3RMXA

Crystal structure of hcr/d f1240a mutant
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
415
structure length
404
Chain Sequence
NSINDSKILSLQNKKNALVDTSGYNAEVRVGDNVQLNTIYTNDFKLSSSGDKIIVNLNNNYENSSVSFWIKISKDLTNSHNEYTIINSIEQNSGWKLCIRNGNIEWILQDVNRKYKSLIFDYSESLSHTGYTNKWFFVTITNNIMGYMKLYINGELKQSQKIEDLDEVKLDKTIVFGIDENIDENQMLWIRDFNIFSKELSNEDINIVYEGQILRNVIKDYWGNPLKFDTEYYIINDNYIDRYIAPESNVLVLVQYPDRSKLYTGNPITIKSVSDKNPYSRILNGDNIILHMLYNSRKYMIIRDTDTIYACSQNCVYALKLQSNLGNYGIGIFSIKNIVSKNKYCSQIFSSFRENTMLLADIYKPWRASFKNAYTPVAVTNYETKLLSTSSFWKFISRDPGWVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Novel Ganglioside-mediated Entry of Botulinum Neurotoxin Serotype D into Neurons.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type D
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 89
structure length 404
sequence length 415
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3rmxA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3rmxA02
4X3AA 4GAFA 3WDUA 5FZZA 4G1RA 1S1AA 4DFSA 1QNWA 4PBOA 4X38A 3BODA 3M3CA 2FDBM 4BLJA 5JLVA 1DQOA 2WJSA 1N1YA 1PUUB 4YW2A 4YFZA 4LO2A 4PC4A 2EXIA 4Y24A 3AJ6A 2ZZJA 1AF9A 1NUNA 1VCLA 1VIWB 2JD4A 4PBPA 2Y9GA 1II4A 4BLIA 1KITA 2ZGTA 1RITA 3NJ5A 4FPCA 4KEIA 3B00A 2GO2A 1WBCA 3JUTA 1WBLA 1G7YA 3F62B 4PCRA 2A70A 3AZXA 3ZSLA 4Q9GA 2IWTB 4AYUA 3AP6A 2DS0A 3FLRA 4CJMA 4HA2A 3CQAA 4LBLA 1GANA 1MS1A 1G82A 4D0TA 1WD4A 5F90A 4M01A 4AVSA 2ZMLA 3ZSMA 3IM7A 5T52A 3OJMA 2P3JA 3IM5A 3AXEA 1APNA 4XHXA 4QKRA 3AP7A 3S8JA 4XBQA 3O5SA 5GZEA 3HR9A 3CAHA 4I1BA 2DVGA 3RG0A 3UDAA 1A3KA 2CWSA 3RTIB 3B69A 4Y1VA 5F5QA 1QDCA 1QQKA 3UD8A 1T9FA 3RTJB 1FWVA 5I1BA 5CA6A 4LBQA 3C9ZA 1DZQA 1JT4A 2ZAAA 4I37A 4EFRA 5EYYA 1F31A 1AXKA 1S0BA 3NBEA 