3R4SA

Cell entry of botulinum neurotoxin type c is dependent upon interaction with two ganglioside molecules
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
428
structure length
424
Chain Sequence
SMANINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTGDSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The biological activity of botulinum neurotoxin type C is dependent upon novel types of ganglioside binding sites.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
total genus 94
structure length 424
sequence length 428
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3r4sA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3r4sA02
4HANA 1IOBA 1I3HA 3PUBA 4BQ1A 2A6ZA 1G82A 3SNVA 2V5YA 4WVWA 1SR4C 2Z42A 1ISVA 1QOTA 3QLQA 1N1YA 5DZUA 3ZC9A 2Z48A 1XHBA 3OBTA 3KMVA 5BYNA 3VSFA 1ENQA 1OFSA 3D5OA 3DGTA 3W59A 4JQ0A 1IOAA 1Y7BA 3SH3A 1DIWA 4Q27A 2R49A 4KEKA 2AREA 5GZEA 4ZXKA 4PC4A 3NBDA 2ERMA 4UW5A 1CESA 1O4YA 4QO3A 4ZOTA 2PHFA 2D7IA 1N3PA 1SLIA 4ATEA 3HBWA 2WQZC 1PZ8A 4GWNA 2YMZA 2NP0A 4I6IA 4LBOA 4XJAA 2A6VA 1LGNA 3T1LA 1ZM1A 1W3AA 5F8WA 2DU0A 3CA1A 4IY8A 2EIGA 1E0OA 4YW1A 1PC8B 4I1EA 3VUOA 1DLLA 4HL0A 2E4MA 1DYKA 1AX0A 1ILR1 4GKXA 4FPFA 4FQ4A 3WG4A 5IK5A 2FMDA 1WLDA 1FATA 4PQ9A 1Q8OA 5HCFA 2OUHA 5KXCA 1QOOA 5CNAA 3FJEA 1IS3A 3AYCA 3ZSMA 2GDFA 1BA7A 1BYHA 4YM0A 2ZHKA 3ASIA 4FPYA 1IS5A 3LCPA 3AH2A 2YROA 2D6PA 4P9WA 2ZGRA 4XBQA 4ISQA 1BZWA 4BPZA 1AVAC 5KXEA 1AVBA 1DQGA 1BXHA 3AYAA 5GM0A 4M01A 2ZGKA 3FJKA 3V0BB 5H9PA 1G7YA 2G4IA 1WBCA 4LO1C 2GMEA 1JT5A 2A6WA 1TIEA 1C1LA 2DS0A 3P6JA 4GAFA 1Q8VA 3ZXEA 4I4OA 4JKXB 2JD4A 2F8XC 1GZCA 4Y1VA 4XXPA 1LOAA 2L5XA 4FPLA 2DVBA 4U36A 3LTQA 1UAIA 1PZZA 1CIWA 1YO8A 3OYWB 3HALA 2W68A 4ZFYB 1GYKA 1S0EA 4Y22B 5IK4A 2D1ZA 3TB0A 1PWAA 3CNAA 1JLYA 4LBLA 1GNZA 4XFTA 5CAZA 1C1FA 1HQLA 4A7YA 3LSEA 4XMAA 3FJBA 3BAOA 1LHVA 4L4HA 4XHXA 4EB2B 2A3XA 1LGCA 2ERFA 4OEEA 2EXJA 2DYCA 4YGEA 1Z2VA 4R9BA 5T5JA 1EV2A 1LOEA 1HQWA 3UK9A 1ONKB 3FJ8A 4I8MA 1Z78A 4M3CB 2Q3NB 1N1SA 2ZMKA 4LO1A 