3ZXGA

Lysenin sphingomyelin complex
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
AAEGYEQIEVDVVAVWKEGYVYENRGSTSVDQKITITKGMKNVNSETRTVTATHSIGSTISTGDAFEIGSVEVSYSHSHEESQVSMTETEVYESKVIEHTITIPPTSKFTRWQLNADVGGADIEYMYLIDEVTPIGGTQSIPQVITSRAKIIVGRQIILGKTEIRIKHAERKEYMTVVSRKSWPAATLGHSKLFKFVLYEDWGGFRIKTLNTMYSGYEYAYSSDQGGIYFDQGTDNPKQRWAINKSLPLRHGDVVTFMNKYFTRSGLCYDDGPATNVYCLDKREDKWILEVVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structures of Lysenin Reveal a Shared Evolutionary Origin for Pore-Forming Proteins and its Mode of Sphingomyelin Recognition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSENIN
molecule tags Toxin
source organism Eisenia fetida
total genus 60
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.980 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3zxgA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3zxgA02
3AKFA 4G6MA 1RG8A 4GAFA 4J2KA 2X2SA 3AH4A 1WBAA 3WINC 1K5UA 5G00A 1FQ9A 4X39A 8I1BA 2BEBA 2ESUA 3PUBA 2D7IA 2NVHA 1VCLA 5BP5A 1I1EA 1TOOA 4LO1A 3RMYA 2MIBA 1FV2A 2X2TA 3JRRA 2NYYA 2KLLA 4HJJA 3FJ8A 5JMCA 3BRDA 1T4QA 1YBIA 1R8OA 4YOLA 3ZXDA 1QXMA 3O3QA 1W3GA 5BXTA 2P39A 4IY8A 3S8JA 1D0HA 3FJEA 4G9MA 1NZKA 41BIA 1TFMB 3Q7WA 3FJAA 5D62A 4I6IA 3WMVA 1M2TB 1FMMS 3CRHA 4WBCA 1G82A 4AN7B 3IIRA 1S0EA 3BAOA 1DZDA 3CQAA 3HOMA 1JT5A 1FMZA 3HALA 2MLLB 3CA4A 1IT0A 4PC4A 4XFUA 2ERMA 1DQGA 1TIEA 4J23B 3BAVA 4FVVA 1T9FA 4IHZA 3WMUA 3P53A 4GP0A 4XFSA 3I29B 1PWAA 3NBNA 2QN4A 3A07A 3O4DA 3IM7A 3OGGA 3N7KA 4J2XA 3V79C 4LO7C 1V6XA 4JP0A 1HIBA 3Q7XA 4EEEB 3OJ2A 2WBCA 1G9DA 4I96A 1S0DA 4DEPA 3CA0A 2AAIB 3POKA 2F2FA 3BAHA 3P6IA 31BIA 3CA5A 4EKXB 3A21A 3FJBA 4JRAA 4ZFYB 3AJ6A 4TLPA 3FUQA 4HR6C 3AZWA 4I4SA 3B9UA 6I1BA 4L4IA 1HWNB 2GZBA 4ZFWB 5EHAA 3H6RB 3H6SE 3H6RA 4ISRA 1XHBA 4XFTA 1A8DA 1DLLA 1EYLA 5EC5A 