3FUOA

The crystal structure of receptor binding domain of botulinum neurotoxin serotype a
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
421
structure length
416
Chain Sequence
TSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSLGCSWEFIPVDDGWGERPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Glycosylated SV2 and gangliosides as dual receptors for botulinum neurotoxin serotype F
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
total genus 105
structure length 416
sequence length 421
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2009-01-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3fuoA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3fuoA02
2YXSA 4A7ZA 3Q9OA 3S8JA 2NM1A 3WUDA 3N7MA 4J2YA 3MW3A 3D6EA 1BQPA 1JLXA 1HQWA 2ET2A 1MS3A 1CJPA 3B3QE 3AKFA 2VXTI 4XOGA 4YW3A 3WOGA 1AXKA 4Q8KA 3AH2A 2P23A 4P0LA 21BIA 1AJOA 1LULA 3CRIA 4AVTA 2ZGQA 4FP3A 4HR6C 4BM8A 5T5OA 3BA4A 2Z49A 3C9ZA 4X39A 9ILBA 4Y20B 3HN1A 1MS0A 4NOTA 1SCRA 3M3QA 1AX1A 5CBLA 4I4RA 2E4MC 3PMEA 3WHUA 1FV3A 1V6XA 2FMDA 2CWSA 1XG6A 3BB2A 1IILA 5SV8A 5FZYA 1ULFA 3AKHA 3V0AA 4AVVA 3RG0A 3N35A 5T52A 2UU8A 3OBTA 5E88A 3MEPA 2AENA 2R1DA 3F62B 1C1LA 4GA9A 3O0WA 3VKOA 2WSUA 4P9YA 4FVVA 3H6QA 4ENDA 2ZQOA 2NN8A 3O4OA 3AYEA 1O4YA 2VW2A 4QBVA 4XJ8A 2CNAA 3UK9A 1CONA 2R0FA 1G86A 5FZUA 3FJ8A 2HW9A 2AFGA 4I4QA 1QKQA 3WDVA 1I3HA 5GLTA 1LOAA 1DHKB 3POWA 5IUQA 3OY8A 1D0HA 3BRDA 2NYYA 1LOCA 1G8WA 2A3YA 2DVDA 5FNXA 1GZWA 2D6OX 3CNAA 41BIA 3ZXDA 3HOMA 4YZ1A 3OJMA 3TC2A 1UX6A 1ISWA 3HR9A 3AKIA 2YROA 1SLBA 1OQLB 1QQLA 4YM0A 4F34A 4IQPA 1WD4A 4FGFA 2BFHA 4FPGA 2D44A 4HL0A 4G6MA 3AZXA 3ILAA 5E89A 4GALA 5T5LA 4IZEA 1V6OA 1WD3A 1BLDA 3AK0A 2KI4A 2K43A 3Q7YA 1WBAA 4LO0C 4PQ9A 3IM6A 1LOFA 3O4DA 2AXMA 2NMNA 4I1BA 4SLIA 1BJQA 1RZOB 3CA1A 1JHNA 4KC3A 1LEMA 2JE9A 4FPLA 2DREA 1CESA 2D3RA 2OUJA 3CAHA 4FPFA 1NUNA 5BYNA 5D63A 4JKXB 2RG9B 1Q56A 5HPZA 4OW4A 4XYXA 2D6PA 1S0FA 2GNBA 3H0OA 5G00A 4I4SA 2GNTA 1XZZA 4XBNA 4ZKTB 1MZ5A 1Z2VA 2RQ9A 2NTDA 3ZYRA 4CRQA 