3HMYA

Crystal structure of hcr/t complexed with gt2
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
450
structure length
442
Chain Sequence
NLDCWEDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Gangliosides as high affinity receptors for tetanus neurotoxin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium tetani
molecule keywords Tetanus toxin
total genus 120
structure length 442
sequence length 450
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 2009-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3hmyA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3hmyA02
1R8NA 1WLWA 3WMVA 1TFMB 3FLPA 2EXHA 4XXAA 3L2YA 1I3HA 3MW4A 2Z49A 1U0AA 3MW3A 1BFFA 2EXKA 3ZSLA 1N1SA 3MW2A 3QCWA 1Z4SA 4YG0A 4GAFA 4ZA3B 5DVHA 3HMYA 2VY0A 1LOFA 2WRYA 2ET2A 1GICA 4USOA 4QO3A 2DVDA 3A23A 1W6OA 1IRPA 5DZEA 2P3KA 3ZC9A 1FATA 1MS9A 2OVUA 1V6NA 1DZCA 1CPNA 2ZGRA 4AN7B 4D0ZA 1Z78A 3RTJB 2Y9GA 1LOAA 1H9PA 4GAIA 4YG3A 5H9SA 4Z8BA 3CA5A 1JUIA 1JYIA 1IS6A 3CRHA 2YXSA 2WSVA 1ISVA 2ZBJA 1ISZA 2L5XA 2D3SA 2FO1A 4XIOA 3IAGC 2MLLB 3NV3A 1S0LA 1LHNA 4LO2C 1FAYA 3PVOA 5GLWA 2LIQA 4KEJA 3SNVA 5E89A 3O3QA 1VCLA 3FJDA 4XTMA 3P53A 1QF3A 5FNXA 4XKIA 3DUIA 3WOGA 3QYDA 3QR5A 1JQZA 5JDBA 3B01A 2PELA 2ZMKA 1S0GA 3AP5A 1DYPA 2V73A 3B9CA 4Z9WB 4LBJA 1QOTA 3UJ0A 5FZUA 3WCSA 2ZGLA 31BIA 3LSEA 3O0XA 4KBBA 4OEFA 3UD8A 2A3XA 1QMJA 1URXA 3ZX7A 1LECA 4I4VA 3E8LC 1WW4A 3W9TA 3OGGA 1SLTA 3VT2A 5CAZA 3OBTA 5F8SA 1S0EA 4ISRA 3JUUA 3O12A 2A70A 3ZYPA 2JKBA 1DQ4A 5EXOA 4LO1C 2CWMA 5EWSA 3AKGA 3UJ4A 2A6ZA 3O5WB 2ENRA 3D7WB 2NN8A 2D43A 1GKBA 4I4RA 21BIA 1ILR1 4XBLA 4FPOB 3NBCA 4YFWA 4I4OA 3T8SA 3BA7A 2ZHLA 4YW5A 2C5DA 2WLQA 3WG2A 41BIA 1XQNA 2XG3A 5GLZA 1YYNA 2R49A 5CA6A 1LGCA 1LULA 3WNXA 1L2HA 1LCLA 5T5JA 4BLJA 4LO8B 2D20A 3BAHA 3T1LA 1ZM1A 3UD7A 1UZZA 4YGBA 1MS4A 3RS6A 1TP0A 2E4MC 4UW5A 3A21A 2BQPA 1FWUA 1CE7B 3USUB 3CQAA 1YIFA 2QN4A 4FVVA 4YGEA 2GO2A 3FJKA 2K43A 1C1FA 3KMVA 1O4YA 1IS4A 1Q8PA 3N36A 4DRVA 4BOWA 4I30A 4MYEA 1NUNA 2R1DA 