2VXRA

Crystal structure of the botulinum neurotoxin serotype g binding domain
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
431
structure length
428
Chain Sequence
NAILSLSYRGGRLIDSSGYGATMNVGSDVIFNDIGNGQFKLNNSENSNITAHQSKFVVYDSMFDNFSINFWVRTPKYNNNDIQTYLQNEYTIISCIKNDSGWKVSIKGNRIIWTLIDVNAKSKSIFFEYSIKDNISDYINKWFSITITNDRLGNANIYINGSLKKSEKILNLDRINSSNDIDFKLINCTDTTKFVWIKDFNIFGRELNATEVSSLYWIQSSTNTLKDFWGNPLRYDTQYYLFNQGMQNIYIKYFSKASMGETAPRTNFNNAAINYQNLYLGLRFIIKKASNSRNINNDNIVREGDYIYLNIDNISDESYRVYVLVNSKEIQTQLFLAPINDDPTFYDVLQIKKYYEKTTYNCQILCEKDTKTFGLFGIGKFVKDYWDTYDNYFCISQWYLRRISENINKLRLGCNWQFIPVDEGWTEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE G
publication title Crystal Structure of the Botulinum Neurotoxin Type G Binding Domain: Insight Into Cell Surface Binding.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 117
structure length 428
sequence length 431
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2008-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2vxrA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2vxrA02
2F2FA 1OKQA 3V64A 1NZKA 3VKOA 2RQ9A 2ZGOA 1W6PB 5BXPA 1HKNA 1SACA 3CNAA 1HLCA 4XZPA 1PZ9A 4PF5A 1DHKB 1QKQA 1N3QA 4M3CF 4FPEA 1BA7A 1DQOA 3V65A 1EPWA 3ZSJA 1YI7A 4AVSA 1QQLA 4K21A 1ISZA 3MW2A 1AVAC 5DXDA 5SV8A 4IY9A 1N1YA 3EF2A 1LESA 3M3QA 1N47A 1MS0A 4JRAA 3BAGA 5BXRA 1CJPA 3WHTA 3SH4A 4FOYA 5BXSA 1WUVA 1YRZA 3V0BB 4AGGA 1TOOA 3M2MA 3I2AA 1HWPB 1JYIA 5FZZA 1JHNA 4I4OA 1ULEA 5IUQA 1DYKA 4Y1UA 5E88A 4FPKA 4UW3A 3NV4A 1JLYA 1MS4A 5GZDA 2JE7A 3BADA 2GNDA 4ENDA 3F62B 3W58A 3MW3A 1GZ9A 3RG0A 2AR6A 3ATGA 1RZOB 1WW4A 2R1DA 3AXDA 3VWCA 4YZ5A 1E0OA 4G1RA 2R0HA 4LBQD 2FFUA 1KJRA 4R9DA 4QD2C 1WBCA 2BQPA 2WNEA 3BRGC 4A7ZA 3RRDA 4YFZA 