3HN1A

Crystal structure of hcr/t complexed with gt2 and lactose
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
450
structure length
442
Chain Sequence
NLDCWEDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Gangliosides as high affinity receptors for tetanus neurotoxin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium tetani
molecule keywords Tetanus toxin
total genus 118
structure length 442
sequence length 450
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 2009-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3hn1A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3hn1A02
3DUIA 1JT5A 3VKMA 3QR5A 1BARA 1PZ9A 2ENRA 1V6UA 1KNMA 3H0OA 2GNTA 3FLPA 2JECA 5F5QA 1N3PA 1PC8B 1ENSA 4GKXA 4FPLA 4IY8A 1JY0A 1DHKB 4GOVA 4LBQD 2TEPA 3OPZA 1RZOB 4IQPA 3WO3A 1AVWB 4X39A 4YM0A 2QYIB 2GNBA 3O3QA 4BLJA 5HCAA 1W6NB 1HDKA 2ZGTA 3WMVA 2VLCA 2MIBA 1SCRA 5DZFA 3FJJA 1BFCA 1S1AA 2ZZJA 4YGBA 5BQUC 4EFPA 3T2TA 1U0AA 3KM5A 3HOMA 1S0JA 1HWOB 3WDXA 1JYCA 1ULCA 2LALA 1JT7A 1ENQA 1PZ8A 3UDAA 1TP0A 3VT2A 2PHFA 3I2XA 2D6MA 2ZBJA 1DQGA 3IM7A 1LGNA 3PUBA 4ZGRB 4LO0C 1DFCA 5JMCA 3B9UA 2ESUA 1AFCA 1DFQA 2ZHLA 3ZXEA 4YGEA 3TC2A 1PZZA 1CESA 2PHTA 4OZXA 5DZGA 1P63A 1MS9A 3IKWA 4Z8BA 1JT3A 3Q9OA 2WSUA 3BIWE 4FPYA 1Q8SA 3KQRA 1DJSB 4DQAA 1JTCA 5JDBA 4ITCA 3NJ5A 4WVVA 3CA0A 4M3CB 1W6OB 3AXEA 1MZ5A 4OW4A 1YYNA 3V0BB 4WZFA 2D44A 4FP2A 5EYYA 4Y1ZA 2IWTB 3A0NA 4J23B 3O4OA 2EIGA 5T50A 1RIRA 1WBAA 2JKBA 2GZBA 2BEAA 1G86A 1UPSA 3RRDA 3AJZA 3ZYRA 4J2KA 1W0OA 5EYXA 2ZGQA 1KJRA 5F8SA 4QALA 1W6QA 3A07A 4AYUA 2ZQOA 5IT6A 4Q8KA 1WW4A 2VXRA 4L4HA 3BADA 4DENA 3BAGA 1LODA 4JP0A 2GMPA 4I96A 2Q9XA 1KJLA 4Y26A 3UL2A 2FDBM 4YZ5A 1UZZA 3BA7A 1V6WA 3I4IA 4SLIA 2VW2A 1V6NA 2EXHA 2ZGPA 2WKKA 4YOLA 2X2TA 3BAVA 31BIA 3FFZA 1WD3A 1LOFA 4FPHA 1MACA 3PG0A 3AKHA 1WW5A 4XFSA 4XBNA 2DRZA 1TTUA 2A3YA 4HA2A 1APNA 4USPA 2JDZA 2ZMLA 4GAIA 3ZXGA 3RG0A 1TWEA 1ISWA 4JAWA 3O0WA 1PUUB 2DUPA 4PBOA 4C1XA 4OWLA 4YW4A 5JLVA 5JOXA 5GZFA 1I1BA 2B7YA 1IJTA 1JOJA 