2VXRA

Crystal structure of the botulinum neurotoxin serotype g binding domain
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
431
structure length
428
Chain Sequence
NAILSLSYRGGRLIDSSGYGATMNVGSDVIFNDIGNGQFKLNNSENSNITAHQSKFVVYDSMFDNFSINFWVRTPKYNNNDIQTYLQNEYTIISCIKNDSGWKVSIKGNRIIWTLIDVNAKSKSIFFEYSIKDNISDYINKWFSITITNDRLGNANIYINGSLKKSEKILNLDRINSSNDIDFKLINCTDTTKFVWIKDFNIFGRELNATEVSSLYWIQSSTNTLKDFWGNPLRYDTQYYLFNQGMQNIYIKYFSKASMGETAPRTNFNNAAINYQNLYLGLRFIIKKASNSRNINNDNIVREGDYIYLNIDNISDESYRVYVLVNSKEIQTQLFLAPINDDPTFYDVLQIKKYYEKTTYNCQILCEKDTKTFGLFGIGKFVKDYWDTYDNYFCISQWYLRRISENINKLRLGCNWQFIPVDEGWTEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of the Botulinum Neurotoxin Type G Binding Domain: Insight Into Cell Surface Binding.
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE G
total genus 117
structure length 428
sequence length 431
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2008-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2vxrA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2vxrA02
3IKWA 3AH1A 1QGLA 1CONA 1ILR1 1GNZA 1II4A 2DUOA 5GLVA 3KM5A 1SBFA 2DRYA 1KDKA 1JYIA 3A0KA 5FRAA 1IOAA 1VAMA 2A5ZA 1V6IA 4X39A 1V6MA 3FJKA 4L8QA 4GA9A 1JLYA 5DUUA 3JUTA 2MIBA 5L73A 2FO1A 1HWOB 4ITCA 3V65A 3BRFA 2ZMLA 2D6KA 2C9AA 2L5XA 3AZYA 4I1EA 4Y1UA 3WCRA 4FP2A 4XHBA 2EALA 4Q2FA 1RIRA 1LHOA 4YGDA 4BQ1A 1LODA 1S0BA 4Q8LA 2NZ9A 3PHZA 5BXRA 2E51A 2BQPA 4YZ3A 5GAQA 3UJ0A 2DVBA 2I1BA 2OW4A 4I4QA 5BXSA 1GANA 1QMJA 1H9WA 2Q9XA 4NO4A 3PVNA 3SH3A 2ZHKA 3NWKA 4YW3A 4K1ZA 3Q9OA 2ZHNA 4PQ9A 1RITA 4GKXA 2P3JA 3WVJA 3BAGA 4XXAA 3E8LC 2HYKA 1RZOB 2DVAA 1MZ5A 2AQZA 3FJIA 4PCRA 1W6PA 2XOAA 5EWSA 1Q8PA 3V0AA 2CWMA 3T1MA 4LO8B 4G1RA 3SITA 2EXKA 2ZGQA 3HN1A 3ZSMA 