1ULFA 1V6KA 5GZFA 4YGBA 3PUBA 1C4RA 1X50A 5BXSA 2C9AA 1ULDA 2XOAA 3KMVA 1O4YA 4QC4A 1ENSA 5FZUA 2D20A 3R4UA 3T8SA 3MW3A 2NZ9A 2JE9A 4FPGA 3TAYA 2AR6A 2NP0A 2MC2A 5JOZA 4OWKA 3O44A 2CTVA 3CRIA 3H6RA 1QOTA 3PHZA 2GNDA 3TC2A 2DTWA 3WZ1A 5GALA 4FOQA 3B9UA 3POSA 1LESA 1LTEA 2DREA 2E4MC 5F8YA 3VSFA 4XTPA 4L4IA 2ZGRA 3WUCA 3S8KA 1DHKB 3WDYA 1W6MA 3AZWA 4BPZA 2FMDA 3CA1A 4I4PA 3FJIA 2A3YA 3JUUA 3N7KA 3UD7A 4XTMA 4HR6C 1ULEA 4H55A 1F9KA 3AXDA 1DIWA 3FJHA 3ATGA 4AVVA 2P3IA 2NMNA 2HWAA 1K5UA 1DZDA 4Y1ZA 4BMEA 2R0FA 5T5PA 1N47A 2X2SA 4YZ2A 3NWKA 2ZQOA 4P9XA 3ZC9A 1FGAA 2ZHMA 2SBAA 2A6WA 2DRYA 3VUOA 4RL7A 3WHTA 4BMBA 5T5JA 4TYSA 3HBWA 1CESA 3AP4A 1AXZA 2RHPA 2WNEA 4JQ0A 2WSUA 1MC9A 1YTOA 2LIEA 2CYFA 4Y1UA 3WO3A 2WT0A 3LLPA 1RZOB 2W68A 2DVBA 4FOWA 3HMYA 1A8DA 4Q2FA 4J2YA 1ZM1A 1LOGA 2EALA 4XJAA 3ZYRA 3AH4A 1QU0A 1CJPA 5F8WA 2Y9WC 4QBCA 3W59A 5BP5A 4Z8SB 3FJJA 3VSZA 3IPVA 4I0YA 1AVWB 3CA0A 2YUGA 1GV9A 4F34A 2W08A 2A6YA 4I4SA 2UWBA 1JY0A 3POYA 4Y22B 3SH4A 1MS0A 1WLCA 5H9SA 2LALA 2E7QA 5JMCA 4R6UB 2KH2A 1BFFA 1CPMA 2DVDA 5B2HA 2PHFA 4YW3A 3QCWA 4I4UA 4JCKA 1RMLA 3AJZA 1V6NA 4AGVA 2ZGOA 3B9CA 4G6MA 5T55A 1S0LA 1EVTA 3P53A 1SFYA 4LO0A 2OUHA 1OKQA 2D44A 3UD9A 5H9PA 2D7IA 4G9MA 3BRFA 4I4XA 1WCSA 4LBQB 3L2YA 5E8AA 4IONA 2CWMA 2R1BA 1W3FA 1FV3A 4PQ9A 3Q7YA 6I1BA 4YM3A 2GALA 3C2UA 4I1EA 1HWNB 1IKPA 3FJ8A 3H6QA 3SH3A 1J1TA 5T5LA 3B01A 5JOWA 4Q1RA 2J3PA 2K4AB 2NTDA 5EYXA 3SLIA 1QXMA 5DG1A 2VW1A 1MZ5A 3AFKA 5D63A 3INAA 3WVJA 1W6PA 3WG4A 2PHRA 3O4CA 3IMNA 4LBJA 4FOYA 1AX0A 3U4XA 1R8NA 3B3QE 4FPOB 3QYDA 3ENRA 4HJJA 41BIA 1W6QA 1JXNA 1DYPA 5EG6C 3AJYA 1ISWA 4R9CA 1IT0A 1DFQA 3AYAA 1KRIA 1GBGA 2R0HA 3W58A 4QD2B 4K1YA 2NN8A 1CE7B 3OJ2A 2P37A 3O0XA 1LGCA 2EXKA 4Q8KA 1KNMA 3FGMA 