3R4UA

Cell entry of botulinum neurotoxin type c is dependent upon interaction with two ganglioside molecules
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
428
structure length
422
Chain Sequence
SMANINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The biological activity of botulinum neurotoxin type C is dependent upon novel types of ganglioside binding sites.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
total genus 99
structure length 422
sequence length 428
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3r4uA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3r4uA02
2ERMA 4FPKA 5GZGA 4Z9WB 2D23A 4UW6A 3C2UA 3A4UA 3FJAA 4FPCA 1DFQA 1JLYA 4FOVA 1YXWA 3APBA 1BFFA 4LBMA 3CRGA 4ASMB 1UX6A 2AGSA 1YI7A 2D43A 1D0HA 4PQ9A 1LOAA 5IUQA 3BAHA 2GNBA 5KXBA 2IHOA 4YG3A 1WBAA 1A3KA 5DG2A 3WINA 1H9WA 4XHXA 1UZZA 3OJVA 2JDZA 4F34A 2P34A 1QDOA 4FPEA 5G00A 1BZWA 3HMYA 1LCLA 3IM5A 1BQPA 4P6AA 1IKQA 3WUCA 1GNHA 1FATA 2YMZA 2RQ9A 4XJ9A 5GJ6A 1DQ0A 3ZXKA 1JLXA 1MS1A 2CTVA 1ENQA 1W6OB 4XTPA 5BVPI 4J2YA 3ZYPA 4L8QA 2FGFA 3NV2A 3NJ5A 2EAKA 1AXYA 1A78A 3LLPA 3U4XA 3O0WA 1CESA 4UW3A 1WBCA 3WDYA 3AH4A 4BLIA 2DVDA 3BTAA 3HBWA 4FPFA 2YZ4A 2BEAA 5EXOA 1SCRA 1LGBA 3V0BB 1HWOB 1IRAX 3UJQA 2ZMKA 3VEQA 4Z8BA 4OW4A 3MW2A 1OQ1A 4ZLBB 3ZXLA 2E7TA 1HWPB 3Q7WA 1H9PA 3OYWB 3OJBA 3WCRA 1J0SA 1N47A 3WG1A 2BFHA 2ZHKA 4GALA 4XJUA 4M3CA 2FDBM 2EIGA 2R1BA 1SFYA 1T4QA 3IM7A 5E88A 2AR6A 4LBJA 4XJWA 5GZEA 3PMEA 5DUWA 3UDAA 4FPLA 1CIWA 2CWMA 4Q27A 3WINC 4XZPA 21BIA 4FQZA 2OUJA 5DZUA 5L73A 5SV8A 3RG0A 5T5PA 1JT7A 3RMYA 1CN1A 1SBEA 3AZWA 1MVEA 5CNAA 1AX0A 1I1EA 3NWKA 3ILRA 3T8SA 1AXZA 5DZGA 2D6LX 1N1YA 3AJZA 3ZVXA 2NMOA 1MC9A 4FP2A 1HWMB 5EYXA 4A7KA 4Y20A 1W6PA 1JUIA 4YGEA 2A6YA 2QN4A 4I1EA 4W65A 2FFUA 3SISA 5E89A 1C4RA 5CB7A 5HCBA 4Y1XA 2K8RA 4EFRA 2B7YA 1SLTA 3BRDA 1GV9A 4YGDA 4P9WA 1SLCA 4YM3A 1MS5A 4YM0A 4QBVA 4QALA 2LIEA 1PWAA 2AAIB 1JW6A 1BFGA 5GM0A 2YY1A 3NV1A 4IY8A 1QF3A 3ZC9A 1WLWA 1C1FA 4KBBA 3FJCA 4XTMA 2ZKNA 