3AZVA

Crystal structure of the receptor binding domain
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
427
structure length
418
Chain Sequence
NEYFNSINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
publication title Structural and mutational analyses of the receptor binding domain of botulinum D/C mosaic neurotoxin: insight into the ganglioside binding mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords D/C mosaic neurotoxin
total genus 79
structure length 418
sequence length 427
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3azvA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3azvA02
4XKIA 3PVNA 1LESA 3W59A 2SLIA 3AZXA 1MS8A 1TP0A 4LBMA 4AGRA 2DUPA 4GP3A 2RSTA 3O4BA 1C4RA 4BOWA 5IK8A 4LO1C 4Q27A 4ZFWB 1MC9A 4GAFA 4Q1RA 4YG6A 2P3IA 4Q8LA 2KKIA 1SFYA 1KITA 1LGCA 3R4SA 2ZHMA 4CZSA 4IZXA 1QOSA 4FOWA 2AAIB 2ZMLA 4XBLA 4ZKTB 2DREA 5JDBA 2YMZA 3LCPA 1GNHA 3IN9A 2X2SA 1LOGA 1S0BA 1ISXA 4Q1PA 1YRZA 2ZA9A 3NV2A 1SBFA 1WW4A 2LALA 3KM5A 2VH9A 5CA6A 1QGLA 3CRIA 5EC5A 4X38A 2D3PA 2HYKA 5DG2A 1SLIA 5I1BA 1N1TA 2ZZJA 3ILAA 4JC1A 3ZSJA 4I8MA 4IZEA 1AXZA 4DEPA 2Z42A 3CAHA 1GBGA 3FJKA 1Q8PA 1LOFA 1FQ9A 5G00A 2JD4A 1WCSA 4I1BA 5HPZA 3FLRA 1O4ZA 3UD9A 1QXMA 4IONA 3VWCA 4LBKA 1BA7A 2AUYA 4F83A 5JOXA 5F5QA 2IWTB 4Y20A 3WZ1A 2YZ4A 4AYUA 2R9KB 4XIOA 4M3CA 2AFGA 1YXWA 4P0JA 1CR7A 4FPHA 3N7MA 4JQ0A 1ISWA 4YZ5A 3FJAA 4GWMA 4JCKA 1UKGA 4F34A 4P14A 3AH1A 3IPVB 1ONAA 5GALA 4I96A 3USUA 2R16A 4DPNA 4J23B 1APNA 2WRYA 4LO2A 1FV3A 3FJJA 3AK0A 1JYCA 2D6PA 3BA4A 2P39A 1QMJA 1ZA4A 4NO4A 3AKFA 1PUMB 4C1WA 4ATFA 1ULFA 5B2HA 1DQ4A 5KXDA 1LULA 4MYEA 1GKBA 4Y20B 1DZQA 1TTUA 3DUIA 2NTDA 1S0JA 1YF8B 4M3CB 3OGFA 2VSAA 3BAUA 1AX1A 5BVPI 3WDXA 1CN1A 1LHWA 4I4XA 3NBNA 1ULDA 1G8WA 4PBPA 2WJSA 4QO3A 3VT0A 3TC2A 4DFSA 1YO8A 2GNBA 2GN3A 1P63A 1SR4C 1HDKA 2DVFA 3I2AA 3O5WB 3H6RB 3ZXGA 1W3FA 1CE7B 3GALA 5DUVA 2ZHLA 8I1BA 3V0AA 4I30A 3FJEA 1YIFA 4DRRA 31BIA 1ULEA 3NWKA 3AP5A 3VKLA 2ZGLA 2GNDA 5JMCA 1C57A 2NMOA 2GDFA 3UL2A 2BQPA 