3RSJA

Structure of hcrf in complex with ganglioside gd1a
Total Genus 105
50100150200250300350400020406080100
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
413
structure length
406
Chain Sequence
IKDNSILDMRYENNKFIDISGYGSNISINGDVYIYSTNRNQFGIYSSKPSEVNIAQNNDIIYNGRYQNFSISFWVRIPKYFNKVNLNNEYTIIDCIRNNNSGWKISLNYNKIIWTLQDTAGNNQKLVFNYTQMISISDYINKWIFVTITNNRLGNSRIYINGNLIDEKSISNLGDIHVSDNILFKIVGCNDTRYVGIRYFKVFDTELGKTEIETLYSDEPDPSILKDFWGNYLLYNKRYYLLNLLRTDKSITQNSNFLNINQQRGVYQKPNIFSNTRLYTGVEVIIRKNGNTDNFVRKNDLAYINVVDRDVEYRLYADISIAKPEKIIKLIRTSNNSLGQIIVMDSIGNNCTMNFQNNNGGNIGLLGFHSNNLVASSWYYNNIRKNTSSNGCFWSFISKEHGWQEN
50100150200250300350400400300200100
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
publication title Unique ganglioside recognition strategies for clostridial neurotoxins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/F
total genus 105
structure length 406
sequence length 413
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3rsjA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3rsjA02
5BXTA 1F9KA 3BA7A 4J2SA 4I30A 3RTJB 2ARXA 3WG2A 1WW6A 3Q9OA 2A75A 3UL2A 3RTIB 3BRFA 1Q8OA 3BRDA 4XHXA 4PQ9A 1XHBA 3WG1A 2BFHA 5DSSB 2W68A 2A6ZA 3POSA 1SFYA 4RA0A 4R9CA 1ENQA 2P3JA 2ZZJA 1JT5A 5HCFA 1HWNB 3BAGA 3DGTA 1MVEA 1ISXA 1Z4SA 4G6MA 1Y7BA 5FREA 1W3FA 1BFBA 3WDTA 1G9BA 3AKFA 3QR5A 3WINC 3R4SA 1GZWA 5DUVA 1AJOA 1CE7B 1NZKA 1PZ7A 41BIA 1SBDA 2YMZA 1V6JA 4EB2B 3M1HA 1PZ9A 3M3CA 3JUUA 3MPPG 1LESA 1VALA 3N0KA 3VSFA 5EG6C 4M3CF 2FFVA 2DVBA 4LO1A 1V00A 4Q1RA 2GN3A 4XHBA 5D61A 4ZLBB 2H0BA 4FPJA 3VT0A 1TFMB 4LBLA 2DVDA 4QBVA 2ZHNA 1KDKA 2P37A 1WLDA 1LHOA 3AJYA 1SACA 1GNZA 3ILAA 1A3KA 3INAA 1O4ZA 4A7KA 5KXDA 1BA7A 3OGFA 3UD9A 1NLSA 3TC2A 1PUMB 2UWBA 6I1BA 