3FUQA

Glycosylated sv2 and gangliosides as dual receptors for botulinum neurotoxin serotype f
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
411
structure length
399
Chain Sequence
DNSILDMRYENNKFIDISGYGSNISINGDVYIYSTNRNQFGIYSSKPSEVNIAQNNDIIYNGRYQNFSISFWVRIPKYFNKVNLNNEYTIIDCIRNNNSGWKISLNYNKIIWTLQDTAGNNQKLVFNYTQMISISDYINKWIFVTITNNRLGNSRIYINGNLIDEKSISNLGDIHVSDNILFKIVGCNDTRYVGIRYFKVFDTELGKTEIETLYSDEPDPSILKDFWGNYLLYNKRYYLLNLLRTDKSITQNSNFLNINQQRGVYQKPNIFSNTRLYTGVEVIIRKNNTDNFVRKNDLAYINVVDRDVEYRLYADISIAKPEKIIKLIRTLGQIIVMDSIGNNCTMNFQNNNGGNIGLLGFHSNNLVASSWYYNNIRKNTSSNGCFWSFISKEHGWQEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Glycosylated SV2 and gangliosides as dual receptors for botulinum neurotoxin serotype F
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords BoNT/F (Neurotoxin type F)
total genus 101
structure length 399
sequence length 411
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2009-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3fuqA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3fuqA02
4EB2B 3ZSJA 2VLCA 2ZMNA 1LTEA 3AXDA 3AKGA 3AZVA 2VU9A 1JYCA 3UJ0A 4DFSA 2DUOA 3M3CA 2EF6A 4Q8LA 4K20A 5EYYA 1AXZA 4KBBA 1QKQA 1NXD1 3OYWA 1DFCA 2X2TA 4RA0A 1LJ7A 4FPYA 2BEBA 3D7WB 5DZFA 1V6WA 1H30A 3OJ2A 31BIA 3AP6A 4P0KA 5FZYA 3IPVA 3LSDA 2D3PA 3NV3A 5T5JA 4U36A 3Q7XA 2DVDA 4XJUA 3FLTA 3A0NA 3O0XA 2ZACA 1IILA 3WCSA 21BIA 5IUQA 2EAKA 1G7YA 4TLPA 4IQPA 4XOGA 4KEKA 5IK7A 2ZMLA 1AJKA 3N7JA 3EF2A 5GJ6A 2A6WA 3N0KA 4Y1UA 2DU0A 4DRRA 4M3CE 4HJJA 4D8HA 4KEJA 3IAGC 1I3HA 4P9YA 1SR4C 4LBQB 1BJQA 2E51A 3PHZA 4Q27A 2WLQA 4FPKA 1QQLA 5DSSB 4LO0C 2FHRA 1JBCA 1Q56A 4ZFYB 3FUOA 4F83A 4QBVA 3Q7WA 1FNZA 1YXWA 3BAGA 2C5DA 3NV2A 4K21A 4YZ2A 3PMEA 