3R4SA

Cell entry of botulinum neurotoxin type c is dependent upon interaction with two ganglioside molecules
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
428
structure length
424
Chain Sequence
SMANINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTGDSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
publication title The biological activity of botulinum neurotoxin type C is dependent upon novel types of ganglioside binding sites.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
total genus 94
structure length 424
sequence length 428
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3r4sA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3r4sA02
4KEJA 3ZC8A 3UD9A 2WSVA 2VLCA 2FFUA 1JT5A 1WLCA 4LO0A 1CN1A 4OZXA 5JOYA 1BLAA 3NWKA 1NUNA 3BAQA 5IUQA 3CAHA 4L4IA 1UMZA 4JKQA 4YW3A 4I4UA 1G8WA 5T5JA 1RMLA 1TWMA 1H30A 1HWMB 1KDKA 2F2FC 3M3QA 2GO2A 4YOLA 1OQ1A 3WV6A 1V6VA 4D0ZA 5D63A 2BEAA 4XFSA 1FX5A 2DUPA 1ONAA 4D69A 1Q03A 2ZA9A 1RG8A 1KRIA 2OUHA 1SR4C 3AP6A 3A07A 1VIWB 1FMMS 1DBNA 4Y20A 3SLIA 3OYWB 3AYAA 5EYXA 2Y9FA 1JN2P 3FUOA 3BA5A 5CNAA 1LEMA 4LO1C 4BLIA 4HL0A 3AKGA 2PHUA 3VSZA 3EF2A 1QOSA 1V6LA 1ILR1 5BVPI 2RSTA 4XJUA 1W0OA 2IWTB 2P2KA 4CZSA 3BAHA 4I8MA 1T9FA 1W6QB 2E7TA 3VEQA 4DS0A 4UW5A 4AN6A 1FAYA 4IQPA 3BAVA 3AZWA 1KDMA 4XJWA 1WW7A 3JRRA 2HYKA 5G00A 4M3CB 1ISWA 3AZYA 3OJBA 1MS8A 4W65A 1S0GA 4OUJA 3HOMA 4YG6A 1QXMA 1LOGA 4GKXA 3I8TA 3O12A 3AP4A 1W6NA 4USOA 1AFCA 2D23A 3AKFA 1LULA 1SBDA 4HANA 2DWRA 5T5OA 3I2XA 3FJBA 1EV2A 1WBFA 1PZ8A 3WMVA 4QKRA 5JOXA 3CQAA 1ISXA 3FJKA 1Q56A 2R49A 2WT1A 3SNMA 5IT6A 4YM1A 2A3XA 1JY0A 4UW4A 3MW2A 2R0FA 1LOBA 5FNWA 1UX6A 4X3AA 1SBEA 3WO4A 1LJ7A 2ES3A 4I0YA 3O44A 3ZSJA 2DVBA 4HJJA 4J2YA 4QALA 3PMEA 5F8WA 3AJYA 5E8AA 2ZMKA 2YROA 3AYDA 2DUQA 4ZLBB 4Z8SB 4RA0A 1MC9A 4YGEA 2NTDA 2ERFA 1DFCA 3VWCA 1GV9A 1N47A 3C2UA 3K1XA 4AN7B 1C4RA 1I3HA 1HQWA 2FO1A 1IKQA 4A7ZA 2KM2A 3FLRA 4I1BA 1V00A 2D6MA 1LODA 1G9AA 2RG9B 5IK5A 1CPMA 2A6WA 2W68A 3WO3A 3ZYRA 1TP0A 3KMVA 1II4A 