3RMXA 3V0AB 2EXKA 3V0BA 2ZZJA 1CQ9A 1V6IA 4Q9GA 1IJTA 3CU1B 2Q9XA 4J23B 4LO8B 1BLDA 1X50A 1K5UA 1IHKA 2P39A 4XJ9A 1KDKA 4Q2FA 3AYEA 3PHZA 4R9AA 4EFQA 2D24A 1GICA 5F90A 3OJBA 4Q26A 3IM7A 3OYWA 4ZFUB 4PBOA 1FWVA 1S0CA 1RZOB 4FPEA 2FDBM 4XKIA 1MZ5A 3ZYPA 1GBGA 2A5ZA 1PZ7A 4KC3A 3LSDA 1IKQA 4EFPA 1C4RA 1IRAX 2K43A 5BP5C 3W58A 1CVSA 5B2HA 1AXKA 2XB6C 3S8KA 1TOOA 1JT4A 1V6UA 3BODA 2HYKA 2NM1A 4I4QA 3P6IA 3AP9A 3ZSLA 2ZQNA 2ZGMA 1DQ2A 1V6JA 1HWOB 1N47A 1LHNA 4P0LA 1YF8B 3C9ZA 1EPWA 3AZXA 4ZBVB 1AJKA 4OW4A 3OBRA 4M3CA 5CBLA 2W39A 4FPHA 5FZUA 5BXSA 2CWMA 2H0BA 1HWNB 5BQUC 2GALA 2P3JA 4GOYA 3V0AA 4JAWA 2ZA9A 1LTEA 3WHUA 1SCRA 3WMVA 4OEGA 4I0YA 4MYEA 4ASMB 3VSZA 1DFQA 1LOFC 2AH2A 3EF2A 1O4ZA 1LHWA 3VWCA 2VXTI 2AUYA 2HWMA 1JW6A 3FJIA 5CB7A 3I2XA 4D0ZA 4PBPA 3FUQA 4Z9WB 5DZGA 5IK7A 3OGFA 2HZ9A 1CPMA 1AZDA 3UJQA 3WV6A 1FWUA 2DRYA 4GOVA 4X38A 3VT1A 1KITA 2ZHMA 4DCKC 1NXD1 1QKQA 1AVXB 2FFVA 2OVUA 5D63A 2DV9A 1ONAA 4JKQA 1Q1UA 2CY6A 2W08A 2PHTA 5FZZA 5BP5A 2WLQA 3APBA 5F8YA 5EXOA 3AZVA 3FLTA 1W0PA 4YG0A 1WUVA 1FAYA 2ZABA 5IUQA 1W6NA 1S0FA 1F5FA 2E51A 3WCSA 4GA9A 3V79C 3IMNA 1VLNA 21BIA 3BA7A 3H0OA 5FNXA 1ISWA 4P6AA 9ILBA 5EWSA 3O4AA 5BQUA 4NOTA 2DVFA 4AN7B 4XE9A 3A0KA 2K8RA 3I2AA 3WDTA 2JE9A 4F34A 1QNWA 4I3NA 5T5PA 3ZPYA 1LOFA 2P37A 3UJ0A 5GLWA 4YZ4A 1G9FA 1PZ9A 3CAHA 1LODA 1Z4SA 1A3KA 4AVSA 1GGPB 2YZ4A 3BOPA 4LBNA 2UUSA 3RTIB 1V6WA 1W6QB 2EALA 1KNMA 1RINA 3FLRA 1MZ6A 1HWMB 5DZFA 4BMEA 3CA0A 2K4AB 3O49A 2Y9XE 4Y1ZA 2ZGNA 4CTEA 2ZGPA 5KXBA 1II4A 1WCSA 7I1BA 2VW2A 1SBEA 3FJCA 4GALA 1OQLB 1YTOA 3O4OA 3WHTA 1LCLA 5DG1A 3AX4A 3RSJA 2AAIB 1DQOA 1BLAA 4XTMA 5BVPI 1RITA 2ZMLA 4IONA 5JLVA 1GKBA 2MIBA 3QR5A 3N36A 4M00A 4I4UA 2JJ6A 4II0A 2VU9A 4FOVA 1M2TB 3WDWA 3ZX7A 2ENRA 3Q9OA 31BIA 2QYIB 4IZEA 1GSLA 3SH5A 4R6UB 3FGMA 4EEEB 1DJSB 3HMYA 3O4DA 1R8NA 5HPZA 1AXYA 4Y26A 1RMLA 1DHKB 2D44A 2D6MA 4YM1A 4BM8A 4Z8BA 3JU9A 4WVVA 1ULEA 3POKA 4X3AA 2ZQOA 2NYYA 1SBFA 1UKGA 4P0JA 1W6QA 4F83A 3ATGA 1ULGA 3MW4A 4DPNA 3O12A 1QXMA 4WV8A 4XIKA 1LESA 5DSSB 