3FUQA

Glycosylated sv2 and gangliosides as dual receptors for botulinum neurotoxin serotype f
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
411
structure length
399
Chain Sequence
DNSILDMRYENNKFIDISGYGSNISINGDVYIYSTNRNQFGIYSSKPSEVNIAQNNDIIYNGRYQNFSISFWVRIPKYFNKVNLNNEYTIIDCIRNNNSGWKISLNYNKIIWTLQDTAGNNQKLVFNYTQMISISDYINKWIFVTITNNRLGNSRIYINGNLIDEKSISNLGDIHVSDNILFKIVGCNDTRYVGIRYFKVFDTELGKTEIETLYSDEPDPSILKDFWGNYLLYNKRYYLLNLLRTDKSITQNSNFLNINQQRGVYQKPNIFSNTRLYTGVEVIIRKNNTDNFVRKNDLAYINVVDRDVEYRLYADISIAKPEKIIKLIRTLGQIIVMDSIGNNCTMNFQNNNGGNIGLLGFHSNNLVASSWYYNNIRKNTSSNGCFWSFISKEHGWQEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Glycosylated SV2 and gangliosides as dual receptors for botulinum neurotoxin serotype F
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords BoNT/F (Neurotoxin type F)
total genus 101
structure length 399
sequence length 411
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2009-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3fuqA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3fuqA02
1WCSA 3I2XA 4I7IA 4IY8A 3AKHA 4FOWA 3TAYA 3O5SA 2ARBA 1FYUA 1UKGA 1CN1A 1BYHA 4YG6A 3WCRA 4A7ZA 4EKXB 2VLCA 1ENRA 1NXD1 2KLLA 2A3XA 2KI4A 5IT6A 4YZ5A 2WT2A 3SLIA 1GGPB 1VAVA 2ERFA 3BA5A 3ZYRA 4GA9A 2DS0A 2MIBA 3M3CA 2F2FC 1OKQA 4FP2A 4WV8A 4AYUA 3L2YA 5JMCA 2RHPA 3ZXLA 3WG4A 3VUOA 3O4AA 1BLAA 2YXSA 4JP0A 4C1XA 3OBRA 1KDMA 2NMOA 2ET2A 3BAHA 3B9CA 2ZGOA 3WHTA 2HW9A 1W6PA 1JUIA 1LOCA 3FJEA 1OFSA 2DVDA 4Z8BA 5CBLA 4ITCA 1ILR1 4IYBA 1W6PB 2E53A 1BFGA 3WOGA 2PHRA 1N3OA 2TEPA 2W08A 5DSSB 5DUXA 2YV8A 3AZXA 3V0AA 4PF5A 1GZCA 5F5QA 1LTEA 3VKOA 3V0AB 1HCDA 4QD2B 1URXA 4BM8A 2AENA 2IHOA 3O0WA 2D6PA 1S0CA 2Y9GA 3PVNA 4XJZA 3RTIB 3WO2A 2E7TA 