3RMXA 2XB6C 5IK4A 5B2HA 2DVBA 3HSMA 1GGPB 3IKWA 1N3PA 4A7KA 1CVSA 1HIBA 1SLIA 1UZZA 3ZPYA 5EYYA 3BAOA 1I1BA 4U36A 2D43A 1DQ6A 1W6MB 4YG0A 4Q26A 1DYPA 3WG4A 4LO3A 3A23A 4CTEA 2WLQA 4OEGA 1C57A 5KXBA 2QYIB 2EXIA 5DG2A 3FUQA 1J1TA 4ZLBB 1N1SA 1YYNA 2TEPA 4G6JA 1URXA 4I3NA 1PZ7A 5DUVA 2FFUA 1MS4A 3ILFA 3SH5A 3JUUA 1N4KA 3HALA 4IY8A 3BOPA 1ILR1 4LBNA 4J2SA 1W6NA 2D6MA 4ZBVB 1W3GA 4D0TA 5GZFA 3V0BA 1CQ9A 4G1RA 4BLIA 5I1BA 1JYCA 2F2FA 3A21A 1O4ZA 1LTEA 4K20A 4Y22B 3I8TA 2DVGA 3PVNA 1CPNA 4YW2A 1EVTA 4QC4A 5CB7A 5DXDA 2R9KB 3O44A 3AP6A 4Y26A 3FGMA 2DURA 4OWLA 4ZGRB 1FV2A 1WW5A 2EALA 1FMZA 1PZZA 1W6QB 1MVEA 2ZACA 2ZGUA 1T9FA 4DFSA 2UURA 4PBPA 4FPOB 1SBFA 4QD2C 1H9WA 2PHRA 2ESUA 1FAYA 2VY0A 4XHXA 3VT0A 1V6IA 1Q04A 2WQZC 1LGNA 1GICA 3ZXFA 4YOLA 1MVQA 4LO1A 1KQRA 1H30A 1RMLA 2W39A 4A7YA 3H6RA 4YM1A 2AAIB 3M1HA 1R1ZA 2DTWA 1SZ6B 4GWMA 3A0KA 2GZBA 2BEAA 2I2SA 4RA0A 2YY1A 4LO2C 4M3CA 4YM2A 4ASMB 2WNEA 4P0KA 4UW3A 4LBMA 3WDXA 1IOAA 2Y9XE 4Y1YA 3AZYA 1QNYA 5DUWA 1JYIA 1FNYA 3O49A 1Y7BA 4NO4A 5HCFA 3INAA 3ATGA 1WCSA 1HKDA 1XHBA 1Z0HA 3H6RB 3ZXKA 3APBA 1W6OB 1APNA 1F31A 1W0OA 3OGGA 2AR6A 3JUTA 3M3CA 4FOQA 3FJJA 3UL2A 2ZGTA 3OJVA 4WBCA 4M3CB 1TWEA 1J0SA 2A70A 2ZHKA 2R16A 1RIRA 3Q7WA 1UMZA 2JDZA 1Q1UA 3WMVA 4DENA 3H6SE 1HCDA 2D7IA 3IIRA 4Y1UA 5GLUA 1MS9A 1QGLA 1WW4A 3B9UA 4TLPA 2ZMNA 2HYKA 3WCRA 3POYA 3WG2A 3B9CA 4D0ZA 4AWDA 3CA6A 3PVEA 4LBKA 3N7LA 2ARXA 4XTPA 4FP2A 4H9WA 3IN9A 1II4A 1KDKA 3OPZA 2PHUA 1VLNA 2KI6B 1XQNA 4GKXA 3NJ5A 4EKXB 5F8YA 1AFCA 3O12A 4JAWA 3B69A 1UL9A 2DUQA 1YO8A 3BIWE 1WUVA 2GNDA 2QN4A 3IM0A 2MIBA 1HWPB 1HWNB 2GALA 2AREA 1GKBA 2NMOA 3OJBA 2K8RA 2GDFA 1DIWA 2AUYA 3WG1A 2P3KA 4RL7A 3O0XA 2WSVA 4P6AA 4L4IA 3CA0A 1QU0A 1BKZA 3N3HA 2WJSA 2DRZA 1D2SA 4EFPA 4GP0A 1GLHA 2Y9WC 4XBQA 1WW7A 2D3SA 3RQ0A 5JOYA 4I4YA 1YI7A 3JU9A 3POKA 1LOBA 1LJ7A 2W08A 2JD4A 4YFWA 1V6UA 5EYXA 3WDTA 3C2UA 4Q2FA 2ARBA 3WMUA 3AJ6A 3FJHA 1Q03A 3FLTA 5T5JA 1N3QA 3LTQA 2A6ZA 1M2TB 4XMAA 1AZDA 1V6WA 2CWMA 2ZAAA 4I7IA 5BP5A 1GNHA 1DQOA 2RSTA 2UWBA 3A07A 