3AZVA

Crystal structure of the receptor binding domain
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
427
structure length
418
Chain Sequence
NEYFNSINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
publication title Structural and mutational analyses of the receptor binding domain of botulinum D/C mosaic neurotoxin: insight into the ganglioside binding mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords D/C mosaic neurotoxin
total genus 79
structure length 418
sequence length 427
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3azvA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3azvA02
4XTMA 2NYYA 2A7AA 1YO8A 2PHRA 3R4SA 4JQ0A 2NMNA 3A07A 3OJ2A 2P3KA 5E88A 3APBA 1JN2P 4XFSA 4IQPA 5IK4A 1HQWA 4P14A 2ZGKA 4Y1UA 4I96A 2P3IA 4DCKC 1YIFA 4PBOA 3O0WA 2B7YA 3SLIA 1CPMA 4XJAA 3JRRA 2V5YA 3WOGA 5KXBA 2QYIB 3RTIB 2AYHA 3JUUA 4GWNA 1L2HA 2ZGNA 2HZ9A 3PHZA 1JOJA 5DSSB 2DVGA 4DPNA 5DUWA 4ZFUB 3N7JA 1DQ1A 3RG0A 1HWNB 5T52A 4I4YA 1MS0A 1SBDA 1MC9A 2DWRA 3RS6A 4BMBA 4P9YA 3ZX7A 3RTJB 1JW6A 2RQ9A 2BFHA 3LLPA 3KM5A 2E4MC 5EG6C 1SZ6B 3AP4A 2DVFA 1T4QA 1QU0A 2LALA 4Y1XA 3CU1B 1WW7A 5GLTA 3O12A 3WG4A 5KXEA 1WBAA 1ABRB 1V6IA 2CYFA 3VWCA 1JYCA 3AKFA 2KI4A 2R16A 1CE7B 3WDVA 5T50A 4AN7B 1AVAC 3OY8A 1JT5A 1A78A 3NV3A 2PHXA 4M01A 1HCEA 2WSVA 2ZGUA 5H9QA 1AXYA 4LBOA 4I6IA 4XHXA 3WNXA 1ULGA 4PBPA 2PHTA 3WUDA 4ZLBB 3RSJA 3M2MA 4J2YA 2JDZA 2VH9A 1RZOB 3WLUA 3BODA 3AZYA 3BA7A 3BRFA 1BFFA 4AVSA 2YUGA 4LBQD 5GZEA 3V64A 2R1DA 5E89A 4I2SA 4FOVA 3WA1A 1GZWA 5FZZA 2GN7A 1GZWB 4UW3A 1ISYA 2GMMA 3FBYA 3D5OA 2D24A 1LTEA 1SCRA 2D6MA 1AJKA 4QC4A 3IM5A 4M3CE 4ISRA 3V65A 4YZ3A 8I1BA 1LENA 3A22A 1WLDA 4IONA 2W68A 41BIA 1DQ4A 4I4OA 4M00A 4OEGA 4OWKA 2Y9XE 5GALA 3D6EA 1W6OB 5CNAA 1KITA 4YM0A 3W9TA 4FQ4A 2D20A 3ZPYA 3VUOA 6I1BA 5CAZA 4FPKA 4XBNA 1MZ6A 2R49A 4NOTA 3OJMA 4Y20A 4Y20B 1AXZA 4YGEA 5GZCA 2E7QA 4YZ1A 3V0AB 3MW2A 3WG3A 1HKDA 1JLXA 3OPZA 1SFYA 4WVVA 1S1AA 2SLIA 4D8HA 1WLWA 1FWVA 2WNEA 4YFZA 2ZKNA 3PMEA 3WDTA 2FHRA 