3AZWA

Crystal structure of the receptor binding domain
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
427
structure length
418
Chain Sequence
NEYFNSINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
publication title Structural and mutational analyses of the receptor binding domain of botulinum D/C mosaic neurotoxin: insight into the ganglioside binding mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords D/C mosaic neurotoxin
total genus 86
structure length 418
sequence length 427
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3azwA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3azwA02
2JKBA 1GSLA 1KJRA 5SV8A 2E7TA 1EYLA 4R6UB 1TFMB 1YRZA 4D0ZA 5EWSA 3RTIB 4LO3A 4M3CE 4ZXKA 5GZCA 1RZOB 2NMNA 1LOBA 5IK7A 3VT0A 3QLQA 1ULEA 5F90A 3IPVA 3VKNA 5HPZA 3AP7A 1LU1A 5BYNA 3USUA 3E8LC 2DREA 2ERFA 4LBKA 2ZGRA 3WUDA 4KEKA 2HW9A 1WUVA 4GOVA 3LLPA 4DPNA 8I1BA 5GZGA 3DGTA 3AKFA 1WBFA 2UWBA 2LIEA 3M2MA 4G6JA 3R4UA 1ENSA 3WMVA 1WW5A 2A5ZA 5GJ6A 3FJCA 2ZGTA 2D3RA 3LSDA 3HBWA 5F8SA 1WW7A 3O0XA 2AFGA 5E89A 2VXTI 1S0GA 1AXYA 4H04A 2C5DA 5IK8A 3B00A 2D24A 3OPZA 1LODA 3AJZA 3GALA 1JT7A 1TWEA 4XJUA 4WBCA 4YG0A 1Q8OA 5D63A 2VW1A 4BMBA 3ZSLA 1EPWA 2Y9GA 4ZFWB 2GMPA 4U36A 2ERMA 3AZXA 1G9BA 1QOTA 2WQZC 1AX1A 2ZGQA 4OEGA 1YTOA 5T50A 2D20A 3H6QA 5DG2A 2UWAA 3FJHA 1W3FA 3UJQA 3O0VA 1J0SA 3AX4A 4P0JA 1WBAA 1DQOA 3POYA 1BLDA 1UZYA 2AAIB 1W6MB 4I7IA 4OUJA 4YFZA 1W6NB 1M16A 4OW4A 1AJKA 4UW3A 4LO7B 1N1TA 1DIWA 4IZEA 2D6LX 1E0OA 4FPGA 2R16A 2ARXA 3TC2A 3CA6A 2YXSA 3N7LA 3O5SA 3CA0A 2WSUA 4YG3A 2CTVA 5BQUC 2D23A 4J2SA 1U0AA 4GKXA 5GZDA 4X39A 3N7JA 4Y1ZA 4XFUA 1GZCA 4LBLA 3WLUA 1JYIA 1S0FA 1FV2A 4XHBA 1W6OA 2WT1A 4YW2A 7I1BA 3MW4A 3ZXFA 2W08A 5GALA 1SFYA 3FJBA 1LOGA 4I4UA 2FFUA 1DQ6A 1HWMB 1UKGA 3FJ9A 4Y20A 3CRGA 4YM2A 4M3CB 1WCSA 2X2SA 3CRHA 4I1BA 1JN2P 4WV8A 2EIGA 4ZFYB 2RG9B 3H6RA 2C9AA 3SH3A 1QKQA 4I4PA 4DRRA 3ILNA 4YW5A 3FLTA 2IHOA 3I2AA 1V6IA 5JVVA 3ZX7A 4BMEA 4R9AA 1JOJA 4Z8BA 5FZUA 4LBQD 2ZGOA 3HOMA 3N3HA 