3OBT | Genus

Total Genus 104

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	104
sequence length	420
structure length	412
Chain Sequence	SAMASINDSKILSLQNKKNALVDTSGYNAEVRVGDNVQLNTIYTNDFKLSSSGDKIIVNLNNNSAIYENSSVSFWIKISKDLTNSHNEYTIINSIEQNSGWKLCIRNGNIEWILQDVNRKYKSLIFDYSESLSHTGYTNKWFFVTITNNIMGYMKLYINGELKQSQKIEDLDEVKLDKTIVFGIDENIDENQMLWIRDFNIFSKELSNEDINIVYEGQILRNVIKDYWGNPLKFDTEYYIINDNYIDRYIAPESNVLVLVQYPDRSKLYTGNPITIKSVSDKNPYSRILNGDNIILHMLYNSRKYMIIRDTDTIYAECSQNCVYALKLQSNLGNYGIGIFSIKNIVKNKYCSQIFSSFRENTMLLADIYKPWRFSFKNAYTPVAVTNYETKLLSTSSFWKFISRDPGWVEPP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase
source organism	Clostridium botulinum
publication title	Botulinum neurotoxin serotype D attacks neurons via two carbohydrate-binding sites in a ganglioside-dependent manner. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Botulinum neurotoxin type D
total genus	104
structure length	412
sequence length	420
ec nomenclature	ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date	2010-08-09

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07951	Toxin_R_bind_C	Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A	PF07953	Toxin_R_bind_N	Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	3obtA01
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	3obtA02

3AJ5A 1CIWA 4J2SA 3LSDA 1W0OA 3AKFA 5H9SA 1S0DA 2XB6C 3WG1A 3WG4A 5BQUA 1S0IA 4X39A 1JQZA 6I1BA 4GOYA 3PVOA 1WW5A 3OBTA 2ZZJA 3KM5A 3INAA 4EKXB 5GM0A 4XJ9A 3SH5A 1I3HA 1DZQA 2P37A 4ZKTB 1G7YA 2HZ9A 3E8LC 3FJAA 2CY6A 1JHNA 1LULA 1VLNA 1BFGA 1GICA 1CR7A 3ZXLA 1AX1A 3AJ6A 4ZBVB 1L2HA 1G9BA 4IHZA 3WDWA 1CONA 4PF5A 1LGBA 2CWSA 3SH3A 4I4XA 4Y26A 2SLIA 2ZACA 3CA6A 3WG2A 3BA4A 2A70A 4XJWA 4ISRA 1AVAC 1QOTA 1R8NA 4PC4A 4FP2A 1ISZA 1KITA 3PJQA 