2D6KA 2ZZJA 3MW3A 4H9WA 1LHUA 4XTPA 4Y22A 1F31A 4Y22B 1HWMB 3AH1A 4YZ5A 5I1BA 5E8AA 4I1BA 4UW5A 1M16A 1FNZA 3OBTA 4K1ZA 3W59A 1LEMA 1LEDA 5DUXA 4EB2B 1Q1UA 1AX2A 9ILBA 1PZZA 3WZ1A 4I4VA 1AX0A 2AREA 3VSZA 1N3OA 1S0LA 3SNVA 1WW5A 2W39A 2EIGA 3O4AA 1W6QA 3N35A 1ISVA 2JE7A 1IS4A 5F8YA 1CR7A 2M49A 3CA4A 1G7YA 3I2XA 1JLYA 1JTCA 3K1XA 1R1ZA 3O3QA 4GP3A 2DUPA 1DQ6A 1IT0A 2A71A 3NV1A 1NUNA 3FJEA 1MS4A 3AX4A 1JQZA 1G82A 2AAIB 3PVNA 1R8NA 1NZKA 1Q03A 3LTQA 1Q8VA 3MW4A 3S8JA 1KJLA 3H0OA 4W65A 1DQ5A 2NTDA 4YOLA 3AZZA 5FZUA 3MEPA 4XE9A 3BRDA 3BAOA 5GLUA 3WMVA 1AVBA 1AF9A 4R9BA 5D63A 2E7TA 3WHTA 5DZEA 4DENA 3WINC 1DJSB 2A5ZA 4I7IA 1V6MA 2VUAA 1V00A 1JBCA 3NWKA 4XJWA 4BLIA 3N3HA 1TWMA 3ILNA 2HWAA 5DG2A 3WG1A 1GZCA 5IUQA 1GICA 1JHNA 1H9PA 4IY8A 2KKIA 4YM1A 3B9UA 3GALA 4QD2B 2EXHA 1HWOB 2D7IA 1I1EA 4XHBA 4J2KA 1UZYA 1AVUA 2MC2A 1LODA 5GZGA 1DQ0A 4LO8B 5BP5C 1GGPB 3UJ0A 1SLLA 1W6MA 3TB0A 2ARBA 1FGAA 3SH5A 3PUBA 5G00A 4HL0A 5BQUC 1BLAA 4A7YA 4YG0A 5T55A 1YRZA 1NLSA 3BTAA 2CTVA 3IKWA 5FNXA 3GNEA 2UWCA 4BPZA 1K5VA 3CRGA 4FOWA 1N1VA 2VY0A 3WCRA 1RY7A 1ULEA 1YF8B 2I2SA 2Z49A 2D22A 1TWEA 5D61A 2AENA 3WO2A 4X38A 2ZHKA 4M3CB 1IRAX 2PHWA 2D3RA 2GNBA 1LECA 4LO0A 4Q2FA 1G9BA 4OEFA 3FJ8A 3HR9A 2W08A 5JMCA 1SR4C 1IHKA 4ATEA 2YZ4A 2P2KA 2ZMKA 4XMAA 1BFGA 3FJKA 2A6VA 1MVQA 1AZDA 4D69A 2AGSA 2NP0A 2A3XA 4J23B 4QD2C 1URXA 4Z8BA 2ZGSA 2DUOA 3HSMA 4KC3A 1DIWA 1W6NB 2VLCA 4R6UB 4I4UA 5F5QA 1QDCA 5KXDA 4KBBA 4Q26A 1CN1A 3VEQA 1PC8B 1SBFA 4A7ZA 4I1EA 2RG9B 4XKIA 1G9FA 3CNAA 5EWSA 5GZDA 3WVJA 4K1YA 4FPYA 4Q8LA 1S0JA 5F90A 1GKBA 1SCSA 2VW2A 5H9SA 1A8DA 3PVEA 3WHUA 1ZM1A 4ZFYB 3A21A 2NMOA 4USOA 2DV9A 4IYBA 2GDFA 1FWUA 2X2TA 2P37A 3T2TA 2E4MA 4YW5A 1XZZA 2BEAA 1JT4A 5DUYA 2OUJA 1S0DA 4KEJA 4I8MA 2DTYA 1YI7A 4FPCA 5CA6A 3T1MA 2A3WA 4LO3C 4LO2C 2WLQA 3AZXA 5IK5A 5F8SA 4GP0A 3FJBA 2OUHA 2NN8A 1BYHA 5IK7A 2D7RA 1I1BA 4I4QA 1Q56A 3POYA 2DTWA 3FJHA 3NBEA 3KMVA 2EAKA 2D44A 1GANA 5IT6A 4FPOB 4AVVA 2NM1A 1MACA 1QQKA 3VKMA 1EV2A 1UL9A 2GN3A 4XIKA 1CPNA 3LSDA 