3AZVA

Crystal structure of the receptor binding domain
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
427
structure length
418
Chain Sequence
NEYFNSINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural and mutational analyses of the receptor binding domain of botulinum D/C mosaic neurotoxin: insight into the ganglioside binding mechanism
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords D/C mosaic neurotoxin
total genus 79
structure length 418
sequence length 427
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3azvA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3azvA02
1WUVA 3AZWA 4K1YA 1FV3A 3BAVA 3M3CA 4GALA 1QXMA 4AGRA 4FPFA 1PUMB 2D44A 2GNTA 1G9AA 2CWMA 3GALA 2D6NA 3R4UA 5CAZA 2AR6A 1LOFA 5HCFA 3RRDA 2EXJA 1ONKB 1HWMB 3P53A 3WLUA 4SLIA 3WDUA 5IK5A 3FGMA 5E24E 1W6MB 1V6KA 3O0XA 4QALA 2DU0A 4AYUA 1RG8A 2WT2A 3AZXA 4CRQA 1VLNA 1LTEA 3HR9A 4YG0A 3K1XA 1LODA 1MS0A 1ZM1A 2ZGNA 4DENA 3FJDA 4GKXA 4PC4A 1G7YA 4XBLA 4Q26A 3PJQA 2IWTB 1O4YA 3S8JA 21BIA 3WMVA 1RITA 1AJOA 3B3QE 2FO1A 1LENA 2D22A 2FGFA 4ZKTB 1PZ9A 2DU1A 1TFMB 3AH4A 6I1BA 1SLIA 1SFYA 2M49A 2KI4A 3HALA 1FWUA 4I4RA 2MLLB 2AQZA 2ZHLA 4BMEA 3CA3A 1FAYA 1VAVA 5DG2A 2I1BA 4YZ5A 1IT0A 4I4XA 4AVVA 2D43A 4AN6A 3ZXKA 1WD4A 2C5DA 4QBCA 4DEPA 1T9FA 4IY8A 1MS4A 3WA1A 2FDBM 2GNDA 3SH4A 2D20A 3S8KA 3LSEA 5BXRA 4AGVA 3I29B 4TLPA 2OVUA 1MZ5A 1MS9A 3VEQA 3FJKA 1MS8A 1GZWB 3TB0A 3AYDA 3AJ5A 3WDYA 2R0FA 4ITCA 1JT4A 5E88A 4WVWA 1OFSA 2KM2A 1SZ6B 3ZC8A 4XJ8A 1OQLB 4USPA 1SR4C 4LBJA 4HR6C 3AYCA 4I4PA 4XZPA 1C4RA 1N1TA 3O0WA 1DZQA 3ILNA 5E89A 2H0BA 1ENQA 1AVAC 1O4ZA 1N3PA 1H30A 1HKDA 4Y20B 2QN4A 4BLJA 4Q9GA 1TEIA 3R05A 4L4IA 1A3KA 3AKFA 2ZBJA 3T1LA 4G6MA 4YGCA 4OEGA 1GICA 4L4HA 3JRRA 2KI6B 1Y7BA 1G86A 1QOOA 3CQAA 1UAIA 2JE9A 3V0BB 2XG3A 1W3AA 2ZGUA 4I0YA 1AXKA 4PF5A 1V6VA 3ZSKA 3N35A 1QF3A 4H55A 2VXTI 3O49A 4LO2A 9ILBA 2AXMA 4LBQA 1JN2P 5GZDA 2DVFA 5DZEA 4OZXA 3FJEA 4WZFA 2ES3A 3BADA 3D6EA 4Q1RA 1JT5A 1YIFA 3M3QA 1AVUA 1DLLA 1ULFA 3N7JA 