3AZVA

Crystal structure of the receptor binding domain
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
427
structure length
418
Chain Sequence
NEYFNSINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural and mutational analyses of the receptor binding domain of botulinum D/C mosaic neurotoxin: insight into the ganglioside binding mechanism
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords D/C mosaic neurotoxin
total genus 79
structure length 418
sequence length 427
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3azvA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3azvA02
4BMBA 3NBEA 3A22A 2B7YA 1GZ9A 1EPWA 4XTMA 2F2FA 3RS6A 4H55A 1DYKA 2A71A 1WBLA 5KXDA 1GANA 1BFCA 1WLWA 3BAHA 1PWAA 4ZFWB 3BAVA 5EC5A 4JAWA 1G8WA 1K5VA 3FBYA 4YGDA 3FJ9A 2DRZA 1UPSA 5D62A 3WHUA 4XXPA 3ZPYA 4OZXA 1YIFA 1SBFA 4FQ4A 1MVEA 2DWRA 2HWMA 3MEPA 2GN7A 1JYCA 5EYYA 4CJMA 3AXDA 1ONAA 2ARXA 3BA7A 2C9AA 4LO1A 2GMMA 2LALA 1Q1UA 3MW3A 1QKQA 2AUYA 1W6PB 1MS0A 3RG0A 1SLBA 3N3HA 3HBWA 2D3SA 2D6NA 1RZOB 3WCSA 3IM6A 1N47A 2ZGOA 3QCWA 2VUAA 4IYBA 5F9TA 1V6NA 3CA1A 2UWCA 1G9FA 3FJEA 4QBVA 4AGRA 1SLCA 3AKIA 1DQOA 2E53A 1S0CA 2K43A 4G6MA 4PQ9A 5FRAA 4I96A 1YXWA 4SLIA 2VW1A 4EFRA 3M1HA 2F8XC 3AK0A 2PHXA 4I3NA 5EG6C 5BP5C 2UURA 1PZ7A 3P53A 4FGFA 1QF3A 5T50A 4OEFA 1XQNA 4Q1PA 1V6UA 1HWMB 2R1DA 2GALA 3OGFA 4XILA 1DFQA 4ZFUB 5GM0A 1SLAA 4G9MA 5DUVA 1IS3A 3IKWA 3OJMA 3OYWA 3RMXA 3AP6A 3ZSJA 2R16A 2R0HA 2CY6A 4FPCA 4HR6C 5EXOA 1BFGA 1UX6A 2UU8A 4USOA 1AJKA 3MW4A 1JTCA 5EYXA 4XKIA 5BP5A 1UAIA 1WD4A 3VUOA 3VKOA 4KEIA 1WLDA 5DUYA 5BXSA 1LHOA 1BA7A 21BIA 4FPJA 5GJ6A 4Y22A 1DQ1A 2WT0A 3UK9A 1RITA 1LENA 4QALA 2I1BA 1W6QA 3L2YA 4J2KA 2V73A 1SLIA 5E8AA 4USPA 1N4KA 5I1BA 1JT7A 3TB0A 1HKNA 2AYHA 3BAQA 1JT5A 2WNEA 4ZFYB 4Y1VA 4YZ1A 2FGFA 3W9TA 4P9WA 1AZDA 1G82A 1WBCA 4TYSA 3AZXA 2D7IA 4GALA 4ITCA 4YM2A 2HZ9A 3WG2A 1JYIA 3JU9A 4JCKA 2WSVA 1BXHA 1V6LA 2AQZA 4P9XA 3HOMA 3SNMA 5FNWA 4U36A 1T4QA 2GNMA 3ZXFA 2I2SA 5GZDA 1FAYA 1N3QA 2VH9A 