3HN1A

Crystal structure of hcr/t complexed with gt2 and lactose
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
450
structure length
442
Chain Sequence
NLDCWEDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Gangliosides as high affinity receptors for tetanus neurotoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tetanus toxin
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium tetani
total genus 118
structure length 442
sequence length 450
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 2009-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3hn1A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3hn1A02
1UZZA 2EXKA 2OW4A 2H0BA 4DPNA 4YM3A 3O49A 1DQ2A 2DREA 3V65A 5LK5A 3BA7A 3OY8A 2Q5TA 1CE7B 1LECA 1W3GA 3SNMA 2BEBA 4YG6A 1LHOA 1WW4A 2EF6A 1D0HA 4G9MA 4FP2A 3M2MA 1A3KA 2ZQNA 3D7WB 3I2XA 4YZ4A 4XJ9A 2I1BA 1G9FA 4YGDA 4P9WA 5DG1A 4JAWA 1AJOA 1HQWA 3U4XA 3OGFA 2ENRA 4J23B 1T9FA 1CONA 3IM6A 3FJIA 3VUOA 3W9TA 1JLXA 3A0NA 1GNHA 2AUYA 2GDFA 1S0GA 4JC1A 3I2AA 1ENQA 2D6PA 2ZKNA 2E4MA 3C9ZA 2A5ZA 4HA2A 4U36A 3WUCA 3WCRA 4LO1C 3H6RA 1G9CA 2ERFA 4PBPA 3WO2A 5BYNA 3FJDA 3HOMA 1IOBA 4X3AA 4XJZA 1NLSA 2VSEA 3SH5A 5F8SA 1LOCA 1C4RA 1AXYA 1Q56A 1PZZA 1RG8A 2AAIB 4F83A 1NUNA 2ES3A 3DUIA 1LJ7A 4LBQB 1MVQA 2LTNA 3TB0A 4ATEA 3O0WA 2ZA9A 3APBA 2ZQOA 1A8DA 3USUB 2B7YA 1GSLA 4K21A 1VAMA 4IY9A 3M3OA 4EKXB 4C1XA 2Y9GA 5E89A 1D2SA 2ZGOA 4I30A 3L2YA 3JU9A 1OKQA 1Y7BA 5F8WA 4X37A 4XJUA 3B9CA 4ZKTB 1N3QA 3HMYA 5GALA 1WBFA 2WQZC 1SBDA 1URXA 4YW4A 3WG4A 2PELA 2LIQA 3UK9A 2Z49A 4Q8LA 2YMZA 1G7YA 1Q8VA 1HWMB 3AKFA 3BA5A 2MC2A 1N4KA 4L4HA 1OQ1A 5BXTA 1HDKA 2DUPA 4BMEA 4P0KA 3WMVA 1YI7A 1LU1A 4LBMA 1SBEA 2KKIA 1LOBA 3RQ0A 3V0BB 4K1ZA 4IONA 3A23A 1SLAA 5I1BA 4RL7A 1DYPA 3QLQA 1RIRA 4CTEA 5DG2A 1PWAA 2W52A 3IMNA 2J3PA 5F9TA 1S1AA 2DRYA 2DU0A 2EXHA 1FQ9A 4ZBVB 21BIA 3FJJA 2ZZJA 5EWSA 1AF9A 4ITCA 1QOSA 1Q1UA 1MS4A 3B3QE 1XG6A 3O3QA 5DZEA 4DRRA 1WLWA 3B00A 4YW2A 2Y9WC 1GNZA 3ILAA 1XHBA 2BFHA 4CJMA 3ILRA 1V6NA 4FOYA 