4Y24A 1UKGA 4XE9A 1YBIA 1Q8SA 3CU1B 5IT6A 2VW2A 2E53A 4XXAA 5JVVA 1FX5A 1SLTA 3FJHA 2HZ9A 3M3OA 4XJWA 2J3PA 1LESA 1W3GA 4YM3A 2ZMLA 4HJJA 5EG6C 3WO3A 4I6IA 1AXYA 2PHXA 1TOOA 3OYWB 1JHNA 4P9XA 3IM0A 2EXHA 1DZDA 1YI7A 1QDOA 1UL9A 2ZR1B 1JUIA 3UDAA 5GLWA 1RY7A 31BIA 4DPNA 1APNA 3A21A 2A75A 4K20A 4XJAA 4DFSA 5D61A 1DQ2A 1DQ6A 1LULA 3ZXFA 3AZYA 1A8DA 4D0TA 3HOMA 1PZZA 1LOCA 4UW6A 2AUYA 1BASA 4DQAA 3H6RB 2PHUA 1D0HA 5EYYA 2P3JA 3NWKA 4XBNA 5FNXA 2ZHNA 4Y1YA 1HCDA 4ATFA 4XJZA 3MPPG 4J2SA 1S0CA 2E4MC 2YV8A 1G9CA 2AFGA 5EWSA 3H6SE 5BXSA 4YW4A 4XTPA 3TC2A 2ZGPA 1JOJA 1II4A 1LGNA 1MC9A 1WBCA 1XG6A 5BYNA 4EEEB 3IM7A 3O44A 4JKXB 4PBPA 1EYLA 4I4VA 1S0EA 1UX6A 5BXPA 1DQ0A 2E51A 1W6OB 3TAYA 1ILR1 4DRVA 4GXLA 2Q9XA 1QQLA 1WLWA 2TEPA 4JQ0A 1FGAA 3FJ9A 1R8OA 4Z8BA 3UJ4A 3A07A 3AKGA 1MS1A 4D8HA 4X37A 1LOFC 4DCKC 2C9AA 2GMPA 3E8LC 4I30A 2Z48A 2P39A 4FOVA 1ENSA 4FVVA 4G1RA 1CE7B 1OKQA 2L5XA 3OJMA 1CR7A 4R9BA 5GM0A 1AX0A 4D0ZA 5T55A 1IKQA 1XQNA 1X50A 4FPOB 5BP5C 2NZ9A 4C1XA 3F1RA 4M3CB 2FFVA 4EKXB 3VKLA 3ZXEA 4I4OA 1HWNB 1MR5A 4ZLBB 2YUGA 3N7LA 5JLVA 3Q7XA 2D6OX 1UPSA 2Y9XE 2ESUA 3AJYA 1DQ4A 3FJBA 1G9FA 1G8WA 1V6LA 3NJ5A 3AP7A 2P23A 4I7IA 3FJJA 2ZGOA 2ZHKA 1WD3A 4Y1XA 1CIWA 3WNXA 3ILRA 3WV6A 3VT2A 4FQZA 2A6VA 1BYHA 3D4KA 2WT1A 4IONA 3PUBA 4HL0A 4RA0A 1MD6A 4Z8SB 2BEBA 3UJ0A 1GNZA 3V0AB 1KITA 3AYAA 5FZZA 3C2UA 2D7RA 1ITBA 4H04A 5F9TA 1W6QA 3FUOA 2YROA 4XDQA 4X39A 4Y26A 2HW9A 1WCSA 3A4UA 3LCPA 4Q8KA 4J2KA 2DYCA 1TWMA 1MVQA 1HQLA 4LBLA 3N7KA 4FPCA 1K5VA 1LOBA 1URXA 1QNYA 2V73A 3B00A 2E7QA 5SV8A 3I2AA 1SLAA 3B9UA 5DUYA 1JBCA 1RIRA 3RTIB 3PVEA 4M01A 4P14A 5DUUA 1DQ5A 1Q04A 2GNBA 5G00A 1AXZA 1CPNA 2PELA 1GGPB 2ERMA 5CB7A 1F5FA 2JE7A 3ZXDA 3SITA 5KXBA 4U36A 1KDMA 4YW2A 4NO4A 1IILA 1JT7A 3BAGA 5H9QA 5D62A 3CA5A 2ARXA 1B09A 1V6OA 5F5QA 4I4YA 4KEIA 1AZDA 1T4QA 4FOYA 4Q1PA 2ZGMA 3OY8A 5GJ6A 2WBCA 4LO1A 5F90A 4ZFWB 2A6ZA 4OUJA 4YZ3A 1V6NA 3ENRA 1QKQA 2LIEA 4I4UA 4G9NA 4YM2A 4M3CE 1RMLA 2A70A 4LBKA 3ILFA 4XBQA 2K43A 2Y9WC 3JUUA 1FNZA 1IOAA 