4DQAA 3MEPA 4I0YA 3OY8A 2A75A 4Y24A 4Y1VA 2W39A 3FUOA 1TOOA 3NV4A 3OY8B 2DREA 2WT1A 2A6YA 3Q7YA 1BFFA 4H04A 3WDYA 4Y1YA 4P9XA 4P6AA 1RMLA 3FLRA 3AYAA 3IAGC 1YTOA 3PVEA 4K20A 4LBMA 3AH4A 2E6VA 2WT0A 1SBDA 2VU9A 3N7LA 4FOVA 2A71A 1QNWA 4YFWA 2UWBA 3IIRA 1MZ6A 3UJOA 3ZXFA 4XTPA 1LECA 4PBOA 1A78A 3A07A 1APNA 1FNZA 4XBQA 4ASMB 1N1VA 2ERMA 4M3CA 4P14A 4OEEA 1HWMB 4BMEA 4YZ4A 4AGRA 4M3CB 2ES3A 1GBGA 2EF6A 2D6OX 4K1YA 2UWCA 3WDWA 2Q3NB 2D7RA 2FFUA 3VT2A 3FJBA 1Q04A 1LOGA 5FRAA 1MD6A 3N35A 4FPLA 1W3FA 3VT1A 1ISZA 2ZGTA 3I8TA 1UAIA 1LOBA 3MW3A 4BMBA 1SACA 4M01A 2D22A 2ZMKA 4LBQA 4PBPA 4IZXA 4OW4A 4GOVA 2ZGPA 2OVUA 4LBQB 4G6MA 5F8SA 1EYLA 4YW5A 1ULFA 2A3YA 1LHVA 3FJ9A 3I2AA 2MC2A 1DZCA 2JECA 1KDKA 1JOJA 2ZGUA 2HWAA 2YROA 2A6VA 5H9QA 4Q9PA 4LBJA 2EAKA 5BP5C 5KXBA 1R8NA 3O0XA 1HIBA 2DWRA 2AFGA 5JOZA 1Q8OA 2WQZC 4USOA 3POWA 2D6LX 5T5LA 1ZM1A 2JE7A 4YW3A 2P39A 1B09A 1JT3A 1RINA 2R16A 3BB2A 1WW4A 8I1BA 1J1TA 3USUA 1VCLA 3ZYPA 1DFQA 5T54A 3V65A 1BASA 4ISRA 1V6WA 3USUB 3WG3A 1EVTA 1TWMA 4I37A 3ZXKA 4G9NA 1SLCA 2ZAAA 1YYNA 2VW0A 1U0AA 1JHNA 2R1BA 2ZHLA 3UK9A 21BIA 2DUPA 1MS8A 3A4UA 3SH4A 1FWVA 5EXOA 3FJHA 1LOFA 4ATEA 2SBAA 2CY6A 4Q26A 5HCAA 4KEJA 3HR9A 3ILAA 1PWAA 1LOEA 3AKGA 3VT0A 2ZABA 4YGDA 3CRGA 1WW6A 4FPOB 3KQRA 3CRHA 5G00A 2Z49A 2VUAA 5FZUA 3ENRA 1JT5A 3CAHA 4XFUA 3KMVA 2HYKA 2GN7A 1JYIA 4I1BA 1S0JA 3ZSLA 4YFZA 4DPNA 3AYEA 1AVXB 1ULEA 4L8QA 1ENSA 3O4DA 1DQ1A 2Y9WC 3WMVA 1W6OA 3C9ZA 4ISQA 3AK0A 4OWKA 1KITA 1W6OB 1HWOB 1FATA 4I1EA 3AP5A 1A8DA 2ESUA 4DEPA 4Q2FA 2NYYA 2E51A 4L4HA 4FQZA 31BIA 1ISXA 1GNZA 2UURA 3O49A 1FGAA 2A6XA 2D23A 5T5OA 1FV2A 5CNAA 2D3SA 3M1HA 5F8WA 1IS4A 2NN8A 4R9DA 4I4UA 3UD7A 1IHKA 4EFPA 3WA1A 2LTNA 2FDBM 1CVNA 1JT7A 2BFHA 1BJQA 5GLVA 4HANA 1HQLA 1KQRA 