2GNDA 3W9TA 4U2AA 3D5OA 3M2MA 3NBCA 4LO2C 4DENA 1IKQA 1S0EA 2WRYA 3HOMA 4AGGA 1MS0A 1DQ4A 3O12A 2K8RA 5GALA 4CZSA 4XJ9A 5F90A 1FN0A 2TEPA 2K43A 1BZWA 3N36A 1WD3A 4EEEB 1FATA 4BLIA 4C1WA 3BAUA 4J2KA 4WVWA 3N3HA 1ULEA 2WBCA 2NTDA 4BMEA 1IOBA 2JDZA 1CVNA 1QNWA 3FBYA 1YO8A 3FFZA 1S0BA 3BODA 1BLDA 3WMUA 3IM0A 4X38A 3HBWA 1LODA 4OUJA 3VT0A 4F34A 4MYEA 2R49A 4Q1PA 1JQZA 2IWTB 2ARBA 1H9PA 1OQ1A 1AX0A 2KLLA 2D24A 2YXSA 2JE7A 1FNYA 3AK0A 1RITA 1ULFA 3K1XA 1W6QA 4XYXA 3NWKA 3AYCA 4LO1A 4JC1A 3CA5A 3UJOA 3W59A 1YRZA 2GMPA 4EFQA 1XZZA 3FJDA 3ENRA 1LOBA 1ISXA 3HSMA 1WW5A 4M01A 3H6RB 2JECA 3BX1C 5AVAA 2P3JA 1LHWA 1TEIA 1UX6A 1DYKA 3WDVA 2F8XC 1S0JA 4X3AA 2W08A 4UW5A 5GM0A 2ZQNA 3SISA 3V0AA 4XIOA 3WG2A 1SCSA 1AF9A 5T54A 1WBCA 4Y24A 3KM5A 4FOQA 3F1RA 4G6JA 3WHTA 1TIEA 4Y1VA 2OW4A 4GKYA 1W6QB 4HA2A 3RRDA 1IS4A 4K1ZA 1N3OA 3ZXJA 2QYIB 3JUUA 2VXRA 4PBPA 2D23A 1KQRA 1YBIA 2HZ9A 1LESA 1RMLA 2AFGA 4J23B 1BFBA 3AP7A 4XMAA 1I1BA 3OBRA 4I7IA 4A7ZA 1FWUA 4DPNA 2CNAA 1AXKA 2PHRA 4ATEA 3I4IA 1A8DA 1W6OA 4XFSA 3CRGA 5HCFA 1S1AA 4C1XA 1PZ7A 2K4AB 2ZQOA 1ULGA 4YW5A 5IK4A 3M3OA 3V0AB 4BPZA 1MS1A 1O4ZA 1OFSA 5IT6A 5JDBA 2Q5TA 2AREA 3WO3A 3C2UA 4M3CB 3WZ1A 2PHUA 4LBJA 3AJYA 5IK8A 2GNTA 4A7KA 1N1VA 1LOGA 3USUB 4Z8BA 4ZA3B 3OBTA 3PVEA 1HDKA 1QDOA 4XDQA 1LHVA 3AJ5A 2WKKA 1JT4A 2UUSA 2D3SA 5EWSA 5H9PA 4XJZA 5B2HA 2GMEA 4W65A 2V73A 3CRHA 2E4MA 4LBNA 1U0AA 3IM6A 1BA7A 4XZPA 1WW7A 5KXCA 3SH4A 1S0CA 3VUOA 1T9FA 2HYKA 2ZGPA 2GN3A 2W39A 3ZXDA 3AYEA 1HKNA 2D6MA 2ZGRA 5DZUA 4USPA 3AH1A 4LBLA 4FPFA 5T5LA 4R9CA 1KJLA 4XKIA 5EG6C 4R9BA 3KQRA 4HANA 4AWDA 3O3QA 4I1BA 2A5ZA 1X50A 2GMMA 1DJSB 4YM0A 3BAOA 4Y20B 1QOTA 3SNVA 3V0BA 3INAA 4USOA 2MIBA 2ZKNA 4P9XA 1UPSA 1S0IA 2P3IA 4JKXB 2R1BA 5CB7A 1FMMS 3MW3A 2JJ6A 