3N7KA

Crystal structure of botulinum neurotoxin serotype c1 binding domain
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
424
structure length
422
Chain Sequence
NINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTITSDSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Identification of a Unique Ganglioside Binding Loop within Botulinum Neurotoxins C and D-SA .
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 91
structure length 422
sequence length 424
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2010-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3n7kA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3n7kA02
1V6JA 2NN8A 2YXSA 2GMEA 2D6LX 2VXRA 3AZVA 3CA4A 3CNAA 4X3AA 1KNMA 2D44A 1BQPA 3WLUA 3IM6A 1ZA4A 1P63A 2B7YA 2ESUA 3CRGA 1LESA 1DQ0A 1LHUA 4I4VA 3CA5A 3UJ0A 5BVPI 3S8KA 2BEAA 2HWAA 2DRZA 4PC4A 3O4CA 5AVAA 2FFUA 1II4A 2VXTI 3D6EA 3RG0A 4EFPA 3FLPA 3O4BA 3ZSMA 1N1TA 4EB2B 1JY0A 1N1YA 2D23A 4GOVA 3AH4A 1Z4SA 5D62A 8I1BA 1ULGA 1J0SA 4BM8A 1OKQA 2LIEA 5GLWA 2ZGQA 2PHUA 5EG6C 3WCSA 3WG1A 2RQ9A 1S0CA 2HYKA 3FJ9A 1N3PA 4GAFA 4Q1RA 4I7IA 3BAGA 1WD3A 2D3RA 2Q5TA 3UJOA 2ZGLA 3V79C 4UW5A 1UZYA 4JPZA 1JT7A 2LIQA 2CWSA 1FMZA 1Q03A 4ZXKA 4Q27A 1SLTA 2DVAA 4X39A 1YYNA 3BRDA 3IKWA 1YIFA 4F83A 2L5XA 4NOTA 4I4QA 4ISQA 5BQUA 1YBIA 1KQRA 2ZAAA 1G9FA 3I2AA 2ZA9A 4YGEA 3FLRA 2P3KA 3VT0A 1EV2A 1GZWA 1LGNA 3FGMA 3BRFA 4IZEA 1UN1A 2WSVA 3BA5A 2FO1A 3VT1A 3FJKA 3WDVA 3N0KA 3H6RA 3RTJB 3UD7A 1MZ6A 2DUQA 3ZXEA 1RY7A 3O44A 1V6UA 2WQZC 5FREA 2P37A 3VSZA 1DJSB 4DFSA 2Q3NB 3VKMA 1ILR1 4Y1XA 1UAIA 4WBCA 5GLZA 4XKIA 3WMVA 3T1LA 4ZLBB 2NMOA 4YM0A 2JE9A 2D22A 1WBFA 3WO3A 4XJ8A 4LBOA 3ZXGA 2XOAA 4I4XA 3CU1B 4BLIA 3OY8A 2WSUA 1C57A 3LTQA 3OJVA 2RHPA 1DIWA 2AREA 1M2TB 3NJ5A 2G4IA 5JOZA 1W6MB 3E8LC 3C9ZA 4Y1YA 5DUWA 3C2UA 1IS4A 3IIRA 1DQOA 4BMBA 4XJ9A 2UWAA 3ILRA 3R4UA 2A6VA 5F9TA 4Q26A 3A21A 5L73A 6I1BA 1FYUA 4FPHA 1PUUB 4I96A 1SACA 4OZXA 2GDFA 1YTOA 2ES3A 3ASIA 2ZHLA 4IY9A 3O5WB 1MACA 3H6SE 3QYDA 5D61A 2FFVA 