3UJ4A 4LO1A 2E4MA 2DTYA 1DJSB 1SLLA 2ZKNA 3BOPA 2XB6C 4Z9WB 2W52A 3JRRA 3NBDA 2Z42A 4II0A 1AJKA 4QKRA 1MACA 1BARA 2CL2A 1QDOA 5DUWA 3POYA 3M2MA 1IS3A 4TZDA 1FNYA 2FHRA 3UDAA 1MS5A 4FPKA 1Q03A 4R9CA 3INAA 1HKDA 5D63A 3WV6A 2V5YA 4PC4A 1SLAA 2PHXA 3IPVA 3VKNA 5FNXA 1SLIA 3IPVB 1NLSA 4I4QA 2PELA 1AXKA 1MS4A 5EWSA 1N3QA 3BTAA 5T5JA 3IKWA 1TP0A 1LGCA 2ZHNA 2DVGA 2H0BA 3CRIA 4YG3A 3AZWA 1NZKA 2F2FA 4IONA 4R6UB 1LENA 3OGGA 3SNVA 4YM2A 2DVAA 1AVUA 5FNWA 2J3PA 3ZPYA 1G9BA 1K5VA 4Q91A 2Q5TA 1LGNA 1I3HA 4A7YA 1MVQA 4ZKTB 1W6MA 2D1ZA 1ITBA 3RMYA 2GMPA 3CQAA 4CZSA 1IS6A 1P63A 3IN9A 1W6MB 2DTWA 4IQPA 3WMUA 4FPGA 3VKLA 3K1XA 2OUJA 4AVVA 2Q9XA 4XJ9A 2KH2A 4P0LA 1Q8SA 4Q8KA 1T4QA 3H0OA 2WRYA 1UN1A 3PG0A 4XBLA 3O0VA 3Q9OA 2VW2A 3MALA 2ZHMA 1O4ZA 1W6NA 2ZBJA 1R8OA 1V6XA 5JOYA 1C1FA 1V6LA 1W6NB 2ZGKA 3ASIA 1VAMA 1JBCA 1LU1A 4X37A 1H9PA 3R4UA 1J0SA 4YM1A 1SLTA 2Z48A 2X2SA 1FMMS 4DRVA 1ZA4A 3BADA 3W9TA 3O4OA 3QCWA 3NWKA 3FJFA 4I4VA 1XHBA 3KM5A 1SLBA 3VSZA 1SFYA 2YY1A 2DYCA 5GZDA 4J2YA 4HA2A 4Q9GA 3S8JA 3RSJA 2A5ZA 5BQUC 4G9MA 3CNAA 3AP4A 3IM7A 4Q8LA 1N1TA 3AXEA 3SITA 3FJKA 1DQ6A 4YLZA 4ZFUB 1OQ1A 4XKIA 5AVAA 5E88A 2D6KA 4DS0A 2L5XA 1CVSA 3FBYA 1YBIA 3FLTA 2C5DA 1QGLA 5FREA 4XE9A 4BPZA 1AVBA 1LEDA 2UUSA 5D62A 1FMZA 3FJCA 1LCLA 4Y20A 2AGSA 5DXDA 2SLIA 5DG1A 4Y20B 3FJJA 1YIFA 3HN1A 5E24E 2EIGA 3ZC9A 3AP9A 1SCSA 2LALA 1ISVA 5EC5A 3LSEA 1G82A 1KJRA 2K43A 4J2SA 2AXMA 3NBEA 3W59A 2GMEA 4LBNA 5DG2A 2LIEA 1IKQA 2A6WA 3H6SE 1YI7A 5H9RA 2A6ZA 1PZ9A 5JLVA 3JU9A 4M3CE 4Q27A 1AFCA 1Q8VA 3AH1A 1IKPA 1G9CA 1H9WA 3PHZA 5H9PA 2D20A 1W0PA 1TIEA 1GSLA 3UD9A 2DRZA 4GAFA 1WLCA 4YW1A 3ATGA 5DZFA 1CJPA 1FN0A 3WDUA 4GWMA 4NO4A 1N47A 2D43A 3BAVA 3N3HA 1AX1A 4IZEA 1LHNA 2GNBA 2D7FA 3MPPG 4X38A 4TLPA 1MS3A 