3FUQA

Glycosylated sv2 and gangliosides as dual receptors for botulinum neurotoxin serotype f
Total Genus 101

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
411
structure length
399
Chain Sequence
DNSILDMRYENNKFIDISGYGSNISINGDVYIYSTNRNQFGIYSSKPSEVNIAQNNDIIYNGRYQNFSISFWVRIPKYFNKVNLNNEYTIIDCIRNNNSGWKISLNYNKIIWTLQDTAGNNQKLVFNYTQMISISDYINKWIFVTITNNRLGNSRIYINGNLIDEKSISNLGDIHVSDNILFKIVGCNDTRYVGIRYFKVFDTELGKTEIETLYSDEPDPSILKDFWGNYLLYNKRYYLLNLLRTDKSITQNSNFLNINQQRGVYQKPNIFSNTRLYTGVEVIIRKNNTDNFVRKNDLAYINVVDRDVEYRLYADISIAKPEKIIKLIRTLGQIIVMDSIGNNCTMNFQNNNGGNIGLLGFHSNNLVASSWYYNNIRKNTSSNGCFWSFISKEHGWQEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
publication title Glycosylated SV2 and gangliosides as dual receptors for botulinum neurotoxin serotype F
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/F (Neurotoxin type F)
total genus 101
structure length 399
sequence length 411
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2009-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3fuqA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3fuqA02
1FWVA 3M3QA 1N3PA 2L5XA 3O0WA 2PHTA 2CYFA 1OKQA 1C4RA 1Y7BA 4ISRA 5CBLA 1SZ6B 3OBRA 4DENA 4AGRA 3WOGA 4QBCA 1V6LA 4FPOB 2W68A 3HMYA 2NYYA 4YFZA 3AP4A 4LO2C 2JJ6A 3OJBA 4XIKA 3Q7YA 3VSFA 1XQNA 3ZSJA 1BZWA 2AENA 4I4QA 3ILNA 3VT0A 3ZXKA 3CRIA 5E8AA 3USUA 1QQKA 3WO4A 3VT2A 2GZBA 5JVVA 1WBCA 4R6UB 2D6LX 2D7IA 1W6OB 1AVXB 1A78A 3H6SE 4JAWA 3OJVA 4L8QA 3FUQA 1JLXA 4LBMA 3TC2A 4YM2A 1MZ6A 2NTDA 1N3QA 2ZMLA 1AXZA 1DQOA 3D5OA 5F8WA 3MEPA 2R16A 3AYDA 1ENQA 4BOWA 4U2AA 3FLRA 3A4UA 3POSA 1LU2A 3LCPA 4XDQA 1JBCA 1AJKA 1G9AA 3WHTA 1TWMA 4MYEA 2A6WA 3H6RA 5F8SA 3AXEA 1UZYA 1VCLA 4G9NA 3BRGC 2TEPA 2IWTB 1CPMA 3BAGA 1V6KA 1K5UA 