3WINA 4FOWA 3A23A 2GNMA 2IHOA 3BAVA 1HLCA 4P9XA 1FNYA 3BB2A 1R8NA 5BOWA 2AYHA 1G7YA 5BQUC 3A22A 1IJTA 1FV2A 3UL2A 3IPVA 1CPMA 1CVSA 2PHXA 1BFGA 3VUOA 4FQZA 4TLPA 2GNTA 3AYAA 2AXMA 2DVDA 4DS0A 4WV8A 2V73A 3SLIA 4PQ9A 2HWMA 3USUA 1TWEA 4XFUA 5H9PA 4K20A 4OUJA 3PHZA 1AZDA 4Y26A 3AYEA 3ZXFA 1YO8A 1LHOA 3PVEA 3NBDA 1LEDA 1GZWB 3POKA 2ZKNA 1N1SA 5DZEA 3HMYA 1EYLA 4YFWA 2CWMA 3SITA 1VCLA 3H6RB 2CTVA 3BAHA 4HA2A 3BAQA 4DEPA 1NLSA 2NZ9A 1CN1A 3EF2A 1ISVA 4R9AA 4R9DA 2J3PA 2R0HA 4PBOA 2UUSA 2VW0A 4FQ4A 1V6VA 5F8WA 1Q1UA 1DGLA 1DLLA 3BA7A 5GLVA 1C1FA 1S0IA 3OJ2A 1IT0A 5LK5A 3QLQA 4G9MA 4JP0A 3AH1A 3KQRA 2AUYA 4OW4A 3AZZA 3W9TA 3RS6A 4AWDA 3AP9A 3AP4A 3OY8B 4Q9GA 1Q8QA 4YOLA 3AZXA 1JQZA 5H9QA 2E4MA 1CONA 1MS8A 1O4ZA 2PELA 4Q2FA 3WINC 1SCRA 3V64A 2A6YA 1AXYA 2NM1A 5DZUA 2ZGOA 4BLJA 2CNAA 1H9PA 3AKHA 1Q8OA 5CNAA 3IMNA 4LO0A 4KBBA 5JOYA 1NUNA 3KM5A 4JC1A 2DVBA 2DV9A 1QU0A 1JBCA 5IK5A 4G1RA 1IS5A 1QOOA 3R4SA 5DVHA 1AXZA 2AH2A 2GNDA 3FLTA 3QCWA 3OBRA 3B00A 1JHNA 1V6IA 3WZ1A 3BODA 4LO1A 2AGSA 3BAUA 4FPJA 5E89A 2P34A 3ZXJA 1AXKA 2GN3A 2JDZA 3IPVB 1W6QA 2DURA 2UU8A 1APNA 2DTYA 4YLZA 1VAMA 5F5QA 2A75A 5GZDA 4II0A 3HR9A 1N4KA 4FPFA 5BP5C 3USUB 3WHTA 1IS6A 2A6WA 2KI6B 4YM1A 1ZM1A 3WG2A 1TTUA 4P0JA 4YM2A 5SV8A 4PCRA 1JLXA 2R1DA 2X2TA 3FJHA 3HALA 2ZABA 4Z8BA 3MALA 2JECA 1SBDA 4PF5A 2Z48A 1DQGA 1JLYA 1BLAA 3IN9A 1LODA 5HPZA 5DG2A 3SH5A 1RIRA 3I4IA 1IRAX 3RMXA 2EALA 5EYXA 1JT3A 3O4OA 2WKKA 2P23A 5GALA 2E4MC 3IM5A 1G86A 2QN4A 4H55A 1URXA 1JOJA 2GMPA 1S0FA 1DFQA 4OWJA 1SLCA 3Q7YA 2VSEA 3VKLA 2R1BA 3QR5A 1FV3A 2E7TA 4LO0C 1Q8SA 1HWMB 1IOAA 4I6IA 2A70A 4YM3A 4D0ZA 2W39A 1UMZA 1C1LA 2XB6C 1MC9A 1FNZA 3H0OA 1CIWA 4YG6A 1VIWB 1Q56A 2EXKA 3WVJA 1FAYA 1JT4A 5HCBA 3FUOA 4LO1C 4G6JA 4LBQA 4I0YA 2GO2A 1QOSA 1KITA 3ILAA 3ZSLA 4XYXA 3LCPA 2ZGRA 2Y9FA 1BFBA 4FPOB 4QBVA 4UW4A 5F90A 1GICA 2KH2A 4XILA 5GLTA 4OWLA 4XJWA 3AH2A 4QD2B 5EHAA 2ZGMA 2Y9GA 3MW3A 4K21A 3CA3A 3PJQA 1H30A 4IHZA 3OJBA 3PMEA 3FJFA 2P3JA 2WT2A 3S8JA 1LU1A 2I1BA 1ULDA 1U0AA 2VW1A 4M3CE 