5GLVA 3UD9A 2ZGMA 1P63A 1UN1A 3MW4A 2A3XA 4ISRA 3WDWA 1IS6A 1HKDA 1J1TA 3I2AA 1CPNA 5DXDA 4XFTA 1A78A 5JOWA 4H04A 4J2SA 1GYKA 1V6LA 3POKA 3V79C 4XILA 1LOAA 1HCDA 2R0FA 1DQ6A 4GKXA 1EYLA 1IT0A 4I3NA 3V0BB 4IZXA 3VKLA 4A7YA 1GNHA 1T4QA 3OJVA 4LO1C 3S8JA 4ATFA 3FJEA 4AGVA 1CIWA 1FYUA 1CJPA 3V65A 4OEGA 3B00A 3WUCA 2PHXA 5GZDA 1LULA 4I30A 2VY0A 2VH9A 1DIWA 1W0PA 3WNXA 3A07A 1QNYA 4WBCA 1CPMA 4AGRA 3BB2A 1APNA 1V6MA 2ZHKA 3R4SA 1F9KA 4FPCA 2UWBA 2GNBA 4OEFA 4KEIA 1JYIA 2I1BA 3H6SE 3HMYA 1N1SA 3VT1A 2D6KA 5GZFA 1AVAC 2PHWA 1VIWB 1K5UA 3N7LA 4YW4A 2Q3NB 2PELA 3AFKA 3AZYA 2FO1A 3HR9A 2A6XA 5GZGA 3JRRA 3OGFA 1LGNA 1H9WA 3RG0A 5JMCA 5F8SA 1DLLA 2MLLB 1MVQA 2VW0A 1QOSA 3T2TA 4JAWA 1Q8VA 4H55A 1YYNA 3CA0A 1AX1A 4FP3A 4GAFA 2DV9A 1IOAA 1LGCA 1NZKA 2EALA 1DZDA 2BEAA 1LHNA 3ZC9A 4LBQA 2ZHNA 4LO7C 3WCRA 2D6NA 1RY7A 2ZGTA 4XJWA 2ERFA 4IY9A 3CNAA 2ZA9A 4GALA 1W3FA 4JRAA 2DURA 4YG6A 1LOCA 3L2YA 4I1EA 2E4MC 1WBFA 3MEPA 5E89A 1Y7BA 2NP0A 2VSAA 4YZ4A 5L73A 3TB0A 4UW6A 1II4A 1XYFA 5T5PA 4YM2A 3FJ9A 2ZAAA 1LHUA 2CY6A 5JVVA 3UD8A 2WT0A 4GWMA 3ZXFA 4DEPA 1UL9A 3ZXEA 1LEMA 5FRAA 2ZGLA 1G9FA 3AP5A 1G82A 2YUGA 3RTIB 2A6YA 5JOYA 1AVUA 3SH5A 3QR5A 4TZDA 1BFGA 2DU1A 3QYDA 3I2XA 1TFMB 1HLCA 1ONAA 4ZOTA 4BMBA 2BQPA 1CESA 2AR6A 1G9DA 3TC2A 3BTAA 4P9WA 4YM1A 4R9DA 3RQ0A 1WD4A 1LU2A 2XG3A 3AZZA 5GLWA 1ENQA 1W6PB 4Q26A 4XE9A 5I1BA 5EYXA 4QD2B 1V6VA 4HR6C 1VALA 1FMZA 2W52A 3B3QE 1DZCA 2JKBA 2ZR1B 4IONA 5BQUA 2Z48A 4Z8SB 1O4YA 3CA4A 3AYDA 1ONKB 2DRYA 2V5YA 5FZUA 1HCEA 4AN6A 2FFUA 3I29B 4DQAA 1ZA4A 2P2KA 5BYNA 5BVPI 1Z4SA 3BAHA 4PC4A 1WW6A 3H6QA 2SLIA 3HN1A 3VKNA 5KXEA 4Y22B 1CONA 3H6RA 4FOWA 3FJIA 1LGBA 3F62B 2I2SA 4X37A 1GV9A 3BAVA 4BM8A 1MC9A 3AH2A 3ILNA 2GNMA 1ABRB 4Y26A 2DTWA 2Z42A 5BP5C 3WG1A 