4LO1A 5DUXA 4EFPA 3WG2A 4WV8A 4Z8BA 1GGPB 1FNZA 3MEPA 5BXTA 2HZ9A 4FPEA 2FFUA 3A0NA 4L8QA 1UL9A 5SV8A 1JW6A 1JN2P 1MZ6A 4XDQA 1AX0A 1XZZA 1ENSA 4G9MA 4DENA 3POKA 2ZGTA 1FMZA 3N36A 5GAQA 1CVSA 3I29B 4WZFA 2AGSA 1GZCA 3V0AB 9ILBA 4HANA 2EXHA 4XTPA 3SNMA 4Q9GA 4YM3A 4IY9A 5KXEA 3VV1A 2R49A 3WG1A 2D24A 5F8WA 1V6MA 4R9AA 1DQ0A 2A71A 3NJ5A 4YLZA 6I1BA 1AZDA 3FBYA 1E0OA 1GZWA 1LOAA 1N1YA 4TLPA 1G7YA 3CRHA 2W08A 5GZEA 3D5OA 1JY0A 3BODA 3IAGC 3HSMA 3P53A 3MW4A 2NVHA 4P0LA 2EXIA 2EF6A 3ASIA 2ZACA 3ILRA 3O12A 2A3WA 4XFSA 2A6YA 1BASA 4EFRA 7I1BA 4HA2A 5IK7A 1V6LA 2Q9XA 3OBRA 2ZQNA 2F2FC 1GLHA 3CA6A 5GM0A 5T50A 1RG8A 2CL2A 4I1EA 1JXNA 2A75A 1HKDA 3CA0A 3WINC 2JE7A 2OW4A 1GZWB 1S0CA 3D4KA 4M3CE 4OW4A 3HOMA 2D6KA 1LU1A 3AZVA 3V0BB 4XJ8A 1ILR1 1FNYA 1KDKA 3ZC8A 3FFZA 3RTJB 5L73A 1ULGA 5T55A 3IKWA 3WG3A 1WBLA 4ZLBB 4XXPA 1A78A 5T5JA 5JOZA 3BB2A 2R1BA 2BFHA 5F90A 1IKQA 4D0TA 4GP0A 4OUJA 4Y22B 2OVUA 1DQ5A 5E88A 1QOTA 1MACA 1KJLA 2P37A 4G1RA 1BFCA 4YM2A 3H0OA 4R9DA 2VW0A 1D0HA 1WUVA 2ERMA 4Y1XA 3O0XA 1MS3A 1Z78A 4YW4A 1W6MA 1LODA 2DUQA 1C1FA 3QLQA 2P34A 3AJZA 2CWSA 2CYFA 3RRDA 5H9PA 4AWDA 2D3SA 1RINA 2E4MA 1CONA 1DQOA 3TAYA 3CA1A 2IHOA 4YOLA 1DZDA 1Q56A 1SCRA 1R8NA 4EFQA 1OFSA 3NV3A 1LOFC 1VCLA 2DVBA 1A8DA 2D7IA 1QOOA 4L4IA 1LHOA 2A3XA 4YZ3A 4DRVA 3ZXDA 4NOTA 3POSA 4Q9PA 2NM1A 1LEMA 1HWMB 3HALA 3FLPA 2ZGKA 1WD3A 1T9FA 2DURA 1TEIA 4FPFA 1N1VA 1FYUA 4XHXA 5DZEA 1LOBA 4QC4A 1PZ7A 2VY0A 4TYSA 4WVVA 1ISYA 2D6NA 1SZ6B 1GSLA 1V6NA 4LBQB 1HWNB 2D6MA 2YUGA 4R6UB 3BOPA 1N3PA 3OGGA 1LGBA 4LBJA 3FJDA 1BJQA 4LO2C 4QD2B 2UUSA 2ES3A 3IM0A 4G6JA 3NV1A 3BRDA 2V5YA 2HWAA 3BTAA 2ZGUA 5AVAA 2EALA 3INAA 1IOAA 4FPKA 5F8YA 3D6EA 5IK4A 3N7KA 1JT5A 4I3NA 5GZCA 2I2SA 4FQZA 1AXYA 4FGFA 3VUOA 4XJWA 2E7QA 2GNTA 3BA7A 1WLWA 1L2HA 5H9RA 1EYLA 1HKNA 2DV9A 4ISQA 1MD6A 3M3QA 1IOBA 1GICA 4CRQA 1TOOA 3AYCA 1MVEA 3UD8A 4KC3A 2D7FA 1V6VA 5FNWA 2JE9A 4H04A 4XIKA 1AJOA 1H9PA 2R0FA 4X3AA 1TWMA 4I4QA 1BYHA 2P2KA 2DUOA 1Z4SA 3B00A 1PZ8A 3ZXJA 3RQ0A 1Q1UA 4P0KA 1CVNA 