3HMYA

Crystal structure of hcr/t complexed with gt2
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
450
structure length
442
Chain Sequence
NLDCWEDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Gangliosides as high affinity receptors for tetanus neurotoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tetanus toxin
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium tetani
total genus 120
structure length 442
sequence length 450
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 2009-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3hmyA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3hmyA02
2W08A 1RG8A 3ZXDA 2IWTB 4G1RA 3M3QA 1ZA4A 2E6VA 2D3PA 4I4SA 3VT2A 3PHZA 1QGLA 4H04A 4QC4A 4F34A 5EYXA 1IS3A 4A7YA 3R4SA 2HW9A 3VT0A 1FX5A 3PVOA 3CA0A 3AJZA 4YG6A 1MVEA 2AGSA 1DIWA 2NM1A 3OBRA 2NP0A 2I2SA 1JLXA 1X50A 4WVVA 4X37A 4M3CA 3OPZA 4P6AA 1QKQA 4DPNA 4P14A 2PHRA 2WBCA 2Y9WC 1ULEA 1W6MA 3AJYA 4GWNA 3ZXJA 2ZQOA 1TTUA 4XJZA 4C1XA 4OEGA 4HL0A 3V79C 2Y9GA 3FJ8A 3OGGA 4FQZA 4J2YA 5BXSA 1BA7A 1MD6A 1HQLA 3NV4A 5FRAA 4XIKA 4FGFA 1JLYA 5DUWA 5JOXA 5KXDA 4FOQA 3CAHA 3V0BA 1BFCA 2PHWA 2D6KA 1UX6A 1DQ4A 1MS4A 9ILBA 4HR6C 4Y1YA 2ZQNA 4PBPA 1II4A 5DUVA 5EWSA 3UL2A 2KI4A 2ENRA 1HWPB 2GN3A 1SLAA 1FMZA 1IKQA 4FPHA 2A3XA 1RIRA 3HMYA 3BTAA 4D8HA 4XTPA 5T5LA 3O4DA 4Z8SB 1WW6A 5BP5C 1AX0A 3WDYA 4YGCA 1UN1A 1V6LA 6I1BA 2WKKA 4GALA 4R6UB 1U0AA 4UW6A 2UU8A 3AXEA 4AGRA 3WMUA 4I6IA 5T55A 3I2XA 4XKIA 2GMEA 3SISA 5H9QA 4J2SA 1W3FA 2Y9FA 3D6EA 3CNAA 2DYCA 2KKIA 3OYWB 4YG3A 2HWAA 5CNAA 2YUGA 2DU1A 1JY0A 4PCRA 1OQ1A 5DZEA 2G4IA 4JP0A 4XIOA 1SCSA 3O0XA 1QXMA 5GLTA 5L73A 3AKGA 4F83A 1G9CA 3JU9A 2P39A 3IAGC 1FATA 4Q1PA 3VKNA 4JC1A 4ZGRB 2D44A 2EXKA 2X2SA 2QN4A 2QYIB 2VY0A 1UMZA 1W6OA 1WW4A 3WCSA 3M1HA 2A6ZA 2CWSA 1W0OA 3UK9A 1Q8PA 3CRHA 5DZUA 5CAZA 1DYPA 3SH4A 1ITBA 1SLIA 3FJKA 1NZKA 4XMAA 5KXEA 3M2MA 2V73A 3O5WB 3VUOA 2SBAA 2ZABA 1WW5A 4FPCA 4IONA 5BQUC 1N47A 5JVVA 3ZPYA 1AF9A 4A7ZA 1V6NA 4OWLA 5GLVA 4YZ2A 1YRZA 