3R4SA

Cell entry of botulinum neurotoxin type c is dependent upon interaction with two ganglioside molecules
Total Genus 94

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
428
structure length
424
Chain Sequence
SMANINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTGDSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
publication title The biological activity of botulinum neurotoxin type C is dependent upon novel types of ganglioside binding sites.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
total genus 94
structure length 424
sequence length 428
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3r4sA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3r4sA02
3ZXKA 3RS6A 2Z48A 4OUJA 2JDZA 4XBNA 1AVUA 3I2AA 4YM3A 2D24A 4K21A 4I7IA 4P14A 4C1XA 1Q1UA 4UW6A 4Q1RA 4G9MA 2ZQOA 1G7YA 4F34A 1M2TB 3HR9A 4U2AA 1LU2A 3ILAA 2VW1A 5KXBA 5DUUA 5EWSA 4ATFA 1FQ9A 1T4QA 2F2FC 4IONA 5T54A 3ZSLA 1DQ1A 3BAVA 4FPKA 1WLCA 8I1BA 5JOWA 2D3PA 3AH1A 1GANA 4ZBVB 1JT5A 1G9BA 1LHWA 2AENA 2B7YA 1LOGA 1JQZA 1NZKA 2LIQA 1W6MB 1AX0A 4PCRA 9ILBA 5FREA 1FMZA 4LO3C 5B2HA 3HMYA 2DWRA 1SLTA 3FJ8A 3POSA 1PUUB 3B9UA 1KNMA 1HWNB 2RHPA 5EXOA 2L5XA 3JU9A 3O4CA 4F83A 2J3PA 3OY8A 4I30A 5T5OA 3VKOA 2D6MA 4RL7A 3HSMA 1SBEA 3AP6A 2D7FA 2GN7A 1YRZA 1WLDA 2VW2A 3B69A 4P9YA 2GNTA 1SR4A 4R9AA 2FFVA 1HLCA 2DRYA 3CU1B 5HPZA 1TTUA 2DUPA 3ZC8A 5IT6A 3D6EA 1PZ7A 1HKDA 1GYKA 2ZGSA 4P0JA 2X2SA 2E53A 5H9SA 3OPZA 4D8HA 1BA7A 3SLIA 4LBQA 1KQRA 1RZOB 1S1AA 2ZMNA 5F8YA 1JW6A 1V6UA 1DJSB 5JOYA 1LENA 3BOPA 1OFSA 4USOA 2HWMA 1FV2A 2MLLB 1TEIA 2DV9A 3IMNA 1C4RA 4X3AA 2VY0A 4I0YA 4FPJA 1S0JA 2DRZA 2KM2A 3ZXJA 1PZZA 3I8TA 5BP5A 2WNEA 2RSTA 4NO4A 2A6WA 3VKMA 5JLVA 4OW4A 2KH2A 4K20A 4Y1ZA 2MIBA 4XJAA 4QBVA 4JPZA 4KC3A 3ZYPA 2ZGTA 2C5DA 1DYPA 4D0ZA 1LHOA 3BAHA 1DZDA 3FFZA 4EFRA 4D0TA 3ZX7A 3F62B 3SNMA 2VLCA 4I4RA 4FOQA 4BPZA 2D7RA 2AH2A 2ERMA 1W6NA 1MZ6A 4HL0A 1ITBA 1LEDA 1APNA 1ISZA 3NV3A 1LESA 4IYBA 1JN2P 1NXD1 2ERFA 1C57A 3CA0A 1H30A 1Q56A 1VALA 4IZXA 2NMNA 