2D20A 2Y9WC 3BAQA 1IS3A 4YFZA 3AZZA 5D61A 1VIWB 1FATA 2E7TA 5GLUA 3S8KA 1JBCA 3SH4A 1FV2A 2JKBA 4FVVA 2GO2A 2VU9A 2BEAA 1SLTA 2GALA 2DRZA 3SISA 2W52A 2X2TA 4YG0A 3IPVA 1WLCA 3AXDA 1XYFA 4GKXA 1MS1A 3SH5A 2ZKNA 2AH2A 3VSFA 1V6OA 4KEIA 3ATGA 3RMYA 2D1ZA 3BA5A 3FJCA 3M2MA 4OWLA 2ERFA 3D7WB 4D8HA 3V65A 4OEGA 4C1XA 3T1MA 1LHNA 3VSZA 3W9TA 1W6OB 3VKFC 1Z0HA 1FGAA 3AX4A 1HWPB 1VAMA 3ILNA 3KMVA 4J2YA 1DYKA 2YROA 2Y9XE 1V6KA 1C1LA 5HCFA 1W6PA 1CPMA 2WKKA 3H6RA 3ZXFA 2GNMA 4M3CF 3S8JA 4YZ4A 4FP2A 1LENA 1JLYA 3ZYPA 3ZYRA 1ISZA 2UURA 1UAIA 3CA3A 4UW6A 2YV8A 1MS0A 3O4CA 1KNMA 3R4UA 1O4YA 2RQ9A 3I4IA 4KBBA 3OYWB 3NV4A 1QDCA 4FPYA 3I8TA 3OJVA 5F8SA 1IS4A 1WBFA 3FJ8A 2YXSA 4BLJA 4I4VA 1ZM1A 2P3JA 4H55A 2AXMA 3WCSA 1UX6A 4A7ZA 2R1DA 1W6PB 3UD7A 4XFUA 4ZFYB 4G6MA 2HW9A 4JKQA 3VEQA 3A0KA 3LLPA 1DQGA 1DQ2A 4J2SA 3ZVXA 1Y7BA 2KM2A 3FUQA 4I2SA 1BLAA 4YGBA 2ZBJA 1PZZA 3WMVA 2B7YA 4GOVA 3BAVA 2DTWA 1AX2A 3ZSMA 3B69A 1Q8QA 3I2XA 2ZR1B 3FLTA 3EF2A 5GLZA 1T4QA 4JAWA 5EHAA 2E4MC 1AVUA 1U0AA 1MR5A 4Z9WB 3O5SA 2PHXA 4BMBA 4BMEA 3B9UA 1ULCA 4I4OA 2E53A 1NLSA 3R05A 1N47A 1SLAA 4TZDA 5IK5A 1LTEA 3ZXEA 1MS4A 4FPLA 3SH3A 4K1ZA 5JLVA 2J3PA 2A7AA 1F9KA 4GKYA 2V73A 1FMMS 3AP4A 2VW1A 3N0KA 2ZQOA 1IILA 1AFCA 1VLNA 2EXJA 4XILA 2CY6A 2AREA 4Y26A 3RG0A 1AVBA 1JLXA 1HWOB 1JQZA 4XMIA 1ENRA 1HQWA 4R9BA 3WDVA 2ET2A 4YG3A 4PCRA 3WA1A 4QKRA 4D0ZA 4W65A 2D23A 2Z49A 3B9CA 3V0BA 4QBVA 1BFBA 5DG1A 1S0EA 5EWSA 3LTQA 4L4HA 3PUBA 1BFGA 3Q9OA 1KRIA 4A7KA 3UJ4A 2QYIB 3H6QA 4K1YA 4BM8A 2VXRA 3WHTA 4I37A 2VUAA 3HR9A 2D7RA 4LO3A 2M49A 5FZZA 2PHTA 2KLLA 1JTCA 3QCWA 5BQUC 4A7YA 2ZGQA 4LBNA 4GXLA 5GLVA 3JRRA 3FJBA 1JHNA 4U36A 4Y22A 2ZGSA 2NN8A 5JOYA 3V79C 4BLIA 1LOEA 2Q5TA 4LBQD 2D44A 1W3GA 4XJAA 1ABRB 4WBCA 21BIA 1BLDA 3WHUA 1F5FA 3MW3A 2C9AA 4JPZA 2P3KA 2LIQA 1JOJA 5BXSA 2ZABA 5T52A 2AYHA 4OWJA 4LO7B 5JVVA 2P23A 1IHKA 1IS5A 1Z2VA 3LSEA 5BYNA 4ZFUB 1N1SA 2AQZA 1YTOA 1EVTA 1FN0A 3FJFA 1HQLA 4YGCA 2C5DA 5CAZA 5JOWA 3AYAA 2AENA 1JUIA 3FJ9A 3CRGA 2ZGPA 1NUNA 3O49A 2GMPA 