3BOPA 1BJQA 1EYLA 2ZR1B 1Z0HA 3D4KA 3CU1B 5GLTA 4A7YA 3ZXDA 1UPSA 1SBEA 1TWEA 3TB0A 1LESA 1EV2A 3VT1A 2PHTA 3ZSMA 1OKQA 1S0JA 2WSVA 3VV1A 2YUGA 3ZC9A 1QOOA 1W6OB 3NJ5A 2K43A 2RQ9A 3M3QA 3WDXA 4I30A 4LBQB 1PWAA 5JMCA 1WBAA 4R6UB 4ASMB 3AZXA 3FJEA 1F9KA 4XKIA 2V5YA 5KXCA 4YFZA 2EXHA 3OGGA 4JAWA 1HKDA 2FMDA 3H6RB 3VWCA 4DRVA 4AWDA 1V6NA 2A3XA 4YW4A 2AR6A 4Q1PA 1LOFC 3CQAA 2D24A 3HR9A 2D6NA 3WUDA 1GLHA 1ISYA 4LBOA 21BIA 2BFHA 2P3IA 1JLYA 4JCKA 3BTAA 4AVVA 4M3CA 2W68A 3LTQA 1AXMA 2AQZA 4XOGA 1LHWA 4ZA3B 1IRPA 1YF8B 5HCBA 5IT6A 2SBAA 1S0GA 2NMOA 4K21A 5BP5A 4LO8B 1Q8VA 3IM0A 4U2AA 2IWTB 1DBNA 5EWSA 1GGPB 3FJDA 2VLCA 1BFBA 3UD8A 4PBOA 3B3QE 5BVPI 2A6VA 2Q9XA 4KEKA 4XE9A 2EAKA 1W6PA 3AFKA 3V0AB 2GDFA 2R1BA 1LOAA 4J2XA 4KEJA 1B09A 2VXTI 4EFQA 4XILA 4QALA 5DUWA 4SLIA 1JBCA 4XBQA 1WLDA 1TFMB 1SACA 2Q5TA 2HWAA 1W6QB 3A23A 3AYDA 1PC8B 1ULGA 1DQ1A 4QD2C 1TP0A 1DHKB 2L5XA 4P9WA 1AXKA 3I8TA 4Q9PA 1HQWA 5GZGA 1TIEA 1RITA 2OUHA 2FO1A 3AZYA 5E8AA 1GV9A 3FUQA 2E6VA 4IY9A 2P2KA 4Y1UA 5D62A 4Q2FA 3AP4A 4LO7B 1SZ6B 1JOJA 1F31A 3JUUA 1AXZA 1EPWA 4G9NA 4Q91A 2EF6A 2ZMNA 3NV4A 4P0LA 3WO3A 1QDCA 1AVUA 3RTIB 1JN2P 1ENSA 5DZGA 4YGBA 4OUJA 1AX0A 1HWPB 3OY8A 2YXSA 1HIBA 3P6JA 3H6SE 2RSTA 1RG8A 3VKNA 1N3OA 1C1FA 2XG3A 1AVBA 1LOEA 3IM6A 1ULCA 3ZPYA 1IOAA 1WCSA 1C57A 3WUCA 2GNTA 2ENRA 3B00A 4Q9GA 3ZYPA 4XJZA 1OFSA 3D5OA 1IS4A 3OYWA 3BA5A 4P9XA 1MS5A 4YM0A 2HWMA 3M3OA 4GOVA 1Z4SA 1W0PA 2VW0A 2Z49A 1UZYA 4WVWA 1ULEA 2X2TA 3AH1A 4EFRA 2P3JA 1S0EA 3CRGA 4PBPA 3S8JA 1Q03A 2D7RA 1A8DA 1C1LA 3ZXKA 1VAVA 2AENA 3AJZA 2C5DA 1MS3A 2H0BA 4FPOB 1NZKA 2R9KB 1M2TB 1NUNA 4Y1ZA 3BAGA 4Y24A 2CTVA 1BQPA 3OJMA 3N7KA 4YGEA 1DQGA 3FJKA 2DWRA 2K4AB 2DUQA 1XQNA 1Z78A 5BQUC 4HJJA 3N36A 2Z42A 3PVNA 1PUMB 1H30A 3B9UA 2GNBA 3SH4A 3HOMA 2UURA 1LHOA 2KLLA 4JQ0A 