA 1DJSB 3HBWA 4FVVA 4YGEA 1C1FA 3O5SA 2ZHLA 4CJMA 3IMNA 3WG2A 3ZYPA 4P0LA 4JAWA 1DZDA 5DZFA 1GBGA 3BA7A 4EKXB 2EXKA 5T54A 3H6QA 4G1RA 5JOZA 2R49A 5EG6C 1LOAA 1NZKA 3RSJA 1KRIA 4L8QA 3V0BB 2DVAA 1U0AA 1DQ2A 4DRRA 1GICA 1SACA 4QKSA 3S8KA 2FGFA 1S0LA 1UL9A 2IHOA 2NM1A 2XG3A 3AYAA 3A23A 3AJ5A 1LEMA 2JE9A 2SLIA 2RQ9A 3D4KA 1ISZA 3VKLA 9ILBA 1ONKB 3WMUA 2I2SA 1HWNB 1MVQA 3O49A 1T9FA 1N47A 5GZFA 2C9AA 3O4DA 4F34A 4M3CF 2AGSA 4AWDA 2OUHA 1FGAA 3O3QA 4IZXA 3OBTA 1GZWA 4DQAA 1EYLA 2JE7A 2ZGMA 2R16A 1GSLA 3AP9A 1DGLA 3WHTA 5F90A 1W6QB 4OWLA 1VLNA 1DQ6A 3Q7XA 3L2YA 1R1ZA 2LTNA 2YMZA 3AYCA 3OJVA 3BAVA 4LO1A 2V73A 4Z9WB 3FLPA 1FN0A 1W6PA 3F1RA 1ULFA 5HCBA 4JQ0A 3VKMA 1MZ6A 1ILR1 4JC1A 5BXTA 5T50A 1AX0A 1ABRB 4YW5A 1KJRA 2DTWA 1BFGA 1FAYA 5EXOA 3OBRA 1M16A 2F2FC 1W6NB 4UW3A 2D6OX 4Y26A 1PZZA 1IKQA 4GKXA 3H0OA 2ESUA 3DUIA 2PHWA 5DZUA 4LBQD 2RG9B 4EFRA 3A0NA 1BLDA 3B9UA 1PZ9A 8I1BA 3VT1A 2NMNA 1LOFC 1Q03A 2UU8A 1TTUA 2CYFA 3B3QE 1HLCA 1HCEA 1QKQA 5BXPA 2A3XA 1OQLB 4XXAA 3V64A 1CJPA 1F5FA 4Q9PA 1WW4A 4OZXA 1QDCA 2GNDA 3APBA 3SISA 4LO2A 2PHFA 3AKHA 1Z4SA 1YIFA 1GNHA 2R1DA 1SBFA 1S0GA 1LCLA 1AXMA 3ILRA 1BFFA 2A6WA 2E7TA 2DUOA 1UN1A 2C5DA 1LESA 3AX4A 2G4IA 2GDFA 3O4BA 5BQUC 4BQ1A 1N3QA 2DU0A 4I4UA 2GMPA 1DIWA 5AVAA 3PUBA 4D0ZA 2A70A 4USOA 5IK4A 2AREA 2ZABA 1Q1UA 4LO7C 4FP3A 4HJJA 3Q9OA 3IM0A 2E53A 3NJ5A 4WZFA 1D2SA 3QR5A 4A7ZA 3WG3A 2DRYA 4FGFA 4KBBA 5JMCA 1R8OA 4HL0A 1LTEA 1ULDA 2VY0A 3AH4A 5DUXA 1Q56A 3ZX7A 3AYDA 3WG1A 1LU1A 3W9TA 1AVBA 5GJ6A 1BFBA 2VW2A 2P34A 2ZR1B 4GP3A 3VT2A 4LBLA 1V6VA 4XBNA 2WRYA 4FPLA 4Y20B 4XHXA 4Q8LA 3P6IA 1QGLA 2D6PA 4GXLA 4Y22A 1SCRA 1DHKB 5BP5A 4Z8SB 3HSMA 1TP0A 5T52A 3IIRA 1W0OA 4YZ5A 