3N7KA

Crystal structure of botulinum neurotoxin serotype c1 binding domain
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
424
structure length
422
Chain Sequence
NINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTITSDSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Identification of a Unique Ganglioside Binding Loop within Botulinum Neurotoxins C and D-SA .
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 91
structure length 422
sequence length 424
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2010-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3n7kA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3n7kA02
1CPMA 4PQ9A 5GLVA 1LU2A 3TB0A 3WO4A 4FOVA 2NYYA 3FJHA 2ZGTA 4DS0A 2NMOA 2ZAAA 1SACA 1Z4SA 4JAWA 4P6AA 3HOMA 1HWPB 3ZXJA 3N7KA 1Y7BA 3ZYRA 1CN1A 1JT3A 2ZR1B 1FWUA 1MR5A 3A21A 1GZWB 1JYIA 1ISWA 5GLWA 3CA1A 1UZYA 1AX2A 1KDKA 3O5SA 3WA1A 3BOPA 4Y1ZA 1JBCA 1DQ1A 2AFGA 1LHUA 3OYWB 1KITA 4M00A 5AVAA 2ZZJA 2VH9A 5DUUA 1W3GA 4Q26A 4FPKA 3WG1A 3O4DA 3ZXFA 3NV3A 4I30A 1AVUA 1BASA 1DIWA 1LOEA 2FFVA 4ZFYB 3INAA 4C1XA 4BLJA 2KKIA 2VW1A 5F8WA 2DTYA 1DQ2A 3RRDA 3FJEA 1DQGA 2AR6A 1FNYA 2ARBA 1NZKA 1QKQA 1ILR1 3LCPA 1R8NA 1JQZA 3O49A 3ILAA 3OYWA 2DREA 3NBDA 4XJWA 3OY8B 4XJ9A 3IM6A 4I4RA 1H9PA 4DPNA 1RY7A 1OKQA 1SCSA 1BFBA 5BXRA 1II4A 3O0VA 2WRYA 1FV3A 3ZXDA 4XTPA 1DYPA 2LIQA 2OUHA 1N3QA 3O44A 3WHUA 5DG2A 3D6EA 3M1HA 1Q56A 3NV1A 4QALA 2K43A 4A7YA 1EV2A 1YTOA 2YMZA 3O4BA 2DWRA 4XHBA 2DRZA 1QXMA 2EXKA 4ENDA 4XMIA 4YG0A 4IZXA 4YW3A 2YV8A 5EYXA 1XG6A 1RZOB 1VAMA 5HCFA 2D6LX 3SH3A 3BRFA 3BAVA 4L4HA 1A3KA 3BODA 4USOA 2ZHKA 4JPZA 2YXSA 1LTEA 4HR6C 1MS3A 1RMLA 3ZSLA 3RMYA 1PWAA 3FJ9A 1N1VA 1QNWA 1IS3A 3I2XA 3P53A 4J2YA 2ZHMA 4XFUA 3VKMA 2JD4A 1UMZA 2V5YA 4I4QA 5GM0A 2F2FA 1PC8B 3UJ4A 3MALA 5E24E 2ZHNA 1TEIA 4HJJA 1V6KA 4Y26A 4U2AA 4XOGA 3I8TA 4G6MA 3POWA 3QLQA 4BM8A 2BQPA 5FZYA 3TAYA 1GNZA 4YOLA 1MZ5A 1TWEA 3W58A 1TIEA 1DLLA 1GYKA 2H0BA 2CWSA 5IK8A 2ERFA 4YZ5A 1K5UA 3HSMA 2GZBA 1CIWA 3KM5A 1LOFA 