3H0OA 4Q27A 5CA6A 2WKKA 1W6MA 3BA4A 1S0FA 4I3NA 3IM6A 3Q7WA 4IQPA 2BEAA 3C9ZA 5DUVA 5EG6C 2E4MA 4U36A 3OJ2A 1UMZA 4I4OA 2PHUA 4LBOA 4AYUA 3BAQA 4XFTA 4XJ8A 2D7IA 3BRDA 2DTWA 1V6KA 1IHKA 4FQ4A 2JJ6A 3WO2A 1AXKA 3KQRA 1SCRA 2D1ZA 3SISA 2DUQA 1WBAA 4OZXA 3S8JA 4QD2C 3AJYA 3FJDA 2OUJA 3C2UA 3FJFA 1PZ8A 3M3EA 3CA5A 2A6XA 2WT0A 4YW2A 3RRDA 2NM1A 1QKQA 1DQ5A 1QQLA 1TWMA 2EXHA 3OBTA 3WO3A 3WO4A 4DFSA 1IJTA 2FGFA 1Q8QA 2WBCA 3UDAA 5T5JA 1ENRA 4I4XA 2HWAA 3A4UA 4XDQA 4M01A 4PQ9A 1MD6A 5HCAA 1IRPA 2D6OX 2IWTB 5DZEA 2GMPA 3W9TA 1VIWB 4AN6A 3L2YA 1RIRA 3ZSMA 4Y22B 1Q04A 4ZLBB 5DG1A 3CAHA 3N36A 2Z42A 1T9FA 4LBKA 1RINA 4AVVA 1TWEA 4LBQD 1DQ6A 3VSZA 4XJWA 1S0DA 4FPLA 4P6AA 4YW5A 4HR6C 3ZXGA 1QOTA 2DU0A 1K5UA 2WT1A 3ILNA 4OWJA 4ITCA 4LO1C 1XG6A 2PHTA 3WDWA 4II0A 5D62A 1MR5A 3CA1A 3Q7XA 4Y20B 2JE7A 3IM7A 2ZACA 5BQUC 4I4UA 3VKNA 3VSFA 3WCRA 1RITA 5FZZA 2QYIB 1ULCA 3B9CA 2EXKA 1IS6A 2YY1A 1EPWA 2ZMKA 4ASMB 1N4KA 3IM5A 3ZC9A 3KMVA 4L4HA 2EF6A 5SV8A 1FATA 5T5LA 3K1XA 3BAUA 4KEKA 3NBCA 1V6JA 4BMEA 2AXMA 1KRIA 4YLZA 3ILRA 1LHNA 41BIA 4I4VA 1FMMS 3M3CA 4Z8SB 3ZXFA 2P39A 3SH4A 3GALA 3BTAA 4CZSA 2VU9A 4Y1XA 4XYXA 5T55A 4GP0A 3OBRA 1XZZA 1ABRB 5DUYA 2WSVA 5D63A 3O4OA 4GALA 1ULEA 3PMEA 3ILFA 3AZVA 1A8DA 1SLIA 3WHUA 1YF8B 3VKFC 4DRRA 1NLSA 1JOJA 4L4IA 2XOAA 4AGRA 3CQAA 3AYCA 4YG6A 4ZGRB 1F9KA 2EAKA 4IHZA 1DBNA 2CYFA 1URXA 2PHXA 4I6IA 1W3FA 4YGEA 4FPCA 4J2KA 4QALA 4USPA 4Y1UA 2GO2A 1G9FA 3O3QA 5IK8A 5E8AA 1LOFA 1F31A 3AP5A 3IM0A 3FUQA 3AKGA 4GKYA 3S8KA 4JC1A 2D6KA 3ZSKA 4WVVA 3AXDA 1CE7B 5DZGA 5JVVA 2LTNA 1EVTA 3TAYA 4Y22A 5T5PA 1AVAC 1YI7A 3ZXLA 2ZABA 3PHZA 3M3OA 4LBQB 2A6VA 2JE9A 1JT7A 1YYNA 3VT1A 2CWSA 3AYAA 1IS5A 3BAOA 4PF5A 4G6JA 2E7TA 2YXSA 1FAYA 3V0BB 1KITA 4YZ4A 3UD9A 3O44A 4A7YA 3FLPA 4IY8A 3M2MA 1WW6A 3JUUA 1ILR1 2D6LX 4Y20A 21BIA 4JP0A 1QOOA 2GN3A 4R9CA 4EB2B 4M00A 1IS4A 4XJ9A 5KXEA 2A7AA 4I4QA 3FJ9A 2MC2A 2ZGUA 4EEEB 2LALA 2D6NA 1AX2A 1IOAA 1W0OA 1GKBA 1W6NB 3WLUA 1OQLB 1LGNA 3AK0A 1G9CA 5FZYA 3WDVA 3BRFA 1H9PA 2D44A 5IK5A 1IOBA 1FN0A 5H9RA 