3VT2A 4BM8A 2R1DA 1V6IA 2UURA 1JT7A 3HR9A 2ZMLA 3KQRA 1RINA 2LALA 1DFCA 3WV6A 1V6JA 1BYHA 2NTDA 4OEEA 1LOGA 1ULFA 4UW4A 3SH3A 1DBNA 1W0PA 2R1BA 1SCSA 4OEFA 2AFGA 5CBLA 1VIWB 4YGEA 1S0JA 4GA9A 1UAIA 3AP4A 1YO8A 3M3EA 2DVBA 1FWVA 1BFGA 2DVFA 2VXRA 3WG3A 4G6JA 4R9CA 2ERMA 3NV2A 3BB2A 3BRFA 4DS0A 1JT3A 4LO3C 5D63A 1JW6A 1DQ4A 2VY0A 3WVJA 1ENSA 4QKRA 3ENRA 3ZSMA 5DXDA 1ULEA 1WBLA 1JLYA 4EFPA 4G9NA 3V0AA 1IOAA 1AXZA 8I1BA 1QXMA 4EEEB 2EALA 2XOAA 2Q9XA 5DZFA 5D61A 3AP9A 5SV8A 2D7RA 4ZLBB 1LGCA 1S0IA 1LEDA 1DFQA 3N7JA 4M3CA 4KEKA 1W6OA 2E7TA 2ZR1B 4FPJA 2DVDA 7I1BA 4Y20B 5GZGA 3WUDA 5KXCA 3LTQA 3MPPG 2W08A 1S0FA 3RMXA 1JT5A 5T50A 2R49A 4FPOB 4KC3A 4OEGA 1Q8PA 1I1EA 3AYDA 2YV8A 2AH2A 4XJ8A 4YZ3A 3N7KA 4NOTA 5IK8A 4ZXKA 1JY0A 1VAVA 5T5JA 1GYKA 4XBNA 5DZUA 4FOVA 4QC4A 2D23A 1LCLA 3CQAA 2F2FC 6I1BA 1JBCA 3BADA 3Q7YA 1LGNA 4XILA 4KBBA 2RQ9A 1KJLA 1CN1A 5CAZA 4GAFA 1BXHA 1AZDA 1DQ6A 3CA0A 2D7IA 2ZHLA 2ZGUA 3JRRA 1WW5A 4X38A 3MW3A 2P34A 1BFCA 1KDMA 1APNA 3AKGA 1N3PA 3CA1A 5DUXA 4U2AA 2A6XA 4WVWA 1QU0A 2JE7A 4OZXA 3GNEA 5FRAA 1EVTA 1ITBA 1G86A 4USPA 4AVSA 1IS6A 2VH9A 2E7QA 3CRGA 4A7YA 2NZ9A 1TOOA 4FPYA 4GKYA 2Z48A 2D22A 2P3KA 5DUUA 2ZGQA 4P6AA 3CA3A 2G4IA 1TFMB 3AP7A 2JDZA 3FUOA 2DURA 3LSDA 3MW2A 3BAGA 4P9XA 3OBRA 1V00A 3AH1A 4LO2C 1GZCA 3WMUA 3AJ5A 2A6ZA 1CR7A 1RMLA 4LO0C 4XIOA 4M3CF 1LOFC 4XIKA 4AYUA 2PHXA 3AXEA 2GZBA 4XHBA 3NBNA 1I3HA 1S0DA 4ZFUB 3OPZA 1BFFA 1G9DA 2PHTA 4GOYA 3CRHA 3VKMA 3T2TA 2HWMA 1UPSA 3KMVA 3F1RA 2GN7A 5F5QA 1IS5A 4K1YA 5BOWA 4YW1A 3BAHA 2UWAA 1ABRB 4P9YA 2C5DA 2ZHNA 2A6VA 2HWAA 9ILBA 1GGPB 1HCEA 3IM5A 1SLIA 1H30A 1YXWA 4QBVA 3O5SA 2A71A 3RS6A 2UU8A 3SISA 3WNXA 1CVSA 3ILNA 1WW7A 1IS4A 5AVAA 2WRYA 4ZGRB 1BFBA 1K5VA 1TEIA 2YUGA 5E24E 1AVWB 4Q9PA 4DENA 1FATA 4YGBA 2ZAAA 4XJWA 4YZ1A 1PC8B 2RHPA 1UX6A 3W59A 1VALA 4DRVA 4I4UA 1IKPA 1FV2A 4FVVA 3C2UA 2JJ6A 1IHKA 4FQ4A 5FNWA 2GNBA 3VKLA 4XYXA 1FMMS 3P6IA 1LENA 2VUAA 4XDQA 4PC4A 1QOOA 3VKOA 3AZWA 3FLPA 1LTEA 5B2HA 1V6VA 3WG1A 1Q04A 1FN0A 2M49A 2Y9XE 2EIGA 2L5XA 