4BLIA 1NUNA 3ZSJA 4CZSA 3AH2A 3WG2A 5HCBA 1HWOB 1QOOA 1QU0A 1W6MB 3IPVA 1W6NB 1V6MA 4ZKTB 2E51A 5BXSA 1HDKA 4QKSA 3D7WB 4AVSA 3WOGA 4D8HA 4OEFA 2UWBA 3CRIA 4EEEB 3WHTA 4PBOA 4GALA 4DRRA 2JKBA 3SNMA 4GA9A 2WSVA 2A6XA 3N0KA 3UD7A 1GKBA 3AJYA 1WW4A 5GLUA 4Z9WB 4EFRA 2SBAA 1PZZA 5BYNA 1LU1A 1Q8SA 4GP3A 3LLPA 4K21A 1Q04A 1FAYA 4BOWA 1B09A 1S0JA 4DENA 2AQZA 2A75A 3WV6A 2NMNA 2D6MA 1SBEA 1DYKA 2VSAA 1R8OA 5EC5A 5H9RA 3HMYA 3I4IA 3R05A 3V0BB 1BJQA 1BKZA 3CQAA 1ULGA 5IUQA 3RS6A 3AP5A 4EFPA 3POYA 1AVWB 2A3WA 3MW2A 3T1LA 1TWMA 4A7ZA 4Y1VA 1E0OA 4P9XA 3NBEA 1OFSA 1M2TB 2K4AB 2W52A 1J1TA 3WNXA 1ULCA 2GDFA 2Y9XE 1AX0A 1S0BA 1V6IA 4DRVA 1WW6A 5T5JA 4IZEA 5EWSA 3MW4A 3RG0A 4LBQD 3I29B 1F31A 2C5DA 1DHKB 2ET2A 5H9QA 1C1FA 2ZMNA 2J3PA 4LBLA 1LESA 1WLCA 3H0OA 1W6QB 3SISA 4QD2C 3ENRA 4QO3A 1ENQA 2EXJA 1IRPA 1J0SA 5BXTA 1SLCA 4Q91A 1LGCA 4P14A 2DV9A 2VY0A 4ZFWB 5KXCA 1LHNA 1QDCA 4LO3C 1MD6A 4YG3A 1N3OA 1V6VA 1W3FA 4JRAA 2P39A 3CA4A 2I1BA 4ZFUB 3POKA 4HA2A 1HCEA 2EF6A 1TP0A 4M01A 4Z8BA 2WNEA 4AGGA 1IS5A 3AJ6A 1I1EA 2Q9XA 2ZGSA 1W6QA 4XHXA 2WT0A 5DG1A 4SLIA 3VT2A 1AZDA 4EFQA 5GJ6A 2R49A 1G9BA 5BXPA 1YO8A 4FP3A 3V0AB 5T5PA 2C9AA 4YW1A 1N1SA 1O4ZA 3ILNA 2D7IA 4FPFA 4J2SA 3RQ0A 3V65A 1W0OA 2W68A 3GNEA 3SLIA 4GAIA 1XZZA 4XFTA 3Q7YA 4M3CB 4R9CA 3AP4A 3T1MA 1QQKA 31BIA 1JYCA 2P3JA 1Z2VA 2GMMA 3IIRA 3ZC9A 1IS4A 1DGLA 2XOAA 1SZ6B 3WDXA 2G4IA 4FPYA 4GKYA 1I1BA 9ILBA 4TZDA 4XJUA 1KRIA 2DVBA 2X2SA 1Q8PA 2DU1A 3V0AA 4UW5A 3FJJA 3HALA 3VKFC 1FQ9A 1Q8QA 2D20A 3WMUA 4K1YA 2FGFA 1VIWB 2P2KA 4Y22B 3OBTA 3BB2A 4LO1A 5DXDA 5HCAA 2DUOA 3O0XA 3UL2A 1GV9A 2FMDA 3IM5A 2EAKA 3AZXA 3NBCA 1YIFA 2RHPA 2WLQA 5F90A 4XTMA 3WG4A 4IQPA 1MS1A 4LBQB 3WINA 1KQRA 4USPA 3CNAA 2DU0A 1N3PA 1N1YA 4Y22A 3H6RB 3IM7A 2V73A 3CRHA 3UJOA 1SLIA 4KC3A 1ENRA 3I2AA 1Q8OA 3HN1A 3P6JA 4G1RA 3CA6A 4WVWA 2QN4A 1APNA 3N7LA 1Q1UA 3NJ5A 2VW2A 3QCWA 3ZXKA 2RG9B 1SLLA 3SH5A 1LJ7A 5DUXA 2VSEA 4Q1RA 1ITBA 3RSJA 3W59A 5E8AA 1ONKB 4DFSA 5HPZA 1ZA4A 4XJ8A 5JMCA 1JLYA 4YGDA 3ZYPA 1WBFA 3H6RA 4G9NA 