2ZMNA 3N3HA 5JDBA 1VAMA 3T2TA 4TLPA 1LJ7A 3TAYA 1BASA 1HKDA 2TEPA 1HWPB 3WINC 5GZGA 3ZSJA 3FJFA 2ZHLA 4LBQB 3NJ5A 1N3OA 1AX1A 1MS3A 2PHUA 2A6YA 3O4BA 3AH4A 1PUUB 1WBLA 3IIRA 4Y1YA 3USUB 3AFKA 4LO2C 4AVTA 3W9TA 3POWA 2UURA 1R8OA 3WG3A 1V6OA 3AP5A 1H30A 3O0WA 1RIRA 2R1DA 4I4SA 3N7MA 1FNYA 2C5DA 1M16A 1AXMA 3OGGA 2KM2A 2AFGA 1CVNA 2NN8A 1ISZA 1TWMA 3V65A 4X37A 1UX6A 2DUQA 5GLVA 2CYFA 5I1BA 3AKGA 5E8AA 5SV8A 5FZYA 3MPPG 1LU2A 1FQ9A 3BA4A 4XIOA 2BQPA 5H9RA 4OWJA 4M3CF 3F1RA 3UD7A 3RMYA 4I4YA 4QKSA 4DRVA 1URXA 2P3KA 3ILAA 2D6KA 2CNAA 3WINA 3MW3A 2LTNA 4L8QA 2PELA 2R16A 3NBCA 2EXIA 3FJDA 2PHRA 2E6VA 4LBQA 4IHZA 2ZGTA 3SLIA 1W3FA 4DEPA 3PVNA 4Y24A 1LENA 4USPA 4LO2A 3VKOA 1CJPA 3USUA 1DZQA 2EAKA 2XG3A 1QGLA 4LBJA 3SITA 4LBMA 3ZXFA 1JOJA 4I2SA 1QDCA 3ZXJA 5H9SA 4OEFA 5DUUA 3S8JA 3AP4A 3BIWE 5FREA 3WNXA 4JRAA 4I1BA 2BEBA 2ZAAA 2WSVA 2MLLB 1JUIA 3OJMA 4GP0A 3AZZA 4G6JA 4BLIA 1KJRA 3UJ4A 2A75A 3M2MA 4QBVA 3IPVB 3N35A 4QD2B 3JUTA 4P0KA 3UL2A 4QD2C 2X2TA 3HOMA 4QALA 1DFCA 4D8HA 3BRFA 2GMPA 2Y9GA 3WCRA 3ZC8A 1ENRA 4XJUA 1EVTA 3O44A 4YW4A 3ILNA 4DRRA 3WO3A 3MW2A 1L2HA 2GNTA 5T5OA 2JDZA 2D6OX 3BAHA 4I30A 1V6NA 2SLIA 3FJ9A 1TEIA 1AF9A 3V64A 3D4KA 3Q7YA 1LGBA 1J1TA 5DG2A 1FV2A 1V6MA 4P14A 4AGVA 1S0DA 4FPJA 2GMMA 4PF5A 3RQ0A 2FO1A 3WDYA 1IKPA 2DTYA 2DU1A 3NV3A 5L73A 5T54A 3IPVA 4Y22A 1J0SA 3AH1A 2D43A 4I37A 3QYDA 3GNEA 1BJQA 1F31A 1IS6A 2RG9B 3OY8B 1BFGA 1ABRB 3I8TA 2R1BA 1AXZA 3E8LC 5EYXA 5GLTA 1W6PB 4Y20B 1QQLA 4XTPA 5G00A 1YI7A 3IM5A 2YY1A 3M3EA 3PMEA 3A23A 1IRPA 3B00A 2E53A 2M49A 1JYIA 2DRZA 4HA2A 5DUVA 3WUDA 4HR6C 2XOAA 4CJMA 3B3QE 2ZR1B 3WDVA 2VUAA 3WA1A 4W65A 1LOGA 2GNDA 3T8SA 3AJ6A 1V6XA 3IM0A 1FYUA 4I4VA 1Q56A 3AJZA 3BAGA 4WZFA 5BXPA 3N7JA 4C1XA 3NV2A 1DQ1A 2GO2A 3FBYA 4Y1XA 2MC2A 4LBQD 1QQKA 2I1BA 1JBCA 1XG6A 3B9UA 2AGSA 3FLPA 3CA3A 1VCLA 2CWSA 1NUNA 1AVWB 1MR5A 4K1YA 4XZPA 3N0KA 2UU8A 3OJ2A 4DENA 1LHOA 3AKFA 4YG6A 3LLPA 4OUJA 1K5VA 2WBCA 3GALA 3AJ5A 3A0NA 1G9AA 1WW4A 4UW4A 4QBCA 2D3RA 5GAQA 3IAGC 3OY8A 4JP0A 2C9AA 2D3SA 1HIBA 