1ZM1A 4J2KA 5T5LA 4XMAA 2PHFA 5HPZA 3ZXDA 1LEDA 1HLCA 4LBOA 2ESUA 1NXD1 1PUUB 1CESA 1ABRB 2C5DA 4QBCA 2LTNA 1S0DA 2ZGQA 1MD6A 1CR7A 3CA0A 2EIGA 2AH2A 5EYXA 2PHTA 1TOOA 3POYA 2MLLB 1P63A 4H04A 2ARBA 4JAWA 3POWA 1JT3A 3B9CA 1ULDA 4P9XA 2AENA 4PBOA 5BQUC 3BA4A 3MW2A 1W6PA 4I37A 4QKSA 2OUJA 1TTUA 5GZDA 3UJOA 3BODA 4D8HA 1C57A 2DUQA 1FQ9A 4BPZA 4GAIA 2DREA 1ONKB 5IT6A 2WLQA 2OVUA 1W6NB 2E6VA 4GP0A 4Y26A 2V73A 4WVWA 4XTMA 4LO2C 2ZMLA 3O49A 3SH3A 4Q9PA 4LO7B 2D3RA 2GNDA 5GZFA 1WD4A 1V6VA 1BQPA 3JRRA 2NMOA 1SZ6B 1XG6A 2R1BA 2A6XA 2RSTA 3BIWE 2E7TA 3SNVA 2R0FA 4F34A 1E0OA 5FNXA 5IK4A 1DIWA 4Y22B 4FP3A 4R6UB 3TAYA 1BLAA 4YZ3A 1KRIA 2JE9A 5FZZA 3O12A 2ZGLA 1QF3A 4XFSA 4UW3A 5T55A 1WLWA 2JJ6A 1Q03A 3ENRA 9ILBA 2AUYA 1N4KA 1BXHA 2GZBA 4OW4A 3A4UA 1FNZA 1UZYA 21BIA 4I8MA 4HJJA 4D0TA 4XJZA 1RZOB 1KITA 4I4XA 1URXA 2D7RA 1SLIA 3FJHA 2Z42A 1G7YA 4JPZA 1M16A 2D3PA 1N1YA 1WCSA 1W0OA 1WW7A 3WV6A 5EHAA 5DG1A 4LO1C 1LOEA 3AP5A 3P53A 1AX1A 4Q9GA 3LSDA 3KMVA 1DQOA 1II4A 2DVGA 5GLZA 4Y20B 2FFUA 3H6RB 3I2XA 1LHVA 3ZSMA 3SISA 4DRVA 1LJ7A 1SLAA 1N1VA 1LHWA 3NJ5A 3HBWA 5GLWA 3BAHA 3UJ0A 1CPNA 2ZACA 5T5JA 3CA6A 4ZBVB 1CVNA 4BMBA 2CWSA 3HALA 3FBYA 1Z78A 4II0A 3VKNA 1EPWA 2ZGUA 1GBGA 3VSZA 3KQRA 4QKRA 1MS3A 3VUOA 1HQWA 5CB7A 4YW3A 3LLPA 1FGAA 4X39A 3D4KA 2D6OX 4FQZA 4MYEA 3ZC9A 3D7WB 1G9DA 4XIOA 1JT4A 5IK7A 4J23B 1LHUA 2AGSA 1ULEA 2E51A 3ILNA 4JCKA 4AN7B 1IS3A 2ZGOA 3TB0A 3M2MA 4AVVA 1G82A 4PC4A 5F5QA 3BAVA 3AXEA 2GNMA 1LOGA 3BOPA 2YY1A 4XOGA 3BAOA 1GYKA 3WHUA 4YFWA 3HN1A 2RHPA 2K8RA 2WKKA 4Q1PA 3JUTA 2AQZA 2AFGA 1FNYA 1DQ0A 2D6LX 2YUGA 2AXMA 4YM1A 3AH4A 2VSAA 2VY0A 3A21A 3NV1A 4XYXA 4YZ5A 1GICA 5DZFA 3NWKA 3IN9A 4U36A 1A8DA 3USUB 5T50A 4YLZA 1WBAA 1LOCA 4M3CE 4DCKC 4G1RA 1Q1UA 2D7IA 