3O49A 2M49A 2A6XA 1AXYA 5GLVA 4DS0A 1FN0A 1ISYA 3RMXA 1V6IA 1UX6A 1V6WA 3DUIA 2GMPA 5HCFA 1JOJA 2CNAA 1DBNA 3A21A 2D3PA 4ZXKA 4YG6A 1Z78A 2R1DA 4YGEA 3BRDA 1I3HA 4P14A 3VKMA 1ISVA 1PZ8A 1Q8PA 4GWMA 3IAGC 3WOGA 1WLDA 4FQZA 2PHXA 4YOLA 3LTQA 4ZBVB 1LOEA 1MR5A 4XHBA 3ZC8A 3ILFA 4M3CB 1TOOA 4ZGRB 1AX2A 1LOBA 1O4ZA 3H0OA 2LTNA 2EIGA 4YLZA 1DQGA 2BEBA 2AFGA 3VKOA 5BOWA 4XXAA 4LO7B 2IHOA 4DPNA 3FJEA 4KC3A 1HCEA 4W65A 1EV2A 3JU9A 2D43A 1VLNA 21BIA 1ENRA 1M16A 3P6JA 4XJ8A 1AXMA 4WZFA 1LGNA 4YG0A 2B7YA 3OYWB 2VLCA 5FNWA 1BXHA 5T5OA 4G6JA 5H9RA 1QKQA 1WBFA 1TIEA 1MS9A 3ZXEA 3NV1A 1LHNA 3FFZA 2E51A 1TEIA 3LSDA 3VKFC 2A3WA 1E0OA 1IS3A 3A07A 4DCKC 4EFQA 3FJCA 3JRRA 3CA3A 2JE7A 1V6JA 1IS4A 3ILNA 4GALA 1JHNA 3MW2A 1JQZA 1MVQA 1Q8VA 1DGLA 3MALA 4YM1A 1G9FA 5JDBA 2F2FC 4Q8LA 1JT7A 4TLPA 1LECA 3IM0A 3A0KA 5DZUA 3V0AB 1QOOA 1HQLA 1FATA 4X37A 4UW5A 2R49A 2QYIB 5GLTA 3VT2A 5DZEA 1OQLB 1W3AA 3N7LA 3ZXGA 2FFVA 3WDVA 1BZWA 3AZYA 2VSAA 1GGPB 2WSVA 1W6OB 2UU8A 2KLLA 3LSEA 2EXHA 1C57A 1IHKA 2VXTI 3SITA 3W9TA 4MYEA 1OQ1A 4PF5A 3I29B 4OW4A 4A7ZA 4WVWA 1LJ7A 2D6MA 3BTAA 3WNXA 4XMAA 4LO1C 1SR4C 1GKBA 3OJVA 4AWDA 3O4DA 4D69A 1BQPA 4FGFA 3SH5A 1AJOA 1BFBA 1W6NB 1LEMA 5HCAA 4I2SA 1HIBA 3MW4A 3OBRA 1RIRA 1H9PA 2KM2A 4ZOTA 2PHTA 4XIKA 3Q9OA 3O0WA 1I1BA 2D6OX 2HZ9A 3R05A 1JYCA 1GZWA 1D2SA 4GKYA 4DEPA 3ZVXA 2ZKNA 3RRDA 2F8XC 2I1BA 3HSMA 2A6ZA 1KQRA 2E4MA 4DQAA 4YM0A 4JRAA 4XYXA 2AYHA 1LCLA 4XFSA 5IK8A 2GMMA 2P2KA 3V0BA 2JJ6A 1SLIA 4HANA 3CRGA 4GKXA 4Y20A 4AGGA 5BXPA 2DRZA 2ZBJA 4YZ4A 2X2TA 3BIWE 1GZ9A 3UJOA 1V6OA 2ERMA 3AYCA 1YO8A 4UW6A 4XJZA 3FJ9A 1C1LA 2Q5TA 1AVAC 2VXRA 1YBIA 1HCDA 1WW4A 3O3QA 3A4UA 1KDKA 4XDQA 1EPWA 4NOTA 2A71A 4HL0A 2P34A 3RS6A 2AAIB 3NBNA 1ENQA 2Y9FA 2DV9A 