3OYWB 1X50A 2V5YA 1ENRA 1I1EA 1ULGA 5H9PA 4XBLA 2ES3A 4K1YA 5IT6A 2D7FA 1II4A 1FMMS 4XXAA 1IRPA 3Q7YA 5T5LA 1KJRA 1BASA 2G4IA 1H9PA 3PG0A 1V6MA 5DUXA 2E4MC 5FZYA 41BIA 3CA6A 3ZXJA 5JDBA 3BTAA 1SCRA 5T55A 3NWKA 3BRFA 4AYUA 2FDBM 3AFKA 1W6QB 4OWKA 7I1BA 2RHPA 2ESUA 2AENA 2DVDA 2R1BA 3FLPA 2Q3NB 1LOBA 5FREA 1GNHA 4P0JA 4Y26A 2Z42A 1GV9A 1N3OA 3B01A 4YZ5A 1Q04A 4GOYA 3PMEA 4KEKA 5KXBA 3ZSLA 3H6RA 5T54A 2SBAA 2Y9GA 1URXA 5JOZA 1LECA 1HWNB 2EAKA 2MIBA 4QD2C 2M49A 4OUJA 3TC2A 3AH2A 2H0BA 1SR4C 4L4HA 4QKSA 4ZA3B 1CJPA 3T1MA 4G1RA 1QOTA 2Y9XE 1FV3A 3A23A 5L73A 1UZYA 3AX4A 5FZZA 4UW6A 2D23A 3CNAA 5DZFA 3WA1A 4D0TA 1H30A 1WLCA 3I29B 3B00A 4JKQA 1SFYA 1CESA 4IQPA 1MS1A 4AGGA 3GNEA 1QMJA 3F1RA 1D2SA 1OQ1A 4XHXA 4YZ2A 3KM5A 1ULEA 3OGGA 4BLIA 2YROA 3FLTA 4GWNA 4PF5A 2D20A 2ZGUA 1SR4A 1M16A 2Z49A 2FO1A 1JQZA 3O5SA 5BXTA 3M3CA 2J3PA 1MZ5A 2LIEA 1UKGA 4Z8BA 2GZBA 3MPPG 4M3CE 3INAA 2DRYA 2NYYA 2Y9WC 3MALA 3BADA 3BA5A 2A75A 4I4VA 1BFBA 3SH4A 3BAGA 5BVPI 4J2SA 4XZPA 4YM3A 3AKHA 4JRAA 3SLIA 3BAUA 1SBDA 3WCRA 2W52A 3H6RB 2C5DA 1FWUA 1CONA 1MC9A 3WDTA 1NLSA 1JUIA 5KXEA 1KQRA 2ZACA 1LODA 3WG1A 3VT2A 3AZZA 1XYFA 2GNBA 2ZGMA 4YGEA 2P34A 1ISYA 4YZ3A 4LBQA 5DZUA 2OUHA 3I8TA 4I6IA 2OW4A 5JOYA 2FMDA 4LBNA 3A07A 1SBEA 2CWSA 3HSMA 1DZDA 2DVGA 2ZHKA 1CE7B 3CA3A 3WDXA 2WJSA 2A3YA 4QD2B 4FPLA 5BOWA 3U4XA 4LBQD 2EXKA 2NMOA 1LOAA 3QYDA 2EALA 3WMVA 1QU0A 3OJBA 4BMEA 2FHRA 3O0WA 4BQ1A 4BPZA 2AREA 5AVAA 4LO8B 5T52A 3DUIA 3BA4A 3FFZA 4DRVA 2D43A 1V6KA 4XIOA 5F8SA 1YO8A 2BEAA 1ULCA 4XYXA 3CQAA 1FMZA 2DVFA 3BB2A 1GYKA 3PHZA 2E7TA 3AXEA 4YG0A 5BXRA 5F5QA 1KRIA 3RRDA 3FJCA 3AYCA 3O4AA 1C4RA 2ZGQA 2D3PA 3WDWA 2CTVA 2BFHA 4F34A 2GN3A 1IOBA 1LHWA 4LO7C 3B9UA 1C1LA 2A3WA 1U0AA 1LU1A 1LOEA 4AVVA 1JW6A 4LBQB 2GNTA 4QO3A 3WZ1A 3S8KA 1W6NA 1EVTA 4HA2A 4L4IA 4R9AA 1S0JA 1W0OA 4WBCA 4IONA 1ITBA 3OPZA 2K8RA 3O4BA 1OFSA 2VSEA 3O5WB 2CWMA 1V6WA 2ZGSA 4ATFA 1VIWB 4M01A 4J2XA 5EWSA 2P3KA 4Y20A 1IS6A 4YW5A 5GZFA 4YW3A 4I4RA 4FPKA 4FPGA 1V6IA 3V0BA 3AKFA 3N0KA 1DJSB 