3R4UA

Cell entry of botulinum neurotoxin type c is dependent upon interaction with two ganglioside molecules
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
428
structure length
422
Chain Sequence
SMANINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The biological activity of botulinum neurotoxin type C is dependent upon novel types of ganglioside binding sites.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
total genus 99
structure length 422
sequence length 428
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3r4uA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3r4uA02
2LTNA 5BQUA 2KI4A 3L2YA 4BMBA 4TZDA 5FRAA 1SBEA 5T55A 3ZC8A 2EXJA 4ZGRB 2D6NA 5F5QA 2GDFA 1JUIA 3KM5A 3IM6A 5D61A 3C9ZA 1IS5A 3WHUA 4XMAA 3WO3A 1TIEA 3ZXKA 7I1BA 3BRGC 2A6VA 1HQWA 4LO0C 1WW5A 2GMPA 4AGRA 1HCDA 3H6RA 3NV2A 1IT0A 1XYFA 3UJOA 3WA1A 2ZHKA 5DG2A 3V65A 2DTWA 4I6IA 1R1ZA 4Y24A 2ERMA 2NTDA 3NBDA 3UL2A 1GNHA 4OZXA 4LBLA 5GM0A 3PVOA 1QNYA 1G82A 3NBNA 1HIBA 1CR7A 31BIA 5DVHA 4DEPA 1Q04A 1ENQA 5T54A 5BYNA 4ZFWB 3B3QE 3N36A 2VW2A 2LALA 4K21A 1IJTA 1CPNA 4I3NA 3ZPYA 2RG9B 4H04A 1S0BA 1EV2A 1DZDA 1CIWA 2A6XA 3H6SE 1JOJA 4J2SA 2AREA 4YGBA 4ZBVB 1A3KA 2E51A 1L2HA 1HDKA 1SR4A 2ZGTA 5HCAA 2DRYA 4JQ0A 2DTYA 4EKXB 2NVHA 1JHNA 4R9BA 1W0OA 2SLIA 4R9DA 2UU8A 4FPCA 1Y7BA 4Y22B 3R4UA 2D6MA 1YI7A 3D7WB 2WNEA 3CRIA 1YYNA 1W6PA 4XJWA 2CWSA 2VW0A 1FN0A 2CL2A 5T52A 3FJDA 1TEIA 4I4UA 3A0KA 5IUQA 3WVJA 4GP0A 1TTUA 4QKRA 1GGPB 2KLLA 4FGFA 3ZXDA 4YW4A 3ZSKA 5CAZA 4Y1ZA 5EC5A 3KMVA 2XOAA 4AVSA 2FFUA 3LLPA 4BMEA 2ESUA 1SBDA 4XIOA 1EYLA 1URXA 1SZ6B 2EXKA 3PMEA 3FJHA 1JQZA 2K43A 2ENRA 3IIRA 1KRIA 4F34A 5D62A 3CRHA 1AJKA 4G9MA 3I2XA 3KQRA 3UDAA 1Z0HA 3VEQA 4HJJA 4ATFA 3OYWA 4P0LA 4CZSA 3VSZA 5GALA 5BP5C 1QOOA 2M49A 1N1YA 1JLYA 5BOWA 3AP9A 4I8MA 2HYKA 1SLIA 3CA6A 4K1YA 2A3WA 3M2MA 3Q7XA 5F8YA 4YM2A 1KDKA 3CA0A 1SACA 1DQ1A 1BKZA 1MVQA 1LOFC 1N1TA 3WMVA 1UMZA 3CU1B 2A3XA 2F2FC 4A7KA 2Y9FA 1Q8VA 4LBKA 4XKIA 1HKDA 1X50A 4P9WA 3DUIA 