3FUOA

The crystal structure of receptor binding domain of botulinum neurotoxin serotype a
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
421
structure length
416
Chain Sequence
TSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSLGCSWEFIPVDDGWGERPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Glycosylated SV2 and gangliosides as dual receptors for botulinum neurotoxin serotype F
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
total genus 105
structure length 416
sequence length 421
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2009-01-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3fuoA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3fuoA02
1KJLA 4X38A 4LO0C 4LO1C 2MLLB 2ZACA 3WMUA 2PHTA 5BXTA 2CWSA 5L73A 2JD4A 4YW3A 4USOA 2ZA9A 2JE9A 1IS5A 3WG3A 2R0FA 2C5DA 2E6VA 1YTOA 2H0BA 1ULGA 5GLUA 4Q1PA 4XOGA 2DWRA 4LO8B 2HYKA 2VY0A 4EFPA 1SR4A 1LGBA 1BXHA 4HA2A 4X37A 1BFCA 3AYEA 3V0AB 3VT0A 4DCKC 4XFUA 3AH2A 2KM2A 2LALA 2P39A 1M16A 3ASIA 4II0A 1DZCA 1CJPA 4ISRA 3ZXEA 4AVVA 2VW2A 3CA1A 4K21A 1JT4A 3IAGC 1AXMA 3WZ1A 3L2YA 2D6LX 4XHXA 2KLLA 1W3GA 3BOPA 1JHNA 1VCLA 4P9XA 5DVHA 2RHPA 1LJ7A 4D69A 1ITBA 1LHVA 1CIWA 1MS1A 5DG2A 1JT5A 3D6EA 1F31A 3ZPYA 2HWAA 1HKNA 1S0IA 1PZ8A 1AZDA 1K5VA 4XBLA 5H9QA 4FP3A 1DQ2A 4I4YA 2JECA 3T2TA 2HW9A 1JLXA 2A3YA 3OJBA 1WBAA 2IHOA 3HSMA 1DQ0A 1WBCA 2YROA 1Z2VA 4TLPA 4EKXB 2ZMKA 3AYAA 1ISZA 1Q8VA 3W58A 3ZSMA 3UL2A 5JOXA 4Y1YA 3IPVB 1SACA 3HALA 1OKQA 3AZVA 1YXWA 3CA4A 4FOYA 3FJCA 4Q9GA 2ERFA 1QMJA 4ZKTB 1TWMA 4I4XA 3BAGA 1BYHA 1NUNA 3TAYA 2UU8A 3OYWB 4C1XA 3POKA 2NTDA 1JN2P 3WG2A 3AKGA 3CA6A 4DRRA 2Z49A 2ERMA 4H04A 1GZCA 1H9WA 1AX2A 4LO7C 4KC3A 1A3KA 3BRFA 3V0BA 4AVTA 4LBLA 3V79C 4GWMA 1HIBA 1BFFA 4XBQA 5KXCA 4ZFWB 5EWSA 3IN9A 2GMMA 1BKZA 1LU2A 1PZZA 3VKMA 2D24A 1N3QA 2Q9XA 1LU1A 3B69A 5HCFA 3NV3A 2Z42A 3MW4A 5T54A 3VSFA 2GMPA 4I4UA 2ZGSA 3OY8A 1GSLA 4OEFA 1S1AA 1AVAC 3I2XA 2A3WA 5GLWA 2WT0A 4WZFA 1W6QA 3UK9A 1GLHA 2DVDA 4UW6A 5EG6C 2OUHA 1QKQA 1Z78A 4GKXA 4QD2C 