2AYHA 2D22A 3M3EA 3BADA 4YW4A 5JOWA 2ZR1B 2ZKNA 3WO2A 5IK7A 4X37A 3WNXA 1K5UA 3P6JA 3UD7A 4IONA 1S0CA 5E24E 5CAZA 1G82A 2A6XA 1QOOA 2D23A 2LIEA 1Q8QA 1LHOA 1G9AA 1S0JA 3CQAA 4LBQD 4Z9WB 3ILNA 1N1YA 3AXEA 4OZXA 2D6LX 4HJJA 1LENA 2DRYA 3RS6A 2YUGA 1F5FA 4R9DA 1FWVA 1BFBA 1E0OA 4I30A 2W52A 3P6IA 1W3FA 2P39A 2UUSA 3ZX7A 5GLWA 2ZGMA 1Z78A 1OKQA 5JLVA 1DQGA 4K21A 1TTUA 4DPNA 5BOWA 2Z48A 1V6NA 2VW1A 5BQUA 4XMIA 4KEKA 1FX5A 4L8QA 4XFUA 1KITA 1RITA 3AZVA 4ZOTA 2GN7A 3FJAA 2ZGSA 3VEQA 4JP0A 1JQZA 1NZKA 1JW6A 1DYKA 4AGGA 3HBWA 4Y1VA 3V0AB 5CNAA 3B01A 3OYWA 3AX4A 1G9FA 4Y1ZA 1A8DA 3Q7XA 3GALA 5DZUA 5GZEA 1DFCA 4P14A 2A6WA 3ZC9A 1YTOA 3O5WB 2E6VA 2ZZJA 3AH4A 4LO7B 5GAQA 1ENRA 2DWRA 2Y9GA 1FMMS 4XJAA 1GNZA 3R4SA 1Z4SA 1VCLA 4W65A 3ZC8A 3W59A 1LODA 4GKYA 1GZ9A 3RMYA 1LGBA 1AX0A 5GLVA 5IK8A 1AVAC 4QKRA 3OY8B 4XDQA 1HCEA 3OYWB 1WLWA 3FJIA 3D4KA 3LSDA 1GZWB 1SBDA 1Q8PA 1IT0A 3POSA 2A5ZA 1CVNA 2PELA 4GOVA 4IZXA 3TAYA 3AYCA 2CTVA 1LHWA 3E8LC 4GP3A 4YGDA 5H9PA 1BASA 3FJDA 3WO4A 2D7RA 4USPA 1B09A 1ITBA 2ZGKA 3NV1A 2AH2A 5L73A 3SISA 3ASIA 3WLUA 3UJQA 2D20A 4XBLA 2EXHA 1C4RA 1YXWA 4BLJA 3VWCA 3MW2A 2BEBA 3CRHA 1AVWB 2Y9FA 3UJ4A 1HLCA 3VV1A 3T1LA 2WT0A 4K1ZA 5H9RA 3FJCA 3ZXEA 1H9PA 2JE7A 1N1TA 4UW5A 1YIFA 4DS0A 1ULGA 3T2TA 2V5YA 3ZXGA 2P3JA 4EB2B 2VH9A 4USOA 1CPMA 4XXPA 1IRPA 2D7FA 1S1AA 3BAQA 4EFRA 1TOOA 3V79C 4HANA 4X3AA 5GZCA 4OUJA 3IPVA 1OQ1A 1BFCA 2P37A 3ZXJA 4FPEA 4PF5A 2OW4A 2X2SA 1DLLA 3UD9A 2KM2A 4R9BA 1IHKA 3ZSJA 1UN1A 1W6PA 2A6YA 3AXDA 3WZ1A 3A0NA 1DQ0A 5BXSA 3P53A 3BA7A 1XYFA 1KJLA 2ZQNA 4C1WA 1JXNA 4XIKA 1GZCA 1W6NB 1M16A 3NBCA 4JRAA 1UPSA 2P34A 2ZGNA 3D7WB 3V0BB 3A22A 1G7YA 2CYFA 3VSFA 1KRIA 1QNWA 4II0A 1V6KA 1U0AA 2UWAA 3RTIB 3BODA 1JUIA 2XG3A 3F1RA 1N1VA 2V73A 4I4XA 5DVHA 3RTJB 4OEFA 2MLLB 2RHPA 4YGCA 5LK5A 3IAGC 2WKKA 3SNVA 1JT7A 2A75A 1F9KA 4UW6A 3ZYPA 2ZMLA 4YW5A 2WBCA 1UAIA 5CA6A 2ZGPA 2DU0A 1LHVA 1S0LA 2I1BA 2WRYA 2J3PA 2R49A 1LOEA 3L2YA 3CA5A 3QCWA 2DYCA 1HWOB 2IHOA 2A7AA 7I1BA 3O4AA 5IK5A 4XKIA 1GBGA 2SLIA 4JCKA 4LBQA 1NXD1 