4AYUA 1BARA 5GLWA 1ITBA 3WNXA 5DUYA 1LOEA 3BX1C 3IMNA 2YY1A 4X3AA 2YMZA 3OJMA 1KITA 1FV3A 1G7YA 3D4KA 3VT0A 3W9TA 1QGLA 2HZ9A 1S0IA 3AKGA 4YZ3A 1LHWA 3WG3A 1N1SA 2R9KB 1A8DA 4Q9GA 3QR5A 1ILR1 3BAQA 4LBJA 1HWPB 3IPVB 4FPJA 1ISYA 3UJ0A 1BFGA 3PVEA 4EEEB 4OWJA 2ZGNA 4YZ5A 4YGEA 4CTEA 4ZLBB 3V0BB 4R6UB 2VU9A 4GAFA 1HWOB 1LECA 4M3CB 2RQ9A 4QALA 2AUYA 1BASA 2YXSA 2XB6C 3P6IA 2RSTA 3HMYA 2DURA 2WRYA 1JT4A 3SNMA 2R1BA 1EVTA 4LO3A 4Q8LA 3APBA 1V6WA 1QOSA 2P34A 2GNBA 3IM7A 3I29B 4BM8A 1N1VA 4D69A 3AZZA 3FJEA 1IKPA 2DUQA 4XJUA 3ZVXA 4BLJA 4Q1PA 1MD6A 3USUB 3FJBA 1DQ0A 5I1BA 1AJOA 1GBGA 1WBCA 1LOAA 1QU0A 4LO8B 2G4IA 4I4QA 1SFYA 1J1TA 4X38A 4YW3A 5EYYA 4I4SA 1HKNA 3C2UA 2VH9A 1I3HA 1QKQA 3UD9A 5DZFA 5IK7A 5AVAA 2IHOA 2D3RA 2WT1A 1YXWA 2FFVA 4QD2C 1BFBA 5IK5A 1AFCA 3O12A 1IRPA 4YG0A 4YFWA 3AJ6A 1IKQA 1NXD1 1V6LA 2PHUA 3OY8B 1K5VA 4Q26A 4Z9WB 4Y22A 5EG6C 1CESA 4Q9PA 2DVAA 3A21A 2FO1A 1LU2A 1WD3A 1DQOA 2JKBA 1UL9A 1U0AA 4DQAA 3OJ2A 4A7ZA 5H9RA 2E6VA 4Y1VA 4NO4A 3A0NA 1ISWA 4IQPA 3O4CA 1DFQA 2ZGOA 3TC2A 3MPPG 4SLIA 1S0FA 1AZDA 4Q2FA 3A22A 4JC1A 3HALA 3RQ0A 3WOGA 1LENA 1AF9A 4JRAA 1WW6A 3UD7A 5BXPA 4G6JA 4U2AA 5CB7A 5CNAA 4OWLA 4FPGA 2YUGA 1UX6A 1WLDA 4R9AA 2AYHA 1VCLA 2NMNA 4J2KA 1ENSA 4DRVA 4JKQA 4I4XA 1WUVA 3POSA 4DCKC 1DIWA 1G9BA 4ENDA 3ZXJA 2R1DA 3M3EA 4YZ4A 3VUOA 3MW2A 4YW5A 1DJSB 3I2AA 1G9CA 2AH2A 4AVTA 1LHOA 1ISZA 4P0KA 5F8SA 1GYKA 4TYSA 3B00A 2HWAA 3POYA 3WDTA 3POKA 4PC4A 3D5OA 5JOXA 1LOCA 2DWRA 4LO2A 4WZFA 1LGNA 4FQ4A 1C1FA 4FPFA 1JTCA 1LODA 2PELA 3JRRA 3O0XA 3WO2A 1SLAA 2GNMA 1GKBA 4J23B 1MACA 1FWUA 2GZBA 1GLHA 3VKMA 5DZGA 4GP3A 2PHFA 4I1BA 2P2KA 2WT0A 2WJSA 3MALA 3AJZA 3WG4A 3ILRA 1E0OA 1LJ7A 3D6EA 3AP5A 1W6OB 4RA0A 3AYDA 5GZDA 2P3JA 1TP0A 5DUXA 4QO3A 3S8KA 1VIWB 4XXPA 4XJAA 1VAMA 2CNAA 1BA7A 3FUQA 5EYXA 2NM1A 2ZABA 4IONA 3NV3A 3ZXFA 2QN4A 2Y9WC 1WW7A 2W68A 4HANA 3R05A 1V6JA 2W52A 3WG1A 3AYAA 3AP6A 2IWTB 3NBCA 3IPVA 2AAIB 1LULA 3AX4A 5FNXA 2NP0A 3ZYPA 1RG8A 1APNA 4AVVA 1UZZA 4USPA 3V0BA 3U4XA 4ITCA 2KKIA 3RSJA 