1M16A 4GP3A 4Q9GA 4A7ZA 2Y9WC 2GO2A 3N0KA 4H9WA 1MD6A 2NZ9A 1HWOB 3LTQA 5B2HA 3WA1A 1I1BA 5D63A 1BFBA 2K43A 3PHZA 1FN0A 4G6JA 3AKHA 4OEEA 4OWLA 4USPA 1Q04A 1G9CA 3ILAA 3FJFA 4LO8B 4I4QA 1JT3A 3N7JA 3OBTA 4J2YA 3AKGA 3BAUA 3IAGC 3T8SA 1S0GA 2HZ9A 1BFCA 4LO0A 4D0ZA 1HCEA 2HWAA 4ZBVB 4DENA 3AJ5A 2D20A 2LIQA 3H6QA 4I0YA 3LLPA 5DSSB 2HWMA 3FJIA 2Z48A 4JAWA 4H04A 5DVHA 3CA1A 4X38A 3V0BB 1ITBA 3OJMA 3V0BA 2K8RA 2XOAA 4KEIA 1FGAA 4KC3A 4D0TA 3AH1A 4ZOTA 3IM6A 3A23A 4F83A 2UUSA 3BX1C 5BQUA 2D1ZA 3PG0A 5GAQA 4QD2C 2FFVA 4KEKA 4CJMA 3CRIA 4QKRA 1KNMA 3VT1A 4GOYA 2FFUA 2D7RA 3F1RA 3FJ9A 4ISQA 2Q3NB 1DIWA 3WINA 1MC9A 3AZVA 4P0JA 3BAQA 3HBWA 4OWKA 2D24A 3O4BA 3O44A 3AKIA 1RY7A 4GAIA 2RG9B 3QR5A 4ZA3B 4I3NA 5EG6C 4IONA 1XZZA 2MC2A 1Z4SA 3ZC9A 3HN1A 4QD2B 3VUOA 5FZYA 2BFHA 3EF2A 3RTIB 1SR4C 1Q1UA 4JQ0A 2KKIA 1QQKA 1ISYA 3CA6A 3QYDA 2P23A 3VT0A 5E24E 2DRZA 3UJ4A 3BA5A 3NBDA 4USOA 1W3FA 1JLYA 1S0LA 2J3PA 3S8KA 2M49A 2Y9XE 2VLCA 3C9ZA 4EB2B 5FNWA 2AXMA 3D7WB 2DRYA 3A22A 1PUMB 3MALA 3FJKA 2LIEA 3P6JA 4LO2C 4II0A 3HMYA 3UD9A 3WO3A 1HKNA 1EPWA 3FJCA 4OEFA 3NBEA 1WD3A 3OJVA 2ZQOA 1DFQA 1II4A 1IOBA 3AH2A 1XYFA 1IILA 4I1BA 4JKQA 1PZZA 1IRPA 1R8NA 4ZGRB 5BVPI 5BXSA 1JQZA 2RQ9A 4LO2A 3VT2A 4XKIA 2KI4A 1K5VA 4QC4A 4LO7B 2VXTI 1SZ6B 1PC8B 3FJHA 4L4HA 1CE7B 1AFCA 3RTJB 1IRAX 5F90A 3CRGA 4FGFA 3FJJA 2VU9A 2AQZA 9ILBA 1DZCA 4QO3A 1TTUA 2ZR1B 5BQUC 1GGPB 3I2XA 1JY0A 1TP0A 2E4MC 5I1BA 1BARA 3N7LA 3E8LC 3O49A 4G9NA 2Z49A 1FWUA 2AFGA 4LO3C 1FWVA 1AVUA 4QBCA 1AVXB 1PUUB 4P0LA 4ZLBB 2D23A 3BB2A 1DQOA 1TWMA 1ISVA 2DS0A 1JT7A 3BTAA 4ZKTB 3I2AA 4OWJA 3NBCA 1BFFA 3HSMA 2VSAA 3O5WB 4HA2A 2VXRA 1WBCA 4X3AA 4QBVA 1S0FA 2R9KB 1JTCA 1BASA 21BIA 1P63A 5F8SA 4ENDA 5F8YA 3W9TA 2FGFA 2Y9FA 3IM5A 2ET2A 3UD7A 5BP5C 4A7YA 3CA3A 3O4CA 4I4OA 5FZUA 3R4SA 1G9AA 2RSTA 1RMLA 4J2SA 