3AZWA

Crystal structure of the receptor binding domain
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
427
structure length
418
Chain Sequence
NEYFNSINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural and mutational analyses of the receptor binding domain of botulinum D/C mosaic neurotoxin: insight into the ganglioside binding mechanism
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords D/C mosaic neurotoxin
total genus 86
structure length 418
sequence length 427
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3azwA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3azwA02
3M2MA 4JKQA 1UKGA 1V6JA 3CQAA 4HANA 1MC9A 2RHPA 4ZFWB 1RG8A 1Q56A 1JW6A 1MD6A 3QLQA 3BA4A 1W6OA 5T50A 1SBFA 1S0GA 3QYDA 4CJMA 1K5VA 2GMPA 3HR9A 4XHBA 2VW0A 1V6NA 5FZUA 2QN4A 1PZ9A 3T1LA 3AZWA 1LCLA 1I3HA 4LO0C 4LBMA 3O4BA 2D6MA 1YRZA 4A7ZA 5GM0A 2A3YA 5FNXA 3O49A 3AP6A 3M3CA 4FPCA 1SCRA 1GBGA 1DBNA 4Y1UA 4YM2A 3AX4A 1ISWA 1QQLA 1ISZA 5T5PA 4EFPA 2ARBA 1HKDA 2NMOA 4AVSA 1KQRA 3CRGA 2ZHNA 1R1ZA 5IK5A 1SACA 4XJ8A 4J2YA 1R8OA 4Q9GA 5F8SA 1JQZA 2UWCA 2JE7A 1W3GA 1H9WA 4HL0A 4P6AA 5BXSA 1QGLA 3N0KA 4GAIA 3WG2A 1LGCA 1DQGA 1V6OA 4AVVA 2ZGNA 4XJZA 2E51A 2VXRA 3A21A 4UW4A 1SLIA 2JKBA 4UW6A 3WINA 1S0JA 4PQ9A 4FPHA 1FMZA 2EALA 1GGPB 4YG6A 4LBKA 4M00A 4JAWA 1L2HA 4IYBA 5JVVA 2D6LX 3WLUA 1WBAA 1JT4A 1Z4SA 5DUXA 4FPOB 5EXOA 3W58A 4IY9A 1IT0A 2ZR1B 1BLAA 1DZCA 1S1AA 4X39A 1O4YA 3OGGA 2DREA 1G82A 2E4MA 4Q91A 2P37A 2P34A 2EF6A 5EC5A 4OWLA 4FPFA 2ET2A 3K1XA 1NXD1 1HWNB 2DURA 3VKMA 3IAGC 3ATGA 1Q8OA 2A6VA 2P3IA 5H9RA 5D62A 3FJBA 3FJIA 1CVNA 1HWPB 3WMUA 2AUYA 1VAVA 2WT2A 4GAFA 3VEQA 4XFSA 4I4PA 2RQ9A 3IPVA 3VUOA 1SBDA 4I2SA 5T55A 3BAQA 1JYIA 1W6NA 4YFWA 2PHXA 2L5XA 5FREA 3QCWA 4FQ4A 3IN9A 5EYYA 1WCSA 2DVFA 3HSMA 4Y24A 1MR5A 2D6KA 3PVNA 5IK7A 1KDMA 2VW2A 2CYFA 2ZZJA 3VKNA 1SLCA 3BIWE 4LO1A 3CA5A 5IT6A 4H9WA 3D6EA 3O4OA 1JUIA 1G86A 1SR4A 5EWSA 2ZHMA 3OBTA 5JMCA 1A3KA 3B00A 3ZXEA 2E7QA 3RMYA 3VKLA 1V6XA 4BM8A 4G1RA 1S0IA 2ZACA 