5IUQA 1KJLA 3VKMA 3WOGA 2P3JA 1JQZA 3B69A 1G8WA 1DQ1A 1N3PA 2VXRA 1TWMA 3NV2A 3MW3A 4FPHA 2ZQOA 4FPEA 4IONA 1N3OA 4XHXA 2JD4A 3BAUA 4YZ3A 4D69A 4FPJA 2VU9A 1Q8QA 1GICA 2P39A 2W52A 4ZBVB 1N47A 1AFCA 1QOSA 5DZUA 3NV3A 3BB2A 4QBCA 3C2UA 1O4ZA 1D0HA 1CQ9A 1DYKA 3FJDA 4FOYA 4WVWA 3O3QA 1GZWB 1FNZA 1TP0A 4II0A 4XE9A 2D6OX 3OBTA 1S0BA 4D0TA 3N7MA 1BARA 2ZHLA 2A6WA 2E4MC 4LO7C 2R1DA 4IY8A 1UN1A 1V6OA 3T2TA 1AXMA 2NM1A 3OJ2A 4PC4A 1QQKA 1CPNA 4TLPA 4Y1XA 4Q2FA 1IS5A 2CY6A 3ZVXA 4XFSA 2GNDA 3VKLA 3VV1A 2QYIB 1LHVA 1AJOA 4FOVA 3IM7A 2NYYA 3PHZA 1RG8A 1JXNA 1LULA 2GDFA 4CZSA 2KM2A 1HQLA 5BQUA 3WZ1A 3VT2A 1SLLA 2H0BA 5JOXA 3FJFA 1WLDA 1CESA 3K1XA 1LOEA 1AVWB 3BA4A 2MIBA 1SBFA 1K5VA 4YZ4A 4P0KA 3A23A 1BQPA 1QF3A 1WBLA 1ZA4A 4YZ2A 3NWKA 3P53A 2DRZA 1AVUA 5BP5C 1DZCA 1V00A 1ULGA 1QNWA 4GALA 4X3AA 2LTNA 1URXA 4J23B 1SZ6B 2GO2A 2P34A 2ZGPA 3WO4A 1LGNA 1VALA 1WD3A 2ZABA 2ZZJA 5DZGA 3L2YA 5B2HA 3KQRA 1HWOB 2EALA 5H9RA 2BEAA 1T4QA 2Z42A 3WDYA 3ILRA 4FQZA 4F34A 3VSZA 1ISVA 1W6PB 4FPKA 4XYXA 4M00A 5JOZA 3OBRA 4DQAA 3AYAA 4YOLA 5GAQA 2DWRA 3S8JA 1HIBA 1G86A 2WKKA 2I2SA 1OQLB 2GNMA 3LSEA 1X50A 3WG1A 3OY8B 4YW3A 1AVBA 3JU9A 4I4OA 1C4RA 5KXEA 2ZHKA 4CJMA 3CA1A 2PELA 3UDAA 1C1LA 1JT5A 3BRDA 4AGGA 3WINC 1FMZA 4IHZA 5EYXA 2M49A 2DYCA 4JP0A 1N1SA 4I96A 2F8XC 2W68A 2A6VA 3AYCA 1QGLA 1RITA 1G9FA 1QOOA 3IKWA 3V65A 1W0PA 1IS3A 4QO3A 5F9TA 4P9WA 5HCFA 1LTEA 1W6MA 3VKFC 3M3OA 4Q27A 1MD6A 3AZYA 4YLZA 2ES3A 4G9NA 1BZWA 3MW2A 3SLIA 4WZFA 4PQ9A 2E4MA 4I1EA 1NLSA 2CYFA 2ENRA 4DENA 2A70A 4EEEB 2VH9A 4ZFUB 1I3HA 21BIA 4K20A 1B09A 1Z0HA 5H9SA 3AP5A 4XBLA 3AZWA 1SBDA 4TYSA 1LENA 1O4YA 4L4IA 2ZGUA 1N1YA 4YM0A 3AXEA 1ONAA 3NBEA 3FJKA 3N7KA 3WA1A 2R1BA 5T5JA 3CU1B 4AN7B 2A75A 4H55A 1YI7A 1T9FA 1SCSA 3POKA 4LBNA 4GXLA 3O49A 3I8TA 1GKBA 4JCKA 3WDXA 1W3GA 2P23A 2JDZA 3W58A 1UAIA 5DSSB 3T1MA 1S0CA 1SLTA 4M3CA 1IS6A 1LOFC 1V6LA 2ZACA 3CAHA 1MVEA 5JOYA 1S0LA 1FWVA 4Y1UA 4ZKTB 2Y9XE 3OGGA 1LESA 2BQPA 3HALA 3C9ZA 1C57A 1S0JA 4RL7A 1RIRA 1IS4A 1I1EA 1DHKB 1W6QB 