3JRRA 1LENA 1LOFC 5GAQA 1H30A 4FPLA 5BVPI 2WKKA 3CA5A 1D0HA 2YV8A 3AP6A 4PCRA 1BLDA 3WDVA 4XJ9A 1NXD1 2D7FA 1IRPA 3IM0A 2ZMNA 2R1BA 1GYKA 1SLLA 2JDZA 31BIA 3CRIA 3AKFA 1S0EA 4GXLA 2WBCA 4BPZA 2A75A 4FPEA 1SCSA 1VAMA 2Y9GA 4YFWA 1AJKA 3USUA 5GM0A 4YM3A 4WVVA 5KXEA 2ZABA 1IS3A 2EALA 1AXZA 2VLCA 4FGFA 3HN1A 1DBNA 2W68A 1LHNA 1JLYA 1BFBA 4M3CA 4Y24A 4I3NA 1FNYA 3T1LA 5BP5C 5T50A 3QR5A 4Q8KA 4XHBA 4DS0A 2GNDA 1MD6A 1N4KA 2YUGA 2AREA 4I2SA 1G7YA 1HWMB 2NYYA 4GOVA 1FN0A 4GAIA 3AP9A 2VU9A 4D8HA 2M49A 4J23B 2DREA 1DLLA 1LODA 4I4OA 3A22A 3ZSJA 2WRYA 1PZ9A 4Y22A 1SBFA 4FPKA 6I1BA 1FV3A 3NV1A 4UW4A 4JC1A 2P23A 2NMNA 1V00A 5BXPA 2PHWA 4OEEA 3NBNA 4I4QA 3I8TA 1FMZA 1GZWA 1I3HA 3NJ5A 4J2SA 5E88A 4U2AA 1MC9A 4RA0A 4M3CB 4YGBA 3CU1B 3N7LA 4Y1VA 1ISWA 2VSAA 3FJKA 5EYYA 3WDXA 3AP7A 5BYNA 5IK5A 5JMCA 3WCRA 4LBQD 1G82A 4FOVA 4Q26A 2LIEA 2PHFA 5SV8A 3CQAA 5JDBA 1DGLA 3EF2A 4A7KA 1W3AA 4I4VA 3VKNA 1SLTA 2DU1A 1XQNA 4P9WA 3D5OA 2FDBM 4FOWA 1Q03A 4F83A 1HCDA 1CPMA 3O0XA 3B00A 1S0GA 3VWCA 2LIQA 1KITA 4Y26A 3K1XA 4JCKA 1TP0A 5E8AA 5LK5A 2E4MA 4P0KA 1GZWB 41BIA 5DSSB 1W3FA 1W6OA 4CTEA 4G1RA 2Y9XE 1AXYA 2CYFA 1G86A 3WO2A 3WDUA 4ZLBB 4XXPA 1TFMB 4DFSA 4LO2A 1R8NA 3I2AA 4K20A 4IZXA 5FZZA 3PHZA 4IHZA 5FNWA 1WD4A 4PC4A 1NZKA 3FJHA 4K1YA 2NVHA 1V6UA 2QYIB 1YI7A 3O5SA 2D43A 1BARA 1JT3A 2P3JA 3CA3A 1AF9A 4YW5A 1VLNA 4LO0A 4LO1A 4KEKA 3AZZA 2P3KA 1EYLA 1JY0A 4YG6A 3O49A 3CNAA 4CRQA 3HOMA 1RG8A 2AR6A 4X3AA 2K43A 3JUUA 3AP4A 3SNVA 3ZC8A 1W6OB 3AYCA 1QOTA 2Q3NB 1ISYA 1WD3A 2D44A 4OZXA 4QKRA 3ZVXA 3FJ8A 1DIWA 2D3PA 2GNTA 5B2HA 4HANA 2EAKA 4LBOA 1IS6A 3AZXA 3ILNA 4C1WA 3BAVA 2DV9A 1N1YA 1QOOA 2WT1A 3WDTA 1FAYA 2DRZA 3BIWE 1DQOA 1MS9A 4IQPA 4P14A 4QC4A 5FZUA 3RSJA 4FPOB 2BEBA 3WA1A 3OBRA 3BRDA 4Y20A 4OUJA 2NMOA 3M3EA 1LCLA 1WLWA 1AJOA 1IT0A 5F8SA 4QBCA 3KMVA 4XMIA 4GOYA 1TOOA 4OWKA 4R9DA 5EYXA 4EB2B 1KNMA 4YG0A 4QBVA 2RG9B 2DVBA 1LTEA 4BOWA 2GNBA 3FGMA 4I6IA 1C1FA 1MS8A 1BASA 3BA7A 1HLCA 1WW6A 4ISQA 1WW7A 2ZHLA 3AZYA 1UL9A 5T5PA 5JOYA 2ZQNA 2DVAA 4YW1A 3FJAA 