3R4SA

Cell entry of botulinum neurotoxin type c is dependent upon interaction with two ganglioside molecules
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
428
structure length
424
Chain Sequence
SMANINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTGDSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The biological activity of botulinum neurotoxin type C is dependent upon novel types of ganglioside binding sites.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
total genus 94
structure length 424
sequence length 428
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3r4sA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3r4sA02
2CNAA 1AX0A 3LLPA 4ATFA 1CN1A 3AH1A 3SH5A 4K21A 5IK5A 4X38A 5DG2A 1N1TA 4LBQD 4EKXB 5D63A 4QD2B 1LODA 4FPLA 3M3OA 1SBDA 2D20A 3ZXLA 1AVUA 3WLUA 4USOA 4Q27A 4D0ZA 3MALA 2MC2A 2TEPA 2KI4A 3BA5A 1CQ9A 1UN1A 1V6NA 4YM0A 3O49A 5DUVA 4FOYA 1TIEA 5DZUA 3AKFA 3FUQA 4H04A 4BPZA 3CRHA 1HWOB 3ZPYA 2KKIA 3Q7WA 4U36A 4L4HA 3RTJB 2AR6A 1FGAA 3WG1A 3OJBA 4YGBA 1F5FA 2L5XA 4DRRA 3UJ0A 1LGBA 4C1WA 5D62A 3T8SA 4ZFWB 4FPHA 1HLCA 1CPMA 1Q8OA 3ZC9A 2JJ6A 2Y9GA 2P3IA 2PHXA 4A7YA 4YM3A 1DQOA 3B69A 2NP0A 5JDBA 1LOFA 1II4A 1Q04A 1DGLA 4Y1VA 4Q9PA 4W65A 4XJZA 1QOTA 3BODA 4XBQA 1TOOA 4XFSA 1W6NB 4KC3A 1R1ZA 4AVVA 2KH2A 1Z78A 1FATA 3TAYA 3BAGA 1FWVA 1LJ7A 3WUDA 1LHVA 3ZSLA 1MS8A 3OY8B 3H0OA 4Z9WB 4DCKC 3N7LA 2UURA 1SR4C 1IS4A 2NYYA 4FVVA 2Q5TA 1XQNA 1OKQA 2VSAA 1NUNA 4AYUA 3CA6A 3MEPA 3PMEA 1LOBA 1MACA 2DYCA 5IUQA 4YGCA 3SISA 5JMCA 2JECA 1IT0A 4I3NA 1PZ7A 4Y20A 2A3WA 1W6OB 1HIBA 3FUOA 4M3CF 2DU0A 3I2XA 1LECA 4M00A 2D3SA 1Q1UA 4FPEA 3HALA 2NMNA 1BLDA 1QDOA 3B01A 2D7IA 2YMZA 3W9TA 1MS5A 1HCDA 2D6LX 1V6VA 1MVQA 3AZYA 2CTVA 1WW5A 3BADA 4DPNA 4YG6A 2ZR1B 4DS0A 3VSZA 4XTMA 1LOEA 3ZSMA 1QXMA 3CA1A 4DQAA 4L4IA 1FV2A 1DFQA 3TB0A 1LEDA 3ZXDA 4AGVA 4J23B 1Q8QA 1UKGA 3AYEA 1Y7BA 4UW4A 4AN6A 4PQ9A 2FGFA 3A23A 1G9DA 4J2YA 2ZGLA 2FMDA 4K20A 4XJ9A 3BAUA 4FOWA 1ULCA 3BA4A 3P6JA 3N36A 4FQZA 3O4CA 2Y9WC 1MC9A 