4I7IA 5JDBA 3OJBA 1IKQA 1LHNA 3ILNA 4GKYA 3ZSLA 3O5WB 3JU9A 2D22A 4P9YA 5GLVA 3LSEA 3ZXJA 4X3AA 4OEFA 1HCEA 1JT3A 3MW2A 4FPYA 3WHUA 2A6YA 1QKQA 2QN4A 2E7TA 2FDBM 1IHKA 3POKA 1WW7A 1DYKA 5I1BA 4FOQA 1PZ7A 2DVAA 1LEMA 4A7ZA 1DQ6A 2P23A 3AP6A 3POYA 3HN1A 2F2FC 3DUIA 3AYEA 3BAVA 1BZWA 3WO4A 1KJLA 4YG6A 2PHXA 3Q7WA 2VSEA 4G1RA 4I96A 4AGVA 3M2MA 4I1BA 3WNXA 4Q1RA 3AH4A 2A3WA 2KI4A 4FGFA 4M01A 1WW4A 4X38A 3I2XA 1WLWA 1NLSA 2AGSA 5DZUA 4KBBA 4GWNA 5EYYA 4TYSA 1ABRB 3V0BB 1JT7A 1BYHA 2AYHA 2PHFA 2R0HA 1IS3A 1V6WA 3O4AA 1LOCA 4P6AA 5BXRA 4YW3A 3AKIA 4LO2A 3AXDA 3N3HA 2GNMA 4I1EA 5IK5A 4GP0A 1T9FA 4XYXA 4NOTA 3W59A 5EXOA 2AREA 1E0OA 5KXDA 3O0XA 4JRAA 4Z8SB 1MS0A 1MS8A 3WCSA 2D20A 1MR5A 5F90A 2MC2A 4X37A 1FQ9A 3Q9OA 3FLRA 2AUYA 3ZYRA 1V6XA 1YTOA 1YRZA 1GNZA 3CAHA 4YZ5A 2FFVA 1DLLA 2DTYA 2DRZA 2A5ZA 1S0CA 1DJSB 5HPZA 4D8HA 2GN7A 4ZOTA 1DGLA 4IY8A 1FV3A 2DV9A 4J2KA 5F8SA 2DVDA 3MALA 2UWCA 2OVUA 4CZSA 1CQ9A 3CA1A 1K5VA 5F8YA 3VSFA 3IPVA 2EALA 1ISXA 1QNYA 1GZWB 1LGCA 2ZHNA 5JOZA 5BP5C 1SFYA 3ILRA 2A71A 3D7WB 2YZ4A 2V73A 4GWMA 3FJHA 1QNWA 4Y22B 1SR4A 2LTNA 2JD4A 2WQZC 2D6OX 3C2UA 1WBLA 2FFUA 3N35A 4BMBA 1WUVA 4BLIA 1G9DA 1MVEA 1H9WA 2Z48A 4HA2A 3FJBA 5GLWA 2VW1A 5T52A 1EVTA 2UUSA 5DXDA 3SISA 2VW2A 1HWOB 1W6NB 4LO1A 4NO4A 2NMNA 3BAOA 3M1HA 4KC3A 4XMAA 4AYUA 4Y1YA 3WMUA 4FVVA 4JPZA 2KM2A 1PUUB 1FWVA 1J0SA 1BA7A 3N0KA 3M3EA 1O4ZA 3VKLA 3UL2A 1AXYA 2F8XC 4GP3A 1LHVA 4FPEA 4I4SA 1TEIA 2E53A 1MACA 1KJRA 4ZFWB 3WINA 1BLDA 4H9WA 3A4UA 1Q04A 2AFGA 3RSJA 2F2FA 5FZZA 1QF3A 5EYXA 5JLVA 4DQAA 1LU1A 3FFZA 3VUOA 1QMJA 4Q8KA 3IMNA 3BRFA 4W65A 4ISQA 1MD6A 4XIKA 1W6NA 2A6XA 3KQRA 4YM1A 5CBLA 2D6MA 1FMMS 4FPJA 3VT0A 1ULDA 1D2SA 1A78A 1DYPA 2AXMA 1JYIA 1DQ0A 4U36A 1N47A 3UJQA 2NTDA 2PELA 4HR6C 2D44A 3NBDA 2Y9XE 2ZMKA 2PHUA 2J3PA 1QXMA 