3NV4A 3BAVA 4XJUA 1QOOA 1CQ9A 2A6WA 2ZGPA 3QCWA 4PF5A 4JAWA 3VKOA 1W0OA 2P23A 2IHOA 4OZXA 1XYFA 1ENSA 2A6XA 4PQ9A 3HBWA 3H6QA 3O4OA 3TC2A 4FPHA 1AJOA 2ET2A 2K4AB 3AYEA 1V6WA 1TTUA 3B69A 4WZFA 7I1BA 4Y1VA 4OW4A 5JOXA 2P3JA 4EFQA 1V6JA 4XFUA 1KJRA 1A3KA 4EFPA 5L73A 1KDKA 3FFZA 1V6XA 4DFSA 4C1WA 2VSAA 4Z8SB 2F8XC 1Q8QA 1UMZA 1Q8SA 3AYCA 1LULA 1DQOA 4JCKA 1W6PA 1FV3A 3HMYA 1W6PB 2PELA 3OBRA 1RG8A 1TFMB 4EEEB 3ZYPA 2PHUA 3CAHA 3O5SA 5HCAA 5GM0A 1UPSA 4DS0A 1BARA 3ILAA 4YW2A 4F34A 2D6OX 1ENRA 2JKBA 3FLRA 4Q1PA 2AH2A 2ZQOA 2R9KB 3F1RA 1FYUA 5JOZA 5FREA 5CBLA 1AVXB 3NBNA 1GLHA 4OEEA 2AFGA 1N3QA 5BYNA 5LK5A 5H9RA 2CWSA 1TP0A 4A7KA 5BOWA 4XDQA 1IJTA 3IPVB 3FJCA 3DGTA 2ZGRA 1CIWA 3BOPA 1V6VA 2DYCA 1ITBA 3ZYRA 1CONA 2DREA 2Y9FA 3AK0A 2PHFA 4ITCA 1DYPA 1MS9A 1WUVA 2KM2A 1IKPA 2WJSA 4YGCA 2HW9A 3I29B 3JU9A 2A3YA 1W6OA 3P6IA 2FGFA 1JXNA 3KQRA 2Q3NB 2D23A 3AP7A 2XG3A 2X2SA 2ZR1B 2MIBA 3B3QE 3V0AA 1ISXA 3U4XA 1GNZA 1KNMA 2ZHNA 3IM6A 1VALA 1FAYA 3N7KA 1WD3A 2ZACA 1SBEA 4EFRA 2LTNA 2R0HA 3CRHA 3ZXFA 4L4IA 4YZ2A 2EF6A 1UZZA 4TZDA 4YG3A 3WINA 3AJ5A 3IMNA 1WD4A 3NBDA 3BX1C 1AXMA 3M3CA 3ASIA 1LJ7A 1CVSA 1DLLA 3OYWB 1QNWA 4GOVA 3V0BB 4YW1A 2ESUA 2ZGQA 3M3QA 3IIRA 1G86A 3HALA 1FMZA 3A23A 1IS5A 3WO3A 4ZA3B 1AFCA 4CJMA 5BP5A 1LOFC 2ZGLA 1IRPA 3INAA 4Q9PA 3VT2A 4D0ZA 4KEIA 1BASA 1ISWA 1C1FA 3P53A 5BQUA 2EXIA 1LU1A 1JT3A 2HYKA 2K8RA 3FJDA 5EYXA 4GA9A 3IM7A 2FFUA 1APNA 2ERMA 3UJ4A 4CZSA 5E24E 3B01A 2GMEA 5T5OA 3POKA 4I3NA 1YBIA 2UWAA 1YTOA 2IWTB 3W58A 3FJJA 4Y1YA 2DVBA 1PUMB 3ZC9A 2BQPA 2Q5TA 1V6OA 4FPEA 3WCSA 1BZWA 3AP6A 1SR4A 3M3OA 4ZGRB 1BXHA 1QOTA 4YFWA 1RITA 4I4XA 3CA5A 3CA1A 1SLAA 3UJQA 3AJ6A 3ZSJA 4AYUA 2WRYA 1FNYA 4LO1C 1WCSA 2UWBA 1Q04A 3FGMA 1YXWA 4I4RA 4FPJA 4U2AA 5B2HA 1DHKB 2NZ9A 3R05A 1JY0A 1GSLA 4DRRA 4YW4A 5GLZA 2XB6C 1UX6A 2SBAA 4JPZA 4OWJA 1GZ9A 1LOAA 4BQ1A 2WSUA 2WT2A 1MD6A 2MLLB 3BAQA 4OWLA 1MS5A 2ZGTA 2ENRA 1XHBA 3ZXLA 3WO4A 3ILFA 3LSEA 2E51A 5D62A 3C9ZA 2XOAA 2UUSA 4XYXA 1ILR1 1JUIA 1RIRA 4AWDA 4G6JA 1EYLA 4ZFWB 