1C57A 1TP0A 3Q7WA 3IM6A 1W6PA 1IILA 4Y20A 2CL2A 4YZ5A 1LEDA 4I96A 4GAIA 1GZ9A 1GLHA 4D69A 3AXEA 1Q8QA 3NV4A 4P9YA 2A6XA 3UD9A 1WD4A 2P34A 4KEIA 4EFRA 4XJ8A 3NBNA 1G86A 4K1ZA 1V6VA 2WKKA 3ZXGA 1GZWB 1SLTA 2WJSA 2AR6A 1OQ1A 2A3YA 2VXRA 5F8SA 2YXSA 2QN4A 2I2SA 3QCWA 3I29B 3VT0A 2D7FA 1BARA 1CONA 2CTVA 3O3QA 4K20A 8I1BA 1EYLA 4ZGRB 3AK0A 3CRIA 1AX2A 4H04A 3HSMA 3A07A 1WBAA 3VKMA 4OWLA 5BOWA 1XQNA 3ENRA 2X2SA 1GV9A 3CA6A 1MACA 4FVVA 1LULA 1LOCA 1NZKA 3A4UA 5EG6C 3RRDA 5EYYA 4LO3A 1CE7B 3CA4A 4G1RA 2LALA 4IZXA 3BTAA 2R0HA 5JOXA 2NMNA 2UWCA 3KQRA 2E7QA 5T50A 4AYUA 3FUOA 2DURA 2B7YA 1Q04A 1FNZA 3INAA 1AVUA 3IKWA 5D62A 2VY0A 2VSAA 4QC4A 5EC5A 1VIWB 1JXNA 4Q1PA 1DQ0A 3ZYRA 1SACA 1DQ4A 4KBBA 5T55A 1V00A 3POYA 4DS0A 4YGBA 1GZWA 1ISYA 5HCAA 5E88A 3M3OA 1P63A 1KJLA 4XBLA 5DZEA 1Q8PA 1CPNA 2ZBJA 2Q5TA 1FV3A 1FGAA 1WW7A 1PUMB 3PG0A 4DQAA 1JN2P 2F2FC 1TFMB 4XFUA 1QDOA 1KRIA 1QU0A 3IN9A 3BB2A 1YXWA 5AVAA 1BFBA 3AP6A 2RHPA 1S1AA 5GZCA 4Z8SB 1YRZA 3P53A 4DFSA 2JECA 4FOQA 3D6EA 4UW3A 3CQAA 2IHOA 4G9NA 4AGGA 5E89A 3RG0A 2DVAA 1JY0A 1LOBA 4C1WA 4QKRA 2DVGA 1U0AA 1MS5A 3MEPA 4YFZA 4XOGA 1S0IA 3BADA 2P23A 2WT2A 1SBDA 2DUOA 2WT1A 1ZA4A 2V73A 4GKYA 3WG1A 2LIEA 1W3GA 2WRYA 3FJAA 1QMJA 3UJOA 1LEMA 2ZKNA 3SNMA 1VAVA 2WSUA 1YIFA 1DZDA 3JRRA 4GWMA 2VW1A 4J2XA 3ILRA 2SBAA 4ITCA 4FP2A 2D23A 1MC9A 4KEJA 2UWAA 1DGLA 1HKNA 4FPKA 3BAQA 5GLUA 2ARBA 2F2FA 2OW4A 4RL7A 5EHAA 3BA5A 3POSA 4OWKA 4YZ3A 3K1XA 4FOYA 1MD6A 4FGFA 4YGDA 1WLWA 1AFCA 3ZXLA 1DBNA 2ET2A 3BX1C 1UL9A 4OZXA 1TWEA 4LO0C 1YBIA 3M1HA 4XXAA 2D20A 4J2SA 4USOA 3O0VA 4G6MA 2LIQA 2W52A 1JYCA 1N4KA 3ZSKA 1S0LA 4IY9A 1UMZA 3CRHA 3Q7XA 3H6RB 1A78A 1FN0A 1XYFA 1W6OB 2RSTA 1RY7A 4YGCA 1SR4A 1MVQA 5LK5A 2A70A 2FHRA 2VLCA 2ZGSA 3N7KA 1S0GA 2DTWA 4YM3A 3WO2A 1TTUA 2ESUA 3A22A 2HW9A 1F9KA 3L2YA 4YM2A 1MS1A 2NMOA 5KXDA 4BLJA 3WZ1A 4H9WA 5IT6A 3RS6A 5GLZA 1HCEA 4I4PA 2ZGOA 2EF6A 2Z49A 4LO0A 2NTDA 4YOLA 4YFWA 1T4QA 5IK8A 4SLIA 4Y1UA 1CN1A 4FP3A 3UDAA 1Q03A 3T1MA 1FX5A 1BQPA 1DQ5A 3NWKA 3WMUA 1APNA 1G8WA 