1GZWA 1DFQA 4ZKTB 2YROA 5KXDA 5G00A 4PQ9A 1C57A 1YYNA 3Q9OA 3HALA 3WVJA 4XMAA 1LOCA 1JTCA 1LECA 5T52A 4D0TA 1ITBA 1RMLA 4XJUA 5BP5C 7I1BA 2ZHLA 4ISQA 3VEQA 1G9DA 4OEGA 1FAYA 2CWMA 3OYWA 1Q04A 3Q7WA 1SFYA 3FGMA 2LTNA 3FFZA 3KM5A 2Q5TA 4FVVA 3BAHA 1DGLA 4Y20B 4JRAA 4XMIA 1V6VA 3IPVB 41BIA 3POWA 2V5YA 1GNHA 3GALA 1KNMA 1G8WA 1W6NB 4XBQA 1ONKB 1K5VA 2A3XA 3SH3A 5BXPA 1TEIA 2ZHNA 4I4UA 3AKHA 2A3WA 3CA4A 4X38A 2C9AA 1DQ4A 2RSTA 3WDXA 1Z2VA 4BMEA 1S1AA 1CE7B 3RMYA 2GNBA 1Q8QA 2QYIB 2DWRA 3B3QE 3E8LC 2Y9WC 3FJIA 3T1MA 1IS3A 5DSSB 8I1BA 1HKDA 2XG3A 4Q1RA 5E88A 4G6MA 2NN8A 1GKBA 4XJZA 4I37A 2BQPA 1KRIA 2E6VA 2BEAA 1DQ2A 3I2XA 3ZVXA 4FOWA 4JKXB 2GMMA 1YXWA 3ZC8A 1YRZA 4YM3A 2P39A 2OVUA 3OGGA 3IMNA 5DZUA 4HA2A 5KXEA 3WO3A 3AZWA 2ERFA 5GAQA 2JE9A 1JN2P 1OFSA 1WBFA 1SBFA 3HBWA 2E53A 3OBTA 3IIRA 3M1HA 1N3OA 3AP7A 3AH1A 3O5WB 4Y24A 2FFVA 3BA5A 5BP5A 4K1ZA 2WLQA 1N47A 4IQPA 2D3PA 3JRRA 1Q8VA 3O4CA 3BTAA 3AJ5A 3AKFA 1QDOA 1V6OA 3MW3A 1V6WA 2VUAA 4I8MA 4XXAA 1R1ZA 1ONAA 1PUMB 1BJQA 4GA9A 1JYCA 3N36A 4FPKA 1WLWA 4EEEB 4P6AA 4IHZA 2WSUA 3USUB 2Q9XA 1W3FA 2GNMA 4K21A 1YO8A 3OJMA 2DRZA 4KEKA 3APBA 4I7IA 2R0FA 1QOSA 4TZDA 3PMEA 3Q7XA 2D3SA 1BFCA 3I2AA 5JLVA 2JE7A 1G82A 3O4AA 1N1YA 2CWSA 4Y1UA 4A7KA 4YG6A 3AP6A 2ET2A 4IZXA 3CA5A 1W6QA 3AJYA 4UW3A 1F9KA 3IN9A 4GAFA 4I4SA 4YW5A 1C1LA 3VWCA 1Q03A 1AZDA 1FV2A 2P3KA 2B7YA 2PELA 1TFMB 5GLWA 2GALA 1FMZA 4FP2A 3FJJA 4TLPA 2UUSA 4OWLA 4GOYA 3RTJB 2P37A 1H30A 2WRYA 2ZHKA 4Q8LA 3SISA 3ZYRA 4M3CA 2E51A 3QYDA 4I3NA 3H6RB 1QOOA 3NV1A 4A7ZA 4NO4A 4Z9WB 1GANA 1I1BA 1WBLA 3WLUA 5LK5A 4GKYA 1MD6A 4LBQA 3UD8A 4Y1VA 2X2TA 4AVTA 5GALA 2R9KB 1BARA 4R9AA 4YOLA 4DCKC 3P53A 3RTIB 5DUWA 1J1TA 1HCEA 2D22A 3BOPA 5EG6C 3ZC9A 3H0OA 1VIWB 3O4BA 3BX1C 2AYHA 1EV2A 