4OWJA 1DYKA 4QKSA 2FFUA 1S0CA 5FZUA 1FV3A 3ZSKA 4I4PA 5JOYA 4FPKA 3FBYA 3AP7A 4K1YA 3CQAA 2AUYA 1G86A 4I4YA 4BM8A 1WCSA 5BVPI 4Y1ZA 2Z42A 1NLSA 4IZXA 2WNEA 4ZBVB 3D6EA 1E0OA 4YM1A 3IKWA 3D7WB 1HKNA 1AJOA 3SNMA 21BIA 4BMEA 2D7FA 3WNXA 1S0IA 1B09A 2DRYA 1HKDA 2ZAAA 1BYHA 3AKIA 1TWMA 1RIRA 5JVVA 2ZGPA 2ZMNA 5DSSB 3HSMA 1DQ2A 4QO3A 4XJWA 1TFMB 2XB6C 3A0KA 2V73A 4YW2A 3NJ5A 2ES3A 4ZLBB 3LSEA 2ZGTA 4YW1A 4OWKA 1ULDA 3A0NA 1LEMA 2ZGSA 1A3KA 5BXPA 1UPSA 1DQ4A 3O5WB 1Q8VA 1W6PB 2D6OX 1Q03A 3M1HA 3ZXKA 4I0YA 4D8HA 1LHWA 5EYXA 4LBNA 5F90A 4P14A 4PBOA 3IPVA 4AGGA 1F31A 3AYCA 1GICA 1LHNA 4YZ1A 1XZZA 2CWSA 2CL2A 3CRIA 3E8LC 5FZZA 2HW9A 3WCRA 2VY0A 3BB2A 3NBDA 2AENA 5SV8A 3CA4A 2OUJA 2ZBJA 1IRPA 4WBCA 2ZMLA 1LCLA 5GM0A 4ZKTB 1QOOA 1T9FA 2LIQA 3AH4A 1AVXB 1N3QA 4X39A 4XJUA 1JLXA 1W3FA 3FLTA 2VU9A 2C9AA 4U2AA 1S0GA 2P23A 5G00A 1W0OA 4KEIA 4LO1A 3AX4A 3B00A 3AZWA 4XYXA 1YXWA 4M3CA 3RRDA 3WDUA 3O0VA 3TC2A 3APBA 3NV3A 31BIA 5BXSA 1V6WA 1DQ0A 3O3QA 3FJ9A 4P9XA 3FJBA 1ISZA 3NV1A 1VALA 3IMNA 1W6QB 2GMPA 3WMVA 4DENA 5BYNA 3CAHA 3A21A 3I4IA 1LU1A 4KBBA 2ZHMA 3P6IA 2LALA 4SLIA 4TLPA 4EFRA 5GZEA 1Z2VA 1G7YA 1A78A 4P0LA 4TYSA 2YY1A 4LO2C 4CZSA 2VSEA 3IM5A 4QBVA 3N7JA 4M01A 4H55A 1IILA 5H9PA 2PHRA 4Y22B 1W6MA 4L8QA 2WT2A 2GALA 3AXEA 4LBQB 2GO2A 4PCRA 3WINC 3WMUA 2NMOA 2WKKA 2DRZA 1WLCA 5BQUC 3BA7A 1RZOB 1T4QA 1BQPA 5GLUA 1ONAA 3AKHA 1QQLA 1JQZA 2R9KB 5T5LA 1KDMA 3C9ZA 1GKBA 2XOAA 2AYHA 2AXMA 4G6MA 5I1BA 1UMZA 3NBEA 1SLAA 1YYNA 5E24E 4II0A 2R1BA 3N7MA 2ZA9A 2ZQNA 4LBJA 1HWPB 4LO3C 1GZWB 1RINA 3VV1A 4I8MA 2D22A 1J0SA 5T55A 3RMXA 4ENDA 1ZM1A 2I1BA 1LU2A 4GOVA 4WVWA 2DTYA 3R4SA 4LBOA 4PF5A 5D61A 1FMZA 4GKXA 3M3QA 2D1ZA 1AXKA 1CR7A 4XOGA 5GLTA 1Q56A 1VCLA 2H0BA 3P53A 4I96A 1JT7A 3F62B 1V6JA 5FNXA 3IM6A 2PHWA 4K1ZA 5F8SA 2D7RA 1N47A 1KRIA 1DFCA 2ET2A 5BP5A 2EXHA 3DGTA 2YZ4A 1RY7A 2F2FA 3MPPG 3O4BA 2IWTB 1G9AA 4UW5A 4I4SA 2NTDA 3V0BB 2J3PA 2VW1A 3AZXA 1UZZA 2A6XA 3KM5A 4GAIA 3FLRA 2GMMA 2QYIB 4I1BA 1CVSA 5BXRA 1V6UA 1JT5A 2ERMA 1KNMA 4BLJA 1XYFA 