4P6AA 4KBBA 1AVWB 1V6VA 3TC2A 4I37A 5FNXA 1BA7A 2NP0A 1S0BA 5HPZA 1DFCA 3V0AB 1ISZA 1EV2A 3V0AA 1W3AA 1Z0HA 4IZXA 4IYBA 4X37A 2D44A 1BLDA 1ILR1 1F31A 1S0CA 3FUOA 5DUYA 1BLAA 1N4KA 2KI6B 3VSZA 3FJDA 1QQLA 4DCKC 1DJSB 3VEQA 3WO2A 1YF8B 3UDAA 3UJ0A 1NUNA 1AXMA 1XG6A 1E0OA 1IHKA 4G1RA 4EFQA 4P0KA 2WRYA 1Z2VA 1JT4A 4I8MA 5BOWA 3OBRA 2DREA 4I2SA 1OQLB 3OGFA 4Z9WB 1AF9A 2FDBM 1V6WA 3UD8A 1V6UA 3BA7A 1SR4A 2L5XA 1G9BA 4Q91A 1CVSA 4D8HA 3FGMA 1J0SA 2F2FC 2FO1A 2VUAA 3VWCA 3BADA 3O4OA 3ZXGA 4AN6A 2BEAA 4IZEA 5BXRA 1YXWA 3F62B 4QALA 1WD4A 5D61A 4I1EA 5BXPA 4EFRA 3BRFA 1FV3A 3BAGA 4I4RA 4JKXB 3RMXA 1ONKB 2K4AB 4I4PA 3BRGC 2D43A 4KEJA 4IQPA 2F8XC 3N7MA 3SNVA 4IY9A 2NM1A 3ZX7A 3MPPG 1HCDA 1IJTA 3NJ5A 4JPZA 1JLXA 2D22A 1UPSA 1YTOA 1ABRB 3RSJA 1BFGA 4I4YA 2IHOA 1HWMB 5F8WA 1TWEA 4I4XA 2IWTB 1RZOB 3K1XA 3ZC8A 4OEGA 1L2HA 2HW9A 4QKSA 3JUTA 4Q9PA 1ISWA 3WO4A 1Q03A 4LO0C 3CU1B 4I7IA 2Q9XA 2I1BA 5DZUA 2ZQNA 1YYNA 4OUJA 4Z8SB 3KMVA 4OW4A 2E4MA 2NTDA 5FZZA 3FFZA 2Y9GA 3Q7YA 3CAHA 4R6UB 2KH2A 3BA4A 3R4UA 4I4UA 2QYIB 4LO3A 4EFPA 5JLVA 4A7KA 7I1BA 2YUGA 3VSFA 4GOVA 2VSEA 1HWPB 1AVAC 4LO1C 4I4VA 1ISXA 3O4AA 4F34A 3PMEA 1EVTA 4ZFUB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DUIA 4MSVA 1LHVA 2WKKA 4XF0A 5FKCA 4AW7A 4YFZA 4QU2A 5F1RA 3KSCA 1POV3 1QJX2 5JZGB 2X2SA 1PGL1 1LESA 1OF3A 1UN1A 2ZGUA 3QOPA 4GH4A 2PHFA 1ST8A 3RZHA 2B45X 4C91A 3UT0A 4OVEA 4JGZA 3DEMA 4WM7A 4YPJA 3VBUB 4HL0A 2BEBA 2ESUA 2GC2A 4UBHA 4AAXA 4BJ0A 5IVJA 4OHYA 1GZ9A 2NVHA 3KV5A 4AQTA 1I1EA 5HBAA 4Q2FA 2K46A 3OJBA 2MIBA 1FV2A 4LO4B 5FPVA 1O3RA 5CFCC 4Y5SA 2KLLA 4PIYA 3FFQA 3O1VA 4HJJA 4XIKA 5CKQA 2C24A 4K20A 4FAHA 2GC0A 3PJYA 5JSOA 4OUMA 2JG8A 2JIJA 3AYDA 1CQ9A 2JDPA 3B5LB 3IIAA 4PQ9A 4YZ4A 4DNYA 5J7MA 5KHJA 3WLUA 1DQ4A 1LCLA 4XILA 3WQ7A 2EVXA 2GN7A 4WM8C 1W8TA 4ZU7A 3WNXA 4KGGA 