2ZHKA 1HKNA 1MS0A 1WBFA 5KXBA 1RMLA 2ZGMA 3ZXFA 1WBCA 3O4BA 1HWPB 1C4RA 2A5ZA 1W0PA 3RMYA 1R8NA 5CAZA 5DZGA 3O4DA 1FYUA 2ERFA 4ATFA 1M2TB 4QD2C 4FPHA 3AFKA 1KJLA 3NV2A 3AXDA 1C1FA 2JECA 2GMPA 2HYKA 5E8AA 4XMIA 2KM2A 5F8WA 5GZCA 2A3YA 3FUOA 3CRIA 3CNAA 2D6PA 4DEPA 2DWRA 3Q7WA 1GZCA 2D24A 1X50A 4YG3A 3FFZA 1CPMA 3ZPYA 3UD7A 1OQLB 1T4QA 1LGNA 3GNEA 4GAFA 4I4RA 3SLIA 4ZA3B 3AJ6A 3O5WB 4KBBA 4OWLA 5D62A 1MS1A 3ZYPA 4JQ0A 2YROA 3A07A 5DVHA 4R9BA 2NVHA 3GALA 1N3OA 4FPFA 1Z2VA 1DZQA 4XKIA 3V0BA 3NV4A 4Z8SB 3VKFC 1PZ8A 5CNAA 5BOWA 3IPVB 1AJKA 4XJ9A 4Q27A 2DVFA 2Z48A 3UK9A 1QKQA 3MW4A 1LEMA 3N7KA 4X38A 1AVAC 2ET2A 4P9WA 5BYNA 1YYNA 1V6XA 2NZ9A 1QOTA 3WCSA 1W6NA 3W9TA 2EAKA 1Q8VA 5DZUA 3OYWB 3NV3A 2HZ9A 1S0GA 2WJSA 1DQ6A 1QNWA 1W6MB 3ILFA 2PHWA 1IS4A 3CA1A 4I4OA 3FJEA 4I4SA 1S0EA 3VT2A 3OJVA 4GP3A 1DBNA 1G9AA 4AVSA 3AP6A 2IWTB 4PF5A 2DU1A 3O0VA 1BFCA 4YG0A 2HW9A 4JC1A 5HCBA 2TEPA 2VLCA 2KKIA 3ZXLA 3FJBA 3JU9A 3IM0A 3DUIA 2K43A 4Y22A 4I1EA 1Q04A 4Y1XA 1UPSA 1ITBA 1PWAA 4C1XA 2YZ4A 1APNA 4G6JA 5EC5A 1MS9A 2A70A 3FLRA 3UD8A 3FJIA 3VKLA 1AVUA 4P6AA 3BX1C 3PVNA 2FMDA 1MS8A 5D63A 2PELA 1KDMA 3AZXA 4FOWA 3SH4A 4YZ2A 1ISWA 1N1TA 1R1ZA 2R9KB 1AVWB 4PCRA 2Q9XA 4IHZA 3ZSKA 1BFFA 3O4AA 1UZZA 3ZXEA 1DFCA 4XJWA 2GALA 4FPCA 2E4MA 2A3XA 2WRYA 1UMZA 4XE9A 4Y1VA 1IS6A 3FJCA 2RQ9A 1HWOB 4Y20A 3UDAA 4ISRA 3CA4A 3H6RA 1BLDA 3PVEA 3WDYA 4YM0A 4EFRA 5T5OA 1IRPA 4XJUA 4ZXKA 4P9YA 4A7YA 4JKXB 3RRDA 1I1EA 1ILR1 2DU0A 3V0BB 3FLPA 1SR4A 2JE7A 1BASA 1MS5A 5G00A 4M00A 3W59A 1WUVA 4DENA 4F83A 1MACA 4YGBA 2BEAA 2M49A 4FOYA 4GXLA 3B01A 3AJZA 2VUAA 3I4IA 5AVAA 3WZ1A 1WD3A 3PJQA 1QDOA 1DGLA 5FNWA 1IT0A 1CN1A 3ZYRA 3SH5A 2GO2A 1JQZA 1UN1A 4LO0A 2EXJA 4IY8A 1IOAA 5GZGA 3P6IA 4YFZA 2NTDA 3RQ0A 2WNEA 2C9AA 