3D4KA 2ERFA 3OJBA 1BFBA 4XIKA 1F9KA 1RZOB 1II4A 4GA9A 3CA1A 1XYFA 1APNA 4Y22B 1LEMA 3WOGA 2D6PA 3T8SA 2WJSA 2EXKA 2DVAA 4M01A 2R1DA 2ESUA 3FJEA 4XXPA 3CAHA 4M3CE 7I1BA 1JT5A 2VXTI 4BMEA 4QO3A 1MVQA 1PUUB 1T4QA 2ZBJA 3WINC 4YOLA 4DCKC 2BEBA 1WBFA 2GMEA 4KC3A 4XE9A 3H6SE 4BQ1A 4G9MA 3H6QA 4AN7B 1ULGA 1LOGA 3W9TA 2B7YA 3NWKA 2AFGA 1G9DA 3T1MA 3FLTA 2MLLB 3FJCA 4XOGA 2A7AA 2AENA 4XTMA 1SCSA 2R49A 3CU1B 4FPEA 5LK5A 3AKGA 3CA6A 3TAYA 2FO1A 3N7MA 2F2FA 2D6OX 4EFQA 1FMMS 3A07A 1XZZA 1F31A 2WKKA 5T5JA 3AH4A 3WCSA 5T5LA 3ILNA 4LBJA 4R9DA 2PHRA 1FV3A 1OQ1A 2GO2A 4DEPA 3M3QA 1CPMA 3HN1A 1W6QB 1CQ9A 4A7KA 3ZSKA 3IM5A 2UURA 2QYIB 4YM1A 3DGTA 1J1TA 4YM3A 2SLIA 4I4SA 1P63A 1W6MB 3FUQA 4R9BA 4FPJA 3B9UA 3TB0A 4YGDA 4DS0A 3H0OA 3PMEA 4YW4A 5F9TA 3R05A 1DQOA 4YW2A 3CRIA 2WSVA 1MZ5A 1AX1A 3B01A 2GNBA 1FWVA 3ZSJA 3ZSLA 1Q04A 3WVJA 3GALA 3UK9A 3M1HA 5CBLA 4LO2A 41BIA 3FJHA 2C9AA 3IPVB 2UWAA 4XDQA 5GZFA 1AJKA 2VSEA 3I4IA 1N1SA 2M49A 1JY0A 1MS8A 3AYCA 4Y1ZA 2MIBA 1XG6A 2C5DA 1HKNA 1CJPA 3OJVA 5GAQA 4WV8A 4D69A 4USOA 5GLVA 2AXMA 4ZA3B 5HPZA 2PHUA 4U36A 2ZGLA 1WBCA 4XFTA 4YGBA 1BYHA 2DUPA 4TYSA 4KEKA 4AYUA 4L4HA 1GLHA 2R9KB 4K1ZA 5GALA 3AJYA 2YV8A 4YFZA 4UW3A 4Y20B 1W0PA 1ISXA 2D6NA 3AZVA 3GNEA 3IM6A 4P0LA 5FZYA 3WV6A 3ZX7A 5F8WA 4OZXA 2VSAA 4FP2A 5AVAA 2ZGPA 4XIOA 1BASA 3ZPYA 3ASIA 2JE9A 2D3RA 2F2FC 4I30A 3NV3A 3NBEA 4K20A 4Y1VA 1TP0A 1LU2A 4BOWA 1SZ6B 4LBOA 1IS5A 1QDOA 4Y26A 2YZ4A 2IHOA 1BLDA 1S0FA 1BZWA 1YO8A 3DUIA 1GNZA 1BARA 3Q7YA 5KXDA 3RRDA 2H0BA 1FATA 1WW5A 4MYEA 5BP5A 5JLVA 3KQRA 4Q27A 4JPZA 3B9CA 4EB2B 2ZGUA 4PF5A 3FUOA 1UPSA 1N3QA 2R1BA 4OWJA 1KJLA 4D0ZA 2ZGTA 2D20A 4LBQB 1CN1A 4GWNA 1WW7A 3N7LA 5FZZA 3IM7A 1V6VA 4P9WA 4QD2B 1AVWB 4C1WA 4YZ5A 4JC1A 1QMJA 3O5WB 4WVWA 2BFHA 1MS1A 4PBPA 4G9NA 2ZQOA 3O0XA 3W59A 4I6IA 2K4AB 4TZDA 1JXNA 1QU0A 2DU1A 1T9FA 4I4YA 4IY8A 3ILRA 3N7KA 2EXIA 3RMXA 3VT0A 2J3PA 1M16A 3RS6A 2V73A 1AZDA 1F5FA 2EXJA 1ULDA 4JKXB 1YTOA 5G00A 3NV1A 5IK8A 1QNWA 1IS3A 2ARXA 4QC4A 4OEFA 2Q3NB 1LTEA 1G7YA 3NV2A 