3R4UA

Cell entry of botulinum neurotoxin type c is dependent upon interaction with two ganglioside molecules
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
428
structure length
422
Chain Sequence
SMANINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The biological activity of botulinum neurotoxin type C is dependent upon novel types of ganglioside binding sites.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
total genus 99
structure length 422
sequence length 428
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3r4uA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3r4uA02
1DJSB 3OBRA 3LCPA 4OUJA 3IM6A 2LTNA 1AVAC 3ZPYA 4QALA 2UWCA 4W65A 3B00A 3AZZA 1CE7B 4QO3A 2NMOA 1EVTA 4EFRA 1MZ6A 1CR7A 1BYHA 3O44A 4EKXB 2ZHKA 4Q9GA 4YFZA 4FPFA 4R9CA 3SH5A 1TOOA 1SLAA 4JKQA 4P9XA 2A6VA 1WW6A 4I2SA 4Y1VA 4F83A 2D3RA 3M2MA 4FPGA 1ABRB 1T9FA 1JXNA 2B7YA 3N7JA 2EAKA 2MLLB 5HCAA 2PHXA 3LSDA 3FJHA 4FPHA 1FWUA 2AAIB 1GSLA 5D61A 4DFSA 2F2FC 2NM1A 3IM7A 1SLLA 3ENRA 2D44A 3H6QA 3O3QA 3WUCA 3L2YA 1II4A 4AVSA 3ZC9A 5FREA 1AJOA 4LBQA 4DRRA 4P6AA 5DUUA 2AYHA 3OJBA 1R8NA 2JECA 3ZX7A 5EYYA 1MS0A 4PBOA 2D7FA 3NBDA 5FNWA 2JE7A 2PHRA 4I8MA 3ATGA 3C9ZA 2GN3A 4M3CF 3Q7XA 2VSAA 3O4AA 4QD2B 1C4RA 2ZR1B 3AYDA 4J2KA 2V73A 1J1TA 3RQ0A 1CIWA 2R16A 5D62A 3WINA 1B09A 3IKWA 1RINA 2ZGOA 4D8HA 5CNAA 1O4ZA 1V6VA 1FAYA 3WDWA 3VUOA 4X39A 2DVBA 4BOWA 3CQAA 5KXDA 1QNYA 3OBTA 2SBAA 4LO8B 4YZ2A 4II0A 4XBNA 1HWPB 4CZSA 2X2SA 4I4UA 5F8WA 1YYNA 2ZGNA 4XXPA 1G9DA 3HBWA 1URXA 1C1FA 1LECA 1JW6A 4Y1UA 2IWTB 1Z4SA 1DGLA 4LBMA 2GN7A 4Q8KA 2TEPA 2D1ZA 4YFWA 3USUA 4YM1A 4AVVA 5T5OA 3A21A 5GLZA 1LEDA 5KXCA 2Q9XA 4QBCA 4Q9PA 1FQ9A 3BRDA 3O0VA 2HZ9A 3OGGA 1LGBA 4YW5A 1IKQA 2E6VA 2ZHMA 1W6OB 5EWSA 3ZXEA 1GZWA 3IIRA 1HKDA 4USPA 1MS8A 5EHAA 4H55A 1UZYA 2VXTI 3MALA 2A3YA 2WT2A 2C9AA 1SFYA 2D6NA 3AZWA 2JD4A 4ISQA 5JOXA 3ZXFA 5GLVA 1ULGA 1RIRA 3M3OA 2ARBA 5H9QA 2K43A 2H0BA 4LO7C 4I1EA 3AXEA 4YW1A 1S0EA 3T1LA 2MC2A 1WW4A 3VKFC 2GMMA 2HWAA 2ZACA 