4P9YA 3WOGA 4YM3A 4XBLA 1GZCA 3ATGA 1GLHA 5T5JA 2L5XA 2P34A 4XJUA 4FGFA 1JHNA 4I0YA 1Q56A 5KXEA 1FGAA 1V6JA 3OBRA 2VSAA 1BZWA 3FJAA 1LHUA 4A7KA 3TAYA 1SR4A 1IKPA 5DZEA 2ERFA 2C9AA 2ZHMA 1MS4A 1DQ1A 1WBFA 1Q8OA 2ZGNA 2DU0A 5IK7A 3V65A 4YZ4A 2ZGKA 1NUNA 1VAVA 1CVSA 4GXLA 4BPZA 3MW2A 2CWMA 2DU1A 1XYFA 1G9CA 3VSFA 4DS0A 3KMVA 1G9AA 1R8OA 4JCKA 1AVUA 1W3FA 4FPOB 1VCLA 3ZVXA 1W6QB 4KEKA 1HWMB 4GKYA 3ILRA 3WV6A 1Q8QA 4TLPA 2KKIA 4LBKA 1X50A 3M3QA 4YW3A 4YW1A 3ZXKA 3H6RA 3AP5A 4RA0A 4OWJA 5DUVA 2D24A 1VALA 1ENRA 4W65A 3RTJB 1QU0A 4YZ2A 3ILAA 1YF8B 2Z48A 4GA9A 1UZYA 1AXMA 4I1BA 2SLIA 2DV9A 3CA1A 3OGGA 3SISA 4ATEA 1V6OA 4XJ9A 4X37A 1LOFC 2AFGA 4Q1PA 3PVEA 3AH2A 3VEQA 1DIWA 5FRAA 4GP0A 2VUAA 2HYKA 4BMBA 4LBJA 1WBLA 4ISQA 1EPWA 1FATA 3IM5A 3ZSJA 3O44A 4K21A 2EXIA 1KDMA 1G82A 4Q9PA 2ZGOA 3WO2A 1OKQA 2KH2A 2PHXA 5D61A 1UAIA 5BXSA 2DREA 1AVBA 2KI4A 1ULDA 4I4QA 2FO1A 1O4ZA 3N0KA 3PVOA 1DGLA 1CN1A 4XKIA 3PMEA 1FWUA 4FVVA 3WA1A 1IHKA 5G00A 2DVGA 2UWBA 3H6QA 1IS6A 2UWAA 4GALA 2W68A 4Y1YA 3IM6A 1LOCA 4TZDA 1AVXB 2V73A 1YIFA 3VUOA 4AVTA 1KRIA 1HKDA 4QC4A 1V6IA 4FPCA 4QKSA 1N4KA 3BAUA 5DUYA 4I7IA 2A6ZA 3H6SE 3S8JA 1YTOA 3AXDA 1Z0HA 3NBCA 2D20A 1SZ6B 1J0SA 1MS0A 1FQ9A 1A8DA 1L2HA 1DYKA 3O4DA 2XOAA 1KQRA 1AXZA 1IS4A 3I29B 1WCSA 1I3HA 4OWKA 3I2AA 3NBDA 5L73A 3BB2A 1D2SA 4LO1A 3SNVA 4A7ZA 5T5PA 1V6LA 3H6RB 2R9KB 1RMLA 3QYDA 2UURA 4LO7C 5GZGA 4YGCA 3I8TA 4I4OA 2WQZC 3RMYA 3O5SA 3ILNA 3AYDA 4R9BA 2HW9A 1GBGA 2J3PA 4DPNA 2MC2A 1GGPB 2CL2A 4XTPA 2D6PA 1SLBA 2CY6A 4YFWA 3Q7WA 4IZEA 2DWRA 1G9FA 5FZZA 2AQZA 3T8SA 1MVQA 3AZWA 1SLLA 2D1ZA 3AP4A 5FZYA 1V6VA 7I1BA 2W52A 3INAA 4XJAA 1H9WA 2OUJA 5BXPA 1UX6A 4AVSA 2D3SA 1BLAA 1DZQA 1QNWA 3LTQA 1MC9A 2FMDA 4TYSA 1G9BA 3B69A 1N3OA 1GZ9A 1JN2P 1QQKA 4P9WA 4FOVA 4WBCA 1YO8A 3U4XA 2PHWA 1S0BA 2R0HA 2RG9B 3WDWA 2VU9A 4FPJA 4BQ1A 5CAZA 2H0BA 4UW4A 3FJHA 5FNWA 1HCDA 2ZKNA 1W6MA 2ZAAA 1GNZA 3BOPA 1Z2VA 4DEPA 3AYAA 1QXMA 3VKOA 2E4MA 1I1EA 3W9TA 3FJKA 5I1BA 5BXRA 1FV3A 4QO3A 5HCBA 5GZCA 5AVAA 2AH2A 