4ENDA 3Q7YA 5F9TA 4IQPA 3CNAA 1FAYA 1S0DA 3QYDA 5EYYA 3WO2A 4PQ9A 3ZPYA 1RMLA 1GYKA 4Y1ZA 3ZX7A 3WDWA 3N35A 3A23A 2DTYA 3BAHA 1AF9A 1V00A 4Q2FA 3AKIA 2NMNA 4LBQA 3IIRA 3CQAA 1BKZA 1LECA 2LTNA 3T8SA 4FP3A 1XG6A 3KQRA 5DZFA 3AKHA 1AVAC 3CA5A 1RIRA 1OQLB 3Q7WA 3CA4A 3OBTA 2DS0A 3BRFA 3AYDA 2WSVA 3A22A 4ZA3B 3UDAA 1DJSB 4OWKA 1Q03A 1G9FA 5GZFA 2D6OX 3AP9A 1ITBA 2JDZA 1Q8OA 3HN1A 1KQRA 1WD4A 3W58A 1S1AA 1JT7A 4YW2A 2NP0A 2XG3A 1DQ1A 4X39A 2DWRA 3OY8A 1SACA 3OPZA 4ATEA 2ZGOA 1PWAA 1G9BA 3WDTA 3F1RA 3MPPG 1K5VA 1VALA 2RHPA 3O4DA 5E89A 3WVJA 1XHBA 4XZPA 2ESUA 1S0LA 1FWVA 2R0HA 3WG4A 3POWA 1M2TB 2CNAA 4DCKC 4K21A 5BQUA 4ZOTA 3FJHA 3A4UA 2E6VA 3N7LA 4IYBA 5DZGA 5H9SA 4LO8B 3POYA 1ENQA 4DQAA 4EEEB 2OUJA 5DUYA 4Q8KA 1CESA 3OY8B 5H9QA 3BIWE 2BEBA 5DXDA 1LU2A 3FUOA 4K20A 4I6IA 1H30A 3RS6A 2RG9B 4I4RA 3QR5A 3PVEA 1W0OA 1Q8VA 3DGTA 4AVVA 2A70A 1R8OA 1DIWA 3OJMA 3O0WA 1AVXB 1I3HA 1SBEA 1WLDA 1HCDA 1ONKB 3ILFA 5T5LA 4LO0A 2MIBA 2MLLB 1LHVA 2D43A 4YGDA 4Q91A 4XOGA 1AJKA 3L2YA 4EKXB 4I0YA 1W6QA 4P9XA 1MVQA 2XB6C 1N4KA 1DQ6A 2VXTI 5IUQA 2DYCA 5D63A 1W6OA 2ZGMA 2D3RA 5KXCA 3P6IA 4USPA 5BXPA 5EXOA 4Z8SB 5D62A 3N3HA 1DFQA 2ZGRA 4PC4A 4X37A 3AYEA 5T5PA 1J1TA 1DHKB 2ZHKA 3ZSLA 5BP5A 1TFMB 2PELA 1G86A 2W39A 1F31A 4GWNA 4YGEA 1RZOB 4XYXA 1WBAA 1W3AA 1V6JA 1LGNA 2WSUA 2EXKA 2A5ZA 1LOCA 3SNVA 5HCBA 2JJ6A 2K43A 4PBOA 1H9WA 5FREA 1BZWA 1W6QB 1JT4A 1EPWA 2Y9FA 2ZMKA 3BRGC 1GV9A 2SBAA 3E8LC 3OYWA 1UPSA 1YBIA 2FDBM 1KDMA 4OZXA 4YZ2A 3JU9A 3PJQA 1FX5A 1PUUB 3N7JA 1WW5A 3IM7A 1G9CA 4LO7C 4UW4A 3C9ZA 1MZ5A 4LBLA 1V6WA 3ZSKA 1V6IA 5BOWA 3VKMA 4LO3C 4AGVA 4KEJA 1J0SA 4XE9A 4HJJA 4FOVA 4P9YA 2XOAA 3APBA 4AN7B 3H6SE 3A21A 1IT0A 1IKPA 1N3QA 4R9CA 3WDYA 1XQNA 1V6XA 1G9AA 2WT1A 1TWEA 2FHRA 2VW2A 4HR6C 3VT1A 3WV6A 4XTMA 2PHFA 3VT2A 4I4YA 1HLCA 2GZBA 4J2XA 5T54A 4GALA 1M16A 5GJ6A 3P6JA 4XHBA 5GZDA 1W6NA 3JUUA 3Q7XA 2A6VA 2KH2A 3C2UA 1OQ1A 4DS0A 4FOQA 2GN7A 3K1XA 1X50A 3WUCA 5BXRA 1B09A 1GZ9A 3OJ2A 5E8AA 1TIEA 1SLCA 3PVOA 1WBCA 2Z48A 3PMEA 3O3QA 4J2KA 