1QKQA 3WOGA 3WG4A 4ITCA 5HPZA 3WO3A 3WO4A 2WNEA 2NN8A 3FGMA 4ISRA 1BLAA 4G6MA 4FPCA 5BP5C 1WBAA 3R4SA 3RSJA 1W6PA 4I96A 4FPLA 4WBCA 4M3CA 4AYUA 4DCKC 1TWMA 1MVEA 2D22A 2Y9WC 1WLWA 2VXRA 4TYSA 4GWMA 1Q8SA 5BXTA 1ULCA 3B01A 3WMUA 1S0GA 2A6WA 2FGFA 4CJMA 4Q91A 1Z78A 1BZWA 4XOGA 1LHOA 2CWMA 2UWBA 5F8SA 2EF6A 4P0LA 1RG8A 1S0JA 3CA3A 5IUQA 5F5QA 3CRIA 5CA6A 4XZPA 5EG6C 4XHBA 4H04A 4TZDA 2VUAA 4GKYA 1W6MA 1Y7BA 3CAHA 1BA7A 1AXZA 3PVEA 5DG2A 1QOOA 2ENRA 5JLVA 1IS4A 4AGRA 1Z0HA 1F5FA 3BAQA 4XJWA 1DZQA 1HQWA 1IKPA 4I6IA 1D0HA 1JUIA 4ZXKA 5BYNA 1SR4C 4YGEA 1JBCA 2SLIA 1ONKB 4CRQA 1DZCA 2NTDA 3WHTA 2WT0A 4LBQB 1LOAA 2E4MA 1HWOB 2AXMA 1CVNA 4JP0A 5DUYA 4FQZA 3O12A 4JPZA 5E89A 3ZXGA 4PC4A 4ZFYB 2CTVA 3SH4A 3HN1A 4YW3A 3UDAA 3SITA 2ZQNA 1BKZA 4D69A 2GO2A 2PHWA 2DS0A 2ZGTA 4Y20A 1FGAA 2ZGRA 2P3JA 2ZHNA 1XYFA 1LCLA 1DBNA 1FYUA 1LJ7A 5DUXA 3AK0A 2DVAA 1PWAA 5BQUC 1ZA4A 1QQKA 4I4PA 1LU1A 1IS3A 3KMVA 2EALA 1FNYA 2DVDA 4K20A 4ZKTB 2Z48A 4I4RA 2UURA 4FPYA 2ZGLA 3ASIA 5JOYA 4Q1PA 4ATEA 4YLZA 2F8XC 3ZXKA 1V6XA 3N35A 4WVVA 4JQ0A 3M1HA 5GZDA 3CA1A 3WG2A 1VALA 3OY8B 2UUSA 3VKOA 1N1TA 5BXRA 4YZ5A 1LODA 1W6NB 3UD9A 3S8KA 4I30A 1KNMA 4PF5A 2EXJA 2LIQA 3U4XA 4I37A 2DUPA 1NZKA 4IZXA 4A7KA 5FZZA 2D6KA 2RQ9A 2NYYA 4P0JA 5E88A 4BMBA 4IQPA 2P39A 4UW3A 2R0HA 5F9TA 1WD4A 2D6MA 2PHTA 2IHOA 2NP0A 2D6LX 2A75A 2V5YA 5L73A 1SLBA 3BODA 2EXKA 4PQ9A 4LBNA 3TAYA 1W6OA 3PMEA 4R6UB 1WLDA 5JVVA 3I29B 1KDMA 4ASMB 4HA2A 1G82A 1OKQA 1KJRA 3N3HA 2YY1A 2D6PA 2Q5TA 3A07A 1GICA 2FDBM 1H30A 1W3FA 3HSMA 4Q8LA 3QCWA 3CU1B 3ILFA 4I4SA 1QGLA 1IT0A 4L8QA 2VLCA 3BA7A 1WBLA 2OVUA 1LHVA 4EB2B 1ISWA 3CRGA 3FJEA 1W6PB 2DYCA 1DFCA 4EEEB 1G7YA 1DLLA 1LEMA 4I4XA 2KM2A 4C1XA 5GZFA 5SV8A 4KEIA 1DHKB 3T1MA 4KC3A 1AXYA 3PVOA 5IK4A 1S0CA 3T8SA 3AX4A 4XYXA 1VIWB 4LO3C 4FPOB 4XIOA 1JYIA 2DVFA 3C2UA 1SACA 2NZ9A 4U36A 3D7WB 5HCBA 4DS0A 2Q3NB 2JKBA 3N7KA 4GAIA 3CA5A 2W68A 1IRAX 1SLCA 2ZZJA 1DQ6A 3TB0A 4YOLA 4DQAA 1LHWA 1W6MB 3SLIA 4WV8A 3RS6A 3PUBA 2PELA 3Q7WA 2R49A 3ZSJA 2WKKA 2CWSA 