3HN1A

Crystal structure of hcr/t complexed with gt2 and lactose
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
450
structure length
442
Chain Sequence
NLDCWEDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium tetani
publication title Gangliosides as high affinity receptors for tetanus neurotoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tetanus toxin
total genus 118
structure length 442
sequence length 450
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 2009-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3hn1A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3hn1A02
1GLHA 4K20A 2ZGOA 3AZZA 3O12A 5FRAA 4AWDA 3PG0A 1LECA 3NV1A 4UW6A 1XYFA 4DS0A 1JW6A 2DYCA 3O5SA 1WUVA 4XJ8A 3ILNA 4Y1ZA 5F8WA 1AFCA 1BFFA 1R1ZA 2D7FA 1QNWA 4P0LA 3AZXA 4I96A 1Z78A 1MVEA 5DUVA 1S0BA 2E51A 4LBQA 1FMZA 5F5QA 3FJEA 2A6VA 4GXLA 1D0HA 1N47A 3AKIA 3AX4A 1DBNA 1W3GA 1YF8B 2DREA 1MACA 1MR5A 3ILFA 1F5FA 1A8DA 2EALA 1LOEA 1SACA 1JT7A 1FGAA 1SLIA 2G4IA 5DG1A 4HL0A 3HMYA 5DUXA 4DPNA 2KKIA 1IT0A 3OY8A 3P53A 3NWKA 4ZBVB 1VAMA 1Z2VA 4WZFA 5E8AA 2AYHA 3B9CA 2ZMNA 4EFRA 1WBCA 4P14A 2ZACA 3ZXKA 4GP3A 1YIFA 5BP5C 4WBCA 4IQPA 4QKSA 1S0GA 3VKOA 4QC4A 1XQNA 2K43A 4XJUA 7I1BA 2ZZJA 2GMEA 2EXKA 1N1YA 2WQZC 5GJ6A 2XOAA 1D2SA 1DYKA 5E88A 1MC9A 2ZGLA 2FFVA 1ONAA 1C57A 2C5DA 4XZPA 4OWKA 1S0DA 3I8TA 1CJPA 2A5ZA 3PJQA 1Y7BA 4I4VA 2ZGMA 4FQ4A 3TC2A 2Y9GA 1W6PA 4Y20B 3O4CA 1GGPB 1Q1UA 1Q03A 1AXKA 5EC5A 1LENA 2PHRA 1DQ4A 1K5VA 4QALA 3FJBA 4L8QA 5BXRA 3Q9OA 5GZGA 2D22A 2DVBA 2J3PA 4JC1A 2LIEA 1EYLA 1DZDA 2MLLB 3OJ2A 2KLLA 4R9CA 2PHTA 3N36A 1OQLB 2NMNA 4YM2A 1BASA 3BRFA 2ESUA 2RHPA 2UWAA 2JE7A 1BLAA 3IPVB 4OEFA 4XKIA 1AVUA 2E53A 1QOSA 3D4KA 1QKQA 2ZGQA 2JKBA 3WG3A 1WW6A 4PC4A 2VSEA 1CONA 4I2SA 2FO1A 4FPHA 3AJYA 3BOPA 1B09A 3BRGC 2EIGA 5GALA 3I29B 4I4UA 4R9DA 1QOOA 4LO0C 4LO2A 4F83A 4WV8A 3OJBA 5IK5A 4XHBA 4YM0A 3AYAA 3PVOA 3AYDA 3RTJB 1S0FA 3RQ0A 1XHBA 2YXSA 1IJTA 1WW7A 2YY1A 4Q91A 5H9QA 4R9BA 1ABRB 1N1SA 5GLVA 3AKFA 1W6QA 