4YW4A 2C5DA 4JAWA 4WVVA 1W3FA 3RMXA 2Y9XE 1TP0A 2DURA 4YLZA 3ZX7A 3ILAA 2P3IA 1QQKA 2WQZC 3WO2A 4YZ4A 5EWSA 3C9ZA 2A3XA 3AH2A 4EB2B 4IZXA 3Q9OA 3NV4A 2NZ9A 1GBGA 3MPPG 1DBNA 4BPZA 4FQ4A 4DENA 5T52A 3HR9A 3H6RB 4XFSA 2GMMA 3AP5A 1ILR1 4JP0A 5H9QA 1CJPA 3OJMA 2Q3NB 4USOA 2UURA 1V6MA 4TLPA 1KJLA 4LO0C 1IILA 2VW2A 5BYNA 4BLJA 1XQNA 2VXTI 1S0JA 3IIRA 3MW4A 1O4ZA 3OBTA 5DVHA 3PVOA 2Y9FA 3AXDA 3OYWA 2D44A 2A5ZA 2K43A 1MS9A 4YM2A 4I4XA 3ZXFA 3HN1A 5T5OA 2R1DA 1JYCA 4ZA3B 2WSVA 4I96A 1Y7BA 4CRQA 3CRIA 2NYYA 1HIBA 2JJ6A 2CWSA 1FN0A 3WCSA 1UMZA 1IOAA 2PHRA 4OWJA 2AENA 3W58A 4RA0A 2D7RA 4GOYA 4HA2A 2A3WA 1LGCA 3LCPA 5DUVA 4H55A 2J3PA 1YF8B 3H0OA 2HYKA 2D3PA 4Z8SB 3VT2A 3I2AA 3VKFC 4TZDA 3V64A 4AYUA 3B01A 2L5XA 4X39A 4XBNA 41BIA 5DZEA 2CL2A 4C1WA 1NLSA 2F2FC 2NMNA 2JE7A 1BASA 1W6MA 1QOTA 1NUNA 3ZYRA 5FNXA 5FRAA 3HALA 2KH2A 1GLHA 2NM1A 1AF9A 1WD4A 2RG9B 4LBQD 1QQLA 2F8XC 2ERFA 4WVWA 4NOTA 3ZSLA 1LENA 2WNEA 4YGCA 1LU2A 2ZHMA 5GALA 2H0BA 3I8TA 2KLLA 2HWAA 1F5FA 1PZ9A 3SLIA 2FFVA 4OUJA 3BA4A 4XE9A 4I1BA 4P0KA 4EFPA 1V6XA 2WLQA 4XXPA 4AGGA 4DPNA 3UL2A 3FJKA 5DSSB 4HJJA 2AH2A 1ISVA 3POWA 4YW1A 3R4UA 1LESA 2V73A 3AKFA 1AX2A 2A6WA 4A7ZA 2ARBA 3ZSKA 1HKDA 3O4CA 2ZGNA 1HWNB 1HQWA 2OUHA 1DQ5A 5AVAA 5EHAA 2X2TA 4IZEA 3POYA 4LO1C 3I29B 3CA0A 3OJ2A 4LO2A 1FNYA 4J23B 5DZFA 3RQ0A 2DU0A 2DVBA 4XYXA 2PHTA 4Q1PA 1BFBA 3NV3A 3H6RA 1V6OA 4YGBA 3UD7A 4XIOA 5GZCA 1CVSA 5T50A 4IY9A 2YROA 2GMEA 3BAUA 2TEPA 4AWDA 1QOOA 4XDQA 4Q2FA 3N7LA 1QU0A 1W6PB 3O5SA 1ULEA 3BA5A 4LO3C 4GA9A 2D6OX 3RTJB 3N7KA 1ULFA 2JD4A 2UUSA 1H30A 2ZMLA 1C1LA 1WD3A 4AVSA 2AREA 2ESUA 2ET2A 4Y1UA 2DTYA 4DQAA 3VKMA 1WW5A 1KRIA 4SLIA 4LBKA 1BFCA 4LO7B 3O44A 1CE7B 1SR4A 1LOCA 3A22A 2VLCA 2BEBA 3RS6A 3UJOA 5KXDA 1AZDA 5T55A 2NVHA 1Q8QA 1II4A 4U2AA 4NO4A 1SLLA 3FJDA 4JKQA 1LHWA 2D7FA 3BODA 3B69A 3FJHA 4AVTA 2KI4A 3RTIB 1FGAA 5DG1A 4AN6A 1G9BA 2DUPA 1BKZA 4AN7B 1N3OA 1VIWB 4II0A 1JQZA 7I1BA 1N4KA 4DRRA 3AKGA 2LTNA 3WMUA 4K1ZA 4AGVA 3AFKA 3VT1A 4CZSA 3LSEA 3T1LA 5IK8A 1GZCA 1Z2VA 