1LEDA 3UJQA 1QQKA 2DTYA 5EC5A 1FQ9A 2GMEA 4R9AA 1GICA 2G4IA 1QDCA 5EHAA 4Q9GA 2UWCA 3A0NA 1TTUA 2DTWA 1FATA 2WJSA 1UAIA 4XIKA 1G86A 2V5YA 1WBAA 3OPZA 3VUOA 1UZZA 4ITCA 1KJRA 1ENRA 4J23B 3F62B 1BZWA 4XXPA 2YV8A 1MS9A 4WVVA 5HPZA 5BXRA 4YW5A 2A6YA 4A7KA 2V73A 1SZ6B 2D20A 4FPCA 4ZFYB 5GALA 2DVAA 1AVXB 3IM6A 3PJQA 3M3CA 2P3IA 4YW1A 4Y20B 3AJ6A 3FLTA 4C1WA 1X50A 2DV9A 4GWNA 4ZBVB 4DCKC 2QN4A 2BQPA 3AXDA 3O5WB 1QNYA 4XJ8A 1BFGA 3WUDA 5GLWA 1AXYA 1N3OA 6I1BA 1UZYA 3ILFA 3T2TA 2FHRA 3E8LC 5F5QA 2PHXA 3H6RA 4XKIA 3AH4A 5DZUA 3TC2A 4I4VA 1H9PA 5FNXA 2ZGMA 3BAOA 3L2YA 4PCRA 2D22A 4P9XA 3BODA 5F8YA 1DQ2A 4LO8B 2JE7A 1JXNA 2VUAA 1GLHA 4XJZA 4I4SA 3AP7A 2ZHMA 2P3KA 1LU1A 1MZ5A 3Q7WA 1JYCA 1BYHA 3AK0A 1FWVA 2ZHKA 2VY0A 1HCEA 4YZ5A 1W3FA 2P23A 1W6NB 3W58A 2EAKA 4LBKA 3WG4A 4PC4A 1MS0A 5HCFA 2F8XC 3CA6A 1VAVA 4FOWA 2YZ4A 3CRHA 3SITA 2AAIB 2ZGPA 3M2MA 4XYXA 3IM0A 4GWMA 1QF3A 4LO3C 1ENQA 1J0SA 1AVWB 4JQ0A 1JTCA 1SLLA 2UURA 1F31A 2E4MA 2OVUA 3VT2A 4AGVA 4FP2A 3NV3A 3WLUA 3CRGA 1Q8OA 2OUJA 1XYFA 3RQ0A 1NXD1 1APNA 1YXWA 4P14A 2AXMA 1DGLA 4XHBA 4WZFA 1W6PA 2OW4A 4I37A 2CNAA 1ENSA 3ATGA 2D6LX 1W3GA 1GZWA 2A71A 3TB0A 1W3AA 3MALA 2PHTA 3BRFA 3SNVA 2NZ9A 1CQ9A 2CTVA 4XJ9A 2LIEA 2ZGRA 1BQPA 3VKOA 5JMCA 1FV3A 3FJDA 4YZ2A 4L8QA 1VCLA 4AVVA 5FZUA 1HWOB 1C1LA 5T54A 1PUUB 1CVNA 1AF9A 5DG1A 1FYUA 3NBCA 3MPPG 2AYHA 5DVHA 3O4DA 1LU2A 3BRGC 3VKNA 1S0BA 2DVDA 1NLSA 5JOWA 4XIOA 4PBOA 4BLJA 4XJAA 1LTEA 5KXEA 1ABRB 4PQ9A 4WBCA 3O0VA 5GJ6A 3FFZA 5EYYA 4J2SA 4JAWA 3FUQA 5DUYA 1LOAA 4H9WA 3W59A 4X39A 4QKSA 3FJHA 1VLNA 2JECA 2ZGTA 2L5XA 1QKQA 1IS5A 2ZGLA 1D0HA 1UN1A 4ZKTB 3O5SA 1SCRA 2KLLA 1HQLA 21BIA 4XE9A 4P0LA 3RMXA 3SH3A 2ZQNA 1CVSA 2AR6A 3BA7A 1S0DA 1RITA 4FP3A 3ENRA 4BM8A 3N7JA 4YZ4A 1ULCA 2XB6C 2A3YA 4G6MA 4YG3A 3CA3A 1DHKB 4OEGA 2KKIA 4EB2B 4AVTA 4Z9WB 3N3HA 2ZGNA 4LO0C 4P0KA 3O49A 1DZQA 3KM5A 2A6VA 5F9TA 5T50A 3H6RB 1YBIA 2WBCA 4BMEA 3APBA 1TEIA 3LSDA 4YG0A 1JOJA 1DLLA 1DQOA 2WLQA 1BFBA 2WSUA 4R9CA 1V6IA 3N7KA 4DQAA 1YTOA 2JE9A 4QC4A 2HWMA 5GZFA 4G9NA 