4ATFA 3VWCA 4QALA 2ZGQA 2WSVA 4GOVA 4K1ZA 2B7YA 2IHOA 1DZCA 2UWBA 2FFUA 3RMXA 3VSFA 3B3QE 1CVSA 4QKSA 1QNYA 1Q03A 4Y20B 4GXLA 2VW1A 2NN8A 1CESA 4K1YA 2VSAA 1LU2A 3LCPA 1YI7A 5BXRA 5BVPI 2DWRA 1MS0A 1H9PA 1A8DA 4LBLA 1KQRA 3IM0A 3WDWA 2BEBA 1MS5A 1PZ9A 3V0AA 1N1YA 1MS8A 1RMLA 4YFZA 3H6RA 4QKRA 2ZMKA 1AVBA 5DXDA 1DQOA 2GNMA 2FGFA 4Q9PA 4FPGA 4Z9WB 2BEAA 1OFSA 2ZKNA 4LBNA 3O4AA 4DS0A 4ISRA 1SACA 1JYCA 1IKPA 2D22A 1HWNB 3UJ4A 5D62A 5FZZA 3OJVA 3RSJA 2ES3A 2CWMA 1YF8B 3VKMA 2AXMA 5E88A 3WG3A 4DENA 1WCSA 1LGBA 3AYCA 4QBVA 4YW4A 5H9SA 2GMPA 2ZGOA 2E4MC 1ISXA 3CRGA 1YXWA 2ZGTA 3A4UA 3UD9A 3VV1A 3D4KA 3WG4A 3KMVA 2D6NA 2GO2A 1DGLA 1IHKA 1GNZA 1GZWA 4BLIA 1SZ6B 2E7TA 2P23A 4EB2B 3AXDA 3BAOA 2VXTI 5IK4A 3ZC9A 4GAIA 2W52A 1DZDA 5F9TA 1FAYA 3HOMA 2WRYA 3IM6A 4KEKA 1AVAC 2Z42A 1XZZA 1S0GA 2WLQA 1YO8A 4LO8B 3KQRA 1V6MA 3FJCA 3O5SA 2A71A 4XZPA 2AFGA 1JBCA 1JXNA 4Y26A 1TIEA 1DQ1A 1WLCA 1F31A 5T5OA 4BMBA 1O4YA 1DJSB 31BIA 3AKFA 3H6QA 1LHOA 5JOZA 1UAIA 3N0KA 5BP5A 1HWOB 4I30A 3BODA 3CA6A 2UURA 4MYEA 3AYDA 1FWUA 5JOYA 2DS0A 3V64A 5F5QA 3HALA 2D23A 4XE9A 5CBLA 3AP5A 4AN7B 1KJRA 3AK0A 1WUVA 3WMVA 4L8QA 1Z2VA 1G8WA 3QLQA 2A6VA 1FYUA 8I1BA 3BAVA 4USPA 4ATEA 4P9WA 4YGDA 2DTWA 2VLCA 3WO4A 3VKLA 2VSEA 4DQAA 5F8WA 5GAQA 1MACA 1BFFA 1AX2A 5T5JA 2ZHLA 1N1TA 2ZHNA 4XJUA 4FP2A 5DSSB 5I1BA 4M01A 2ZGSA 4K21A 3QYDA 2X2TA 1IOBA 2ESUA 2CNAA 3ILRA 4GOYA 1GANA 1LEMA 1V00A 2ZGLA 2UUSA 2W39A 3RRDA 3IPVA 3WV6A 4LBQB 3AH2A 2E51A 4ZA3B 2GNDA 2GNBA 4Q26A 1S0FA 2NYYA 1RY7A 4Y1VA 1O4ZA 1QQKA 2P34A 1G9DA 4XXPA 4BMEA 3Q7YA 4CTEA 3OJ2A 2EXHA 3B01A 5E89A 1LOCA 4R9DA 1DFCA 1QMJA 1IOAA 5E8AA 3WCRA 5LK5A 3EF2A 4XFUA 2D7FA 1CIWA 41BIA 3OY8B 1XQNA 1YIFA 2D6LX 3D7WB 4OEFA 2XOAA 4M3CF 5BQUA 1UL9A 2ZBJA 1URXA 4P0JA 4I7IA 2NTDA 2R16A 3FUOA 1Z0HA 3B69A 2EXIA 2HYKA 3ILAA 1QF3A 3MALA 3E8LC 1KDKA 3T8SA 1I1BA 3D5OA 2EXJA 4DRRA 4CZSA 3P6JA 3ZC8A 4X38A 4DRVA 4I2SA 1MZ6A 1QDOA 3N7KA 4YZ4A 5JOWA 4CJMA 1YTOA 2ZGPA 2GALA 1W6NA 2Q5TA 3ZSLA 4LO7C 2ZA9A 1HKNA 4DCKC 1XG6A 1LCLA 