3ZX7A

Complex of lysenin with phosphocholine
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
AEGYEQIEVDVVAVWKEGYVYENRGSTSVDQKITITKGMKNVNSETRTVTATHSIGSTISTGDAFEIGSVEVSYSHSHEESQVSMTETEVYESKVIEHTITIPPTSKFTRWQLNADVGGADIEYMYLIDEVTPIGGTQSIPQVITSRAKIIVGRQIILGKTEIRIKHAERKEYMTVVSRKSWPAATLGHSKLFKFVLYEDWGGFRIKTLNTMYSGYEYAYSSDQGGIYFDQGTDNPKQRWAINKSLPLRHGDVVTFMNKYFTRSGLCYDDGPATNVYCLDKREDKWILEVVGLVPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structures of Lysenin Reveal a Shared Evolutionary Origin for Pore-Forming Proteins and its Mode of Sphingomyelin Recognition.
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Eisenia fetida
molecule keywords LYSENIN
total genus 57
structure length 296
sequence length 296
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.980 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3zx7A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3zx7A02
4J2XA 1YXWA 1RZOB 3K1XA 2D7IA 4IY9A 3ZC9A 3OJVA 4H9WA 2NP0A 5BQUA 4ENDA 2MIBA 1E0OA 3UDAA 1S0GA 4FVVA 4G6JA 3UJ0A 4JPZA 1JT3A 4P0JA 4P0LA 3VT1A 1EV2A 4IY8A 4JAWA 3I2XA 1N4KA 4D0TA 4DENA 3CRHA 3O4DA 3WINA 3PMEA 4LO0C 4G1RA 4X38A 4XFTA 5BXTA 3VEQA 1IT0A 4Q91A 1AFCA 1XYFA 4LO1A 3CU1B 2IWTB 4CJMA 4LO3C 3RTIB 1PC8B 9ILBA 2YUGA 4OEGA 3A21A 5JMCA 1R8NA 3C9ZA 1JLYA 2Y9FA 4ZKTB 1ITBA 4QD2C 1G9AA 5HPZA 3CRIA 3BAHA 4JKXB 2KH2A 5I1BA 4I4SA 8I1BA 1AVXB 3V0AB 1HWNB 1WD3A 3AKFA 4AN6A 4I1EA 1VCLA 1SR4C 1TWEA 4I7IA 4JP0A 1JT7A 2Y9GA 5DUYA 1AF9A 4J2KA 1HWMB 4QC4A 1G9DA 4OWJA 1S0EA 3PUBA 1AVUA 3Q7WA 1PUMB 2FGFA 1RMLA 3T8SA 3V0AA 1T4QA 1I1EA 2KI6B 1SZ6B 4D8HA 2HZ9A 2DREA 1IRAX 1XHBA 3CA4A 3PHZA 2DRYA 1QQLA 4P0KA 3JUTA 4XKIA 3OGGA 1MD6A 4II0A 5BOWA 2P39A 2F8XC 1YBIA 1Z4SA 3BADA 3H6QA 4I0YA 2VSEA 3FJHA 4I8MA 3BB2A 3BAOA 4OEFA 1NUNA 3P6IA 3A07A 4X39A 3POKA 4A7ZA 3AKGA 