4XXAA 1N1TA 1WUVA 1TWEA 5JOYA 5GZEA 5BQUA 1I1BA 2C9AA 4I4XA 4QALA 4GWMA 1IRAX 3VKFC 2SBAA 1P63A 3H6SE 4OWJA 3NWKA 4FGFA 4YLZA 2UUSA 5BP5C 2ZBJA 1JUIA 3DGTA 2VU9A 4J2KA 1F9KA 1KDKA 1S0EA 2AR6A 4CZSA 3M3QA 3NJ5A 5BXRA 4JQ0A 1DQ5A 1KJRA 4I2SA 4FPGA 4D0ZA 1SBFA 3INAA 4A7KA 1BZWA 4MYEA 3I4IA 3IKWA 4KEJA 3O44A 4I7IA 4IHZA 4LBLA 4Y22A 4XTPA 4GKXA 1FV3A 1V6KA 4I3NA 3AZZA 4YW5A 1ISZA 1KNMA 1BQPA 3HALA 1R1ZA 1YYNA 2X2TA 2DVAA 2PHRA 2DU1A 4R6UB 3AYCA 3ZYRA 5IK7A 3FJCA 3IPVB 1NZKA 4EFQA 3AZXA 4XJAA 3ZSLA 2EAKA 5CA6A 1C57A 4GOVA 3WG2A 3BX1C 3BAUA 2V73A 1Q8OA 3O4BA 3CA5A 4YZ5A 1QQKA 4YZ2A 2E51A 5EC5A 1Z78A 1SFYA 5H9SA 1DGLA 3NBDA 4FPLA 4QD2B 3Q7XA 4XBQA 2DYCA 4YOLA 5BP5A 1N1SA 3ZC8A 4J2XA 1ULGA 3AK0A 1N1YA 1O4YA 1MS3A 2CY6A 3IM0A 5L73A 1LHNA 3ZX7A 4FPKA 4Y1ZA 4YFZA 2K8RA 4QKSA 3AKHA 3D4KA 1Q8SA 4BOWA 3FLRA 1EYLA 3QR5A 1QNWA 4LO1A 4WBCA 3P6JA 3AJ6A 4OUJA 4D0TA 4YG0A 2CWSA 4EFRA 1FNYA 4I4QA 5HCBA 1JQZA 1HWNB 1DQ1A 1QDOA 1G82A 3FJKA 1LGBA 4IY8A 4YGCA 1TIEA 3NV4A 2OUHA 2VW0A 3WINC 3ZXDA 3WLUA 4XMIA 3VWCA 3ZXJA 1CQ9A 4Z9WB 4QBCA 1SR4C 2PHWA 1DZCA 1JHNA 1YBIA 3VSFA 2R0HA 1H9PA 3OGGA 1PZ7A 1W6MA 4P0LA 4Q27A 3A21A 5GLZA 1MS8A 1GZWB 3OYWB 2NMNA 3RTJB 1JOJA 1HLCA 1LULA 2KI4A 1WCSA 3HSMA 3UJ0A 1W6NA 4ISRA 1JN2P 1CPNA 2D6KA 3WDWA 4Z8SB 3CAHA 4Q8KA 1LESA 4G1RA 5GM0A 3ZXLA 1TP0A 1G9AA 5T55A 5KXDA 3R4UA 2A3WA 4Q26A 1W3FA 2UWCA 1CJPA 2ZMKA 2MIBA 3UJQA 1AXKA 2WT0A 2JECA 3AJZA 4DEPA 2WKKA 2A6YA 2D6MA 3POSA 3OY8B 1BLDA 3T8SA 4LBOA 3EF2A 5GZDA 1LOEA 3ZXFA 31BIA 1PUMB 1W3AA 4I4YA 3O12A 4F34A 4FOWA 4XZPA 3VV1A 4FPFA 1ISYA 1ONKB 2CYFA 1PUUB 2ARBA 3N3HA 2W39A 1XQNA 1EV2A 1W6PA 2DWRA 2D3SA 3CA4A 4Q1RA 2EXIA 2NM1A 4BQ1A 5F90A 2FDBM 1WW6A 4TYSA 4AGRA 5BVPI 4EB2B 2LIEA 5EHAA 3V64A 2Q3NB 1GANA 4L8QA 2R16A 5CNAA 3VT0A 3ZXEA 2HW9A 3FUQA 1DQGA 3BOPA 1C1FA 5IK4A 3H6RB 2WLQA 2JD4A 3IAGC 3KM5A 1QDCA 4UW6A 2D6OX 1LEMA 1X50A 1II4A 1YF8B 4USOA 4JKQA 3WDTA 3FJBA 1O4ZA 4QD2C 5F8YA 4WZFA 2A3XA 4I1EA 4TZDA 2OUJA 1UZYA 4BPZA 4P0JA 2QN4A 2X2SA 4H55A 3PVEA 1PZ8A 5EG6C 