2AFGA 4IY9A 4K1ZA 3NV1A 1PZ8A 3VEQA 4IZXA 1LU2A 1AVBA 1C1FA 3Q7WA 2ZZJA 3Q7XA 4D0ZA 3VKMA 3WINC 3O4CA 4ZGRB 1KITA 4R9DA 5CNAA 4P9YA 1RY7A 3N7KA 2P2KA 4XJAA 5LK5A 2WQZC 2GDFA 3CA0A 4FOVA 1S0DA 2ZMNA 1AXYA 1DQ0A 5DZEA 1EV2A 4P0LA 1P63A 1WD3A 2FFUA 4GOVA 2XOAA 5H9QA 1TIEA 3AJYA 2ZGKA 4CRQA 2DURA 5F8WA 1W6NB 1TWEA 1DZCA 3HN1A 2YMZA 3PJQA 2ARBA 4A7YA 3UL2A 2D3RA 4I4SA 5BQUC 4C1WA 1Q8OA 3POYA 2D22A 2PHTA 1IOAA 3R05A 3ZSMA 5E24E 3AZWA 2A6YA 4Q1RA 3IM0A 4NOTA 5KXCA 3LTQA 1CIWA 4YW2A 4Y20B 4LO7B 4YW4A 3V0BB 1DQ4A 2OUJA 4JPZA 1Z78A 3ZYRA 3ZYPA 4ATEA 1ISWA 5IK8A 3WG4A 2RG9B 1Z4SA 2DTYA 4YFWA 3WVJA 1CR7A 3VT0A 3LCPA 3WDVA 2AXMA 1IKPA 3P6IA 3WDYA 2QN4A 1GZWA 1DGLA 5BQUA 2MC2A 2A7AA 2AAIB 3FJAA 2JD4A 2NN8A 2IHOA 4FPOB 3PVNA 1WBFA 4HANA 1T9FA 3FJBA 1HIBA 1AVXB 4M3CA 4UW3A 4G9NA 2GMPA 2ZHLA 3ATGA 4XDQA 3AZYA 1LHNA 1I1BA 3WO3A 4LO2C 3BRDA 5F90A 4XMAA 1MS9A 3VSZA 1MZ6A 1AX2A 1S0EA 1W3AA 1VALA 5DXDA 2ZHMA 1WW7A 3C9ZA 4WVWA 4HJJA 3NJ5A 3BIWE 1LTEA 1JOJA 3ILRA 3POWA 1ZM1A 3O4OA 5FZUA 2JE9A 4DS0A 4LO2A 3ZXDA 2OVUA 4OW4A 3A4UA 2WSUA 2ZBJA 1F5FA 2CL2A 3O4DA 3ZX7A 3R4UA 2TEPA 3BX1C 1Q8SA 1QDCA 4PC4A 3TAYA 3OBTA 3FGMA 1OQLB 1GZWB 1S1AA 1LOCA 3IN9A 3M3OA 3B3QE 4U2AA 4BOWA 4PBOA 1L2HA 2DREA 1FATA 2DVBA 1NXD1 1S0GA 5G00A 4WZFA 4W65A 4R9BA 3IMNA 4Y22B 4M3CB 1S0IA 2VU9A 1YYNA 4EFPA 4TLPA 3RSJA 3M3EA 4I4UA 4I4YA 2YZ4A 1AVWB 1BLDA 1FGAA 1BARA 1DQ2A 3PVOA 4CZSA 1ONKB 1QNYA 1V6VA 3UJOA 4EEEB 3V64A 2ERMA 3AJ5A 4LBOA 3N35A 4Q26A 2CNAA 2ZGLA 1XZZA 4UW5A 2E4MA 1DQ5A 2EF6A 3POSA 2R9KB 3AH4A 4GP3A 2Q5TA 4GWMA 3VWCA 1CN1A 3AYAA 5DG1A 4XIKA 3ILFA 5T5PA 1IJTA 2KKIA 3SISA 4FPHA 4ZKTB 1HCEA 2A3XA 2DUOA 1D0HA 2KI6B 2VW2A 4EB2B 1Q03A 4H04A 3AYDA 4HL0A 1FWVA 9ILBA 2LTNA 3FUOA 3DGTA 5B2HA 3ZXKA 4XFSA 3CRHA 3AP4A 3FJ8A 1LESA 1LEDA 1JLYA 3EF2A 1F31A 3BODA 2JJ6A 3LLPA 1QGLA 3LSDA 4Q9PA 8I1BA 3LSEA 5H9RA 4P0KA 1MS3A 4LBMA 5HPZA 4ZLBB 1N1TA 1AXKA 1A78A 1FV2A 3D5OA 1FNZA 4Z8SB 2HW9A 3M2MA 2NM1A 5BXPA 4DENA 1YRZA 4X37A 2PHUA 2W39A 2UUSA 2VXTI 4TZDA 1PZZA 