1G9CA 2F2FA 3BRDA 3BRFA 4KC3A 2Q9XA 1JTCA 1DFCA 4I3NA 1ISWA 5BXRA 4JRAA 1BFCA 1ABRB 1BFBA 1KNMA 4G9NA 2ET2A 3F62B 1J0SA 4EFQA 3O44A 2VU9A 1DZDA 3MPPG 3AJ6A 3IM7A 1TWMA 4X3AA 1RY7A 1TOOA 1K5VA 3QR5A 2BFHA 3FJDA 3WINC 1QXMA 4OEEA 3S8JA 3KMVA 3RMXA 3VSFA 3FJCA 1DJSB 2AFGA 3UD8A 4EB2B 1ISYA 3SNVA 4A7KA 1EVTA 1FN0A 5D62A 3W9TA 3N0KA 4ZGRB 2E4MA 2FFVA 3ZXGA 4P6AA 7I1BA 4A7YA 3OBTA 4I4OA 1XG6A 2GZBA 4QBVA 1PUUB 2D22A 1M2TB 3AKIA 3BA4A 1GGPB 1S0BA 3FJ9A 1PWAA 3AZVA 2X2TA 2D23A 3AJ5A 3QYDA 2ESUA 2QYIB 4IZXA 1DQOA 1FQ9A 2NTDA 3CRGA 3NBEA 4IONA 4IQPA 3VT2A 2HWMA 4YOLA 1IHKA 5F90A 1V6WA 2XOAA 3FJIA 1FGAA 4I4QA 1D0HA 2NVHA 2KKIA 3ZC8A 4I4PA 1ISZA 3WO3A 2RQ9A 2WRYA 4GAFA 4GOVA 3AH2A 1BFGA 3RMYA 3V0BB 3N7KA 3NBCA 2AXMA 3BX1C 3EF2A 2BEBA 5D61A 1EPWA 3WMUA 3I29B 1TIEA 1PZZA 3HALA 5FZUA 1G9BA 3TC2A 2LIQA 5BVPI 1WBAA 2KLLA 2VUAA 3AH4A 2D24A 2I1BA 4H04A 3V0BA 4WBCA 3V79C 2AAIB 4LO7B 2R9KB 4G6MA 1FMZA 2F2FC 1YF8B 2Y9WC 3P53A 2GO2A 4I37A 4IYBA 5JLVA 1IOBA 1W3AA 3E8LC 4I4XA 4EEEB 1CVSA 3FJKA 3IIRA 3ZX7A 1FV3A 5DSSB 3VWCA 6I1BA 3WA1A 2D1ZA 41BIA 3VUOA 4Z9WB 3ILAA 4ISQA 3OBRA 5DZUA 4ZLBB 3HN1A 2MLLB 4OUJA 1JQZA 2ZQNA 4L4HA 1DQGA 3BAGA 2NZ9A 3D7WB 3NJ5A 4F83A 1AVWB 1F31A 3FUOA 2VXTI 4I4UA 3A22A 1JT5A 3N7MA 3O3QA 1AXMA 4QALA 1NZKA 1V6XA 4IZEA 4X37A 3PG0A 1XZZA 3CA3A 1Q03A 2P23A 3CAHA 4XFUA 1BFFA 5BQUC 4IHZA 4QKSA 4ZBVB 1WBCA 2NM1A 3CA6A 5BP5A 3FJJA 2M49A 4PC4A 2D7RA 4I2SA 2ERMA 2K8RA 3BAQA 1ILR1 2VLCA 3UD9A 2UUSA 4EKXB 3BA5A 4I6IA 1L2HA 2VSAA 3BAVA 1S0CA 3WMVA 4DCKC 3BA7A 4LO2A 2QN4A 3AKHA 4LO1C 3R4UA 1HCDA 2D44A 4D0ZA 1ISXA 4GAIA 3N7LA 3OGFA 3LLPA 4L4IA 3AZWA 1CE7B 4J2YA 1YYNA 3FJ8A 4I4RA 3IM6A 2VXRA 1DFQA 31BIA 4ZFUB 1Q04A 1IILA 3FGMA 1BARA 2J3PA 1BLAA 5DVHA 5FNXA 5F8WA 3HOMA 5EC5A 4F34A 1BA7A 3N7JA 3S8KA 2MC2A 3O49A 2KI4A 4ZA3B 2WBCA 1ISVA 3FJBA 4GP3A 3O5WB 