2HZ9A 2GNTA 4Y26A 1GZWB 3VEQA 4WVVA 1F31A 5DSSB 1OKQA 2RG9B 3LLPA 3JU9A 1I3HA 2IWTB 2CNAA 1EVTA 1S0IA 5DUYA 4XMAA 4HJJA 3Q7XA 2E6VA 3H6RA 4PBPA 1C1LA 2F2FC 1II4A 3NBCA 3HR9A 2ET2A 5F8SA 9ILBA 1TFMB 2SLIA 4LO8B 4FOQA 1KDKA 3M3QA 1QDOA 1CESA 1ISXA 3LCPA 4GP0A 3POYA 1W6NA 4J2SA 3ZC9A 1U0AA 1XZZA 2NN8A 2DVDA 3WOGA 3UJ4A 1DIWA 4LO3A 4FPEA 3FJCA 2D7RA 1KQRA 2ZHKA 3M3EA 5BXSA 4Q1PA 3WNXA 1FATA 2WJSA 4IONA 4PBOA 5T55A 4XBLA 4R6UB 1DQ6A 5H9RA 3UJ0A 1V6LA 3JRRA 3I2AA 1LOGA 3ZPYA 1K5UA 5HCAA 3MW4A 5IT6A 3ZXEA 3O4AA 2FMDA 4XXPA 1UKGA 3SITA 3RTIB 2WKKA 5DVHA 3ZX7A 4M3CA 1PUMB 1ONKB 3PVNA 1IKQA 1IKPA 4KEJA 4QBVA 1LJ7A 4G6MA 4D69A 2DVFA 2C9AA 3AXDA 1GZCA 3UL2A 1RG8A 4YOLA 2VW0A 2DURA 5T5JA 1ISVA 2Y9XE 4XJ9A 3FLRA 3WV6A 4AN6A 3CA3A 1AJKA 4A7KA 3UJOA 4ZOTA 3KQRA 1MZ6A 1SBDA 4K1ZA 4GAIA 1Q8OA 2GNBA 1LU1A 3AP7A 1RINA 1G86A 3K1XA 1BFCA 4U36A 3LSDA 2RSTA 1I1BA 1X50A 1Q8SA 4P9XA 2WNEA 4LBNA 4Y1VA 1LEDA 2D1ZA 5KXDA 2HWMA 2ZQOA 1W6OB 3VSZA 5E24E 3FLTA 2D3RA 5JVVA 3POSA 2NP0A 3POKA 4FPKA 3WDYA 1HQLA 4Q2FA 3BTAA 3OYWB 1T4QA 3W59A 3UDAA 2WT2A 2ZA9A 2GNDA 5EWSA 1LHUA 5T54A 3MPPG 1DQGA 4C1WA 1PZ9A 4AGGA 5JOWA 4XTMA 3AJZA 1L2HA 1V00A 3IM5A 1QQKA 1UL9A 1PZ7A 1G9FA 4L4IA 3POWA 2JECA 2ARXA 4AVSA 5AVAA 5IUQA 4OWJA 2P3KA 2E7QA 4YZ1A 2OUHA 3BA7A 4J2XA 4YGCA 1DQ2A 2ZGSA 4I8MA 3WMUA 2R49A 1JBCA 1N3PA 4I4PA 3O3QA 3WG2A 2PHFA 4AVVA 2JE9A 1DQ1A 1JT3A 1AXYA 1MD6A 4EEEB 4IY8A 1IOBA 3AZWA 1AVXB 4G1RA 3WMVA 3IAGC 2P3JA 3HALA 1V6UA 2NTDA 2A3YA 3USUA 1ZM1A 4PQ9A 1WW5A 4GWMA 3R05A 5JDBA 2QYIB 3T1LA 3FBYA 4FPOB 2YROA 4X38A 1VAVA 3GNEA 1CR7A 1S0EA 5FNXA 4X3AA 4X37A 2LIQA 1DFCA 1SBFA 3PHZA 1CVSA 3Q7YA 4LO1A 4I30A 4FOVA 3IN9A 2UU8A 4JCKA 3SH5A 4I1BA 2LTNA 2YUGA 1G7YA 2SBAA 5H9PA 4C1XA 1LU2A 2DS0A 1F9KA 2UWBA 1AXMA 3CQAA 1KITA 2XG3A 3OJVA 4II0A 2ERFA 4IY9A 3O4OA 4ZFUB 2AAIB 1G9AA 1SCRA 3AP4A 3B69A 5JLVA 2ZGUA 1SLBA 2D6PA 4CRQA 1FMMS 3AZVA 4BQ1A 3BB2A 3V0AA 4ATEA 1YYNA 3A0KA 1CPNA 1MS5A 4BPZA 1ISYA 1TP0A 3IM7A 4JAWA 2VSAA 2FDBM 1HIBA 1SR4C 4YG6A 4HR6C 3ENRA 