3H6SE 4XJZA 4DCKC 2ZGQA 1A78A 2EALA 3ASIA 3PG0A 1GZ9A 1VLNA 2NTDA 2GALA 3A0KA 4I4VA 3O0WA 2CTVA 5DZGA 1F5FA 3VT0A 2ZGPA 1HKNA 1JT4A 1Q03A 4BMBA 1HKDA 2R0FA 4P9YA 4UW6A 2ZABA 4Q9PA 2A70A 4CTEA 3N35A 3ZSMA 4P0LA 2AAIB 5IK5A 2ZQOA 4FOYA 4FP2A 2R16A 1RG8A 1KJLA 1WUVA 2Z42A 1WD3A 4ITCA 3B9CA 4JKQA 1R1ZA 5DZEA 4R6UB 3AP9A 1MVQA 1N47A 4XDQA 5GZFA 5FZZA 2PHWA 1K5VA 2EIGA 1HWNB 4I4UA 1CR7A 5F8SA 2ZGMA 4D0ZA 1ONAA 1LOCA 4LO1C 4GWMA 4YFWA 1DZQA 1WD4A 4XIOA 4D69A 2R1DA 3VKNA 4GKXA 4QC4A 5T54A 4QKRA 1W6OB 2B7YA 1S0EA 1AX1A 1JW6A 1MACA 4WZFA 2ESUA 3FJDA 4QBVA 1ZM1A 4YZ3A 5SV8A 4L4IA 1JY0A 1V6LA 1BZWA 3B01A 1KDMA 3IMNA 3VKOA 5F9TA 3F62B 1AXYA 1JUIA 3WINC 4EB2B 3N36A 1BFGA 2VXRA 5DUVA 4LBJA 2LIEA 2HWAA 4FGFA 1W6PA 3BAOA 1SR4C 5BP5C 1YYNA 1JT7A 4LBKA 1TFMB 2ZGKA 1W6OA 4I8MA 2OW4A 3S8KA 2E6VA 2JE9A 4IYBA 5FRAA 5H9PA 4DQAA 3USUA 2IWTB 4XBLA 5GLTA 1IRAX 3B3QE 3FFZA 4YGCA 3AP6A 4PBPA 4QD2B 2E7TA 1MS0A 3OJ2A 6I1BA 3K1XA 4Q8LA 1GSLA 1Q8VA 2D6KA 3CU1B 2P37A 3O3QA 3A0NA 1UZZA 3FGMA 1WBAA 3FBYA 4CRQA 1F9KA 3BAGA 3AYCA 3RTIB 4OZXA 2DYCA 2R9KB 3IPVB 1JLXA 3OPZA 1CQ9A 5CA6A 2L5XA 2PHFA 3A07A 2ENRA 1YBIA 4XBQA 4FPEA 3AZYA 2A7AA 4I4XA 2E7QA 3M3CA 1PUUB 2M49A 5KXDA 4IHZA 4LO8B 2A3XA 1DQOA 3CA3A 1V6WA 1CVSA 1JOJA 3SITA 3LSDA 1JN2P 1CONA 4D0TA 4XMAA 5H9SA 4LO3A 3C2UA 8I1BA 2E53A 1DFCA 4H04A 4ZA3B 3ZXLA 3NBNA 3D5OA 1NXD1 4FOQA 1MC9A 3AYEA 1S0IA 1FWVA 3WUDA 2D1ZA 2A6WA 2OVUA 4FPHA 2JECA 2TEPA 4H9WA 2GO2A 3FUQA 1EVTA 1H30A 2Z49A 1IOBA 1LODA 2GNMA 4FPGA 4II0A 3AKIA 1V6NA 4FQ4A 4YM1A 5E88A 5JOZA 5CB7A 2GNDA 2Y9FA 1PUMB 1NLSA 4ATEA 3Q7XA 1BFCA 2BEAA 2UU8A 4C1WA 2VU9A 4GOYA 2ZGOA 4ZLBB 2PHXA 5KXBA 3AKGA 1LULA 3ZSKA 3T2TA 4I4SA 4AGRA 4Q2FA 4FPCA 1BYHA 3RMXA 4XXPA 1BLAA 1IJTA 3WCRA 3PVOA 4KBBA 1GBGA 4AYUA 2GMPA 1AFCA 5D61A 2VW0A 2VLCA 1WCSA 3T8SA 3OGFA 4TLPA 4JC1A 1PZ8A 1S0CA 2A71A 5FNXA 1VAVA 1IILA 5JVVA 3R4UA 1EPWA 3WO2A 2LALA 4NOTA 3FUOA 4FPLA 4EKXB 2AH2A 1DBNA 4U36A 3OJBA 4JP0A 4FPJA 2PHTA 2CY6A 5GLZA 2X2TA 1ENSA 3C9ZA 3SH4A 4I4PA 4YGBA 1G9AA 1AXZA 