4XXPA 3AFKA 1Z4SA 4RL7A 4D69A 1LOGA 2QN4A 5DSSB 1FNYA 3OJBA 3POYA 4H9WA 2XG3A 3MW4A 1NZKA 4Q27A 3WINA 3POSA 1XHBA 3V0AA 1ISZA 1WW6A 2BFHA 4AN6A 3NBEA 2W39A 3CRHA 1R8NA 2DTWA 1XG6A 1OQLB 1LHNA 5GLWA 1ONAA 4AN7B 3OY8A 2DVBA 4IY9A 3BRGC 1JLXA 1Q1UA 2PHRA 4Y1VA 4AGRA 1TFMB 1EVTA 1WLDA 1CPNA 3ZPYA 1Z78A 1LEDA 1NXD1 1BFBA 4K1ZA 3BAOA 4ZXKA 4FPKA 2P2KA 1QQLA 4D8HA 1N1TA 4IYBA 5T52A 3HBWA 5H9QA 2EXJA 2CTVA 4FPFA 3FGMA 3EF2A 3S8KA 3VSZA 1YI7A 1HWPB 1CJPA 3BA5A 2DURA 3WZ1A 3HR9A 1Q8PA 4Q1RA 1MVEA 4NO4A 2GO2A 4XOGA 1BQPA 4P9XA 5BXTA 3V64A 1FAYA 4YZ3A 3NV1A 2A75A 4Y1XA 3T1LA 3FJBA 2FFUA 3TB0A 2A6WA 4C1WA 4I4UA 4CTEA 2Y9WC 4PQ9A 3FJ8A 1W6MB 1DZDA 2E4MC 1IT0A 1T9FA 2ZGMA 1WD4A 2IHOA 2JE7A 1SBFA 3B00A 4XFUA 3CU1B 4I30A 3Q7XA 1BYHA 2FFVA 3D7WB 1QKQA 3FJEA 1UL9A 1C4RA 3WCRA 4LO2A 4KEJA 4GWMA 2HWAA 3AYEA 4ASMB 5DUXA 3WINC 4M3CE 4OEFA 2R1BA 1DBNA 3RQ0A 5F8YA 4KBBA 21BIA 4I4VA 3V0AB 4WV8A 2GMMA 4LBMA 5GLUA 3OGFA 4LBQA 1PZ7A 1QOOA 2CNAA 4XIOA 2K43A 4Q8LA 3BODA 2VXTI 2AR6A 1IRPA 4YGDA 5CB7A 1DQOA 1FWVA 3ZSKA 3JRRA 4CRQA 2LTNA 4LO3A 5DG2A 4ZKTB 4P0JA 5GJ6A 3OY8B 3LSDA 1K5UA 4Y24A 3ZC9A 3T1MA 1VAMA 4ZFUB 1IILA 4YLZA 3DGTA 3UJOA 4Z9WB 2P3JA 3HN1A 4JRAA 2NYYA 4J2SA 4ISRA 1F31A 1N1VA 4M3CF 3FJCA 2ZACA 5BP5A 4QKRA 1ULEA 3AK0A 4FQZA 1KDKA 3ZXFA 1QDOA 1W6PA 1BLDA 5BVPI 1F5FA 1GNHA 3AZZA 2WSVA 4ZFYB 4H04A 4D0TA 4ZOTA 1A78A 1LHWA 5EXOA 2W08A 4XTMA 2WBCA 1AXKA 4M01A 2AXMA 5DUWA 5IK5A 4DFSA 3CA5A 4GWNA 4XFTA 1MR5A 2AENA 4YG6A 5IK4A 2DUOA 1LOBA 2WT0A 1M2TB 3BX1C 1SFYA 2Q5TA 3JUUA 1C57A 1Y7BA 2CYFA 1HQWA 1VLNA 3UK9A 2D6KA 3WDVA 2EF6A 1TOOA 3AJYA 4LO8B 4HR6C 1E0OA 4J2XA 1AF9A 3HSMA 3A22A 1ULFA 1M16A 4EFRA 1C1LA 3ZXLA 5DXDA 3CAHA 4Y1UA 4ZA3B 5KXCA 1AJOA 2Y9GA 8I1BA 1LU2A 1ISVA 2ZQNA 5T5LA 3WHUA 3V79C 1QF3A 4BLIA 2A5ZA 4LBQB 1LOAA 4Y22A 3NWKA 4DCKC 5FREA 4XILA 2UU8A 3RS6A 1LEMA 4XXAA 1RG8A 1RINA 4XHBA 1XQNA 3VKFC 1HQLA 3AH1A 4FPGA 5EC5A 1WW7A 1JUIA 2GDFA 5EWSA 4I4YA 2E6VA 4HANA 1LOEA 1BFFA 4I2SA 3B01A 2YMZA 2Z49A 4UW6A 1XZZA 3BRFA 2P3KA 1S0DA 