4I8MA 3AP9A 4XFTA 2D3PA 3PMEA 4FOYA 2E4MC 5F5QA 3A0KA 5G00A 1FATA 5FRAA 8I1BA 2RHPA 1GNHA 3BODA 1M16A 3I4IA 3R05A 4FPFA 4GXLA 3CA3A 4CTEA 1LCLA 3N7MA 1DFCA 5T55A 4AN6A 2DUOA 1HQLA 1VALA 1AX2A 4OW4A 3IN9A 4M3CF 4ZXKA 1IOBA 1LOGA 1CESA 1ENRA 4DRRA 2WBCA 2ZGNA 4M3CE 4FOWA 2WT1A 3BRGC 3LCPA 1BKZA 1AFCA 3N7JA 1W6OA 1WLCA 2ZABA 1CVSA 4GA9A 1UMZA 1MZ6A 4LBQA 1JT5A 4I4OA 4OWKA 1SLAA 1ONKB 4I4PA 2OW4A 4LBMA 4R9BA 1V6MA 2A6ZA 4YW1A 2A3YA 3PG0A 1CN1A 2ZA9A 2CYFA 4YG0A 1V6LA 3H6RA 3ZXEA 1UL9A 1JYCA 1PZ9A 1IKPA 2ARXA 1Q1UA 4LO3C 1IT0A 1LTEA 3MEPA 3VKOA 3RG0A 1APNA 4OZXA 3WZ1A 3OPZA 2GMEA 2EXIA 1Q8OA 2OUJA 3CA5A 2DTWA 1GKBA 3B01A 3PVEA 3MW3A 3O44A 3V65A 3NBEA 3C9ZA 2D3SA 3A0NA 4LBQD 1KRIA 3ATGA 1UKGA 4IYBA 2TEPA 2NP0A 3OBRA 4LO2C 2DRYA 3FLPA 1LHUA 2ES3A 4R9DA 5KXEA 4I6IA 1R8OA 3USUB 2W39A 1DZDA 4BM8A 4YW5A 3SNVA 3V0AA 3P6IA 2DVGA 3T2TA 2ZHKA 1GBGA 4AGGA 2C9AA 4FPKA 1JXNA 1S0FA 5HCAA 1MS4A 4YW2A 3WHTA 1W6QA 1V6UA 2ZBJA 4UW5A 1KQRA 4EEEB 4IQPA 2JJ6A 1MZ5A 1HCDA 1GZ9A 3A21A 2ERMA 3UJ4A 3ASIA 1JTCA 3L2YA 4L8QA 4Y20B 2DURA 1WD3A 4YG3A 1SBDA 1SLTA 1XYFA 2QYIB 1XHBA 3BAQA 1W3FA 4XFUA 1N4KA 5E24E 1FAYA 3WOGA 5DUVA 4CRQA 3F1RA 3M3CA 2E4MA 3HBWA 4ZLBB 3RRDA 3O12A 1O4YA 1TOOA 3K1XA 3HALA 1ISWA 3TAYA 5FZUA 3POSA 1UAIA 5BYNA 1SR4C 1GYKA 4BMEA 4PCRA 2KH2A 2A75A 1ZA4A 2G4IA 2WT2A 3H6QA 1A3KA 4OEGA 1DZCA 2HW9A 5DUYA 3IAGC 2K8RA 1JW6A 2AH2A 2D3RA 1N1YA 3O0VA 1IILA 1LECA 2GMPA 3BX1C 2BEAA 4JP0A 4LO1C 4RA0A 2VUAA 1CVNA 3PHZA 1LOBA 1JUIA 3NWKA 1DQ2A 5H9QA 1PZ8A 2AAIB 3I2AA 2I1BA 4Q27A 1N3PA 1RIRA 4GALA 5CNAA 1G82A 4QD2B 4JKQA 2GALA 4LO3A 1S0LA 3IM5A 3FJJA 2NM1A 4DCKC 3RQ0A 3NV2A 4QKRA 41BIA 3A07A 4LBJA 3WINC 4XTPA 5DSSB 3BB2A 5IK7A 1YBIA 4GKXA 1MVQA 2KKIA 1WBFA 3CRIA 5F8WA 2DVFA 4WBCA 5JVVA 4J2YA 4K20A 2ZHLA 1D0HA 1YYNA 1ITBA 3T8SA 