2D20A 2ZGKA 4FOQA 1DLLA 3NBNA 3AKIA 4A7KA 2EXJA 1GGPB 1YXWA 2ZGSA 3RMYA 3POWA 1G9AA 1BLDA 4I4QA 4I4YA 3VEQA 4FPOB 3BODA 2JECA 2I1BA 3ZC8A 3A22A 3HMYA 5EYYA 1G9CA 2NYYA 1AJOA 2DU0A 4XBLA 4TZDA 1ISWA 2GN3A 1UZZA 1CVSA 1QOSA 1O4ZA 2DTWA 2FHRA 2ZGQA 3MALA 4PBOA 5T52A 3KMVA 3WDWA 3BA4A 3WCSA 1CONA 1BFGA 3N3HA 1SLLA 4P9WA 3PVOA 1FWUA 1WLDA 4LBMA 4GAIA 4XE9A 2VY0A 2K8RA 1XQNA 3D5OA 2Y9XE 3ZSKA 2NZ9A 4YGEA 1CE7B 4FQZA 4LO0A 2D22A 3O4AA 5DUWA 1BFCA 4AGVA 4OUJA 2ZGMA 4FPHA 1WBLA 2DS0A 5DZFA 4P9XA 3SNMA 2GMPA 1S0LA 4Q1RA 4YZ2A 3ZSMA 3OY8A 4Y22B 3O12A 4P6AA 3IM0A 1N1TA 1SLAA 3B9CA 1VAMA 2IHOA 5GLWA 1W0OA 1W6OB 3O3QA 3A21A 1N1VA 4G6MA 4DFSA 4LBLA 3KQRA 3BX1C 3ILRA 4YGCA 2YY1A 1EYLA 1J0SA 4R9CA 4FGFA 3POYA 1V00A 1ENSA 2NMNA 2W68A 1ULGA 3CAHA 4R9BA 1BARA 4FP3A 1HQWA 1W6MA 2DUQA 5FRAA 3WDYA 3FLTA 3MEPA 2P23A 3AYDA 1VAVA 1LGNA 5FNWA 3AZWA 2E7TA 4M3CA 4YM1A 3IPVB 4IONA 3WMUA 2J3PA 1CQ9A 1XHBA 4ZFWB 2LIEA 5DUVA 3SITA 3OPZA 2E4MA 3WG2A 4UW4A 2JDZA 2ZQNA 4OEGA 1S0BA 3VUOA 3ILNA 3RS6A 3RTJB 3FJ9A 3WHUA 3OJVA 4I4VA 3WUDA 4IYBA 2EF6A 5GLUA 3H6SE 1DZQA 4L8QA 1HKDA 3M3OA 1YF8B 4C1XA 3WO2A 5KXDA 4YW4A 5FNXA 4BMEA 5T5JA 3UDAA 1JTCA 4AN6A 3O0WA 1HIBA 1QDOA 1Z78A 2NVHA 1JT3A 2VW1A 2CL2A 2R49A 1IKPA 1DFQA 1TIEA 3O0VA 2F2FC 5E89A 1IILA 4LO1C 2AUYA 4PCRA 1G9DA 4DRVA 1V6KA 3ENRA 5DZUA 2A6YA 1NUNA 1XZZA 2PHWA 5F8SA 3I29B 3TAYA 1MS8A 4Q26A 5GAQA 1X50A 4USPA 1YO8A 4PQ9A 1LOCA 3WV6A 1CIWA 5IK5A 1VALA 1CN1A 4I6IA 2BEBA 3Q7WA 1PUUB 3QLQA 1UN1A 3UJQA 3A07A 3R4UA 4Y1YA 4Y1ZA 1FX5A 3Q9OA 2GNMA 4WVWA 4YM0A 1AJKA 1Q8QA 1ITBA 2D6NA 3MW4A 1BJQA 4GALA 1KNMA 1SBEA 2ZMKA 2D7RA 1KDKA 2W08A 3FLRA 1IS4A 4X37A 3O44A 4H9WA 1CPNA 3BB2A 1QDCA 4YZ1A 2D6LX 1LHWA 5JOWA 2D3PA 2DRYA 5IK7A 1DFCA 4GP3A 1MR5A 1LULA 5H9SA 2DUOA 