4ZBVB 4I4RA 1DQ1A 3R4UA 2VW1A 2WT0A 3AH2A 4FOVA 4I4XA 1V6WA 4YG3A 1GV9A 1LODA 1DJSB 1LHNA 3VV1A 4Y22A 2ZHLA 5JOYA 1IKQA 2YXSA 4BPZA 3SLIA 1LHOA 1VIWB 3NBDA 1FX5A 5EG6C 4WBCA 4XJUA 1ILR1 1PZ8A 4QBCA 4DENA 3JRRA 2X2TA 4XMAA 2NM1A 1DFCA 4PCRA 2P39A 2GMMA 1N1TA 1JYCA 5KXCA 3BA5A 3AP7A 2Q9XA 2AREA 4ISQA 3LCPA 2DS0A 1C1LA 4KEJA 3AKFA 1QXMA 1G8WA 3HBWA 4XMIA 1TWMA 3AYDA 5BP5C 1H30A 2YROA 4AGGA 1AVXB 4QKRA 1DIWA 5HCFA 3P6JA 4I1EA 3VSZA 2NTDA 4XHXA 4Z9WB 4X3AA 1A78A 3POSA 3OJMA 2HYKA 3O0WA 3WUDA 5IK4A 3V0BA 2DWRA 1JTCA 1DYPA 1S0EA 2WLQA 4YM0A 5JOWA 5DUVA 3UD8A 3FBYA 2ZMNA 2DRZA 2LIEA 3PUBA 1BFFA 1RMLA 1W6PB 3MW2A 2KLLA 3D7WB 1IKPA 1ZM1A 5DG2A 4EFRA 1LENA 4WVVA 4UW5A 1FN0A 3WHTA 1RINA 2DTYA 2D44A 1ZA4A 1W6QA 4J2XA 3VSFA 1CPNA 4R9CA 1W6MA 1HWMB 4J2SA 4D8HA 1SLBA 5T5OA 1HCDA 4DQAA 4LO7B 3WO4A 4HJJA 3RTJB 4GKYA 3LLPA 1ENRA 1GNHA 3WDYA 3B69A 3A0KA 4FOYA 4TLPA 3RSJA 2D3SA 4BMBA 3ZXJA 3C2UA 3JUTA 2AQZA 2K8RA 2OUHA 1UZZA 2P2KA 3NV4A 1W3FA 4ZXKA 1QKQA 3POWA 1Q8SA 2KH2A 2V5YA 3NBNA 1LOBA 2DUQA 5BYNA 5D61A 2ZGOA 2R0HA 4P14A 1HLCA 2E53A 3SISA 1YBIA 4H55A 2E7TA 1UZYA 4YZ1A 1MS0A 3WDXA 1Z78A 2WBCA 4JRAA 3CA4A 1LOAA 1PZ7A 2I2SA 1S0BA 2K43A 3NBCA 1JLYA 3MALA 2HWMA 3B3QE 1IHKA 1GZ9A 3OBRA 4PBOA 1I1BA 4Y20A 5DG1A 2SBAA 5GLZA 4YW1A 3PVEA 1ONKB 3N7JA 3U4XA 3D5OA 5T54A 4I37A 2D22A 5DUWA 1WLWA 1G9AA 1TWEA 3BRDA 4OWKA 3WMVA 4DRRA 4ASMB 2Y9WC 3F1RA 1EV2A 4NOTA 2JDZA 2UWBA 2D23A 3S8KA 4AGVA 2DYCA 3IKWA 1HCEA 2NYYA 1FGAA 4XKIA 2A70A 1WW6A 2YUGA 1N3PA 1NZKA 3IM0A 4CTEA 3CNAA 1BXHA 3UJOA 4GP0A 4GOVA 3WUCA 2ZGQA 1G9BA 1AF9A 2Z48A 3UJ0A 2P3KA 2E4MC 1QOSA 4YLZA 1DZQA 4U2AA 3BX1C 3PJQA 2AR6A 4I4OA 1LOFA 3V0BB 1YIFA 1YI7A 4YZ4A 2A6YA 1N1VA 2JJ6A 1JBCA 1LGBA 1XHBA 2ZABA 1FNYA 3BAHA 5D63A 2A3XA 5L73A 4M3CF 1N1YA 4QALA 4LBQA 3I8TA 5E8AA 5BXTA 2A6WA 1KRIA 2BQPA 1MS4A 1D2SA 3N35A 1BFCA 4JCKA 1IRAX 2DRYA 3AXEA 1V6UA 2Y9XE 3A22A 3RG0A 2FFVA 5DUYA 3SH5A 1FYUA 1O4ZA 2GN3A 5E88A 4DPNA 2DVDA 3HMYA 3BAOA 4I96A 2WT1A 3ZC8A 1QQKA 5BXPA 3BODA 3SITA 3AZYA 