3N7MA

Crystal structure of w1252a mutant of hcr d/c vpi 5995
Total Genus 94

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
422
structure length
418
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNTGLITNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYAFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
50100150200250300350400400300200100
020406080Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
publication title Identification of a Unique Ganglioside Binding Loop within Botulinum Neurotoxins C and D-SA .
pubmed doi rcsb
molecule keywords Neurotoxin
total genus 94
structure length 418
sequence length 422
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3n7mA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3n7mA02
3WLUA 3PJQA 1FGAA 4HA2A 3I4IA 3MALA 3V0BA 4YZ5A 3AKFA 2WJSA 3B9UA 4GP0A 3WINC 3JUTA 2P3IA 1Q8PA 2Y9XE 1FV2A 3NV2A 5DZGA 1ISWA 1NZKA 4Q27A 3ZXGA 1NUNA 2DUQA 5F9TA 4FQZA 1W0OA 5FNWA 1IKPA 2EXJA 1LGBA 2F8XC 5DUYA 1MZ5A 4I37A 3O44A 4ATEA 2ZR1B 2P34A 4FPHA 1W6QA 3N7MA 2C9AA 4QBVA 1G9AA 4USPA 1WW5A 1JBCA 5T55A 2HW9A 1G86A 31BIA 1WBLA 4JQ0A 1TWMA 1SZ6B 1Q8OA 5KXCA 1OQLB 3N0KA 4EEEB 1SCSA 2JJ6A 4XXPA 1GZ9A 1BFFA 3AYEA 4J23B 3AKIA 2DS0A 4EFRA 3D7WB 1BQPA 1QMJA 4JPZA 3FJDA 1GYKA 5GLZA 1I3HA 1XYFA 1IT0A 2ZHMA 2XB6C 5DZEA 1JOJA 2NMNA 3AXEA 4XTMA 2DVDA 4AGGA 1V6UA 1CE7B 3ENRA 1LHWA 3JU9A 2L5XA 4I8MA 2ZGQA 2DUOA 2F2FA 1WBFA 1DJSB 2VXTI 3ZPYA 2R1BA 5CB7A 3O4AA 1PUUB 1K5VA 2A70A 5D62A 4I4XA 2D6PA 1YXWA 2ERMA 3F62B 1AXKA 3WUCA 3FGMA 3OYWA 2JE9A 1C4RA 2A6WA 5H9QA 4A7YA 2P3KA 4PF5A 3INAA 4X38A 1SBEA 4FOYA 2WRYA 1LODA 2WT1A 4UW5A 2JECA 3Q7XA 1V6JA 3LCPA 4I3NA 1JTCA 2VUAA 3BIWE 1N1SA 2D44A 3T1MA 3UD9A 3N35A 2D7RA 4F83A 3O49A 2Y9GA 1N1TA 4I6IA 1QNYA 3M3EA 1ISYA 5CBLA 1M16A 4KEJA 5IUQA 2WT2A 1Q8SA 5GZDA 4FPGA 1LULA 3TC2A 4Q9GA 3BRDA 5HCBA 4YZ3A 3AJYA 3A0NA 5BYNA 5D63A 3AP4A 1IHKA 2AXMA 3CA6A 3SNMA 4YLZA 3FFZA 7I1BA 1W6MB 2UUSA 1CR7A 4M3CA 2FFVA 4I4QA 1JT5A 3AH4A 5DG1A 2TEPA 2PHWA 4LO3A 2AREA 2RG9B 1NXD1 1QU0A 