2ZGPA 3JUUA 3UJOA 4FPEA 2P2KA 2DUOA 3A23A 3POKA 2P23A 4JC1A 3Q9OA 3WDYA 3BRFA 1D2SA 2AR6A 3WG3A 3LSEA 1BLDA 2HYKA 4YM2A 5EXOA 4YG6A 4LO1A 2FHRA 2A5ZA 3BRGC 1PZ8A 1DQ0A 1DFQA 2OW4A 5HCFA 4P14A 3FJIA 4J2YA 3OGFA 3P6JA 2E7TA 1GANA 4I0YA 1IS5A 1OQLB 2HW9A 1MR5A 3IMNA 3DUIA 3WDTA 3AP7A 5T50A 4Y20B 3O4BA 4P9YA 1AFCA 3LLPA 3P6IA 4ZGRB 1WLCA 4X37A 2ES3A 4QBVA 3FJBA 1I1EA 3ZYPA 5LK5A 3Q7YA 4EFPA 1LHNA 4CTEA 3AP6A 1HDKA 3OYWA 1QQLA 3A4UA 4G6JA 3SNMA 1YF8B 3BADA 1ULFA 3O4DA 2YZ4A 3VWCA 1FATA 3AJYA 3CNAA 5CB7A 5H9RA 5GLWA 1PUUB 2DV9A 4Y1YA 1CPMA 3VKMA 1V6OA 3HR9A 1U0AA 4FPJA 1WUVA 3MPPG 1YIFA 1EYLA 5GLUA 4BM8A 4BMEA 1FMMS 3ZSMA 1GKBA 2VW1A 3WINC 2OUHA 3H6RB 1QOTA 2D7RA 2VSEA 3V64A 3OY8A 4XHXA 1ENRA 2G4IA 3ZXJA 5F8YA 3GNEA 1W6NA 5GZGA 1W0PA 1QF3A 1AVWB 3D4KA 4AGVA 3CA0A 1LGNA 3JUTA 1AX0A 2Z49A 4LO2A 2A6XA 5GM0A 3INAA 1NXD1 5GJ6A 1BJQA 5JOZA 3H0OA 1ONAA 1OFSA 31BIA 1WBFA 1SCSA 5B2HA 3EF2A 3M3CA 4XE9A 4RA0A 4WVWA 2A7AA 4XJZA 3UK9A 1DQGA 1BQPA 2D3SA 4YM3A 3VT2A 3WCRA 1AXKA 4XJAA 1W6QB 2CNAA 5BXPA 1MVQA 1H9PA 3K1XA 4Y1XA 3WZ1A 4U2AA 3AP5A 2P3IA 4XKIA 4FGFA 5BP5A 4Y1ZA 4OEEA 2QN4A 3CA6A 3AZVA 3UL2A 3FJFA 4BLJA 1BFBA 4XBQA 2WSUA 4GWNA 3GALA 4XTMA 1DIWA 3FJAA 4A7YA 2AQZA 1A8DA 2KLLA 5KXBA 3AKIA 1CQ9A 3AXDA 3A0KA 1YTOA 4GP0A 3AH4A 1YXWA 3B3QE 2C5DA 2JJ6A 4JCKA 1JT3A 4XIKA 4YZ3A 1Q1UA 1N1SA 1ULEA 4H9WA 1S0DA 3AKFA 3AKGA 4OEGA 1I1BA 4OWLA 4OEFA 2BQPA 3UJ0A 2ARXA 1FX5A 3NV3A 1VCLA 5DZEA 2XB6C 1IJTA 3I2XA 4UW5A 2R0FA 1Q8OA 4R9DA 1V6JA 3UD8A 3FUOA 4J23B 2FMDA 1PZZA 3AYCA 4FPKA 5GZCA 2D3PA 2XOAA 1C57A 5CAZA 3WDVA 4KEKA 2CL2A 2WT1A 4I3NA 1TIEA 1KQRA 1S0LA 3ILNA 5IK5A 2ZA9A 2E51A 1XHBA 4QC4A 2RHPA 4JAWA 1PUMB 2ZGSA 2ERMA 1FV2A 3AH1A 2KKIA 1AVXB 1SLIA 4AWDA 1IOAA 3RTJB 3WVJA 2I1BA 1QDOA 4BPZA 2D24A 2NVHA 3BOPA 3JU9A 2JDZA 1G86A 5JOWA 1E0OA 3AFKA 1WD3A 3B9UA 4Z8SB 4I4YA 1HLCA 4Q26A 1SLTA 2DRZA 4ZLBB 3AP9A 2PHUA 4I4OA 4ENDA 1K5VA 1DQOA 1Z2VA 3UJ4A 1GYKA 2YUGA 3OYWB 1CN1A 4BQ1A 1YO8A 2E4MC 1A3KA 1F9KA 2YV8A 2GMEA 1M2TB 4R9AA 1LOBA 