3A0NA 1GLHA 1IS5A 2AH2A 1AF9A 4XIKA 1II4A 1QNYA 4FPYA 2WLQA 4EB2B 1JLYA 5T55A 4XXPA 3TC2A 4I6IA 1I1EA 5HCBA 5BP5A 2JD4A 2VY0A 4KEIA 1GZ9A 4FOQA 4XOGA 1JQZA 1HLCA 4FVVA 3AJ5A 1QXMA 5I1BA 1CPMA 1HKNA 4RA0A 4Y26A 1SCRA 3B69A 1AVAC 4JRAA 1W0OA 1LESA 3AZVA 2VH9A 4PCRA 3POSA 2G4IA 4HL0A 2NP0A 3ZX7A 4F83A 5SV8A 4R9AA 2DUQA 5JOXA 4K21A 5KXCA 2BEAA 1PZ7A 1F9KA 2PHWA 4FPEA 4M00A 3ZXJA 4P0JA 4OWJA 1XZZA 1DZDA 1WLDA 3AYCA 1G7YA 1LU2A 3NJ5A 3BAUA 1IJTA 3BX1C 4YZ2A 3ZXGA 2VXRA 2NM1A 1UL9A 2RG9B 2NZ9A 1YO8A 1AXZA 2RSTA 4CRQA 3E8LC 5GZGA 4Y1ZA 1V6IA 3D4KA 5IK7A 3AJ6A 4D0TA 2AQZA 1LHWA 1HCEA 4XMAA 2R0HA 2CTVA 3ILFA 3GNEA 3QYDA 4X39A 3CA1A 3H6QA 4HJJA 3VKMA 4FQ4A 3AJZA 2AYHA 3N7MA 3VV1A 9ILBA 4GKXA 2DRYA 1IOAA 3O3QA 1T9FA 1HQWA 3I4IA 3JUTA 1N1YA 4OEGA 4I3NA 3WDXA 4QKSA 1W3AA 1HWPB 1V6JA 5BOWA 3QLQA 4EFQA 4AGVA 4NOTA 1KJLA 3DUIA 4BLJA 2P3IA 2GN3A 3ILNA 3HMYA 3IM6A 3N36A 5KXEA 3CU1B 3LSDA 2ZGLA 5F90A 1RITA 3I29B 2D24A 3UD8A 2AR6A 4LBLA 3WG2A 2ZGSA 2ZMLA 1BQPA 3H6RA 3O4CA 5BXTA 4LBQD 4R9BA 1XQNA 3AP7A 1G86A 3H6RB 4ZOTA 3V79C 5B2HA 3RMXA 1G9DA 1F5FA 1C4RA 4Q1PA 3WINC 5CA6A 4I2SA 1GZWB 5GJ6A 2R0FA 4UW4A 3HALA 3WLUA 2FMDA 1M2TB 4UW6A 4H55A 4AN7B 3RG0A 1L2HA 4I96A 41BIA 3T8SA 4LO7B 1V6KA 4JAWA 2P3JA 4AWDA 4LO0C 4IY9A 1IILA 4WZFA 4A7KA 4XMIA 3A23A 1M16A 1BXHA 1GYKA 3D5OA 1FX5A 2ZGRA 1QKQA 3NBNA 4JQ0A 3UJ0A 4LBOA 4JCKA 1MS1A 3D6EA 3WDTA 2A70A 4XJ8A 2V73A 3C2UA 5T50A 4OUJA 4XTMA 3N7JA 3BA7A 1JN2P 2GDFA 1FV3A 3OGFA 1V00A 1UMZA 2GZBA 4YGCA 4XILA 2YMZA 5HCFA 3ZSJA 3P6IA 4LO7C 4YW4A 1K5UA 1JYCA 4QBVA 2D3RA 1ENQA 4ENDA 3ZSMA 4FPHA 2GMMA 5GLTA 2HWMA 5DUUA 1ULCA 1XG6A 1QDCA 2XG3A 4M3CF 1ULDA 2YZ4A 3NV1A 4W65A 1GICA 2GNDA 2FFVA 1IT0A 1JLXA 3APBA 5IUQA 2GALA 5E8AA 4GALA 4GWNA 3HSMA 3MW4A 5IK4A 