1UZZA 3IMNA 3WV6A 5DUWA 5BXRA 2ES3A 1LEDA 1ISWA 1B09A 4XIKA 4P0LA 2DTYA 4PF5A 4Q91A 1MD6A 4BLJA 2ZBJA 5DUVA 1JLYA 3FJJA 5FREA 1V6IA 3WO2A 2YMZA 1QGLA 1TWEA 4IY8A 4Q1RA 2FFVA 1ISVA 4AVSA 1IRPA 2OVUA 4GXLA 4ZXKA 3PVNA 2H0BA 2ESUA 1W3GA 1Z0HA 2R0HA 2KI4A 4GAIA 5DG2A 5GAQA 4H9WA 5F9TA 1L2HA 1Q8QA 2PHTA 3B69A 3O0WA 2AAIB 3CRIA 5DG1A 1E0OA 4JQ0A 2RSTA 1W6NB 1JLXA 5CNAA 4G6MA 4M3CA 2Y9WC 3O49A 2CWMA 4Q2FA 2GDFA 4BQ1A 4P0JA 3VKOA 3H0OA 2AXMA 3DGTA 3FJAA 3O4CA 4JCKA 4DS0A 1N4KA 3USUA 4JKQA 1W3AA 3LLPA 2LTNA 2Z49A 3APBA 4YFZA 5BOWA 1OQLB 2L5XA 5DZGA 2WT2A 5F8WA 2M49A 4LBMA 1SBFA 1AJOA 3V64A 3FJKA 3POYA 3GNEA 1WCSA 1AVBA 1PUUB 3ZXKA 4JPZA 1QQKA 1XHBA 4GA9A 3VKFC 3ILAA 1TOOA 2W68A 4P14A 3O4AA 4D0TA 1G9AA 3WLUA 2WSVA 2VW1A 4XXPA 2KKIA 1JXNA 2NMNA 2VW2A 4IYBA 4AN7B 5DVHA 2YROA 4RL7A 4Y20A 3SH3A 4WVVA 2ET2A 3AKFA 4XHBA 1DHKB 3U4XA 5BXTA 1GLHA 3O4OA 4CTEA 4FOYA 1YI7A 3ZYRA 1IRAX 1SZ6B 3AJZA 1G9CA 1V6UA 3RSJA 3O44A 2WQZC 2R1DA 4M3CF 4I6IA 1FWVA 1HQWA 4Q9GA 2ZABA 3CQAA 5BXPA 1GBGA 1GZ9A 1M16A 1RZOB 4YGEA 4XXAA 2DUPA 3N35A 2P23A 2AH2A 1GGPB 4YZ5A 3S8KA 3M1HA 2EXHA 3JUTA 1Q8OA 1DQOA 1WW4A 1BFCA 3LSEA 4YZ1A 4I4SA 1ITBA 4OWKA 3VSZA 3WINA 3UJ4A 5BQUC 1N3QA 8I1BA 3WUDA 1ISYA 2EXJA 3O4BA 2D20A 4QO3A 5FNXA 1N3PA 4QBCA 2UWAA 1LECA 2CYFA 4XJ8A 2YZ4A 3RMXA 3UK9A 2AGSA 1PZ9A 1M2TB 3WDTA 5HCBA 5D61A 1DQ1A 3ILFA 3SNMA 5KXBA 4NO4A 3AYAA 4XJAA 4L4IA 1DGLA 4Y1ZA 4EFRA 4FVVA 3BAQA 3FGMA 9ILBA 4GOVA 1JOJA 1GICA 5D62A 1SLBA 4L4HA 1WLCA 5F8YA 2B7YA 3RS6A 3BRFA 3IM5A 3PVOA 3M3QA 1SLLA 5IK5A 1HWMB 1MZ6A 4PCRA 1SACA 2CTVA 4ZGRB 3T1LA 4Y1YA 3MALA 3Q7YA 3UJQA 1JUIA 3BADA 3WG3A 2VSEA 4GP0A 2ZGUA 1UKGA 3SITA 3IM7A 3B9CA 5JOZA 1YIFA 3MW2A 4YM3A 5BP5A 3ZX7A 1A3KA 1ZM1A 4Z9WB 1VAMA 1HQLA 1Q04A 4UW3A 1RG8A 