2M49A 2UUSA 4CJMA 3ZXJA 4JC1A 3WNXA 2KLLA 4YFZA 1URXA 1MD6A 4OEEA 1C1FA 4YZ1A 5D62A 3ENRA 3WG2A 1ZA4A 1S0CA 1SR4C 3N7JA 3RSJA 1W3GA 2A6XA 4M00A 2GN3A 1FYUA 1W6PB 3R05A 4KEIA 3NV2A 2D6NA 3A4UA 1G8WA 1GANA 2ZMNA 3O49A 3F1RA 1DQ5A 2E51A 1WUVA 3NV4A 2A7AA 3HALA 2UWCA 3FBYA 3WG4A 3OJVA 1QMJA 1HIBA 1LGCA 1SLCA 1QOSA 4IONA 5JOZA 1UN1A 1IOBA 5BOWA 4K1YA 4LBNA 5FZUA 1ONKB 2EAKA 4GOYA 1CIWA 2WT1A 1SBDA 2E7TA 1R1ZA 5T55A 3CA4A 4OEGA 1KITA 5BQUA 1LHOA 4AGVA 4IHZA 3FJFA 3RMXA 3AZVA 1AZDA 4LBLA 4UW3A 4P6AA 1TEIA 4P14A 2EXKA 4I1EA 3BAHA 2GMEA 1SLTA 1LGBA 4P0KA 5H9RA 2E53A 4Y22B 1AX2A 2C5DA 4ZBVB 3IAGC 3UJ4A 4XIKA 1YRZA 2GALA 1N47A 2GNDA 5GZDA 5CA6A 2YUGA 4G6JA 1AJKA 4HL0A 1N1SA 1BJQA 3M3EA 2BQPA 3O4CA 2OVUA 1VIWB 4I6IA 3BRDA 2OUHA 4JQ0A 5HPZA 5CBLA 4R9DA 2DYCA 1UMZA 2YY1A 3Q7YA 3VKNA 2AAIB 2NMNA 4R9CA 4I3NA 2PELA 1MZ6A 3O12A 2FHRA 1BKZA 4L4IA 4USOA 5KXDA 1GICA 1QGLA 1IOAA 4EEEB 1WLWA 6I1BA 4QD2C 3SLIA 5E24E 1N3QA 1FMMS 4QD2B 1Q8VA 1AX0A 4BM8A 2RQ9A 3AJ5A 5GZEA 1JQZA 4IZXA 3PVNA 3CA3A 4GP3A 1LJ7A 4EKXB 1JXNA 1S0EA 2EALA 2PHUA 4ENDA 2NN8A 4BMEA 5BYNA 3BA4A 4QBVA 1V00A 4YW5A 1A3KA 2ZGLA 4LO1C 1FX5A 3R4UA 1GV9A 4XE9A 1JLYA 5GAQA 1GKBA 3MEPA 2A70A 3ZSMA 1EV2A 1MS5A 4OUJA 4WVWA 1ITBA 4FPEA 1DQ2A 4YG0A 4EB2B 3FLTA 1RY7A 5JVVA 3AJ6A 1GYKA 3CRIA 3AP7A 4Q9GA 1LHVA 2P23A 4KC3A 1ZM1A 1V6XA 1BFGA 2ERMA 2D3RA 3W58A 3WCSA 4Q26A 2VSEA 4QBCA 5E8AA 2R49A 2Z42A 3O4BA 3AKFA 1DLLA 1YXWA 3O5WB 1GSLA 2ARBA 2K4AB 3ZX7A 2DVDA 2WRYA 3WG3A 2D43A 3UJQA 1LESA 4Q2FA 4XJZA 1TIEA 2DVAA 4XJWA 4G6MA 3BAQA 2ZA9A 3M3OA 3FJDA 1DQ0A 3JU9A 2KM2A 2ZABA 2R0FA 4PCRA 2YZ4A 4DRRA 1CR7A 1V6MA 4FP3A 1BXHA 1OFSA 3GNEA 4JPZA 3M3CA 1H30A 3L2YA 2A6YA 3WVJA 5DG1A 5FNXA 4X38A 2I2SA 4MYEA 1SCSA 2WJSA 1AXYA 4PBPA 1HWNB 4FOQA 3D5OA 4YG3A 1DZCA 3SH4A 2ZHNA 4H55A 1CQ9A 2F8XC 4XHXA 3UJ0A 3VWCA 3LCPA 3O4AA 4J2YA 1K5VA 2D6LX 3BTAA 4L8QA 3VV1A 3RTIB 1WBCA 2AUYA 2NZ9A 4XMIA 2WLQA 1IRAX 1FN0A 5GALA 4FOYA 3AZXA 3WDYA 4I8MA 4II0A 2F2FA 2A71A 1G9DA 5IK8A 5EHAA 5DZUA 4FOWA 1ABRB 1LCLA 