2OUHA 1PWAA 2ENRA 1G9DA 1LHVA 5KXBA 4FP2A 4L8QA 1SLLA 1FX5A 1GNZA 4I1BA 4USOA 1WUVA 1IKPA 1W6PB 2VH9A 1GZ9A 2YUGA 1JUIA 1S0BA 1FQ9A 1VLNA 2BQPA 2C9AA 5BXPA 3A0NA 3APBA 3RSJA 1LOBA 4OEGA 4DCKC 1TOOA 2FHRA 1QQLA 2CL2A 3ENRA 3O0VA 1ENSA 4I30A 3WNXA 1DYKA 1XG6A 1AVBA 1AX1A 5BXTA 3ZYRA 1LCLA 1D2SA 4JAWA 3P6IA 1VALA 5E8AA 1BXHA 1LU2A 1KDKA 4EEEB 2EIGA 3AJ6A 1QF3A 4YGDA 2KKIA 1ISZA 3N7MA 3K1XA 4XJAA 1OQLB 3H6QA 1FMMS 2WT0A 5IK4A 1F9KA 4XJZA 2K8RA 3O4DA 4YFZA 2ZMKA 4ZFWB 1MR5A 2EAKA 2E53A 2SLIA 1RINA 4GXLA 1QDCA 3B69A 2NTDA 4FPYA 3M1HA 5DZFA 3AZWA 3JU9A 2DYCA 1OQ1A 3FJDA 3ZXDA 1SZ6B 2NYYA 5H9RA 4LBLA 3HOMA 2D3PA 4XDQA 3NBNA 1XHBA 1OFSA 4LBQB 3N36A 1N3OA 1ENRA 3RQ0A 2CY6A 3PG0A 5DUUA 3NWKA 1EVTA 2ZGPA 3I29B 4YZ2A 3F1RA 5T55A 2YV8A 5HCAA 1L2HA 4L4HA 5FZYA 4LO2A 3AKGA 5T5OA 2PHRA 4R9BA 4XXAA 4HR6C 4FPEA 1QXMA 4I2SA 4FPKA 4P9WA 3NV3A 3I2XA 1G8WA 3WCRA 2GALA 1K5UA 1W6OA 2RG9B 2D6PA 1V6KA 4GWNA 3BIWE 5CBLA 21BIA 1WCSA 2IWTB 3TB0A 3VT2A 2A3XA 5HCFA 2A5ZA 2D7RA 3BOPA 2EXHA 1JTCA 1LOFA 5JMCA 3R05A 1Q8PA 2D6KA 2ZZJA 1W6NA 4QKSA 3TC2A 2DRYA 5GJ6A 1I1EA 1UZZA 2RSTA 4Q8LA 4AVSA 2LALA 3JRRA 1ISYA 2ZGSA 4TYSA 2A6XA 1QOTA 1A3KA 2ZHNA 3VWCA 1Q8VA 5GM0A 2DU0A 3ZYPA 4LO8B 4QBCA 4GA9A 1N47A 4IY8A 3N35A 2D6MA 2QYIB 3P53A 5GLUA 1B09A 4DENA 3SISA 3WOGA 2C5DA 2ERMA 4GKXA 5BP5A 1RG8A 5KXEA 1ISWA 4K1YA 2UWCA 3VEQA 1AVUA 4GP3A 3GALA 3AP7A 1HDKA 3WG3A 3A4UA 1JYCA 1HWOB 3HBWA 2A7AA 2PHTA 4DRVA 4USPA 4J2KA 4CRQA 2ZBJA 5F8SA 3ZXLA 3AKFA 2P2KA 2JE7A 2VW2A 3ZXKA 1V6LA 1W3GA 4D8HA 1HIBA 1CJPA 2ARXA 1KRIA 4ATEA 3D4KA 3Q9OA 3B3QE 2ZACA 2HZ9A 5JDBA 1LULA 5T54A 1LHNA 4OEFA 2ZGKA 4LO2C 2ZGTA 1IRPA 2HW9A 1DFCA 4UW6A 3AXEA 2D43A 7I1BA 3M3QA 1LECA 4P6AA 3AJYA 3OBTA 2ZHKA 3N7LA 1AJOA 1Z78A 1LENA 1E0OA 3UDAA 1PZZA 3DGTA 3WUDA 3WDWA 2P39A 1GKBA 1H9WA 2K4AB 1SR4C 4AN7B 3WG4A 4YG0A 1TEIA 2AFGA 2A3WA 1YI7A 4IYBA 2MLLB 4WZFA 1IOBA 4LO3C 1DQ2A 1LJ7A 1LOFC 2D3SA 3NV4A 4R6UB 4DRRA 1CVNA 2BEBA 4JCKA 4IONA 4WVVA 3WV6A 2D7IA 3ZSKA 1DYPA 4DQAA 3VKNA 1W6OB 4Y22A 1EPWA 3OGGA 