1GBGA 1Q8SA 2JJ6A 4QD2B 1UKGA 3RS6A 1QDCA 4UW3A 2K4AB 3B00A 2OUHA 2A75A 3OJMA 4AVSA 4HA2A 3BB2A 5H9PA 3SNVA 1BZWA 2Y9XE 3BA7A 1W0PA 2ZHKA 1BXHA 4R9AA 3MW4A 3WA1A 4I4XA 3RTIB 1SLTA 2ZAAA 1CQ9A 3AZWA 4XJ8A 3ZXKA 3I2AA 5DUUA 2PELA 1ISZA 5E24E 4Y1ZA 5F90A 4FPFA 4M3CB 2D7IA 4I8MA 2OW4A 1ISYA 1G7YA 2DREA 3W58A 3NV3A 3N7MA 4Q27A 2MLLB 3BAUA 3AH4A 1W6MB 2FDBM 2D3RA 1FWVA 5IT6A 3BAGA 3PUBA 5AVAA 5IUQA 3BRFA 4IZXA 4XXAA 1XHBA 4A7KA 3AZVA 3SNMA 2ZHMA 1JT4A 3WG1A 4H9WA 4Y22A 3OBTA 3V0BB 2L5XA 4KEJA 4I4PA 2E7QA 4YW3A 1KRIA 5JMCA 1DQGA 3UJQA 3IMNA 2E4MA 3N3HA 4FOYA 4LBOA 2AAIB 4IYBA 2P3KA 2D6PA 3ENRA 5GZDA 1AFCA 4FP3A 3O4BA 1AJOA 1SBFA 1GNHA 1DQ6A 1IRAX 2DVGA 3T2TA 2VU9A 3NBEA 3RG0A 3B9UA 1W3AA 1BLAA 3POYA 2R0HA 3NBCA 1GICA 4L4HA 2WT1A 3WVJA 4LO0A 1OKQA 1BKZA 2DVFA 2EAKA 4YM3A 1TWMA 2P2KA 3FJEA 4GP3A 4UW4A 1FQ9A 1APNA 3BA4A 3AZZA 2P3JA 4U36A 1S0DA 3UJ0A 4JRAA 2ARBA 2FHRA 1LU1A 4EFRA 4J2KA 1SFYA 4I4YA 4ENDA 4YZ1A 2ZGRA 3NBNA 2K8RA 2JDZA 4YGBA 4LBJA 1A78A 3ZX7A 3AZYA 1VALA 2R0FA 1JTCA 3V65A 1SLLA 1TFMB 3Q7XA 2A6WA 1V6KA 1YYNA 1S0EA 1LOFA 4ISQA 1KITA 4GKXA 4G9MA 2WNEA 2LALA 5FZUA 3AFKA 4FPEA 1TOOA 4P9YA 4IZEA 4Y1XA 1UPSA 3N7JA 1SLCA 1W6OB 3I8TA 4D0ZA 2DV9A 5GZFA 4I1EA 1V6WA 4Q91A 4I4VA 4G9NA 5EYYA 3FJJA 4BPZA 3QR5A 5EHAA 1CONA 1ULGA 1HLCA 3APBA 1PC8B 3AH1A 4GP0A 3ZVXA 4LO3A 5HCBA 2OUJA 1QNWA 1SR4A 3MEPA 3WHUA 4YM0A 2A70A 1VLNA 4ASMB 1GLHA 4YW5A 5T52A 4IHZA 3INAA 1ONAA 5JDBA 1VCLA 2AQZA 4XBLA 1WLWA 1HCEA 4AGGA 1Q04A 2CL2A 3UDAA 2ZGMA 2AH2A 4X39A 3CQAA 4EFQA 4YW1A 2ZZJA 4YG0A 1N1VA 1BFGA 1FMMS 1KDMA 3N7LA 5EG6C 1C1FA 1VIWB 5CA6A 4Q2FA 3CA1A 3RMYA 4YZ5A 4IY9A 2LTNA 5FREA 4AVTA 5GM0A 1FNYA 1JHNA 1ILR1 2K43A 2YMZA 2PHTA 4R9CA 2WT2A 3USUA 3AYEA 4DEPA 4L4IA 4XFSA 4XHBA 2FO1A 2CY6A 4GA9A 2DVDA 4I4QA 2EIGA 3NWKA 5F8YA 1BYHA 3AP7A 2D3SA 2UWAA 2PHUA 3V0AB 4PBOA 1G9FA 3POSA 1ABRB 1SBEA 3H6RB 5EC5A 1LULA 2YXSA 1W6QA 3IKWA 4WZFA 3FJ9A 5HCFA 2MIBA 1JOJA 1I1EA 4XJAA 3FJAA 4IQPA 2C9AA 4XFTA 1BFBA 2RG9B 2ARXA 3AKHA 3I4IA 4FQ4A 1MZ5A 5G00A 1GGPB 