2VXRA 1HWPB 2WRYA 2BFHA 5CAZA 3UJQA 3WHTA 1GZ9A 1HIBA 2AGSA 1WW4A 2G4IA 2DU1A 5GLVA 3V0AB 3PVOA 1N47A 4XMIA 4ZA3B 3RMYA 2M49A 4JRAA 4AVTA 2CWMA 1IILA 2AUYA 5F5QA 4P0KA 2P23A 3I2XA 4QKSA 1W6QB 4XBLA 1BJQA 4GOYA 4LO7B 1E0OA 4YM1A 1V6VA 1UZZA 1SACA 2KLLA 1DQGA 5GLWA 1TOOA 5FZUA 2FDBM 3P6IA 1AVBA 5JOZA 1V6LA 1CESA 2Q9XA 4ZFYB 4XMAA 3AYDA 1KJRA 2HYKA 1LOFC 3SH5A 2Z49A 3MW4A 1S0EA 3T8SA 3Q9OA 1I1BA 2DREA 4YW3A 4X37A 2EALA 3HBWA 3CRIA 3ZSJA 4DQAA 4HA2A 1S0IA 2OVUA 3V0BA 3WNXA 1IT0A 3LTQA 3OJBA 4XKIA 3A21A 5H9PA 4CTEA 1GLHA 2ZGLA 1N3QA 5E24E 4MYEA 4OEEA 1WD4A 1L2HA 3I4IA 2ZGNA 1A3KA 2RQ9A 4YZ3A 1LGCA 5T52A 3UL2A 1GSLA 4FVVA 2ZHNA 1LOAA 4SLIA 5T50A 3POWA 4FPFA 1IS3A 1Z4SA 4DENA 1LULA 1LJ7A 1DFCA 4TLPA 1HWOB 1V6NA 2ZR1B 3WG1A 2AAIB 3UD8A 2Q3NB 2EXIA 4LBLA 5E89A 2X2TA 1BKZA 1YIFA 2A3WA 2W08A 1AJOA 2LIEA 5DG2A 3UJ4A 4YM0A 1CPNA 4OWKA 4I4PA 3POYA 4XTMA 1DIWA 4BMBA 3VT2A 2P37A 3RG0A 4H9WA 3WINA 1W0PA 3WZ1A 5BYNA 5GZDA 3V0AA 3AZYA 4OEFA 2UWCA 3LSDA 5EC5A 2DVGA 1QMJA 4PBOA 3RTIB 2TEPA 4KEJA 1B09A 1JYCA 3M3QA 4R9DA 1AFCA 1JTCA 1M16A 2ZGPA 4I8MA 1BFGA 1ISVA 1XQNA 2VSEA 3R4UA 1W6QA 1PZ9A 2V73A 1YBIA 4L8QA 1ULDA 3N7KA 1BLDA 1X50A 4FOYA 1Z2VA 2CY6A 2WT2A 2IHOA 1SLLA 3O5WB 4LO0A 1JLYA 3I29B 1I3HA 2DVFA 1SLCA 3NV1A 4K1YA 1K5VA 4K1ZA 4YZ1A 4Q26A 1UPSA 4CRQA 2BEBA 2ZMLA 5FNWA 4M3CE 5BOWA 1F5FA 3WDUA 2HZ9A 4ZFUB 1JXNA 2ZHMA 1VCLA 5IK4A 1RMLA 5BXPA 1SR4C 31BIA 5GZFA 1WW5A 5F9TA 1MC9A 3FJJA 1FWVA 2ZHLA 1VAVA 4LBMA 4XE9A 2VXTI 2BQPA 5EYXA 4BQ1A 5JDBA 1ENQA 4Q9GA 1GGPB 3FGMA 2P2KA 3IAGC 2FFUA 4QBCA 3ATGA 4OWLA 2ESUA 1BYHA 2UU8A 1QQKA 5DZFA 1J0SA 2A71A 3LSEA 2ZGQA 2PHWA 4XHBA 2AFGA 4AGGA 3FJIA 3NWKA 4GOVA 1UKGA 5D61A 4EKXB 1BZWA 1LTEA 1JHNA 1Q03A 4ZOTA 3NV4A 3AZXA 3N7JA 2Y9WC 3O0VA 4W65A 1UN1A 1R8OA 2DUOA 2VH9A 3H6RB 1LCLA 2RG9B 3U4XA 1C1FA 1WBLA 5BP5C 3AYEA 1DQ2A 1S0BA 1PWAA 2Y9FA 1QDCA 2P3JA 3WUDA 1LEMA 3W59A 5EHAA 4ISQA 1TIEA 1W6OB 2A5ZA 4RA0A 3UJ0A 2E7QA 2ARXA 1CIWA 1AXYA 1QF3A 2D22A 4FGFA 4Q2FA 1W3AA 2ZAAA 4WBCA 1IKPA 3LLPA 1FYUA 2F2FA 4G1RA 