2WNEA 1RITA 2ZGRA 4LBKA 1HWPB 4X39A 1YIFA 4LO3A 4LO7B 5BXSA 1AXMA 3D5OA 5GZFA 2CWMA 1QGLA 2GALA 2YROA 3R05A 3JUUA 3TAYA 3OJMA 2D6LX 3BODA 1HKNA 1WBAA 3N7MA 1S0CA 2K4AB 1DQ0A 4YM2A 5JVVA 3ZXGA 3O4CA 3QCWA 4D8HA 1OFSA 3WHTA 4RA0A 5GLVA 3E8LC 2HYKA 1UMZA 1N3OA 3WA1A 3OJ2A 5JOZA 4LBQA 4LBQD 4FPHA 5DSSB 3ZVXA 2A6WA 3NV3A 3VT1A 1GZ9A 1VCLA 1SLBA 3USUA 3AP6A 3OBTA 3BA4A 2KLLA 3AYEA 3A0KA 5JOXA 2D43A 1IRPA 3AFKA 4PF5A 2GMMA 5T5LA 3JUTA 1UKGA 4Y1YA 1N1VA 4TLPA 2F2FA 4P14A 4Y26A 4XFUA 4JCKA 4FP3A 4SLIA 2HZ9A 3WHUA 1MS5A 2FHRA 2E6VA 2P3JA 5T5PA 4YFWA 3LSEA 3FFZA 1ONAA 2I2SA 2NN8A 1LU2A 1UN1A 1AVAC 5E8AA 3V0BA 1HWOB 4AWDA 2DV9A 3HN1A 1V6WA 4D69A 4A7ZA 1QMJA 3O4AA 3AP5A 4DFSA 1JT4A 1QOTA 2GO2A 4AN6A 3FJHA 3CRIA 4XHXA 3LCPA 3FLTA 1J0SA 4I4RA 5DVHA 4ZA3B 2VW1A 4WVVA 3I8TA 2AGSA 1IILA 5FZZA 3UD7A 4M00A 1ISVA 2CNAA 2D24A 4YG3A 3ZSKA 4LO2A 1U0AA 3O0XA 3O5WB 4I1BA 2A3YA 4LO0A 1F5FA 2GN3A 1GBGA 1LOFA 1S0BA 4FPCA 4GALA 1Q03A 4HJJA 3T1LA 2E4MC 2Z42A 3M1HA 1QNYA 3FJ9A 1DJSB 3VKNA 2AXMA 2IHOA 5T52A 4HR6C 4JRAA 1W6QB 3FJ8A 1MS0A 3WCSA 1ULDA 1CIWA 2SLIA 1ULCA 5DUWA 5G00A 3AZYA 2DRZA 5IK5A 1DYKA 3O0VA 4XE9A 2DUQA 3AYAA 1H9WA 4BLJA 3LLPA 4DCKC 1HIBA 2A70A 3BIWE 2P3IA 3PJQA 1T4QA 3AKIA 4I96A 2KM2A 3WZ1A 4M3CB 2GMEA 1W6OB 3P53A 1BARA 4LO7C 2PHFA 3S8KA 4Y24A 3PVOA 1V6XA 1SACA 2YY1A 3RRDA 3BRGC 3Q7WA 1V6MA 4G6MA 1LOAA 2MLLB 1WBCA 2E53A 5EXOA 4AVVA 3O4OA 2F8XC 1IJTA 3UL2A 4J2SA 4IYBA 4I37A 2NMOA 2NVHA 3Q9OA 4L4IA 1BKZA 1RY7A 2AREA 1AJKA 1EPWA 2ZHKA 1MS9A 2ZMNA 5GAQA 1R8OA 2ZHMA 3WDVA 4Y20A 1NXD1 1MR5A 1W0OA 1AFCA 4XFSA 3W58A 1ISWA 2KI6B 4IZEA 4Q9GA 2XB6C 4FPEA 1QF3A 1ILR1 5BXPA 2JKBA 4PBOA 3RSJA 1FAYA 3WOGA 1BLAA 5JLVA 1TTUA 3WDUA 5D62A 1E0OA 1AX0A 2DUOA 3N0KA 4H04A 4DQAA 4I4PA 2WT2A 4Z8BA 3CA6A 3VEQA 5IT6A 1R8NA 2P39A 3BAVA 4II0A 1F31A 3AX4A 4Y1VA 4Q1PA 1GV9A 3UJ4A 5FREA 4ZFWB 4K20A 1DZQA 5FNXA 4R9AA 5HCAA 3V79C 5KXEA 3FGMA 1KITA 2ARXA 3UDAA 1ZA4A 4R9BA 1SCRA 4NO4A 1Z0HA 1LODA 1M2TB 4M3CE 1DZDA 2D3PA 5HCFA 3FJFA 3AH2A 2AENA 1DHKB 2JE9A 1DQOA 