5GZEA 2Y9WC 5FZYA 4BM8A 3AJ5A 3VT2A 1G8WA 1MS8A 1ULDA 3WDXA 1DQOA 2P3IA 3OJMA 5F8YA 4LBJA 5BYNA 4AN7B 4YFZA 1DZQA 2Q5TA 3AP5A 4I4XA 2D6KA 3WCSA 4YM1A 4H9WA 5G00A 1EPWA 3CA0A 1LGNA 3VV1A 3NV4A 4YFWA 1MZ5A 2TEPA 1UN1A 3W9TA 3C2UA 4ITCA 4JKXB 2BEAA 1GANA 5BQUC 3A4UA 1FWUA 5JMCA 2KH2A 2A6ZA 2WT0A 1BXHA 2EXJA 1VCLA 1URXA 3VUOA 3BX1C 4I4OA 3WG1A 1ULCA 2E4MC 1MS0A 1V6JA 2W39A 1JTCA 4JQ0A 2GNMA 3CNAA 3V79C 1DGLA 3M3CA 1BYHA 4M01A 4ZFYB 1KDMA 2DRYA 2CYFA 3WUCA 1LEMA 4M3CE 1S1AA 3DUIA 1C1FA 1HWNB 1N1VA 1O4ZA 2Z49A 2YV8A 3D5OA 4M3CF 1JXNA 5CA6A 4RA0A 4H55A 4RL7A 3RS6A 1W0OA 3VKNA 1AF9A 3QYDA 2GMMA 2CL2A 3PUBA 2EF6A 3BADA 1YXWA 3APBA 1LGCA 3O0VA 3PVEA 2WSUA 4ZFWB 4D0TA 2VW1A 2DU1A 4YW1A 3RSJA 4DEPA 3OBRA 3ZXFA 4ZGRB 3B00A 4YZ2A 5BXPA 5T5PA 3N35A 5JOYA 4AVTA 3MALA 1RZOB 2RQ9A 1LGBA 4LBQB 1TEIA 1FN0A 3AXEA 4KC3A 1YRZA 3R4SA 2IHOA 4Z8BA 3FJJA 3FJ8A 2R0HA 2VXTI 1MS4A 4ATFA 1BA7A 4K1YA 3V0AB 2VUAA 1IHKA 2PHWA 5B2HA 1LHNA 4YZ3A 4I4YA 2R1BA 3VKLA 4DCKC 3H6QA 3ZSLA 4I1EA 2F8XC 1AVWB 3ZXJA 1LULA 3WDUA 4G6JA 2P2KA 1BFGA 2UWCA 4XIKA 1PUUB 1QF3A 1HKDA 2OW4A 2L5XA 4XHXA 3OY8B 1GNZA 3WO4A 3C9ZA 4JPZA 1HDKA 3AJ6A 3GALA 1IS4A 4UW3A 2KI6B 3FJ9A 3ZSKA 3WINA 3LTQA 1YO8A 4Y22A 1AXZA 2Q9XA 3D7WB 1GNHA 4GOVA 3NV2A 1W6MA 1UPSA 5DZGA 2D3SA 4GKYA 3A07A 2CWMA 3ILRA 4DRRA 2PHXA 3AKHA 3WLUA 1OFSA 3ILAA 4BMBA 1GICA 1RIRA 2VH9A 2HW9A 1AVBA 1VLNA 2ZHLA 4Q9PA 2ZGPA 2UURA 2A70A 4AGRA 1V6XA 3V0BA 1I1EA 1LOFA 5KXBA 41BIA 8I1BA 2FGFA 3WO2A 2D44A 4DRVA 1DQ0A 2GN7A 4QO3A 2P34A 1W6PB 1JT4A 3ZXDA 3FUOA 2PHUA 1RITA 3AFKA 1TIEA 4I4QA 5KXCA 1A78A 3INAA 1JY0A 1LOCA 3HN1A 3FJDA 2CTVA 1SLCA 1XG6A 3AYCA 4JRAA 1N1TA 1AZDA 1QOTA 2Z48A 4OUJA 4KEKA 4I6IA 2AFGA 1T9FA 4XBNA 2W08A 2V5YA 4U2AA 3AP9A 2AGSA 4G9NA 2K8RA 1WLDA 1KJLA 5GZDA 4W65A 4DFSA 1O4YA 4XBQA 5T5OA 2UUSA 5BXTA 4G9MA 3AH1A 1BJQA 2ZABA 2P37A 1DLLA 2E7TA 2K4AB 1SLTA 1CIWA 2JJ6A 4Y24A 1S0LA 2D3PA 1EV2A 2A3WA 3NBNA 1UZZA 2NYYA 1AX1A 3M2MA 4XXAA 1ZA4A 1W3FA 1RY7A 1GZ9A 1J1TA 4Y1YA 5T50A 1ISZA 4CJMA 3JUUA 