4FQ4A 1Q8PA 2DRYA 1AFCA 1UZZA 2W39A 4I7IA 3NWKA 3APBA 4Y20B 3POYA 2HZ9A 4D0TA 1TWEA 4AN6A 4M3CE 1I1BA 2F2FC 2K4AB 3R4SA 3KQRA 1AVUA 2BQPA 1LECA 3BAHA 4I1EA 4YZ4A 1ULCA 3IM5A 2F8XC 3RS6A 4GA9A 1ENSA 5E24E 4JPZA 2GMEA 2IWTB 1N47A 3PVNA 1IHKA 1U0AA 3VV1A 1RINA 3T8SA 4KEJA 4DQAA 1LOEA 4K1ZA 1QNYA 3NBDA 5F8YA 3N0KA 4EFQA 1TIEA 3H6RA 2TEPA 3POWA 5GZGA 1HCEA 4AVSA 1CESA 4XYXA 3WCSA 3WNXA 2ZGQA 2D7IA 4Q2FA 4FPYA 2A3XA 2ZHNA 1DZQA 4YZ5A 5FRAA 4ZBVB 2ZBJA 1XHBA 1S0DA 3FJIA 4Q91A 3ZXJA 4BM8A 4P0JA 1F9KA 1LOFA 3ZXLA 4I30A 4YZ2A 1TEIA 1S0CA 2Q5TA 5DZEA 2OW4A 3PVEA 4UW5A 4Y1ZA 4WV8A 4I4PA 4Q1RA 5H9SA 5DUYA 1LGCA 2BEAA 2A6ZA 2DUOA 1HWNB 3M3OA 3N7MA 1H9PA 4YGCA 2J3PA 5EC5A 3IM6A 4XJZA 3H6RB 1DJSB 2WNEA 1JQZA 3OGGA 2KI6B 2HWMA 2YZ4A 4YM1A 1S0FA 1MZ6A 1M2TB 4FQZA 1V6LA 1KJRA 5GALA 2LTNA 1S0BA 4YGDA 4P6AA 2DVFA 3M3QA 4FPFA 1ONAA 2D20A 1YO8A 2EXKA 1A78A 4KBBA 2UWBA 5I1BA 2R1DA 3PG0A 2OVUA 3WHTA 5BP5A 1UMZA 4H55A 2ZAAA 3QCWA 5IK4A 2EIGA 2D6MA 1N1VA 1BJQA 2P34A 1SLBA 1CVSA 4XILA 5CB7A 1QXMA 2AQZA 1LHWA 5GLZA 1LHUA 4GP3A 3V0BB 3A0NA 2WQZC 4LBJA 1V6VA 3SISA 1Z4SA 1FATA 2ZKNA 3WO3A 4R9CA 1ENQA 4XJ8A 4IZEA 4LBMA 3O4BA 4XIKA 3B9UA 4Z9WB 1SBEA 1QF3A 1MS0A 4XE9A 3O12A 1ULDA 1C4RA 1QNWA 1GBGA 1Q1UA 4I37A 3PJQA 3O4OA 5DUXA 4I8MA 1PC8B 4R9BA 4XMAA 1ILR1 1FNZA 5HCAA 4PQ9A 4GP0A 3AK0A 2ZGUA 3MEPA 3OY8B 3AJYA 3R05A 4FPGA 4FPCA 3TB0A 2D6PA 1W6QB 5F5QA 1GV9A 4BLJA 4R6UB 1GGPB 3AJZA 1GICA 5GZEA 5T5JA 4FPJA 4Q9PA 5IK7A 4KEIA 3WHUA 2JKBA 3BA4A 3C9ZA 4AGRA 3O4DA 3SNMA 4EFRA 3UJQA 5JLVA 3F1RA 5GLVA 3FLTA 4L4HA 1R1ZA 4ATFA 1JYIA 5BXSA 4H9WA 3N7KA 2DURA 2D1ZA 4YOLA 4XKIA 1CQ9A 4XTPA 4SLIA 3VUOA 3AXEA 3DUIA 4OWLA 4ZFUB 1DZDA 2QN4A 1HDKA 2CL2A 4JQ0A 3IMNA 3RTJB 1UX6A 3ENRA 5KXDA 3H0OA 5D61A 4ZXKA 1GZ9A 5JOZA 4G9MA 5DZFA 4A7ZA 4FVVA 1Y7BA 3USUB 3O0WA 3ZXFA 1SLIA 3POSA 4ATEA 3R4UA 3PUBA 4FPHA 5DUWA 2BFHA 1ENRA 2JE7A 2SLIA 1W6NA 2PELA 3BA5A 3MALA 3ATGA 1DQGA 2UUSA 2CWMA 3F62B 4G9NA 1JW6A 3I4IA 2GO2A 3AH4A 1MZ5A 5BQUC 5CBLA 4I96A 1EV2A 3AYDA 1P63A 3UD9A 1FGAA 4U36A 1FYUA 