2D24A 5H9QA 2C9AA 3M2MA 3BTAA 4XZPA 1EV2A 1PUUB 3WVJA 4R6UB 4CJMA 5GLZA 1K5VA 5KXCA 1Q8OA 3UDAA 1ENSA 3MW4A 3KQRA 4ZFUB 4AYUA 1HKNA 2EXKA 4ZFWB 4YG6A 4OWJA 3T8SA 2D3PA 3OBRA 3LSEA 4EFQA 2P3IA 4U2AA 4R9CA 3HMYA 4QBCA 2A71A 1SLLA 3CA4A 1HDKA 5FNWA 1JN2P 3NV2A 2M49A 1BXHA 3SH4A 3N7KA 3ZSLA 2ZBJA 4I1EA 2E7TA 3PVOA 5D62A 2PHXA 4AN6A 3AH1A 5E8AA 2HZ9A 1PC8B 5IT6A 3I4IA 1R8NA 3IM5A 1S0IA 1HQLA 4PC4A 1DZCA 1KNMA 2EAKA 3N36A 1JLYA 3MPPG 3W58A 2CL2A 4XJUA 3FJ9A 1WBCA 3O4BA 3NBDA 3VT2A 1YF8B 4R9AA 4TYSA 4LO2A 2YZ4A 1GV9A 3I2AA 4XJZA 4YLZA 4XTMA 4XXAA 1IOBA 1DGLA 4I96A 4Q9PA 3FJFA 4LBJA 3VKFC 2ZGRA 5F8WA 3GNEA 1LOGA 3WDYA 2GMMA 1VIWB 2XOAA 4LO7C 3VT1A 4BPZA 3S8KA 1SCSA 6I1BA 4DCKC 3N0KA 1V6VA 3BAGA 3CU1B 4QKSA 1IS6A 4D8HA 1ULCA 3WA1A 3D5OA 4Y20A 4XJ9A 1QQKA 4LO8B 2C5DA 1V6JA 2NZ9A 4GXLA 1DQ5A 4KEIA 1G9DA 2LALA 4BMEA 1VAVA 2BQPA 1YBIA 2DS0A 1IKQA 1SFYA 3WDWA 4DQAA 2A3XA 2DU1A 3NV4A 2LIQA 1JT3A 4PBOA 4Y24A 4WV8A 1DQ1A 1SR4A 5EG6C 3ZSKA 4YW1A 2FGFA 1BA7A 4FPCA 4AGVA 2HWAA 1BLAA 2AQZA 2FHRA 5JMCA 4XE9A 1WLCA 4I6IA 5DSSB 1DZDA 1S0DA 3O4CA 5EWSA 1ENQA 3FJBA 5EXOA 4H04A 4MYEA 1AVXB 1IKPA 2NP0A 4XJWA 1HWMB 1ABRB 2Q3NB 4OEEA 1WLDA 3A4UA 4DRVA 1A3KA 3AP9A 4J2KA 2D1ZA 1LOFC 5DUYA 3AYDA 3LCPA 3AJYA 4ATFA 1MS8A 5DG1A 2K4AB 3AP4A 4WVVA 3FLRA 4XIOA 5F9TA 3IMNA 1IS3A 3NWKA 4OWKA 3WINA 1EYLA 1JT5A 1AVUA 3WG3A 1LECA 1ULDA 1AJKA 1I1EA 1CR7A 4YZ5A 4I8MA 2KLLA 3SLIA 1G9CA 1W3AA 4Q1PA 2ZHLA 3DGTA 4JQ0A 3I29B 2EIGA 2DVFA 3AJZA 3SH3A 3VKNA 2FFVA 1RINA 4G9NA 4FPJA 2A6VA 2Q9XA 3BX1C 5BXPA 3UJOA 1FQ9A 3IM7A 3BRGC 1PZ9A 3RRDA 3ZVXA 2KKIA 2ZMKA 3VUOA 1RG8A 1QDOA 2PHFA 2R0HA 4K1YA 3V64A 5JDBA 4LO3C 5DZFA 1TWMA 1LESA 4FPHA 1BZWA 4C1XA 4QO3A 1MS1A 1QOSA 4M01A 2JKBA 3ZXLA 5D61A 4AN7B 5T55A 4FOWA 4Z8SB 4DRRA 2JECA 2F8XC 2DVAA 2YMZA 1PWAA 4LBOA 3NBNA 2EF6A 4FOVA 4YGBA 4DEPA 3RSJA 8I1BA 1IS5A 1UZYA 2VW0A 4Z8BA 2ES3A 1KJRA 2E4MA 1PUMB 2F2FC 5DZGA 1IS4A 1SACA 1MACA 1MC9A 1GYKA 1TEIA 1FNZA 2Z42A 3VSZA 2GNMA 4YGEA 2G4IA 1MR5A 4LBLA 3USUA 1WBLA 3T1MA 3BAUA 3BAVA 1PZ8A 