5FREA 4XJWA 1DJSB 1LESA 2WLQA 3NBEA 3B3QE 4J23B 1WW4A 1HCDA 1JYIA 1ENSA 4P9WA 3A21A 4XOGA 4OW4A 3KMVA 4YW2A 1W6QB 2OVUA 1FNZA 3DGTA 3P6IA 5BP5A 5DG2A 5I1BA 2WSVA 6I1BA 1G9DA 1PZ8A 2GN3A 1M16A 3S8JA 3OGGA 4HA2A 1LHOA 5F90A 3SH4A 1MVQA 4LBOA 1ENRA 2ZKNA 3H6RB 3HOMA 1LOAA 3ASIA 1Q8VA 5T52A 1HCEA 3B01A 2A71A 2I1BA 1IS3A 2ZAAA 4Y1XA 2Y9FA 3O0XA 5BOWA 4P9YA 2ENRA 3MEPA 4ISRA 3CRHA 2D6NA 2ES3A 4IHZA 5EG6C 1Q8QA 3N7LA 3A23A 1W6NB 4LO2C 1HWPB 3E8LC 3ZC8A 2KM2A 2ZGNA 2ZQNA 3RMXA 4FVVA 4Q9GA 1MS3A 4XJAA 1WLWA 4A7YA 3RRDA 4ASMB 1QQLA 5CAZA 1PZZA 3N3HA 3NJ5A 3A0NA 3ZSMA 4QKRA 2W52A 3BIWE 3QR5A 4IZXA 2MC2A 4JP0A 4Q8LA 1TWEA 2V73A 4Y1UA 4AGVA 5EXOA 1M2TB 2R1DA 1WD4A 3T2TA 2A6XA 4P0KA 2XB6C 3WCRA 5GLUA 1SCSA 1TOOA 3OGFA 2R9KB 4MYEA 4P6AA 1WD3A 3WDWA 2WBCA 4M3CB 3HSMA 3N7KA 3ZSJA 3CA5A 3S8KA 1V6IA 2FFUA 4I3NA 4F34A 2VY0A 3CA6A 4LO7B 2D24A 2DWRA 3F62B 3FJHA 1QDCA 4EB2B 4Q1RA 1GBGA 3P6JA 4Q26A 2W68A 1V6WA 4LO0A 1C4RA 3WDVA 3WDTA 1TWMA 4Y20A 2EXIA 2AH2A 2D23A 4FPCA 2D6OX 2X2TA 1PWAA 3V65A 4ENDA 3O5WB 4LO3C 1GYKA 3RG0A 1CQ9A 3FJFA 1SBEA 2AENA 1AVAC 3IMNA 4LBKA 1GKBA 4K21A 2WT1A 2ZBJA 1MS9A 1W0PA 4P0JA 1FX5A 3VSFA 1ISWA 4BLIA 3O4BA 1Q56A 2KI4A 3NV3A 2DTWA 1CPMA 4R9AA 4IYBA 4XFUA 1QMJA 1Q8PA 4SLIA 2I2SA 4Z8SB 4I4RA 1WBLA 4YM3A 1RMLA 1FNYA 2ZGKA 2EAKA 1IS5A 1JLXA 1NZKA 1HLCA 4TYSA 1QU0A 3IPVA 1SLAA 1KJRA 2X2SA 4I4SA 3BAGA 1CVNA 3I4IA 3WUDA 2F2FA 5D63A 3AKGA 3UD8A 1E0OA 2ZGRA 3N0KA 3WZ1A 3UD9A 4GA9A 2DVGA 4LO7C 1UZYA 4FOWA 4FPYA 1HWMB 1NXD1 2ZMKA 4PF5A 3BA5A 4UW5A 1ILR1 3ZVXA 4D0ZA 4YW3A 4UW4A 2NVHA 5HCBA 4XILA 4XE9A 4BOWA 3CRGA 2GZBA 2AR6A 3R4UA 4BLJA 2WRYA 1UMZA 4XIOA 4YLZA 5BVPI 3UK9A 5GLZA 2D6LX 1SFYA 1G82A 4HANA 3ATGA 1DHKB 5IK8A 3SH3A 3I2XA 3U4XA 4FPJA 3ZYPA 2P39A 4KEIA 1P63A 4Q8KA 1GZWA 4I37A 4Q27A 1N3QA 3CRIA 3UJQA 4FPFA 1QNYA 2AQZA 3FJIA 2A7AA 3BAHA 4X39A 1JOJA 3USUB 1FV3A 4ZA3B 2R16A 5DZEA 1V6MA 1WLCA 1DFQA 2GALA 5GLTA 1JHNA 4NOTA 5F9TA 3FLPA 1GV9A 3D6EA 2DUPA 1BQPA 3FJAA 5DUUA 1DYPA 1AJOA 2MIBA 4DQAA 2QN4A 5GAQA 1AX0A 