4BLJA 1DQ4A 3H6RA 5GLVA 2D7FA 5BOWA 3ASIA 1S0CA 3V0AB 1AVUA 4IY8A 4K20A 1AXKA 3BA7A 4I8MA 3POKA 1LU2A 4XBNA 3IN9A 3VV1A 5F8WA 1ULCA 1G8WA 3LSDA 1ILR1 4GKYA 4L4IA 1S0GA 2VW0A 3AYEA 4LBKA 1SLTA 3WG1A 1PC8B 1LOFA 4M01A 2CNAA 4ZGRB 5DUXA 5GLTA 4DENA 3NBDA 2CTVA 1FV3A 1LGCA 1WLCA 2YV8A 1WCSA 5GJ6A 5EG6C 4DCKC 2HWAA 1TTUA 5I1BA 1BKZA 2OUHA 3NV2A 2ZAAA 4XTMA 4J23B 4GWMA 1GZWA 2WRYA 3ZXJA 2AGSA 5H9PA 3VSFA 1LODA 4I0YA 4XXAA 3IAGC 1TFMB 3BOPA 3CA5A 4LBOA 1S0DA 1L2HA 3F1RA 3AP5A 1AVWB 3FJCA 3W9TA 1U0AA 1PUMB 2CY6A 3JUUA 3H0OA 1JBCA 4JC1A 1FN0A 1W3GA 2Z49A 2IWTB 5HPZA 1TEIA 2D6KA 1MD6A 2ZGRA 5T54A 3AKGA 4UW5A 5D63A 2OW4A 2WQZC 3AYAA 2A3WA 3I4IA 2ZGUA 3LTQA 3SH3A 1ENQA 4LO1A 2A5ZA 1K5UA 3O4OA 3N36A 2ZABA 4DRRA 4J2SA 3SISA 4QALA 4BOWA 3AX4A 1DQ1A 3FJDA 1AVBA 1G7YA 1JY0A 4LBNA 4YGBA 1IT0A 5IK8A 4FOWA 2AFGA 4ATFA 3PMEA 1DIWA 2DRZA 4A7YA 3VT0A 4ZA3B 4XYXA 2A6XA 2UU8A 1GICA 1UMZA 3TC2A 3UD9A 1V6MA 4BM8A 5FZUA 1W6NB 2F8XC 2PHRA 2X2SA 3FUQA 1FGAA 4XIKA 2VXTI 1PZ8A 1Q03A 4LO7C 1IOAA 3KM5A 1CPMA 1RIRA 1ULFA 3S8JA 1GNHA 2UWBA 3IM6A 1QGLA 1LCLA 4I4UA 4OZXA 1DQGA 2XG3A 8I1BA 3HN1A 3UL2A 5DZEA 5D62A 1XG6A 2HWMA 5EYXA 2E4MC 3WZ1A 1FATA 2ZHNA 4LBQB 3WG4A 4YOLA 4XKIA 3BAVA 1URXA 2TEPA 4ZFYB 1GBGA 1Q8VA 1D0HA 4IHZA 3A4UA 3AJ5A 2KH2A 1JOJA 4AYUA 3WA1A 2BEAA 3CA6A 1IS6A 1AX2A 2D23A 1JUIA 3A0KA 3M1HA 4AVTA 2D6MA 2GO2A 5CBLA 1IRAX 1SBDA 3NBEA 3CRGA 3OYWA 2DVAA 1RMLA 4I3NA 2YZ4A 1I1EA 4YW3A 3N7MA 4P9YA 5L73A 4QD2B 4XJ9A 3CA0A 3DGTA 5BP5C 1MS1A 3C9ZA 3WMVA 4QKSA 3WO4A 2EXIA 5GZGA 3UJOA 2A6ZA 4M00A 4XJWA 1Y7BA 2SLIA 4YW5A 4GWNA 4JPZA 1NXD1 2E6VA 3PVNA 2A70A 3CA1A 1DQ6A 4NO4A 1LJ7A 1QNWA 2AH2A 1DQ5A 1FYUA 5GZEA 2MC2A 1O4YA 2Y9FA 4Q8LA 1G9FA 3N35A 5EXOA 3WDVA 1HQLA 31BIA 3BAUA 4NOTA 1YYNA 2ERMA 