3WV6A 1VCLA 4G6MA 5KXCA 4FOYA 1GSLA 3P6IA 5BP5C 3BAQA 1R8NA 1R8OA 3WVJA 2FO1A 2E6VA 1LOGA 3B9CA 1KDKA 1F9KA 1LEMA 5IK5A 1OQLB 1IS5A 3WDVA 5BQUA 3AX4A 1QNYA 3MEPA 1V6UA 1V6VA 2MLLB 4BOWA 3AXEA 3E8LC 2LALA 4XILA 4XHBA 1CVNA 2R0HA 1KJRA 4DS0A 2FMDA 3N36A 1DQ1A 4U36A 2DVGA 4FPOB 1KDMA 2CY6A 1IS4A 3ILNA 3VKOA 4KC3A 1FX5A 4IYBA 5BXRA 1G9AA 2NP0A 2EXIA 1N1VA 3AK0A 1SR4C 4BMBA 3WHTA 3KQRA 5JMCA 1ULGA 4I2SA 1N1TA 1HQLA 3ZXGA 2WT2A 4I3NA 2WJSA 3WUDA 3FBYA 5BXTA 1K5UA 3ZSMA 4YFWA 2A3YA 5E24E 2SBAA 1WW4A 2ZHLA 2DUQA 5JVVA 1J1TA 1YYNA 1DQ6A 3O4BA 1NZKA 3OBRA 2LIQA 4ZFUB 3BAOA 1LHVA 4YOLA 3UD9A 3WMVA 2ZMNA 3O0XA 1G82A 3NBDA 5CAZA 1FV2A 3N0KA 2JE9A 4PF5A 3D5OA 5F8SA 2E4MA 5T5JA 1LOBA 4OZXA 1DQOA 3TC2A 1C57A 1W6MB 1GICA 4K1YA 4AVVA 2Y9GA 4A7YA 4Y1YA 4GKYA 3OGGA 4ITCA 3N7JA 4YZ3A 1CONA 1EV2A 1YRZA 1IS6A 3L2YA 3POKA 1WCSA 3ZPYA 1MR5A 3WDWA 5HCFA 1LHNA 1WW6A 3SNMA 4K21A 3WDUA 4GKXA 1TIEA 3BOPA 4GWMA 1N3PA 2DVAA 3USUA 3BRGC 1M2TB 1BLAA 8I1BA 1N1SA 3OY8A 3TAYA 1FWUA 1KNMA 1UPSA 1SLIA 1ISZA 2VSAA 3BB2A 5GLZA 4QBCA 4D69A 2ZR1B 3AP9A 3O12A 3AZXA 4J2KA 4UW5A 2P3KA 2VSEA 4JPZA 4I4SA 4ENDA 1O4YA 1ONKB 3ZC8A 4PBPA 1CPNA 1DQ4A 1SCSA 3M3EA 3M3CA 4I4PA 2E4MC 3VWCA 2A6VA 1Q56A 4P9YA 1UN1A 3IKWA 3PUBA 4USPA 2D6PA 4EEEB 5GLWA 4G1RA 3CA6A 2YUGA 4TYSA 5IT6A 3PVEA 1GKBA 1S0BA 2GNTA 3WA1A 1JT3A 4YG0A 2YXSA 5T54A 1QGLA 4FPGA 4OEFA 1QOSA 1PC8B 2DV9A 4ZGRB 1FAYA 2HZ9A 5I1BA 2NTDA 2DWRA 1LULA 3CA4A 2P23A 4I4UA 3M3QA 4Q8KA 4XBLA 1YTOA 1LHUA 2A70A 2ZGMA 4M01A 1BLDA 2DUOA 1W6NA 5JDBA 3IPVB 4LO7C 2DRZA 4JCKA 4XJ8A 3UJ4A 2G4IA 2YV8A 4ATFA 1WW7A 4XMAA 1PUMB 4QKSA 3IN9A 4I4QA 3WO3A 4P14A 5JLVA 1JTCA 1MACA 1HKNA 4I7IA 2P3JA 4OWKA 4DRVA 2BQPA 4RL7A 1ENRA 3AYEA 4XXAA 3B3QE 5BXSA 2R49A 1K5VA 3Q7YA 3FLPA 1MZ6A 4D0ZA 1S0LA 1HCDA 3W9TA 2ZABA 3MALA 1BARA 3AJ5A 4J2XA 3BRFA 3DUIA 4HR6C 1LOFA 2GN7A 4P0JA 3QLQA 5H9RA 5H9SA 5HPZA 3CNAA 1OKQA 1BJQA 1TFMB 2ZHNA 3LTQA 2JECA 1JT4A 4Q26A 2EXJA 1GZ9A 1FV3A 5EG6C 4XIKA 1CQ9A 2D6KA 4M00A 3TB0A 3OGFA 2GDFA 4ZOTA 5F8WA 