1WLDA 1IOAA 1PZ9A 3AJ5A 2AH2A 5EYYA 5HCFA 1SLLA 4A7ZA 3FJIA 1S1AA 2YROA 5JOWA 3JUTA 5F5QA 4YGEA 1VIWB 1MS3A 1IKPA 3S8JA 3OYWB 4WZFA 1I1EA 3FJKA 2DVAA 3M2MA 2P3KA 1O4ZA 2FFVA 1QU0A 3UDAA 1BLAA 3H6SE 3WDWA 1JW6A 3O5SA 5GLWA 4XE9A 2Q3NB 2VLCA 1AF9A 1S0BA 2VH9A 4Q1PA 5EWSA 4BMBA 7I1BA 3O0XA 2EF6A 2F8XC 1IRAX 4TZDA 1V6XA 1V6LA 3AJ6A 2ZGQA 3PVEA 5EC5A 1DQ1A 5DZEA 1CPNA 3JUUA 3B3QE 4BOWA 1BARA 4I4VA 1VAVA 1GANA 2W52A 3MW4A 1QOSA 2D44A 3QLQA 5GZCA 5CAZA 3NBCA 3VEQA 1WW7A 2WSUA 2D3RA 4QKRA 1AVAC 4EFPA 2ZQOA 1JYCA 3BAVA 4OW4A 5E89A 2EALA 3B9UA 3ILFA 1SLIA 1GYKA 3IN9A 5T52A 4H9WA 3ZSJA 1WD4A 4ZGRB 4Q26A 1Z0HA 2LIEA 1W6NA 2GDFA 3LSDA 5GZDA 4P0JA 4CTEA 5FZYA 3T1LA 3AFKA 1BJQA 1G82A 1QNYA 4XJAA 2D6KA 3AKGA 3O44A 1IS6A 2P34A 3FJEA 3O4AA 2E7TA 3N3HA 2D6NA 4JKXB 2DU1A 1XG6A 4HA2A 2K8RA 1BFCA 5HCAA 2PHFA 5JOZA 1CVNA 1N3OA 3T2TA 1DJSB 2HWMA 3OBRA 2KI6B 4YFZA 1ABRB 2ZACA 1FAYA 1WLWA 3OGGA 3FJDA 5GZFA 2D6MA 4FPOB 1O4YA 1W6OA 2A75A 4KEJA 3EF2A 4XMIA 3VKLA 3ZXGA 3V0AA 3PG0A 2OVUA 1PZ8A 3CU1B 1F9KA 4P0KA 2X2TA 1FNZA 1C4RA 1C57A 2ZGMA 2ZKNA 4XZPA 1ISXA 3SH3A 1ISVA 4GWNA 4GOYA 1KJRA 3WO2A 4G1RA 4FP3A 3O4DA 3BRDA 3WHUA 4KEKA 2OW4A 3FJJA 3FJAA 3ATGA 4D0TA 1ZA4A 3AP9A 1Z4SA 3AZVA 1PUMB 5T5JA 4XXAA 5GJ6A 2PHUA 3Q9OA 2E4MC 2VUAA 4LBMA 1G8WA 2VW2A 4GWMA 3VKOA 1DZCA 5LK5A 1ONKB 3VT1A 4XHBA 1SACA 3R4UA 4NO4A 1PC8B 1DHKB 2NVHA 5H9RA 4R9BA 5EHAA 4YOLA 5JOXA 1SR4A 1GV9A 3IM7A 3USUB 4I6IA 3KQRA 2ZGKA 5IK4A 4AWDA 1ULGA 1APNA 3PVOA 3UD8A 3CA3A 2AREA 5E88A 3UD7A 2Z48A 3WG2A 2FHRA 3VKFC 1RITA 1AX1A 3JRRA 3N0KA 4Q9GA 3O4OA 2GNTA 2P2KA 4LO7C 3RSJA 4OEGA 1K5VA 2D6PA 1LTEA 1ILR1 4PC4A 3UJQA 5DVHA 1AXMA 1D2SA 1QMJA 3ZC8A 5DZGA 3WA1A 4YZ2A 2AGSA 1VLNA 3KMVA 2CWMA 1DQ5A 2JE7A 1GGPB 2JDZA 3BAOA 1DYPA 3A07A 2WRYA 4IHZA 4LO0C 4MYEA 3AJZA 1JTCA 1FX5A 3FJFA 2ZGRA 3QR5A 1IJTA 3UD9A 4XKIA 1JLYA 2AFGA 3NWKA 2G4IA 4FPJA 1SBFA 5F8YA 2JE9A 3POWA 1Q8SA 2ZHNA 1QDCA 4GP0A 1MZ6A 2OUHA 3BTAA 9ILBA 1GZ9A 3ENRA 3AYAA 4J2XA 4J2KA 1WUVA 1V00A 1SLCA 4FPFA 1CIWA 3Q7YA 1WBFA 2ZGNA 1J1TA 