5BP5A 4I4XA 3N36A 4F83A 4XJWA 2YV8A 4XJ8A 4YZ1A 3ZXJA 1YYNA 4HR6C 4USPA 5EYYA 2A6YA 4ENDA 3AJ6A 5GLWA 3FFZA 1IILA 2OUHA 4XBQA 1GYKA 1VLNA 1PZ9A 5CBLA 1S1AA 2AREA 4EB2B 3FLPA 4XJAA 2KI4A 1CR7A 3SH4A 5GZEA 4USOA 3AYDA 4TZDA 2VSAA 4GA9A 1XG6A 1S0EA 3ZXDA 3UJOA 2DS0A 2X2TA 4LO1C 1DFQA 3NV4A 2AR6A 4BLIA 1PZ7A 4XDQA 1C1FA 5GZFA 1QMJA 1ITBA 3ZYRA 4YFWA 1YO8A 2Z49A 1DQ4A 1IRPA 1CONA 3A0KA 4FOQA 1CVNA 1GZWA 4KEJA 1Q8SA 1JW6A 5DG1A 5I1BA 4XOGA 1LHUA 4I4YA 3WINA 2PHWA 3BX1C 4FGFA 1F31A 3FUOA 5CNAA 1HKNA 4Q8LA 1PUMB 4Z9WB 2JJ6A 1JUIA 4C1WA 3EF2A 3WVJA 2NVHA 3M3CA 4A7KA 2V73A 2E53A 1UZZA 1HLCA 1TIEA 3BA5A 4D8HA 2TEPA 2EF6A 3AK0A 1CPMA 1V6NA 3O12A 4YGBA 3WDUA 3F1RA 3JRRA 3BRGC 2ZAAA 3O4CA 1LGCA 1FAYA 5GM0A 5DUYA 2PHRA 1Q56A 1LCLA 4LBOA 2UURA 2QN4A 1QNYA 2I1BA 2D6NA 1XZZA 2PHFA 2Z48A 2A3WA 4YW1A 3AH2A 2GNTA 2WT0A 4Y1YA 2ZGLA 3FBYA 2ET2A 2ZMNA 3IIRA 3NBCA 4ZA3B 2EXJA 5IT6A 1LOFA 2UU8A 1IOBA 1Z4SA 4Y22A 5FZZA 2SBAA 1SR4C 4I0YA 3WHTA 4LBMA 4ITCA 31BIA 3ENRA 4XJ9A 1DJSB 1QU0A 2MLLB 3Q7XA 3IM5A 1MS8A 3WMUA 2AUYA 1JT4A 5CAZA 2OW4A 4FPLA 5D61A 2EXIA 1LOCA 3BADA 5IK5A 4DFSA 1W6PA 3WDWA 5DVHA 3A0NA 1ISXA 2E7QA 1KDKA 3B01A 1PUUB 2P3KA 3RQ0A 1N4KA 2R0FA 4QALA 2ZGMA 2NP0A 3V0BA 4AGRA 2J3PA 3OY8A 2WBCA 4DRVA 4OEFA 1MZ5A 3KM5A 3I4IA 1ISWA 5JLVA 3OJBA 4XILA 3HN1A 5FNWA 5KXCA 3GNEA 4LO1A 3AP4A 4CTEA 4XBNA 3H6SE 1HCDA 4AVSA 2R49A 5T52A 1DQGA 4P9XA 1DLLA 5T5PA 3B3QE 5DUXA 3WO2A 1BA7A 3BAVA 1KQRA 3M3QA 4ISRA 2DRYA 3AH1A 1ONKB 5FREA 3D6EA 1HCEA 5DUVA 1QXMA 4JPZA 3WV6A 1SCRA 2LALA 3H0OA 41BIA 1FMMS 1AVXB 1PWAA 2GN7A 4Z8SB 2HZ9A 1IHKA 1AX2A 4BM8A 2NTDA 3NBNA 4GKYA 4OWJA 2LIQA 3CA4A 3JUUA 5KXBA 4YM3A 5EC5A 1ABRB 4HJJA 4I2SA 5LK5A 1IKQA 2L5XA 3RMXA 1V6MA 5AVAA 1G9DA 1KNMA 1NXD1 2D6PA 4J2KA 5KXDA 1IT0A 1SLBA 4ATFA 1CN1A 5BVPI 5T5OA 4FP3A 1M2TB 5BXRA 3AZZA 2DTYA 4P6AA 4Q9GA 2ZMLA 2YROA 5IK4A 2VW2A 1LECA 2WLQA 1Q8PA 4I4VA 4FQ4A 4Q91A 4I4QA 1GLHA 4I4RA 2DUOA 3WNXA 1IJTA 3A07A 4YGCA 4OWLA 4IZXA 1IOAA 5DUWA 1AZDA 3D7WB 1PC8B 2DU1A 1D2SA 4QKRA 2R9KB 