1BARA 2R9KB 3U4XA 2NMNA 1ENRA 3L2YA 4CRQA 3DUIA 3S8KA 4LO7B 4PC4A 4HJJA 5DZFA 3JUTA 1CPNA 4LBMA 4LO0C 2VW2A 1JT5A 4XMIA 2D6MA 4QBCA 3W59A 1IJTA 3OJBA 3M3OA 2DVAA 1S0JA 3A23A 4U2AA 4KC3A 3FJFA 5T5PA 3WDXA 3BX1C 1PZZA 1NUNA 1KNMA 1I3HA 1V6JA 1M16A 3LTQA 1Q8VA 1DQ2A 2CTVA 3WHTA 3LSEA 1MR5A 2AYHA 2ZGKA 1V6OA 3ZSJA 2Q3NB 4YM2A 5GALA 1GZWB 1IS6A 3UD8A 3AP4A 3CU1B 4KEIA 2AENA 3JUUA 1S0LA 4G6JA 3H0OA 3R05A 1AZDA 5D61A 4YLZA 4YGEA 3VKFC 4ZXKA 1DQ0A 1SCRA 4YOLA 1QOSA 2P37A 5DVHA 3A07A 2OVUA 3AP6A 1LOFC 1VAVA 2XG3A 3WDVA 2NZ9A 5FZYA 3FGMA 1CPMA 4EKXB 1MVQA 7I1BA 1A3KA 1JW6A 3I29B 3O0VA 3LLPA 1MS1A 1LOAA 2RSTA 5FNXA 4AWDA 2DUQA 4R9BA 1Q56A 3ZSMA 1FGAA 2WT0A 2NVHA 3VSZA 3BOPA 1DQ5A 3ZSKA 4KBBA 1RZOB 4XDQA 5DG2A 2P3IA 1SBDA 2D43A 5IK5A 3AZXA 4YZ3A 2SLIA 4LO3C 4OWKA 1GZCA 1WBCA 1DYKA 1SR4C 4JCKA 1W6PA 3GNEA 5KXCA 1N3QA 3WNXA 1FNZA 2VUAA 4LO1C 3CA5A 1ISVA 4K20A 3AJ6A 3C2UA 2DUPA 1W3GA 4IY8A 2AUYA 3FJIA 1LOBA 3F1RA 1C1LA 2DVBA 1N4KA 4TZDA 1HWMB 4HANA 4Q9GA 3ZXLA 1DFQA 1HQWA 1G86A 4Z8BA 4JQ0A 5DUXA 1V6IA 5DZGA 5F8SA 3IPVB 2GNTA 1Q1UA 5GZGA 1AXMA 1S0IA 4FOWA 1QOTA 1RITA 3FLPA 2KH2A 3BAHA 1V6UA 3WDUA 2J3PA 2XB6C 3JRRA 1Z4SA 1NXD1 4I3NA 1T4QA 1GZ9A 1ENQA 1S1AA 2ZGNA 3NJ5A 1V6VA 2JE7A 3A21A 1JN2P 5T54A 1HKDA 1LGCA 1L2HA 2TEPA 4Y1UA 4W65A 1WLDA 1LHWA 4GAFA 5GLZA 2R1BA 2D1ZA 1GV9A 1CVNA 1WBFA 4XBQA 1Z78A 4JKXB 2YZ4A 1B09A 1PUUB 5BXTA 4H55A 2H0BA 4LBKA 1EV2A 3BIWE 2D20A 3BAQA 1EYLA 1N3PA 3A0KA 2UWCA 3WUDA 3O4CA 5SV8A 1W6NB 2ZGUA 1UZYA 4I4UA 3N36A 1DBNA 5BOWA 2DTYA 2YROA 3S8JA 4AN6A 4ZOTA 1D2SA 1G82A 4XYXA 2GZBA 2E53A 1JT3A 5DG1A 5EXOA 21BIA 4FVVA 4RL7A 5KXBA 3SH3A 3WUCA 3WOGA 4JKQA 4C1WA 3MW3A 3PG0A 2BFHA 2D6OX 1LENA 3AKIA 2CYFA 2Z49A 3FLRA 1AVWB 2RQ9A 3SITA 4EFPA 1LHNA 3OYWA 3VKOA 2BQPA 2F2FA 3PVNA 5GLUA 1TEIA 1PUMB 1MC9A 4FPJA 1MS3A 3HN1A 2JECA 3ILFA 3H6SE 1IS5A 3CA4A 3T1LA 1P63A 5GZEA 1TP0A 4M00A 2KM2A 1HIBA 3Q7WA 4YFWA 5HCAA 2A6XA 1LHUA 1PZ8A 3P53A 1CR7A 2KI6B 1PZ7A 1AVUA 2A3YA 3W9TA 4Y22B 3O3QA 2A6YA 2WQZC 2PHFA 3O44A 4I37A 