4M3CA 1XQNA 2LIQA 4AGRA 2KLLA 3I4IA 3UD8A 5FRAA 3VKNA 4NO4A 4X37A 3VV1A 1S0IA 2YY1A 4II0A 4AGVA 4P0JA 4BLJA 1AX1A 5EYYA 5FNWA 2AUYA 2C5DA 1TEIA 4JKQA 1U0AA 4CRQA 3CRIA 4LO2A 4LO3A 1Y7BA 1V6KA 5BVPI 1O4ZA 2G4IA 3HN1A 1TOOA 4G1RA 4YLZA 5HCFA 1PZ9A 1HCDA 3POWA 1W6NA 4HANA 1DZDA 1PUUB 4XOGA 3Q7YA 2JE9A 1SLCA 3T8SA 3AP9A 1IOBA 2YMZA 3EF2A 3SITA 2JJ6A 4ZBVB 4YM2A 2HWMA 1FX5A 3VKFC 2GZBA 2K43A 4HA2A 3CA0A 2ES3A 2AQZA 4LO7C 1CESA 2EXKA 1LHWA 3IN9A 1LGNA 1W3FA 4BMEA 3IAGC 4Y26A 1DFCA 1H30A 1CJPA 4LBQA 5EXOA 4LBQB 2DVDA 1Z0HA 1BKZA 3WDYA 1X50A 1SACA 4Z9WB 1BQPA 2LIEA 1GNHA 4AN6A 3D4KA 2DRYA 3N7LA 4GKXA 2UU8A 4RL7A 2FO1A 4X39A 4D0TA 2JECA 1DGLA 2OVUA 1J1TA 1SLTA 3SH4A 4CTEA 1PZ8A 1BA7A 1DQGA 1BJQA 4XIOA 1HKNA 5AVAA 4DQAA 2F2FC 4Y1ZA 3ZVXA 3ATGA 4QKSA 1Q8PA 3SH3A 4GOYA 2VW0A 3D7WB 1ENQA 4EKXB 2DURA 1S0EA 4GALA 1FN0A 2A75A 2GALA 1YYNA 1OQ1A 3L2YA 3ZXGA 4Q8KA 1VLNA 4I4PA 1G9AA 1OQLB 1S0CA 3F62B 2WBCA 3LCPA 4C1XA 1LHVA 4K20A 1IILA 1ONAA 3AXEA 4ASMB 1SLIA 1QXMA 3JUTA 4R9AA 1KQRA 4GAIA 2ZBJA 1J0SA 3AYAA 3BAHA 4G9MA 4BM8A 5DUUA 1UAIA 2ERFA 3P6JA 3M1HA 4XBQA 3AH4A 2ARXA 3IM0A 5BXTA 2E53A 1LCLA 4R9DA 3Q9OA 3B9CA 4YGDA 1DQ2A 4UW6A 1QF3A 5H9PA 3BB2A 3RMYA 1VAMA 5CB7A 4KEKA 5DVHA 3ZC8A 4FGFA 3NJ5A 4XZPA 3BADA 1W3AA 1LGCA 3UL2A 3DUIA 1LU2A 1K5UA 4Y24A 1LOEA 3RRDA 1IOAA 1EPWA 2L5XA 3AYDA 2ZGOA 5DUVA 3AZVA 4ZXKA 3UJOA 4YGBA 2I1BA 5BXRA 3O0XA 1HDKA 5IK8A 1BFBA 1MVEA 4JRAA 4XXPA 1C1LA 3ZXJA 3VT0A 1FQ9A 3FUQA 3VSFA 1V6UA 3OJVA 3M3EA 2A6ZA 1W0PA 2YV8A 3AXDA 4R9CA 5JVVA 4OUJA 1IKQA 4P6AA 3OY8B 3HOMA 4WVWA 2ZA9A 1F9KA 1C4RA 2E6VA 3CA3A 3NBCA 4UW4A 1DFQA 2AXMA 2DU1A 1S0BA 2D3PA 4JP0A 1JT7A 1WBFA 3A4UA 5JDBA 1ULFA 4TYSA 2VSEA 4LBNA 1N1TA 3IPVA 1F5FA 4SLIA 2DUQA 1Z2VA 1DZQA 2YROA 3C2UA 1I3HA 1HWPB 1UN1A 5FZYA 4FOYA 3E8LC 3A0NA 5JLVA 4I30A 1LOFA 4YW3A 2ZQNA 3O4CA 1ISZA 2WKKA 5T5PA 4USPA 1VIWB 5GZFA 1KDMA 4U36A 4I4SA 4IHZA 3AFKA 3ZSMA 2J3PA 2ZMLA 1N3PA 1O4YA 4K21A 4PCRA 1C57A 2D7FA 3WDUA 2CL2A 3S8KA 3I2AA 4XFTA 1OFSA 4QO3A 2ZMNA 2KI6B 1D0HA 