3HN1A

Crystal structure of hcr/t complexed with gt2 and lactose
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
450
structure length
442
Chain Sequence
NLDCWEDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Gangliosides as high affinity receptors for tetanus neurotoxin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium tetani
molecule keywords Tetanus toxin
total genus 118
structure length 442
sequence length 450
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 2009-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3hn1A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3hn1A02
1YTOA 1TEIA 4XE9A 3WDVA 4I0YA 2I2SA 1V00A 1LOBA 4LO2A 3IM5A 5D62A 4I3NA 3WG4A 1OQ1A 1MVEA 1MZ5A 3WUCA 1GLHA 4QBCA 2JE7A 1LJ7A 2JJ6A 1JT5A 2E4MC 5T5JA 4DCKC 1CPNA 1QGLA 3LCPA 2HWMA 4K1YA 4ZFYB 3AFKA 1IKQA 3WUDA 1FAYA 3R4UA 3CU1B 1WBLA 4YM0A 3OY8A 3RMYA 4GKXA 5GZDA 3CA4A 5GALA 2ZGTA 4CTEA 2P23A 1G9CA 4QBVA 1QKQA 3F1RA 1FNYA 3MW2A 1LU1A 4A7KA 1G82A 1LOFC 1IOAA 4I4UA 4G6MA 1JXNA 4FP3A 1W0PA 1TWEA 2KH2A 2UURA 4WZFA 1ISXA 3WNXA 4FPJA 3V0BA 1RZOB 3H0OA 3INAA 1J0SA 3GALA 2QN4A 4U36A 1SACA 1YXWA 1MS5A 3VSZA 5JOXA 1GNZA 1O4ZA 3BRFA 3OJ2A 4AGVA 1JN2P 3NJ5A 3OYWB 1N3PA 1OFSA 4XIOA 2A70A 1WLCA 1IRPA 4ITCA 4FPHA 1DJSB 2HZ9A 1DGLA 2DU1A 4Z8BA 1QF3A 4LBLA 1Q8VA 1YO8A 1KDKA 2VXRA 4XJZA 3O5WB 1MS9A 3O0WA 3A21A 1H9WA 2Y9FA 3FGMA 1DFQA 1BFFA 1I1BA 3KMVA 3AZWA 1T4QA 1LULA 4UW4A 1W6MA 1JLXA 3BODA 3LSEA 2R0HA 4Y20A 5EXOA 1Z4SA 1Q1UA 1F5FA 3WDTA 4ZA3B 3MPPG 1G8WA 2K4AB 1MS8A 5F8SA 4JCKA 2UWBA 4LO3A 5JOZA 2KI4A 2LTNA 1S0DA 4ZOTA 4D0TA 2FFVA 3O4AA 4HR6C 2D6NA 3ZVXA 1LHVA 2ZGRA 3ILNA 4ZFUB 3ZX7A 1J1TA 4WV8A 2X2SA 2XOAA 1GZ9A 3PJQA 3WCRA 1SR4A 3BAQA 4XBQA 4F83A 2ZZJA 1FGAA 4AN7B 4H04A 4R9CA 3A23A 1HDKA 5GLZA 1IT0A 1AX0A 4YG0A 5IK5A 2DUPA 5BP5C 1FWUA 2D20A 3CNAA 5B2HA 4YM2A 4LO7B 4PC4A 3OPZA 4FPFA 3MALA 2F2FC 4L4HA 2ZKNA 4SLIA 4YZ5A 3I4IA 4AGRA 2AREA 1W6NA 2GMMA 2ZGMA 3AKGA 4XOGA 3FJDA 4I7IA 3OBTA 2Y9XE 1C1LA 2IHOA 3WV6A 2BEBA 2J3PA 1JT3A 3N36A 3FJKA 1PWAA 5F5QA 1YYNA 1QOTA 