2VUAA 2P3IA 1ULGA 3AH2A 3WG4A 3PVEA 5GM0A 3CNAA 4Z8BA 4CJMA 5IK7A 1MS0A 1H9WA 5L73A 2Y9XE 1WUVA 1N1SA 2EXJA 3BX1C 1DFQA 3EF2A 3AP9A 1LOEA 2A3XA 2ZKNA 4XILA 1HWMB 2GALA 3O0XA 2E4MC 1SLBA 3RTJB 3AJ6A 2FO1A 1Z78A 1SFYA 3ASIA 1SBFA 2ZA9A 1MACA 1QNYA 3AFKA 4I4YA 4I37A 1V6OA 3BODA 5AVAA 4LO7C 5G00A 2UWBA 3WCSA 2SLIA 3O0WA 4Y1YA 3JRRA 1S0CA 3MW3A 3WVJA 1HQLA 3A23A 3W58A 4GXLA 1KJLA 2ZGRA 3SITA 2DS0A 3PUBA 2R1BA 5GZCA 4KBBA 1JT4A 5F8WA 1UX6A 2ZGMA 2UURA 2D20A 5JMCA 3O4BA 3ZYRA 1SZ6B 2A75A 2WSUA 2R49A 1ISXA 4UW4A 1GNZA 4G6MA 4DCKC 4FOWA 1AXZA 1JBCA 4GWNA 2PHFA 3WMVA 2GZBA 3QLQA 4M3CB 3H6RA 1QU0A 4FPEA 3H6QA 1VLNA 2CTVA 3WUCA 4NOTA 4H04A 1IKQA 1MS1A 3A0NA 1LHUA 1QGLA 5F90A 3O4AA 1Q8VA 1W6OA 3JUTA 3PVNA 4WV8A 2FMDA 3N7LA 4JKQA 3AX4A 4D69A 1ONKB 2GMMA 2KI4A 1WW7A 1RY7A 2Y9GA 3USUA 1UZYA 1HKNA 4R6UB 1G82A 2GNMA 5GLZA 1O4ZA 5CB7A 1BARA 3WV6A 5EYYA 1FGAA 1Z0HA 3AKHA 5F8SA 2GNDA 1UAIA 2VW0A 1N3OA 3BB2A 2JD4A 1TFMB 4XFSA 4YG3A 4IZEA 4XBQA 3WA1A 5CNAA 1HCEA 4G9NA 4FPOB 2R9KB 4YZ5A 4P9XA 3SNVA 1GICA 6I1BA 2ES3A 4DPNA 5DZUA 1LODA 1LHVA 4ZKTB 4YZ2A 3E8LC 2KKIA 5IUQA 5H9QA 1I1EA 2ZQNA 4Q9PA 3RMXA 4GP3A 2A3YA 1WD3A 2ENRA 1TP0A 2D23A 1J1TA 1Q8PA 1OKQA 2D43A 2NN8A 4JCKA 2VSAA 3WMUA 1CQ9A 3R05A 3UJOA 5FNXA 3HN1A 3WG2A 2A6ZA 4R9BA 2W68A 2NMOA 1Y7BA 4Y26A 1RG8A 1QDOA 1YO8A 3CA6A 4M3CF 4WVWA 3FBYA 4Y1VA 3UD7A 4J2SA 4AWDA 1DHKB 4GKXA 3RSJA 4XJZA 1S0LA 2CNAA 4PC4A 3F1RA 1WLWA 5GLUA 1N3PA 2ZZJA 2AR6A 4LBJA 4DRVA 4M3CA 3O4DA 3AJ5A 4I1BA 3D4KA 3WDYA 3H6SE 4OEGA 4YFWA 1DYKA 3O5SA 3POKA 4QC4A 5HCBA 3P6JA 1N1VA 5CBLA 4GA9A 1ISWA 4X39A 4X38A 5GALA 4AGVA 3PG0A 1MS8A 3FJHA 4C1WA 4ATEA 4LO1A 2ARBA 3CRGA 3ZXEA 1BASA 5DUXA 3N35A 1ONAA 1LOCA 1FX5A 5LK5A 4YFZA 5BQUA 1W6PB 2ET2A 4J2YA 1XHBA 3AKFA 1XYFA 4QO3A 2QN4A 1C1LA 5KXDA 1YTOA 2C9AA 1O4YA 1A78A 1AX1A 1AVXB 3SH3A 2E6VA 1EV2A 3A0KA 3ENRA 5FRAA 3MEPA 1ZM1A 1BFFA 4ZFWB 1V6IA 3APBA 3OJVA 1UL9A 4I1EA 4XFUA 4J2XA 1HDKA 1P63A 2YV8A 1CJPA 4HJJA 4YGDA 5GLTA 3AP7A 3N7MA 1Q8OA 4Q1PA 4A7KA 3BRGC 5GZGA 1LECA 4FQZA 1SCSA 2V5YA 