2I2SA 2VSAA 1BYHA 4PBPA 1W0PA 4M3CA 5GZGA 1IILA 1CJPA 5EHAA 2FDBM 4K1ZA 1QXMA 3UJQA 3A23A 4YGDA 2OW4A 2Z48A 4YG6A 1PZ8A 3LSEA 1Q03A 3ZXGA 2V5YA 1D2SA 1GNZA 5GLTA 4UW6A 3SLIA 1XG6A 1DZQA 3Q7WA 1Z4SA 2K8RA 3AJYA 1LOBA 1OQ1A 3JUTA 4LO1A 2ZHNA 1J0SA 2A7AA 1W6QA 5E8AA 5JOZA 3AYEA 4GKYA 2DS0A 4XIKA 4A7YA 3USUA 1HCEA 1GZ9A 4Y26A 5T5JA 3CA4A 4EB2B 2E4MA 1CONA 2GO2A 1JT3A 1SLLA 4XILA 3FJIA 1ULCA 3H6QA 1QNWA 2VUAA 3WG2A 5HCBA 2HW9A 1OQLB 1QF3A 3CAHA 1GANA 3WDVA 5H9QA 4KEJA 4QKSA 1DZCA 9ILBA 1AX1A 1CN1A 3OJBA 1FNZA 3BIWE 3AKHA 5JOYA 3QYDA 1DHKB 1MS1A 1HQLA 1G9DA 5B2HA 4I4OA 3OY8A 5DUWA 1AVWB 5BXTA 3O3QA 2W08A 1PUUB 2NN8A 1ENRA 2A70A 3INAA 1RMLA 3ENRA 4FPOB 1CQ9A 21BIA 1JT7A 3AK0A 3AKFA 3AZWA 1QMJA 1V6UA 3OGGA 4D8HA 1XZZA 2ZMKA 1GZWA 1G8WA 3WV6A 5SV8A 1KDMA 2D24A 1DLLA 4GOYA 3LSDA 2JECA 3NV1A 1B09A 1JW6A 3T1MA 4I96A 2YZ4A 4I2SA 1H30A 1XHBA 2PHTA 4XJ9A 3FLPA 1WLWA 1N4KA 2AXMA 1ISVA 1MR5A 4I4VA 1G86A 4EFQA 1O4ZA 2LIQA 3A4UA 1JYCA 1CVNA 3BA4A 4EFRA 1RZOB 3HR9A 1IS4A 3RTIB 1BQPA 4QC4A 5H9PA 3V0AB 1S0CA 4DFSA 3HSMA 4ATEA 2MC2A 4FPHA 1ULEA 1ONAA 2MLLB 1MZ6A 1YRZA 5JOWA 4IHZA 3WINC 1ZM1A 1ULGA 5BQUC 1H9PA 2F8XC 3BAHA 4JPZA 4YZ1A 3VWCA 1A78A 1FMZA 1IHKA 2FMDA 5T5PA 1NLSA 3WLUA 3FJ8A 2ZMNA 1WCSA 3VV1A 2ZKNA 3AH4A 1MZ5A 1XQNA 3FLTA 2YV8A 4IZEA 4FOYA 4XFSA 5E24E 4K20A 4LBQB 1AVBA 1MS3A 1NUNA 3LCPA 1N3QA 4L4IA 3FFZA 1DQGA 4Z8BA 4II0A 4XFUA 2A6YA 1WD4A 4GWMA 3IM0A 2ZMLA 1SLCA 4Q1RA 4XBNA 4HR6C 4J2YA 1KJRA 1W6NB 2MIBA 3OBRA 1W6OA 4G9NA 4R9CA 1EPWA 2ZA9A 4JKXB 1DQ4A 4Y20B 2GN7A 3O44A 2D7FA 4FPEA 4L8QA 3GALA 3ZC9A 5CBLA 1SCSA 2FGFA 2ZAAA 5GLVA 2WSUA 2C5DA 3B9UA 1BLAA 2P39A 3PHZA 4UW4A 3H6RB 4XHBA 4ISQA 3VKLA 1S0JA 4FOQA 2EALA 3WZ1A 3NV4A 2PHRA 1WBAA 3B01A 1SR4C 5DZEA 2KM2A 4I7IA 2FHRA 4WVVA 1RINA 1CVSA 2EXIA 2D6PA 3O0WA 3O4DA 3ILAA 3WDXA 1S0DA 4BPZA 2GN3A 1N3OA 1YTOA 2OUHA 3ILNA 1TFMB 3N7MA 1FV2A 1FQ9A 5G00A 2ZGUA 3WDUA 1QOTA 5EXOA 3VT2A 3BRDA 5IK8A 3HBWA 3AZXA 2VSEA 1DQ2A 1FAYA 3H0OA 3RTJB 1MS8A 1N3PA 4LO0A 3WMUA 1AVXB 3CA5A 