1N1SA 4J2XA 4ATFA 3T1LA 2D6NA 1LOGA 3V79C 4HJJA 4I37A 1LGBA 2DRZA 2CWMA 2D43A 1MS8A 2GNDA 3O0VA 1LHNA 2H0BA 1RINA 3OGGA 5EHAA 4HR6C 4DEPA 21BIA 1GV9A 3CQAA 2EXJA 3VT1A 2V73A 3ZXKA 4JKXB 2ZAAA 3AKHA 2DVAA 5DZFA 3O44A 3OYWA 3N0KA 1QOSA 1AXKA 3MPPG 4LO1A 3V0BA 2KH2A 2Q9XA 4P0LA 4P9XA 4J2SA 4ENDA 3BIWE 1BLDA 1TIEA 1PWAA 3AZWA 1Q8OA 2D3SA 4FPLA 5BXPA 4AVTA 4XJ8A 2WQZC 2CY6A 4P9WA 1BFCA 2GMPA 3FJ9A 2VU9A 1KRIA 2D1ZA 2A70A 1ONKB 1WBCA 4FPGA 4IZXA 5DZUA 4LBKA 1VCLA 4G6MA 4Q1RA 4XILA 1LOBA 2JD4A 3OGFA 1QDOA 4GKYA 4ZKTB 4QKRA 5JOWA 4FQZA 3Q7XA 4DRVA 3UD9A 1W6QB 4IZEA 3O49A 1ZA4A 1RMLA 2FDBM 2W52A 1HLCA 4M3CF 2UURA 3UK9A 4F83A 2ZABA 1MZ5A 1N1YA 1JYIA 31BIA 1Z4SA 2DS0A 4YM3A 1MS3A 4PC4A 1H9WA 1QMJA 1OKQA 4YG6A 3QR5A 5F8WA 3FJFA 3ILRA 4WBCA 4MYEA 1G9CA 1T9FA 5EC5A 1B09A 1E0OA 1V6NA 4TLPA 5BXSA 1ULCA 1GBGA 4GWMA 1G9DA 3O4DA 2VXTI 3PJQA 3WUCA 1MR5A 3A0KA 3ZXDA 2WT1A 3PG0A 1QKQA 1M2TB 3WDXA 3ZSKA 4JC1A 3WG2A 3BRGC 3BA5A 4LBMA 4QBVA 4BOWA 3UD7A 1WW6A 2OW4A 2NVHA 2GNMA 4XMIA 2DU0A 4XXAA 3BA4A 5F9TA 5GLWA 1FMMS 1II4A 4ISQA 1FATA 1LESA 1V6LA 2Z42A 1S0FA 4XBLA 3WMUA 2ZGMA 4XJZA 3FUOA 3O4BA 4L8QA 5KXCA 3B00A 4LBJA 1QQLA 3R4UA 4Q91A 2CNAA 1DBNA 1HQLA 3AH2A 4LO7B 5HPZA 1W6MB 3POSA 1LHOA 5JOYA 1ULDA 2QN4A 1G8WA 3QYDA 1DZCA 5HCBA 3RQ0A 2RHPA 4QALA 5GAQA 3UDAA 3SISA 2D6PA 4RA0A 4FOQA 3FJAA 4P0KA 3ZXEA 4GAFA 3AJZA 1WLCA 2WT0A 3VKLA 4AGGA 4XJ9A 5GJ6A 2BEBA 3CA6A 4FPFA 5T5JA 4ZOTA 2F2FA 3TAYA 2Y9GA 1QNYA 4X3AA 4I0YA 5DXDA 4QBCA 3USUA 5T5LA 4G9NA 3USUB 3SNMA 3ENRA 3MALA 4FP3A 2R0FA 1GYKA 4Q9GA 2Y9WC 4H55A 1WW4A 1QGLA 4GXLA 3AJYA 4L4HA 5T54A 3AP5A 1NXD1 3NV2A 1UKGA 5SV8A 3ZSLA 1IS3A 1R8OA 3WDWA 2R1BA 1PZ7A 2FMDA 2C9AA 4LBLA 4WV8A 3N36A 1S0GA 3RMXA 1VAVA 2D6LX 2RSTA 1LOCA 1MS1A 1N4KA 3BAUA 4IY9A 1WBLA 2A6YA 2YXSA 3AKGA 3O5WB 5GLVA 3WV6A 1FV2A 4YZ4A 2TEPA 5DZGA 1AVWB 1XG6A 2EALA 2ZHMA 4Q27A 2AR6A 2VXRA 2Z48A 2P34A 1D2SA 4FP2A 2VW1A 3H6RA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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