5DG1A 5H9SA 3POSA 3WOGA 3LTQA 1GSLA 1OFSA 4JPZA 4YM2A 1FMMS 4P9WA 4Q1RA 3F1RA 4ASMB 1HCEA 3BX1C 3SNVA 1M16A 2JD4A 1WBLA 2P37A 2Q9XA 3ZYPA 4QBCA 5GLZA 1V6MA 2ERFA 1MS9A 3OGFA 1QGLA 1CESA 1X50A 3B9CA 4YFWA 1FQ9A 1LHUA 2A6VA 3U4XA 4LO7B 1N1YA 1C1LA 4M3CE 1U0AA 4IZEA 4OZXA 3AZZA 4IQPA 1PWAA 2DV9A 2JKBA 1A8DA 4R9DA 4WVVA 2ZHLA 1AVBA 4IONA 2D24A 3SLIA 3WV6A 1LHOA 5AVAA 1QNWA 5BOWA 5B2HA 1G9CA 5DZFA 1ULFA 1IHKA 4Y1YA 4QALA 4Y22A 2GZBA 1YRZA 1KITA 4YZ4A 1ENQA 5DUWA 4LBQA 41BIA 3H6RA 1LESA 2DUOA 4EFQA 2K4AB 1JOJA 4P9YA 2RQ9A 1S0JA 2HYKA 4XILA 1SLTA 4HJJA 1QQKA 1SLBA 3FLPA 1CE7B 1YTOA 4I1EA 4AVTA 3DUIA 1D0HA 4Q8KA 5FNWA 4IY9A 3VKMA 2NN8A 1AXZA 3WCSA 3HMYA 2DS0A 1LOFC 1AXYA 2KM2A 2FO1A 2LTNA 2BEAA 4YW4A 2A7AA 3T1MA 1MZ5A 1UL9A 1KJLA 3A4UA 1S0LA 1IS3A 1KQRA 2AAIB 3C2UA 4AGRA 1MS0A 3WVJA 1DZQA 4I4UA 3OPZA 2CYFA 1AVWB 1K5UA 1MR5A 2NM1A 3NV4A 2VW0A 4HR6C 5IT6A 2MIBA 2DWRA 4ZFUB 1YF8B 2VXTI 2WT1A 3AP5A 3RS6A 1TWEA 1WW6A 4A7KA 1LOCA 1RG8A 6I1BA 1IOBA 3VSFA 2E7QA 1H9PA 1HWMB 3PJQA 1P63A 4DEPA 5FRAA 4LO2A 4BQ1A 4HL0A 3OJ2A 4YW5A 3PVNA 3WG3A 2A5ZA 2X2SA 3FJ8A 4JQ0A 1I1BA 3V0BA 4OEFA 2ZABA 1DQGA 4FPYA 4Q8LA 1URXA 1ISYA 3D4KA 3NBNA 2DTWA 1LGNA 4YZ5A 3WINA 3A22A 3QCWA 1XHBA 2BQPA 5BQUA 4Y1UA 2HZ9A 4JCKA 5DUXA 1ENSA 4LBLA 1JHNA 2A6WA 1ENRA 1H9WA 2ZZJA 1BKZA 4XDQA 1QF3A 1GLHA 4EB2B 3CRGA 1LENA 4CRQA 2CY6A 1AFCA 1S0EA 1FNYA 3OYWA 4I4OA 1H30A 4JAWA 1BA7A 1AZDA 4FOQA 3R05A 5KXDA 1HQWA 2EIGA 3AYDA 1JT3A 2A3XA 3NV2A 3RTIB 4I4RA 4NOTA 3POKA 3BRFA 4PBPA 1QKQA 3BAQA 3WO4A 2DVGA 1WBCA 4XBNA 4LO3A 3VT2A 1S0FA 4J2SA 1JUIA 4ZA3B 1HQLA 4USPA 4XMAA 2VXRA 5GZGA 1BASA 2DVFA 3CA0A 4LO8B 1SFYA 4I37A 1UAIA 2GMEA 1WW4A 3ILNA 4XBLA 4RA0A 1JXNA 3BAHA 3RQ0A 4XTPA 2ZGOA 4FOVA 3ZX7A 4EEEB 5KXBA 2DREA 3WG4A 3OY8A 1LOGA 2BFHA 4X3AA 4Y20B 3BOPA 1W3GA 5JLVA 4LBKA 3OJVA 1FWUA 1FYUA 2E53A 3PHZA 4UW6A 4FGFA 4Y1XA 2MLLB 4BLIA 1DLLA 4HANA 4XXPA 2WQZC 2A70A 2GNDA 5T50A 3MW2A 1M2TB 2QN4A 3L2YA 1V6IA 1N3PA 4I2SA 4R9AA 3VUOA 1N4KA 4OEEA 3RMYA 4GA9A 2PELA 2I2SA 1S0DA 2E51A 