1IT0A 5GALA 2KH2A 4HJJA 1JQZA 3H6RA 1Q8SA 3ZVXA 4A7KA 4YG3A 1BFCA 2NVHA 1MS8A 1W6OA 2YUGA 3FJHA 2AQZA 4YZ1A 5T52A 1G9BA 2J3PA 4TYSA 2P3IA 3AYDA 1WBFA 4ZA3B 4L4IA 1DYPA 2D6LX 4JCKA 3RTJB 3AZWA 1KDMA 4FPCA 4FQZA 4BOWA 2R0FA 4BMBA 2WNEA 2D3PA 1S0JA 3CA5A 3WG2A 3ZXDA 1FMMS 3VKFC 3HN1A 1ULFA 2ARXA 4FPOB 3H6QA 1V6KA 4I4XA 2ZHNA 3DUIA 3PJQA 2ZACA 4P9XA 1DZCA 5F5QA 4NO4A 5HCBA 1N1TA 1QF3A 3AZYA 2BEAA 2RQ9A 2KI6B 1SLBA 1MS4A 1QOSA 4J2YA 2HWAA 1UZYA 1D2SA 1YYNA 1IS4A 5GZFA 2D7RA 3BRDA 2DWRA 1FMZA 3TC2A 1UPSA 2GZBA 3M3QA 4Q8LA 2AXMA 3BAUA 1MVEA 2A71A 1W6NB 2WT0A 4XBNA 3WDUA 4XFSA 1SLCA 6I1BA 1RG8A 3PVOA 3NV1A 1I1EA 1WD3A 2GNBA 5D61A 4AWDA 3F62B 3AP7A 4WBCA 1ULCA 4PCRA 4LBKA 1ISXA 3O5WB 2VW0A 4R9DA 2PHXA 2GNMA 5T5LA 4Q91A 4I4RA 5JOWA 1LU1A 2P2KA 3H6SE 3I4IA 4A7ZA 5DUYA 3HR9A 1LECA 1H9PA 1SFYA 5JOYA 4UW6A 1A8DA 1GNHA 4ATFA 2R9KB 1WW5A 3WVJA 4GP3A 2PHWA 4XHBA 2D22A 5GZDA 3N7LA 4H55A 3M3CA 2AYHA 1BFFA 3WDXA 1ENSA 3PVEA 4XJZA 5CA6A 3ILFA 4JC1A 2OUJA 1SCSA 4LO3C 2ES3A 1W6MB 3BAVA 4Q9PA 1SLLA 1HLCA 1AJOA 1V6LA 1SZ6B 3AJYA 3R4UA 4ENDA 4AVVA 1WW6A 4XYXA 5BXRA 5DUXA 4GXLA 3WO4A 1UN1A 3FFZA 4M3CE 2BFHA 1OKQA 4YZ2A 3O0XA 1JT7A 3OJVA 5JMCA 4CZSA 3O5SA 2A3WA 5BXTA 1JLXA 2ZGLA 1WLCA 1DQ6A 1HCDA 2JE7A 3VV1A 4YLZA 2EXHA 1KQRA 1W0OA 1I1BA 1NLSA 2NZ9A 4FPGA 3WUCA 2AENA 1ULDA 4JPZA 1GANA 2GN3A 3U4XA 5DXDA 5H9QA 3AKIA 1MS9A 4EKXB 3UD8A 3B69A 2IWTB 1ITBA 3AXDA 3R4SA 4IQPA 4AGRA 1H9WA 4XDQA 3AKHA 4Q8KA 2FFUA 4K21A 4U2AA 4ZKTB 3WOGA 1B09A 3NBEA 1W6MA 3B01A 1HDKA 2KKIA 2KI4A 2DREA 1SLAA 4X39A 2E7TA 2JKBA 4G9MA 4LO7B 2KLLA 1BKZA 1CR7A 1G9CA 4ZFWB 4LO7C 3SISA 2Y9FA 4Q1RA 2GN7A 2Y9WC 2ZGQA 4ZLBB 3JUUA 1MS0A 1R1ZA 3WLUA 1T9FA 2VSEA 3VKNA 5FRAA 4XMIA 2ZGUA 4FOWA 4YW5A 4J2KA 3CRGA 1N3QA 1G9DA 1Z0HA 3D7WB 5JOZA 5GJ6A 4XILA 4ISRA 4CRQA 3R05A 3VKLA 3A21A 3OPZA 5DVHA 3VEQA 3VT2A 2DUPA 3C2UA 2D6NA 4R9CA 4RA0A 2A7AA 3KM5A 3BRGC 1JHNA 1XZZA 1D0HA 3SH4A 1JTCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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