1SLBA 1N3QA 2D7IA 3UL2A 4XYXA 4CJMA 2A6ZA 2A6XA 1V6OA 2WKKA 2K4AB 2GNBA 1WW7A 3OY8B 1QDCA 3UJ4A 1EVTA 1V6NA 5L73A 3WDWA 4YZ1A 1HCDA 3AZZA 2Y9FA 1MVQA 2ZQOA 4PBOA 1TTUA 1AFCA 3HOMA 4GP3A 1F5FA 2RHPA 4USOA 1MS1A 1YI7A 2EXIA 3BOPA 2AENA 1C1LA 1DGLA 3WDTA 4K1YA 2LALA 2W08A 2OVUA 4GWMA 3AZWA 4FPOB 1FWUA 1DQ0A 4FOWA 1LENA 5D61A 1G9FA 2FHRA 3MW4A 1KRIA 1CESA 1TIEA 3V0BB 4KBBA 3FJCA 4Y22B 1HDKA 4G1RA 1LOEA 4WZFA 1II4A 1S1AA 5T5JA 3ZXDA 1BYHA 1FQ9A 5CAZA 1LGCA 2ZKNA 4NO4A 4DRVA 3BADA 3M2MA 4OW4A 4DCKC 5E88A 4IY8A 4Z8SB 3QLQA 2EIGA 1SCRA 1W6PB 5GZCA 1QDOA 1J0SA 3CRGA 2EAKA 1BASA 2CNAA 2ZGKA 2NVHA 5IK8A 2CYFA 2D3SA 2QYIB 3TAYA 1W6QB 2ZBJA 5GLVA 3ILNA 3BAQA 3WO4A 1PZ7A 2VH9A 2PHUA 4YZ2A 2OW4A 3PVNA 3BA7A 3O0WA 3H0OA 4YM3A 3H6RB 3PUBA 4AYUA 3O12A 4LBQB 3UDAA 2NN8A 4DFSA 3DUIA 2VXRA 4H9WA 4QD2B 2ZGSA 1W6NA 3OBTA 3AYCA 2YMZA 2FDBM 3WDVA 4FP2A 1SLTA 4Q26A 3NBNA 4JP0A 1GKBA 3RMYA 4KEKA 3RS6A 3RG0A 3BAOA 2ZA9A 3LLPA 1QQLA 1WW6A 4XJ9A 4X3AA 4JKQA 3WUDA 1AVAC 2VU9A 2WLQA 4EFQA 2CWSA 1LOAA 2ARBA 1AVXB 2R0HA 2PHRA 3FBYA 2AH2A 1GZWA 2A5ZA 1JT4A 4BOWA 1YBIA 3QYDA 1WLCA 2KI4A 1LHVA 4UW3A 1LOGA 1HQLA 3B3QE 2XOAA 1PZ9A 5DZUA 4Y1UA 4CRQA 2HYKA 3VT2A 4FPEA 4AGVA 2EALA 4D0TA 1HCEA 4ZFUB 1UMZA 2NMOA 2FO1A 4Y20B 41BIA 2P3JA 1LTEA 1DQ2A 3ZXJA 3WA1A 2PHFA 4R9AA 1U0AA 5DXDA 4ITCA 5GZFA 1LESA 1VLNA 3FJIA 3M1HA 3H6QA 5GZGA 4Z9WB 4YGDA 1Z2VA 3BAHA 1DZQA 4AVTA 3S8KA 1WCSA 3BRFA 2Q9XA 2DURA 1AX0A 4OUJA 1DQ4A 1ONAA 1JYIA 1KJLA 3BRGC 1GBGA 3I29B 1YIFA 3V0AA 2VLCA 3RTIB 1URXA 1MS5A 4HL0A 1VCLA 5HCAA 3AZVA 2DTWA 3KQRA 5IT6A 3ZXLA 4IY9A 4QD2C 4DENA 2E7QA 5EYXA 3GNEA 4FQ4A 3RMXA 5KXDA 3N7JA 5EHAA 4WVVA 2F2FC 5DUXA 1G82A 4XKIA 3D5OA 1WBCA 1VALA 1EV2A 4XBQA 1ISVA 2A3YA 3IPVA 1V6KA 5IK4A 2D6LX 1DQGA 3SH5A 3IM0A 5T5PA 5JOZA 4H04A 5BXRA 1KQRA 4YGEA 1LU2A 4BMBA 3WHUA 4ATFA 1HQWA 3O3QA 1JQZA 4XFSA 2E6VA 1LOFA 5FZUA 3R4UA 4ZBVB 4I4PA 4LO1A 2R16A 2AFGA 1RG8A 1SR4A 1V6IA 2YUGA 4U2AA 3BA4A 1W0PA 3WZ1A 2GN3A 1UAIA 4EKXB 1B09A 1RITA 2BFHA 3T1LA 4XHBA 2X2TA 3IIRA 1DZCA 1JUIA 1KNMA 4KC3A 1QXMA 