1FV3A 2FHRA 1LEDA 1BLAA 4KC3A 4YGDA 4AVVA 1S0FA 1O4YA 4GOYA 5GZFA 1ULEA 3M3CA 1DQ6A 3M2MA 2QYIB 2WKKA 4Y1ZA 2GNBA 4P6AA 4XIKA 4GA9A 3ZC9A 4G6JA 3Q7WA 4FVVA 1S0EA 4I2SA 3BB2A 4BOWA 2EALA 4P9YA 1IS6A 4NO4A 2PHUA 4TLPA 1QQKA 1HWNB 4GXLA 3OGGA 1CIWA 5SV8A 5H9RA 2Q9XA 3VKFC 1LODA 1V6WA 1DIWA 4XXPA 2W52A 4X3AA 1GYKA 2EXJA 4ATEA 3VWCA 3O49A 1YRZA 1ONKB 1QU0A 3ATGA 1N3QA 3KQRA 2P3IA 3SH3A 3ZSMA 1IILA 4YFWA 1W6OA 1JYIA 2EF6A 5H9SA 3BIWE 4I1BA 1SBEA 3WO4A 3N7JA 4II0A 1IKPA 1LGBA 3B3QE 3O4DA 2D7RA 5D63A 1G9BA 2WT1A 2W39A 4QD2C 4Z8SB 4OEFA 4JP0A 4YZ4A 4I1EA 1ULFA 4P0LA 3QYDA 4FP2A 2VW0A 3POYA 4J2XA 1GKBA 3OYWA 2Y9GA 1H9PA 1YIFA 1Q8QA 2ZQOA 1KJLA 5DZUA 1JUIA 4K20A 3ZXGA 2ZHMA 1V6JA 3SH4A 2RSTA 5JMCA 4TZDA 3ILAA 1FWVA 2ESUA 4Y26A 2JD4A 2Q5TA 3ZSKA 2A3YA 1V6OA 4QC4A 2WBCA 3UDAA 2ZGNA 4M3CE 1Z2VA 1KRIA 3SNVA 4IY9A 5BQUA 4GALA 1BKZA 2ZGSA 4G9NA 1CN1A 1LGCA 4Y1VA 2RHPA 4IYBA 4UW5A 3T2TA 5IK8A 4EB2B 1WUVA 1ISWA 1S1AA 2ZABA 1V6KA 5IK4A 1PUMB 3M3OA 3WDWA 3CA3A 1DQGA 2DVAA 5H9QA 3WMVA 2P37A 2IWTB 4DENA 1ENSA 1AVAC 3JU9A 4YW4A 1NLSA 3N35A 1GZWA 2E4MA 1PUUB 2H0BA 2XB6C 5FZUA 3UJOA 4I4RA 4FPOB 4BLJA 3V0AB 4K1ZA 3B69A 4BLIA 2ES3A 1EVTA 3QCWA 3DGTA 4Q2FA 1WD3A 5EYXA 3VUOA 3QLQA 2PELA 3WO2A 3CQAA 2AGSA 1C4RA 3AK0A 4L8QA 4M3CF 4ZLBB 5GLWA 1SLAA 1LOFA 1WW4A 3PG0A 5T5PA 5IUQA 1HQWA 1MS1A 3I2AA 4OUJA 1I3HA 4PCRA 3FBYA 3I8TA 3Q9OA 2AXMA 3BA7A 2Z48A 2W68A 2WLQA 1V6NA 4WVVA 1SZ6B 1V6VA 5GLTA 4YG3A 4Q1RA 4XYXA 4KEIA 3AH4A 5GAQA 3RMXA 1QDCA 2GN7A 3P6JA 1JYCA 3N3HA 3IMNA 3CA6A 1AX2A 4XJ8A 3FJIA 4XJUA 2EXHA 1I1EA 2SLIA 2A7AA 2ZGKA 3UK9A 5EG6C 3PMEA 4FPKA 5BQUC 3AP7A 3HN1A 3PVOA 2LIQA 3D4KA 2RG9B 4DRRA 5E8AA 1UL9A 2DVGA 4Z9WB 1W6QB 1CR7A 4YOLA 5T52A 3AX4A 2BEAA 3OJBA 2E7QA 3RTIB 5CBLA 3N7MA 3AP4A 1IS3A 1F31A 5DVHA 4OEEA 5GZCA 4IONA 5KXCA 1AXZA 2D6LX 2OVUA 1TP0A 2XG3A 3CA5A 3NV1A 7I1BA 3O4OA 1IHKA 4WBCA 4BMBA 3FUOA 2M49A 5D61A 1K5VA 1XQNA 1RMLA 2AQZA 3C2UA 1M16A 3PUBA 4I4OA 4LO7C 4GP0A 3MW3A 1HCDA 3M3EA 4DQAA 1DQ2A 4EFQA 1FYUA 5BP5A 2VH9A 2Q3NB 1EPWA 1IOBA 4KBBA 3BX1C 1AVXB 3WG1A 