3BADA 1OQLB 3SISA 1ISVA 4YM0A 4FGFA 3USUB 3UD7A 4QD2B 1SLBA 4ISQA 3A21A 1W6OA 4IZEA 4GAFA 1DZCA 4Q1RA 1V6OA 3UK9A 1QMJA 1MS3A 3POSA 3OGGA 3WDTA 4JKXB 1D2SA 4YFWA 5SV8A 1QU0A 1N1VA 4GA9A 2GNMA 4TYSA 3VT1A 3ZSLA 1IKPA 4BPZA 3O4OA 1HDKA 4M3CE 4R6UB 3RSJA 2WQZC 3H0OA 3AH1A 1GYKA 3P6JA 5KXDA 1DQ4A 4F83A 1WLDA 3ILNA 4YZ3A 1BARA 3MW3A 3HBWA 4UW3A 5BP5C 1ULFA 3PVNA 1W6PB 4GKYA 1JLYA 1GZWB 5DZGA 1LESA 1MD6A 5HCAA 3O4CA 4YGDA 2A70A 5D62A 1WD3A 2NMNA 5BYNA 5DUXA 4ENDA 3WCRA 1IS4A 4Q9PA 5DZFA 4AGRA 3POWA 1Q8QA 4I4XA 3RRDA 1GNHA 4NO4A 3I2AA 4Y24A 3O0XA 2YUGA 1Q1UA 5F8SA 4ISRA 3WDUA 2AREA 1S0FA 4XTPA 1F9KA 3AJ5A 4I96A 4LBQD 1Q8SA 4ZOTA 1MS5A 1JQZA 4SLIA 2Z42A 3T1LA 3ILRA 1E0OA 1V6JA 2RQ9A 1R1ZA 1KJLA 4I3NA 1JLXA 3W9TA 5DUUA 4Y1UA 3SH5A 2I1BA 2SLIA 1WW4A 3S8KA 2Y9WC 5BOWA 4LO2A 2ZHLA 4Q8KA 1AXZA 4YW4A 1ISYA 5H9PA 5FZZA 5GLVA 4XDQA 1N1YA 1Z0HA 5EWSA 3V0BA 2R1DA 3NBEA 4K1YA 1KITA 1WUVA 3GNEA 2KI4A 4D0TA 4DFSA 1LHOA 2XG3A 1TFMB 1VALA 2UU8A 2ZACA 1BKZA 1N3QA 1Z78A 2Z48A 1PWAA 3O4BA 2EIGA 1R8OA 3P53A 5DZEA 4FVVA 4Z8BA 1QDOA 2NYYA 3N36A 1C1FA 1B09A 1UL9A 3WMUA 5GLTA 1YYNA 2D7IA 1WD4A 2ZR1B 1K5UA 2DU1A 4CRQA 5EXOA 1GKBA 1JYIA 1RZOB 2GZBA 3ZXKA 3VKLA 4FOYA 1JT7A 1KQRA 1HIBA 3NV1A 1AX1A 1R8NA 1PZ9A 2MIBA 5BQUC 3IM7A 3ZXDA 3OJVA 2ESUA 1VAMA 1NZKA 9ILBA 2PHFA 2AGSA 4FPOB 1Q8PA 2E6VA 2UWAA 4XTMA 2GALA 4X37A 3C9ZA 3CRIA 3WDWA 3QR5A 3RTJB 2D1ZA 5FREA 1DQ5A 3WG2A 4CTEA 4BQ1A 2LTNA 4FQZA 3V79C 4DEPA 1W6OB 1FWUA 3FJ8A 1ULEA 2TEPA 3RG0A 1GZCA 2PHWA 4LBLA 2VW1A 4FQ4A 3ZYPA 4I6IA 3LTQA 3BIWE 1N3PA 1WW6A 3IAGC 2ZGUA 1V6WA 2CL2A 2CWMA 3MW4A 5BXTA 4J2XA 1XZZA 1HKNA 4OWLA 2C9AA 5KXCA 4PF5A 3A0KA 1BASA 2VXTI 4XILA 1Z2VA 1GANA 3NJ5A 3UD8A 2HW9A 3N7MA 1C57A 3PUBA 2MC2A 1PUMB 4FOQA 1DQ6A 1UKGA 1LGBA 1LHWA 1UPSA 2D3RA 4YM2A 1DYPA 2D7RA 4I4YA 4JRAA 4QD2C 2PELA 5DUVA 1FV2A 4GXLA 2ZABA 1QNWA 1PZZA 4LO7B 1DQ1A 4LBMA 3USUA 1I1BA 5DG2A 1V6KA 1DJSB 2MLLB 1IILA 4DRRA 3FLPA 5GLZA 2RHPA 2D6OX 3WNXA 4XXAA 3SH4A 3CU1B 2E4MC 3VSFA 3WINA 2M49A 3V64A 1CIWA 2DREA 2NN8A 1BLDA 