1FNYA 4YW4A 1W6OB 1YBIA 2XOAA 4JKQA 3VWCA 4OWKA 1SLAA 3NV1A 3WHUA 3AH4A 1H9WA 3OYWB 1HWPB 4Y26A 1LEDA 1DYPA 1ILR1 1SR4A 4L4HA 4MYEA 3BAHA 3FLRA 1K5UA 3IAGC 3H6RB 5T54A 3HSMA 5CA6A 2DVFA 4G9MA 1FATA 2HWAA 3P6JA 2D1ZA 4ASMB 1FV3A 3JUTA 2VUAA 4XIOA 1KITA 1W3AA 2FDBM 2ZA9A 1Q04A 1BKZA 3O4DA 1JHNA 3BAGA 2DU0A 2BFHA 3WCSA 3O5WB 4FP2A 5E24E 3PUBA 4Q8KA 4IQPA 1J1TA 1R8OA 2A7AA 1MS1A 2ZR1B 4I8MA 2FHRA 1Z2VA 1BFGA 1Y7BA 5DXDA 4M01A 3O4BA 4I6IA 2D22A 4ZGRB 2GN3A 3QYDA 3FJIA 3QR5A 2D44A 1LOAA 1DGLA 3ZSMA 5E88A 2Q9XA 5BXTA 2Q3NB 9ILBA 2A6ZA 3WG2A 3FJJA 3TAYA 1KDMA 3RSJA 2DURA 2HYKA 1NUNA 2OVUA 1PZ8A 3WG4A 1W6NA 5DZEA 4XTPA 3WUCA 3CA5A 4DCKC 3WDVA 1LU2A 1BFFA 3ILAA 1LHNA 3FUQA 1CIWA 3M3EA 2G4IA 1AF9A 5F5QA 3BRFA 3M1HA 4YGDA 3W9TA 2ZKNA 1PZZA 3FJAA 3CRIA 1UL9A 2RQ9A 4EFQA 5HCBA 3ZXEA 2KH2A 2WRYA 1JBCA 3POSA 4M3CF 1CE7B 3RRDA 3SISA 2CWMA 3A4UA 4EKXB 1MS5A 1N1VA 1GNHA 5GLVA 4R9CA 1MC9A 1Z78A 4JRAA 5D62A 3POWA 5JDBA 2D3PA 2WSVA 1GGPB 1HQWA 1G9AA 5BXSA 2YUGA 3ZXGA 4HA2A 3PJQA 3BA7A 5DZFA 1S0IA 3D5OA 1L2HA 3V79C 2YZ4A 2UUSA 3CA3A 5H9PA 1BXHA 3VT1A 1W0OA 2D6MA 1H9PA 3RG0A 4XTMA 4AWDA 4UW5A 2E51A 3R05A 2ZBJA 4Q1RA 1VAVA 5H9QA 3BODA 4EFRA 4GOYA 4GP0A 1NZKA 4PCRA 3UD9A 4XMAA 1FN0A 3NBDA 1LJ7A 2K43A 2SLIA 1F5FA 3VUOA 1LGBA 4HL0A 3BTAA 4J2XA 4XIKA 2HWMA 2P2KA 3APBA 2RHPA 3BAOA 4RA0A 3A22A 1SLCA 1BFBA 3AFKA 4LBJA 2D43A 4LBQB 2DVAA 1AVAC 1XYFA 1OQ1A 4C1XA 3BOPA 1JY0A 4XXAA 4LO2C 4X38A 1UPSA 4GAFA 4AGVA 6I1BA 3SNMA 3LCPA 4A7ZA 2YMZA 4ATEA 4NOTA 1V6WA 1A78A 2XB6C 1ULDA 5JOWA 3O4AA 4XKIA 2XG3A 4JKXB 2F2FC 2KKIA 3INAA 3Q9OA 3AKHA 4R9BA 3ILFA 3RMYA 2Y9FA 1I1BA 3I29B 3OJMA 5GLZA 5T5LA 2ZHMA 5BXPA 2MC2A 3V0AB 1GNZA 1JT3A 3Q7YA 4FVVA 1EV2A 5DUUA 4ISQA 4JC1A 3WDTA 5GLUA 4QC4A 1RINA 2DV9A 1ULCA 2DVDA 3DUIA 4UW6A 2GMEA 4J2YA 4I3NA 1ENRA 2KLLA 4GWMA 2GMMA 1FGAA 1YF8B 5BOWA 2VSEA 2PHXA 4HANA 4OZXA 4R9DA 5T55A 4P0LA 1HWNB 2P3IA 4W65A 5G00A 1MS9A 1G9CA 5L73A 4IY9A 1V6UA 2ESUA 1WW6A 4DS0A 1VIWB 2NN8A 5EHAA 1WW4A 2Y9WC 3HR9A 1ZM1A 1V6JA 3PVOA 3V64A 