1MS5A 2A6XA 3H6QA 1DQ4A 4IONA 4I4SA 4YG3A 1FMMS 2A6WA 3SH4A 3SLIA 1MR5A 1ISXA 3OJ2A 1DFCA 4Z8SB 4BMBA 2Y9WC 4PBOA 1LOCA 1V6XA 4Y22B 1IKPA 4GWNA 3AKIA 2GN3A 4IY8A 4ZA3B 2AENA 3ZC9A 3FUOA 3WINC 3V64A 5HCBA 4R9AA 1W6NB 3Q7XA 3IKWA 2CTVA 2A70A 1SFYA 2GALA 1CN1A 1RY7A 1EVTA 3FLPA 2E7TA 1FQ9A 3VT2A 1URXA 2AGSA 3PVOA 5FREA 3QYDA 3GALA 5G00A 2RSTA 3W9TA 1Q8SA 1LOAA 3AX4A 1GKBA 2GZBA 5KXBA 4OWJA 5T5OA 3N36A 1HQLA 1I1EA 2VW1A 4J2YA 2V5YA 1AVBA 3ZX7A 4YM2A 1VALA 4JAWA 4XZPA 1YYNA 3OGFA 3VT1A 3H6SE 3ZXKA 4G6MA 1YBIA 4YGEA 3O4AA 4CJMA 3INAA 2W52A 1IILA 1SLAA 5GZDA 5T55A 1UZYA 2EXJA 1D2SA 1UKGA 3V65A 4YZ1A 3BODA 1BA7A 1TTUA 2AAIB 1ONKB 3ZYPA 5GZCA 5EHAA 3BX1C 1RZOB 1MACA 2ZGKA 3VKLA 1WBFA 5DG1A 1AVWB 3AKHA 3M3CA 2DUPA 1G9CA 2RQ9A 2VH9A 21BIA 1O4ZA 2F2FA 3OJVA 1CE7B 1KDKA 2PHRA 1IS4A 1MVQA 1EPWA 1DQ1A 3QLQA 4XFSA 4YLZA 4FOQA 3HBWA 1C1LA 2ET2A 4ENDA 2SBAA 1XG6A 4NO4A 1VAVA 1R8OA 5DUUA 3ILFA 1WW4A 2NN8A 2AUYA 5IT6A 4G6JA 3AH1A 1CONA 2D6KA 1ULFA 3Q9OA 1LEMA 1V6OA 5F90A 4YZ3A 2FMDA 1RMLA 2NZ9A 3ZXDA 2P37A 2AFGA 4JRAA 2D3RA 3V0AA 2DUQA 3BAQA 2W08A 3RG0A 3MW2A 4JKQA 4Q8LA 1MVEA 3ZSKA 1DQ5A 3LSDA 2EXHA 1PZ7A 1HKDA 1DYPA 3U4XA 2DU0A 4LO3C 1V6KA 4MYEA 4HR6C 1T9FA 1LESA 4Y1XA 3MW3A 2D23A 1OQLB 2ZR1B 3WLUA 3D7WB 1LGNA 4J2XA 5AVAA 3UD8A 4XJWA 2Y9FA 1KQRA 5DZUA 3DGTA 2ZGTA 1CVNA 3FLRA 1KRIA 5E89A 4TZDA 2VSEA 1X50A 4Q27A 1K5UA 4JP0A 3FJFA 4OEGA 4ITCA 4UW3A 3IPVA 5BOWA 4ASMB 1V6IA 3T1MA 3AZWA 1MS3A 3RRDA 4ZOTA 4AWDA 2UWCA 3C2UA 1XYFA 2GDFA 2JJ6A 4F34A 4XIOA 4QKSA 3OYWA 2DS0A 4LO7B 1N3OA 2P2KA 4WVWA 2ESUA 3WUCA 4P0LA 3S8JA 4M3CF 4AGGA 2GNMA 3LSEA 3JUTA 2A7AA 1VIWB 4Y1UA 2L5XA 4XXAA 2R16A 2KI4A 2G4IA 4P9YA 3BAUA 1N1TA 1WCSA 2E51A 3CRGA 1IRAX 1JOJA 1G9BA 5CA6A 3AP5A 2GN7A 2D3SA 4X39A 1QQKA 2DYCA 3P53A 1WUVA 5D63A 3A21A 1HQWA 1YF8B 1HWPB 3A23A 1HWOB 1SR4C 5GZFA 1QQLA 3ILRA 1FWVA 3CRHA 1LHOA 1O4YA 1FX5A 4QD2B 2NM1A 3FBYA 1QGLA 3WDWA 3Q7YA 4D0ZA 4L4IA 3ILAA 1A8DA 1WBLA 1G9AA 1G8WA 4I0YA 3A07A 3VKFC 2WT2A 4WBCA 2VXTI 1LOGA 3WDYA 4OW4A 2MIBA 4HL0A 1KDMA 