3D7WB 1CPMA 1CVSA 3QYDA 2DVBA 4Y24A 4EFQA 5GJ6A 3IPVB 1MS3A 4XOGA 4ZXKA 2EIGA 3V65A 4TYSA 3D5OA 2WJSA 1GZWB 2AYHA 3OGGA 2K4AB 5BXTA 1V6WA 3IIRA 3MALA 1IRAX 2K43A 3NBEA 2NVHA 1VAMA 1V00A 3TB0A 1W3GA 1BLAA 4LO2A 1WBCA 1DQ4A 4XTPA 4ENDA 2W52A 2XB6C 4J23B 2ZGOA 3GNEA 1PC8B 2GNBA 1MS5A 2AQZA 1LOBA 4TZDA 1DZCA 1FWUA 3M1HA 4I4SA 2P34A 4GWMA 1JLXA 1BXHA 2JECA 1CONA 1Q8SA 3AH4A 4ISRA 4XJUA 1DZQA 5JOXA 3V79C 2ZGKA 3INAA 1ULFA 4AN7B 1LU1A 1EYLA 2DTYA 3FJBA 2HW9A 4BM8A 5BXRA 3VV1A 4Q8LA 1LGBA 3PJQA 3WDTA 2OUHA 1R1ZA 1AJKA 3FJKA 3KM5A 4BLIA 4EFPA 3FUOA 4YW1A 4FOVA 3NBDA 4YW4A 1II4A 1ISYA 1FNYA 2CL2A 1GNHA 1D0HA 1QNWA 1JY0A 2AREA 1G9AA 1G9DA 1MZ5A 5HCFA 1CVNA 2XG3A 4XIKA 3B3QE 4P9WA 1G86A 3HALA 5DUWA 2FHRA 3OYWB 2OW4A 3DGTA 3IN9A 4XXPA 4JKXB 3HOMA 3ZXDA 1MS4A 4YGCA 1HCDA 3A22A 2A70A 1JUIA 1SBDA 3N0KA 2ZBJA 2Q5TA 1W6PA 3O49A 2D3RA 3Q7YA 4PBPA 5BXSA 2UUSA 5I1BA 3MPPG 1MS9A 1G8WA 4I2SA 4BOWA 2GMEA 2I1BA 1DQ0A 1MVEA 1BFCA 4YOLA 4QKRA 1V6MA 3A07A 2W39A 3NBNA 3OGFA 3USUB 4YG0A 2P3KA 5BVPI 1D2SA 1N1YA 2PELA 3BA5A 1V6XA 5E88A 2SBAA 2NTDA 5DVHA 3UK9A 3TC2A 3BA7A 1S0GA 4P0LA 1R8NA 3AZWA 4KEIA 1SLAA 4H55A 1BFBA 1MVQA 2F8XC 1ZA4A 3WINC 4Q91A 3DUIA 3B00A 1DLLA 3VKLA 1YXWA 3MW2A 1PUMB 3IPVA 2E51A 1BQPA 2ZHKA 3RQ0A 2NYYA 4AVSA 4Z9WB 1N1TA 2R16A 4HANA 1AVWB 1AF9A 1CN1A 4LO3A 1HQWA 1GZWA 3FJAA 2WQZC 1QOSA 2A6YA 2R0FA 3QCWA 2K8RA 3BADA 4LBNA 3FJEA 4XXAA 3BIWE 3T2TA 4A7ZA 2DYCA 1KDMA 2YMZA 4IY9A 2YUGA 2WLQA 3OJMA 4LO0C 4YGBA 2YZ4A 1U0AA 3ZPYA 3O12A 4XHXA 4BLJA 3IKWA 1AXMA 4I96A 1GBGA 3AP4A 1KDKA 4QD2B 3CA4A 1WBFA 3VUOA 3QR5A 4FPGA 3VT0A 1FNZA 3AJZA 4LO2C 2I2SA 3OY8B 3P53A 3ZVXA 4Q8KA 3NJ5A 2R0HA 4GAIA 3R4SA 1GZCA 4FPYA 3AZZA 4XZPA 2DVAA 4UW5A 3CA3A 3FLRA 1DGLA 1WCSA 5DXDA 1FV3A 3WOGA 2D6PA 1OQ1A 2DVDA 3WDXA 5GZEA 3VWCA 2NZ9A 1CR7A 3V64A 2UWAA 3B01A 2NP0A 2R1DA 3FJCA 4DS0A 3AKIA 2PHRA 2D3SA 2H0BA 4FPHA 1JYIA 4JQ0A 4UW3A 1NUNA 5KXCA 4LO8B 3VEQA 1JT3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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