4ASMB 1FGAA 2JD4A 1KDMA 1KJLA 3IPVA 4CTEA 3UL2A 2V73A 3OYWB 4ZFWB 3O5SA 4C1XA 3MPPG 3A23A 5CB7A 4YG0A 3RG0A 4P0KA 3BAQA 4ZA3B 1FWUA 3O49A 3T1LA 4QD2B 4GALA 4Q9GA 2PHUA 1W3GA 5DZEA 1RITA 1LGCA 4FOYA 2P3JA 4XTMA 3SNVA 1N4KA 3BB2A 4AN7B 4CZSA 1HWPB 5T5PA 1ENRA 1JY0A 3WDWA 3VKFC 2FFUA 1JXNA 4YZ2A 3VKNA 1DYKA 3ILRA 5IK4A 5H9SA 1L2HA 2DURA 1ISZA 5T50A 4Q9PA 4L4IA 2AGSA 3N7MA 1UKGA 3VKOA 4J23B 1SCSA 4LO3A 2DRYA 4H04A 4I4PA 2GMPA 5BXSA 4ATFA 1DLLA 4K20A 3ZXFA 1ZA4A 4YFWA 1CN1A 5JOYA 1UAIA 3IM7A 3P6JA 5DG1A 3BIWE 4BLJA 1AFCA 1WD4A 2PHXA 5EYXA 3UDAA 2IHOA 1N1VA 5DG2A 5EC5A 2P3IA 4WZFA 5E89A 2D20A 1LJ7A 3SH5A 1B09A 1SLIA 3HN1A 1R8OA 1U0AA 1HDKA 1NLSA 5DVHA 1LU1A 2ES3A 3N7KA 2KH2A 4OWKA 4LBKA 1AVUA 5HCAA 3NWKA 4X37A 5EXOA 1NUNA 1ULDA 2UU8A 3O3QA 2R1DA 2NZ9A 3CQAA 3FJFA 4YZ1A 1H9PA 2YMZA 4QD2C 4YGEA 3FJBA 2D24A 1CVSA 1ISWA 1G86A 3BA4A 5EWSA 2CL2A 3ZXDA 1QDCA 1AVWB 4GP3A 4Q91A 3N7LA 3I29B 2ZHMA 4ZOTA 3UD7A 4BM8A 2F2FA 3VT1A 5T5LA 1BLAA 1BLDA 1DBNA 4YZ5A 1NZKA 4P9XA 1AX0A 3M3EA 2E4MA 1BA7A 1IS4A 2F8XC 5SV8A 1MS4A 2DUOA 4I30A 1UX6A 4XJAA 3FJHA 2E7TA 1WCSA 1AVBA 2CY6A 1W6QB 1F5FA 3ATGA 1OQ1A 3INAA 2I1BA 4H55A 3WG2A 1TWEA 1MVEA 4Q26A 2ZGLA 1TP0A 1SLBA 4R9CA 1IT0A 2CNAA 3WMUA 1D0HA 4P0JA 5F90A 1DZCA 1A8DA 3BA7A 4I6IA 1QU0A 2ZMNA 1PZ7A 3GNEA 4M3CB 1AXYA 4M01A 2UWBA 2VW2A 3FJ8A 2ZMKA 4JC1A 1RIRA 1Z78A 1IRAX 4IY8A 2EAKA 4QALA 4ITCA 4Y26A 1I3HA 1XZZA 1FN0A 4G1RA 4LBQB 5FNWA 1N1SA 4YW1A 1WW5A 1BQPA 1HWOB 4U36A 4LBJA 3FJ9A 4XIOA 1MR5A 1G9BA 3WUCA 1IRPA 4PC4A 2ENRA 1V6XA 1CONA 2EXKA 1VAVA 3WDYA 5BXRA 4D0ZA 1XG6A 1HKNA 5FZUA 3M3CA 4TYSA 5KXCA 4AVVA 5CNAA 3CRGA 2YV8A 4KBBA 2D44A 3HR9A 1XHBA 2AQZA 2BFHA 3NV4A 3VSZA 1Q8SA 1C1FA 2K8RA 1PZ9A 2AR6A 2ZA9A 1LOFA 1MC9A 31BIA 3PHZA 2FDBM 1JT5A 4AVSA 