4JPZA 1W6MA 1QMJA 4M3CF 1V00A 3KM5A 4ISQA 4X38A 1CIWA 3PUBA 1A78A 3I2XA 1LHNA 3FUOA 5FRAA 2PHWA 2UWCA 2DTYA 1JBCA 1IJTA 3EF2A 1BYHA 4Q1RA 1AXZA 2WT2A 3KMVA 5DZEA 3UJ0A 2PHTA 1ISVA 1Q8VA 3TB0A 2SBAA 2H0BA 4KBBA 2YV8A 4G9MA 1QOTA 3AFKA 1MS5A 4GWNA 5HCAA 4J2XA 2E7QA 4LO1C 2D6NA 1JOJA 3USUB 2IWTB 1TIEA 1SBEA 5FREA 4I37A 1LCLA 1YRZA 1FN0A 4BQ1A 2HWMA 4Y22A 1V6LA 2AGSA 4FQZA 3O5SA 1LEDA 1X50A 2DUOA 5BVPI 4BOWA 4ATEA 4I4PA 2X2TA 3AJ5A 1G9BA 2VSAA 3WDUA 3QLQA 3R4UA 4D69A 5GALA 3FJEA 3WHTA 1JY0A 4TZDA 2Q5TA 3BA5A 4IYBA 1DQ4A 3FJKA 4I0YA 2VUAA 4IY9A 3WCSA 1S0GA 1SLCA 2ZHNA 4P9WA 4ISRA 1W6QA 5DUUA 4M00A 4LO0A 4EEEB 1L2HA 3VKMA 4ZA3B 5JOXA 3SNMA 3CRGA 2ZABA 3VKLA 4IHZA 1ZM1A 1P63A 4Q9GA 1JT4A 1NLSA 1N47A 1V6MA 3BRFA 1CE7B 2FDBM 1SLAA 4P9XA 4WVWA 4YZ4A 3AYAA 1S0BA 3LLPA 2ERFA 5GZDA 4UW4A 2VU9A 1MD6A 4I4OA 1C1FA 4FPYA 3AZZA 4CZSA 5JOZA 3IPVB 4ITCA 2VLCA 1LGCA 5F90A 2ERMA 1DZQA 1BFFA 2W68A 5T50A 1AXYA 4PCRA 1BARA 4F83A 3FFZA 5KXEA 3N7JA 4YG3A 5JVVA 3AZWA 3MALA 1ISXA 3QR5A 1W6PB 3FLPA 3QYDA 5EC5A 4XFSA 1GSLA 2OVUA 2GMPA 3FBYA 3WO3A 1DJSB 5DUXA 1TFMB 1ONAA 4ZXKA 3WV6A 2E51A 4XHBA 1KDMA 3U4XA 4Q91A 1W6OA 1ZA4A 3V65A 5GZGA 2LTNA 1JTCA 3BAHA 2VSEA 5GJ6A 5KXDA 2DV9A 4AVSA 2VXRA 1OFSA 1WW6A 2R1BA 3M3OA 4GAFA 4KEJA 31BIA 1FYUA 1WBFA 5AVAA 2KH2A 3AP7A 5HCBA 1DBNA 5FZZA 4J23B 4FOYA 1R8OA 1CN1A 1LHUA 3PHZA 1LU1A 3CA3A 1SLTA 2ZGOA 3K1XA 2D6KA 3SITA 2OUHA 2MC2A 5GM0A 1FWUA 4GOYA 1BFGA 2GN3A 2ZA9A 2EXJA 4FQ4A 3B00A 1MZ6A 3DUIA 2P2KA 1TP0A 2A3WA 2B7YA 4YM3A 4LBQB 1ISYA 1ONKB 4HA2A 1LU2A 4YZ2A 2E53A 3UD8A 5BP5C 1GANA 3JRRA 1SR4C 2DUPA 3AKGA 3PJQA 4Q8LA 4M3CE 3OJ2A 1AXMA 4QALA 4Y1XA 3W9TA 1DQ2A 4ZFYB 4XFTA 4YZ3A 2FO1A 1VALA 4I2SA 1Q8SA 1UKGA 1T4QA 4H55A 4XILA 3OGFA 4AGRA 2JJ6A 4JKQA 4WZFA 1FATA 1ULEA 4I4UA 4L4HA 3ZSMA 3NBEA 4BMBA 1QF3A 1S0EA 1RY7A 3AP5A 4FPKA 1QXMA 2L5XA 1EPWA 1DFQA 2ZHMA 2GO2A 4JC1A 2WT1A 3O3QA 5BXTA 5T5PA 4QD2B 2ZGLA 2CY6A 3R05A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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