4Y1VA 4WVWA 1AJKA 1DQ5A 4GKXA 3O4BA 2Y9FA 3AXEA 4YGDA 4K21A 1IKQA 4IQPA 3O49A 2P3JA 3HSMA 4YW4A 4ATEA 1J1TA 3WG3A 4L4HA 3AH2A 3ZXJA 1LHVA 5DUUA 4BMBA 4D69A 4F83A 1RY7A 2AXMA 3SNMA 3UJQA 4G6JA 3I2XA 5BOWA 1RINA 1VALA 1GNHA 2JE7A 4QC4A 1KJRA 1MR5A 3LSDA 2QYIB 5T5OA 1WUVA 3CRIA 3WDTA 4JKXB 3IIRA 4ZOTA 1OFSA 1TOOA 3IM0A 5L73A 2A71A 3VKMA 2VSAA 3USUA 2DURA 3T2TA 2OUJA 1LOGA 4ZLBB 2VU9A 4OUJA 1N3QA 3LCPA 4Y22B 4OEEA 3VSZA 3Q7XA 3W58A 3ZXEA 4Q2FA 4DFSA 2D3RA 1AZDA 2DU0A 3VT0A 2BFHA 2ZAAA 1S1AA 5BYNA 3WDUA 1T9FA 1AXYA 1BJQA 2WQZC 1LOBA 4Q1RA 5T52A 2R0HA 2E51A 3CAHA 4FGFA 2R16A 3SITA 3VT1A 2FGFA 4XJ8A 3F1RA 3FJEA 2DS0A 3OJMA 3ZSJA 1DYKA 1WLDA 3CA1A 2JDZA 3O4AA 5H9PA 3BRDA 4EFQA 2Y9WC 1LJ7A 2VW1A 1FN0A 3WINC 3KQRA 5JOWA 1VLNA 4HL0A 1BKZA 2PHWA 1HKDA 3FUQA 1ULEA 5JOYA 4I1BA 2WNEA 1GANA 3A0KA 1DFQA 4XYXA 4Q26A 2HW9A 3CU1B 5KXEA 3CA4A 4FQZA 4AWDA 3KM5A 2NTDA 4Y22A 4QD2B 4X37A 1SR4C 2D3PA 1IOAA 3T1MA 1W6NB 1VAVA 4AVVA 4LO2A 4FOWA 2F8XC 1AFCA 3AJYA 1QU0A 3N7KA 3BRGC 1RIRA 5DUWA 1GZWB 5DSSB 1SLAA 3BAOA 3JUTA 5H9RA 1SACA 3AYAA 5T55A 4EKXB 4CRQA 4AN6A 5FREA 4GOVA 1LESA 4Q9GA 3O4CA 4HJJA 5EC5A 5BVPI 1JN2P 1V00A 1UAIA 1WW7A 1LHWA 4ATFA 4GXLA 1LODA 1S0DA 3POWA 3AZZA 2YUGA 1PC8B 3POSA 1UN1A 1JBCA 1IJTA 4LBMA 2Q3NB 3HALA 3O5SA 4K20A 1P63A 3INAA 2ZGMA 5GJ6A 3N7MA 2JJ6A 4LBOA 2TEPA 5SV8A 3BA4A 5GLVA 1G9AA 4F34A 2WT1A 4FPFA 1V6XA 1DFCA 3MPPG 1CR7A 1GNZA 3V0AB 2P34A 5JOXA 1W6NA 4LBQD 2I2SA 1BASA 1Y7BA 2OUHA 2WT2A 1Q56A 1KRIA 2ZGQA 2UURA 4YM0A 4XZPA 1GZWA 1FV3A 1AVXB 5BXRA 2E53A 5EG6C 4NOTA 5BP5A 4Y26A 3D4KA 2Z42A 1QXMA 5GZDA 1DZQA 3Q9OA 1OQLB 1M2TB 4FPLA 4LO0C 1AX1A 4P9YA 1N3OA 1CVSA 1YBIA 4BQ1A 3VKFC 2FHRA 2UWBA 4Y24A 3WUDA 1G9FA 4ZFYB 5GALA 5JOZA 3A22A 3RSJA 5IK7A 1D2SA 1RG8A 1J0SA 1LHUA 1PZ8A 2PHFA 3SH5A 1LGBA 3V0AA 4H9WA 1NZKA 1JLYA 2WJSA 2W08A 3FJHA 1O4ZA 2SBAA 2KLLA 3WDWA 4GP3A 4H55A 4XHBA 1N47A 3C2UA 3FJ9A 1MVEA 2M49A 3RRDA 4DENA 1PWAA 1ABRB 1IOBA 1BQPA 3WUCA 2D44A 4AYUA 4A7KA 3DGTA 2Z48A 2EXJA 3UDAA 2Q9XA 1WW6A 4P9WA 1MS5A 