2I2SA 1M16A 1GSLA 2D6KA 2BEBA 5D61A 2A75A 4X38A 3LSEA 4KEIA 3RTIB 2AFGA 4BOWA 1URXA 3WDYA 2AENA 3ZVXA 2A6ZA 4F34A 1XQNA 2R9KB 3M3EA 2UUSA 1S0IA 4QBCA 2ZKNA 1ZM1A 3BX1C 2A7AA 3ZXGA 3WHUA 1F5FA 4ASMB 2E51A 1JT4A 2D44A 3IPVA 3I29B 5JLVA 3A4UA 3AZZA 4YLZA 4GALA 4C1XA 2ZMNA 1O4YA 4Y22A 1HCDA 5JVVA 4EFQA 4XHXA 1FNZA 2DVFA 3ZXLA 4GP3A 1Q8VA 3V0BB 2YY1A 1FGAA 2P3JA 4Y26A 4XFUA 4I2SA 3Q7YA 1S0JA 3FJFA 2WNEA 1T4QA 4GAIA 1LGCA 2Y9XE 2JJ6A 5CBLA 1S0LA 1HWPB 2K4AB 3HSMA 4XMIA 3ZPYA 1GGPB 1JHNA 3VKFC 4IZXA 4P0JA 3R4SA 3HR9A 1YIFA 2D43A 3WG3A 4Q27A 1N4KA 3LLPA 1WBCA 2DS0A 4I4RA 3A23A 3HALA 2AUYA 2D24A 2DRZA 3QLQA 3NV4A 4M00A 1V6XA 1GBGA 2NVHA 4M3CF 3PVEA 2VW2A 1PZ7A 3AJZA 4EFPA 1AZDA 1DIWA 3AKIA 4XBNA 3AYEA 1HKDA 3M1HA 3A22A 4G6JA 2DRYA 3B3QE 3H6QA 1SBFA 4EKXB 3VKMA 3F1RA 5CA6A 4MYEA 2W39A 4Q1PA 2C5DA 3OJ2A 3UL2A 1PC8B 4I30A 3HMYA 4L4HA 5L73A 2P37A 3WDVA 2BFHA 3N0KA 3D6EA 3AP9A 4HR6C 4DPNA 2R1BA 3UJ0A 1TIEA 5T5PA 3BRDA 3FBYA 1IJTA 4DRVA 5HCBA 1GNZA 3BAUA 4FOVA 3AYCA 4TLPA 3WVJA 4Y1ZA 2B7YA 3JUUA 1QOTA 3ZXJA 2PHRA 4CJMA 3POYA 5FRAA 4AWDA 2A5ZA 4K21A 2FGFA 2HZ9A 1G7YA 1LOFA 1G9FA 4AGGA 2AH2A 1BFCA 5DUWA 4YGBA 3ZC9A 4XOGA 1ULGA 2KH2A 1MVEA 5AVAA 2JDZA 4NOTA 1SLCA 3JUTA 3BTAA 4I4QA 1W6MA 4FPYA 2ZGOA 5E88A 4OWKA 4I4OA 5IK4A 1K5VA 4FPGA 2F2FA 3B01A 1KNMA 5DSSB 1QOOA 3CNAA 4FPLA 4H55A 3R05A 3WO2A 3AX4A 1A3KA 1MS1A 3TAYA 1SR4A 1JUIA 3UDAA 1CONA 4Q2FA 4RL7A 3P6IA 5IK7A 4XFTA 4ZXKA 3RMYA 1V6NA 2EF6A 4ZGRB 1RIRA 4LO1A 1LHUA 4OEFA 3IM5A 4ZA3B 3IN9A 1W0PA 5KXBA 2FFVA 1G9DA 2ENRA 3IPVB 3V65A 1LCLA 4P9WA 5DXDA 4AYUA 1EVTA 2D6PA 5H9QA 2DU0A 4LO7C 3OY8A 1IT0A 2VSEA 4OW4A 4I7IA 4Y22B 1YI7A 3WOGA 1GZ9A 3CA1A 3S8JA 2ZBJA 2CYFA 2D7FA 1ISZA 2GMPA 3PHZA 2KI6B 1Y7BA 3V0AA 4WVWA 5I1BA 4DENA 1FN0A 4U36A 5BP5A 2GN7A 1Q04A 4FPEA 3WCSA 1IS6A 5GZGA 2ARXA 4QO3A 2D3PA 5B2HA 5BXSA 3WA1A 1S0EA 1G9BA 4HA2A 2EALA 3NBDA 41BIA 2FDBM 2LIQA 3BB2A 4YW2A 4AVSA 3CA0A 3B9UA 4Y1VA 1IRAX 3B69A 5F90A 1IS3A 3O4AA 2VU9A 3MEPA 1DFQA 3ZX7A 4LO2C 3POKA 1ITBA 4I4PA 2GDFA 5E24E 3OGFA 