4P0JA 5HCFA 4L4IA 3HSMA 1SBFA 1LENA 2LIEA 1YIFA 2WRYA 2JECA 5SV8A 3T1LA 3CA0A 3OJ2A 1Q8SA 3FJIA 2JE7A 4FP3A 4HANA 3I29B 4XJUA 4I4UA 3T1MA 2Y9WC 4D0ZA 4ZFUB 1MS9A 1AZDA 3CA4A 2ZGMA 4D69A 3ZSJA 1AJOA 5FNWA 3MW4A 4YGCA 5CA6A 5BXTA 3V0BA 4XBLA 4XMIA 4R9AA 4AVSA 2D43A 4FPCA 3KMVA 2CWMA 1ILR1 3ZX7A 1Y7BA 4C1XA 3WLUA 5AVAA 2A6WA 4ZFYB 4WV8A 1HLCA 4ATEA 5FZYA 4OEEA 2YV8A 5B2HA 3DGTA 2GMMA 5JOWA 1OQ1A 3WDYA 3UDAA 2GNDA 2PHRA 3LLPA 4LO0A 4YM2A 5DG2A 4USOA 1DQ5A 2ZQOA 4XHXA 3AZVA 4M00A 3ZSKA 2EXJA 1U0AA 1GZCA 1N1VA 4I2SA 1LODA 1W3AA 2HYKA 3ZC8A 3NV3A 3H0OA 1NXD1 1ZM1A 4I4YA 1I1BA 4GAIA 1SLCA 5GALA 2M49A 4YLZA 1ENQA 4TZDA 4L4HA 2D7FA 4Y1VA 3ZXFA 1AF9A 4DFSA 3VSZA 1UZZA 1LU2A 4I37A 3D6EA 1JY0A 1VIWB 3EF2A 1N1TA 1WD4A 1X50A 4IZXA 1N1SA 4FPHA 4FOVA 3ILFA 1BFCA 1IS5A 3WCRA 1V00A 5GLUA 1GZWA 4QBCA 1KDKA 2DYCA 1DIWA 3W9TA 5GAQA 4Y22A 5H9RA 2D6LX 1II4A 1R1ZA 3CNAA 3IKWA 1FV2A 1G9FA 3FJ8A 3BIWE 1QDOA 1ULFA 3S8KA 2GO2A 1RINA 1FX5A 4DPNA 3A22A 4Z8BA 2EIGA 1ISVA 3WA1A 1JT4A 2ZGRA 3WO2A 1AVWB 3V64A 2NZ9A 3QCWA 3SNMA 1UX6A 3AXEA 2LALA 4YZ1A 2ZGTA 4XBNA 4XFSA 1G8WA 4LBLA 3RS6A 4I3NA 2PHWA 4G6MA 1MC9A 1N3QA 2YY1A 3ZVXA 1P63A 3VT2A 1QQLA 2ESUA 4LO7C 3JUTA 3W58A 2DUPA 1GSLA 1VAMA 5DUUA 4YFWA 1FWUA 4M3CB 5T54A 4P14A 4Z9WB 5JOYA 3O4CA 1Z2VA 4EFPA 2ARBA 2B7YA 4YGDA 3AH2A 1W6MB 1T4QA 2P34A 4FQZA 4ENDA 2DU1A 4ATFA 3AYCA 3BA7A 2RG9B 3V79C 4I4QA 4J23B 3O0WA 2WT0A 4F83A 3Q7YA 2VU9A 2LIQA 1HWMB 4YOLA 4AN7B 2R1DA 4XHBA 2NYYA 4H55A 3VKFC 3O5SA 4LBKA 1W6PB 5IUQA 1LEDA 5L73A 4JC1A 3R4UA 3WG3A 1K5UA 2WKKA 7I1BA 1LJ7A 4LBNA 1V6OA 4Q26A 2DS0A 2XOAA 2BEBA 1V6VA 5E89A 1SCSA 3NBCA 4HL0A 5GZDA 3HMYA 5EG6C 1JLXA 1CPMA 2R0FA 4XJ8A 1OQLB 5GZCA 2Y9FA 5DZFA 1LGNA 2VH9A 4DEPA 2UWAA 2JDZA 4K1ZA 4YM3A 5T5PA 1W6MA 3RTJB 2KI6B 4USPA 1F5FA 2CNAA 3RMXA 4D0TA 