4IYBA 1TWEA 1R1ZA 3AP5A 4JCKA 1QOSA 3A4UA 2Q3NB 1TP0A 1OQ1A 3A0KA 2D3PA 3NV1A 1CVSA 2ZGTA 2GO2A 1DBNA 2D6NA 9ILBA 1FX5A 2HWAA 2DVFA 3OPZA 1Q04A 1AXZA 4ZLBB 1T4QA 1IS5A 2VW2A 1C1FA 4LO3C 4YM2A 3ZSMA 1GANA 4GA9A 1Q8QA 1IOBA 1F9KA 3Q7WA 1FMZA 1MS8A 4LO8B 1ITBA 2ZHKA 3CAHA 2A7AA 1Q8VA 3VT0A 3SH4A 3IM5A 1WBAA 1GNHA 1WD4A 2Z48A 2UURA 1SACA 4XFUA 1Y7BA 4YM1A 1S0CA 4K21A 2AYHA 3UJ0A 4II0A 1VIWB 2MC2A 4IZEA 2PELA 3W58A 3O5SA 3H6SE 4ENDA 5HPZA 2ZMKA 3VKFC 2ZZJA 4YM0A 3W9TA 2GDFA 3O4OA 3M3CA 5EC5A 2UWBA 1QOOA 8I1BA 4M3CE 3ZSKA 1G9CA 4R9DA 3ZXEA 5F8WA 4D69A 4GKXA 3K1XA 3KM5A 4D8HA 1W3AA 4QKSA 5BQUC 1KITA 2UU8A 5BOWA 4CTEA 3AK0A 4Q8LA 3OJVA 3SNVA 4YFZA 3HALA 2CTVA 3JUUA 5GLUA 1SBDA 4NOTA 3UD7A 2D23A 1V6MA 4P6AA 2MLLB 2D6KA 4GALA 4Q8KA 5EYYA 2E4MC 4XJZA 2D3RA 1NLSA 3HMYA 4LO2A 5JDBA 5H9SA 2Q5TA 1LEMA 4D0ZA 1LJ7A 4DEPA 1XHBA 1AVBA 3AH2A 2ZQNA 4ZXKA 2GMPA 3BX1C 2GMEA 1PUMB 3APBA 1PZ8A 1LOCA 1WW4A 4HJJA 1AJOA 3NV4A 3V0AB 1FATA 2R0FA 1XQNA 3CA5A 4Y1YA 1FMMS 3AFKA 3WINA 1HWMB 1BFBA 4YW5A 3BA5A 4OWLA 3IKWA 3V79C 2DVBA 4YG0A 3USUB 4I4YA 4XMIA 4XBLA 1MACA 2GALA 5T52A 2W68A 1CIWA 1ULEA 3ZXKA 2DRYA 2WT0A 1UZYA 1FAYA 2D43A 1JT7A 1H9WA 1RINA 2BEAA 3IPVB 4U36A 3CRHA 2RSTA 2Y9WC 2DU0A 2GN7A 1AZDA 4AGRA 1GGPB 1MS9A 4SLIA 5G00A 1ULFA 2GNDA 5FZZA 1W6OA 3A07A 3VSFA 1UX6A 2D20A 5GLTA 4I0YA 1APNA 1Q1UA 4DQAA 3IM6A 1ULCA 3VKLA 2ZMNA 5JOYA 3A21A 2D7FA 2GNMA 2B7YA 1ULDA 1ABRB 1HWPB 1YF8B 1S0IA 3WHTA 3UK9A 2DV9A 1FNYA 3T8SA 1TFMB 4A7KA 1BFGA 4I4VA 1WLWA 4A7ZA 3FUOA 4GAIA 1A3KA 3N3HA 4OZXA 1JW6A 4I4RA 1DZDA 4FOVA 4XFTA 3ZXFA 1JLYA 4GOYA 2HWMA 2D22A 1WUVA 1RMLA 1XG6A 1DQ6A 4YW1A 3NBCA 4R6UB 1MC9A 4OEGA 3WG1A 1MR5A 4C1WA 4C1XA 5I1BA 3FJJA 1O4YA 5BP5A 3C9ZA 3IM7A 3PG0A 3R4SA 4I1EA 2ZHLA 5T5LA 5GZEA 3FJAA 4I4UA 5BXSA 2WSUA 5SV8A 2CY6A 1OKQA 5H9RA 4Y1ZA 1LHOA 2D6OX 2BEBA 2R49A 3KMVA 5DUVA 1JHNA 2NTDA 1N3PA 2ZGUA 1PC8B 3FJFA 2K43A 1BARA 2LIQA 2Z42A 1VAVA 2HZ9A 3O4BA 1Q56A 1JXNA 1MD6A 1BKZA 3CA1A 3B9CA 1K5UA 3HBWA 1IILA 4L4HA 1J1TA 3I8TA 1N3OA 4TLPA 1AF9A 3Q9OA 1MVEA 5DUWA 