1W0OA 4FP2A 5FNXA 3LLPA 3FFZA 1DHKB 4GKYA 3HMYA 1J0SA 3M2MA 1AX0A 1V6MA 1G9FA 2XG3A 5FZYA 2AYHA 4ZFYB 1DFQA 2X2TA 3ZYRA 3UJ0A 1LEDA 2ZHKA 4DRVA 1PUUB 4BQ1A 4W65A 4JKXB 4LBNA 1SBDA 3FUQA 4BMEA 3O5WB 2YMZA 1S0JA 1JT7A 1JTCA 3BRGC 3N7JA 3WOGA 1IKQA 2ZGLA 3NV4A 1J1TA 1W6PA 3FJEA 1Q8QA 1AXKA 1QU0A 4BLIA 1BQPA 1ULEA 3IM7A 5BQUA 1Q8OA 2OUJA 3TC2A 2V73A 3S8KA 2KKIA 2MC2A 3FJJA 5F8WA 4J2KA 4YM0A 3O0VA 4TYSA 4YW4A 3AXDA 1GNHA 4Z8BA 3BB2A 1JUIA 1LOBA 3M1HA 2I1BA 2Z48A 2X2SA 3OJMA 2EXIA 3VSZA 2FGFA 3B01A 1Q56A 1E0OA 2C9AA 3RMYA 3AJ6A 3A0KA 3P6JA 1G9DA 5DUVA 2FFVA 5GLTA 3FJBA 4RL7A 3WINA 1IJTA 3ZXGA 3P6IA 3GNEA 1W0PA 1JBCA 4AYUA 1LULA 4XTMA 1W6PB 2I2SA 1QDOA 2ES3A 1T4QA 1II4A 2E7QA 4DENA 3LTQA 1Z0HA 2DVGA 3MPPG 3UJOA 3NV2A 1V6NA 3UJ4A 8I1BA 1QDCA 1AVXB 2FHRA 1ZM1A 4YFZA 3RQ0A 3WG4A 4XJUA 2YXSA 5CNAA 1L2HA 2A6VA 5T52A 5H9PA 5JVVA 2AXMA 1F5FA 2ZGOA 2D22A 2ZGPA 4IYBA 3JU9A 3WO4A 2PHXA 2FFUA 4CZSA 2UWAA 1B09A 3B9CA 4EEEB 4QO3A 4DEPA 1ABRB 4LBQA 1CR7A 2CY6A 1V6JA 2D6OX 2VW0A 1NLSA 1GNZA 2YY1A 3PMEA 2ZHMA 2KH2A 5BXRA 2ZQOA 4XJAA 3UDAA 4LBKA 3NBEA 5DXDA 3WMVA 2WSUA 3VEQA 2VUAA 4NOTA 3OBTA 1OFSA 3FJ9A 4ZGRB 1DQ6A 4YW2A 2WLQA 1SLCA 3SITA 4A7YA 1YIFA 1ZA4A 2ZGNA 2E53A 2A71A 9ILBA 4XBNA 3UD7A 1FV2A 4LBQB 1WLDA 1BZWA 1N1SA 1MS4A 2XB6C 2ZZJA 4HJJA 2NP0A 3WUDA 2ARXA 3KM5A 3HR9A 3SH5A 1DYKA 3CA0A 1W6MA 2ZGMA 4PBPA 3BADA 1ISVA 3D4KA 2K8RA 1S0LA 2VXRA 3IIRA 4M00A 5IK8A 1V6WA 3N3HA 3B3QE 4GALA 1BLAA 1C57A 1Q04A 2WSVA 4M01A 3O3QA 5D62A 3A4UA 3RMXA 5H9RA 4AN7B 4LO3A 4I4RA 2R49A 2D6NA 5CAZA 4L8QA 1JXNA 5IUQA 3BTAA 4DPNA 1N3PA 1IOBA 5JOWA 1XZZA 1AX1A 3WVJA 2AH2A 1OQ1A 2EF6A 3N35A 5F9TA 2ARBA 1WLCA 4AGVA 1W6MB 3NBCA 2R0HA 2FO1A 5T5LA 1IOAA 3AJ5A 3FJDA 2CNAA 1RIRA 7I1BA 2DTYA 4XDQA 4I1BA 1SCRA 3O4CA 4USPA 4PF5A 2E4MC 2XOAA 2WJSA 1GANA 1CPNA 3SH3A 4GAFA 3VKOA 4XFTA 1BFGA 3RTIB 1UAIA 3CAHA 1APNA 2ZMLA 3Q7WA 1FWUA 1UN1A 4IY9A 3BAOA 1JYCA 2B7YA 2ENRA 1QOSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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