1MC9A 4OWKA 3FLRA 1SZ6B 4YW2A 3NBCA 4XJZA 3Q7WA 4M3CB 3IPVB 1V6XA 3RRDA 3S8JA 3SH5A 4XKIA 3UD9A 3BAHA 3N0KA 2TEPA 5KXBA 3FJIA 1MVEA 4PCRA 1R8NA 4FPCA 2D20A 4Q8KA 1KNMA 3FJFA 1JN2P 3ZXEA 3BX1C 1CONA 3R4UA 4Q1PA 1SLLA 1CVSA 3ZPYA 3NWKA 2KLLA 1AVXB 4FQ4A 1W6MB 2RSTA 3AKFA 5EC5A 3B00A 4YZ4A 4C1XA 3INAA 3IKWA 3POYA 4FPYA 3AJ6A 3WUDA 3ZC8A 2WJSA 1HCDA 4GP0A 1LULA 1VAMA 1W6OB 4K1ZA 2PHUA 1IS4A 4USPA 3NV1A 2ZHKA 3WDTA 2ET2A 2KM2A 5H9PA 3SLIA 4Q27A 3WUCA 4BOWA 1AVUA 3CRHA 4LO1C 1V6LA 3C2UA 3IN9A 1IILA 1JXNA 1CN1A 4ZA3B 1V6MA 2NVHA 1JOJA 3OYWB 2D7FA 1GZ9A 3NBNA 3FBYA 2DRZA 1MS5A 2ZHMA 1ISVA 4OW4A 4QD2B 3ZXDA 2D6KA 5GAQA 1LOFA 5BXSA 2CNAA 2Y9FA 2QN4A 5JOWA 2Y9GA 4XDQA 4G9NA 3V79C 2HW9A 4LO0C 1VALA 3LSEA 3R05A 2ZGNA 3VKNA 4EB2B 3MW2A 5H9RA 3Q7YA 4ISQA 3PVEA 4I4YA 2ERMA 3N36A 2JECA 1AJKA 5HCAA 2A6VA 5HPZA 3A0KA 3H6RB 1LEDA 4DPNA 2DURA 3CU1B 1NUNA 2E6VA 4CZSA 1ULEA 3AYEA 1Q8QA 4I1EA 2AENA 5T5JA 3W58A 2D23A 5L73A 1FATA 3BA5A 1XQNA 2I1BA 3VUOA 1WBAA 1QQKA 1OFSA 1G9DA 5BQUA 3WINC 3VKOA 4YM2A 4LO2C 1A78A 1O4ZA 1CVNA 4EEEB 4AVSA 2JKBA 3CQAA 3TAYA 3O0WA 2BFHA 3AKIA 1UMZA 2D3RA 3AJYA 5DXDA 2AAIB 5FZZA 2D6NA 1JHNA 2HWAA 1Y7BA 4YZ3A 2WBCA 3V0BA 4YG0A 1IT0A 1OKQA 2SBAA 4GKYA 1RMLA 4ISRA 2X2SA 3AFKA 1IKPA 2GNTA 1S0CA 3D7WB 2IWTB 1MS0A 2VW0A 2P2KA 3MW4A 3OGGA 5F9TA 4D0TA 2WLQA 1N1VA 2NP0A 1YO8A 3OY8B 4YM0A 2A7AA 4H04A 1RINA 5T5OA 5IUQA 1Q8OA 2WQZC 2UWBA 4I4OA 1TFMB 4YFWA 5T5LA 5H9SA 5T55A 1V6OA 3ASIA 5E8AA 1DQ0A 1EVTA 3F62B 4Y1YA 4YGBA 3T8SA 1PWAA 4Y1ZA 3AP5A 1W6QA 3HR9A 3AZWA 1BA7A 1I1BA 1SFYA 3UJ0A 1JW6A 2DWRA 3ZXLA 1WLWA 3I8TA 1F31A 3V0AB 1FNZA 1G9BA 4HR6C 2YY1A 4AN7B 2D6LX 4I7IA 4Z8BA 2Z49A 3RG0A 2Q3NB 3FJKA 4QALA 3T2TA 