4TZDA 1DZDA 3FJEA 1V6MA 2WT0A 2D3SA 2GN3A 4WV8A 2ZGKA 5LK5A 3M3OA 4ZFWB 4Q26A 3N7LA 2VH9A 3QCWA 5T52A 4FPJA 4LBJA 4K1ZA 4I1EA 4IHZA 2QYIB 4H04A 1DQ0A 1ONKB 2CY6A 2E7QA 4YM3A 2ZGQA 1S1AA 2Y9GA 3FJJA 3PVOA 1BJQA 2ERMA 2NM1A 3ZSKA 4EFRA 5GZCA 2D6NA 3AH2A 2SBAA 2W52A 1YF8B 3OJMA 3IIRA 4OEEA 4R9DA 4IY9A 1Z4SA 4J2KA 3D5OA 3FJCA 4JCKA 4Q8LA 3FJIA 4IY8A 5GLUA 1SLTA 5H9RA 2Q3NB 1AVAC 3NBNA 2K43A 1RINA 5E89A 1DYKA 1YO8A 3AZXA 1A78A 1FNYA 1OFSA 1BA7A 1WBLA 2ZGSA 1LGNA 1N1TA 3RS6A 4XMAA 1W6MB 2JKBA 1LHNA 3BOPA 1BXHA 1I1EA 2DYCA 3INAA 1U0AA 4XBLA 4EEEB 1P63A 3IKWA 5BQUA 1MZ6A 1SLIA 5FZYA 1ZA4A 1MACA 3PG0A 3Q9OA 4LBQA 4IONA 1AXKA 1AVBA 1FMZA 3R4UA 3ZXFA 4ATEA 1AVUA 1AXMA 2Q9XA 3ASIA 5H9SA 1SCSA 1DQGA 3O0WA 1LHVA 4G1RA 1EYLA 3O3QA 1TOOA 3AFKA 4LBOA 3AP5A 4JC1A 4Q91A 2Z49A 3FJAA 2ARBA 1LECA 4QBVA 1WCSA 2VXRA 3FJ9A 3OY8B 2GMMA 1AX2A 1AX0A 1ULDA 3AKHA 3BAGA 3D4KA 4G9MA 2WT2A 1N1SA 2WKKA 5IK8A 1SLAA 3WHTA 3CA4A 3QYDA 31BIA 1CE7B 3T8SA 3WINC 8I1BA 3AZVA 3V0AB 1JT3A 2DVGA 1LOCA 2J3PA 2NMOA 3FGMA 7I1BA 3DUIA 4YFZA 3H6SE 3OYWA 1L2HA 1IOAA 4ATFA 1AJKA 3GALA 1CPNA 5T5LA 5BXPA 3OBRA 1IOBA 2DUOA 3I4IA 4PBPA 3ILAA 2ZMLA 2EXIA 1LOEA 4D8HA 5EG6C 4LBNA 2EXHA 4BMBA 4P6AA 4FPFA 3KQRA 4XBQA 2VSAA 2X2TA 2JD4A 2LALA 2AQZA 3CA5A 3UJ4A 2K8RA 2UWBA 3WZ1A 1G82A 1IHKA 1XG6A 4LO3A 4GOVA 5CAZA 1TWEA 2R16A 1W6QA 4FPHA 4JP0A 1YRZA 1XHBA 1OKQA 1RY7A 4Y1YA 4A7YA 4U2AA 2H0BA 2A3WA 3ZXEA 1QQLA 1A8DA 2EXKA 3U4XA 4M3CA 5GM0A 2EXJA 4ZFUB 2HWAA 4YZ1A 3JU9A 3B9CA 3BA4A 3D7WB 1CESA 3VT0A 3B00A 5GZDA 2IHOA 4OWJA 2A6XA 2DURA 2ZZJA 4UW6A 1V6UA 1SACA 1G9CA 5JDBA 2ET2A 2YXSA 1QGLA 3AXEA 3WDXA 4FPKA 4KBBA 2P34A 2P39A 1H9WA 4KC3A 4IYBA 2W08A 2E53A 5T55A 1MR5A 3N35A 5CB7A 4USPA 4YGCA 5GZEA 3NV2A 1S0CA 4K20A 3WUCA 2X2SA 1MS4A 3T1MA 1CJPA 1J1TA 2CWSA 3LCPA 4P9YA 2ZQOA 1AJOA 2YMZA 4GOYA 1MVQA 1WLWA 3Q7XA 1CR7A 1HWNB 5GAQA 2R0HA 3DGTA 2ZHNA 2GNTA 2XOAA 4JPZA 3OBTA 1BFFA 1IRPA 2NP0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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