2Q5TA 3BRFA 1V6VA 1LEMA 1G9FA 4FPLA 1GZCA 4U36A 1AXKA 3Q7YA 4J2XA 4LBOA 1II4A 1IS3A 3K1XA 1W6MB 3WCRA 1YBIA 4PF5A 3N3HA 2KI6B 3BAOA 1MS5A 4IY8A 4OW4A 4ZFUB 1Q8OA 4QD2B 5GLUA 1T9FA 3RMXA 2ZGMA 4I1EA 2EF6A 3MW4A 2D6LX 1LCLA 4ZFYB 3NJ5A 5T5OA 2D6OX 3AYCA 2DU0A 4DENA 1DFCA 5FZUA 2VY0A 2JDZA 3V64A 2H0BA 3PUBA 1V6NA 2R49A 3T2TA 4CRQA 3CA3A 3Q9OA 4YFZA 1SBFA 1DYPA 3SH5A 4YM1A 3ATGA 3WDYA 3ZSLA 3TB0A 2Z42A 1WLCA 1UZYA 1C57A 5BVPI 3BA5A 1P63A 2DVBA 3EF2A 4TLPA 4D0ZA 4ASMB 3AJ5A 2JJ6A 4ZXKA 2WSVA 2XG3A 3N7JA 4LO7C 2R0HA 4Y1YA 3O5WB 3SNVA 1KJLA 2L5XA 4DPNA 4LBNA 1I1BA 3CRGA 1PZ9A 5DUVA 3V79C 2W39A 4Y1UA 2DREA 5T50A 2P23A 5CA6A 2PHXA 4H9WA 3WCSA 1BZWA 4JAWA 3VSFA 4XJZA 3V0AA 5BP5A 1LGCA 2GNDA 2UUSA 5KXBA 2BQPA 1R8NA 1WBFA 2GMEA 1LHUA 4XTPA 4DS0A 2I1BA 4JP0A 5KXEA 3W59A 2P37A 1CE7B 3BA7A 1LOFA 3P53A 2GNTA 5JLVA 5H9SA 2ERFA 2R0FA 5GAQA 4XZPA 3HN1A 2F2FA 5GZEA 3FJAA 2ZQNA 2WT2A 1PWAA 4YOLA 3BAUA 4LO3C 1UN1A 2CTVA 2HWMA 2P3IA 4LBQA 1AVUA 2J3PA 3FJFA 2A75A 4XFTA 1HLCA 1JBCA 3AP4A 2CY6A 3O4OA 4I0YA 1W6NA 1F9KA 2EAKA 1PC8B 2A71A 2Q3NB 1SLBA 2R16A 2A6WA 4Y20A 1GV9A 4LBMA 1N47A 1RY7A 3SH4A 3VKNA 3BAVA 2D6KA 4ISRA 1AVAC 1JLXA 2ZR1B 2Y9XE 1MVEA 1Q8PA 4P9YA 1YO8A 1QQLA 1HWMB 4IYBA 4FVVA 4XYXA 3HOMA 4OEGA 3OJVA 2TEPA 1Q56A 2ARXA 2E7QA 3AFKA 5HPZA 2E53A 3IN9A 3WUDA 5BXRA 4YW2A 1AX2A 4M01A 5E89A 2OUJA 5GZCA 1S0LA 1I1EA 1QDOA 3WHTA 1LOGA 1FYUA 2DUOA 1V6OA 4EFPA 3E8LC 2D43A 2NYYA 5JMCA 1Q8QA 4P6AA 4WBCA 5JDBA 4G6MA 4AN6A 1FMMS 1LHNA 3IM5A 4UW5A 3DGTA 2DRZA 3T8SA 1BXHA 2DU1A 5JVVA 5F90A 2CWMA 2A6ZA 3SH3A 4HA2A 2X2SA 4YZ2A 1K5UA 1AXMA 2WLQA 4X39A 4P14A 1JY0A 4XMIA 1LGBA 1LTEA 3UD8A 5BXSA 1LU1A 1FATA 4OEFA 1WW4A 1QDCA 1V6XA 1G9AA 1W6MA 1BFCA 4CJMA 2OVUA 3SITA 1ABRB 4GXLA 5DSSB 1V00A 1UAIA 3AKIA 3I8TA 2Q9XA 1DBNA 1V6KA 5DUUA 1JYIA 4Q8KA 3OBTA 1ONKB 4IY9A 5FNWA 1DQ6A 3N7LA 2EXHA 3AXEA 3QCWA 2D23A 3MW3A 4QBCA 1VALA 3P6JA 2DVFA 1KQRA 2GMMA 1YIFA 1GICA 4MYEA 3FGMA 1YF8B 3ZX7A 4YW1A 4QBVA 4I4RA 2ZZJA 4LO2C 1IOAA 1TOOA 1VLNA 3B69A 3ZYRA 2D20A 