3N7LA

Crystal structure of botulinum neurotoxin serotype d/c vpi 5993 binding domain
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
422
structure length
418
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNTGLITNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Identification of a Unique Ganglioside Binding Loop within Botulinum Neurotoxins C and D-SA .
pubmed doi rcsb
molecule keywords Neurotoxin
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 96
structure length 418
sequence length 422
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3n7lA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3n7lA02
2OVUA 2FGFA 1KNMA 3SISA 2W68A 2FFVA 1DYPA 4FVVA 1I3HA 2A71A 2DRYA 4RA0A 4Z8BA 3O4OA 2DU1A 3C2UA 3WZ1A 3PJQA 3BRFA 4P9XA 5DXDA 4I1EA 1CR7A 3BAHA 4USOA 3WMVA 1TP0A 2DU0A 4WBCA 1WLCA 2WRYA 2E4MC 1D0HA 1KJRA 4ASMB 1IS6A 3USUA 4KEIA 5GLTA 3QLQA 2ZHMA 4OEGA 1G9DA 1W6QA 2DTWA 2D20A 2A3YA 4GXLA 4G9MA 4QKSA 2VSAA 1QGLA 2FMDA 1LECA 2E7QA 3FUQA 4SLIA 4BQ1A 1CIWA 3AZVA 1F9KA 3AH2A 4JP0A 1BXHA 2R1DA 1S0JA 3A23A 4FGFA 2Z49A 1GKBA 1SLCA 1HWPB 4FOWA 2X2TA 3IPVB 4LO3A 5H9QA 2ZGQA 2I2SA 4ZOTA 4I4UA 1URXA 4YG6A 4Y20B 5BXPA 3O4AA 2JD4A 3BOPA 2D3RA 3PVEA 2P3IA 2WNEA 3T1LA 2B7YA 3ZSMA 5HPZA 4LO7C 4BLJA 2DTYA 2E6VA 4FPHA 4YZ1A 2D44A 4PF5A 4XFTA 3OJMA 3A0NA 1BFCA 4Z8SB 3WV6A 3BAUA 1SLTA 1JOJA 3SNMA 5JOYA 1LOEA 4FP3A 4KC3A 1PZ9A 1MS0A 4FOQA 1LHOA 3NV1A 3S8KA 1WBCA 6I1BA 3WDVA 4AVVA 2UURA 1FN0A 2V73A 3UL2A 4IYBA 4QBVA 1S0DA 1GZWB 5DUXA 5IK8A 2YXSA 2ES3A 3V0AB 1MVEA 4GP3A 4YGBA 1DQOA 1MS9A 1HDKA 1GNZA 5BXRA 3BAQA 4ZFYB 3O49A 4YW3A 1DQ4A 4YW1A 4UW4A 3RRDA 1N1TA 1Q8VA 1LODA 5E89A 4ISRA 3AZWA 5I1BA 1BLDA 1IS4A 1MZ6A 5DZEA 4AVTA 5JLVA 2HYKA 5BP5C 4A7ZA 4XBLA 3RTIB 4P0JA 1SBFA 4DPNA 2GNDA 2R1BA 1AVXB 3CQAA 1IILA 1SLBA 3FJAA 4JRAA 1YI7A 5F5QA 3POSA 1G7YA 4Q8LA 5FZYA 5T52A 1DZCA 2DWRA 5FREA 3IPVA 1HLCA 2ZQNA 4EEEB 2ZMKA 1Q56A 3AZZA 1GLHA 1JN2P 4Y20A 1ULFA 3A07A 3W58A 1GGPB 3JRRA 3BRDA 3GNEA 4Y26A 4M3CA 1BARA 2JKBA 2NN8A 