4RA0A 1PC8B 4IY8A 3ILRA 4I4OA 4USOA 4USPA 2EXJA 4TZDA 4I4QA 3N35A 1V6XA 3APBA 2YV8A 2Q3NB 2D7RA 1MVEA 3Q7WA 1SLBA 4LBOA 2NM1A 1NZKA 2FFUA 4ATFA 1DFCA 3OY8B 4YZ5A 1TFMB 2V73A 1URXA 3USUB 4XZPA 3V64A 3AYEA 1SACA 3PVOA 5SV8A 5GM0A 1MS4A 5LK5A 2GDFA 2AH2A 5F8SA 2WQZC 3AYDA 2P39A 1AVXB 1GLHA 4DRVA 1KJRA 4M00A 2A75A 4D8HA 3N7MA 5GLWA 1FNYA 3AKHA 2FO1A 3KM5A 1W0OA 4I3NA 1PWAA 5JOXA 4EB2B 1MS5A 1N3OA 1JBCA 4GA9A 3FUOA 4OEFA 1IS5A 1CPNA 3AH1A 1QGLA 4WV8A 3BRGC 2AUYA 5DUXA 1FWUA 1DJSB 2VH9A 1JLYA 2D6LX 2DVFA 1DQ1A 4YW5A 1XYFA 3ILAA 4FPHA 4OWJA 4QD2C 4Q9PA 3VWCA 2NMOA 1IJTA 4Q1PA 4YM2A 1QNYA 1PZ7A 1HKDA 2YROA 4IZEA 4FP2A 3AK0A 1Q1UA 4ZFUB 4IYBA 5E89A 3BB2A 2VSEA 4AGRA 1V6VA 4OEGA 4Y26A 2P3KA 4G9NA 1GZCA 5BXRA 3VT0A 1UZYA 3OGGA 3HOMA 1SLCA 4QBVA 1G9BA 1WUVA 5FREA 4YGDA 1SLAA 1SLTA 2HWMA 3P6IA 5IK4A 1S0JA 4XJWA 1S0EA 2WLQA 4NO4A 4ASMB 1FV2A 1UZZA 3O0VA 3WV6A 2D1ZA 4I7IA 1JT5A 1FMMS 1R1ZA 2ZQNA 1BJQA 1LGBA 4H04A 4GAIA 2D6KA 5DZFA 2NVHA 2D7FA 4LO7C 3N7JA 3ASIA 2P23A 1HQWA 1LU1A 3AZVA 2PHWA 3OJBA 3HALA 2A3XA 1ULCA 4AVTA 4BQ1A 2Q9XA 3V65A 1SBDA 2OW4A 2KI6B 4QKSA 1WD3A 2FGFA 2K8RA 4I8MA 1CIWA 2DWRA 1QMJA 3T2TA 1JN2P 2D6NA 2RG9B 1SCRA 4R9AA 4UW3A 4JC1A 3ZPYA 3BA4A 1UPSA 1S0FA 1Q03A 2UURA 3IM6A 2ZGQA 3BA5A 4XIOA 5F9TA 5BQUC 3UK9A 4LO3C 3WG2A 2MLLB 1AX1A 3CU1B 1BKZA 3ZXLA 1LULA 3H6RB 2RSTA 2VW0A 1V00A 1DQ4A 4WBCA 4ZFWB 1IRPA 2ZGLA 4FPKA 3N0KA 3BAHA 4Z9WB 1WW5A 2HYKA 4FVVA 2AXMA 5D61A 5GLZA 1W6MB 1IOBA 3T1LA 1KJLA 3WUDA 1FQ9A 3AKGA 1G9AA 1BLDA 1BASA 1Q04A 2GNTA 1LHWA 2I2SA 1LOFC 1FAYA 3FUQA 1AZDA 2D22A 4YW4A 4D0ZA 4XBNA 3AJ5A 4AN7B 1QQLA 2Z42A 1JT3A 2D23A 1G9DA 4GOVA 4WVVA 3PMEA 4ZKTB 1F5FA 2VUAA 1LHUA 2Z48A 4DENA 7I1BA 3D6EA 4ITCA 3CNAA 3A0NA 1MS3A 3RMYA 2SLIA 3WMUA 