3POIA 2FDFA 3T2PA 1ZBA2 2P39A 1QQP3 2HWD1 4EWAA 4DUWA 4IY8A 3S8JA 2RR11 3H3ZA 1B09A 4QM8A 4AVAA 4XOGA 1NZKA 3FJEA 3AZZA 2VQAA 5EYYA 4Y1XA 4Z2AA 1ONAA 1UXXX 1OLRA 2D98A 1I3HA 3JB8A 3AK0A 3ZSLA 1ZRFA 2ES3A 3CRHA 4I09A 1G82A 5BYNA 3I8TA 1IPKA 1PVC2 2D6NA 2C9AA 4KWLA 4R9BA 4UT5A 5T5OA 1DZDA 1TNRA 3V64A 3O1TA 2J1TA 2YUEA 1Q8QA 3NVCA 4IV1A 1UOJA 4IGPA 1FMZA 4B7EA 3HOMA 4TZDA 1MEC1 4QPIC 2KR2A 1WLDA 4NE9A 1UU4A 1V6OA 3VZMA 1CAVB 2GH8A 2OZ6A 2VVEA 2W3JA 3WUDA 5LA1A 2VVDA 1B35C 4A45A 2BWCA 1QU0A 1S2KA 3BAVA 3WR0A 2BNNA 1GFF2 1JYXA 5E16A 4LHSA 3WMUA 2EXJA 3WNKA 1PX4A 4XFSA 3G6JB 3POGA 4MADA 4R9CA 2TBVA 3TBDA 4UBGA 5C4WB 1PWAA 2RV9A 2QN4A 3NV4A 5FY5A 1AR73 4CP1A 1RUI1 2QQLA 3AYAA 1EY2A 1W6OA 3K2OA 1N1TA 4PJYA 1Q8PA 4Z07A 4JP0A 3OY8A 1W04A 3VN4A 4WVVA 2D93A 4EEEB 4IE6A 1G9DA 3JB4C 1RUJ1 1W39A 5F2SA 5JPMB 3FHIB 3CA0A 2AAIB 2VH9A 4RSUA 2HWD3 4LJHA 4CU9A 2F2FA 5LATA 4HETA 2Y26A 2RR13 4NIHA 4CCMA 2Q8CA 2XMLA 4DY5A 2VPVA 4ONUA 5EJZB 3A21A 5KXDA 2W52A 2Y34A 3FJBA 4ZFYB 2K9ZA 2D6PA 1RUC2 2IXIA 1GWMA 1QMJA 4LTAA 2GC3A 4H7MA 1CPMA 2BBVA 5DQ0A 3VDDA 3AJ6A 2B46X 2YC0A 2VZQA 1R093 2W87A 2JDZA 3ZPYA 1LHNA 2ZEYA 4CDWA 3B9UA 1JU4A 4RQPB 3LDBA 1KDKA 5HCAA 5FMOL 5A7WB 1WUVA 1AL21 1SACA 2E53A 1MEC3 2C5DA 4H3WA 2JKBA 2E6VA 1H8TA 2WUHA 3CU7A 1QXRA 3VBHC 4OMCA 3WY6A 4Z92B 3H6SE 2ADDA 4Q0UA 4AEDA 4LUMA 1XHBA 2DFBA 1A8DA 1SEFA 2CV6A 5FYHA 4QX8A 3NMBA 3PUAA 3R05A 4OUSA 3SCHA 1JOPA 2UY9A 2VBDA 4GP3A 2KXLA 3I54A 3M4FA 2DYCA 2GO2A 1AR81 1YUDA 2VR4A 5B4NA 1MD6A 5B2HA 3H50A 1JYIA 2WC2A 3WA1A 1UOBA 2R072 3K4AA 4OI2A 4YVWC 5F3EA 2XUEA 4RR3A 1RUI3 3ZFFB 4CPBA 3SISA 2EF6A 3I7DA 4EJRA 1H1MA 5BNPC 2K43A 4OEEA 4QQLA 5FBJA 2VUCA 3CIHA 5FO7B 2RS31 4M4RA 4FTSA 2CTVA 2NPIA 4FOYA 3MICA 1SCRA 4L97A 2RJKA 4O65A 4XYXA 5T3NA 2CSGA 1IPJA 1RUJ3 2EIDA 4LO8A 4LOSA 3ZFGC 3OPTA 3R0RA 