3N7LA

Crystal structure of botulinum neurotoxin serotype d/c vpi 5993 binding domain
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
422
structure length
418
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNTGLITNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Identification of a Unique Ganglioside Binding Loop within Botulinum Neurotoxins C and D-SA .
pubmed doi rcsb
molecule keywords Neurotoxin
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 96
structure length 418
sequence length 422
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3n7lA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3n7lA02
4G9NA 4XYXA 1LEMA 1SACA 3UD9A 4R6UB 1G9BA 2A7AA 4MYEA 5IK5A 4Y24A 1CE7B 1URXA 3IIRA 4YM1A 2D23A 1AFCA 2KKIA 3Q7XA 4QD2C 1NZKA 2HWMA 4LO3A 2DV9A 1ITBA 3ZC9A 4GOYA 4AN7B 3R05A 3CA6A 4YM0A 4IZXA 1DBNA 2FFUA 5E8AA 2YUGA 3CA5A 4JCKA 3I2XA 3ENRA 5CAZA 3SNMA 2A6XA 4U36A 3SH4A 1APNA 4HANA 21BIA 1AVBA 1IHKA 3IN9A 1BFGA 4EFRA 1QOOA 2ARXA 4JQ0A 2VXRA 1V6LA 1BFCA 4YW2A 1GKBA 1N1TA 3AFKA 2E4MC 1LHNA 1GZCA 3AYCA 2P2KA 3ZYPA 5IK7A 5T5OA 3KMVA 1G9CA 3O4DA 3MPPG 4BMBA 3M3QA 4XJ8A 4XXAA 4H55A 3FJHA 3RRDA 4KC3A 1Q8QA 9ILBA 3IAGC 1PUUB 2A6YA 2PELA 4DQAA 3AZVA 2DVDA 4XJUA 1KITA 2F2FA 3CAHA 1QQKA 2DRYA 1ZM1A 4BQ1A 4C1WA 4BLIA 1EYLA 1LU2A 2GMEA 5GZCA 1QNWA 1W6NA 2CWMA 2AFGA 1HCEA 2ESUA 4ZGRB 1MR5A 4Y22B 1Y7BA 2NM1A 3VKLA 1D2SA 2ZMKA 1W0PA 3SISA 3NBCA 1IKPA 2I2SA 3N0KA 1MZ5A 2ARBA 1HKNA 1XYFA 3CA1A 1W6MB 41BIA 1GNZA 1U0AA 4P14A 1N3OA 4G6JA 1DFQA 3N7KA 3WG4A 3NJ5A 2DU0A 2M49A 2TEPA 2K8RA 1R8NA 2J3PA 2KI4A 1DYKA 3LSEA 1UKGA 2FMDA 2ZACA 1TTUA 3LCPA 4EEEB 1IS3A 2FDBM 4LO1C 1LEDA 3LTQA 4QALA 1DQGA 1VALA 4XIKA 3V79C 2E53A 1N4KA 1G9FA 3APBA 1DQ4A 3BAOA 3POYA 3AYEA 4D69A 2NVHA 3HSMA 2I1BA 5H9PA 1W6QB 4IQPA 1K5VA 4XFSA 4GXLA 5FNWA 3ZXLA 4XHBA 4HR6C 2UUSA 4BM8A 1LGCA 3O0XA 4QD2B 4Y20A 4OEGA 4KEIA 1Z4SA 5H9RA 1WBLA 4J2YA 4YG0A 4XDQA 2A75A 4Y22A 1J1TA 2NMNA 5T5LA 4ZFYB 1DQ0A 2AUYA 5F8YA 4Q1RA 1CJPA 1RIRA 3OJ2A 1V6IA 1SBDA 