4X3AA 2G4IA 3SNMA 3N7KA 2JD4A 2GN7A 3D6EA 3ZXDA 1BA7A 3A21A 2VH9A 3CRGA 3SH5A 1OQ1A 4I4XA 2DS0A 2A3WA 3CNAA 41BIA 2VY0A 1F9KA 4PF5A 3N36A 4G9NA 1PUMB 2KI6B 1CE7B 1QOTA 1IKQA 3VKLA 1H9PA 2DRYA 2LIEA 4YW2A 3M1HA 5E88A 3AKGA 2D6OX 2P3IA 3SITA 1RITA 1N1YA 3OJ2A 5GM0A 1IS5A 2P37A 5GLTA 4I4PA 2ES3A 2NVHA 4NOTA 4I4RA 1LECA 4Y20A 3AH4A 1MS8A 3WG1A 3PHZA 4R6UB 1EYLA 2DVFA 1ULGA 4EFQA 1LENA 3ILFA 1GZWA 2A6VA 4HJJA 2D23A 4ZLBB 3AZYA 3ZSLA 3OBTA 5EG6C 2JJ6A 2AREA 3M2MA 1FV2A 1PWAA 1UKGA 2GNMA 4UW5A 3IPVA 9ILBA 3P53A 4R9AA 4G9MA 2NP0A 1LTEA 3AP6A 4XDQA 5JOYA 2VW0A 3O0VA 1SBEA 3WHTA 1DQ4A 3UD7A 4Q91A 3MALA 1IS3A 1G7YA 4LO2C 3USUA 2D7RA 1SLAA 5KXBA 2ZGSA 2F2FC 5DUUA 1S0LA 1JBCA 5F9TA 4CZSA 1B09A 3SH3A 4PC4A 2A3XA 3IM0A 3VT0A 1SLIA 1QDCA 2D3PA 4DRVA 5CNAA 3AKIA 2D7FA 4BOWA 1DQ6A 3FLRA 3LSEA 4I37A 2OW4A 2LIQA 1JT4A 4Z8SB 2AGSA 4AWDA 1II4A 3K1XA 2JE9A 1S0FA 3AP9A 1QNYA 3JUTA 4LO3C 1ISYA 5F8WA 4F83A 4I4SA 2R16A 3HMYA 3AYCA 4ATFA 5T54A 1BASA 3W59A 3VT1A 1HCEA 4F34A 3B9CA 1MS1A 1D0HA 1WLCA 2ZMKA 3POWA 4GAFA 2D7IA 4A7YA 4K20A 2NTDA 3N3HA 4U2AA 4D0ZA 3NV3A 2P39A 2D22A 5BP5C 1CONA 3QCWA 3N7LA 3OYWA 1MS3A 2SBAA 2ZGUA 3QLQA 2VW1A 4ZFWB 2CWSA 4G1RA 4YM1A 2AYHA 4Y20B 1YBIA 3UD8A 3AX4A 4JKXB 1Q04A 4XYXA 3IMNA 1S0GA 2X2SA 5LK5A 3PJQA 3WLUA 3WDUA 1CVNA 2WNEA 4XJ8A 5HCFA 5JOWA 2ET2A 3ZYPA 2YV8A 3NBNA 5B2HA 1GZWB 2V5YA 3CA6A 2E7QA 2Q3NB 5IUQA 1HLCA 1ISXA 1W3AA 2Y9XE 2I1BA 3P6JA 1CPMA 3MPPG 4XMAA 4FQ4A 3R4SA 1W0PA 3E8LC 3OJMA 2DTYA 5GLZA 1J1TA 3ZC8A 3POKA 1NLSA 3CQAA 2DUQA 3WO4A 3WMUA 4AGGA 4U36A 1FNZA 3IPVB 1W6NA 4YM2A 3WUCA 2BEBA 3O0XA 2MLLB 4P0LA 5SV8A 5E89A 1O4YA 4XBQA 3C9ZA 2K8RA 1V6KA 5H9SA 3IN9A 1ILR1 3USUB 3FUOA 5H9PA 2RHPA 3A23A 2YROA 3MW3A 3IIRA 3WUDA 5DVHA 5GLVA 1HKNA 4XZPA 3FUQA 2YXSA 1AX1A 3C2UA 4LO7B 1S0IA 5T5OA 2NM1A 3D4KA 3WDTA 1T4QA 2FGFA 3ASIA 1FMZA 5F90A 3APBA 1LULA 4LO0A 1LU1A 3N7MA 2WT2A 2RSTA 2HZ9A 2ZHKA 2R1DA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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