3OGGA 1FGAA 5CA6A 3A4UA 2F2FA 1V6KA 3OJBA 3VKMA 1MACA 1SLCA 4TYSA 4XMIA 3ZXGA 3ZSMA 5EXOA 1G8WA 1DZQA 2D6PA 2BFHA 4NOTA 3BA5A 3WDUA 2KM2A 2AENA 1SLAA 3WVJA 3WG4A 2FGFA 1BFFA 4FOVA 2NMOA 4OEEA 2D44A 1IS3A 4YG3A 1S0LA 3P6IA 1PWAA 3OY8A 1S0DA 3O5SA 3AP9A 3ZVXA 4D69A 1IS5A 3WOGA 2DRZA 4YW3A 4FPGA 5T50A 3W58A 1UZYA 2DVAA 3UD7A 3BA7A 2DREA 2DUQA 5FZZA 1D0HA 2SBAA 1BARA 4YLZA 1QXMA 1LHOA 4R9AA 1Z2VA 3GALA 3CAHA 1AXMA 3WMVA 1Q8PA 1WBLA 5EC5A 3O5WB 4IHZA 1S0GA 1GZWB 3RTJB 1EPWA 4ISQA 3R4UA 2D6LX 1MR5A 3B01A 1PUMB 1N1YA 5H9QA 3LCPA 1MS3A 1PZZA 2C9AA 2NM1A 3OY8B 5T55A 2A6ZA 1ULDA 4WZFA 5G00A 3A0KA 4PBOA 3NV1A 2YV8A 1DBNA 1PC8B 5DUYA 4Y1XA 4YG0A 1TTUA 5SV8A 1WLDA 3FJ8A 1SFYA 3C9ZA 4JP0A 1QF3A 2WNEA 2KI6B 3O4DA 2ERMA 7I1BA 4LO8B 4I2SA 4OW4A 2Y9GA 1EVTA 3O0VA 2E7QA 1CQ9A 3PJQA 1W6PA 2JE9A 5JLVA 4UW4A 1BXHA 1ULCA 5FNWA 4OWLA 1KITA 1QMJA 1D2SA 3AKHA 3IKWA 4AVVA 4G9NA 1GNZA 3D6EA 3QCWA 1CR7A 2HWMA 1LCLA 3FJHA 1BQPA 3OYWB 5H9RA 3I8TA 4FP2A 4M00A 1KDMA 5T52A 3WINC 1DQ2A 4Q8KA 3T8SA 1AXYA 3IPVB 1S0FA 1J0SA 1LOEA 4Y22A 3POSA 2MC2A 2DS0A 1GANA 4LO3A 3WO4A 1LOFA 3T1MA 3FJCA 4FPOB 3KMVA 2AQZA 1RINA 1XQNA 2DVBA 1C4RA 1DQ5A 4I4XA 1IKPA 1F31A 3M3EA 1I1EA 2ZMKA 1WLWA 2RHPA 1OKQA 2P37A 4YGCA 4GP3A 4XTPA 1UMZA 4GOYA 1CVSA 2EIGA 1MS9A 5GLZA 2DWRA 3A22A 3AH4A 3R05A 2ZHMA 5E24E 3IN9A 1JY0A 2EXIA 4BOWA 1BKZA 3AP4A 4ZLBB 1JT5A 5GLUA 2CWSA 4LBQD 4EFPA 4YGDA 1AVXB 2Y9XE 5GLTA 3NBNA 2F2FC 3Q9OA 1W6NA 1V6NA 2A71A 5DUUA 2A3YA 1MS5A 2D6OX 2A75A 4XTMA 1GZCA 3WDXA 1C57A 1VAVA 4CRQA 1JT3A 1R8NA 2LIEA 5E8AA 4I4UA 4ENDA 2AYHA 3AZXA 1XG6A 1V6JA 2J3PA 2NN8A 2VXTI 5E88A 2NZ9A 2DVGA 3JU9A 4I4OA 1HWOB 1FX5A 3NV4A 3PUBA 4FPHA 3BOPA 4XFUA 3FLPA 4FPLA 2NVHA 3LTQA 1NUNA 1KNMA 4YW2A 2RQ9A 5HCAA 5CAZA 2FMDA 4AYUA 