2ZGNA 2Y9WC 3WDUA 1LOBA 4G6JA 4H04A 1RY7A 4XILA 1TWMA 1AXZA 5JDBA 4ASMB 2DWRA 1WD3A 3HR9A 4TLPA 1I1BA 7I1BA 2RSTA 3AH4A 5IK4A 3B3QE 3O4CA 3BA5A 4XJZA 2WKKA 3T8SA 3DUIA 5D61A 1GSLA 4UW6A 3N0KA 2HZ9A 1LOGA 2DTYA 1WBFA 2A7AA 1W6PA 1CVNA 4OWKA 2AENA 2DVGA 3USUB 1KQRA 2WSVA 4I4PA 5F90A 3OJBA 2R16A 5DSSB 2YUGA 2RG9B 4GP0A 2Z48A 3BRFA 1P63A 2WJSA 2KM2A 3VKFC 3B01A 1N3OA 1LOEA 1KRIA 4RA0A 4I1BA 2MLLB 1FQ9A 3ZXDA 3AZXA 3ZVXA 3WNXA 3ZSLA 1IHKA 3K1XA 1FMZA 1LOFC 5FZYA 4PC4A 1J1TA 5DZGA 3OGFA 1W3AA 1QQKA 1B09A 2NM1A 1T4QA 3MPPG 3ILFA 3V0BA 2DV9A 4H55A 4FPLA 4Y20B 1OQ1A 1APNA 1HWOB 4EFQA 1M16A 4YG6A 2E53A 5F9TA 2NN8A 5KXBA 4GOYA 3NJ5A 3S8KA 3WCRA 4JCKA 3I2XA 1LTEA 3Q7XA 3WINC 3T1MA 4X38A 1IKQA 3H6QA 1DGLA 4EKXB 1AX0A 3BTAA 3ZXEA 1AFCA 1UX6A 4SLIA 3ZC9A 4LO2C 4R6UB 1SLIA 1Z4SA 2R9KB 4FPCA 4Q9GA 2QYIB 4F83A 1DZCA 1VCLA 3OJMA 2DYCA 2DREA 1LGBA 3I8TA 1G9BA 3RTIB 4XXPA 4AGRA 2DVFA 4HA2A 5GALA 1LHNA 1Z0HA 5BP5A 4FPJA 4Z9WB 3PHZA 1N3PA 4K1ZA 4X39A 3TB0A 2PELA 3LSEA 4Q27A 1V6NA 1KJLA 4AWDA 3HOMA 1LU1A 2YXSA 5F8YA 3BRDA 1V6IA 2JE9A 1G86A 4EB2B 1AX1A 3JUTA 3OBTA 4GAFA 4I4RA 3O4BA 2GALA 1FMMS 1AVXB 2WT2A 3AZZA 4QO3A 1ISVA 4Q1PA 1R8NA 4GXLA 2ARBA 5CNAA 5B2HA 2A71A 2I2SA 1OFSA 2DVBA 1I3HA 3U4XA 3P6IA 3UD7A 3INAA 3QYDA 4FPYA 5FREA 5GM0A 3O5WB 1KDMA 3N7JA 2Y9GA 2AYHA 2ZACA 4ZFUB 1H9PA 2C5DA 4KEJA 4ATEA 2P34A 4QBCA 2KI4A 2R0FA 1SR4A 4I7IA 3QCWA 2WT1A 1W6OA 4XMAA 1UL9A 1V6LA 2ERFA 2VXRA 3AP6A 3M3CA 2A3XA 2GZBA 3LCPA 1R8OA 3QR5A 4JQ0A 2XB6C 1AZDA 3B69A 3WVJA 1DQ0A 1Q8SA 2LTNA 3T1LA 4HANA 3ZYPA 3WOGA 1LHUA 3AK0A 4WVVA 3AP4A 1DZDA 3M3EA 5AVAA 2DVDA 3ZXLA 4EFRA 1MS9A 4Y1VA 4ISQA 4XMIA 3D6EA 1CESA 1XYFA 1PZZA 2BFHA 1FNYA 4BPZA 1NLSA 3O0XA 1VLNA 3IPVA 3BIWE 2GDFA 4LO3C 2ET2A 1JN2P 4OEEA 3FJEA 