2GNTA 4AGGA 3NBCA 3IN9A 4UW4A 5FZUA 2A6YA 3M3EA 21BIA 5DG1A 1V6NA 5GAQA 4XFTA 5D63A 3AJ5A 5DZUA 2W08A 3VKLA 4Q2FA 2R1BA 3FBYA 4X38A 1JTCA 4K1YA 3PHZA 1W3AA 4R9BA 1R8OA 4G9MA 2AREA 3FFZA 1LOFA 1HWMB 3N7LA 4GA9A 1CVSA 1AF9A 1KITA 1JY0A 3AKHA 1V00A 2VW0A 4XJ9A 4D0ZA 2K4AB 2AFGA 2A3XA 1AXMA 4IZEA 3QLQA 3LTQA 4QD2C 1HKNA 2WLQA 1W0OA 4LO0A 2ZGMA 5G00A 1MC9A 3PG0A 3H6RA 4GXLA 1GLHA 1NUNA 3NJ5A 3ZVXA 3FLRA 1N3OA 2EIGA 2R1DA 3N7MA 1HCDA 2KH2A 1UN1A 2X2TA 5T55A 3F1RA 3OJ2A 4LO7B 1EV2A 2UWAA 4FVVA 1P63A 2AUYA 2JE9A 4GKXA 3O4CA 2VH9A 2A6ZA 4F34A 2RG9B 2CY6A 2E7QA 3E8LC 2D20A 1NLSA 2Y9XE 3O49A 1IRPA 1GV9A 4M01A 3NBNA 2HWMA 3FLTA 1JHNA 4RL7A 3W59A 4YW2A 4DEPA 3FJ9A 1DQ2A 3WNXA 3WUDA 1JYCA 4GAFA 1W6QA 1WBCA 4LBKA 4LBQD 4NO4A 2P34A 1ISYA 2ZGKA 4QKRA 1SCRA 2R9KB 3POYA 3BB2A 2EXIA 1K5UA 1HQLA 1UAIA 1ISZA 1WW7A 1XQNA 2DURA 3ILAA 1ITBA 3ZSLA 3HOMA 2GMPA 3I2AA 3ZSKA 1SBFA 1DYPA 3BAUA 3H6SE 4YG3A 3O0XA 3T2TA 4YW4A 1LHUA 1G9BA 1QNWA 1UMZA 2W52A 4ZA3B 4FP3A 5DSSB 1MS5A 1C1LA 4ZFWB 2ET2A 1GNHA 2ZMKA 1ISVA 2A3WA 3CRHA 5BXSA 1UZZA 3I4IA 4Q27A 2DUQA 4YG0A 1FNZA 5GALA 2FFUA 3WG1A 2P3KA 1XG6A 7I1BA 2GALA 5DUWA 3WV6A 1V6WA 5IT6A 1QXMA 2DU0A 1N3QA 1TTUA 5E24E 5T5PA 2NMNA 4X3AA 2F2FA 1FMZA 4FOVA 3P53A 5DVHA 1YBIA 4C1WA 4DRVA 3FJ8A 4Q1RA 4PBPA 2K8RA 2YXSA 4LBOA 1JN2P 4IYBA 3CA4A 1ENQA 3DGTA 2DVGA 3MW4A 5GLTA 5GZEA 3FJJA 1AJKA 4YZ1A 3SISA 2DREA 1GNZA 1A78A 4TLPA 3MEPA 4I4QA 1DYKA 4OWJA 5DZFA 1RZOB 5FRAA 3BAGA 1RITA 2ERFA 4YGCA 4LO1C 3WA1A 1BARA 2W39A 1TEIA 1UKGA 1N3PA 3VKNA 4P0KA 3V0AB 1ISXA 5T5JA 3B69A 2BEBA 3AJ6A 2QYIB 5KXEA 3PVNA 1S0BA 2Z42A 4LBJA 4IONA 5JDBA 4Y22B 4XJ8A 1LENA 4GOYA 1Q56A 1EPWA 2ESUA 4HL0A 4G1RA 2OUJA 3FLPA 4FQ4A 1UX6A 1M16A 1V6UA 5T54A 2FO1A 3BTAA 2WQZC 1CESA 2Y9GA 3O5WB 3VEQA 1AVUA 3TC2A 2ZMLA 2ZGQA 3V0BB 4L4HA 1RMLA 1SZ6B 2UU8A 3IPVB 4PCRA 3JRRA 3AP4A 1CJPA 4HANA 3FJCA 3BA4A 2J3PA 1L2HA 2EXHA 2A71A 3POWA 2ZHLA 5F90A 2DTYA 1MZ5A 1PZ9A 1QMJA 1BASA 3AYEA 1VLNA 4M3CE 1HIBA 2I2SA 2GNMA 1IOBA 4XBLA 1GZ9A 3SH3A 3ILRA 1J0SA 