3AH4A 5GLUA 4Q2FA 2TEPA 2WSVA 4XMAA 4UW3A 3M3CA 4I4SA 3MEPA 4AGGA 1HKDA 1GKBA 1GLHA 3PMEA 1LHVA 1IKQA 3N7LA 2NYYA 2FGFA 2QYIB 4J2YA 1FMZA 1BJQA 1V6OA 3RTIB 3SH4A 3ATGA 3UJOA 1XZZA 3AXDA 3UD9A 2ZABA 4GP0A 1WD3A 1FWUA 2V5YA 1L2HA 1MC9A 5GZCA 2P23A 4XFTA 2PHUA 4ASMB 3BTAA 3QYDA 4LBJA 2ZGNA 4LBNA 2RG9B 3OJBA 1LHWA 3ZSJA 1V6UA 3WDYA 1IS3A 2Y9FA 3N36A 4I0YA 1YTOA 3PUBA 1K5UA 1ENRA 1SLCA 3H6QA 5CB7A 3I29B 1FX5A 1XYFA 3T1MA 1WD4A 3A07A 3PHZA 2VSAA 2ESUA 1S0LA 4OWLA 3BRDA 3ZXKA 5EYXA 4ENDA 1AX1A 3RMYA 2ZGTA 1CVNA 2FFVA 3WINA 2A7AA 2D20A 4FOQA 1ISXA 1Q8QA 1SR4A 4FQZA 3IM7A 3NV1A 2K43A 4JPZA 4YM1A 1JYIA 1C1LA 3IIRA 3B69A 2D1ZA 2DS0A 3SLIA 3VSZA 1QKQA 2D44A 5GLWA 4ATFA 2A75A 1W6QA 3H0OA 41BIA 4JP0A 3N35A 2OVUA 4HL0A 1DIWA 2ZGSA 1FYUA 3FJEA 3SITA 3B01A 3POKA 4JKXB 3B9UA 1MD6A 1B09A 5DUVA 4QO3A 4I4VA 3NBEA 5E88A 4WV8A 4Y22B 3S8JA 4PQ9A 3UD8A 4ZFYB 1AVXB 2R0FA 1SLTA 3POYA 5DZGA 2GNMA 1BA7A 5GLTA 1FGAA 4AN7B 4ZOTA 1MACA 1G8WA 1V6LA 1M16A 4YM0A 4Y1XA 4M01A 2DTYA 2NP0A 2WSUA 4IQPA 3BAOA 2CTVA 1MZ5A 2BEAA 1CESA 2ZGMA 1N47A 3HBWA 4IZXA 1DLLA 2BQPA 5JOWA 2P2KA 4OWKA 3WO4A 4I8MA 1MZ6A 4W65A 3RG0A 3PVNA 3POWA 1WLCA 4XXPA 3CU1B 5EYYA 1HCDA 5T54A 4Y1UA 5FZYA 1SZ6B 4PCRA 1SLLA 2ET2A 3ZPYA 2AYHA 3A4UA 2VW2A 1JXNA 3IPVA 4H9WA 1KRIA 4GP3A 3PG0A 1AX2A 2YXSA 1RZOB 3ILFA 2GNTA 1Z2VA 2W68A 3OJVA 3A22A 1WLDA 1PZ9A 1Z4SA 4GAIA 1UL9A 5FZUA 2D3RA 1LHUA 3R4SA 3GALA 3FBYA 4YW3A 2ZGKA 3NBCA 2D7FA 1JYCA 5H9RA 2DVGA 1A78A 1JTCA 1ZM1A 4BLIA 2DTWA 3K1XA 5H9PA 1W6MB 1YRZA 4C1WA 2D6NA 4OW4A 1CPMA 1GICA 4BMBA 1OQLB 1TWMA 2R9KB 4Q91A 3CNAA 4GWNA 3ASIA 1AVUA 2FFUA 1W6NB 1KQRA 5IUQA 2GNDA 1FNZA 1QQLA 4AVTA 3D6EA 1BASA 4XTMA 3FJAA 4XBLA 1G9BA 4UW5A 1MS1A 4CRQA 3MALA 2WT1A 2XG3A 2P37A 3F62B 2FMDA 5DUYA 2EXJA 2WBCA 5T5OA 2KH2A 1HQLA 4XOGA 4AGVA 5BQUC 3BAQA 4I4OA 5H9QA 3WO3A 3TC2A 1GZWA 5KXBA 5GJ6A 3OYWA 1AVBA 2ZGPA 3AZVA 2FO1A 1VLNA 5JDBA 2WJSA 4ISQA 2UWBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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