2R1BA 4FPHA 4XTPA 1DQOA 4Y1ZA 4TZDA 5T5LA 3BRDA 4LBMA 3A0NA 2GMPA 5EG6C 4YG3A 2DVDA 2ZKNA 3R4SA 1W3GA 1AVAC 3APBA 2D3SA 4I4YA 1LHVA 1QXMA 2DRZA 2ZQOA 1LJ7A 3ZPYA 5IT6A 4USOA 2FHRA 2BEAA 4P0KA 5DVHA 3BODA 3POYA 2ET2A 2AFGA 2D1ZA 1DQ5A 2A6XA 3BA7A 4FPKA 2YUGA 3USUB 3Q7YA 5E89A 4JRAA 1QF3A 2DTWA 2V73A 3C9ZA 1BLAA 2CTVA 3AZVA 2QYIB 1QDOA 4AWDA 4AVVA 1FGAA 3ZX7A 2LIQA 2VSAA 1GV9A 2JE7A 1H30A 4DEPA 1V6LA 1DQ4A 3VKMA 4Z8SB 2PHFA 3N0KA 3WLUA 4I4PA 1HCEA 3C2UA 5DUYA 5FZUA 3WDVA 1FQ9A 4PF5A 2LALA 1IHKA 2AYHA 1FWVA 3DUIA 1LTEA 5EHAA 2DUQA 2GN3A 3I2XA 1N3PA 2RHPA 3FJ9A 2TEPA 3N7MA 1MS5A 2ZGNA 1ENSA 2GALA 4P6AA 4I1BA 4OWJA 3OBRA 1CE7B 1MR5A 1FWUA 3ZXKA 5FZYA 3RRDA 3M3OA 3NJ5A 4ZFUB 4GOVA 3CA4A 4WZFA 5IK4A 3GALA 5BQUA 5DXDA 4Q91A 1SLBA 4OUJA 1BFGA 4I0YA 5CA6A 3NV1A 1AVWB 3WO4A 1DZQA 2KLLA 3CRHA 2VUAA 2EXIA 4HL0A 2M49A 4D8HA 4UW5A 3WCSA 4C1XA 3AYEA 4JKXB 5GLUA 1MVQA 4ZXKA 4A7YA 1GGPB 2UWAA 3T2TA 4LO2C 1DYPA 2I2SA 2PHTA 4C1WA 4K20A 2X2SA 1GZ9A 1DZDA 4W65A 5SV8A 3MW3A 1VLNA 4WVWA 4BOWA 3ZXDA 3VUOA 3W59A 4ZGRB 3ZXFA 2P3KA 3I4IA 3ZYRA 2DV9A 1ULCA 1VALA 2ZGOA 4LO1A 5GZGA 3WDTA 2JKBA 1HQLA 4HJJA 1JXNA 4DFSA 3FJCA 1V6OA 4K21A 2NMOA 3BRGC 3N3HA 4Q9GA 3LSEA 2ZBJA 4XJ9A 3A07A 1I3HA 3MEPA 1S0CA 1L2HA 5DG2A 2H0BA 3OY8A 1ISVA 1DJSB 3O4DA 1XG6A 1WD4A 1FMMS 2IWTB 1PZ7A 2F2FA 4SLIA 2PHRA 2C5DA 1BJQA 4LO7C 4Q8KA 1DGLA 4ISQA 3UK9A 4G6MA 4EB2B 1DYKA 5FNXA 4AGGA 3SH5A 4JC1A 4Y22A 3WMUA 2XG3A 2RQ9A 4R9BA 4I8MA 1OKQA 1ABRB 3CA0A 3NV2A 2Y9WC 3H0OA 2UUSA 3NBEA 3P6JA 1GNHA 3AJZA 1KDMA 3WZ1A 1WBFA 4XJ8A 3O0WA 5BP5A 1KJLA 5H9RA 4Y1YA 1V6UA 3MALA 2YROA 3CRGA 1Q1UA 2GNTA 1W6OA 5IK5A 1GBGA 3RG0A 2YXSA 3NBNA 3AP5A 1H9PA 2SBAA 4YLZA 5KXCA 4DQAA 4XBNA 4IZXA 5H9QA 1GKBA 3VSZA 2HZ9A 3B00A 2V5YA 4LBOA 