4OEEA 2AQZA 1IILA 3ZXKA 4XOGA 2ZGSA 2QN4A 2OVUA 4XXPA 3CA6A 4LO8B 2F2FA 1SCSA 2UWCA 2FHRA 3BADA 1DZCA 1ITBA 1HWOB 2WBCA 3A22A 4JKXB 2A7AA 4JP0A 2EF6A 2ESUA 1SBFA 3F1RA 2AENA 2PELA 3N3HA 4JKQA 3WCSA 4IZXA 1IKQA 4JAWA 2VY0A 3AZZA 5EXOA 3M2MA 2WKKA 2YY1A 3SNMA 1QDOA 1YIFA 2RQ9A 3N36A 1TP0A 1YYNA 1S0IA 2R16A 4XBLA 2DURA 2GN3A 1MD6A 3IPVB 2ZHNA 5GJ6A 4YGCA 1I1EA 3GNEA 4LBKA 1GICA 3DGTA 4J23B 3OGFA 4LO1A 1SR4A 1LHVA 3PG0A 1AFCA 1MACA 1V6UA 3WDWA 1RG8A 1S0DA 4LBQD 2WRYA 2VU9A 4XJ9A 3NBDA 4A7KA 1BFGA 5EWSA 1PZZA 2W52A 1DQ5A 4FP3A 2E53A 4DRRA 1LENA 3CA5A 1YRZA 3WINC 2KI4A 4II0A 1IRAX 3AP5A 2CY6A 3O4AA 3BAQA 4GWNA 2PHUA 4BM8A 2ZHLA 1DQ6A 3D5OA 3IKWA 2ZR1B 1MZ6A 4X39A 4ZFYB 1LU2A 1XZZA 4P6AA 4P0LA 5T50A 3R4SA 1TTUA 2ZA9A 4XJUA 3FLPA 3AKFA 1FMZA 1ZA4A 3SNVA 4FQ4A 4GOYA 4ISQA 5KXCA 5IUQA 4Y22A 5DUUA 4UW4A 2GNBA 3NBCA 2V5YA 1CQ9A 4P0JA 4M3CF 4XKIA 2ZHKA 2ZGUA 4YZ3A 2R9KB 5DUYA 3PJQA 1W6PB 5KXBA 4ENDA 1VAVA 1B09A 1ULGA 1UKGA 5H9QA 4YZ1A 4LBNA 2GMEA 1W6QB 1N1TA 1N1SA 1G8WA 1U0AA 3T1MA 1VAMA 3UJ0A 5JVVA 4LO2C 1ONKB 2ZGKA 4XFUA 1H9WA 4K21A 5FNXA 2ZMKA 4C1WA 4LBMA 1ONAA 4EKXB 5AVAA 1PUMB 3QLQA 2D24A 1XHBA 3FJDA 2ES3A 3O12A 1UL9A 4FPLA 5E24E 2ZGNA 2ERFA 1S0GA 5CNAA 4Y1YA 4A7YA 4IY9A 1W3GA 1UMZA 5JOYA 2Y9XE 1AJKA 4U2AA 3MEPA 4YW1A 4OWLA 3WG3A 3FJAA 1UAIA 3IN9A 3UJQA 4Q91A 1DQ2A 1HKNA 1LEDA 2OUJA 1YI7A 3D7WB 2E6VA 4FPEA 4OUJA 2MIBA 1KDMA 3WMVA 1NLSA 2BFHA 1QOSA 3KQRA 5HCBA 1XQNA 2W39A 1EYLA 1WW7A 3NV2A 3PVEA 4YFWA 1WLWA 3GALA 3SISA 4C1XA 3RQ0A 3AP9A 3WDXA 4IHZA 4CTEA 5CB7A 1SBEA 3ZXFA 1V6LA 4Q27A 1QF3A 1LOCA 4I4RA 2JECA 4I4VA 5BYNA 5GAQA 3FJKA 3BAVA 1C1FA 1JLXA 4QO3A 2JDZA 3I8TA 4KEKA 3ZXJA 1BYHA 4GXLA 1Q56A 1W0PA 5CBLA 1LODA 4R9BA 1G86A 1GSLA 1V6MA 2ET2A 1DLLA 