3FJBA 1TEIA 1HCEA 2ZGPA 4DCKC 1Q8VA 5DG1A 3Q7WA 1LOEA 4FPCA 2VW0A 1HWNB 4GOYA 3AX4A 3R05A 4M01A 1SCSA 2ZMLA 5T5PA 1SCRA 2FFUA 2EAKA 3ASIA 3P6JA 3JU9A 3P6IA 4XDQA 4XJWA 4XE9A 2J3PA 1DQ2A 2NP0A 4RA0A 3AZXA 2WT0A 3AKIA 3O0VA 3RMYA 3B00A 4EEEB 1TWEA 3BODA 3ZXGA 3JRRA 4OWLA 4Q9PA 1FNYA 5DZUA 1D0HA 4I4SA 1HWPB 4Z8SB 4FPKA 1GSLA 2DREA 2X2TA 1MVQA 3ILFA 4BLIA 1BXHA 1ITBA 2D6NA 1WLCA 3WG1A 1W0PA 4Y1XA 4XJAA 3Q7YA 2D6KA 3MALA 3NWKA 5FZYA 4WVVA 2AYHA 4JP0A 4QBVA 4YZ2A 4I0YA 4GA9A 3ZVXA 1AXZA 2GMMA 4LBKA 2ERMA 3WINA 2B7YA 3WV6A 2F2FA 1UMZA 5GAQA 1V6WA 3WDVA 1LEMA 1BARA 4YOLA 4QKSA 3U4XA 3O44A 4EFRA 4AVTA 1WCSA 3IMNA 4FOYA 5BQUC 1N1YA 2D6OX 4Y20B 4EFPA 3C9ZA 1WD3A 4FPJA 1SR4A 1K5VA 4YGCA 2HZ9A 5E8AA 3BOPA 2EF6A 1FMMS 2AQZA 4BM8A 4EB2B 4LBLA 3WO3A 3AH4A 2R0FA 1QDOA 3AFKA 1N1VA 3V64A 1JT4A 5DZFA 2D6MA 1T4QA 3OBRA 1ENQA 3ZC8A 4H04A 1IS5A 1HQWA 1PZ7A 3WHTA 4I2SA 4HANA 3I29B 5CNAA 2A3WA 3VEQA 2YZ4A 3MEPA 1V6OA 3HN1A 1HIBA 4YLZA 2ZZJA 4YM2A 3RMXA 3ZPYA 5DG2A 1QNWA 2C9AA 5IK8A 1MS1A 1AVWB 2E7TA 4FP2A 2UUSA 4Y1UA 4ZKTB 4IYBA 3I8TA 4Y20A 1ULDA 3NV2A 4YZ5A 1SBDA 2ERFA 1C57A 2UWAA 3AP7A 1DLLA 2A5ZA 3HR9A 1V6IA 4QBCA 1ULCA 3ILRA 4C1XA 1UX6A 2IHOA 1BA7A 5DUYA 1ONAA 4IZXA 1JW6A 3WG4A 4YW1A 2NVHA 1LU1A 1W3FA 3M3EA 2D6PA 2H0BA 1GGPB 4CTEA 4KEIA 2R9KB 1LGNA 5IK4A 4LO0A 5F5QA 3AYCA 4XJUA 2CTVA 1LHOA 2ARXA 5DZGA 1N1TA 4XOGA 1F9KA 3O4OA 2GDFA 3RG0A 2K8RA 2RHPA 2K4AB 2NYYA 4J2YA 2ESUA 4Y1YA 4DEPA 2ZGOA 4AVSA 3BAGA 4G6MA 1A8DA 1MACA 1ISXA 2GZBA 4GWMA 3AP4A 3WDXA 1ISWA 2DYCA 1R1ZA 2DVFA 2A6XA 1JY0A 3ZXKA 3OPZA 3BIWE 1DHKB 2AFGA 1AXMA 3N3HA 4J2SA 7I1BA 3SISA 1BFGA 1YO8A 4XBQA 4M3CF 1G82A 4PF5A 1MZ5A 1HWOB 2W52A 5F8YA 1Z2VA 3FJFA 1BFCA 1WBAA 5GZEA 1CJPA 1AVAC 2EIGA 3IM6A 1PUUB 5DXDA 3WA1A 2UU8A 1V6MA 3PVNA 1HDKA 1G86A 1UZYA 2FDBM 4XBNA 3AH1A 1OKQA 1SBEA 2DUPA 1DJSB 3BTAA 3IM7A 2P2KA 4CZSA 1HLCA 4PBPA 4YZ1A 1IILA 3WLUA 4I37A 4JAWA 3CRGA 4OZXA 2DU1A 4OWJA 3AP6A 3PMEA 3NBNA 3R4SA 2NM1A 4XXPA 1WBLA 3VSFA 3FBYA 4JQ0A 3PG0A 5F90A 1II4A 2KI4A 