1K5MB 2CGNA 3GHNA 1LJ7A 4BDVB 2ZGQA 1CAXB 4ZPIA 2VOVA 3ILNA 3WW3A 1BFCA 2HZ9A 4D0ZA 1EAH1 4ZBVB 5GZGA 1OSGA 5L36A 2DVDA 2LIQA 1QY4A 1BEV2 3J7MA 4KU7A 5JOYA 4YG0A 4Q8LA 4ZS2A 1RUD2 4RFRB 3VDCA 1LGCA 1UW8A 2DWRA 2WT1A 4GKYA 4QT6A 4CXYA 1KRIA 2Z48A 5FP4A 4H04A 1W6PA 1OVSA 1UF2C 1WW4A 4XW3A 5FYZA 5C8CA 4J1XA 2A6XA 1UIKA 1AL23 4XZPA 4AK3A 3BTYA 2R6QA 4K40A 1VRH2 4CRQA 2WO1A 4E2GA 3IDBB 1DGRN 4JAAA 2KA3A 3UNPA 4D0TA 4LHKA 1MZEA 3SCFA 3KHCA 1Q5OA 2YGMA 3A23A 3O1MA 4B8EA 3BOPA 4F83A 1N47A 1WWYA 3IMNA 5JI9A 3RS6A 1JHJA 2DFCA 2MEV1 2RS12 2WA4A 3ZN6B 1UU5A 1NOVA 1F4AA 1QXJA 1PO21 1AR83 1VAMA 3NNLA 4LPLA 4QD2C 3H7YA 3CRIA 1UY2A 1KNMA 4CJMA 3VBOB 2FFUA 3D4KA 3HT1A 2J22A 1JZ6A 1L7LA 3LE0A 2XJVA 1ULGA 4COZA 3K51A 2ZBJA 2OZJA 3M70A 3T2OA 1LENA 2DBNA 3AZVA 3BB6A 1NLRA 1XJAA 2RS33 2Q5TA 3CBNA 3ILFA 1SZBA 3LAGA 3PU3A 4Q4V1 3IBMA 4XTPA 4YW4A 3RNSA 5LK7B 3BAQA 2VCCA 2FQPA 3AVRA 3TYJA 3LEKA 3UGGA 3O4BA 1G6NA 2JXAA 3A4UA 3J26N 5LA2A 1W0NA 2HJIA 3ZMNA 4ET7A 3WCRA 4CCCA 3BCWA 3WP4A 2G9GA 2RS51 3C7EA 4CDXA 1SQ4A 2VCMA 4CCJA 3DXTA 2VE1A 1EAH3 5F9TA 4UW4A 3HN1A 1Z4SA 3D6EA 3RG0A 3VUOA 1NY72 3H3UA 2BEOA 1SR4C 5DZFA 4N9HA 3SCGA 1Q1UA 1GANA 2AC1A 2KKIA 1CZSA 4N43B 1UKRA 1SLCA 4XQDA 4XBNA 2OPKA 5EQUA 2FDKA 3KD4A 5DPNA 2VQUA 3ACLA 2IVIB 4XJUA 1LOFC 3MEPA 3WVJA 1L3JA 2B9UA 1W3FA 1S1AA 3OGJA 1OOPB 2JJ6A 5FK8A 2M49A 1F9KA 1PO12 2GDFA 2CWMA 4EB2B 3DYMA 2B42B 4FQ4A 4K8RB 4QPWA 1YI7A 4BPZA 4DUVA 2XQXA 1OKOA 3VD9A 3MALA 2MEV3 1AJKA 3HMYA 3VBSC 2ZXQA 4AFBA 4ASMB 3UD9A 1PO23 1LGNA 2W08A 5FUNA 3GGLA 4CP9B 4DZGA 1SCSA 1HKNA 4IEUA 4HKWA 4LBQB 4QAWA 3FJCA 3A0NA 3D3AA 1YFWA 3ZXKA 4OEFA 5D8AA 1W0OA 3MFAA 2E32A 4NHXA 4LE4A 2PHLA 2OT7A 3H8OA 3OF1A 3NSTA 4Q4V3 1G8WA 5JPNB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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