3R4SA

Cell entry of botulinum neurotoxin type c is dependent upon interaction with two ganglioside molecules
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
428
structure length
424
Chain Sequence
SMANINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTGDSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
publication title The biological activity of botulinum neurotoxin type C is dependent upon novel types of ganglioside binding sites.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
total genus 94
structure length 424
sequence length 428
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3r4sA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3r4sA02
2VY0A 4P6AA 2ZABA 3IM6A 3B01A 3TB0A 4D0ZA 3AFKA 3FJCA 5BOWA 4YW5A 2K43A 5IUQA 2A6XA 2E4MA 2AFGA 1S0EA 5DZFA 4YGBA 4DPNA 3N36A 1KRIA 4Q2FA 3V0AA 4Y22B 3T1LA 2JECA 1Z2VA 1XZZA 2PHTA 1APNA 3O44A 4GXLA 2ZA9A 2MLLB 5T54A 4YM1A 3V65A 1JY0A 1TEIA 4PBOA 3VEQA 1PUMB 4YOLA 1MS8A 4YW1A 1SLLA 1AFCA 1FAYA 4H9WA 4I30A 4P14A 1L2HA 3M3OA 1NZKA 1S0JA 4Y1ZA 4Y26A 2AQZA 1DFQA 3AKIA 4X39A 3ASIA 2XB6C 5GAQA 5GLVA 2CWSA 1JQZA 4J2KA 4XXPA 2AR6A 1CIWA 5DUWA 1MS0A 2D6KA 2WNEA 2HYKA 1S0IA 3CA6A 1F31A 2K4AB 5E24E 41BIA 3MEPA 1G7YA 2Z42A 1LULA 2ZAAA 4YM0A 2D6PA 1EYLA 5CNAA 1W3AA 2JE7A 4EFQA 3ZXFA 3AYCA 4XIKA 5JVVA 1N1VA 1WD4A 4DRRA 1OKQA 1SFYA 1UPSA 1J0SA 1GGPB 3BX1C 1DQ0A 3I2XA 1CVSA 1AVWB 1MACA 4FOVA 3AK0A 1GZ9A 4GWNA 4OZXA 5GLUA 1V6OA 3WO2A 2DVBA 4ZFYB 3FFZA 1E0OA 4LBQD 3CA4A 2Q3NB 1S0FA 5DVHA 3QCWA 1S1AA 4FPLA 3ILNA 1MVQA 2NZ9A 3JUUA 1BASA 1I1BA 2F2FC 1O4ZA 1SR4C 2D22A 1UX6A 2AENA 3CNAA 3B9UA 4RL7A 1T4QA 3OGFA 2UWCA 3V64A 3FUQA 3D6EA 5F5QA 3NWKA 1KJRA 3N35A 1ISXA 2D3RA 1LU2A 1WUVA 4OEFA 3WG3A 4DEPA 1KDKA 1MS3A 1C1FA 3N7KA 1UL9A 5DG2A 3I29B 2ES3A 1IT0A 2LIQA 4Q9GA 4ZBVB 1GICA 4I4SA 1LCLA 5DZUA 4FQZA 2EALA 5E88A 1XQNA 4CTEA 2Y9FA 1SR4A 2TEPA 4X38A 5T5LA 3OJ2A 2VW0A 3JRRA 2D6NA 3FJ9A 1D0HA 3D4KA 2ZHLA 3ZYPA 5GZCA 1LOGA 5GLWA 5KXEA 1N1TA 3AZXA 2NP0A 1HQWA 1AVXB 5T55A 4LO1C 