4I4SA 3AP7A 2PHUA 2AQZA 1C1LA 5CAZA 3WINA 4XBQA 3JRRA 1C57A 3BAOA 3O4DA 1OQLB 3CRIA 1QXMA 3APBA 2ZBJA 4JAWA 2YMZA 1AF9A 3PVEA 4LO2A 1HCDA 2ZA9A 1Z2VA 1ABRB 5T5PA 4RL7A 3JU9A 1LOAA 4YZ3A 1JLXA 2DURA 1Q8OA 3W59A 3D4KA 2R1BA 4QKRA 1A78A 1D2SA 1BFFA 4XIOA 1W6QA 2KKIA 1UZYA 3VKLA 2VH9A 5JOXA 3AFKA 4PBPA 1JT7A 1IRPA 1PWAA 3OY8B 4DS0A 4CJMA 5DG1A 2D6OX 4XHXA 3VT1A 2GNBA 1HWNB 1MZ6A 3IKWA 1QOOA 5T5LA 3FJKA 3AYCA 3FUOA 1LEMA 2UUSA 5BQUC 1AXYA 4P14A 5JOYA 3B9UA 1UKGA 4FQ4A 4KEKA 4D8HA 3BAQA 3FJFA 2UURA 4BQ1A 4Y1XA 2ARXA 4Y26A 2D3SA 1T9FA 1MS3A 1W6MB 4FVVA 1RINA 3FJJA 2AXMA 4TYSA 3NV1A 4L4HA 2P3IA 1GZCA 3L2YA 9ILBA 3SLIA 4ISRA 5BVPI 3UJ4A 1WW5A 2NTDA 3C2UA 5GZCA 4LO7B 1KITA 2X2TA 4QC4A 2E7QA 5JLVA 2VLCA 2ZMLA 1VIWB 4M3CB 4XHBA 2EAKA 4J2KA 1DJSB 3VSZA 1LHOA 4GKXA 5EWSA 2V73A 1GYKA 1N4KA 2MIBA 3P6JA 1QOTA 1WLWA 4ZKTB 1JT5A 2D3RA 4D0TA 3V0AA 1FAYA 1II4A 4XJAA 1S0JA 3V79C 1FV2A 1F9KA 1SCSA 1JW6A 3FLPA 2OUJA 4WV8A 3WO3A 2AREA 4ZXKA 2D44A 4C1WA 2JJ6A 1JT4A 1WD4A 4XDQA 5H9RA 4DQAA 2QN4A 1S1AA 1ULDA 4G9NA 4YW2A 4KBBA 2JKBA 4D0ZA 4XJ8A 1MS5A 2ZKNA 5DVHA 3CA4A 1MZ5A 4Q2FA 5HCAA 1EVTA 2NMOA 1C4RA 5T55A 4KEIA 1F31A 1MVEA 2DUPA 2ZHKA 2LALA 4LO3A 2Q3NB 2WBCA 2NP0A 1LEDA 1YIFA 1TP0A 4MYEA 3NBCA 2ZHLA 4J2XA 4HL0A 4ZBVB 5DUUA 1K5VA 3OGGA 4I30A 2EALA 5G00A 2ZZJA 3P53A 1BASA 5JVVA 3O49A 4IZXA 3ZX7A 3IIRA 2Q9XA 2ZGLA 2ZGPA 4XJUA 4YW1A 1GLHA 3SNVA 5IT6A 1FWVA 3RQ0A 1S0IA 1BQPA 3UD8A 3ZXKA 3A0NA 3AP9A 2D6PA 1V6OA 4QBVA 2EXKA 5EC5A 2C9AA 3AKHA 1CR7A 3FJAA 1WW6A 4FP2A 4LBJA 2GN7A 3CQAA 3SH5A 1SBFA 2ESUA 3FJ8A 4BLIA 2GNTA 5BXTA 1SR4C 2VW2A 3N7LA 1JYCA 1EV2A 1GNZA 3CU1B 2W52A 4WBCA 4DPNA 3H6RB 3IM7A 1V6JA 2SBAA 4OW4A 3D7WB 1M2TB 2PHXA 1V6VA 4I96A 1HDKA 1Q04A 2HW9A 2A6WA 2V5YA 2A75A 2OVUA 5KXEA 