1JT3A 4GWNA 1C1LA 1IRAX 3NV1A 5GZFA 1WBFA 4NO4A 4JCKA 2VW2A 3AZWA 3AKHA 1PZZA 2GN7A 1JT5A 5T54A 2DVBA 4XJ9A 3V79C 3UK9A 5E24E 1RITA 5IUQA 3I4IA 3O4DA 4XFTA 3ILNA 1DQ0A 4R9CA 2W39A 1GLHA 3V0BA 4XFUA 4Q8KA 3S8JA 2LALA 1QOOA 4XMIA 1BYHA 3N7JA 3OY8B 1TIEA 2GALA 4DS0A 3WHUA 3H0OA 2MC2A 4G9MA 3K1XA 5CBLA 4BPZA 2R1BA 2BEAA 3A0NA 1DBNA 3AXDA 2UWCA 2ZQOA 1GZ9A 3S8KA 2PHUA 1ISYA 3OJBA 2DVGA 1V6KA 4U36A 2D7IA 1JHNA 2ZGSA 1W3AA 1F5FA 3LTQA 5EYYA 1SLLA 1EVTA 3RTIB 2LIEA 2NMOA 4M00A 4OEGA 2D7RA 4ZFWB 1V6UA 4LO1A 3WCRA 1DQ6A 4FPEA 1YRZA 5EYXA 3SLIA 1DQOA 3N0KA 4J2XA 1WW5A 3NBEA 5KXCA 2NZ9A 3AJZA 5D62A 1PZ9A 5JLVA 4I8MA 4XTPA 5IT6A 3A07A 3OY8A 2VXRA 5HCFA 1MS3A 4LO7C 4GKYA 4HA2A 5B2HA 2OW4A 1MS0A 3WVJA 2DV9A 4II0A 3AJ5A 2GN3A 4J2KA 1CN1A 4A7YA 3TC2A 4YM1A 1JYCA 1B09A 3UL2A 4YW2A 1JT7A 3WDYA 1QNYA 2P39A 6I1BA 2PHRA 2E4MA 3M3OA 1BFBA 2XB6C 4XJZA 5T50A 5FRAA 4W65A 3TB0A 5IK5A 1IS3A 4ASMB 4D8HA 3NJ5A 5GLUA 4K1YA 3CA0A 2AREA 1Q8QA 4I4UA 3AK0A 2ZR1B 3CA3A 1QGLA 4DPNA 5D61A 2JD4A 1QKQA 4XILA 5GZGA 1S0JA 3V65A 2Q5TA 1LEDA 4ZGRB 3ZSKA 1AVBA 2PHTA 1DGLA 1AVUA 4AGVA 3FJ8A 1XG6A 4YW3A 1W0OA 5HCBA 2KKIA 1FV2A 1WD4A 5EHAA 2VUAA 4G1RA 1GV9A 2JE9A 4JRAA 1LTEA 2GNMA 4L4IA 4I1EA 5DUXA 5CB7A 4ZBVB 1XYFA 1BLDA 1H30A 4Q91A 3ZSMA 2WKKA 4R9DA 3RQ0A 4I7IA 3CA6A 4ISQA 3IN9A 2A6WA 4ENDA 3UD9A 2D1ZA 3AYEA 2JECA 2DUQA 4YFZA 4ZXKA 3IM5A 4PCRA 4FP3A 3BADA 2LTNA 1DZDA 5E88A 1Q1UA 4KC3A 4R9BA 4GALA 1G8WA 1CIWA 1N4KA 5KXDA 3O0WA 2AH2A 1HCDA 1JLXA 3M3QA 5H9QA 2AGSA 4IY9A 3BA5A 5F9TA 2A75A 2ZA9A 4P14A 3ILAA 1I1EA 4I96A 4FPHA 2YY1A 1HQLA 1KQRA 3NV4A 5BXPA 3ZYRA 4IY8A 2FMDA 4Q8LA 4Y1ZA 4LO3C 1NLSA 4YZ4A 1TTUA 1VIWB 4JKQA 1QOSA 3AP9A 3GALA 3EF2A 3PUBA 4IZEA 3FLRA 4K1ZA 2KH2A 3OJVA 5JMCA 3FUOA 2ZABA 2HWMA 1FX5A 1QQLA 3N7LA 4QD2C 4XFSA 2ZHNA 1AJOA 3NBDA 4WBCA 5FNWA 1AF9A 1Z0HA 3A4UA 2W68A 4LO7B 8I1BA 2FFVA 4FQ4A 3F62B 2WBCA 1CPMA 4FPYA 4TZDA 2D6LX 5BP5C 4QKRA 3BAQA 2ZGTA 5HPZA 2AAIB 3I2AA 1S0BA 5DUVA 1EPWA 1KITA 3H6RB 1W6PB 3BRFA 1KDKA 1FWVA 1SFYA 3VKNA 