1MZ6A 4LO0C 1WBFA 1JYCA 4BM8A 1IS4A 3O0WA 3W58A 1IKQA 4WBCA 3BRGC 2R16A 4YZ2A 4ZKTB 4BQ1A 2D44A 1TTUA 3ZSLA 5JLVA 3WNXA 1AF9A 2WRYA 3K1XA 1BFCA 1UAIA 4Q26A 2JE9A 3FLRA 4H04A 1IKPA 3LSEA 5HCBA 4I4XA 1FN0A 5CBLA 3LTQA 5EYXA 4YZ3A 3I2AA 4LO1A 3VUOA 1BFGA 1CVNA 1FWVA 2UWAA 4XIOA 4LO0A 3OBRA 3UD8A 4GKXA 1K5VA 3AZWA 2ZHNA 1GZCA 5BXTA 1DQ4A 3WZ1A 1PUUB 2JJ6A 2A6VA 4ISRA 3KMVA 1VAMA 3WLUA 1D2SA 2EXKA 1DHKB 1V6VA 1SBDA 3SISA 3I8TA 2SBAA 3FJFA 1JLXA 2ZGSA 1VAVA 3ZXJA 4HL0A 2DVGA 3AZZA 3R05A 4Y1YA 4YFWA 3WVJA 1UZYA 1JOJA 3BRFA 5AVAA 3DUIA 2JKBA 1TWEA 1AZDA 1AVUA 4LBMA 1HDKA 5GLTA 4PCRA 4WZFA 2Y9GA 1MZ5A 2P3KA 4I0YA 2PHUA 2BEAA 2CL2A 4II0A 1YBIA 3O4DA 4ZGRB 4XBNA 1N3QA 4KC3A 5IT6A 4UW3A 1BA7A 1QDOA 1IILA 5F8SA 5CAZA 1QNYA 3CA1A 4GWMA 3DGTA 1CQ9A 3USUA 3BB2A 4YGEA 3VSZA 2YROA 3N3HA 4AN7B 1FMZA 1Q04A 1PZ7A 3AYEA 3WV6A 3PMEA 3BOPA 3APBA 3MW4A 3FJAA 4J2YA 1QF3A 3FJIA 1ITBA 1AXMA 4LBJA 3OGGA 3VV1A 1CONA 2B7YA 2ZQNA 4YGDA 3AYAA 3SNMA 1ISVA 4YFZA 1YI7A 1SCRA 4XJ8A 4UW5A 3HMYA 4JCKA 4FPFA 1WBAA 4I8MA 4TLPA 4OEEA 4RA0A 3PJQA 1G9FA 3LSDA 2DU1A 3BA4A 1MS5A 4L8QA 5F8WA 2ZGOA 2DREA 4QALA 1W6PB 2OUHA 2DVDA 5HCFA 5F9TA 1BXHA 5GZEA 4CRQA 1MVEA 2A6WA 4YW3A 3QYDA 2P3IA 2R0HA 3WMUA 3ILFA 1OQLB 4R6UB 2FDBM 3RG0A 3VT2A 3RQ0A 3ZC8A 3T2TA 3WINA 3IAGC 1SLCA 1V6MA 4Y1UA 1HKNA 4H55A 4Q27A 2A3YA 1UKGA 4R9CA 5CA6A 1OQ1A 4X37A 1W6MA 4AGVA 1DZQA 1AX2A 1IS3A 2Q9XA 4BMEA 1YYNA 1JHNA 5I1BA 4XOGA 1ULDA 3N7LA 3TC2A 5B2HA 3S8KA 2OVUA 3C2UA 5JOXA 4P0JA 1SACA 2VSEA 3FJEA 4WV8A 1G8WA 5KXDA 2QN4A 1BQPA 2NMOA 3UJ0A 2A70A 3BTAA 1JT5A 5DG1A 4NOTA 1KDMA 1GV9A 3NBEA 4JQ0A 5DZEA 2X2SA 3A07A 2PHXA 4W65A 2NTDA 5KXBA 1BFBA 3AP6A 1TP0A 2I1BA 2DWRA 1UZZA 4BPZA 1JTCA 2ZQOA 4XJ9A 3RTJB 1JYIA 1YO8A 4GAIA 4HJJA 3FLPA 5EC5A 3AKGA 3SH3A 5G00A 4QKRA 2HZ9A 1A8DA 1CPNA 2PHFA 1LOEA 4YGCA 1RIRA 1XYFA 3NBNA 4M3CE 4Q8KA 3M2MA 1MC9A 3RMYA 2VW1A 2DUPA 2DUOA 2FO1A 4ISQA 1PC8B 2W68A 3HN1A 1W6PA 2DVFA 4YM2A 3ILAA 4XFUA 4I4OA 3F1RA 2GNMA 3NBDA 1DQGA 4P0LA 2HWAA 3UD7A 4FPCA 3B00A 1MS9A 1Q56A 1Z78A 