4M00A 1LGNA 1FV3A 3WG3A 5DZFA 2ARBA 1GGPB 3POYA 4SLIA 1MS1A 4XHXA 2LALA 2OUJA 1SACA 2P34A 4IY9A 4UW6A 5FREA 3ZSKA 1S0EA 3FBYA 1MZ5A 2Z49A 2D43A 4FGFA 4XKIA 2P2KA 3SLIA 1BYHA 5T5JA 3CNAA 1KJRA 1LHWA 4LO1A 1Q1UA 1DQ5A 1JT3A 5DUXA 2FMDA 2H0BA 4PF5A 5I1BA 2PHWA 5JDBA 5HCBA 1IKQA 1HQWA 3W9TA 2VW0A 1UZZA 1QOTA 1R8NA 1N1TA 3AP9A 1RZOB 4LBLA 5DUUA 2A6YA 2A75A 3C9ZA 3H6QA 1Z4SA 5D61A 5H9RA 5T55A 2D3RA 2W39A 2J3PA 1W0OA 1WW7A 2EXIA 3EF2A 1SLAA 3CA6A 2ZR1B 3IM6A 4KEIA 1GLHA 4FOQA 3VUOA 2DVGA 5GZEA 1JUIA 1SR4C 1WUVA 3PJQA 2AAIB 1EVTA 5BYNA 1QQLA 4AN6A 1O4ZA 1GBGA 5JOZA 2ZGMA 1LCLA 1QKQA 3WZ1A 1DJSB 1LHUA 1CVNA 3OGFA 2DVBA 3O0XA 3NBEA 3CA1A 4YM1A 4YW4A 1APNA 2DS0A 1YTOA 1LHVA 3I4IA 2FO1A 1V6MA 1Q56A 4YW2A 4YM0A 4I0YA 2KI4A 4EFPA 2XOAA 2FGFA 4JQ0A 4Q1PA 1V6NA 2EIGA 3R05A 3AZXA 1JW6A 2ZGOA 2JDZA 5F9TA 3A0KA 5EYYA 4F83A 3QCWA 2LIEA 3WINA 3MW4A 4HJJA 1IILA 5IK8A 2D6NA 3M2MA 4LO3C 1LOBA 1AXMA 5EHAA 2AREA 3ZXEA 4LO7C 5DUVA 5CA6A 1BFFA 2AXMA 2EF6A 1VAMA 5IUQA 4HL0A 1CPNA 1HQLA 4YG3A 3BODA 3FJKA 2KM2A 3WDTA 2DTYA 1AF9A 4XILA 4Z8SB 5H9PA 1UL9A 1BXHA 3B01A 4YGDA 4BPZA 1JLYA 3UJ0A 1QF3A 5T5OA 1FYUA 3QR5A 3WNXA 4PCRA 3IM0A 3F1RA 4C1WA 3V79C 3FJDA 2UWAA 3ENRA 3WCRA 5HCFA 2HYKA 2ZGPA 4Y22A 1X50A 1MS9A 3UJQA 2E7QA 4Y1XA 1SR4A 1XYFA 3S8JA 3V0BA 3SH4A 1DZQA 3NJ5A 4FPEA 1Q8OA 3AH2A 1IKPA 1FQ9A 2GDFA 1WW6A 5IK5A 2JECA 1WLDA 3FUOA 2Y9XE 1HWNB 1D2SA 9ILBA 4JCKA 3IKWA 5L73A 1KDKA 3OJ2A 1HCDA 4WVWA 2DVDA 1EPWA 1AJOA 2DYCA 2ZGSA 1ISXA 3ZXLA 4K1YA 1SBDA 2F2FC 2R49A 1ISVA 3AXDA 3V65A 3P6IA 4XTPA 1HWMB 3KQRA 2E4MC 3JU9A 3ZSMA 3BAVA 4FPFA 1DHKB 3D7WB 3WG4A 2ZQNA 2A71A 2ZACA 4OUJA 1KQRA 4RA0A 4GWNA 1V6UA 4XE9A 4QO3A 3RMXA 3N7JA 3DGTA 2BEBA 1URXA 3A22A 4R9DA 3WV6A 5GLZA 1MS8A 1RINA 4IYBA 1MS3A 4USOA 3UK9A 