1ULFA 3BADA 1JN2P 3VT1A 3M3CA 4I30A 1Q8SA 4FP2A 3F62B 4FOVA 3RMYA 2X2TA 4GOVA 1H9WA 1VAVA 2VW1A 3PJQA 5EWSA 2ES3A 5F8WA 3AZVA 3UJ4A 3ZSMA 3LTQA 3TAYA 3OGFA 4XXAA 3O0VA 4Q91A 4Z8SB 3CNAA 3RS6A 2NZ9A 1ULDA 3A07A 4LBQD 4BLIA 3O5SA 4M00A 3F1RA 5FZZA 2EIGA 5GZFA 1ZA4A 4AWDA 1BFFA 4YG3A 2ET2A 1OFSA 4XBQA 5KXDA 1Q1UA 4PQ9A 1LEDA 1S0EA 3POWA 2D3SA 4XHXA 3S8JA 4JCKA 3FLRA 1FX5A 2D22A 1RITA 2GALA 2ZQOA 3WO4A 3RG0A 1C4RA 5IT6A 2UWBA 3CQAA 1PZZA 1BJQA 5DXDA 6I1BA 2ZGLA 2AGSA 1T4QA 2UWAA 4DRRA 4KEIA 4W65A 5DG1A 2BFHA 3RRDA 4FP3A 4AGVA 1DYKA 2ZHLA 1UKGA 4GWNA 41BIA 5D63A 2ARBA 3JUUA 4OWKA 2JE9A 1FWVA 2B7YA 1DQ5A 4PCRA 4L4HA 1M16A 3FJKA 2RHPA 2Z49A 2AQZA 3O4BA 4LO1C 2D3PA 4YM0A 2ZHMA 1NZKA 4I4PA 3O49A 1OKQA 3AP7A 1CPMA 1GSLA 4XBLA 2AFGA 2ZBJA 4KC3A 1IS6A 3BTAA 4IZXA 2YROA 2NMOA 2E4MC 2D44A 3IKWA 2VLCA 4M3CF 4USOA 4YLZA 3BB2A 3BAGA 4F83A 4I37A 2PHWA 2K4AB 1MS4A 1MS9A 1BLDA 4Y1XA 2DVDA 1V6IA 3I4IA 2DYCA 3BODA 1JXNA 3W58A 2P3KA 4WVWA 3AH2A 2DUPA 2JE7A 5FZYA 2DVGA 4FOWA 4WV8A 1W6QB 4XJ8A 4ZOTA 4ZKTB 1IOBA 4XTMA 3ZXEA 2BEAA 4ZA3B 4FQZA 3M3QA 1S0GA 3UK9A 1FGAA 2UURA 2V73A 4C1XA 4G1RA 3FBYA 1W6PB 3ASIA 1KNMA 2WBCA 1AXZA 1WBLA 5T5LA 1SLTA 5L73A 2ZACA 1W3AA 5E88A 4M3CE 1Z2VA 2AR6A 1TWMA 3WDWA 5GLZA 3FJCA 4FPYA 1FNYA 1S1AA 1SCRA 1DGLA 4PBOA 1PUMB 3MEPA 1V6MA 3ILFA 5IK4A 3AZYA 4I4YA 1F5FA 1LHVA 3FUOA 3N7KA 3WUCA 1LESA 2CYFA 1QQKA 3OPZA 2ZGPA 4X37A 3ZXLA 3GNEA 3ZSJA 5F9TA 1AXYA 4UW3A 2LIEA 1GZWB 3N35A 3FJ9A 1PZ7A 2A3YA 1JT5A 3PVNA 3OYWB 3NBEA 1R8OA 1MS0A 1HWNB 1AX0A 2D1ZA 1IRAX 4GKXA 1Z78A 1M2TB 3IAGC 4FPKA 4BOWA 2BEBA 2VXTI 2WKKA 2ZGKA 2VXRA 5GJ6A 4KBBA 4GALA 3VKOA 3PG0A 3CA1A 1D0HA 3R4SA 1W3FA 4XDQA 2ZGSA 4XOGA 1RIRA 1ISXA 3AH1A 2KH2A 2D7IA 4H55A 3N0KA 2QYIB 2C9AA 2A5ZA 2Y9GA 4NOTA 2DV9A 8I1BA 1F31A 2ZGRA 4XE9A 4D0TA 3VKFC 1TWEA 2D7RA 4AN7B 2SBAA 3AXDA 1UPSA 5FREA 4LO7B 4KEKA 1W3GA 2AENA 3BOPA 3SISA 4GA9A 4GAIA 5HCFA 1C1LA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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