1Q8OA 2IHOA 1ILR1 1BLAA 3CQAA 4OWLA 4Y1VA 5DUXA 3O0VA 5CB7A 1V00A 5E8AA 4XMAA 1TOOA 3T8SA 3V0BB 4FPKA 3CA3A 4FPEA 3PHZA 4XE9A 4M01A 1RINA 4ATFA 2GMEA 4JRAA 1LEMA 2OW4A 4AWDA 1PWAA 2EXHA 2RSTA 3BAOA 2GNDA 1IS6A 2WSVA 2CTVA 4BLJA 4I4PA 1VALA 3S8JA 1V6WA 3Q9OA 3H6QA 3M3EA 1N3OA 2D43A 5BXRA 3AXEA 1LOFC 5DZGA 2R49A 4YG0A 4KEIA 1Z0HA 4QC4A 1S0LA 3FGMA 1WW6A 2FHRA 3RRDA 4PBPA 1SLTA 2DTWA 3PVOA 1R1ZA 2AGSA 4FGFA 5LK5A 2DTYA 1DQOA 5JMCA 5T5PA 4BMBA 4ZOTA 3P6JA 3WDWA 3IIRA 3UK9A 4ZFUB 5H9PA 3WDTA 5D63A 2EIGA 5DUUA 5IK8A 1QMJA 3VKLA 1W6NB 1EPWA 1G9BA 2GN7A 1V6UA 3UJ4A 3A22A 2P39A 1LOFA 3N7JA 3AP4A 3FJKA 3UD9A 3V79C 5GALA 1YXWA 2D20A 1LTEA 2A75A 2XOAA 4HA2A 1IOBA 4XILA 2R0FA 4I4RA 1HKDA 2GNBA 3GALA 4BLIA 1V6IA 1SLBA 1KITA 4XJZA 2GDFA 3L2YA 4R9BA 4Y22A 1HQLA 2ZGUA 1XG6A 5FZZA 3CAHA 3FLTA 1LOCA 3HSMA 3BAVA 3P6IA 2Z49A 4DCKC 4LBQB 2ZKNA 3KM5A 1YRZA 5JDBA 2F2FA 3OBTA 2ZGKA 4UW4A 4QD2B 4M3CF 3WHUA 2ZR1B 2H0BA 3AZVA 1GBGA 3FJHA 3V0BA 3UDAA 2P2KA 3WA1A 3PVNA 1DIWA 1KNMA 3JUTA 5BVPI 4UW6A 3BAGA 2W52A 5JOWA 1AVAC 4USOA 1RITA 1WBCA 2ZGRA 2E7QA 1HLCA 1GZWB 4XBLA 2NVHA 1LHVA 4A7YA 1S0CA 3AZYA 3ZXGA 4GOVA 1WLWA 3PG0A 2ZGTA 3FJJA 3ZVXA 1BLDA 1II4A 1F9KA 1SCSA 2XG3A 1N47A 1O4YA 4P0KA 5GLZA 1EVTA 3O4AA 1J1TA 3ZC9A 1HWNB 2LIEA 4AYUA 3WUDA 5JOZA 2D24A 2D6MA 2R9KB 3C9ZA 4HR6C 3O49A 2ERMA 3RTIB 2SLIA 4KBBA 4K1ZA 2EXJA 4XMIA 5EWSA 1DFCA 3RS6A 1G9AA 1W6NA 4M3CB 5FREA 2F8XC 2WKKA 2D7RA 2WQZC 4ZXKA 1WW7A 2GNTA 3WDUA 1AXKA 4QD2C 1DQ2A 3ZXKA 2AREA 2ZMLA 3D7WB 4D0TA 1SLIA 5BP5C 1KJLA 1G9DA 4IZXA 2IWTB 5GZGA 1AXYA 1WBLA 2EF6A 4YG3A 4IY9A 2JD4A 2D1ZA 4XJUA 3FUOA 3PVEA 4K21A 3FBYA 4LBKA 3BIWE 5T52A 2RQ9A 1TWMA 4USPA 5EHAA 4NO4A 2L5XA 1IRPA 1JT7A 3N0KA 2ZACA 4Z8SB 4J2SA 3CRGA 1ENRA 3ZYRA 5SV8A 3MPPG 5FNWA 4SLIA 1ONAA 4YZ4A 3B69A 2E6VA 4GKYA 4XTMA 5BP5A 1HWMB 3POSA 1LHWA 2YZ4A 4FPOB 3AJ5A 1WW4A 1MS4A 2GN3A 1ULGA 4LO8B 3MW3A 3A23A 1LGBA 3ZXDA 3WDYA 5FZYA 4I1BA 1GZWA 3BAQA 1TFMB 3VKNA 3QLQA 1YF8B 1ISZA 4YG6A 2DUQA 2I2SA 5H9QA 1H30A 4U2AA 3AP9A 5IK7A 3OJMA 1H9WA 