3VSFA 1V00A 1G86A 3BIWE 2P3KA 2GZBA 2HW9A 1QDCA 4LBOA 3CU1B 5T5OA 4ZFWB 1HWPB 4YZ3A 1G9BA 4I4QA 4XBQA 1JHNA 3POWA 4ZFUB 2ZGKA 4ASMB 3BA4A 3AX4A 3B9UA 1SBDA 1W0OA 2R9KB 2D1ZA 2D7FA 3AZWA 2UU8A 1MS8A 1SBEA 3DUIA 2LALA 4J2XA 4ITCA 1F5FA 1W6MA 3RMYA 5DUXA 2OUHA 2Q9XA 4YGBA 5D63A 1FV2A 2QN4A 1WUVA 4FQ4A 4G1RA 5KXDA 3E8LC 1GKBA 2YY1A 1QU0A 3WHUA 5GZEA 1MVEA 4QKSA 3CA1A 4HL0A 1MS4A 4K1YA 2OUJA 1CE7B 4XHXA 1CN1A 1WBAA 2JD4A 1BYHA 3P6JA 3VWCA 3AXEA 4QD2C 3ATGA 2XOAA 4I4VA 2EXKA 2P39A 3WDYA 1BASA 2E53A 1ENSA 1ISZA 1VLNA 5BXSA 1W6MB 1VCLA 1DQGA 1Q1UA 4WV8A 4Q9PA 1C1LA 1KDKA 3AKIA 2ZGNA 1YF8B 4X39A 1RIRA 3ZSLA 3SLIA 4GWNA 1UAIA 3PG0A 4P6AA 1W6OB 1FV3A 2A3WA 3HALA 3FJFA 4FGFA 5DZEA 1PZ8A 3ASIA 2GO2A 1FAYA 1V6OA 2KH2A 5F5QA 3FUQA 3AJ6A 3ZXLA 4LO3C 4I96A 3OPZA 3D4KA 1LOFC 4SLIA 3NBEA 1K5VA 3A23A 3UL2A 1QOOA 2WT1A 3ZSKA 1SCRA 2ZHLA 1Z78A 2UURA 1JTCA 1SR4A 5GZCA 3ILRA 4LO7B 2ZGOA 1C1FA 1KRIA 4LO0A 4I8MA 4I4RA 2AUYA 2ENRA 2R16A 3CA6A 2Y9FA 4G9MA 3VEQA 4XBNA 2DVFA 2LIQA 2HWAA 4QC4A 2G4IA 3BRGC 4QALA 4I4YA 4LO2A 4J2YA 4R6UB 5JOXA 3N7KA 1BLAA 2GN7A 1NLSA 3FLRA 2ARXA 2WSUA 3NJ5A 4I4PA 4IZEA 2D22A 2E6VA 3CA3A 2D7RA 5LK5A 1R8OA 4D0ZA 2IHOA 2FDBM 1LENA 1LU1A 4YW1A 1MZ5A 4XBLA 2ZGQA 3VV1A 3BRDA 2WJSA 3TAYA 2PHFA 2X2SA 4PQ9A 4L8QA 1TWMA 4OWJA 3MPPG 1TP0A 2D7IA 4EKXB 2D3RA 1URXA 5H9SA 1FQ9A 4I37A 3ZPYA 2A70A 2DYCA 4OZXA 1AFCA 1DFQA 1Q8SA 1V6XA 41BIA 3UDAA 3IIRA 4II0A 1JT7A 3OJMA 1YTOA 4DRVA 3VT2A 1ENRA 2NYYA 1AX2A 4ZKTB 2UWCA 1N47A 3P53A 4ZBVB 3A21A 1GSLA 5EHAA 4FPJA 2RG9B 1SLTA 1GZWA 4KC3A 5HPZA 4AVTA 2VUAA 1AZDA 1AVWB 3QLQA 2CL2A 1HIBA 1IHKA 3ZC8A 4YOLA 1KJRA 2E7TA 3FJBA 2A6VA 3WA1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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