4KEJA 1FNYA 2ZAAA 5JOXA 5AVAA 4YW3A 3WDUA 1TIEA 2QN4A 1ISYA 3WA1A 1JHNA 4XHBA 2A6XA 1O4YA 3B00A 2NVHA 4XZPA 1LOGA 3M3OA 3PVOA 1QNYA 3ZXJA 3L2YA 1CQ9A 1V6IA 4JKQA 3S8KA 2WQZC 3AYAA 4P14A 4XBNA 2K4AB 1JYIA 4XXPA 3A0NA 1W6MA 1SLCA 4DPNA 4I4OA 4QBVA 2ZGKA 2DREA 3MALA 4UW4A 1T9FA 1LEMA 1NXD1 1UPSA 1IS5A 4FOVA 2HW9A 3D6EA 2JKBA 2Y9GA 2GNTA 2D23A 1YBIA 3N0KA 2A70A 4DRVA 1SCRA 2KI6B 2HWMA 2ZGNA 4FPJA 3UD9A 2YY1A 3PVEA 1DFCA 2ZZJA 3V0AB 2A5ZA 3RS6A 3O44A 1LOFC 1WBAA 2GMEA 2WT1A 4M3CE 3WDVA 1DYPA 3W59A 2CTVA 1KITA 4I4VA 5D63A 5IT6A 1ULEA 3WHUA 4OWJA 5FNXA 3FJEA 3O12A 3OY8A 1H9WA 1S0JA 1SLLA 2Z42A 1IHKA 4Q8KA 5DXDA 3N3HA 3CA3A 3JUTA 1TTUA 1UN1A 5DZGA 3UJ4A 1Z0HA 5BQUA 5T54A 2HZ9A 4I4RA 4FQZA 1CIWA 3SNMA 1Q8PA 2D6MA 2NP0A 4YZ3A 1WLCA 1PUUB 3V64A 2NM1A 3A07A 3AZYA 4M3CF 3AH4A 3DUIA 3O4DA 3F62B 2P23A 4LO1C 4W65A 5BVPI 5F8YA 2AUYA 3JUUA 2ARXA 2VXTI 3WCSA 4HANA 3BRDA 2D6OX 3ZX7A 5GLTA 3PVNA 2MIBA 2MLLB 4PBPA 3A21A 4G9MA 1GNZA 2D7FA 4J2SA 3ZPYA 2DV9A 1BFBA 4XJ8A 4J2YA 2VY0A 3FJAA 2WT2A 1W6PA 21BIA 2GO2A 2HWAA 1FATA 2GNDA 1PZZA 1FMMS 3ZSLA 5BXTA 3VKLA 3ILFA 2SLIA 2W52A 3AYEA 1TOOA 3PUBA 4ENDA 3T8SA 4Y22B 2D1ZA 4J2XA 1DIWA 4ZBVB 2ESUA 3BADA 4ZGRB 4WVVA 4JPZA 4YZ4A 2FHRA 1GZ9A 5BOWA 1S0CA 1AX2A 1HIBA 2R0HA 1G7YA 4LO0C 4LO2A 3U4XA 4X39A 4EB2B 4XFUA 1QNWA 3V0BB 3BRFA 2R1BA 4RL7A 1QGLA 3D4KA 3K1XA 4DS0A 4DQAA 3B9UA 2YXSA 4X3AA 1PC8B 2LIQA 5E24E 2NMOA 4XFTA 3ZXGA 3RRDA 3MW2A 4BQ1A 4XFSA 4Y1ZA 3RQ0A 4EFRA 1JQZA 1JT7A 1LEDA 1FNZA 4LO8B 4H9WA 1MS5A 1S0LA 2Z48A 2DTWA 2VSEA 1RG8A 3R4SA 1LULA 2K43A 1ILR1 1BKZA 4P0LA 4GKXA 4OW4A 1WD3A 2PHRA 3WINC 3O0VA 1LODA 4P9WA 4FPGA 4OEEA 1S0FA 1AXKA 4EFQA 4OEFA 1MVQA 3PG0A 4QC4A 4LBOA 3BAUA 5GZFA 3WMVA 2D6KA 5GJ6A 1T4QA 2ZBJA 4LO7B 2D6PA 4GAIA 1SBEA 1LENA 