4GP0A 3RSJA 4DENA 3MALA 2LTNA 4IY8A 4IYBA 3SITA 3NV3A 3OJBA 4AN6A 4D69A 5D62A 5DUYA 2UWBA 2A5ZA 4G1RA 4WVWA 2ERFA 4PC4A 1XHBA 2VXRA 1ISWA 1IJTA 3NV4A 1ULFA 4FP3A 4OEGA 1HWPB 3POWA 4AVSA 1LGCA 2FMDA 2D3SA 2ZGMA 2NN8A 3R4UA 2HW9A 1N4KA 2Y9WC 4M3CA 4ZA3B 4IHZA 1VCLA 4Y20B 1FWUA 3FJ8A 4YM3A 9ILBA 4YZ1A 2ENRA 3BODA 3POYA 4XTPA 1AJKA 1TIEA 4YW2A 4TZDA 4AVVA 4GALA 1HIBA 21BIA 1W0OA 1AVBA 5GJ6A 4J2XA 2ZZJA 4AGGA 4YLZA 7I1BA 1CJPA 2FFUA 1DLLA 1V6LA 4LO7B 3WG4A 1QOTA 1UMZA 5EYYA 4FQ4A 3VT1A 3ZPYA 2D23A 2LALA 4P9WA 1SLAA 1LGNA 4EB2B 4DFSA 3AJYA 2UU8A 1MD6A 1QNWA 3UJQA 3OY8B 4Z9WB 5BQUC 4I6IA 2WSUA 3B3QE 3N7MA 4GOYA 2P34A 3WDXA 1NXD1 2PELA 1DYPA 2A6YA 1QGLA 3HR9A 4ITCA 3NJ5A 3SNVA 4Y24A 1HCDA 2UUSA 3UJOA 3VKFC 2P23A 1LHNA 1LEDA 4PQ9A 3RMXA 4XYXA 1M2TB 2ARXA 1LESA 1HWOB 3AXDA 4I37A 3O0XA 1H9PA 1LODA 1MS1A 4C1WA 4ZFWB 2ZGPA 1W6QB 3H6SE 3WG1A 1S0DA 4L4HA 1OFSA 2RG9B 1IHKA 5BQUA 3ILRA 3D5OA 4XFTA 1DYKA 1FV2A 1JXNA 2ZMNA 2QYIB 1BJQA 5H9RA 4OW4A 1ENQA 2D3PA 3U4XA 2RHPA 4R9AA 4Z8BA 1Q8VA 5DUVA 1FNZA 3PUBA 4XBQA 4QBCA 4I4YA 4LO7C 2Y9XE 4LO2C 4QO3A 1C1LA 1JLYA 6I1BA 1IOAA 2D7FA 3KQRA 3JU9A 4Y20A 4XZPA 2KH2A 3AKFA 5KXCA 4P9XA 1ZM1A 1G86A 1SBEA 1X50A 4C1XA 4FOYA 4XHXA 4XJAA 3POKA 3O5SA 1BYHA 2AH2A 4KEJA 2E51A 2KLLA 3O4OA 4L4IA 3ENRA 2K8RA 5H9SA 4LO2A 4X3AA 4GP3A 31BIA 3ATGA 2AUYA 3IPVB 1AX1A 3ZXEA 3WO3A 1I3HA 1GNHA 1ULCA 2VU9A 5EXOA 1FQ9A 2DYCA 3OY8A 3HBWA 1W0PA 2ESUA 2EXIA 1GYKA 1JT3A 2YUGA 4K20A 2CNAA 3A21A 2KM2A 4JKXB 1FMMS 1FV3A 4R9DA 4DRVA 2AYHA 4Q8LA 1LHOA 1QQLA 1RMLA 4AVTA 1G82A 1GSLA 1NUNA 5IK4A 2R1DA 3CRIA 1SZ6B 4OWJA 4HANA 3T1MA 3SH5A 2GALA 1F5FA 1Q1UA 4I4VA 1W6OB 3AJZA 2J3PA 4F34A 4FP2A 1CESA 3O4CA 3UL2A 2NM1A 1KQRA 2NMNA 1W6QA 1FNYA 1VIWB 2W39A 4OUJA 3ZSJA 4QKSA 4EKXB 2WT2A 3Q7WA 3O5WB 2GMMA 2Z48A 3BA5A 4I7IA 3WMVA 2KI6B 2WJSA 1GLHA 4XKIA 2D6LX 1PZZA 5EG6C 1DQ5A 1QQKA 2ZHKA 1QOOA 2YY1A 3AH1A 4BOWA 4Q91A 2VW2A 3OJVA 3WDVA 2WBCA 4JPZA 3HALA 2PHRA 1LJ7A 1IS5A 4LO3C 2A71A 4FVVA 1FX5A 1VLNA 3AP7A 4WVVA 4FPHA 2PHWA 1PZ9A 1Q8SA 3VKOA 