4GOVA 3ASIA 2H0BA 1MS3A 5GJ6A 4XTPA 4Y1XA 5DG1A 2ERFA 1JT4A 3TC2A 5GZEA 4OEFA 3NV3A 2ZGMA 3M2MA 1W6OB 4XIOA 1A3KA 4L8QA 3B01A 1SBDA 3JUTA 3UJOA 2CTVA 4DS0A 3N36A 1N47A 2NTDA 2OUHA 5H9SA 3K1XA 4I4SA 2PHTA 3AYDA 4YFWA 3ILAA 4ISQA 4LO0C 4FPYA 3VKMA 3V79C 1CESA 2A6ZA 4XJ8A 4IONA 4GP0A 3QR5A 5DZFA 3I29B 2DUQA 4QKRA 5F8SA 2A5ZA 4J2YA 2PHFA 4OWKA 3OJVA 3A4UA 1QU0A 1T4QA 1ABRB 4GALA 3V0AA 1CPNA 3JUUA 2W39A 1N3PA 3ZXGA 4IHZA 3WINA 4GWMA 1WD3A 2P39A 2ZGTA 4C1WA 4YGEA 1FNZA 1QQLA 4KBBA 1QXMA 1SCSA 3IM7A 5GLWA 1W6NB 2PHXA 1F5FA 1YF8B 2ZA9A 3OBTA 1CVNA 4D0TA 3WG4A 4D0ZA 3POWA 1SZ6B 5GM0A 5JVVA 4J2XA 3QCWA 4JQ0A 4YM2A 5JDBA 3MW2A 4X39A 4ITCA 4LO8B 3WDYA 3EF2A 2Y9GA 2WSVA 4YM0A 2L5XA 1KQRA 4KEKA 4FPJA 3FJ9A 1KDMA 4LO2A 5IT6A 3AK0A 3A22A 5IUQA 4XHXA 4U2AA 2RG9B 3T8SA 3R05A 4LBNA 2P2KA 2LTNA 3N0KA 2Q3NB 3PHZA 5F8YA 1AXYA 1HKNA 1XHBA 2CWMA 1LHVA 3INAA 2GMMA 4Y24A 4Y22B 4EFRA 4TYSA 1GICA 1LCLA 2A70A 4I4YA 5KXEA 3CRGA 1MS8A 4XYXA 3N7JA 4JC1A 1Q04A 3UD7A 3NWKA 1YO8A 1YBIA 3LCPA 5GLUA 2D43A 5GZDA 2DV9A 1QDOA 1N1YA 1N3OA 5AVAA 3RS6A 1HCDA 1JW6A 1LEDA 2JE9A 1PZ7A 5LK5A 2ENRA 2GO2A 3JU9A 4JAWA 2Z48A 2FFUA 1FGAA 2ZMLA 5E24E 2AAIB 2EALA 2ZZJA 1JLYA 2KH2A 3FLTA 1YYNA 4QALA 3NBDA 3AP7A 1M2TB 3RMXA 3BAGA 1AF9A 3VKNA 4Q2FA 41BIA 1MC9A 2R0HA 1DLLA 3D6EA 1C1LA 4XOGA 4NOTA 2G4IA 1DQ1A 3UD8A 3POKA 4FQ4A 4TLPA 2GALA 4FPFA 4BOWA 3ZX7A 4UW5A 2LIEA 2VXTI 2GNMA 1DQ6A 3NBCA 3NBEA 3H6SE 1FX5A 4DENA 1AVBA 3AJZA 3FGMA 4UW6A 4FPOB 3BA7A 3SNVA 3H6RB 2HWAA 5GALA 4Q9GA 4J2KA 1V6NA 4FPEA 4XXPA 1K5UA 4OUJA 3OGFA 2HWMA 1WD4A 2C5DA 2Q5TA 3LLPA 4I6IA 3WMUA 3F1RA 2A75A 3RSJA 1UAIA 3ZSKA 3HMYA 1UPSA 4DCKC 4HR6C 1J0SA 2WT1A 1BASA 5T5JA 1S1AA 1WLWA 2UWAA 1V6VA 1JT5A 1ENSA 4XJAA 1H30A 2K4AB 2ZBJA 1SR4C 3BA4A 1J1TA 3WLUA 2ZHLA 1LHUA 1SBEA 2ZAAA 3PVNA 2FO1A 4ZLBB 3CA3A 5HCAA 2PHRA 4LBKA 5T5PA 4I4PA 2BEBA 2VW0A 4QO3A 5B2HA 1ILR1 3AJYA 1IKQA 2D6LX 1GYKA 5DUUA 4KEJA 3LTQA 4ENDA 4X38A 3PG0A 3VSZA 3N7LA 3N7KA 2YY1A 1LGBA 4K1YA 2M49A 2ZGUA 4XXAA 1LESA 2GMEA 1GV9A 4WZFA 