1S0LA 4AYUA 3VKOA 3O5SA 4XMAA 1HWNB 2VUAA 2ZHMA 1X50A 4K1ZA 1BKZA 4YZ3A 5EYYA 4RL7A 1DZCA 3WUCA 1AX0A 1WBLA 2MIBA 4XTMA 3ZVXA 3BA4A 1T9FA 4HL0A 4C1WA 2AQZA 4FPLA 1T4QA 4EFRA 4EFQA 1TIEA 3AP6A 4Q9PA 5EC5A 1DQ6A 3B01A 1CESA 1V6NA 5GZGA 4OWKA 3NV2A 1Y7BA 5DXDA 3UD8A 1S1AA 2ZMNA 4YW3A 3PUBA 3ILFA 5BXRA 3Q7XA 2OUJA 2KM2A 3WHUA 4LBMA 3V0BA 1YXWA 1JYIA 1S0DA 3ZSJA 1A78A 1GYKA 2M49A 5CA6A 4I4YA 4H9WA 3B9UA 3D5OA 3WMUA 2NVHA 2DU1A 5IT6A 1MS9A 4RA0A 1DBNA 4J2YA 1QGLA 5T52A 1DZDA 4YW4A 2Q9XA 1UL9A 1GZCA 5FZZA 4XFSA 3V65A 2ZMLA 2MC2A 3M3OA 1Q04A 4YG3A 1GGPB 3WO2A 1LGBA 3O4AA 1KJLA 1GNHA 4XBNA 1PZ9A 2ZGUA 3MW4A 2D24A 1HCDA 1R8OA 3HN1A 1QNWA 4BQ1A 3W59A 3RMYA 1HKNA 3NBCA 4CJMA 3BADA 4YGBA 4XIKA 3OJMA 1CR7A 3VV1A 5JLVA 5DUYA 4CTEA 4FP3A 2SBAA 2E51A 1WW6A 3AJZA 3O3QA 1LOEA 5IUQA 4BPZA 4LBJA 4JKQA 2A71A 2AR6A 4NO4A 3M3EA 4FPGA 4ENDA 2GNBA 4XTPA 4YW2A 5DZGA 3CA1A 2D20A 3L2YA 1ULEA 1MS4A 3N7KA 3FJCA 1BZWA 2DUOA 4FOVA 1GLHA 5F8YA 4Y22B 1I1BA 4MYEA 4D0TA 4FGFA 2AAIB 3UK9A 4ZGRB 31BIA 4QO3A 5T5JA 1W6QB 1FWUA 5CAZA 3CRIA 1IHKA 1G82A 4M3CF 5IK8A 2WJSA 1DQ1A 4HANA 3WDTA 4Q8KA 2ARBA 1W0PA 4XE9A 1JXNA 1ISXA 4XOGA 3HSMA 4P0KA 3I8TA 2WLQA 3BTAA 3AYCA 4D69A 1BFFA 2ZQNA 4XBLA 1QQKA 3RTIB 2F2FA 2KI4A 1V6XA 4DPNA 1VAVA 3ZC9A 1MVEA 1UKGA 5GAQA 3IM0A 1LOCA 3V0BB 2PHWA 3CA6A 4YGCA 2D7FA 1W0OA 1XZZA 5JVVA 2PHFA 3LSEA 3O0XA 1Z2VA 1DQ4A 5BYNA 4I4UA 3SH4A 5FNWA 5JOXA 5KXCA 1V6MA 4X38A 1DZQA 2Z49A 4XXPA 3KMVA 4JQ0A 3FJBA 4W65A 4LO7C 1HKDA 1R1ZA 3WDUA 4GOYA 2AENA 1SBEA 3AXDA 2FGFA 4XIOA 3MPPG 4C1XA 4J23B 1S0GA 1V6OA 3FJEA 5FZUA 3AKIA 3A07A 1QNYA 1HQLA 4XFTA 4P14A 1XQNA 2LTNA 1FN0A 2CYFA 3SH3A 5GZCA 1IILA 3CA0A 5H9SA 1RMLA 4I1EA 1SBFA 2P3IA 3V0AA 1IS3A 2YY1A 2K43A 5IK7A 2XG3A 4GWMA 4LO7B 4XBQA 4AGVA 2FDBM 4M3CA 3ILNA 1F31A 1JT5A 3T1MA 2Y9XE 3UD9A 1PC8B 1AJKA 3LSDA 1XYFA 2YROA 4Y20A 2W52A 1G9AA 5BXSA 5CB7A 3A0KA 2E6VA 1Z0HA 1DQ5A 1HQWA 3POYA 3MW2A 2WRYA 3ZX7A 1LOGA 1AXMA 1FATA 3F62B 3RRDA 4AVTA 5DG1A 3MEPA 1WBAA 1JW6A 3FJ8A 2D6NA 4XJUA 4GAIA 1WLDA 5FNXA 