1V6UA 1UX6A 1AJOA 3FJIA 4FGFA 4H9WA 4Z8SB 1GANA 2BQPA 1DYPA 1HWNB 1N1SA 5HPZA 2CWMA 1FAYA 1RZOB 1YF8B 3WO3A 2P34A 4FPFA 1FQ9A 1R1ZA 1CIWA 5BQUA 4Y1XA 2GNTA 1QQLA 2P3KA 3V0BB 1S0EA 4P9YA 4YOLA 4WBCA 3OYWA 5BXSA 1W6QA 4SLIA 1SR4A 2F8XC 1QMJA 3OYWB 3SH3A 2QN4A 1RG8A 1W6QB 3NV2A 3LCPA 1ISWA 4I4YA 3WO4A 2ZGQA 3VSFA 4Y1UA 4ZFYB 1Z2VA 3WG1A 4GOYA 4XHXA 1LHUA 1DZQA 1CQ9A 2ZQNA 2EXIA 2AAIB 1TWEA 1MC9A 4AN6A 3M3EA 1CR7A 3RTJB 3BIWE 2ZGMA 1GKBA 2VW1A 1BFCA 2A7AA 2JDZA 1DQGA 4F34A 5F9TA 2R1DA 1LGBA 3R05A 1ISYA 4L4IA 2D3PA 3FGMA 4YW2A 5BYNA 1G9FA 1LOAA 2DURA 1UZYA 3AX4A 1BKZA 1NUNA 4X3AA 3EF2A 3PVOA 5DZGA 1SR4C 3ZXDA 4Y22A 2XOAA 2WSUA 5GALA 3AFKA 2ZACA 4Y22B 5D61A 5GZEA 4I8MA 1S0BA 3WUDA 4LO8B 1WD3A 2VXTI 2IWTB 1AX2A 1WBCA 3B00A 2UWAA 4GAIA 3OPZA 2ZA9A 5GZFA 2JJ6A 2EXHA 1QU0A 1D0HA 4XBNA 3AZZA 5BXPA 2D6MA 4ZXKA 2KI6B 1MR5A 1JTCA 3BA4A 1MS9A 1WBLA 1Z4SA 2FGFA 1RIRA 4DRRA 4ZFWB 4TYSA 1Z78A 5T5PA 1QOOA 1CESA 1BZWA 4XHBA 3T1MA 7I1BA 3AZYA 3TB0A 1CONA 4RL7A 3AXDA 4YM3A 2A3WA 1AXYA 1S0DA 1LULA 3VWCA 3WHUA 4PQ9A 1WLWA 4Q1RA 1G8WA 1MZ5A 2CWSA 3JUUA 3D7WB 3O5WB 1WW5A 2ARXA 5GLWA 2DVBA 1MS0A 3SNMA 4G1RA 5FZZA 4D8HA 2D44A 3PUBA 2D6NA 5T52A 1DQ5A 4ZA3B 5LK5A 4UW3A 4DENA 1G9AA 4XXAA 1Q1UA 4QALA 4QD2C 3B9UA 2P23A 3U4XA 2X2TA 2PHUA 1QQKA 3O44A 5BXRA 6I1BA 2WJSA 1KNMA 4XIOA 3CA0A 1AZDA 1EV2A 2YUGA 4XYXA 5H9SA 2DU1A 4DFSA 2GO2A 2WSVA 4OEFA 1IRAX 5E89A 3RRDA 3OJBA 4P9WA 4WVVA 4XDQA 2EALA 4QO3A 3M3OA 3B01A 4EEEB 3ILRA 5EHAA 4ZBVB 3FLPA 1I1BA 2K8RA 2DU0A 1QOSA 3BRDA 2P37A 4J2XA 3T1LA 3QR5A 1W3GA 4C1WA 4JKXB 1UPSA 3FJ8A 4K1ZA 3N0KA 5GAQA 4UW5A 1DGLA 4ZGRB 4KBBA 3BRGC 1VIWB 5IK8A 2WKKA 4YGEA 3T2TA 5JVVA 1EPWA 1E0OA 2CYFA 5FZYA 4J2KA 1N3PA 3WVJA 1IRPA 3OJ2A 4LBKA 1S0FA 2ZHKA 3OJMA 3PMEA 2WNEA 