1SBFA 3I29B 2PHRA 3UJQA 4A7ZA 2WSUA 3ZXGA 4ENDA 2ZMKA 2A6YA 1AX2A 2WQZC 3M3QA 1PC8B 4BLJA 1MZ6A 1QOSA 3OJ2A 3P6JA 4NOTA 1BJQA 2Q3NB 2R1DA 2PHXA 3USUA 1JOJA 3AYAA 2FHRA 2QYIB 3ZSLA 4JP0A 3HSMA 3VKMA 4RL7A 1W3AA 3I8TA 2DVAA 1JYCA 4IZEA 3VT1A 5I1BA 1F5FA 5E89A 5CA6A 2W39A 1GV9A 4LO7C 1V6LA 5SV8A 1TWEA 2P2KA 4ZFUB 1WLCA 1NUNA 2ZGNA 1DJSB 3VV1A 5JOWA 3OY8B 4IONA 5T5PA 3VEQA 1TWMA 1QMJA 1FX5A 4YGEA 4XJAA 1EV2A 2XB6C 3NBEA 2WT0A 2P39A 4KEKA 5L73A 3CAHA 4M01A 1H9PA 4IQPA 3N7MA 5JOZA 3M3EA 2BEBA 4XDQA 2AREA 1XQNA 4I4YA 4OEGA 1JXNA 1YRZA 2VXRA 5F9TA 2Y9GA 2F8XC 3NBNA 2NMNA 1W6QB 1DLLA 1AX0A 5JVVA 1LGBA 4ITCA 4CRQA 2DRYA 5BXRA 2NN8A 4K21A 2E7QA 3AP4A 1UX6A 4BOWA 5HCAA 3A0NA 4GWNA 3HR9A 4Z9WB 2AAIB 1S0IA 4WZFA 3WMUA 2EXHA 1KQRA 1UL9A 1AVBA 4Y1YA 3FJAA 2UWAA 2E4MC 3ASIA 1ONAA 2A71A 1QOOA 2AYHA 2OUHA 1G8WA 2D20A 4ZFYB 3IIRA 2P34A 1EYLA 4I0YA 3IPVA 4DRRA 2NYYA 3B9UA 1J0SA 1MVQA 5F8YA 1ISZA 4L4IA 1SLTA 1FWVA 3CRHA 3Q7YA 3T2TA 2Y9FA 4XBNA 2MC2A 3M3OA 3N7LA 1YXWA 3LTQA 3FLTA 4H9WA 1LU2A 3OYWA 4OZXA 3WDWA 3ZXJA 1SR4C 1AXYA 4AN6A 1C1LA 3BTAA 4OEEA 3N7JA 4LO8B 2P3IA 1W6MA 3FUQA 3BAQA 1LOBA 1HKDA 4ZFWB 3AKIA 4HL0A 1BFGA 4WV8A 4USOA 1S0LA 3C9ZA 2KH2A 4Q8KA 2UWCA 2FO1A 5IUQA 1SLCA 4TLPA 2BQPA 1TEIA 1TP0A 2D1ZA 2Y9XE 1K5VA 2W08A 2ZGRA 4GOYA 3PVOA 4LO0C 1KJRA 1B09A 4R9DA 1DYPA 5FZUA 3WLUA 1S0FA 3CA3A 2D22A 3T8SA 5E24E 1SCRA 2A3WA 3AH1A 2DV9A 4FGFA 3WHTA 1LOFA 2ZR1B 4BM8A 3O3QA 2ZGPA 1HCDA 4XFTA 4ZKTB 2V5YA 5CBLA 1RITA 1I3HA 3AZWA 4XILA 2OW4A 1BZWA 1CJPA 1VAVA 1Z0HA 1LTEA 2VW0A 3QCWA 2PHUA 5JOXA 3F62B 5T52A 1VLNA 1DQ4A 1N1SA 3IM6A 3AYCA 4LBQB 4Y24A 3IM7A 1VIWB 2ES3A 1LULA 4W65A 4IYBA 1KNMA 4XZPA 3AZYA 5EYYA 2K4AB 5BVPI 4FPLA 3V0AB 1F31A 5DUUA 4GKXA 2W52A 1ENSA 2ZKNA 4C1WA 4YOLA 