4GOYA 5GALA 5DUWA 1BJQA 2VXRA 2AGSA 2W52A 4FPLA 4FPYA 2ZKNA 2D6PA 2ZGQA 2NM1A 2GO2A 1I3HA 1EPWA 2MIBA 1R1ZA 4P0LA 3V64A 5H9RA 2V5YA 2YXSA 4XFSA 3QCWA 3IKWA 3CRHA 2VLCA 4KBBA 4CZSA 2PHWA 4YM1A 4YW1A 4ISRA 2ZGLA 1HQWA 1KNMA 4OEEA 1WW5A 4IQPA 1RZOB 4PBOA 1CONA 1DJSB 4Q2FA 3W9TA 3FUQA 5L73A 2A3XA 2F8XC 1DQ1A 1S0FA 2CNAA 1GLHA 5JOXA 3CA0A 4I4QA 4L8QA 5DZGA 3WG4A 3AP4A 5E8AA 5F8WA 2VH9A 4TZDA 4YG3A 1FMZA 2X2SA 3ZSMA 3PVOA 3R4SA 2KKIA 4H9WA 2UWAA 3I8TA 2E6VA 3WINC 3CNAA 1HKNA 4YOLA 4U2AA 4ZA3B 3ZVXA 3FJCA 1LCLA 4P9YA 2NYYA 1BFGA 1XHBA 2BQPA 2ZA9A 3IPVA 4YW5A 3BODA 3MW3A 1V6WA 1VAMA 4LO0A 3AXDA 1Q8VA 4BOWA 1V00A 3BAOA 4QD2C 1AXMA 2A71A 3ASIA 4Q8LA 3LTQA 1LHNA 2FHRA 1MACA 3RMYA 1JY0A 3WG2A 2WSVA 4M00A 3P6JA 4GWNA 4ZFYB 3QLQA 1AFCA 3VKOA 1BZWA 2DREA 2Z49A 1JXNA 2D24A 1CVNA 1A78A 3UJQA 1LOAA 4OWJA 1LU2A 1Z0HA 4I3NA 1LOEA 4LO3A 1ENRA 1GSLA 5T50A 3USUA 1W6PA 1PZ7A 4LBOA 1SACA 1N1SA 4GOVA 4A7YA 1J1TA 3AZZA 3H6QA 3ZSLA 5GLTA 2LIQA 1D2SA 2RG9B 3AH2A 4F34A 1H9PA 3BAQA 5F8SA 3BTAA 5T5OA 3V79C 2XOAA 4NOTA 2ZQOA 2DUOA 1DFQA 1LEMA 3VUOA 1LHOA 2KH2A 3IMNA 5KXCA 4K21A 5EHAA 5BQUA 1QU0A 2D3SA 3O4CA 4ASMB 5DZFA 2KLLA 4I37A 3AP6A 5BOWA 4EFQA 2RHPA 3CRGA 3SNVA 1J0SA 1BFBA 1VCLA 4OWLA 1FYUA 2P34A 4LBQD 1SLCA 2AH2A 1DQOA 3ZPYA 4FPKA 1DYKA 2P2KA 3AJZA 1ISYA 1JT3A 2DS0A 2AYHA 4OW4A 5JDBA 4F83A 4ZFUB 4FQ4A 3SISA 2R16A 2UWBA 4XOGA 1EVTA 2G4IA 4FOWA 2NMOA 1IS4A 1WW6A 4Y22A 4FPJA 1DHKB 1ULGA 1GV9A 4IHZA 3OGGA 4ATEA 2Z42A 5HCAA 3RG0A 1HWOB 4KEKA 3OPZA 3KMVA 8I1BA 3WUCA 7I1BA 1S0LA 3POYA 4IYBA 2VY0A 3IM5A 4I1EA 4JCKA 4GKYA 4G9MA 4JAWA 4A7ZA 3HMYA 1CJPA 2VU9A 3NV4A 3H6RA 2JKBA 3M2MA 2ET2A 4J2XA 1AVBA 3O5SA 4YZ1A 5H9PA 3Q7WA 1V6UA 4XJUA 2ZHMA 1N1YA 4Y1VA 4RL7A 2AENA 2GZBA 3PG0A 4XMIA 5CA6A 3VKMA 3AP9A 3O12A 5IK8A 1W6NB 3RTJB 2DVGA 5DSSB 2EALA 2GMEA 1BXHA 4IY9A 3ZX7A 3OJBA 1IRPA 1FATA 3VT0A 4QD2B 3POWA 2ZGTA 2W08A 4EB2B 3AXEA 1SLBA 1IHKA 1UZYA 1GYKA 2GNMA 4CJMA 1YXWA 4ISQA 5BXTA 3T8SA 4GAFA 4TYSA 3KM5A 1AX1A 1Q56A 3IN9A 4OEFA 5AVAA 1ZA4A 