1LTEA 1Q8SA 1ABRB 1UAIA 2NP0A 1KNMA 3AKFA 3IKWA 3CU1B 1LHOA 1J0SA 1C57A 3M1HA 2E7QA 1ENQA 1LOFA 4R9CA 1FX5A 4RL7A 1S0LA 4XIOA 4SLIA 2RHPA 3ZXGA 1GLHA 5F8SA 4F83A 3WDTA 5FREA 3VSFA 2DUOA 2Q3NB 3A22A 2D6OX 2A6ZA 2DVFA 1JYIA 1ENSA 1LULA 4WZFA 2P37A 4GAFA 3VKNA 4YZ1A 3WMVA 5T5JA 5T55A 5E89A 4XXPA 1BLDA 2ZGNA 5IUQA 1N3QA 1DZDA 5EWSA 5GALA 3VKFC 4XJAA 3WOGA 2ZHMA 4BPZA 2VW1A 1BJQA 3D5OA 4AVVA 1NUNA 4D8HA 3NBNA 2ZGPA 1QQLA 4XE9A 3H6RA 3ZXDA 2HWAA 1WLDA 3MW2A 2RSTA 1TWMA 3TAYA 3H6SE 1S0GA 3BADA 2ZHKA 1R8OA 2Y9GA 1QF3A 1XG6A 4EFQA 5DG1A 1UX6A 1W3FA 3OBRA 2DUQA 2VW2A 2D20A 3ZSLA 2F8XC 1VLNA 4IONA 3O0WA 1PC8B 3SNVA 4DS0A 1G9DA 4P0JA 1AXKA 1WW5A 3HN1A 1VAVA 1NLSA 2QN4A 3BAVA 2W39A 4XBNA 1WBFA 3ATGA 4K1ZA 3EF2A 1IS6A 2C5DA 2Q5TA 1AVAC 3A21A 3UJOA 1FNZA 4IY9A 1UMZA 4GP3A 3WMUA 1LENA 4I4SA 1ULDA 1ISXA 1TFMB 2GN7A 2GDFA 4JP0A 4NO4A 5GZDA 1JT7A 2BEAA 3FJFA 1WW6A 2E7TA 4H04A 3KM5A 1Q8PA 4P0LA 3POSA 2ES3A 2XG3A 1DQOA 4M01A 5G00A 1IT0A 2ZGOA 1MC9A 2ZGQA 4YZ2A 1YI7A 1MS8A 2AAIB 1PZ8A 5BXRA 4YGCA 2A6WA 2K4AB 1AVUA 2ZAAA 1BLAA 1DGLA 4M3CF 4HL0A 2LALA 3F62B 5EXOA 2PHFA 4LBKA 5DUXA 2ZHLA 5JOWA 5KXEA 1FQ9A 2ZGUA 5SV8A 3VWCA 3O4CA 1WCSA 5HCBA 1RITA 4LO2A 1MVEA 2EXIA 3NV3A 1XQNA 1MS1A 1TEIA 4LO1A 2R1DA 4FPOB 4ZA3B 1HQLA 2P34A 1W3AA 2GO2A 3AJ6A 5D62A 2A5ZA 2VUAA 1D0HA 2VW0A 2D3PA 4DENA 5T5PA 3WA1A 2WBCA 4TZDA 4XFUA 3M3EA 3P6IA 3ILAA 2AREA 1MS5A 3R4UA 1SR4C 4K20A 1FV2A 1DQ2A 4CZSA 3IPVB 2EXJA 3GNEA 3P6JA 2DWRA 1YRZA 1GICA 5DZUA 2LTNA 2DTWA 1UZZA 2WKKA 1C4RA 4OWKA 4I4VA 1T4QA 3T1MA 3ZSMA 4GKXA 2L5XA 5GM0A 1EVTA 1LODA 2ZGKA 4YG6A 2CWSA 1E0OA 4OWJA 2YZ4A 3UK9A 2AQZA 2B7YA 3RTIB 2ZGRA 4Y1ZA 4AWDA 3RMYA 3BODA 3HBWA 3AYDA 6I1BA 2NYYA 3AXDA 1X50A 2OUHA 1DFCA 5DUWA 4RA0A 2CNAA 3HOMA 4AVTA 2NTDA 4LBQD 2BFHA 3U4XA 3AJ5A 1HWNB 1S0FA 3V0BA 1SFYA 4Z9WB 1BFFA 3LLPA 4R9AA 4P0KA 4JRAA 1A3KA 1S0IA 2ZA9A 4OEEA 3VKOA 1LOGA 2UU8A 1FYUA 1TOOA 3INAA 3WDWA 2ERMA 3ILRA 3AP9A 1ISZA 4YM2A 4IY8A 3WCSA 2VY0A 2VLCA 2MIBA 4YOLA 4I0YA 4UW4A 3OY8B 4YLZA 2WSUA 3OGFA 