4JKQA 3AKGA 3OBRA 1AXMA 4D0ZA 3BAUA 2X2TA 1EVTA 5H9SA 1T9FA 1JLYA 3T1MA 1YIFA 3WO3A 1AFCA 4LBJA 4LBQD 2B7YA 1TIEA 2VW2A 4AGRA 3L2YA 3O0XA 4YM2A 1GLHA 2EF6A 2DS0A 2ZGKA 2DRZA 1V6IA 1V6KA 2WT1A 1H30A 2I1BA 4LBNA 4Y1ZA 4U2AA 4OWJA 4XXAA 1H9WA 5E88A 4D69A 1IKPA 4LO3A 4EKXB 3AP9A 4GALA 3PHZA 3AZZA 3ZC8A 4I2SA 4UW6A 3V79C 4DQAA 3N36A 4QO3A 1OFSA 3O4OA 3KM5A 3WMVA 4LBKA 2CNAA 1ULFA 2F2FA 1HWMB 2D3SA 4IY9A 3NBCA 1SLLA 2CTVA 2I2SA 3MEPA 1FWUA 3K1XA 3O4CA 4HA2A 1AZDA 1JUIA 4FOVA 4GOVA 1U0AA 4WBCA 3AP7A 4USPA 3B3QE 2VW1A 3R4UA 2JD4A 4GA9A 4BMEA 1IS5A 3LCPA 1Q8QA 2UUSA 1JW6A 2ZMNA 3WUCA 2ENRA 3W58A 1CIWA 4YG6A 1UAIA 1ULCA 4YW4A 3QLQA 2GMMA 1LENA 4I4VA 4ASMB 3QYDA 1YI7A 1ZA4A 4CJMA 1MS4A 3VKOA 3OY8A 4TZDA 1W3GA 5DZEA 4KEJA 3WVJA 3D6EA 1BKZA 3AH2A 1Q8SA 5F90A 1W6OB 1AXZA 1WW4A 1FAYA 5LK5A 1G9FA 3T1LA 1S1AA 4FPKA 1JBCA 2NM1A 1OQ1A 1LOFC 1SBEA 1LGCA 4FVVA 5DUXA 1DQ5A 5GJ6A 2DUPA 3AYEA 3OBTA 5KXEA 5BXSA 2GNTA 2XG3A 3FGMA 4K20A 5EWSA 1IRAX 1W6QA 3WNXA 4XJ8A 4K1YA 2KLLA 4UW5A 3FJJA 2CL2A 2D6MA 5GAQA 1A78A 1MR5A 1GKBA 2X2SA 2J3PA 4G9NA 1IILA 3WG3A 3AK0A 1DZCA 4G9MA 1HCEA 2DTYA 3B00A 4YW1A 1LHNA 3EF2A 1HQLA 1QGLA 2P3KA 4ZOTA 4YW5A 1LOAA 1D2SA 2DURA 1DYKA 1ULGA 5JDBA 2JDZA 2KI6B 4JRAA 3WG4A 2FGFA 1JHNA 5H9PA 4ATEA 2DYCA 2YV8A 1AF9A 1Q8PA 2VXTI 4HR6C 4HANA 4L4HA 4P0LA 2CYFA 4EFQA 1AXKA 3A0KA 5JOYA 4I4QA 2R16A 4I6IA 4KEIA 1OKQA 3WDUA 3A23A 2A6WA 2P23A 1DQGA 2ERMA 3WUDA 4AYUA 4FPGA 4SLIA 3RSJA 2EALA 2A7AA 3N3HA 2A6VA 3OJMA 2ZGTA 5T54A 4I96A 3BA5A 1QU0A 3V64A 3WCRA 1YF8B 4OUJA 1SCSA 4XTPA 4LBMA 1MC9A 1RINA 4LO3C 4DFSA 5H9QA 5F8SA 2VSEA 1AVXB 1JY0A 4YW2A 2AR6A 2ZHMA 5DXDA 1R8OA 3CQAA 4J2XA 3CRGA 1FMMS 4OEFA 3BB2A 2D6KA 1GZWB 2GNBA 2ZHLA 2SLIA 2F2FC 4CZSA 1CVSA 1N3PA 1V6OA 1O4YA 