5BXPA 2FFVA 1CE7B 3ILNA 1BLDA 4J2XA 5IK8A 2DU0A 1F5FA 3BADA 4BM8A 4AGVA 4XOGA 1K5VA 1CN1A 1G9AA 2R49A 2V5YA 3WO2A 2FMDA 1MS9A 1AXYA 5GLWA 3HSMA 4FOVA 1LTEA 2C5DA 2AREA 3M3EA 4OZXA 2DRZA 3PJQA 3IIRA 3FJBA 1XYFA 3ASIA 4YM1A 3SLIA 2HZ9A 4YW2A 4NO4A 2Q9XA 3RQ0A 2F8XC 3POWA 3WO3A 4TYSA 1BJQA 4NOTA 3A0NA 3K1XA 1LOEA 4FPOB 4Q8KA 1DLLA 3PMEA 1AJKA 3MPPG 4Y24A 4I1BA 1ZM1A 3WDTA 1J1TA 2EALA 5GJ6A 4TLPA 4Y20A 3IM7A 1LGNA 4QD2C 3GALA 4XBNA 4Q8LA 5B2HA 4Q1RA 1GSLA 4DFSA 4EEEB 1RINA 1DHKB 1TWEA 3NV2A 2NMOA 4I4OA 3WLUA 2ZMLA 4RA0A 3C9ZA 1AXKA 2YV8A 1V6XA 4I96A 2DUOA 3TB0A 2PHXA 1N3OA 2ERFA 2LIEA 1IRPA 2JE9A 4LO1A 3BA5A 1S0BA 4I4RA 4BLJA 3WZ1A 2HWMA 4LO2A 1LODA 2A5ZA 4AYUA 4P9XA 1AXZA 1WW7A 1D0HA 2A7AA 1FN0A 1LECA 4M3CE 3R4UA 1C57A 1KJLA 4ZFUB 1ONKB 4ZKTB 4XTMA 4II0A 3ZYPA 3FJDA 3WINA 4XJ9A 4OWJA 1AX1A 1R8OA 3AYAA 1C4RA 5D63A 3TC2A 3HR9A 1H9WA 4ZFYB 3PVEA 2A3WA 1IILA 1M2TB 5IK7A 4UW5A 4WV8A 1LJ7A 2Z48A 2ZR1B 1JT7A 4I0YA 3AP9A 3UJOA 4P0LA 1DZQA 1PWAA 4ITCA 1ULFA 4P0KA 3QCWA 2DRYA 2GN7A 5T50A 3N35A 3AX4A 5BYNA 2F2FC 1SLBA 5GZCA 2VH9A 4WBCA 3ZYRA 1WBAA 4JPZA 1Y7BA 1YBIA 3FLTA 1F9KA 2MC2A 2VW0A 3USUB 2LIQA 1LOGA 3O49A 3F62B 2ZMNA 1OQLB 4USOA 1R1ZA 3O12A 4ZFWB 3CRIA 4FPKA 4PF5A 1LESA 3LSDA 3NV1A 3IM5A 3OGFA 2VXRA 3ZXEA 3M3CA 1W6QB 1LEDA 4OEEA 3UD7A 1HDKA 1EVTA 4XHXA 4G6MA 3SH5A 4GKYA 1ENSA 1ULDA 1AVXB 1R8NA 2JKBA 3CA3A 3A22A 1HCDA 4BOWA 4D69A 5HPZA 3BRDA 5JLVA 4ZBVB 5DUYA 3IN9A 4XJWA 3ZXGA 1JYIA 1QQLA 4SLIA 1H30A 3HBWA 2ERMA 1WD4A 1VAMA 1J0SA 1LHVA 2AR6A 2W68A 2ET2A 2M49A 2YY1A 3T1MA 3MW2A 1IS4A 3KM5A 4AVVA 1GYKA 2D24A 3VEQA 3Q9OA 3B9CA 3DGTA 3ATGA 1IT0A 2WSUA 4LBQA 1E0OA 3FUQA 3NBDA 3O0WA 1NLSA 1ULCA 4GWMA 3P6IA 4D0TA 1FV3A 4FPLA 1QU0A 3O4OA 3AJ5A 4PQ9A 3WG2A 4FPYA 4QO3A 1Q8OA 4OW4A 1Q8QA 3RTJB 3BRGC 2D7RA 1T9FA 1K5UA 1JUIA 1FV2A 1JQZA 5H9RA 1S0CA 3OY8A 5CB7A 5FNWA 3ZXFA 4ZLBB 4LO2C 1EPWA 3FBYA 1BASA 4OUJA 1BQPA 4LBQD 1CJPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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