1PZ8A 3LCPA 2CY6A 4JC1A 2EAKA 3ZX7A 1CN1A 2WT1A 2DURA 4XDQA 1WLCA 1S0GA 1MR5A 1RG8A 1WW5A 1SBFA 1GANA 3ZXLA 1W3FA 4I4QA 1JUIA 5E89A 4Q1PA 4ASMB 2JDZA 3H0OA 3IM5A 4LO3A 1YIFA 1FGAA 4K1YA 2A3XA 1RY7A 3BAHA 2VH9A 1DJSB 1WLDA 2ARBA 1QDCA 1GKBA 2M49A 3IPVA 1W3GA 1ZA4A 4A7ZA 4FPYA 4Y1XA 3CRHA 3USUB 2A3WA 4I2SA 3IMNA 5DXDA 3OPZA 5GZDA 2MIBA 2VXTI 4ENDA 1B09A 3ZSKA 5GM0A 4M00A 3WO4A 3OYWB 2V5YA 8I1BA 1DZDA 1C4RA 1ENSA 2V73A 4FPGA 3O3QA 2KKIA 2FFVA 1FYUA 1BKZA 1LOAA 1N1SA 1CR7A 1BZWA 1W6OA 2D6OX 2NYYA 5HCAA 1ABRB 4I4UA 4GA9A 4A7KA 4IONA 3W59A 2P3JA 4GAFA 5FNXA 4P9YA 2C9AA 3WG2A 1DZCA 1QU0A 4I3NA 4ATEA 4JP0A 4JKQA 3BADA 1K5UA 2DV9A 1Q8PA 3IM7A 4G9MA 3TAYA 3A0KA 5IK5A 2Q5TA 4EFPA 2E7TA 4EEEB 1URXA 2G4IA 1N1YA 4LBOA 3VWCA 2GZBA 2A6ZA 5T5OA 4I1EA 3SH4A 2ZGNA 1YTOA 5T5JA 2C5DA 1W6MB 1AJOA 4TYSA 1CPMA 2AAIB 3H6RB 3O4BA 1AXZA 3F62B 1Q03A 4LBQA 1CE7B 1GNZA 4G9NA 1V6XA 2R1BA 2YXSA 1R8NA 3WCRA 1V6KA 2MC2A 5HPZA 2W08A 5FRAA 3AP5A 2BEBA 1DGLA 1NLSA 4IQPA 3B9CA 2CYFA 3VT0A 3QR5A 2ET2A 5D61A 1AX0A 1QXMA 5BXPA 4XFSA 1R8OA 4DQAA 2OUJA 2X2TA 1BARA 1U0AA 5DSSB 3O12A 4I96A 5T50A 3Q7XA 5BYNA 1RZOB 3W9TA 3I4IA 2HWMA 1HCEA 1WD3A 3OYWA 3WUCA 3M3QA 4CJMA 2GO2A 3FJDA 3E8LC 2UURA 4D8HA 1ONKB 1C57A 1DQ1A 2CWMA 3FJBA 4JAWA 4KEKA 1BFFA 3AJ6A 3WINC 1T9FA 1LU1A 1JN2P 3A0NA 3M1HA 2FGFA 1DQ6A 3GNEA 2ZMKA 4FPJA 4G6JA 4LBLA 2WLQA 4XJWA 3CU1B 5FZUA 1N3PA 3IM0A 3ZSMA 3Q7YA 4YZ5A 3AH4A 4IZEA 3VSFA 1A3KA 4F83A 3INAA 1I1EA 3NV1A 3V0AB 4Q9PA 4FOWA 4XHBA 1DBNA 1LHUA 4G6MA 5BXSA 5GZFA 3NBCA 3AKHA 1P63A 1FATA 4FOQA 1V6NA 4AGRA 4XXAA 1JBCA 3BAUA 3BA7A 3WHTA 1ULEA 3WCSA 4OWKA 4DS0A 1Y7BA 1WCSA 1Q8QA 3H6RA 5L73A 4U36A 5F8YA 2VUAA 1LOBA 2BFHA 4YW4A 2YMZA 1Z4SA 3AYDA 1V6JA 2DRZA 2WT0A 1UN1A 4ZLBB 4J23B 2VSAA 3VKMA 2AXMA 2DU0A 3MW2A 2VLCA 2ZHMA 1A78A 2ZGLA 1EV2A 3CA0A 2A7AA 2GMPA 3A4UA 3AX4A 2KI4A 3IN9A 4LBNA 1JW6A 2ZBJA 1IRAX 1LENA 1QOSA 3AH2A 2BQPA 4PF5A 1G9CA 3NV2A 3LLPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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