3ASIA 2D7RA 4D0ZA 2KM2A 2E51A 2WRYA 2DYCA 4FPKA 1AXMA 4Y1YA 4ISRA 3AH4A 1XHBA 2RQ9A 3OPZA 3T2TA 4XOGA 3ZVXA 1UPSA 4FOYA 4AVSA 2AR6A 5EHAA 3ILNA 4Q9PA 3UJ4A 5L73A 3RG0A 5KXDA 2Z42A 1Q8OA 4P9YA 2Z49A 2JE7A 4XBQA 5GZGA 4M00A 4IYBA 1OKQA 3GALA 5T52A 3I4IA 2X2TA 5GLWA 3HMYA 2CTVA 4Q8LA 1MS3A 2XB6C 1BXHA 2JECA 3AP7A 3P53A 4JAWA 1BASA 5H9SA 4I7IA 1YYNA 3FJBA 1VIWB 4LBQB 1H9PA 2ZQNA 1IILA 4KEKA 1RMLA 4U2AA 2A6VA 1SBEA 2ERFA 4I4OA 4G6MA 4CTEA 3WCRA 5DUUA 3L2YA 3CA4A 1WLCA 1WD4A 5DUYA 4R9BA 1G86A 4Q91A 3C9ZA 5F5QA 2FHRA 2JJ6A 3WZ1A 2IWTB 5JOZA 2W68A 4WV8A 3R4SA 3Q9OA 3AH1A 4GOVA 1MS9A 3CA0A 2OW4A 4OZXA 3WNXA 3B00A 1FMMS 3JRRA 3K1XA 1H9WA 4LBJA 1O4ZA 2D3SA 2QYIB 2BQPA 3WDUA 4BLJA 2AENA 2MLLB 3ZPYA 5FZUA 1KQRA 1W6PB 3VT1A 2SLIA 3T8SA 1WUVA 1GZWB 1KJRA 4UW5A 3BAUA 4J23B 1HIBA 4EKXB 4YW4A 3O49A 4TLPA 5T50A 1LGNA 4KEJA 4Y1UA 4JKXB 4Z8BA 4LO0A 4G1RA 5FZZA 5BQUC 5GLZA 2WQZC 1S0DA 1QOSA 1JLXA 5KXCA 3AZXA 4FPCA 4USPA 1YBIA 1OQ1A 3UDAA 4F34A 2UURA 2Q9XA 4AYUA 3WV6A 1MS4A 1YXWA 2HYKA 3O12A 5LK5A 1M16A 2Y9WC 4Y1XA 2OVUA 2PHTA 4Q8KA 4LBQA 1QXMA 1V6OA 3MEPA 4DFSA 1PZ7A 4ATFA 3BAQA 1V00A 1SR4A 2VXTI 4XTMA 2D22A 1W6MA 4FGFA 1Z78A 1BQPA 4LBNA 1S1AA 2ZZJA 1Q8VA 2V73A 3VV1A 4X39A 3UJQA 2GNDA 1HDKA 2UWCA 5DVHA 3MALA 1HWMB 2A3YA 1FV3A 1SLAA 4M3CE 1AX1A 4JC1A 1BKZA 3N7LA 4HA2A 4YZ3A 1RY7A 2A71A 2C9AA 5EYXA 1QDOA 4L4HA 4YG3A 2R49A 4FP3A 2DVAA 4K1YA 4LO3C 3A4UA 3WDYA 1WLWA 3OJVA 3F1RA 3FUQA 3D7WB 1W6QA 1YO8A 2KI6B 4NOTA 3WVJA 4H9WA 4ATEA 3NBEA 1S0BA 4XJZA 1Z0HA 2D6NA 4YGEA 1B09A 1LOBA 2YROA 4Q2FA 3N36A 4DEPA 3JU9A 3B9UA 3AP5A 1CQ9A 1Q04A 4JKQA 1AVXB 7I1BA 1MS0A 2GALA 4ENDA 3PJQA 3I29B 3NV4A 5BXPA 2GMMA 5JVVA 2WNEA 4FOQA 4PBPA 3B3QE 4CRQA 1WBAA 1FAYA 4PCRA 3UJ0A 2Z48A 2JE9A 1GZ9A 2E4MA 1JHNA 2R1BA 3VUOA 2JKBA 2EXHA 4Q26A 5BP5C 2D6MA 4I6IA 3FJCA 1V6NA 1N1VA 1LESA 4M3CB 2BEBA 4A7KA 1S0EA 1ULFA 5JOYA 3BRGC 1JYCA 5D61A 1QOTA 1PZ9A 2ZR1B 4LBLA 1VCLA 4FOVA 2EALA 3FJDA 4I4QA 3WG1A 3WUDA 2DREA 1LHVA 2ENRA 5CB7A 5HCAA 3OYWB 4I37A 3WUCA 1KRIA 4HJJA 4YW1A 