3M1HA 3M3OA 3AYEA 2PELA 3Q7WA 2A75A 3NBDA 1VIWB 1VALA 4EKXB 3ZXGA 4H04A 1IRAX 4XMIA 3N7MA 3QLQA 1LHWA 1G9CA 3QCWA 5E89A 1HQWA 4GKXA 3CA1A 4J2YA 3L2YA 3ZYRA 1APNA 4LBMA 2R0FA 4CZSA 1GSLA 2AXMA 1SZ6B 3AK0A 1MS1A 4YGDA 4EFPA 4OWLA 5HPZA 2DU0A 1CE7B 1WBAA 1KRIA 3BAVA 2NZ9A 1WCSA 4GWNA 4FPGA 2A6YA 4A7ZA 2ZR1B 2DVAA 2HWAA 2H0BA 3MW3A 1SLLA 3RMYA 5T5LA 1KNMA 5CB7A 3O0WA 2GMPA 5H9SA 4WVWA 4LO1C 2YMZA 1FYUA 4GALA 3WA1A 2YZ4A 1R8OA 2DUQA 2FHRA 1BKZA 3V64A 5GZCA 4XJZA 2GO2A 3WHUA 3IM6A 2JD4A 1W6OA 3BAUA 3WHTA 5SV8A 3ZXLA 1PC8B 1OQ1A 3AH4A 4YZ4A 1FAYA 5JOXA 3BA4A 3SNVA 3IM0A 3BODA 4Z9WB 3OYWA 4JKQA 1FV2A 1JYCA 3VWCA 4TZDA 3CA4A 1H9WA 4D8HA 1YBIA 4BMEA 3B9UA 4YG3A 4YW5A 5FZUA 3T8SA 1BFBA 3IIRA 1ITBA 3VKFC 2CY6A 1R8NA 2EXHA 1H9PA 4FP3A 3BAOA 1JQZA 1HKNA 4QD2B 2VXRA 2NMOA 1NUNA 1G9BA 3H6SE 3FUQA 4YZ5A 2HYKA 2GDFA 1V6VA 4FPLA 2BFHA 1ULEA 2OUJA 3EF2A 3SISA 2Q3NB 1J0SA 3O44A 1IS6A 5LK5A 1FQ9A 1A3KA 4LBQD 2M49A 4QBCA 2DUOA 4LBLA 4I0YA 4IZEA 3CAHA 1NLSA 4XTPA 4J2KA 3VT0A 4YGBA 1SR4A 1S0CA 4M00A 1UX6A 2ZHMA 2LALA 3JUTA 1TTUA 4PCRA 3HBWA 5HCFA 1JT5A 1IOAA 5IK7A 1N3OA 1UAIA 1QGLA 2ZGTA 4EFQA 1ULFA 3WO3A 3VT1A 4XFSA 2AUYA 2AREA 2D43A 3BRDA 1LODA 2DV9A 2JDZA 1BLDA 5DZFA 1H30A 3T1MA 5FNWA 1W3AA 1HWOB 5EHAA 1N4KA 5DUWA 2P23A 3WVJA 3IKWA 3LSEA 4Y22B 4XYXA 1CN1A 4ZKTB 1V6OA 1YTOA 4TLPA 1W6MB 3AP6A 2ARBA 2DTYA 4QD2C 4YW4A 5EYYA 2D7IA 5BQUA 3OBTA 3W58A 5L73A 4FQZA 1IRPA 2E4MA 1IILA 4ZLBB 4YGEA 1AX2A 2ZHNA 31BIA 4OZXA 4GAFA 3F1RA 1JLYA 5EYXA 1Z4SA 4ZXKA 1FWVA 3O49A 2D20A 3AH2A 2BEBA 3V0BB 1JN2P 2ZMLA 2VW2A 1LOBA 5D61A 1YI7A 1DQ5A 3AZYA 2A6WA 2BQPA 2VLCA 3O4DA 3FGMA 1LHVA 1ULGA 3OPZA 4NO4A 4OEGA 3BAQA 1S0JA 2Z42A 3UD7A 1ENQA 4USPA 4FOYA 3KM5A 2A3XA 4I7IA 3FFZA 1LTEA 1DZCA 3TB0A 2ERMA 3WG4A 4FGFA 4L4HA 3N7JA 5DXDA 3TAYA 3A22A 1JUIA 1BARA 3FJKA 2DRZA 4YG0A 4CTEA 3CU1B 4OEEA 21BIA 3WINC 4AYUA 1LCLA 2CWSA 5GLWA 5FZZA 1BZWA 1Z0HA 5KXEA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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