1CE7B 3BRGC 5EHAA 3BAOA 1JQZA 3OY8B 1VLNA 2PELA 5KXCA 4K21A 4OEEA 1XYFA 3FJDA 3POYA 1VALA 1AJKA 4FQZA 3VT0A 2CNAA 1BKZA 4XJZA 5DZUA 2D6KA 3AP6A 1FMMS 1WCSA 4YZ4A 1MS5A 4XILA 4XJ9A 1LOGA 4AWDA 3KQRA 1IS3A 2R0FA 1FATA 1BJQA 3BA5A 1MVQA 2ZR1B 1TTUA 1W0PA 3N7MA 2I1BA 3ZC8A 3C9ZA 3M3CA 1FQ9A 4YOLA 4ATFA 4DRRA 4FOYA 5GZFA 1XG6A 4YGCA 1IRPA 1OQLB 1TFMB 1DQ5A 4ZGRB 1MZ5A 3B3QE 4GKYA 4XJWA 1ZM1A 3H6RA 4BLIA 5FZZA 1LU1A 1RITA 2ZGNA 2AR6A 5JOWA 3HALA 1BFFA 3M1HA 1Q1UA 1ZA4A 1S0FA 4NO4A 4L4HA 1DZDA 2P3KA 1YXWA 3WINC 2DREA 1IJTA 2JECA 1XZZA 1R8OA 2EIGA 3BX1C 2HW9A 5EXOA 3LSEA 2ZGLA 2EF6A 3WVJA 1S0GA 1DQ0A 2QYIB 1W3AA 1AJOA 4Q27A 1LOFA 4R9AA 1PZZA 1H9WA 1QQKA 1ITBA 3FJHA 3N3HA 3V0BB 1I1BA 2MLLB 1VIWB 1C1FA 4IZXA 4Y1VA 3BTAA 4I30A 3BAVA 3WHTA 1FV2A 2P23A 5EYYA 5KXDA 4YZ2A 3UK9A 3VV1A 3PUBA 3CA0A 2ET2A 2GNTA 3V64A 2IWTB 1Z4SA 4WV8A 1PUUB 3FBYA 1NXD1 1K5VA 4LO2C 4LBJA 4AVSA 4PC4A 2NM1A 4Q8KA 4IQPA 3VKFC 2D1ZA 1CONA 2ZGRA 3AFKA 2K43A 4LO7B 4CRQA 4P9WA 1BFBA 1Z2VA 3I2AA 2D7FA 3FJIA 3IM0A 4II0A 3QYDA 1CJPA 1WBAA 2KI6B 5T5LA 2BQPA 3VWCA 3PVOA 2C9AA 3DUIA 4GAFA 4LBMA 4Q1RA 5E8AA 1MD6A 1CN1A 3VKLA 1V6JA 5BOWA 3MEPA 3CRHA 3FFZA 4QBCA 2CY6A 1V6XA 2GN3A 1X50A 4QC4A 1IHKA 1JXNA 4ZA3B 1V6UA 1Q8SA 1JHNA 2D24A 1IKPA 5GZCA 2Y9XE 4I96A 2GNBA 1LGNA 1PZ8A 3CAHA 4IZEA 4GKXA 4DFSA 5FNWA 2E4MA 3IM6A 4FP2A 4QD2C 4OW4A 2R9KB 3A21A 3NV4A 3PMEA 3BODA 3ZPYA 2Y9FA 4XBQA 3V0BA 1NZKA 1KRIA 3VKOA 1IS5A 1GZWA 1W6PB 4JPZA 4DEPA 2AGSA 2AXMA 21BIA 4IY9A 3M3QA 2WSUA 1BYHA 3S8JA 1AXKA 3AP4A 1CVSA 1C57A 3MW3A 3MW4A 1II4A 3HOMA 3OJ2A 3ZXEA 1SACA 5GAQA 4K20A 5HCFA 3FJ8A 2UWCA 1LHNA 1LOBA 5EWSA 2NMOA 4WVWA 3O4BA 3AH4A 4LBOA 4XZPA 3WG1A 5CBLA 2P3JA 2BEAA 1MS4A 1V00A 5SV8A 2NP0A 3CU1B 1G86A 2KLLA 5G00A 4ATEA 7I1BA 3ZXKA 2YUGA 1BFGA 5CAZA 1G9AA 3B00A 2F8XC 4M00A 2MIBA 3O12A 3UJ0A 3RG0A 2NYYA 4LO1C 5BQUA 3VUOA 4PQ9A 4YM3A 1PUMB 2VY0A 1AXZA 3AKFA 4YG3A 2AFGA 2WT2A 4RL7A 1GBGA 2OW4A 2KM2A 1KJLA 5IK7A 3FJJA 1LU2A 3FJKA 2DUPA 5GLZA 1BLAA 1TIEA 1W6OA 1E0OA 4AGRA 3AH1A 2ZHKA 