1Q8OA 2YMZA 2KI6B 1EV2A 1ENRA 1DQ1A 3FLTA 1YTOA 1YF8B 2AUYA 4AGRA 1G7YA 1EYLA 3TAYA 4XHXA 2DVAA 3IPVB 3M3CA 1RZOB 2E7QA 2ZHKA 4G9NA 4HR6C 1BZWA 2D22A 3FFZA 3UJOA 1V6LA 2GNTA 1VAMA 1SZ6B 4XIKA 1CVNA 2ES3A 2AR6A 1XZZA 1BLAA 1GBGA 1QQKA 1SLIA 1S0IA 3H6QA 3WZ1A 3FJCA 4I3NA 3ZXLA 3POKA 3ZXDA 5JVVA 4P9XA 5HCAA 2DWRA 2YV8A 2ZGNA 4JPZA 2DRZA 2XOAA 4KEKA 3H6RA 1W6PA 4I4XA 2DRYA 1AX2A 4Q1PA 1LOFC 3HOMA 1CESA 3FJJA 2CWSA 4P0KA 1N3PA 3POYA 2D24A 4PC4A 1WBCA 4M3CE 2P3IA 4GP0A 5AVAA 1LOCA 1A78A 1IKPA 3IPVA 2A7AA 5GM0A 2VH9A 3PHZA 3B3QE 4U2AA 4C1WA 4ZFUB 1C4RA 2ZMNA 3V0BB 3WO2A 4IONA 4P0LA 2CYFA 1ENSA 4XMAA 4OWKA 3B69A 4UW6A 3FJIA 1MD6A 5FZZA 3FJAA 1DQGA 4X39A 4BMEA 3QLQA 4DQAA 4WV8A 2PHXA 1MS8A 2HWAA 4OW4A 9ILBA 1UPSA 2DUOA 2Y9XE 1UL9A 1FNZA 3D5OA 5T5LA 1XHBA 4AGGA 1SBFA 1H9WA 2GMEA 3VUOA 1LU2A 1CQ9A 4Q27A 2RQ9A 2GNBA 2F2FC 1IHKA 4QALA 3IKWA 1GYKA 3APBA 4JC1A 2RSTA 4FPGA 1FGAA 1RMLA 2CNAA 2V5YA 1KDMA 2BEBA 1S0FA 2KM2A 2WSUA 3D6EA 1CONA 3AJ6A 5BXSA 2P37A 1MZ6A 4YG6A 2D23A 4SLIA 1YI7A 1ZA4A 2IWTB 5KXBA 4M3CB 4TYSA 1KJLA 2P23A 4R6UB 4FOQA 1ULFA 2VXTI 1TWMA 1LENA 2ZHMA 3OJ2A 4WZFA 4UW3A 1KNMA 1G9BA 2ZACA 2G4IA 1QDCA 3VKOA 1G9CA 4X3AA 3VKLA 4UW4A 2RG9B 1FYUA 2VSEA 3OYWB 1YXWA 1F31A 1Q03A 1HWMB 4LBNA 2EALA 2CY6A 1PUMB 4A7ZA 4LO3A 5BQUA 1A3KA 2CL2A 3M2MA 4P0JA 2VLCA 1IT0A 5D63A 3VV1A 2DTYA 2ZQNA 3BAVA 4I4QA 3OGFA 5F8WA 4YM3A 3FGMA 4I4YA 3ATGA 3WO4A 1GZCA 3BX1C 4J23B 1R8OA 1HKNA 1AXKA 2D7FA 4P6AA 3ZXFA 1SLBA 5I1BA 1UKGA 4PQ9A 4TLPA 3AYDA 1I1BA 4L8QA 2EXIA 3CNAA 2MIBA 1ULGA 1M16A 2AENA 5LK5A 4I6IA 3N35A 2A3YA 1W6QB 1S0CA 1W6MB 4M3CA 1JTCA 2I1BA 5GZCA 1JXNA 4LBQB 3LLPA 1DIWA 3BB2A 2SLIA 2HYKA 1ONKB 3PJQA 2A6VA 3AZYA 4USPA 3B9UA 4FOVA 4RL7A 5G00A 2ZGKA 3W59A 3OYWA 4X38A 1G9DA 3SH3A 2A6YA 4YZ3A 4IHZA 4ITCA 3BAUA 1MC9A 1FMZA 4DRRA 2GNDA 1K5UA 2E6VA 3SH4A 3M1HA 1SLCA 2GMPA 3AKFA 3PVEA 3R4UA 2X2SA 3VWCA 5GLTA 1W6OB 1E0OA 5BXTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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