3EF2A 4YZ3A 4KBBA 4XJWA 4LO1C 2P23A 2KKIA 1SLTA 3FJ8A 2LTNA 3F62B 1YXWA 4AN6A 1FQ9A 1WD4A 4Q8KA 4Q26A 1AXZA 1CE7B 4YW5A 1SR4C 1ULFA 4OEEA 2R16A 2ZGKA 2LIQA 1C57A 4GXLA 5EHAA 2ZKNA 3HOMA 3SNVA 2UUSA 2FFUA 3BAVA 4OEGA 2VH9A 2DVBA 3MPPG 3SH3A 2RG9B 4I8MA 4L4IA 1LULA 1IS6A 1IJTA 1AX0A 4W65A 2CL2A 3A23A 3FJJA 2MC2A 1ENSA 2G4IA 3AFKA 4I4UA 1GSLA 4FGFA 5DSSB 3INAA 4LBQD 1A8DA 9ILBA 1RITA 5T52A 5JOXA 3UJ4A 1EYLA 4CZSA 3WNXA 2A6XA 2GNMA 1CR7A 1ISVA 4K21A 4CRQA 2LALA 3FJDA 1LECA 1LESA 1DHKB 1D0HA 2NP0A 2CTVA 2R0FA 3WCRA 1LOFC 3AP4A 3OYWB 5DZUA 1QOTA 4IZEA 1GYKA 2OW4A 2D7RA 4EKXB 4LO0A 1DFQA 1TOOA 2FMDA 4I3NA 1CESA 3BAUA 1ONAA 3AXDA 1UAIA 1Q8VA 1DQ5A 2HZ9A 1M2TB 3SH4A 5BOWA 5GZCA 3V64A 1W6PA 3OY8B 3WDTA 5GLUA 1N3OA 4QD2C 3UDAA 4XBQA 5F8YA 1GICA 2CNAA 3BOPA 4GKXA 4GWMA 1I1EA 1J0SA 1MACA 1HWOB 1LHVA 3P53A 3VKOA 1MVEA 1EVTA 2HWAA 1G9FA 1S0LA 4FP3A 5GLWA 4FOWA 1IILA 4XBLA 2ENRA 4LO2C 5DVHA 3ZXDA 3I2XA 3TC2A 4LO3A 3AJ6A 4R6UB 1RY7A 1WLCA 3WDUA 4NO4A 2ZAAA 5HCBA 2D43A 3O4AA 4FPYA 3VT1A 4XILA 1URXA 4XJ9A 3Q7WA 1IOBA 3C9ZA 4C1XA 3A0NA 1FAYA 1PWAA 3AZZA 2KI4A 1JN2P 2ZGSA 4ENDA 1V6IA 4JP0A 4D0TA 1Q1UA 2ZGRA 5GZDA 3PG0A 2HW9A 3ILAA 1KNMA 1G9CA 1AX2A 1FNZA 3FFZA 4Q1RA 4P9XA 1GKBA 1QF3A 2FGFA 2WRYA 3CRHA 1W3AA 1FV2A 1E0OA 1WLDA 4ATEA 5GZEA 3IIRA 2PELA 4F83A 5KXEA 3E8LC 3R4SA 4YGEA 4BLJA 1LOEA 3JUUA 1DYKA 1V6KA 5HCAA 1XQNA 3ZVXA 3WO2A 3AZXA 1QNYA 3Q7XA 2BEAA 4M3CB 2EAKA 1SBEA 3IMNA 2PHTA 3M3EA 2A3WA 1N4KA 4AWDA 1SLAA 1BQPA 2X2SA 3MW4A 4R9AA 1AFCA 2OUJA 31BIA 1TTUA 1Q03A 2DUOA 1EPWA 3NJ5A 4ZLBB 3WG4A 1W0OA 4BLIA 1DZDA 2ZHKA 1UN1A 3UL2A 2EXHA 2W39A 5CA6A 3OGFA 3AKHA 1S0DA 2D24A 1GZWA 3O4DA 4LO7C 4IZXA 1LHUA 4OUJA 1UL9A 2KM2A 3ENRA 1DLLA 3POYA 4FPGA 2PHWA 3MW3A 2AH2A 2YMZA 4GOYA 2Z49A 4XTPA 2CWMA 5H9SA 4LO3C 5IUQA 1YF8B 3PVOA 1LGNA 3RTIB 3FLRA 2GZBA 1PC8B 4Q1PA 4X38A 4LBNA 4WZFA 5KXBA 3UD7A 2VLCA 2ZGMA 4I7IA 2AAIB 4J23B 4XBNA 1NUNA 4LBLA 2YY1A 1TIEA 4FOQA 2GNTA 2PHFA 2VY0A 3UJQA 3VKFC 1ENQA 2AYHA 2GALA 1K5UA 1LEDA 3FGMA 3T2TA 4Y1YA 