3PG0A 1GYKA 4YZ2A 2ZZJA 5GLTA 2VUAA 3VKLA 1IRPA 2ZGRA 5T5LA 1G7YA 1LEDA 4DEPA 1W0PA 2KI6B 4ISQA 4X3AA 3HOMA 3POSA 3B00A 1AVAC 3VSZA 2AXMA 2A71A 2UU8A 1VALA 3WLUA 2EF6A 2W39A 1W6QB 1N3QA 3T2TA 4I4YA 2PHWA 3AP6A 2VY0A 3WNXA 1AXKA 3VUOA 2WT0A 1TEIA 2XG3A 3AJ6A 4I0YA 5IK7A 2OW4A 3IM6A 2D1ZA 1ISYA 2WKKA 2ZGUA 4GOVA 3UK9A 1UAIA 1JN2P 2VW0A 1KQRA 1DQ2A 4IQPA 3CA5A 3BIWE 4QD2B 1HLCA 2AYHA 2EALA 5DXDA 2P37A 4H9WA 3FJFA 5CA6A 1DQGA 1SLBA 1UZYA 4PCRA 4FGFA 1G8WA 5JOYA 3A23A 2Q9XA 1AXMA 4AGRA 4EKXB 3Q7XA 1JHNA 5FZYA 1IS3A 4GP0A 2DTWA 2E53A 2ZGKA 6I1BA 1ONAA 4ZFYB 4R9CA 5EYYA 2HWMA 3M3OA 4I4VA 1V6WA 3IPVA 2W08A 1WLCA 1TOOA 3AYDA 3N7MA 3AP7A 1XZZA 1XHBA 3I4IA 1WUVA 5CBLA 2VW1A 1NXD1 2XOAA 2UWBA 3CA3A 3VV1A 1AFCA 4UW4A 3ZXEA 3NBNA 2D24A 4GWNA 3K1XA 4GAIA 1G9FA 3V0AB 1JY0A 3D4KA 1AVUA 3JUUA 2QYIB 3USUB 3ZSJA 2ZQNA 3O4DA 4GXLA 3W59A 3M2MA 4FOWA 1RY7A 2RSTA 1FQ9A 3OY8B 1V00A 1PZ8A 4YW5A 4Q91A 3F1RA 5GLUA 3CQAA 1EVTA 3O49A 4D8HA 4LO2C 5GLVA 1QNWA 1ISWA 3FGMA 4ISRA 1S0CA 1LGNA 1S0DA 4LBLA 4CTEA 3RSJA 1X50A 1VLNA 1ZA4A 5EC5A 4G9NA 4XFUA 4XOGA 1VAVA 3INAA 1KITA 5JOWA 5DUYA 3OPZA 1S0GA 3ASIA 1APNA 3GNEA 3QR5A 4HANA 1DIWA 4JRAA 3A0KA 4M3CE 1BYHA 3UJ0A 3CU1B 3FLTA 1G86A 2R9KB 1MS3A 1URXA 1MS8A 2E7QA 4I4OA 4EFQA 1QKQA 4WV8A 4Y24A 2GALA 2Q5TA 1B09A 1HCEA 2KM2A 1RZOB 2MIBA 5D63A 4YZ5A 1FMMS 2A7AA 5BXPA 1E0OA 2ZGTA 2GN3A 2ENRA 4DFSA 3BAGA 2WBCA 3O4OA 1WLDA 4GP3A 1MZ5A 1DGLA 2C9AA 1DZQA 3PHZA 2MC2A 1W6NB 2WT1A 4CJMA 1EYLA 1W6QA 3I2XA 3JUTA 1P63A 2ZQOA 1XG6A 2UWCA 1ULCA 3FUQA 5JOZA 4ZBVB 2VH9A 1PZ7A 1V6JA 1V6IA 1S0FA 3N35A 2EXHA 1RG8A 1LECA 1GZWA 3SNVA 4G9MA 5GZFA 3AH1A 4KEKA 4Q9PA 2P39A 3CRHA 1Q8VA 1ZM1A 4Y22B 4QC4A 3AZZA 5F5QA 2DREA 1A8DA 3VT0A 4XFTA 2KKIA 1V6LA 4OEEA 1FMZA 4WBCA 2D6NA 4OWLA 2I2SA 4DCKC 3CA1A 2V5YA 2ES3A 2R0FA 3V79C 3NBEA 4FPYA 1G9CA 1XYFA 1I1BA 2A75A 3AJYA 2Z42A 1DZDA 4H04A 2ZGQA 3SH3A 1SBDA 5BQUC 3PJQA 2XB6C 3AZYA 1IT0A 1G9DA 1UL9A 1VAMA 3AYCA 4Y1VA 1Q04A 1DHKB 2VU9A 3R4SA 3QCWA 2ZGOA 4XJAA 5BOWA 3CAHA 3F62B 1ENSA 