3BAOA 2ET2A 3BX1C 3Q7WA 1RITA 4I4RA 1MS1A 2EXIA 1AVWB 2F2FC 4I4OA 1WLCA 3OYWA 2UURA 3M2MA 5I1BA 1WLWA 3FFZA 3BRGC 3WDYA 3FJAA 1CE7B 2Z42A 4GP0A 3T2TA 1SR4A 3PVNA 2X2SA 1BASA 1W3FA 2VSAA 4XHBA 1UPSA 1K5VA 4BMEA 4L4IA 4PBPA 2WNEA 4LO3A 4CZSA 9ILBA 2E7QA 4TZDA 4A7YA 2H0BA 4P0LA 4BOWA 3CAHA 3AZYA 1WW5A 4XMIA 3AYDA 3POSA 4QKRA 1WW4A 1S0EA 1SLAA 1J1TA 4ATFA 4A7KA 2ERFA 2WT1A 4ZFYB 1KJRA 1QMJA 1LOAA 5EWSA 3AJ5A 3SNVA 1SLIA 1ONAA 2NMNA 3FJIA 1I3HA 1O4YA 1A8DA 3POWA 2R16A 4YZ5A 1GBGA 1FGAA 4KEKA 4Y1ZA 1N1VA 4R9CA 3N7JA 2DVFA 4F34A 4Y1VA 1UX6A 3WO4A 1MS0A 2OVUA 4H04A 1LTEA 1TFMB 1WBCA 2R9KB 1G9BA 3GNEA 4EKXB 3N3HA 3NV1A 1AF9A 4SLIA 3VSFA 3PVOA 1HWPB 5E24E 4ASMB 5DSSB 2JKBA 4P9YA 3FUQA 2DUPA 3OPZA 3ZPYA 41BIA 4IQPA 1LGCA 1ENQA 2BFHA 1AX2A 2W08A 4KEJA 4KEIA 3V0AB 4ISRA 1SCSA 1AVAC 4M00A 3AP5A 1QKQA 4Z9WB 3OGFA 1PZ8A 4M3CB 2YMZA 1GV9A 2TEPA 4M01A 2A3YA 4YW1A 3CRHA 4A7ZA 1MZ5A 1MS3A 4FOYA 1BJQA 3T8SA 3M3CA 2VU9A 3ZC8A 5GZEA 2DS0A 4LBNA 3B9CA 4ZKTB 5EXOA 4YZ1A 4JKXB 3CQAA 1QDOA 4I8MA 4ZOTA 2EF6A 1ONKB 4Y20B 3AK0A 1SLBA 4AGGA 4QALA 3FBYA 3O49A 2WBCA 1C4RA 1MVQA 3ATGA 4I4SA 1TP0A 3AX4A 4I3NA 1F5FA 1WW7A 3O0WA 4Z8SB 1AVXB 1ITBA 2FMDA 2ZQOA 1MD6A 3D7WB 5FRAA 4G9NA 1FWVA 5T5LA 4YW5A 2DTWA 3W58A 2GMMA 1TWMA 1BA7A 4HJJA 2D1ZA 3OYWB 3UJ4A 2JJ6A 4ZBVB 1BLDA 1YF8B 3SNMA 4OEEA 1RZOB 2D6OX 1CPNA 1NXD1 1MS5A 1LEMA 3P6JA 4Y24A 1JN2P 3VKFC 4Y1UA 2ZGNA 2ZR1B 2NP0A 3JUTA 2DVGA 2V5YA 5T50A 4GALA 2JD4A 1ABRB 1DHKB 5DUVA 4ZA3B 2W68A 1CQ9A 1M16A 1W6NB 3FJJA 2UWBA 4FOQA 1IKQA 4JRAA 2A6ZA 1G9CA 5D63A 4UW3A 5KXDA 4YZ4A 4Q1PA 3NBEA 4I37A 2GN7A 4ZFUB 4G6MA 1PUMB 4LBKA 5GZFA 4KC3A 1ULFA 3INAA 1WD4A 5E88A 1W6PA 2KLLA 2OW4A 5B2HA 1NZKA 4AVVA 4U2AA 1SFYA 1V6WA 1GSLA 1GANA 3JUUA 4GKYA 3UJQA 2EXJA 5T5PA 2GZBA 4J2SA 3U4XA 4X37A 1S0JA 2DWRA 4XZPA 2Y9WC 1AFCA 4IZXA 2YZ4A 2VY0A 4ITCA 3AFKA 4AN6A 4I4PA 2VLCA 3O12A 5JOWA 4XHXA 1ULCA 4FVVA 4J2XA 1BARA 4LBQD 3WA1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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