4OW4A 4IHZA 2D7IA 3POKA 4G6JA 1BKZA 3O44A 3KM5A 8I1BA 2DTWA 2W68A 3O0VA 4L8QA 3LSEA 3HALA 5DZGA 5JDBA 4I4VA 2P3JA 2Z42A 1PUMB 3ZXLA 4USPA 2JD4A 3AJZA 2CWSA 2FHRA 3WG1A 3FJAA 1IOAA 1N47A 2WQZC 1BA7A 3V0AA 3L2YA 3OJ2A 2Y9FA 1S0CA 3BAGA 1GZCA 3AYAA 3BADA 3WG3A 1JLXA 1MS3A 1W6OB 3ZXFA 3FLPA 1LOCA 3ZYRA 5CNAA 2W08A 1VAMA 1V6MA 5F90A 2A6ZA 1JT7A 3ZYPA 3MEPA 3S8JA 4LO8B 4XZPA 4Z8SB 4QKSA 4FVVA 1SLLA 2JECA 4YZ2A 1BJQA 5H9QA 5CB7A 3OYWA 4K1YA 1DGLA 1CIWA 3LTQA 2GNDA 2ZA9A 2VU9A 1VALA 2ZQNA 4PC4A 1AVBA 1U0AA 3BA7A 3O4CA 3OY8A 1HQWA 5GZGA 5EYXA 1OQLB 1Y7BA 4I1BA 1V00A 1KDKA 4I4QA 1QDCA 4A7YA 3WHUA 1GZWB 1MS5A 5JOZA 1GANA 1AXKA 1C4RA 3V79C 1FWUA 5B2HA 1V6LA 1AXYA 2NN8A 2FDBM 1WBLA 5DZFA 2UU8A 2XB6C 4AGRA 1HIBA 4QBVA 4I0YA 3H6RA 3Q9OA 1Z0HA 1AJOA 2DU0A 2ZMKA 3I2AA 5H9PA 1ULEA 4XJAA 3OPZA 2D7FA 21BIA 1VCLA 4XFUA 4G6MA 2XOAA 5BQUA 1C1FA 1OKQA 2ES3A 3ZXGA 4YGCA 4KEIA 1TFMB 4XYXA 3USUA 4IONA 2ZMLA 2AGSA 1H9PA 1WW4A 5F5QA 4DRVA 3O3QA 1YYNA 5FNWA 1JT3A 1IRPA 5GLTA 3A4UA 2D1ZA 2E6VA 4EEEB 1LHWA 1JHNA 4J2KA 2XG3A 5SV8A 4YG0A 3FJ9A 2Q5TA 3AJ5A 3APBA 4ZOTA 1ISYA 1KITA 3O5SA 1IS4A 1AVUA 4FQZA 1NLSA 4GALA 1MS9A 1VLNA 3N3HA 1AXMA 1DQ2A 5GJ6A 1W6NB 1ITBA 3AP9A 3WDVA 4DFSA 2A71A 1PZZA 2DVGA 4ZKTB 1WD3A 6I1BA 5I1BA 3VT2A 1BFGA 1WUVA 5DZEA 3BB2A 2RSTA 3P6IA 2F8XC 1DQ4A 4AVTA 5BVPI 1CONA 2Y9GA 1Q8PA 1LJ7A 3V0AB 1X50A 3ZC9A 4P0KA 2NVHA 4M3CA 2KI6B 4H04A 5E24E 4ISRA 2EIGA 3ZXKA 1MZ6A 2A75A 2TEPA 3KMVA 5E89A 4HA2A 3WDWA 2CY6A 4ZFUB 4Z8BA 3PHZA 5FRAA 3SNMA 1DQ0A 3WZ1A 4Q2FA 4Q8LA 1SFYA 1AVAC 4X37A 3AP5A 4GP3A 1B09A 4P0JA 3WA1A 2NZ9A 1TEIA 4XXAA 2GDFA 1R8NA 2I1BA 4IQPA 4ZGRB 1DQ6A 3FJFA 4ATFA 1CVSA 3AK0A 3BTAA 3AKIA 3I29B 4JQ0A 2A5ZA 2DV9A 3BRGC 3V65A 3VWCA 2D3PA 1UMZA 4HR6C 2W52A 4Q9PA 5BQUC 1Z2VA 4FPKA 4FPLA 3UD9A 4P9YA 1OFSA 1ABRB 4RL7A 3N36A 3ILFA 5DUUA 2VUAA 3BRFA 4ITCA 1LU1A 1QOOA 4Y1XA 4ZFYB 3H6RB 1HQLA 2WSUA 3RQ0A 3AH1A 2NMNA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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