2A5ZA 4M3CA 2CL2A 2YXSA 4I4YA 1GNZA 1ILR1 3O4BA 5HPZA 4P0KA 5D62A 1LHOA 3M3QA 4H9WA 3CA4A 1HDKA 1P63A 3BX1C 4FPYA 4KEJA 1H30A 5BXTA 3FJFA 3QR5A 1Z2VA 4SLIA 1CVNA 3OYWA 2XB6C 1JTCA 3IIRA 3K1XA 2C5DA 1S0CA 1LOAA 2E7TA 2XG3A 3HN1A 3BA7A 2ENRA 3WA1A 2YZ4A 3MPPG 4L8QA 3UL2A 2EAKA 2BEAA 1JUIA 4GP0A 1Y7BA 2ZGMA 5T54A 5GZDA 1Q8QA 1YF8B 2D6PA 5EC5A 3AH2A 1A78A 2DUOA 4M3CE 1BA7A 2GZBA 4CZSA 2ZABA 2L5XA 5BQUA 4XFTA 4LO3A 1SZ6B 3NV3A 3V0AA 5IK5A 3ZSJA 2G4IA 1TWMA 3WG1A 1WBAA 8I1BA 1GZWB 5E88A 1YXWA 3ZSKA 1T4QA 2UUSA 1K5VA 2ARXA 4U36A 3CRHA 3ZXDA 5DG2A 1RY7A 3A23A 31BIA 4FOVA 5GZCA 4ISRA 3ZYPA 3AX4A 1W6OA 4EFPA 3H6SE 1Z0HA 1G9CA 1Z4SA 3V0BB 4J2SA 4JPZA 5BP5C 5KXEA 1N1VA 1HWMB 5GLUA 3VT1A 5IK7A 4Y20B 1GNHA 1DQ0A 1LOFA 4ZLBB 5G00A 3O4OA 2H0BA 3FJBA 1CR7A 2DYCA 1IOAA 1AVUA 5KXDA 1IS6A 2DU1A 4AN6A 2UWAA 1M2TB 3UJ4A 1UN1A 3BAUA 1BLAA 3V79C 3ZX7A 1W6NA 3WCRA 3VKLA 3BAGA 4CRQA 4J2XA 3BOPA 3D4KA 1CN1A 3WLUA 3VEQA 3LCPA 3M1HA 3NV4A 4P9WA 1SLLA 1D0HA 3TB0A 1CVSA 1WW6A 2KKIA 4Z8BA 2A6VA 1AVBA 3OBTA 2AREA 5DSSB 2D3SA 1JYIA 1XG6A 2TEPA 3VKNA 4FPJA 4R9DA 1VALA 4LO0C 1FNZA 5FZYA 3Q7XA 2GNMA 2DU0A 4K20A 3RSJA 2WT1A 5CAZA 2K43A 3I2AA 1R8OA 4FPFA 2ZACA 2YMZA 2ZGPA 4EEEB 3WDTA 3BAOA 1PZ9A 3VV1A 4GP3A 4L4HA 2AGSA 3POWA 4QALA 3PVNA 1BFCA 4P9YA 5EHAA 5DUVA 2DUQA 9ILBA 1N3PA 2BQPA 5DUWA 2Z49A 4I96A 3I4IA 3FLTA 2DVAA 4ZA3B 3WO2A 3M3OA 1HLCA 1OFSA 2D3RA 3WHUA 4IQPA 1ISXA 1NXD1 4XE9A 4K1ZA 1N4KA 1MS8A 4I30A 2DTYA 4ATEA 4XMIA 3WINA 5DXDA 1CONA 4Y1XA 3E8LC 1DYKA 2ARBA 4KBBA 4J2KA 3O5WB 4BOWA 5L73A 1L2HA 3POKA 1N3QA 5GZGA 3I2XA 2GN7A 3OY8A 1Q8SA 2DUPA 3USUA 2NYYA 1FYUA 3EF2A 1RINA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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