2FMDA 4ITCA 4LO8B 41BIA 2B7YA 4YG3A 1DQ2A 2PHFA 4G9MA 4JP0A 5BQUA 2P37A 3ZYRA 2A3YA 1GKBA 1W6NA 4YZ4A 5BYNA 1MVQA 5CB7A 1Q1UA 1S0EA 3FFZA 3WDXA 2ZQOA 1UAIA 4FOVA 1S0FA 3AJYA 1N1SA 2Z42A 2K4AB 4USOA 4HJJA 1JXNA 1QF3A 2KLLA 3RMXA 4D69A 3HSMA 3E8LC 1GV9A 5T50A 1LECA 1IOBA 4Q9PA 2CWSA 4LBQA 1GANA 2GMEA 1C1FA 4OEFA 5DUYA 1GZWB 3CRHA 2WSUA 1YTOA 2LIQA 5JOZA 3FJBA 1ONAA 3AZYA 1WBAA 2G4IA 3Q7YA 2VSAA 1BFBA 1DYPA 4OWJA 1BZWA 3HBWA 4ZLBB 4FPGA 2PHTA 1ISYA 2D24A 5F5QA 3AXEA 5KXCA 3UK9A 1Q8PA 2VU9A 4YM2A 1IJTA 1H30A 2FGFA 3O5SA 3ZXFA 5HCFA 5CA6A 4YFWA 4YLZA 2E51A 5E8AA 4EFPA 4F34A 4JKQA 1BLAA 4GOVA 2M49A 4XFSA 4YM3A 1W6QB 2ENRA 2FFVA 3POSA 3HALA 3AKFA 4ZOTA 1HWMB 3NWKA 2ZGTA 2AAIB 1JQZA 3IMNA 1DBNA 1G82A 3R4SA 2HYKA 2P3KA 3GALA 4I1EA 4YG0A 2ZHMA 4EEEB 3NV3A 2FO1A 1V6UA 5JMCA 2H0BA 4FPFA 5E24E 1QU0A 2A6VA 3CA3A 1RG8A 1PZ7A 1W0PA 2D7IA 1IS3A 4R9AA 5DG2A 1ISXA 3OJ2A 2JD4A 2P2KA 1QNYA 1ZM1A 1ZA4A 1R1ZA 1QMJA 4Q8KA 3WG3A 2XOAA 1Q56A 2K43A 1SCRA 2YROA 2Q5TA 4DEPA 4WZFA 4Y22A 2UWCA 21BIA 4AVVA 4XOGA 5LK5A 1YBIA 1BXHA 3R05A 3AH1A 1FNZA 3USUA 3AJ6A 1V6WA 4J2YA 2VUAA 1A8DA 2ZR1B 1MACA 3PJQA 4XFUA 1F5FA 1RITA 4YGDA 1BYHA 4U2AA 1SLCA 2ES3A 3FJHA 1W3FA 2ZMNA 4HR6C 4I37A 1SZ6B 1SFYA 4IZEA 1UPSA 2WLQA 2WT0A 3VKNA 3OYWB 6I1BA 4IQPA 4Z8BA 4OWLA 4P0KA 3WUCA 2KI6B 2W39A 3ZXGA 1LHVA 4BMBA 4Z8SB 4Q91A 4Y20A 2D43A 5GZFA 1A3KA 3FGMA 4II0A 2EXHA 4M3CE 1ENRA 2UWAA 4P0JA 5HCBA 4CTEA 2RHPA 3AH2A 4K1YA 4W65A 4XTPA 1HCEA 3B00A 4I2SA 1MC9A 4I4XA 4X3AA 1LENA 1V6XA 4Y24A 5H9QA 3WLUA 3T2TA 4CRQA 4JKXB 4KC3A 1TWEA 1IS5A 1ONKB 4XFTA 4CZSA 3RSJA 2D1ZA 3LLPA 3OBRA 3AJZA 3WDTA 2P39A 2EIGA 1WW7A 5GLZA 3PG0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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