1HWOB 4Q9PA 4USPA 2D20A 3FFZA 1JLXA 4EFPA 5FNWA 1AVAC 4KEIA 3RTJB 3NBNA 3IM5A 1HKNA 1G82A 1YTOA 4OWLA 1I1BA 1BLDA 3UJ4A 2FO1A 2K4AB 3HMYA 4LO7C 3I2AA 3WO2A 3CA1A 3Q7XA 4Z8SB 3OJ2A 4XFSA 2FDBM 2ZQOA 4I4YA 4USOA 4G9MA 1S0LA 4LO8B 3BRGC 2IHOA 4QO3A 2RSTA 1OQLB 3BAUA 3CA0A 1JT4A 4KBBA 4LO0A 3MALA 1HCEA 4QD2B 2Z49A 4R6UB 3ZXDA 1DIWA 2NYYA 4GOYA 4EFRA 4ZFWB 4FGFA 2AQZA 1FWVA 4I1BA 3FJEA 4JQ0A 1HWPB 1TP0A 1S0FA 5E24E 4LO3A 5GAQA 2LIEA 1MC9A 4HJJA 3Q7YA 1R8OA 5FZZA 5BP5C 4JKQA 1II4A 3H6RB 5BXPA 4DEPA 3IAGC 21BIA 1M16A 3HBWA 1A8DA 1T9FA 2Y9XE 5EHAA 1W3GA 1TTUA 3FJFA 5B2HA 4ZFYB 4TLPA 1K5UA 1W3FA 5EG6C 1BASA 1FMMS 4LO2C 4KEKA 3HSMA 4KEJA 1FWUA 1WD4A 3O4BA 5BXSA 5F8YA 4OW4A 1DZCA 4HR6C 3F1RA 1SR4A 2L5XA 3H6RA 2E4MC 1S0DA 3VT0A 1FV2A 1P63A 2HWAA 4QKRA 3RSJA 5FZYA 2K43A 3O4CA 3LTQA 3CA5A 2BEAA 2RG9B 5D63A 3CQAA 5F8SA 1IJTA 1V6UA 3FUQA 2FFUA 1Q1UA 3O4AA 1HIBA 1UPSA 2X2SA 3FJAA 2HW9A 4I4VA 1ONKB 1IRPA 4GP0A 2DS0A 3JRRA 3BTAA 4AN7B 2Z48A 2D43A 1Z0HA 4Q9GA 3R4SA 2Q3NB 5G00A 3NBDA 3P6JA 4OWKA 3UD7A 1EYLA 1RG8A 3O4OA 1DLLA 4ISRA 4QBCA 4J2SA 3OJMA 4ZOTA 3WO4A 3H6SE 1QQKA 4J23B 3VSZA 1V6VA 4I96A 1JY0A 1TFMB 3B9UA 2DRZA 3A23A 4HA2A 1Z2VA 3AH1A 2ZR1B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EAH1 4WVMA 1J3RA 1OA3A 1YXWA 5FYZA 4GWJA 3E5XA 2WJSA 4QXCA 4IY9A 3M3OA 1Q5OA 3M8LA 2JG8C 4ENDA 3K77A 1C8M1 4YFWA 2MIBA 1E0OA 2ZJCA 4NRQA 1RUD3 3UDAA 3P6BA 1ULEA 4CCCA 1JT3A 1ULDA 4P0LA 4G4FA 1LODA 3BADA 2ZACA 3N9NA 2HYKA 4IY8A 2BP6A 1SLLA 2VVFA 2W95A 2VZOA 1G8WA 3GZAA 4NE9A 4UW3A 5BNPC 1FMD1 1UIJA 3ZFFC 4CCJA 1W8TA 3SQOA 5EIYB 4WVVA 2J1VA 4LO0C 4UFJA 4MV2A 4BXSV 2HBUA 2IXLA 5DDJ3 4QM8A 5EV7A 1W6PA 2FHRA 2AUYA 2G9ZA 1KGYA 4Q91A 1A78A 5JCTA 4OHYA 1XYFA 4FPKA 1OUXA 2LUWA 4O61A 3WT3A 3RTIB 1WCKA 9ILBA 1LOFC 1YWKA 5DZFA 4CEWB 1NE4A 4KWKA 1KD7A 1R64A 3AMQA 1VR3A 