4OWLA 1TTUA 3A22A 3HBWA 4FPJA 4YGBA 1BLDA 3OBTA 4I4XA 1WBFA 3ZXEA 3R4SA 1H30A 1GNHA 2ZR1B 3BAQA 2LIQA 3A0KA 5GLUA 3IMNA 2I2SA 1AVWB 3WDVA 5BVPI 2UU8A 1WBAA 1PZZA 4OZXA 1QF3A 5DUVA 4GP0A 3FJDA 3POKA 3WINA 1S0GA 5EYYA 1Q56A 4JPZA 1S0LA 2I1BA 1VLNA 2OUHA 2P2KA 5EYXA 1ULGA 2JE9A 4GXLA 3AKIA 3WZ1A 5CB7A 3BAGA 4WVWA 1C57A 2EXJA 1D2SA 1DQ4A 1LJ7A 4U36A 3FJAA 1F31A 3O4BA 1S1AA 4D69A 4HR6C 3WCSA 4GKYA 2NVHA 1SBEA 4LO0A 1DHKB 2R49A 1JY0A 4BLIA 4XJAA 1JT4A 1YRZA 4CJMA 5GM0A 1V6OA 5GLZA 1S0IA 4GP3A 1DLLA 1RY7A 3NV3A 2VSAA 3DGTA 3RS6A 4JC1A 3AH2A 4YZ1A 5L73A 1WUVA 1DQOA 3F1RA 3BODA 1IOBA 1SBFA 3V64A 4I4PA 4BQ1A 3S8KA 2CNAA 1AXMA 2NTDA 4DCKC 2OW4A 4FP3A 1YXWA 1DBNA 3RQ0A 3Q7XA 1O4YA 2M49A 1GZWA 1QOTA 2WBCA 4U2AA 4AVTA 3Q7WA 1Z0HA 4USPA 5IK5A 3P53A 3CA4A 1V6NA 2AUYA 1JXNA 1AX0A 1ONAA 2JKBA 5KXDA 4J23B 3MW2A 5JDBA 5DZEA 3SISA 1DYKA 2HZ9A 1PZ8A 3P6JA 1TEIA 1ONKB 1C1LA 1LOFC 2VSEA 2DVFA 3IM5A 4I4RA 4FOYA 5CAZA 3CA5A 3BAOA 1Y7BA 4KC3A 1SZ6B 4LO2A 4AGGA 3FFZA 3IM0A 1PUUB 3O12A 4CTEA 1DQ2A 4YZ3A 1V6MA 3HOMA 3AYDA 1BFBA 4YG0A 1XYFA 3OJVA 4P0KA 3AJYA 3UJQA 2E7QA 4MYEA 3FUQA 1JW6A 1TFMB 3SH5A 3GALA 2BEBA 1BA7A 1X50A 1DIWA 5DZUA 3NBCA 1V6VA 5JOWA 3AP6A 4FPCA 3AKFA 1CPNA 1LHOA 4ATFA 2Y9FA 4LO3A 1N4KA 4XJWA 4I30A 2DUOA 3ZVXA 1LEMA 3ZC8A 3CA3A 3PJQA 5DUYA 3F62B 2KM2A 3VEQA 1KRIA 1DFCA 2ENRA 1HDKA 2ZZJA 4XFTA 1PUMB 3WUCA 4KEKA 2DV9A 3B3QE 4EFRA 2NMNA 3WNXA 4QBCA 4QC4A 2D7IA 2MLLB 4I4OA 3N7KA 2GNMA 2R9KB 4LO2C 4D0ZA 3BRFA 3LTQA 1Q8QA 5GZCA 5DVHA 2B7YA 4XZPA 3VKFC 1OQLB 2PHTA 2RQ9A 2FO1A 1WD4A 1DQ0A 2Y9XE 1PC8B 3M3QA 2QYIB 2KKIA 5F8YA 1LODA 4LO1C 2E4MC 1Q8PA 4IHZA 3A21A 4I4SA 4G6JA 1VALA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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