4KC3A 2KM2A 1SCSA 3N7JA 5AVAA 3V79C 1PWAA 1LEMA 2A6ZA 4M3CA 3FFZA 1G9AA 3CQAA 3WNXA 3KMVA 3QLQA 2P3IA 4QBCA 3PVEA 1YF8B 1W3FA 4YM0A 1G9DA 5G00A 1WLDA 1BQPA 2NP0A 4LO3A 2VW2A 4J2XA 3O49A 3RQ0A 3B9CA 5F5QA 4BM8A 2UWBA 1FX5A 4H55A 2VW1A 4HA2A 3CA6A 4PBOA 3OYWA 3BAHA 2JE9A 2DU0A 4R6UB 4DRRA 4LBQA 4P0JA 1OQLB 1R1ZA 4QKSA 4DRVA 4YW5A 2NN8A 4R9AA 3ZVXA 2FFVA 4IY9A 4YG6A 4GP3A 4Y20A 5I1BA 3EF2A 3F62B 3CAHA 1G9BA 1G8WA 1AXKA 3ZXEA 4JCKA 3M3QA 3JUUA 1JQZA 3O0XA 2GNDA 2ZABA 4M00A 1IRPA 4YW2A 1CPMA 1TP0A 3V0BB 1DFQA 2NVHA 3P6IA 1G86A 1JYCA 4Q27A 1S0IA 4GAFA 1MACA 1S0GA 4OZXA 4XFTA 3POWA 4IY8A 3GNEA 4GWMA 1CQ9A 3ILAA 3WOGA 3FJDA 2P37A 1ULEA 1GZCA 2ZZJA 3T8SA 3JRRA 1XZZA 4G6JA 5E24E 2CWSA 1LENA 1KJRA 1AJKA 1NZKA 4X3AA 4EFPA 2VY0A 3HR9A 3A21A 4FPGA 1RY7A 1ITBA 1YTOA 5F8YA 4NOTA 4K1YA 4XJZA 1F5FA 2HWAA 1SLLA 1DBNA 2OUJA 2A6VA 2P39A 5DSSB 1BLDA 4KEKA 1UPSA 4GALA 1W6QB 1QOOA 4RL7A 1JT5A 1DQGA 1PZ8A 1FNZA 3D6EA 2RG9B 4J2SA 1SBDA 3WDWA 3QYDA 1Q56A 1GICA 3OJ2A 2A6YA 1C57A 1V6KA 4GWNA 5CB7A 2DS0A 1BA7A 1IRAX 1JY0A 5H9SA 1KNMA 3AJYA 4YW1A 2X2TA 4LO7B 4ZBVB 21BIA 1SACA 1M2TB 1F9KA 2ZGSA 5BQUC 2FGFA 4I7IA 1SCRA 4I6IA 1RMLA 5JOZA 1W6NA 2ZGUA 4FPJA 3NV3A 4WBCA 6I1BA 1N1YA 2Q5TA 1IS6A 3IIRA 3UJOA 2P34A 1CJPA 4LBKA 3FUOA 2LTNA 2EAKA 1O4YA 2MLLB 7I1BA 3L2YA 3VT0A 1HWPB 3WHTA 2E4MA 3AP9A 3ZC8A 1TOOA 4GKYA 1K5UA 3PMEA 3AXDA 1OQ1A 1CESA 2DYCA 2Q3NB 3POKA 3BADA 4WVVA 4QO3A 2BEBA 3RMXA 1A78A 3BA5A 1TTUA 4JAWA 3WMVA 3I29B 3R05A 3LTQA 1TWMA 4LO1C 3BAQA 3WHUA 1CPNA 4LBQD 3H6RA 1ULDA 2VXRA 5KXBA 5BVPI 4AGRA 3UD7A 3B9UA 1LULA 1WBAA 1XHBA 4KEIA 3UD8A 1Y7BA 2GZBA 4IYBA 4OEGA 1JUIA 1ISYA 3ATGA 3HMYA 1N3QA 4LBLA 1AX1A 1CVNA 4YGCA 2GNMA 1GSLA 5GM0A 1F31A 1AX2A 1UAIA 1W6PB 4ISRA 4FPYA 1SLTA 1QQKA 5HCBA 