1SR4A 2K4AB 1Z4SA 2I2SA 4I1BA 3BRGC 4ZOTA 3D5OA 1S0GA 2DUQA 1ULDA 4GA9A 5DUXA 1EV2A 3O4DA 4Z9WB 1NUNA 1FN0A 2R49A 3NBCA 3AKIA 4EFRA 3N0KA 2DVAA 1S0DA 4FOQA 4AGGA 1SBFA 3APBA 1W3FA 4GWMA 2Q5TA 2JD4A 2WQZC 1LGBA 4HA2A 3M3EA 4EFPA 1KRIA 4XYXA 1LHWA 3I2XA 5I1BA 3FFZA 3H0OA 1IJTA 2WT0A 3VWCA 5JOYA 1MVEA 1ISWA 1R8NA 2R1BA 1JW6A 3WDTA 4Y1ZA 1L2HA 3WMUA 3V0AA 1TP0A 2VUAA 5CNAA 4YZ2A 2RQ9A 1N47A 5HPZA 3UJOA 1E0OA 4YFZA 4ENDA 2A6WA 4R6UB 1ULCA 1IOBA 3Q9OA 4C1WA 2F2FA 5FZYA 3FJFA 4XMAA 4GP0A 4A7KA 1NLSA 5GZFA 2NP0A 4X38A 4YM0A 5GZCA 4USOA 2W68A 4YW3A 2CWSA 4LBMA 1W6QB 3M1HA 4LO0C 1C1LA 1WBAA 4FP2A 2EIGA 1ISZA 1MS5A 3BA5A 1YTOA 1N1VA 2OW4A 1BQPA 4XHBA 3MALA 5FNWA 1JLYA 4ZBVB 5KXEA 2DVBA 4YGDA 41BIA 2GDFA 5GLVA 1ULEA 1Q8OA 1PWAA 4JKQA 1IRAX 5H9SA 1N4KA 3FLPA 4XKIA 4R9AA 2DTWA 1LU1A 3QR5A 3VSZA 4JP0A 2ZGSA 2NTDA 4FPGA 1BFFA 3Q7YA 2BFHA 5IUQA 2X2TA 1CVSA 3OGFA 2WKKA 3WVJA 1S1AA 1Z78A 2HWAA 3VKFC 4GAIA 1V6MA 5JOWA 1F31A 3VSFA 1AVWB 1GKBA 1SLLA 2E4MA 3WOGA 3LLPA 4CTEA 4XFTA 3POKA 2Y9FA 1S0BA 2ZACA 3RSJA 2P37A 1FMMS 2DRZA 1ISVA 3OY8B 1WBFA 3AKHA 4LBNA 1TTUA 1FNYA 2E7TA 3WCRA 4D69A 4LO2C 1HIBA 2DURA 2DV9A 2D6MA 3BOPA 4BQ1A 3N7MA 3AJ6A 2HWMA 1NZKA 3LSDA 4P6AA 1W6MA 1SCRA 1UZZA 3BAHA 2B7YA 3MW4A 4QO3A 4GP3A 1GZ9A 3WO2A 1I1BA 1AF9A 3D7WB 3OJ2A 4X3AA 5DG1A 3WDWA 1QGLA 2R0HA 2D7IA 4P0JA 3WDXA 3RS6A 1M2TB 5BP5A 3DGTA 1QNWA 1DIWA 2W39A 3VV1A 1MZ6A 4R9DA 5FREA 1LJ7A 5LK5A 2A3WA 4BM8A 1BARA 4AVSA 4JC1A 1WBLA 1XZZA 3GNEA 1N3QA 3AYEA 2Q3NB 1WLCA 4AVTA 3WHTA 3I4IA 1GANA 4LO7B 4JRAA 1CQ9A 2D6LX 3BRDA 5IK4A 3O0VA 2ARBA 4AWDA 1Q8PA 2P3IA 4II0A 1C57A 2XB6C 1WLDA 3BA4A 1OQ1A 5CBLA 1QOSA 2A6YA 1JLXA 5EXOA 2UURA 1PC8B 3WCSA 2EXIA 4XTMA 3N3HA 3VKNA 5HCBA 1LECA 3L2YA 5IK7A 2DTYA 2LALA 1F9KA 4QKRA 1GZWA 1H9WA 4J23B 2ZABA 1I1EA 2OUJA 1DFCA 3A23A 3IIRA 2R9KB 3IPVB 1VIWB 3SNMA 3JUTA 1DQGA 5T54A 4Y1UA 3AFKA 2JDZA 1FV2A 4WVVA 2ZGRA 2ZGKA 4G6JA 3OBRA 4XHXA 2Y9GA 4Q91A 1AX2A 4LO8B 2GN7A 5T5LA 2UU8A 3SH5A 2VSAA 4FP3A 1U0AA 4P0KA 4YGEA 4MYEA 3OBTA 4HANA 