5BXPA 3AZWA 4BOWA 4BLJA 4XTMA 2R49A 2WSUA 3GNEA 1BARA 5T5LA 5KXBA 2IHOA 4QC4A 3JRRA 3FJCA 3WVJA 1S1AA 3OY8B 2DREA 2ERFA 3O49A 4H04A 3VKMA 2ET2A 2E7QA 3ZXGA 4AVTA 1IRAX 3Q7XA 3O4BA 5T5OA 3AZZA 4I4RA 1VCLA 3BAUA 1RMLA 4XXPA 2D6PA 1RY7A 1URXA 3TC2A 1YO8A 1YI7A 4Q8LA 1J1TA 2D23A 3OYWB 4WZFA 2NN8A 1HKNA 1G9CA 2R16A 2NVHA 5DUXA 31BIA 3UJOA 2JKBA 2VXRA 4FPGA 1C4RA 2WLQA 3SITA 1GANA 5FNXA 4XIOA 1QU0A 1QGLA 4QBVA 2X2SA 2ZGQA 1IS6A 4UW3A 2D1ZA 2D7IA 3BRDA 2I2SA 1UN1A 4A7KA 9ILBA 3IM7A 2ZGUA 4UW4A 3AP7A 2VSAA 3BAHA 2Q3NB 2ZGPA 3ENRA 3BADA 2DU0A 3O4DA 2P39A 3B69A 3FGMA 1G9AA 2P3KA 1H9PA 2FHRA 1DFQA 3MPPG 1AVXB 3USUA 1BXHA 2Y9GA 2UU8A 5GZEA 4LO0C 3FLTA 3UK9A 4CJMA 4OWLA 2W08A 5CAZA 3PUBA 1AJKA 3AK0A 1WBCA 4ITCA 4TLPA 4EB2B 5E88A 4YZ4A 2WNEA 4IZEA 3UJ0A 5H9PA 3AP5A 2ZGOA 5F9TA 2BQPA 1V6KA 4Y20A 1LOFA 5LK5A 3P53A 3QLQA 3VEQA 2ZGKA 4K1YA 1PZZA 4II0A 3GALA 3R4SA 2ZKNA 4P0KA 4C1WA 2D6KA 3AKGA 1YXWA 3RMYA 1W3GA 2CL2A 4DS0A 1BFFA 2EXKA 2GN3A 3AX4A 1QQKA 2ZAAA 2WJSA 4BQ1A 5GLZA 3WDTA 1XZZA 4QKSA 1Q8PA 4G6JA 1CPNA 1FNZA 3IIRA 2ZMLA 1SLIA 3N7LA 1Q56A 1BASA 1WW6A 4DENA 4OWJA 3AKHA 1S0BA 3QR5A 4RL7A 5GZFA 1I1EA 1CE7B 4YZ2A 1HDKA 1G86A 3NBNA 5T5JA 3OJVA 3UD9A 1V6IA 2MIBA 1CJPA 5BXSA 3FJFA 1SCRA 1FGAA 3FJ9A 3U4XA 4YZ3A 3O4OA 4I0YA 1QOSA 3UD7A 5T50A 5IK8A 2YROA 1RZOB 3FUOA 3F62B 5FREA 3CRHA 1V6JA 3ILAA 4BPZA 4XXAA 1KDMA 1FN0A 5D61A 2MLLB 4R9CA 4IONA 3SLIA 2A7AA 1SLBA 1KNMA 1IJTA 1BLAA 5EHAA 4XJAA 1TWMA 4AGRA 3FBYA 2ZGLA 2DVBA 4XZPA 3APBA 4ZGRB 3WDUA 1DQ4A 4GAFA 1HWNB 1XG6A 2ZGSA 3IPVB 3WMVA 2VY0A 2JE9A 2UWBA 5BOWA 2E51A 5DVHA 2FGFA 4Y1XA 5GJ6A 1FMZA 4XDQA 4FQ4A 5CB7A 4F34A 4UW6A 2W52A 5EC5A 3AYAA 5IK4A 3AJYA 1MS1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3OBTA

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