3JRRA 2GNMA 1IJTA 1HKDA 2DTYA 4XJWA 5BP5C 2PHRA 3ZSJA 1FWVA 2AFGA 2DUQA 4I0YA 1UZZA 4GALA 5IK5A 1V6IA 1W6NA 1V6KA 3FJDA 1HIBA 1JT3A 1G8WA 4OEFA 4CTEA 3CRIA 4H55A 1LGNA 3WO2A 4GOVA 4ZFYB 2YROA 1FNYA 2ZGQA 1LJ7A 4J23B 5CBLA 3ZC9A 4QD2C 5FRAA 4F83A 1G9AA 2RHPA 2AUYA 2W39A 3UD7A 3RMXA 5T5PA 1V6WA 2NYYA 2R0HA 2CWMA 4FOQA 3OJ2A 5EYYA 3RMYA 1YBIA 2HZ9A 4XXPA 4WVWA 4IYBA 4JCKA 1E0OA 2Q9XA 2ZMLA 2D24A 3GALA 3RQ0A 5FNXA 3BOPA 1SBDA 4FPGA 4R9CA 3VWCA 3GNEA 1MZ5A 2EXIA 1DLLA 4ASMB 4LO0A 4LBQB 1CE7B 1I3HA 4YGDA 3MW3A 1C1LA 2ZAAA 2VXRA 5IK8A 3AH2A 4I4RA 5E24E 4JRAA 3R4SA 1PC8B 3O12A 1APNA 3A21A 2A71A 1FMZA 4CRQA 3B9CA 4X3AA 1AX1A 1CESA 4P14A 2M49A 1URXA 1DFQA 1X50A 1AXKA 4XFUA 2A3WA 1HWOB 1ISYA 2ARBA 1RG8A 2BEBA 1QOTA 3AZXA 1CQ9A 1XYFA 2ENRA 4ENDA 2J3PA 1YRZA 3FJCA 4XZPA 2LIQA 4D8HA 3WINA 1V6UA 3RTIB 4YZ2A 6I1BA 2P3KA 1G7YA 3WO3A 5GLWA 1AX2A 2ZGKA 3N7JA 2BEAA 1B09A 4FPOB 1IS6A 4IHZA 1ZM1A 3UDAA 2ZQOA 1FV3A 4Y20A 3MEPA 1D0HA 4XTMA 4IY9A 2HYKA 4I37A 3PG0A 1CPNA 2P37A 1FQ9A 1Z0HA 1IRPA 2JDZA 3VEQA 1GKBA 1V00A 4XOGA 1IOAA 4M3CA 3IPVA 5GZDA 5DUUA 1AF9A 2Y9XE 1KJLA 1G86A 1EPWA 2D43A 3U4XA 1CIWA 1CR7A 4FPJA 4FP2A 2ZGRA 3BODA 3AK0A 1WCSA 3CA1A 1MACA 4DEPA 5HCFA 1HWMB 2YXSA 2ERFA 2NZ9A 1UX6A 3WCSA 4X38A 5GLUA 1XHBA 3PVNA 1WBFA 4I4VA 1JT7A 4ZOTA 1W6MA 1GNZA 3AZZA 2K43A 1NLSA 1ONAA 1N1TA 1LGBA 2VU9A 2GN3A 1WW7A 3FJEA 4J2XA 4G9MA 1SCSA 1RIRA 3ZSLA 4FPKA 1FWUA 1W6OA 2AQZA 4A7KA 1K5UA 3BAOA 1P63A 3OPZA 7I1BA 2PHTA 4MYEA 2BQPA 3FGMA 3WZ1A 5IT6A 4YM1A 3ILNA 4AGRA 1UAIA 3VSZA 3I2XA 2R0FA 2L5XA 1TWEA 3UK9A 2DVDA 5KXDA 1WD3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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