1MD6A 1FV3A 2P37A 3N0KA 1MS9A 2PHFA 1X50A 1ULDA 1GGPB 1MS4A 4ZFUB 1XZZA 2CYFA 1G9AA 5FZYA 2GZBA 4FOWA 1JT5A 4AVTA 3BIWE 3R05A 3AH2A 4XILA 4LO2C 3N36A 3D6EA 1ILR1 3I8TA 1G8WA 3RG0A 5AVAA 5I1BA 2LALA 3OJMA 3MW3A 1R1ZA 1Q8QA 2A70A 6I1BA 1LOEA 4ATFA 2AGSA 5H9PA 2DWRA 4QKSA 1CPNA 1TFMB 4I7IA 4YGBA 2D6OX 3BAOA 2ZGUA 3W9TA 2M49A 3VT1A 2D23A 1G9FA 3FJDA 1DQ5A 5BOWA 3F62B 2FFVA 1LU2A 3WHUA 1QU0A 2ZBJA 1HWNB 2RSTA 2Y9FA 2BFHA 1CONA 1PC8B 4JKXB 1IS6A 3APBA 1GZCA 1KDKA 2KI6B 2VY0A 8I1BA 3V79C 1AVBA 3IM5A 1AZDA 3RRDA 5T52A 5FNXA 2AENA 1BFFA 4SLIA 4BLIA 1N1YA 1JQZA 3W58A 2DTWA 3NV1A 2DRYA 3AYAA 1BFGA 1FN0A 5EC5A 3HMYA 1JOJA 1OQ1A 1KJLA 1VAMA 4UW6A 1YI7A 1DQ4A 2WSVA 3FJKA 4AN7B 3AZXA 1LOCA 3WCSA 3O5SA 1APNA 4IY9A 1SR4A 4DPNA 1SBDA 1MS1A 5IK7A 4MYEA 2XG3A 2BEAA 1S0FA 2KI4A 5CBLA 4JRAA 3RMXA 3QR5A 1Q03A 4YZ4A 3RMYA 4XDQA 1LOGA 3ZXDA 3NBEA 4LBLA 5EYXA 2ZQOA 4OZXA 1ENSA 2ZAAA 3KQRA 1GBGA 3BAVA 4OW4A 4XJUA 1Q04A 4I4VA 1PZ7A 3NWKA 3WDUA 1JLXA 3VT0A 4ZOTA 4XFUA 3QYDA 4IHZA 5T5LA 1N1VA 1AX1A 4GOVA 1LTEA 3O4OA 1MACA 3WO2A 1V6KA 4AN6A 1DZDA 4WZFA 1QOSA 3SNVA 2VU9A 5BQUA 3IM0A 1T4QA 4Z9WB 3S8JA 1QDCA 5E8AA 3ZXLA 4M00A 1Q8VA 1Q8PA 3WMVA 3V0AA 4I1BA 1UPSA 1WW5A 3VV1A 3RTIB 3VSFA 2YROA 1FWVA 3V65A 4XMIA 2AH2A 4Y22A 1TP0A 4XMAA 4XXAA 4OWKA 4KBBA 4FOQA 3NV2A 3M3QA 3WDXA 4DENA 2ZABA 3AZYA 4YGDA 1V6MA 2YMZA 2WJSA 1LGCA 1JT4A 4A7ZA 3OPZA 2DU1A 3V0BA 1S1AA 5DZGA 4FOYA 2D43A 1V6IA 1JLYA 3IPVA 2E53A 3UJQA 2ZKNA 4FP2A 3FUQA 3HALA 5IK8A 3NV4A 1SBEA 3USUB 3PJQA 4EFQA 1VAVA 1WCSA 4IY8A 4J2XA 1LOFC 3OJVA 4Y26A 4HJJA 3D5OA 2GNBA 3IAGC 2VW2A 4K21A 1LULA 3R4UA 4HR6C 4K1ZA 2WRYA 1BXHA 1N4KA 41BIA 1IHKA 1IILA 4GP3A 1KRIA 3B9CA 3BA5A 3POSA 1GZWB 4LO0C 1YRZA 4ZBVB 2WBCA 1W3GA 5H9SA 1TWEA 4NOTA 1LESA 5BVPI 2ZMNA 2LIEA 1UL9A 4YM0A 2GDFA 3WLUA 2L5XA 1I3HA 1S0IA 3UD7A 1DQ1A 1H9WA 1F31A 1N47A 4D0TA 3MW2A 1JT7A 3A22A 4G9NA 2D7IA 1ZM1A 4Y24A 1MS3A 9ILBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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