2YV8A 3MFAA 4LORA 2TUNA 4O7XA 2D6OX 3A0KA 5GZDA 1MS3A 1QNWA 1AL23 3ENRA 5E6HA 1YIPA 2ZEYA 4NHXA 1ITBA 3NNLA 1UYPA 1W8UA 2ZKNA 3K75B 4N9HA 4D3WA 4JGZB 2OZJA 3ABZA 4IEWA 4I3GA 4JKXB 2P34A 2WA3A 2KH2A 2VBPA 3OBAA 3WDYA 1IOAA 1QJZA 4Z2AA 5FLIA 3VBUA 4OI0A 3KQ4B 2XLAA 5BPXA 3WP3A 1AVXB 1CQ9A 1W6OA 1DDLA 3FHAA 3DXUA 3P3PA 3AKFA 2F17A 3ES4A 2XDVA 1APNA 3POSA 1UO9A 3PVNA 1LR5A 4J1WA 4CUAA 1HRI2 1QJY2 2RV9A 3VZLA 4MG2A 4G3YC 4YW4A 3IM0A 3LEGA 3ZXFA 4AHZA 3GNEA 2LS6A 2C26A 2JIGA 1CR7A 3UT0A 5FV3A 2D6MA 3VDAA 4QC4A 2DVGA 4LHKA 1BLZA 1S0EA 3PUBA 1AVUA 3Q7WA 4OI2A 2HWF1 2WL1A 4Q4V3 4YZ4A 3KHCA 4BMEA 4M4PA 3L2HA 4XILA 1RMLA 4H3WA 4S2FA 3RFRA 2ZGNA 4R9CA 4XF3A 2JX9A 3TEZA 5A1FA 1FATA 1UY4A 4D8HA 1QJY3 2HZ9A 1IRAX 3QOPA 4KU8A 2EAKA 4HK8A 2BEOA 4CDXA 1QQLA 3BOPA 3SCHA 4PJYA 4BZ4A 2EXIA 1MD6A 4II0A 4AVTA 2DUPA 1X9TA 1Z4SA 4QQPA 3T08A 3H6QA 2RDRA 2F8XC 2JIJA 4HT1T 1Z78A 5C3QA 3BB2A 5JZGB 1NUNA 4OQ9A 3K4AA 3A07A 2CGPA 1GSLA 1DQ6A 4P14A 2GC1A 2V09A 1NCQC 4AEDC 1G9CA 3AKGA 4FQ4A 2Z69A 1XNCA 4KC3A 5E16A 2Q9XA 1AYM3 2IXIA 2RR13 3I7DA 3TN93 4Y20B 4AVBA 2GNBA 1DFCA 5BXRA 4NPMA 5KC5A 1BVP1 5IJRA 4RGKA 3FE5A 3T1MA 1PMIA 5FYVA 5FMDA 1W8NA 2YC2A 2BV4A 3B3QE 4IE4A 1YQ8A 5IVYA 1VPHA 3VBOB 4QKNA 2WNVA 3OPWA 4G9NA 3NAPA 4Q5OA 3F62B 1AX0A 3MF6A 4BQ3A 5J48A 1RB8G 3IB3A 2ARCA 4UXAA 5DAPA 5IK4A 5FY7A 4F7ZA 3EB7A 2IUWA 4LHLA 1PK6A 1MQTC 2BJSA 4QPIC 4YW1A 1MZEA 3MPPG 4AF9A 3IM7A 3IDEA 4AI0A 3AVSA 4XFCA 4C0HA 2TNFA 1REEA 1YFUA 1Y7BA 2R071 2DUOA 3G7DA 3GHMA 3VGIA 4OMDA 4E4DX 1TOOA 5FZ1A 3S8JA 1LKNA 2R063 1DGWA 3QLQA 3RMXA 3VSFA 3FJCA 4QGLA 3RG0A 1DJSB 2W94A 4GQ7A 4N43C 4B4QA 5J96B 3ZXLA 3BPSA 3ZSJA 4RQPA 5L7OC 2ZEXA 4Q4X3 5FP4A 3U75A 5AC92 4Y5SA 1ISYA 3RZHA 3AMMA 3QD6A 5FDBA 2PAKA 1DU3D 3N0KA 2RS33 1HRV2 1ZA7A 1C28A 2OPKA 1B09A 1RMU1 1W2OA 2PHDA 2VQAA 4V2VA 1AX1A 5JXGA 3DCQA 