1MVQA 1CIWA 2ZGLA 4DCKC 3BRDA 1F31A 2D7IA 1SCSA 2WLQA 2IHOA 1JUIA 3ILFA 1LHWA 3UD8A 4IHZA 3BIWE 1CR7A 1N1YA 1MACA 4LBOA 1AJOA 1EPWA 4LO8B 2YXSA 4TYSA 1ILR1 2EF6A 3WDVA 1AJKA 2GMPA 3MW4A 5E24E 1W6OB 1SLBA 4DRRA 1MD6A 5BVPI 1PZZA 1FGAA 1UL9A 3TC2A 3IM0A 5JMCA 3WG2A 1BFBA 1ONKB 3AKHA 2JD4A 5GZEA 3H6QA 1ISWA 3FFZA 2ZMNA 3CRHA 4YW5A 3AP6A 3I2AA 2ZGMA 1AX0A 2VSEA 5GAQA 2P3JA 3DGTA 4Q9GA 3ZSKA 3BRFA 4I4PA 3AZZA 1MZ6A 2WT0A 1GBGA 4OEFA 5CA6A 1IS4A 3O0VA 4JPZA 4FPFA 3AZYA 4OW4A 3IMNA 4XTPA 1PWAA 3N7JA 1SLCA 1UN1A 2HZ9A 1LOFC 1V6VA 4I4XA 3O3QA 3JUTA 4IZEA 1IRAX 5CNAA 4I4YA 3FJEA 1ISVA 3ZC8A 1H30A 2AGSA 5IT6A 1NXD1 4ASMB 2GNMA 4XILA 3AX4A 2ZHNA 3O4BA 3OYWA 5BXTA 2A3XA 1M2TB 2G4IA 2LIQA 1KDKA 5GLVA 1Z2VA 3V64A 3DUIA 2DVGA 5T54A 1ULCA 1W6NB 4J2XA 1LECA 3H0OA 1QMJA 1DZCA 3M3CA 4AGVA 3SH3A 4QBVA 1G8WA 2HW9A 4GP0A 2E6VA 4J2KA 2R0FA 4DPNA 1W6OA 1II4A 1JXNA 3BAGA 3B9CA 1JBCA 1W0OA 4X38A 4FPLA 4YM3A 3WLUA 3S8KA 3O4AA 4ZLBB 1V6XA 3BAHA 1QU0A 1RINA 5FRAA 1SLTA 4YFZA 1PUMB 2JDZA 2P3IA 4I96A 1EV2A 2R9KB 2GNTA 4BMEA 4ZBVB 4YFWA 4C1XA 4FPHA 1JT3A 1HLCA 4OUJA 5DUVA 1C1LA 8I1BA 4UW3A 1DZQA 3IPVA 3NV2A 4WBCA 3IM7A 3QR5A 2W52A 1T9FA 1G82A 4LO7C 4XBLA 1CPMA 3VSZA 2P3KA 2D44A 3WINC 3SITA 2CL2A 4Q1PA 3BOPA 1DQ6A 4PC4A 5GLUA 4R9DA 1QGLA 4PBOA 2P39A 2GNBA 3FGMA 2FFVA 1V6KA 3D4KA 2RG9B 1CVNA 1VAMA 3ZSJA 1R1ZA 4P9WA 3ZYRA 1FN0A 1IOBA 1RZOB 1LCLA 3Q7YA 4L8QA 1JTCA 1IRPA 1V6MA 4Y20B 1A78A 5D63A 3WHTA 4OWLA 4I1BA 31BIA 5BP5A 1Q56A 2ZGSA 3QCWA 4I2SA 2NMOA 1JT5A 4UW6A 3T1LA 3WO3A 2R16A 1SLIA 3WDXA 1P63A 1FWUA 3PMEA 3NWKA 2FO1A 1JOJA 4GWNA 3O5WB 4QKRA 3FJIA 1WBCA 4XZPA 3FBYA 1QKQA 3OY8A 1JQZA 3ZXEA 2DS0A 2A70A 1GGPB 4Z8SB 1JY0A 1CESA 3PVOA 3PVEA 3C2UA 4FQZA 2V5YA 2GN3A 1AX2A 1SZ6B 3M3OA 2ZABA 2D24A 4LO2C 3CRGA 3POKA 5BXSA 1JLYA 3PVNA 4A7ZA 1G7YA 5E88A 3AXEA 4XJWA 4FPJA 4PQ9A 1AXZA 4ZFWB 2WT1A 3VT2A 1OQLB 3HR9A 2D1ZA 3AKIA 1HCDA 2ZMLA 4K21A 1GYKA 3AP4A 3NBDA 5FNXA 2D6LX 1WW4A 3FJAA 1FWVA 2YMZA 1YIFA 1BA7A 2D6KA 4WVWA 1K5UA 3H6RB 3NV1A 1SCRA 2DURA 