1XYFA 2FFUA 3BRGC 2WJSA 3AKHA 1IT0A 1AXMA 2DURA 2HYKA 3FLTA 2OUJA 3WLUA 4UW4A 2ZACA 1ISXA 1ULFA 4LO7C 1C4RA 1EYLA 1DFQA 2NP0A 1WLWA 1G9CA 4LO0C 2PELA 5IT6A 4GWNA 3QYDA 4DEPA 3WZ1A 4PCRA 1KJRA 4FQZA 3AZZA 3FJFA 2KI4A 2ZGRA 1GLHA 5GALA 1CPNA 5T5OA 1AVXB 1UPSA 3VEQA 5BVPI 1GANA 1XQNA 1M16A 4GP0A 4LBMA 2D44A 2RQ9A 1WBCA 4TYSA 1X50A 2NVHA 1FATA 3U4XA 1S1AA 1T9FA 3AXDA 2A6ZA 1GICA 2IHOA 3BX1C 5DZFA 3O4OA 1D2SA 1ULEA 2ARXA 5T5LA 4G6JA 3UK9A 4PC4A 1DQ0A 1ISVA 2KM2A 1DZDA 5BQUA 2P3IA 2D7FA 3FJ8A 2EXHA 1S0FA 4YW5A 5T52A 3AXEA 4ASMB 3BAUA 1A8DA 4BPZA 4I1BA 4ZOTA 4FVVA 7I1BA 1UX6A 1SBFA 1FV2A 3WDTA 1MVEA 1TOOA 2DVFA 4YW2A 1LGNA 3BADA 1FMMS 1BFFA 3WDYA 1DQ4A 3Q7WA 2P23A 4XILA 3HR9A 4W65A 3UDAA 3AK0A 3M3EA 3R4SA 3MEPA 2PHUA 3MPPG 1LHVA 1GZCA 1QQLA 4YM3A 5F8YA 3O4AA 2DVGA 4L8QA 1WLDA 1AF9A 2HZ9A 1G8WA 1LOBA 4RA0A 4K1ZA 2GMEA 4XYXA 2F8XC 2DVDA 4BQ1A 3IN9A 1AXKA 1SR4A 5BP5A 1BA7A 21BIA 3P6IA 4XXAA 3IM0A 2AREA 2WT1A 4AN6A 1AVAC 3O4CA 3HBWA 1AJOA 4YZ4A 1SLBA 3APBA 4Q1PA 2MIBA 2WBCA 2SLIA 3PVNA 2UWCA 1BXHA 4AVTA 1IS6A 4KEIA 2WSUA 1BLDA 1RITA 1UAIA 2QYIB 2NZ9A 4GAFA 3BA4A 1PZ7A 2YY1A 4LBOA 4ZBVB 2D3SA 2I2SA 1LHOA 1LENA 4IY9A 4X37A 4FPOB 1CVNA 2FHRA 4WV8A 2WQZC 2D23A 3M2MA 1VCLA 1GGPB 1HWMB 1LHWA 1S0DA 2DUPA 5GZGA 5EHAA 3S8JA 2ZKNA 3OGGA 3FJAA 5GAQA 1YXWA 3AJ5A 4AVVA 1WBLA 4J2XA 4I6IA 5BOWA 3WDWA 5BQUC 3FJBA 5DVHA 1V6OA 1BARA 1FNZA 4AGVA 5JOXA 3O12A 2WT2A 1SCRA 1QF3A 3CRGA 4XZPA 1LCLA 3BA5A 41BIA 3JU9A 3PHZA 1JHNA 3TC2A 3KMVA 2EXIA 4LBNA 1GZWA 1IOAA 2ZQNA 1V6JA 1W6PB 4MYEA 5F5QA 1JTCA 4GOVA 1HQWA 3DGTA 2JE7A 3USUB 1KNMA 2VXTI 1LOAA 1QOSA 1QOTA 3WVJA 2KI6B 3F1RA 4AWDA 3AP7A 1SFYA 1V6XA 1HIBA 2HW9A 3AYAA 3B9UA 2YZ4A 2FDBM 2A3YA 5FZUA 2D6OX 4OWJA 5B2HA 3E8LC 4OWKA 4NO4A 4JCKA 2AGSA 3AKFA 3VV1A 4P0KA 1XHBA 4YW4A 2AXMA 2ZMKA 4XJAA 4P9WA 2D24A 2CWMA 1C1LA 3OJMA 4J23B 2ZBJA 3NV2A 2W39A 3OY8A 4YZ2A 2LTNA 3N7JA 3PVEA 1YF8B 2JDZA 4LO7B 1DQ5A 5DUWA 3VT1A 3D4KA 3ILRA 3JUUA 1HCDA 2D3PA 2ZMLA 1LOGA 3SNVA 3KQRA 2MC2A 3VSZA 3MW3A 1ISYA 2P3KA 3WMVA 