2DU0A 3AB0A 4ZZ8A 5B4NA 3EHKA 3KF5A 1LTEA 3I2FA 1TEIA 4EWDA 3ACFA 2VMEA 4GIQA 4CZSA 5F3CA 1O8SA 4MH0E 4GH4B 5FQ0B 2IXHA 3KV5A 3MEPA 4LHSA 5LBEA 4AQTA 4CP9A 2RDNA 2XJVA 1JOJA 4GD4A 4RR3C 5FP8A 4JKMA 3P1IA 1PWAA 3AJ5A 4BDVB 1G7YA 1NQJA 2QYIB 1UD1A 4LBJA 4PHZA 4FPOB 3NBEA 2ORXA 4IQPA 1H2NA 3FBYA 2HWMA 3PJYA 5A7OA 3DL3A 3URFA 3ZIWA 1JYCA 4Q0SA 1CAVA 1W6MB 4N53C 5GZFA 1QMJA 2A3XA 1UY2A 2Q4SA 3I3QA 3VL8A 4B4PA 4YARA 4BE3A 2QDNA 4XW3A 1XU1A 4DUVA 3ELNA 1GMMA 4X8NA 4YW7A 4B3NA 5IFTA 1FGAA 1D0HA 4HVRA 3LAGA 4FPFA 4RD7A 5T3NA 2HKXA 1NLSA 5B4XA 1ISZA 4FPEA 2NPIA 3WG1A 1PO21 2BWAA 2RS11 2RQ9A 4ASKA 1A6CA 3VHRA 2FCTA 3FWEA 2VMDA 4JGYA 1DBNA 1GZTA 1GP4A 5FLJA 5DMYA 3FJSA 5G04L 5T55A 2BEBA 3VKLA 4AXOA 3I2HA 4IV1C 4I0BA 5LCWL 2DTYA 1RUH3 4QB2A 4D8MA 5IT6A 4PIZA 1D4VB 1UQXA 2Z5WA 2VCCA 5A1LA 2VNVA 5DAQA 4C1XA 2LIQA 1WBAA 2VUAA 2KLLA 3ETPA 4NWVA 1RUF3 3U10A 3WUCA 4CDQC 5C3RA 1JODA 4I09A 2DBNA 1IS3A 1JU3A 1Q8VA 4GB33 4WM7B 1BMV1 2FCUA 3E5UA 3S5QA 4FBFA 3PUSA 3V79C 1OF4A 4G6MA 5FOJB 1GLHA 4W8JA 1J84A 1EV12 3DN7A 2Y9WC 3P53A 2GO2A 3LPGA 1BBT1 3C7GA 4Q4W3 1AJOA 2VZ3A 4Z82A 5FTTC 5IUQA 3RQ0A 3WINE 5BNPA 4I37A 3AP5A 4NROA 1W3AA 3E8LC 2C9KA 3E5QA 3MIFA 1KS4A 5A7WB 1O3QA 2TEPA 1QJU3 3R4DB 3D0SA 4FO9A 5FJKA 3ZX7A 4AHWA 2ZX1A 2DCYA 4BPZA 4BQXA 3WA1A 6I1BA 4L9BA 5F6LB 2P4EA 2XJSA 1HXS1 3VUOA 4Z9WB 5HCBA 3SH3A 3ILAA 1LOFA 5AVPA 4ISQA 4CXYA 1PM7A 1W2TA 3GZTB 5DZUA 1SACA 4IEXA 1A8MA 5J37A 4OUJA 4QGNA 3MPBA 1N1TA 5A3PA 2Y64A 5GZCA 2JE9A 1TZOA 3A4UA 4E2GA 1DQGA 3BAGA 1VBB1 1W8WA 3NJ5A 1I9RA 2MEV2 1J3QA 2G1MA 1Y43B 2J7MA 2WR9A 1UPIA 2QE3A 4YZ2A 1MS8A 2IC1A 5KC6A 4QALA 1MZFA 3T30A 4QPYA 1JI6A 1AUYA 1ENSA 2G19A 2VZTA 1PZ9A 2E26A 2Y0IA 5FZLA 3CA3A 4YG6A 1W03A 4CCLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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