4XJ9A 3O5SA 3ZX7A 1FNYA 2PHUA 3AJZA 3VEQA 4D0TA 3B01A 1WD3A 3SLIA 1N47A 1AVWB 2AYHA 1DLLA 5GLTA 5I1BA 2UWBA 2D43A 1OFSA 5HPZA 3POWA 4I30A 5DG2A 1XZZA 4AGGA 1F9KA 2WSVA 3OJMA 3ZXJA 4DRVA 4LO7B 1HKDA 1SLLA 1CPNA 5EYYA 2MC2A 4G9MA 4ZKTB 5JLVA 3OJBA 3QYDA 5DSSB 1UZYA 4Y26A 3BA7A 1YTOA 2K43A 2DVBA 1DHKB 4AGRA 4QBCA 3ZXKA 3I8TA 2KLLA 2CY6A 2DTYA 3FJ8A 1GNHA 4ISQA 3RS6A 3FLTA 5IK8A 3AYAA 5H9QA 3IM5A 3A0KA 3V65A 4X37A 3Q7WA 4XKIA 1ULGA 2SBAA 1W6PA 4ZFUB 4GKYA 3V0AB 2AXMA 2ZQOA 1GZWA 3W59A 1DYPA 4YGDA 3M2MA 3FLPA 3PG0A 3PUBA 2NZ9A 1DQ5A 4QC4A 3FUOA 5CBLA 1BARA 3USUB 2PHXA 3CRIA 1LHUA 3ZXFA 1ZA4A 4XFTA 4QO3A 3N3HA 3B69A 4YZ4A 2DUPA 1TWEA 3BA5A 5EC5A 1BYHA 3BX1C 1LOCA 1LOEA 2DU1A 4ITCA 3VKMA 1W3GA 2X2SA 3UD7A 3IM6A 4XHXA 2D6PA 2VSAA 4EB2B 5DZFA 4Y1VA 3OBTA 1HQWA 1LOAA 2PHWA 2R0HA 2UWAA 1CONA 3A23A 1V6JA 2AH2A 1QDCA 2F2FC 2ZKNA 1SBFA 4J2SA 1Q1UA 4A7YA 4W65A 2ZGTA 2XOAA 5B2HA 5F90A 3SH5A 2D3RA 3BTAA 2CYFA 3CA3A 1I1BA 3VT0A 3WINA 3A07A 1DQ1A 5FZYA 4YZ5A 3E8LC 1TIEA 5KXBA 3W58A 2A3WA 2DRZA 1IKQA 4FPEA 2NN8A 1IOAA 4I8MA 4GWMA 5AVAA 2FGFA 4FPGA 4L4IA 1GV9A 3JUUA 3CNAA 1IJTA 3W9TA 3PHZA 1C1FA 1ISYA 4GA9A 3A0NA 3V0AA 1A8DA 3MW3A 5F9TA 1WW7A 2OUJA 1HWPB 4PF5A 3FJ9A 1YF8B 5BYNA 3WHUA 1AF9A 4FPYA 5JOXA 1G9AA 2W08A 1GSLA 5DXDA 1QNYA 3USUA 3QLQA 4I4UA 4YGBA 3BA4A 5BOWA 1JW6A 5F8WA 2LIEA 4FVVA 4YW3A 1FATA 4P6AA 1ONAA 1I3HA 3FLRA 1DJSB 1N3PA 3RTJB 3V0BB 2ZBJA 4I3NA 4FOWA 1TP0A 4I4RA 3CQAA 2P23A 4LO0C 1JT4A 5GJ6A 4FQ4A 3TB0A 1O4YA 3FJJA 2VU9A 4CJMA 2KH2A 3AZWA 4X3AA 1DIWA 4EFPA 3UL2A 3O44A 1KJLA 1Q03A 3AJYA 1S0JA 4M3CA 4USOA 5BQUA 1RG8A 2EXKA 3LSDA 3D6EA 3N7MA 5DZGA 4QKSA 1LU1A 3O4OA 2EIGA 1N1SA 2WJSA 4BOWA 2EAKA 4WVVA 3AH2A 4GAIA 2YY1A 1L2HA 1V6UA 4XMIA 1GANA 1KDMA 3WO4A 3OGGA 3KQRA 1FMZA 2VH9A 1S0CA 3HALA 3RSJA 3WG3A 1HWOB 4FP2A 4GALA 4P9XA 2ET2A 1AZDA 5JDBA 4LBMA 1I1EA 2H0BA 2YV8A 4KBBA 4ZOTA 5DZEA 1LGBA 3FJKA 3WO2A 1ULEA 5GZFA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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