1GZWA 2ZGLA 1W3AA 3V0AB 2CY6A 1J1TA 4I4SA 4GP0A 2AXMA 1V6VA 4OEEA 4P9XA 3A22A 2F2FC 3AXEA 1IT0A 1IS5A 1LESA 2YZ4A 1EYLA 2VXTI 3IM5A 1Q8QA 2W52A 4AYUA 1BKZA 1FYUA 1O4ZA 1WUVA 4HR6C 4PC4A 3M2MA 3TAYA 41BIA 2ES3A 1UZZA 5IK8A 5BOWA 2JDZA 5BP5C 3TB0A 31BIA 2NM1A 4F34A 3AH4A 4AVTA 2DU1A 4BLIA 4F83A 1MC9A 3ZYPA 1S0FA 1N1TA 2A6WA 1MVEA 5BYNA 1W6MA 5JOWA 3H6QA 3B3QE 1EV2A 2PHXA 4IONA 3VSFA 2Y9XE 1X50A 4ATFA 2D7FA 4I30A 3O12A 4BMBA 3WG3A 1LHNA 2DUPA 1C1LA 5GZEA 4YGEA 1HDKA 1Z0HA 4FOVA 1WCSA 3VV1A 3IM7A 4JKQA 5DUWA 3LCPA 3O3QA 1WBLA 3U4XA 4LO3C 1BYHA 1AZDA 1JN2P 5FNWA 3AK0A 1N3OA 3AKIA 2B7YA 1TIEA 2Z48A 2D44A 1LEDA 1RINA 5T54A 1Q8SA 9ILBA 1P63A 3SNVA 1Q04A 5FREA 4GAIA 1R8OA 4PBPA 1Q03A 2AENA 4ZKTB 5CBLA 1QNWA 1IS4A 2K43A 3MW2A 4DCKC 2UURA 2GDFA 4XJUA 3N7LA 5F8SA 4XIOA 1MZ6A 3FJEA 2D3PA 2WRYA 3AZXA 3P53A 2DREA 1WW4A 2PHUA 4YZ1A 1MS8A 2WSUA 2GN7A 3UD9A 3CA1A 1JBCA 2OVUA 2DURA 4HANA 4I2SA 1YI7A 2A71A 1JOJA 4MYEA 3AKFA 4G9MA 4ZLBB 3BAVA 5CNAA 1LHUA 1HLCA 1JHNA 3FJHA 1DHKB 4FVVA 4J2YA 2UU8A 5BXPA 4XFUA 2KI4A 1AF9A 2D6LX 1BFBA 1KRIA 1ENRA 4ZA3B 3ZXGA 3SLIA 3FJJA 3N36A 1KITA 2ZQNA 1PUUB 2D6PA 1HQWA 3OJVA 4DENA 1PC8B 1BXHA 4CTEA 4IZEA 4X37A 4OWLA 2D22A 8I1BA 1HIBA 3IM6A 2AH2A 3VKFC 3RS6A 2P23A 1K5VA 1QQLA 1S0JA 3SNMA 4YFZA 3Q7WA 2Y9GA 4D0ZA 3AH2A 3UL2A 1AXYA 3BAOA 1SLCA 3AP7A 2NMNA 2NYYA 2EIGA 1DLLA 5HCFA 1Z78A 4QBVA 1CR7A 4XKIA 4XBLA 2PELA 1BARA 2CYFA 3IPVB 2WT1A 2BFHA 4OEFA 3WO3A 4XIKA 3O4AA 1LECA 4Q9PA 4ZFWB 1G7YA 4XZPA 1OFSA 2JD4A 5T5OA 2P2KA 1AFCA 1CIWA 1IS3A 2ZGKA 2YMZA 5T5JA 3AYCA 3AJ6A 1G9CA 4R9CA 5KXDA 3FJFA 4LBNA 3T1LA 3FJ8A 2R0HA 3WINA 4CJMA 3M1HA 3ZSJA 1WW7A 1A8DA 2E7TA 4CRQA 2VW0A 2ERFA 2WSVA 4P9YA 3WUCA 2D7IA 1SR4A 4KBBA 3AP6A 4JPZA 4YOLA 2ZAAA 2LIEA 1FV2A 