1IOAA 3SISA 1LOFC 4Y24A 2I2SA 4IZXA 1M2TB 2DVGA 4LO1C 1ISXA 4FPFA 5FREA 3WV6A 1SR4C 3BAGA 4J2YA 1AXYA 4AWDA 1SFYA 1WD3A 1EYLA 4JAWA 5T5OA 2R9KB 1LEDA 3OYWB 5E24E 3QCWA 4QBCA 4AN7B 4P0JA 2ARXA 2DYCA 3VKOA 3S8JA 5EG6C 3IMNA 4YZ4A 3CRIA 2ZACA 3OGGA 3M3QA 3O0XA 1ZM1A 3WCRA 2X2SA 2ZABA 4GXLA 1BA7A 4Z8BA 1V6VA 4XIKA 5DUUA 4R9BA 2YV8A 3AYAA 1XZZA 4YG3A 2EXKA 3FLRA 2SBAA 3M3OA 2D1ZA 3N36A 1V6LA 1YRZA 1IRAX 1ISZA 1SLLA 4WV8A 1S0DA 4CZSA 4IHZA 4M3CF 3P53A 2KM2A 5IK5A 2P37A 3GALA 4FGFA 1CONA 1DFCA 4BMEA 2YY1A 4M3CB 3O0VA 3P6IA 1AVUA 5BVPI 3ZSLA 4M01A 1W3FA 3RTJB 5IK7A 4J2XA 1CPNA 3UJQA 2AUYA 3T2TA 2DTYA 5EXOA 3IAGC 2DWRA 1AX1A 4XZPA 1G9DA 3WO3A 4FPYA 2JDZA 5F8SA 4XOGA 4RL7A 3VKNA 3W59A 3AJ6A 2WSVA 4YW3A 1S0FA 4PBPA 3ILAA 2A3XA 2BQPA 1VAMA 1QQKA 5AVAA 4Y1VA 1W6MA 2AAIB 1R8OA 2A6VA 2JD4A 2PHTA 2GNTA 1BZWA 1G9BA 1IRPA 1ONKB 1CQ9A 4LBNA 5KXBA 3AH1A 3PVOA 4I4SA 1ILR1 1QGLA 3PMEA 1UZZA 4ZFWB 4Y26A 1S0JA 4YGBA 4XHXA 4I4OA 5DZFA 3FJ8A 3C2UA 3SITA 4HR6C 1SLAA 4LO2C 2QN4A 2E53A 2NP0A 3AP7A 4OEEA 2P23A 3AYDA 2DREA 3FJ9A 4K1ZA 2EXHA 1AXMA 4XJWA 1N1YA 1QKQA 1JT3A 2VW1A 4LBJA 4UW4A 3AKGA 1UL9A 5H9PA 4LBOA 3DGTA 5T54A 3QR5A 3BB2A 3A22A 1FWVA 3WDXA 3FJEA 4QO3A 1DFQA 4JC1A 4Y22A 2YXSA 1GZCA 4BLJA 2KLLA 5DVHA 1S0GA 1Z4SA 1MS3A 2LIEA 1JYCA 2H0BA 3FUQA 3MEPA 3ZC8A 4GKYA 2IWTB 1DQ5A 5F5QA 4LO7B 2ZGLA 4XJAA 4M00A 1WLDA 3I2XA 3BODA 1SLIA 4FPLA 1W6PA 1AX2A 3FJKA 2NZ9A 5FZYA 4FPKA 1SLCA 4P9YA 4OWKA 1W6NB 1N1VA 1F31A 1RIRA 1S0BA 1Z0HA 4YGCA 4FVVA 5JVVA 3BTAA 2XG3A 4QALA 1EPWA 4PC4A 3WG3A 3FLPA 2AGSA 4H55A 4QC4A 3O4CA 3AX4A 4ISQA 3H6RA 2NM1A 4XTPA 4LBQA 1BLDA 3LTQA 2KH2A 4G6MA 6I1BA 4W65A 1GZWB 1QNWA 4AVSA 1I1BA 4Q91A 2JKBA 4BM8A 5DSSB 4AN6A 3HSMA 1HKNA 3AJZA 3CA4A 3BAVA 3FJHA 4LO0A 1MS0A 1DYKA 3PVEA 4XIOA 4GAFA 1PZZA 3N7KA 3ZX7A 1V6XA 4J2KA 2DVAA 4XXAA 1AJKA 2ZGOA 1LHUA 1RZOB 5E8AA 4XDQA 2I1BA 4WVWA 3O5WB 2W39A 3CA0A 3WVJA 5BP5C 4FPJA 2DU1A 5HCFA 21BIA 3ILFA 4BLIA 2ZGMA 3WG2A 3OJBA 4BPZA 4PQ9A 3ILRA 4Y1XA 5F90A 2YZ4A 1DHKB 3B00A 4ZKTB 3D6EA 4LBKA 2CWMA 3WG4A 2JE7A 4Q9PA 