4F34A 3AKIA 3BB2A 4Q1PA 1QMJA 2ZABA 4Q91A 1AVWB 1SLIA 3SITA 4P0LA 5BP5A 1G9CA 3ZXJA 1VAMA 1JUIA 3APBA 3WDTA 3DGTA 1FWUA 2Y9WC 4XKIA 4HJJA 2AENA 1B09A 4M3CF 4J23B 1W6PA 4YLZA 1V6MA 4I8MA 4LO3C 2UUSA 4OZXA 4A7KA 5DUWA 4R9BA 3RQ0A 1ULDA 3ZYRA 1F31A 1AVAC 3BADA 2Q9XA 2V5YA 1Y7BA 1Q8QA 2DYCA 3O5WB 5D63A 5KXBA 3SLIA 3ZSLA 1W6NA 4H55A 4YZ5A 4FPKA 5DSSB 2E51A 1Q8OA 3WG2A 4TZDA 1L2HA 2VW1A 1GANA 4XE9A 4YG0A 4G6JA 3T1MA 3USUB 3FJFA 2ZMNA 3WOGA 1W3GA 1YRZA 1JYCA 31BIA 5DUVA 3FJEA 3I8TA 4R6UB 1LOFC 2ZQOA 2SBAA 2EXHA 3Q7YA 2VSEA 5JOXA 3R4SA 4I2SA 2ZGSA 3ZXLA 2LALA 3WO3A 4JKXB 1AVUA 1BA7A 1EV2A 4JCKA 4R9CA 2VXRA 1P63A 1O4YA 2YZ4A 3VEQA 3HN1A 1ENQA 2A7AA 1S0CA 4EB2B 1LHWA 1DJSB 1IT0A 1DZQA 1FNYA 3IIRA 5CNAA 3OYWB 3AP5A 1ULCA 4GOYA 2UWBA 3FUOA 1N1SA 3CRIA 2ZKNA 1HQLA 2DUOA 2JDZA 4Y22A 3WUDA 3UJQA 1W3FA 4YZ3A 5GLVA 4LBQB 3ZXFA 1JYIA 5EG6C 1JBCA 1AX2A 2Z42A 5D61A 2JE7A 4PBPA 3B69A 3WA1A 1VCLA 4J2SA 4D8HA 5DZGA 2D6PA 4EKXB 4PBOA 5HCBA 1MS1A 3TB0A 9ILBA 4M01A 2CL2A 3N35A 2GDFA 1SLAA 2WQZC 3AYEA 2VUAA 4BM8A 5BYNA 1KDKA 3FLRA 1NLSA 4I7IA 4I4QA 1QKQA 1WBLA 2KI4A 4CZSA 2DS0A 4Q9PA 3TAYA 5F9TA 4P9YA 1AXMA 4PCRA 3ILFA 4Y1UA 2D22A 1UN1A 1TWMA 5CA6A 1WLDA 1TEIA 2WBCA 1QF3A 4EFQA 1VAVA 3OBRA 3T2TA 1ULEA 2NZ9A 4X3AA 2UU8A 3IAGC 1QDCA 2VU9A 1N1VA 1I1EA 3CA4A 2A6XA 2MC2A 1C4RA 1SCRA 1JT7A 2WLQA 4XJUA 5CB7A 4XFSA 1DFQA 4JKQA 1ISXA 1V6LA 5FNXA 4ZFUB 4I4VA 1CPMA 3AP9A 1LJ7A 1WW6A 3OYWA 2DVFA 4M3CB 1G8WA 3SH5A 3NBNA 2XG3A 3R4UA 4LBQA 4FPGA 1WUVA 2RSTA 2FDBM 3HBWA 2AREA 4EFPA 2XOAA 3ATGA 3AYCA 1ISYA 1W6MB 5BQUC 3AX4A 3AYAA 3IKWA 2EAKA 4GWNA 2W08A 3P6IA 3P53A 2F2FA 4W65A 4HA2A 1V6WA 5EC5A 3UDAA 3O0XA 2R16A 5T54A 1FYUA 3HSMA 3OY8A 4H04A 4YW2A 3AJ6A 5DUYA 1G82A 2WKKA 1GZCA 4I0YA 1KITA 2R49A 4BPZA 3WG3A 1OQ1A 2ZGOA 2QN4A 4XBNA 1FMZA 2D3SA 1UKGA 1T9FA 5F8WA 1H9PA 4FPCA 1RY7A 5E88A 3H0OA 2D7RA 4HL0A 2ZGPA 1SR4A 3HR9A 1EVTA 5IK5A 1DBNA 4ZFWB 2PHUA 4USPA 4I4XA 1GSLA 5H9RA 1HCEA 1DQGA 1APNA 1A8DA 1UMZA 3SH4A 2BFHA 4C1XA 4GAIA 4YFZA 1ISWA 3ILRA 3FJBA 