2WT2A 3ZSKA 4LBJA 1W6OB 1MS9A 2E4MC 2WBCA 5GJ6A 2ZHMA 3O4OA 2WNEA 3I2AA 2AGSA 1LHWA 3I8TA 3BB2A 1SZ6B 3S8JA 1NXD1 4M3CE 5HCAA 2D7RA 4XYXA 2MC2A 2D6OX 3KQRA 2ERMA 1ISWA 3UDAA 4BMEA 5JMCA 4U2AA 2A7AA 5T5PA 3WDYA 5DZGA 4Q1RA 1YXWA 4I4XA 4OWKA 4OW4A 5GZDA 2IHOA 4FOYA 1AVXB 5EC5A 2YV8A 1ULFA 5F90A 1N47A 4I37A 4J2KA 3ILRA 3AZZA 4XILA 3POSA 1V6NA 3A23A 3M3CA 3OYWB 4XMAA 4I4UA 3OGGA 1Q8VA 4ZOTA 5DUVA 4D0TA 3FLPA 4Y1VA 2R0FA 3HBWA 1UMZA 4EFRA 3OGFA 4ZFYB 4XMIA 4XTMA 1ZM1A 1LU2A 2WJSA 1WLCA 3AYAA 4FPFA 4YZ4A 1NUNA 4GXLA 1JT3A 1LOAA 1IILA 3RMYA 3DGTA 5IK7A 3AKGA 1I1BA 3ZXLA 4Y20B 2ARXA 1LOFA 4P14A 1V00A 3ZC9A 2NTDA 2KI6B 3WUDA 1NLSA 4XBQA 4EEEB 5EYYA 1TEIA 5EYXA 4X38A 2WLQA 4YFWA 1BASA 4YG0A 2K8RA 3WDXA 1DQ2A 1MS1A 2E7QA 4P9WA 2VU9A 1ENQA 1WW5A 4TYSA 1M16A 3OBTA 1Z2VA 5GALA 1DQ1A 1PUMB 3VKLA 3NBCA 1W0PA 1IJTA 1AX0A 4YM3A 3N35A 1DQ6A 2R1DA 1DQ0A 1UX6A 2W68A 3LSDA 3V64A 3CRIA 2WKKA 1G82A 3UJ4A 3D5OA 3HOMA 4YGBA 1FV3A 3QCWA 5GLWA 3FGMA 3BA4A 5CAZA 3WG2A 1WLWA 1SLAA 3VT1A 3JU9A 3MW4A 1AVBA 1AVUA 4QD2C 1FAYA 2QN4A 4AGVA 3WDUA 2ARBA 1HKNA 1BZWA 3M3EA 3R4UA 3PVOA 3AJ5A 2ZGPA 1BFCA 5JDBA 1QOTA 5T52A 4FOQA 3TC2A 1XQNA 1LOBA 1AXMA 1LGCA 2ZMNA 3USUA 4UW4A 3FLTA 1S1AA 3AFKA 2HW9A 4LO0A 5D62A 4I4VA 1VIWB 1VCLA 4I3NA 1WBCA 2R9KB 5E88A 1T9FA 4IHZA 2Y9FA 5DUXA 5BXTA 1YRZA 3Q7XA 1W6NB 1V6WA 5E8AA 1A3KA 2FFUA 4M01A 1FATA 4AN6A 4UW3A 1FN0A 2A3XA 3H6SE 3FUQA 2D23A 1LGBA 1ONKB 5D63A 3SISA 1LOCA 3S8KA 3WV6A 3PUBA 4YM1A 3O0VA 3D7WB 1DZCA 2GMEA 4Y26A 2RSTA 3SH4A 4USPA 3WG4A 2D6MA 5JVVA 4WV8A 5JLVA 3LLPA 5DZEA 2AREA 3MPPG 4A7ZA 5IUQA 2W08A 3H6RB 2DWRA 4YZ5A 2EXJA 2SLIA 4EKXB 3VKNA 4IQPA 5T50A 4DPNA 1GLHA 1E0OA 3IAGC 1AJOA 4M3CF 1D0HA 1I1EA 1LCLA 2CL2A 3FBYA 4QALA 2D6NA 1JW6A 1JT7A 2D24A 4L4IA 