1DQ1A 4AWDA 3FLPA 4OZXA 5GM0A 4CRQA 3VKMA 4ZFYB 4YGBA 3VV1A 3CA0A 3R4UA 4QKSA 2A6ZA 1S0GA 4ATEA 1BFGA 2WSVA 4PBOA 5B2HA 4G6JA 1IJTA 5GZDA 1LOEA 2DVAA 1CJPA 2VSAA 2MC2A 1ULGA 2WKKA 5FRAA 2KKIA 2X2SA 4D69A 3AKIA 4R9BA 5JMCA 4YGCA 4GP0A 2DU1A 1QMJA 1W6MB 4FPLA 3KMVA 4Z8BA 4D8HA 1OQLB 2AFGA 4FQ4A 1S0DA 4FP3A 1AX1A 3ZYPA 3AFKA 1DQ0A 3NBDA 1W3AA 4I2SA 3O4OA 3V0AA 4LO0A 1YI7A 3C2UA 1J0SA 1DQGA 1YIFA 1F31A 2DUPA 2KLLA 3BAOA 1M16A 1PWAA 1LESA 1W6OA 3TB0A 1IS6A 4ZFUB 4GOVA 1AVAC 1V6JA 2ZGQA 5DUYA 4Y1YA 5GLUA 2G4IA 2YUGA 2C5DA 3N35A 1W0PA 1HLCA 3IAGC 2NMNA 4DEPA 1PZ8A 3FLTA 3OY8B 2VW1A 4II0A 2OUHA 3I8TA 4XJWA 5H9QA 1VALA 1LHNA 4AGVA 2WNEA 4CJMA 3NV2A 1GSLA 2D7RA 3AJZA 4XYXA 3UJOA 4YLZA 3WG1A 1JT4A 4XJ9A 2WJSA 5FZYA 3AZVA 5FZZA 4FPCA 4A7YA 1LGBA 1JOJA 4DRRA 2A7AA 1QXMA 2RQ9A 2OW4A 5IK7A 3AKGA 2EALA 4UW5A 1V00A 3AJ6A 2ZQOA 4BLIA 1BASA 3LLPA 4IZEA 1IOBA 3CU1B 4JP0A 3TAYA 1II4A 2Q3NB 1ABRB 2VLCA 1I1EA 3ASIA 3AYCA 4XBLA 5HPZA 5GZGA 1ENSA 1MS0A 3W58A 1DZDA 4EKXB 1WW4A 4AYUA 3NBCA 5GLVA 2UWCA 3B69A 3RSJA 1G9FA 1CESA 2WT0A 4F34A 4DFSA 4I4YA 4GWMA 1GICA 1W6PB 1GZCA 1GZWB 3LSDA 5JOWA 4XOGA 2W08A 2AH2A 1ULCA 3NV3A 5F5QA 4J2KA 1IOAA 1ZM1A 3AK0A 3POKA 2WBCA 1UMZA 1CR7A 3IM5A 4I96A 5CAZA 4AGGA 2GN3A 1EYLA 1A3KA 4ZLBB 1GYKA 1FX5A 2UURA 4Y20A 1GV9A 1LOAA 1SLTA 4I1EA 3AX4A 4WBCA 4NOTA 1MACA 3FJCA 3CRHA 1S0BA 3LTQA 1W6NA 4L4HA 3WO2A 2ZGRA 6I1BA 3AP5A 2VH9A 4FPHA 4GXLA 2YZ4A 2EXHA 3QLQA 3ILAA 4USPA 2DVFA 2RG9B 1DQ6A 1M2TB 3SITA 2DUQA 2GN7A 2XB6C 5BQUC 2A3YA 4I4XA 2EXJA 3NBNA 2PHFA 2RHPA 2ZGUA 1LHOA 4HR6C 2DU0A 2ZKNA 3T2TA 1G9CA 2A6VA 4QKRA 2I2SA 3AZZA 3LSEA 1S0IA 4Q27A 5D62A 4IONA 3HOMA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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