1O4ZA 4DCKC 1AVAC 3JRRA 1WW6A 2D7RA 4BM8A 4Q2FA 2R0FA 2JE7A 4RA0A 4AGVA 3WDUA 5HCFA 2AH2A 1SZ6B 4I37A 5GZCA 3ILAA 4X3AA 3UDAA 2A70A 2VXRA 5DUUA 2WRYA 5F8YA 4WVVA 4Y1ZA 5T5JA 4YOLA 2KH2A 3ZVXA 4IHZA 2D6OX 1G9AA 1WW5A 2P23A 1JBCA 2P3JA 3NBCA 1HWPB 2UWBA 1O4YA 4LO0C 1PUUB 2RSTA 1A3KA 3FJHA 1N3PA 3QR5A 2DTWA 3R4SA 1LOFC 3RMYA 3AH1A 1TEIA 5GZEA 1G7YA 5GLZA 3B9CA 1S0LA 3AP7A 1WBAA 5JVVA 4YLZA 3AYEA 1S0BA 2X2SA 3CU1B 3D6EA 3IAGC 1G86A 4Q27A 3ZXEA 3BOPA 2ZQNA 3B69A 3T2TA 2A5ZA 1JXNA 4KBBA 1AJOA 1RINA 2DV9A 4LO0A 3W58A 5HCBA 4YGBA 5E88A 3VV1A 2PHWA 1JT3A 2WBCA 4ZBVB 1QNWA 1UL9A 3T8SA 4Y1XA 4FVVA 2ZAAA 1FQ9A 3WUCA 4GKYA 2ERFA 4YG6A 2D24A 1TP0A 1V00A 1EYLA 4GAIA 3SH3A 1IS4A 2ZGRA 3WNXA 4ENDA 1LOGA 2D44A 1RG8A 3UJ0A 3O0VA 4JQ0A 4K21A 2ZGTA 1YF8B 1AXZA 1CVNA 4XTPA 1R1ZA 3WV6A 1KNMA 1JY0A 1Z0HA 3HR9A 1QQLA 4X38A 5JLVA 4M00A 4I30A 4AN6A 1E0OA 2R49A 4ISQA 4C1XA 3NBDA 1UN1A 4YW1A 3F62B 1BZWA 2DS0A 3JUTA 1V6JA 2WLQA 3QLQA 4Y1YA 5T5OA 3V65A 1XG6A 4PCRA 5BYNA 4AN7B 1GBGA 5DZGA 2FFVA 1JN2P 1IT0A 3I2XA 3N7LA 4XE9A 2E6VA 4DPNA 2Y9FA 3C2UA 3NV2A 4J23B 5GLVA 3RQ0A 4LO1C 2JKBA 2KLLA 3PVEA 5DG2A 4BLJA 1CQ9A 1DFCA 1Q8QA 2IWTB 4YM1A 4QBCA 2HYKA 1QDOA 4IY8A 3O44A 2WT2A 3D7WB 3ZC8A 1N1VA 4AVTA 5CA6A 3OJ2A 4RL7A 5DVHA 5H9SA 1J0SA 3NV4A 1W6MA 2ZA9A 5IK5A 2WKKA 3K1XA 1DQGA 3ZXLA 1LHUA 1CPNA 4QC4A 1DIWA 1GSLA 1DZQA 1XHBA 4I2SA 1IRAX 3O0XA 4Q91A 1GICA 4YZ4A 5D63A 2ZGNA 1W0PA 2WT1A 1SLLA 4LBJA 1ULFA 4GAFA 2XG3A 1TOOA 4F83A 1KDKA 1HKDA 1IS5A 1FN0A 5JOXA 3ZSKA 1SCSA 3CAHA 4ASMB 2KI4A 3WG3A 3WINA 1G9BA 1DYPA 1ISVA 3AP9A 3CRGA 4I4QA 2PELA 3S8JA 1BFFA 1YI7A 5CB7A 4Q9GA 4YFZA 1QOSA 4I7IA 1JLXA 4XJ8A 2QYIB 1DQ6A 1MACA 31BIA 3FJJA 4DEPA 3CRIA 2A6XA 5EHAA 4JC1A 2ZQOA 1FNYA 2NTDA 2AGSA 2ZR1B 4WV8A 2EIGA 1PC8B 3KQRA 2VLCA 4M3CF 1HCDA 4LO3C 1ZA4A 1IHKA 1ULDA 1AF9A 1KJLA 1H9WA 2MLLB 2X2TA 4R9CA 2NVHA 1SLTA 1MS8A 1W6MB 2SLIA 2DUQA 1QOOA 3ZXGA 2GMEA 1OKQA 2DVAA 4AVSA 1TFMB 4Q8KA 5DSSB 1AX0A 5GLTA 1LCLA 1NUNA 4FQZA 3VT1A 3P6JA 1LJ7A 2ZGPA 3FLRA 2EXHA 5SV8A 