1ONAA 3CU1B 3FLRA 3WA1A 1GZWB 3IN9A 2DVFA 4H9WA 3NBDA 4JQ0A 3O5WB 2GNBA 3AX4A 3ILFA 3VWCA 3O4BA 1WW6A 4DS0A 4Q1PA 3NV4A 4GOYA 2JJ6A 1G9FA 3WINC 1LOGA 4FQ4A 2AAIB 4KEJA 2DTYA 1S0DA 2XB6C 2D43A 3W58A 2ZGMA 1SR4C 3OJMA 2E53A 2D20A 4FPEA 1W0OA 2HWMA 3B01A 5GZFA 1ZA4A 1Z4SA 2A3WA 1JLXA 4G9NA 1GYKA 4FQZA 3WG1A 2E6VA 2ESUA 4JP0A 4BLJA 1KQRA 1W6MB 3B69A 1FNYA 3FJBA 1QNYA 4UW6A 2ZR1B 4II0A 1APNA 2ZA9A 4Y1XA 1SFYA 3ASIA 2AUYA 2OUHA 2R16A 2ZHLA 3O4CA 5F9TA 3A4UA 4FOWA 5GLTA 1PZ9A 2Z49A 1C4RA 1AXZA 4U36A 2KKIA 2ZGRA 1XYFA 1FMZA 3ILNA 3CNAA 2VLCA 1V6XA 4Z9WB 3BAUA 1J0SA 3W9TA 2CNAA 4YZ2A 3K1XA 2PHWA 4QD2B 1ULGA 4AVSA 1U0AA 4ENDA 1QKQA 5B2HA 2KH2A 5LK5A 5F8WA 4J23B 2EXHA 3BOPA 1CN1A 3OJBA 2EF6A 5DZFA 3AZWA 2F8XC 1IKQA 1N1SA 2DVGA 2UWCA 3IPVA 2GO2A 5GLZA 1HWNB 4I4OA 1T4QA 4YM2A 2A3YA 4TLPA 1LOFC 2WT0A 3RSJA 3ZXJA 1EPWA 2FDBM 4XE9A 1V6JA 5T55A 1UZYA 4XOGA 2ZACA 1B09A 2GMMA 4XFSA 5DG1A 1PZZA 4I96A 1CVSA 4Q26A 1UKGA 1RG8A 2ENRA 1DFCA 2WQZC 1EVTA 4ASMB 3F1RA 3OPZA 3UJQA 1N4KA 1TFMB 3HALA 4ATEA 3OY8B 5EXOA 3VKOA 3HSMA 5KXEA 3BTAA 4FPOB 1SBEA 3VEQA 4R9DA 3VT2A 2YY1A 1IKPA 2JECA 2A75A 1UL9A 4FGFA 1YYNA 2FMDA 4H04A 2VH9A 5D61A 1MS3A 4BPZA 4YW4A 3BX1C 1MS0A 4Y22B 1TWEA 1D2SA 2W39A 3CA3A 4Z8BA 4AN7B 3CA5A 1LGNA 4QC4A 1ISXA 4XJAA 1JTCA 2ZGTA 2G4IA 4XXPA 5JOXA 3IMNA 1IOBA 4XJWA 4FPLA 1S0LA 1QDCA 1HCDA 1UN1A 2D3RA 1N1VA 1YO8A 4D69A 3V0BA 4XHXA 1HKDA 1BFFA 1YIFA 3IM0A 1URXA 3ENRA 1ISZA 2K4AB 3AKHA 4FPCA 4LO2A 3RTJB 1LU1A 5H9PA 1JT4A 2J3PA 1R8NA 4LO0C 1YBIA 3N7KA 2AR6A 2Z42A 2VSEA 4QKRA 4M3CB 2A70A 3ZSLA 1Q8OA 4A7KA 5GZCA 1VAVA 3AP4A 4XDQA 3FJAA 4RA0A 4L4HA 1DIWA 1QU0A 1C1FA 3AYDA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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