2ZGLA 1I3HA 2DTWA 3EF2A 4JKXB 4FOWA 1MZ6A 4I3NA 3UD8A 1ULDA 1G82A 2XG3A 1W0PA 2AUYA 3M3OA 1S0GA 3WUCA 2YUGA 1ISZA 3VUOA 1CESA 2NM1A 4I4YA 5T55A 2ERMA 4LO2A 1MS8A 2D7RA 4LO0A 1QGLA 4OEGA 1V00A 2BFHA 3V79C 1AJKA 2D6NA 2KH2A 1YI7A 2CNAA 1G7YA 1WW5A 3AYDA 4G9MA 2ZGUA 1QMJA 1DQ6A 1BQPA 1D0HA 3BA7A 5D62A 4HANA 4ATFA 1RIRA 1IKQA 3WDVA 3OJVA 4XE9A 4I96A 2FO1A 2A6YA 1N1TA 2D6PA 4ISRA 4F34A 4X38A 1URXA 3A23A 5GZDA 4YFZA 3BAHA 2ES3A 3V64A 2AENA 3DUIA 3ZXGA 1JXNA 1UKGA 3RTJB 4WBCA 4I1EA 1OQ1A 3BAQA 1Z78A 4F83A 4Q8KA 2W08A 3NV4A 1W6MA 3BIWE 1W6NA 3AFKA 5FREA 2PHRA 1IHKA 4XKIA 4K20A 3PUBA 1HQLA 3VWCA 1V6UA 1UN1A 4M3CF 3OBRA 1CJPA 3LSEA 3BRDA 3ZPYA 2CL2A 2DVAA 2K8RA 2R1BA 4JQ0A 2AYHA 3AH1A 3IAGC 4I0YA 3CAHA 1G9FA 4YG6A 5JOWA 1LEMA 2ZHLA 3W9TA 1H9WA 3ILFA 1L2HA 3BTAA 5I1BA 3PMEA 4R9DA 1ABRB 3FLPA 5EG6C 1P63A 2MLLB 4OEEA 5EXOA 2BEBA 1LECA 4OUJA 1MS5A 1MS4A 5T50A 2JJ6A 3H6QA 2F2FC 5GZEA 3V0BA 4ZXKA 2DRYA 2D43A 5D63A 5G00A 2GN7A 4Z8SB 4Q27A 3UD9A 2GNTA 5L73A 2A5ZA 5E89A 4OW4A 1HLCA 1SBDA 4LO2C 3JRRA 4P0JA 4YM0A 1W3AA 2RSTA 4J2KA 1S0LA 4X39A 4YZ1A 3FJCA 2R0HA 4HL0A 4XBNA 1LEDA 1Z0HA 1VALA 3B69A 3FJKA 4Y1XA 2E4MA 1CE7B 3UJQA 4H55A 1UL9A 4RL7A 4AN7B 1LOFC 4ZGRB 3LTQA 4R9AA 3FLRA 2ZA9A 1G9DA 1FN0A 3UJ0A 3CA5A 4OWLA 3AH4A 1TTUA 4CJMA 2NN8A 4Y20B 2UURA 3GALA 3A4UA 3WDUA 3PJQA 1G86A 4IONA 2UWAA 4Y1UA 4I2SA 3ZXEA 2VUAA 4YGEA 3AX4A 3ATGA 4YLZA 5IK4A 2A6VA 3A22A 1QDOA 3L2YA 4A7KA 4X3AA 1O4YA 1YRZA 2DUQA 2Z48A 3CA0A 5CNAA 2CYFA 4Y20A 5JDBA 2Q5TA 2DS0A 4Y1YA 4ISQA 5DSSB 3M3QA 2D3RA 2ZGNA 4Y24A 4BMEA 5DUYA 4R9BA 2D22A 2Y9WC 4I4OA 1PZ9A 3POSA 4I37A 1FMZA 4M3CA 3FJIA 1OQLB 3WO3A 5DZUA 5FNWA 1JT5A 5KXEA 1DJSB 3VSFA 2XB6C 3IKWA 3O5WB 5GZCA 2YROA 1C57A 5CBLA 3ZX7A 4XIKA 3AZVA 1FYUA 4YM2A 3QR5A 5LK5A 2KLLA 1AVBA 4KEJA 1SLTA 2UUSA 4XFSA 3JUTA 4IY8A 1QNYA 1RINA 1N4KA 4PF5A 1GNHA 1LGBA 3B00A 3Q9OA 3ZC8A 1IKPA 4KEKA 2GN3A 3AJZA 3AZWA 4QBCA 2Y9GA 4GXLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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