3O0WA 4XIKA 3V0AB 2B7YA 4OWLA 3UL2A 1DBNA 1R8OA 3FJCA 2RHPA 5DXDA 1OQ1A 1FN0A 3HN1A 3WUCA 4ZOTA 4FPCA 1UZYA 2YV8A 4RL7A 3UJOA 3S8KA 4R6UB 2A6ZA 1JT4A 3HR9A 3M3CA 1ITBA 1HWNB 2IHOA 2R49A 3POYA 3IM0A 2DUPA 2KLLA 3UJ4A 3FFZA 1N1VA 1MS4A 4XJ8A 1YBIA 2DUQA 3WHTA 1TTUA 3ILRA 2Y9FA 3V64A 1JYIA 2P39A 4JC1A 5EG6C 5CA6A 1CJPA 4I4XA 3AP4A 5FREA 2GNBA 2XG3A 3BRGC 4WV8A 4JRAA 2E6VA 3SH4A 3FGMA 3ZYRA 1V6OA 3GNEA 2W08A 3WDXA 1UX6A 2R16A 4LO1C 3Q7XA 4XIOA 2R0FA 4R9CA 2D23A 3FJHA 5GAQA 3ZXJA 4IY8A 3I29B 3VKNA 2DVDA 1HDKA 2A3YA 4F83A 1BXHA 2DVBA 2Y9XE 2SBAA 1RMLA 1C1FA 5EXOA 3K1XA 2EAKA 3WZ1A 2D43A 5IK8A 1TP0A 1OQLB 2HWAA 3USUA 1I3HA 4AN7B 3W59A 4F34A 1GNHA 4ISRA 3HOMA 1WD3A 2ENRA 3QYDA 2AQZA 1YO8A 4D69A 1BFBA 1AJKA 4G9NA 4JKQA 1YIFA 3OJMA 3AH2A 5CB7A 5BXTA 3AJYA 4YGDA 1WBAA 4X37A 2NZ9A 3IPVB 1IKQA 3D5OA 4ZXKA 2A71A 1GNZA 4XFTA 3ZXEA 2W68A 3WO3A 1ISWA 1EPWA 5GLVA 4JP0A 1W6PA 1JN2P 2W39A 5KXCA 4ZFYB 1G9BA 4Y24A 3H6QA 3JU9A 2WJSA 1V6KA 1VAMA 3AK0A 3N7KA 1ULEA 4C1XA 3CA5A 2UWCA 2ESUA 1LOAA 2M49A 4DFSA 2ARXA 2E4MA 2GN3A 1YI7A 2PHTA 2BEBA 3W58A 5H9QA 3ASIA 1GZCA 3OBTA 2RG9B 4M3CB 4YG0A 2GNMA 1JY0A 1SCRA 5T5OA 4I4QA 3M3EA 3ZVXA 3I8TA 4G9MA 4ISQA 1MS1A 3AP6A 1N1SA 1GBGA 1DQ6A 3MW3A 4AVSA 1BFFA 2Z49A 4FQ4A 2D3PA 4FP2A 2SLIA 4Y26A 3VWCA 1L2HA 4UW3A 1CONA 2WSVA 3UK9A 5BP5C 2WLQA 2ZHKA 1MVEA 5DUUA 2A6YA 3ZXFA 2F2FC 5HPZA 2EXKA 4Q91A 1W6QA 1W6MB 5F9TA 2YUGA 2UWBA 4OUJA 2UUSA 3I2AA 1AX2A 4GKYA 1NXD1 5E8AA 4IYBA 4GXLA 4YG3A 4QD2C 1PZZA 4XHXA 2RSTA 1LGCA 1BFGA 2EXIA 3V79C 1SBEA 3H6RB 2ARBA 3N35A 4YW3A 2C5DA 3ILAA 4Z8SB 5L73A 4LO0A 1G9FA 3HBWA 1DZDA 3RG0A 5T5PA 2P3JA 3BIWE 5HCBA 1SCSA 4G6JA 5F8WA 4FPGA 2R1DA 2YXSA 5IK7A 2FDBM 2WT0A 3WDTA 3O12A 1IS5A 4YZ3A 2WBCA 1MD6A 3SITA 2UWAA 2ZGUA 2UU8A 1NZKA 2EXJA 1TEIA 4GALA 2GN7A 1PUUB 1JBCA 3CNAA 4GP3A 1R8NA 2DURA 3LCPA 4I30A 3PUBA 3IIRA 3V65A 3INAA 5CNAA 8I1BA 3WDYA 1DIWA 1EV2A 4CJMA 2R0HA 3WDVA 4P6AA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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