1JT5A 1JOJA 3ENRA 3V0AA 4Y1ZA 1W3AA 3FJBA 4LBQA 1GANA 2ZGLA 3FJ8A 3WDTA 3UD8A 2ZACA 4L4IA 3V65A 5FZZA 2GNMA 1ULDA 1JYIA 3O5WB 3D7WB 4LO0A 3AKIA 4R9BA 5D61A 3D6EA 3QYDA 4YW3A 4YFZA 3BA7A 1FNZA 1MD6A 3LSDA 1DZCA 1TWMA 3JU9A 4QD2C 2SLIA 1AVWB 4ZKTB 4Q1RA 1JXNA 4I4RA 3KM5A 4P9XA 4C1XA 4XJZA 1PUUB 1CPMA 1DLLA 4QO3A 3T1MA 3WG2A 2EXKA 4J2SA 3VKNA 1SZ6B 1S1AA 4MYEA 1V6KA 3WZ1A 4YM1A 1WBFA 4P0LA 2D7IA 1R1ZA 2PHXA 4LO8B 1YO8A 2AFGA 1AJOA 3A07A 4R9DA 1Q1UA 4FOQA 1DYKA 3DGTA 4GAFA 1YBIA 2AUYA 5DUUA 3AP4A 3BAVA 1WBLA 2RHPA 3ATGA 1RITA 2IWTB 1W6OA 2Z48A 3PVNA 2F2FA 2PHFA 3H6SE 4OEGA 1V6NA 1Q03A 2CYFA 3O4AA 3A0NA 5JOXA 2DRYA 3SH4A 3WG4A 5IK4A 2OVUA 1Z78A 1RIRA 3V0BA 4IHZA 3RRDA 1M16A 3IM0A 2DVFA 5H9PA 1MS0A 1LHOA 3R05A 2DU1A 1Q8SA 4JC1A 2DS0A 4YG6A 3H6QA 3S8JA 1FYUA 2E51A 1SBFA 4K20A 3SITA 1AX1A 1EPWA 4ZFWB 4XBQA 1PZZA 4Y22A 2X2SA 1LODA 2Y9WC 5F8YA 2NN8A 2W68A 3O3QA 2FHRA 1L2HA 1RINA 3NBCA 2CNAA 3SH5A 1W0OA 4JKXB 2D20A 4X38A 3FFZA 3P6JA 2JKBA 4R9AA 2UWAA 1S0IA 3M1HA 4G6JA 4X37A 4PC4A 1QXMA 4WZFA 5KXEA 1AJKA 3BADA 4FPJA 3AZVA 1ITBA 1U0AA 2A6ZA 5LK5A 5E8AA 3JRRA 4ATEA 4Q8LA 5FREA 3O0VA 4LO1A 1T9FA 1LU1A 3FJ9A 3A21A 2GNDA 1SACA 4BMEA 3MW3A 5F90A 2D3RA 31BIA 1I3HA 3ZXJA 1LOEA 1D2SA 1DJSB 2AQZA 1RMLA 3WOGA 4LBOA 3WDXA 1IOBA 2ZBJA 2Z49A 5F9TA 2D6MA 4F83A 4FP3A 5GZDA 4YZ1A 4M3CF 1ABRB 4I8MA 1SLAA 5B2HA 3IMNA 3VSFA 1W3GA 1S0EA 2WSUA 1QMJA 1QDCA 4KEJA 2A6XA 2PHUA 1Z4SA 3ILFA 1Z0HA 1CR7A 2M49A 4LO3A 1YIFA 3EF2A 4LBNA 3FJEA 2R16A 1MVQA 3WHUA 1Q8OA 4Y26A 9ILBA 5D62A 3B9UA 1LJ7A 1GZWB 4D0TA 4FPHA 4BM8A 4ZXKA 3FUOA 1LOFC 5GAQA 1ISXA 1IHKA 2GMPA 4M3CB 2P2KA 4YW2A 1FWVA 2K4AB 5FNWA 3S8KA 1JBCA 4KEIA 4IONA 1DFCA 1GNZA 4HL0A 1TWEA 3FJIA 1LTEA 2ARXA 3AYAA 2ZA9A 4R6UB 1HDKA 4BQ1A 2WRYA 1BXHA 3BX1C 5DUXA 2HW9A 1OFSA 3ZXDA 3IAGC 5HCAA 3FLRA 1BA7A 3HSMA 2PELA 1AVBA 4I6IA 2ZAAA 2GO2A 2I1BA 2W52A 1MS4A 4JQ0A 4QKRA 1F31A 3WO4A 3WG3A 1Q8PA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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