3KM5A 4ZBVB 1ISZA 3WO4A 1LOAA 4I37A 5FZUA 3WDWA 1LEMA 2A6WA 1UZYA 4CJMA 3D4KA 4XFUA 3VT2A 3O4CA 4I3NA 1EYLA 1WW4A 5JMCA 5DG2A 5L73A 1FV3A 3NV2A 4GA9A 1V6IA 2EXJA 5D62A 2DURA 3IMNA 1CQ9A 1MR5A 2AYHA 3WCRA 2A3WA 3CNAA 5GZGA 1Q8PA 4FPLA 4U36A 4WVVA 2ESUA 2A6YA 2ZGKA 4D69A 3WDUA 2D23A 1GNHA 1QNWA 2D6OX 1UL9A 3UJ4A 5T55A 1AFCA 1N3QA 2P34A 2P37A 1AZDA 3SH3A 3VSFA 2PHWA 4AN7B 1ONAA 3W59A 5BVPI 4UW3A 1W6MA 4X37A 3I2XA 4I1BA 1NUNA 1EPWA 4M3CE 1JY0A 3RTJB 2CWSA 4ZXKA 3ZYPA 1Z78A 3AZYA 1ISVA 2HZ9A 4L4IA 1LULA 1RZOB 1WBFA 1W0OA 2WJSA 2VW2A 2IHOA 2A3XA 2AUYA 3O0VA 2YV8A 2GMPA 5FRAA 2DRZA 2EXIA 1RINA 1JLXA 4QD2B 5BXTA 1S0EA 1UX6A 2DVBA 2AQZA 1DQ2A 4XIKA 3U4XA 3W9TA 1ULGA 3A0KA 1Z0HA 1UZZA 1AX0A 4F83A 4G9NA 1YIFA 2ARXA 5F90A 1LGCA 3WCSA 3LSDA 1G9FA 2LIQA 4DRVA 3O5SA 3WO2A 3WNXA 3D7WB 2GN7A 1R8NA 3AKHA 4DQAA 3L2YA 4P14A 1DYKA 3ZSJA 3O3QA 3IM5A 4YM1A 5EYXA 1FAYA 4I4OA 4YW4A 1SLLA 4Y1YA 3M3OA 1D2SA 1XQNA 8I1BA 2JJ6A 2DVGA 2NVHA 4AGGA 3AXEA 3Q9OA 1DIWA 1S0LA 4BMEA 3BIWE 1IRAX 1A78A 2D6NA 2K8RA 4AGVA 1O4ZA 4ZKTB 4XDQA 2VH9A 1N4KA 3NJ5A 3ENRA 2ARBA 3AKGA 1YTOA 1RG8A 1PC8B 4AN6A 2EXKA 1PWAA 2X2SA 4AYUA 4Y1ZA 1LOCA 3IN9A 1DHKB 4P0KA 4G6MA 3ZC9A 1DGLA 4OWJA 4CTEA 3GALA 2J3PA 3FLPA 3Q7XA 1HWNB 2ERMA 4G1RA 3MALA 1G9BA 3OJBA 1JT3A 1M16A 5DVHA 5JOZA 5IK4A 1QNYA 4Z9WB 1S0IA 2VLCA 1V6OA 3P6JA 4YGDA 1IOBA 1RMLA 1WW5A 2DVDA 4Q26A 5H9PA 2GZBA 1ENRA 4XMIA 1SFYA 5T50A 1IOAA 2YMZA 4XTMA 1W6QB 1U0AA 3ZXDA 1S0BA 4A7YA 2ZHNA 3FJCA 3F62B 3H6QA 4LO0A 2E7TA 1TOOA 3MPPG 2DVAA 3M3EA 1BQPA 3CA1A 2E53A 3AZXA 2AH2A 2CYFA 1HWMB 3CA6A 3O44A 2XB6C 1ONKB 1LENA 2D3PA 3WHUA 1DFCA 2SLIA 4HANA 4BMBA 4XMAA 1HWOB 4P6AA 3UD9A 3OPZA 1RIRA 2YROA 2NMNA 1AX1A 3B9CA 1QOTA 3AJ5A 1LTEA 2F2FC 3OGGA 1JTCA 3O4DA 2D7IA 3B9UA 1Q03A 5BXSA 1MACA 2OUJA 3RMYA 2RHPA 3O0WA 3KMVA 1TWEA 2A6VA 3AXDA 4LBLA 1HKDA 2KKIA 3Q7WA 3V65A 4I4RA 3CA5A 3D5OA 1BZWA 4OWLA 2RQ9A 2TEPA 4K1ZA 4IY8A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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