2E6VA 2DUQA 3CQAA 3UJ4A 3B9UA 1MACA 2FO1A 4AVTA 4U2AA 2CWSA 2BEBA 3UL2A 2AYHA 1Q03A 1XHBA 4Y24A 3I2XA 4I4SA 2DUPA 4OEEA 3OYWA 3QCWA 1IKPA 3U4XA 1GBGA 4BLJA 4I37A 3AKGA 1JLYA 5HCAA 1Q8VA 2B7YA 2A3YA 2P37A 1S0DA 3IPVB 3IMNA 3ASIA 2NMOA 4AVVA 3USUB 1DQ0A 1GANA 1AX0A 2WT2A 4ZLBB 3WO3A 5EXOA 3FJ8A 1A8DA 5FZYA 2R0HA 2UWCA 3W59A 3ZSJA 1N3QA 4G1RA 1F9KA 4Q26A 1VAMA 1A3KA 5F8WA 2FMDA 2WJSA 1MR5A 1WD4A 3AZVA 5F8YA 2ZHNA 4K1YA 2AGSA 1V6KA 1ISZA 1G7YA 4BOWA 1GV9A 2D7RA 1OFSA 3RS6A 4L8QA 4G6MA 1YIFA 2K8RA 4LO2A 1KRIA 4GWNA 1V6XA 1LHOA 4Q1PA 2CL2A 4SLIA 4QBVA 4AYUA 4WVVA 1UX6A 4YGEA 1FX5A 1WLWA 2GNBA 2ZGKA 1BASA 4Q9PA 1MS3A 3T8SA 3VSFA 4XZPA 3IM6A 2A3XA 2F2FA 3PMEA 2VW0A 3MEPA 4PBPA 3VEQA 2OUJA 4DEPA 1II4A 2DVGA 1BYHA 3O4OA 4X37A 1BLAA 2ZMKA 1JYCA 2AXMA 3AKIA 3RTJB 2VY0A 4XFTA 3O0WA 4A7YA 1TOOA 4UW4A 2GALA 3AJ5A 3N35A 1RMLA 4QKSA 5CB7A 1DZDA 1XQNA 1YXWA 3LTQA 2VLCA 4K1ZA 2AENA 1MZ6A 2D3SA 3BIWE 3IN9A 2JE7A 2YY1A 3SITA 3AP9A 4FOWA 4P14A 4JAWA 1IRAX 2FFVA 3UK9A 3SNVA 4CRQA 4QD2B 1BFCA 4NO4A 4FPFA 2GZBA 2D6KA 3N0KA 3UD8A 3AYEA 2AH2A 3WG3A 1JTCA 3PG0A 1R1ZA 4LO0C 1FWUA 1FYUA 4KBBA 1CJPA 3T1LA 4YZ5A 1CVSA 4YG6A 4GP3A 2PHUA 5E8AA 3PVNA 4I30A 4LO3C 1P63A 3FGMA 3ZSKA 4BPZA 4YM1A 1LHWA 2K4AB 3CNAA 1ENQA 4AN6A 1W6QA 2ZGNA 3HMYA 4Y20B 2AQZA 1RY7A 1FQ9A 2A6XA 3Q7WA 1SACA 3IM0A 1JLXA 3F62B 2DVBA 1SBEA 2PHTA 4Y22B 2CNAA 4BQ1A 1HKDA 3VKOA 2EXKA 1OKQA 3MPPG 1GZ9A 4GAIA 1H30A 2ARBA 4KEIA 3ZYPA 4FPOB 4XXPA 3NJ5A 1APNA 3TB0A 4LBQA 2D7FA 2A71A 1VCLA 2KI6B 2EXHA 1AXKA 4ZOTA 1Q1UA 3PVEA 1DZQA 3AP6A 2NZ9A 4PBOA 4XMIA 1DFCA 3OGFA 2IWTB 2W39A 1EVTA 2JECA 3ZC8A 3BAQA 3V0BB 4H9WA 1R8NA 5FRAA 3D4KA 1WBCA 1TTUA 1MS4A 1G82A 2RSTA 1ULFA 4LO8B 4PF5A 3UD7A 2DTWA 3V0AA 1QDOA 1SLIA 1HDKA 4IYBA 1UMZA 1LEMA 3AJYA 4JQ0A 3UJ0A 1TEIA 3MALA 3B9CA 1QDCA 3FJEA 2ZGSA 3A21A 1BJQA 2Q5TA 2JE9A 3ZPYA 3ZC9A 1QQLA 1DBNA 1AXZA 4XJZA 4K21A 3R4SA 4EFPA 2EAKA 2D7IA 3O44A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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