3PHZA 4Y20A 3SH3A 1JY0A 1PWAA 4LO7C 4P9WA 1C57A 1IS4A 1ULGA 3WMVA 4I7IA 2WBCA 4LBLA 3ATGA 1HLCA 4Q1PA 3ZYRA 3VUOA 1FN0A 1N4KA 1BLAA 3JRRA 4TYSA 3I2AA 1GICA 2Z49A 4DRRA 3MW3A 3CA3A 4XJUA 4EFPA 4JRAA 3BAUA 2AQZA 3AJ5A 4ZOTA 2W52A 1GSLA 2EF6A 1TOOA 3CQAA 1ENRA 2ZGNA 1UN1A 3HN1A 2UWAA 3LSDA 5LK5A 1ZA4A 4JKXB 3RRDA 1A78A 2A6YA 2ZGRA 3F1RA 5CA6A 3RQ0A 5E89A 1DIWA 5BXPA 2ZMLA 3WNXA 4OWJA 1HKDA 4J2SA 2DUPA 1DQOA 2ESUA 4WBCA 3VV1A 3UD8A 3CU1B 5T50A 5GLWA 1S0LA 4Q1RA 2VY0A 1BXHA 1E0OA 2SLIA 2D24A 1S0EA 1HWOB 1G8WA 3NBDA 3O4DA 4LBQD 1KDKA 4ASMB 1H30A 2OUJA 4EB2B 1IS6A 3POYA 2LTNA 4R9CA 4DS0A 1P63A 3VKMA 1YTOA 4P0KA 1IKQA 4G9MA 1IJTA 2DRZA 3NV3A 3AXDA 3LSEA 1LECA 2A71A 4K20A 1RY7A 5BXTA 3IN9A 4I2SA 5BQUA 4I30A 4XBNA 3VEQA 1MS4A 1Q03A 1BFCA 4G9NA 2V5YA 3OJMA 4YG6A 1I1EA 4I1BA 3V65A 3R05A 1G7YA 5GALA 4IQPA 1ENQA 5B2HA 1CJPA 2E4MA 1KJRA 4AVVA 3ZC9A 3RSJA 4DPNA 4XE9A 4IONA 3FJBA 2ZAAA 1LHNA 2KI6B 1CN1A 3ZYPA 3MW2A 5GJ6A 4XJ8A 1L2HA 4TZDA 3OBRA 3FLTA 2OUHA 2VSAA 4L4IA 2R1DA 1FNZA 1T9FA 1O4ZA 4F34A 1IS3A 3ZVXA 1V6WA 1FV3A 4ZA3B 1CVNA 3AP6A 2ZHNA 2YROA 4MYEA 2WQZC 1AVWB 1CPMA 3CNAA 4X39A 5GAQA 1FYUA 4PCRA 1H9PA 2D6MA 1X50A 3VSZA 3OJ2A 1HWNB 5F8YA 4GOVA 4HANA 2FFUA 2ERFA 3V64A 3NWKA 5DG2A 2A3WA 2V73A 5CNAA 3AZXA 4G6JA 1LCLA 2G4IA 4OEFA 2AR6A 5FNXA 3U4XA 4XMAA 3MPPG 1OFSA 2VSEA 5FRAA 1JN2P 5JOXA 1LGNA 3TB0A 3OGFA 4ZGRB 1JLXA 3EF2A 2ENRA 1DQ1A 1GLHA 3ASIA 2ET2A 3WMUA 1W3GA 2K8RA 4QKRA 4ZFYB 4P9XA 4X37A 3AP9A 1SBFA 3WCSA 1UPSA 4RA0A 1A8DA 4YFWA 1UKGA 3B69A 1Z78A 3SLIA 3UJOA 3POKA 3A23A 1LOBA 4FPCA 1DYPA 1KDMA 1N47A 4YW4A 4KEIA 2E51A 3HR9A 4YW2A 1D0HA 1HIBA 1BJQA 4BQ1A 4FOQA 2RQ9A 3AZYA 2FGFA 1QOTA 2ZGPA 2PHXA 1TEIA 3AKHA 4LBMA 5KXEA 1D2SA 4ISRA 3POWA 1MZ6A 1ENSA 2E7TA 1W6OB 3WDUA 1YO8A 1R8NA 4XILA 3VT1A 3USUA 1DLLA 2UWCA 3POSA 2GMMA 2NYYA 4P0LA 2J3PA 3B01A 2ES3A 4LO0C 2KKIA 2MIBA 2VW0A 4FP3A 2WNEA 3P6JA 3OY8A 3D4KA 2P2KA 3N7LA 2M49A 3Q7YA 4P14A 5JMCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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