5GZGA 4J2YA 1A8DA 2UWAA 5DUWA 1DBNA 4LO3A 1NZKA 2KM2A 3UD9A 1WW4A 1IKQA 4ZOTA 2LIQA 3WO2A 1N1YA 3M3QA 2L5XA 3V0AA 1AX1A 5FNXA 4II0A 2P37A 5GLWA 5JMCA 4P6AA 2BEBA 4NO4A 1AFCA 3AZVA 1MR5A 4FP2A 2ENRA 4H9WA 3OBRA 3A0NA 1N1SA 3UJQA 3O3QA 1HLCA 4Q8LA 1QQKA 1DLLA 4K20A 3WHTA 2DU0A 1I3HA 2W68A 3IM5A 4EFQA 2YY1A 3ASIA 4I1BA 4XBNA 1LGBA 4FPFA 1BJQA 3GALA 3FJDA 4I0YA 3A21A 1WCSA 4FPYA 1JT4A 3IIRA 4L8QA 3H6QA 3USUA 4OEGA 2D6MA 2A6ZA 4UW4A 3AKGA 1APNA 3W59A 4I8MA 1ILR1 5HCAA 1ENSA 4GA9A 2W08A 3PUBA 2E7QA 1HQWA 5JOWA 2D6KA 4XOGA 3A0KA 2DU1A 1BLAA 1GZCA 3VKLA 4XFUA 2ZKNA 4AWDA 4X39A 3IPVA 1PUMB 4YG3A 1W6OA 1RMLA 1TTUA 1ABRB 1MD6A 2P39A 3OY8A 1HQLA 1UMZA 2HWAA 4DRRA 1ISXA 1LHVA 1Q8VA 4FOWA 3V0AB 3WMUA 3H0OA 4ISRA 3E8LC 3SNVA 3OJVA 2PHFA 2ZHNA 1VAMA 1AVUA 1IILA 6I1BA 1J1TA 3UD7A 2NZ9A 4XJWA 1CPMA 1M2TB 3NBNA 1MS5A 3MW2A 4LBLA 2VSAA 1ENQA 1Y7BA 1BYHA 1W3FA 3N7JA 5D61A 1W3GA 2A6WA 1WUVA 3N36A 1C57A 1CVSA 1V6XA 4YM0A 2YUGA 3JUUA 4R6UB 4XJ9A 1TWMA 3CA4A 4MYEA 2K4AB 1BKZA 3FUQA 1BQPA 3USUB 3IM7A 1G9CA 1PZ9A 1V6OA 2JDZA 2D1ZA 3KMVA 2ZABA 2EXJA 3WOGA 4GXLA 3H6SE 1F9KA 2RQ9A 3ILNA 4I1EA 4PBPA 5IUQA 4Y1UA 1FYUA 1HDKA 3VKFC 2D6LX 4GKXA 3I2AA 3UJ4A 3IPVB 3D4KA 2Z48A 3POKA 4JP0A 1W6OB 4Z9WB 4DQAA 3SITA 3OY8B 4GP0A 2NMNA 4OWLA 1KDMA 3BAOA 1Q56A 3WLUA 2ZMKA 4EKXB 2ZMLA 4XFTA 4I4XA 3RTJB 1VCLA 2BQPA 3ENRA 4FP3A 2EXIA 1S0FA 2VW0A 4CTEA 4OEEA 3BRGC 2CYFA 2YXSA 2A6VA 2VY0A 4A7ZA 3AP5A 1YBIA 4FOQA 3T1LA 2YV8A 1HWOB 3WO4A 4I4OA 3O49A 3VKNA 3ZC9A 4I4PA 1GGPB 2P3IA 1YTOA 1G9DA 4XBQA 3N7MA 1Z2VA 3AJZA 4JKXB 3FJKA 1VAVA 4FOYA 5GALA 4DFSA 4LBKA 3WUDA 1LEMA 1DHKB 5IK4A 4D8HA 3RTIB 1LGCA 3CA5A 2AR6A 2XB6C 3APBA 4XMIA 4XJZA 4D69A 4QKRA 3VSFA 1LULA 3UD8A 1FX5A 1B09A 2DUPA 3HALA 3I4IA 4YGCA 3Q9OA 2ET2A 4IZEA 1VLNA 4ZXKA 1MVQA 1GLHA 1Q8PA 2PHRA 4XHBA 2Q9XA 3AJ6A 1LOFA 3FJFA 2E51A 4XJUA 4G6JA 1R8NA 1GNZA 3FJIA 4KC3A 1SACA 1GKBA 3O12A 5E89A 1ISZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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