5EC5A 2EAKA 3NV2A 3OJVA 2K8RA 1V6IA 4Y20A 2VW0A 3EF2A 3O3QA 3UD8A 1AJKA 3USUB 1W6PB 2YY1A 3ILAA 1LGCA 3JU9A 1TWEA 1CPMA 3WO4A 3MEPA 2IHOA 3U4XA 3V0BA 2D6KA 3QYDA 2WRYA 4DRRA 4KEJA 3FJ8A 5DUVA 2CTVA 3AX4A 5B2HA 4UW4A 2JJ6A 1DYPA 4I4SA 2UWCA 1HCEA 5GLZA 1S0IA 2VSEA 3UD7A 1VALA 1IKPA 3A22A 3P6IA 3NBNA 1BFCA 1IS6A 3RQ0A 3O4AA 2ZQNA 4BLIA 1TIEA 4LBQB 4PQ9A 1UN1A 1YO8A 3BAUA 3WUDA 5T52A 3F62B 2HYKA 2DWRA 3N36A 2UUSA 1N3OA 3OYWA 4I8MA 2F2FC 2PHRA 2ENRA 3WZ1A 3PHZA 1LEDA 3W59A 2WLQA 4Y22B 4XJ9A 2ZAAA 3UK9A 1CESA 4P9WA 4ZGRB 2CL2A 3ZXJA 2NMNA 3O4BA 2WSUA 4Q9PA 2WJSA 3ZXGA 2WNEA 2D3PA 3A0NA 2GN3A 1JTCA 4XIOA 4YLZA 3CA6A 1W0PA 4XIKA 4XXPA 3AZVA 3C9ZA 4UW5A 2AREA 3B69A 1DGLA 1G82A 1Q1UA 1DZCA 3WG1A 3AK0A 3FBYA 3UL2A 3AH1A 1LOGA 1KDKA 4YFWA 2RSTA 3WINA 2EF6A 1YRZA 2LTNA 1FWVA 2PHFA 2FFUA 2CYFA 2ERFA 1BLDA 1IS3A 3ZXLA 1SBDA 1G9DA 3B9CA 1W6NA 1GNHA 1WW7A 1PUUB 4J2YA 4UW3A 4I2SA 1YYNA 4LO1C 4WV8A 3PMEA 2ZZJA 3ATGA 1W6OA 5EYXA 3FLRA 3BRFA 4WBCA 3A0KA 3RMXA 1V6XA 3IM6A 1C1FA 1SCSA 1RINA 2A5ZA 5D63A 1G9BA 5GAQA 2D1ZA 1ONAA 2DRYA 1LHUA 2NN8A 1QOTA 2MC2A 4JPZA 1W0OA 1JYCA 4IZEA 3ZYRA 2NVHA 1AVXB 1QMJA 4OWKA 2DVDA 2ZMKA 3ZC9A 5JOZA 1GBGA 4M3CA 3HN1A 1FQ9A 1YF8B 2GMMA 2R1DA 4XFUA 3KQRA 4AN7B 3WDVA 3WG3A 3NBEA 2A3YA 1PZ8A 1S0JA 2SLIA 3O4OA 1V6JA 3IAGC 4LO7C 3FLTA 3CA4A 5DZUA 1QDCA 4FPEA 3DUIA 2D7FA 2JECA 1Z2VA 2VW1A 1KJLA 3NV3A 3FJAA 4BMBA 3W58A 1KJRA 4IZXA 2AAIB 5FRAA 2EXKA 1IS5A 5GLUA 2PHTA 3HBWA 2D3RA 4ZXKA 1NXD1 2D23A 1Q8QA 4W65A 5GZEA 4I96A 3BB2A 1QQKA 3INAA 5KXDA 3CRIA 2FMDA 4XILA 4YG6A 4KC3A 2A6XA 4R9CA 3POSA 1SBEA 5T5JA 2BEAA 2YZ4A 1DBNA 3FJIA 3CAHA 1M16A 1K5UA 3O5WB 2SBAA 3V65A 4PCRA 3NBDA 4BPZA 1HWPB 3BX1C 1LHVA 3UD9A 4K1ZA 2ZMNA 3ZYPA 1P63A 5F8YA 1HLCA 1UMZA 4QKSA 3VT1A 1JYIA 5GZGA 3T1MA 3BA7A 4Q27A 5T5PA 4QBVA 2CY6A 4YZ4A 1ABRB 5DVHA 2A7AA 4YGBA 3BIWE 5BVPI 1GZCA 1HDKA 3MW2A 5FZUA 1KQRA 4LO3C 2QYIB 3NV1A 3PVNA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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