2ZAAA 4M01A 1CJPA 1DYPA 4YM1A 1QU0A 4ZGRB 4I4UA 3USUB 2CWMA 2WLQA 3GNEA 3NBDA 3ZXLA 1SCSA 2D6LX 3M3CA 1LHUA 4XMAA 2DVGA 2PHUA 5DSSB 4ZXKA 3WNXA 1Q8SA 3VKNA 1SLBA 3AH2A 2UWCA 3AJ6A 3IM5A 2E51A 4YZ1A 5CBLA 2KI6B 4QKSA 4YW5A 2A6WA 4XJZA 2WQZC 3RMXA 2NZ9A 1W6NB 2A6ZA 2L5XA 3LSDA 4HL0A 1IS6A 4EB2B 5DUWA 4I4PA 1SBDA 3M3OA 4GAIA 2Q3NB 1BXHA 4FPOB 3O4AA 4QD2C 1I1BA 2KI4A 3BAOA 4G9NA 4Q26A 4YFWA 1AXKA 3NBEA 1K5UA 4OEEA 4AN6A 4IY8A 5GLWA 1IRPA 2FGFA 4CTEA 2DRYA 3T1LA 2DVDA 1AVWB 1BFFA 1II4A 1DGLA 3WCRA 1MS9A 4RA0A 1QNYA 4JP0A 1URXA 4H9WA 1JYIA 3O4OA 3UJQA 3JUTA 3BX1C 4XJUA 3AP6A 2K8RA 2I1BA 2MC2A 2ARXA 3V64A 3UK9A 4Y1UA 1CIWA 1SLLA 1BARA 4XXAA 5LK5A 4Y1VA 2LIEA 3MALA 1JT3A 3F62B 1IRAX 4WVWA 3HBWA 4I7IA 3AXEA 1PC8B 1BQPA 1S0FA 4XBNA 5FZUA 3O0VA 1YYNA 3AJYA 2H0BA 3WOGA 2ENRA 3AJ5A 4BQ1A 1R1ZA 1YI7A 3MW2A 3SLIA 1MS5A 3WO4A 1A3KA 3M1HA 1LEDA 1QQLA 2ZHNA 3IMNA 4QALA 4PF5A 3WLUA 2YY1A 4II0A 5HCAA 1AXMA 2PHWA 4JKXB 3O44A 1UZYA 1HCEA 4AVTA 4ISRA 1DZCA 2HWMA 2WT0A 2UWBA 2D22A 4UW3A 2ARBA 4JRAA 1NXD1 3PHZA 5FRAA 3RTIB 3WMUA 4CJMA 1FWUA 3AZYA 1DFCA 2VSEA 1VAVA 4GA9A 1D2SA 4RL7A 2Y9GA 2PHRA 41BIA 4M00A 2QN4A 1DLLA 1UZZA 3FGMA 4LO0C 4LBOA 3SITA 1UMZA 3M3EA 4YW3A 4QBCA 1QKQA 4U2AA 5E24E 2EIGA 1SR4A 3FJIA 3BADA 1V6UA 2A3YA 1EV2A 2VLCA 5FZYA 3WUDA 2JECA 1IJTA 3IM6A 1W0PA 4ZBVB 2EAKA 1GANA 3VKOA 4FPCA 1LJ7A 3UJ0A 3NBCA 3ZC9A 1G9DA 4UW5A 3B01A 1S0IA 4ASMB 2WBCA 5EG6C 1QF3A 5EYXA 4FQ4A 2A6XA 1QDOA 4FOYA 5BP5C 5T5OA 1WW6A 3WO3A 4SLIA 4ITCA 3OJBA 2DVAA 1OKQA 1QQKA 1DBNA 2UWAA 3T2TA 3UJOA 2FO1A 2WT2A 1Q04A 2ZMNA 5DVHA 3AFKA 2GMMA 5CB7A 5KXBA 3RSJA 1CPNA 5GLTA 3HMYA 4USOA 1HIBA 4XFTA 4FPGA 4I4SA 3AH4A 3WDUA 2FFVA 2GMEA 1KJRA 5FNXA 3B3QE 1G82A 1ISVA 1LCLA 1W6MB 4KEKA 2DU0A 2OUHA 3AKGA 1RY7A 4BPZA 2F8XC 5IT6A 2CTVA 2NYYA 3U4XA 4Y1YA 3ZXKA 1UN1A 5DZUA 5CNAA 2TEPA 3A07A 4D69A 4IHZA 1QNWA 3BAGA 1WW7A 2DU1A 1N3OA 4AVSA 2AR6A 1I1EA 4OEFA 1NZKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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