1K5UA 2L5XA 2CWMA 1FMZA 1GNHA 3WDXA 2Y9WC 1WBLA 3RS6A 2SBAA 1N47A 4FP2A 2ZABA 5KXCA 4ISQA 2LIEA 3FJ8A 1D0HA 2DTWA 3CU1B 3OGGA 4YGDA 3FJ9A 4P0KA 3AX4A 4X37A 1ENRA 5GLUA 4TYSA 2VH9A 4UW4A 4XFUA 3N35A 4XXPA 3C2UA 1LECA 1GGPB 5DUWA 3IM5A 1YTOA 4LBQA 4Q8LA 1ISVA 5GM0A 1QDCA 4QALA 2VU9A 2FDBM 3I2AA 1I1BA 5B2HA 2MIBA 1DQ1A 1QNYA 4NO4A 2D23A 1FV3A 1PZZA 2EXKA 3UJ4A 3WOGA 2R0HA 2Z49A 2NP0A 4X3AA 2ZAAA 2GMEA 3V0AA 1JLXA 2CY6A 2G4IA 4XIKA 2ZQOA 1IJTA 3PMEA 2JKBA 4L8QA 1FN0A 4AGVA 1GZ9A 5IK8A 2D43A 4Q91A 1LODA 2WT2A 3VWCA 3ZX7A 2D44A 2IHOA 3B69A 2DUOA 3H6SE 3IAGC 5GLTA 3ATGA 4M3CA 4WVVA 5BP5A 2D7FA 2XOAA 1V6MA 1BARA 3MALA 4YZ4A 1YBIA 1QXMA 1CONA 2EXIA 1HIBA 5GLVA 4H55A 3AJ5A 3AKHA 1V6WA 3SITA 4PBPA 1L2HA 3AZVA 1SLBA 3LSEA 2WBCA 4FOQA 2LIQA 2LALA 1RIRA 2RG9B 5FZYA 2R49A 4P14A 2UU8A 3F1RA 4ZGRB 4GWMA 4DS0A 1W6PB 3A22A 1FATA 3WO4A 3SNMA 4EEEB 1IKQA 3D5OA 3OJBA 3E8LC 4P0JA 3S8JA 5GZEA 3PUBA 1XZZA 4GKYA 3WINA 4QC4A 5IK5A 2HWAA 3S8KA 3CA5A 2WSVA 5GALA 1JYIA 5EXOA 4J2YA 1GANA 2ZQNA 1G86A 3U4XA 1LCLA 4Y1UA 31BIA 2ZBJA 1DQ2A 1G9CA 3RMXA 4YM3A 1QQLA 4DPNA 4FPYA 4YGCA 1FV2A 3H0OA 4QD2B 1LU1A 1DHKB 2GN7A 3NBDA 3RG0A 1Q56A 4CTEA 1BYHA 1UKGA 3OPZA 3Q7XA 1DFQA 3WDVA 2ZGSA 4Q26A 4XBQA 5DG2A 4KC3A 1N3QA 4AGGA 5H9RA 4EFPA 8I1BA 1S0JA 3POKA 1VCLA 4FQ4A 1RY7A 3FJFA 4YZ1A 1S0CA 1VAMA 2D6NA 4AWDA 1YO8A 4K1ZA 1W6OA 1V6UA 3O5SA 1QQKA 3ZXKA 1ISYA 3FJKA 4I7IA 4I3NA 3O44A 3R05A 4XBLA 5JMCA 3HOMA 4AVTA 3ZVXA 3IMNA 4IZXA 3APBA 3BRGC 1S0BA 2E53A 1MZ5A 4Z8BA 3MW3A 3ZSJA 4BQ1A 5FRAA 2HWMA 3FJDA 3WA1A 2GDFA 1IOBA 3AYDA 3ILRA 1XYFA 1V6NA 4FPOB 3IKWA 1HDKA 4Q2FA 2YXSA 5BQUA 2ZA9A 1WW5A 4M3CB 1GSLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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