1CESA 2F2FA 3O5SA 1LCLA 3BA5A 3HBWA 1MR5A 1YI7A 1FQ9A 1VAMA 3B01A 2UWAA 4C1WA 1PZ9A 1UZYA 3F62B 2YV8A 5KXBA 3BRGC 2E51A 1ULCA 1G7YA 1RIRA 1K5UA 1PC8B 3NBDA 4USPA 1URXA 3TAYA 3OBRA 4AYUA 5DZFA 5CB7A 3AP9A 4YGEA 3WDUA 1Q8SA 4HANA 2FMDA 2ARXA 4RA0A 2A3WA 1YBIA 2YROA 5DUVA 1ILR1 5BVPI 5E89A 3R4SA 3LTQA 1R8OA 1CVNA 1QQLA 3BA4A 1GSLA 5HCFA 2B7YA 2YZ4A 4LBQD 1CQ9A 2YMZA 3N0KA 3B00A 1Q56A 2NZ9A 3VSFA 4M3CB 3V0AA 1XHBA 2DU0A 3IKWA 1JBCA 5EWSA 1DQ0A 5BOWA 1TWMA 1LOEA 3BOPA 1S0BA 3PVNA 3HOMA 4H55A 3FLTA 2A75A 3JUTA 1RITA 1D0HA 4FPGA 3USUB 4Q9GA 1LTEA 1AVWB 3FFZA 3ILRA 2D6OX 4OEGA 1BJQA 3O4CA 2VY0A 3RG0A 3T1LA 4KEKA 1EV2A 2PHTA 1UN1A 4XBNA 2UUSA 3AKFA 3VKNA 1DQ4A 4CJMA 3W58A 4FOVA 5DUUA 3O0VA 2GZBA 2JE9A 3NV4A 1ULDA 3IM6A 2D24A 3PHZA 2CNAA 4JRAA 1AXYA 2R9KB 4MYEA 1BYHA 4YFZA 3ZSJA 1IS5A 5JVVA 3ZXFA 3CA0A 2AYHA 5F9TA 5T50A 1UMZA 2JECA 2DV9A 3O12A 5BXSA 4YG6A 1JTCA 4FPLA 4HJJA 3AJYA 41BIA 4Y22B 2VUAA 3FJCA 4JPZA 5CAZA 2WJSA 1W3GA 1ZA4A 5EYYA 4IZEA 3WG3A 3ZXJA 1W6QA 4F34A 2EIGA 3VV1A 4I4PA 3UL2A 2ENRA 5KXDA 5BXTA 3Q7YA 4XKIA 1W3AA 4GWNA 1D2SA 2D3PA 4AVTA 1JT7A 1WW7A 2D6MA 3WCSA 1WLWA 1VCLA 1HQLA 3NV2A 4YZ3A 1XYFA 1W0OA 2E53A 4LBKA 4XTMA 4H9WA 2CL2A 3WHTA 3ZXEA 1ISYA 2Z49A 4M00A 1T9FA 1QDOA 4XFTA 1DQ1A 2C9AA 4C1XA 1BFCA 2MLLB 2ZMLA 3OGFA 3K1XA 3AYAA 1H30A 4KEJA 1JQZA 1QNWA 1C57A 1LECA 2I1BA 1W6PB 1LOCA 4XHXA 3BAOA 5IT6A 4Q8KA 1V6UA 2R1DA 4BM8A 5CNAA 3A0NA 4Y1XA 1CONA 4CRQA 5AVAA 1KNMA 3S8KA 1BARA 3MEPA 4Q26A 2DYCA 1KJRA 3B9CA 5FRAA 1LENA 2GN3A 1SLTA 1ULGA 2K43A 5FNXA 4I4YA 4BPZA 3POWA 1S0IA 4XMIA 2PHXA 2AFGA 1G86A 3H6RB 2D6PA 4LO1C 1KITA 2VU9A 3UJQA 2DREA 2R49A 4Q27A 4FQ4A 4FQZA 5T5OA 4FPEA 2VSEA 4ZBVB 1WD4A 4QKRA 4K21A 3UJ4A 3O44A 3CA1A 3GNEA 4BQ1A 4QALA 4EEEB 3AYEA 3NV3A 1YF8B 3VKOA 3CRIA 4XBLA 4M3CA 1FNZA 3UD9A 1N3OA 4BMEA 3ASIA 3OY8B 2WT2A 4DPNA 3ENRA 3AXEA 3AJZA 1AZDA 4FOQA 3BAVA 4EFPA 1BFGA 1GNHA 1S0LA 3POSA 4Q1PA 2R0FA 2DUOA 3AXDA 4JQ0A 2AH2A 1HLCA 3IPVB 5L73A 2A6VA 4LO0C 1UPSA 3ZYPA 1ISVA 4GAFA 2AENA 4I37A 21BIA 4X39A 3JRRA 2D22A 2ZA9A 3V64A 3T1MA 3SITA 3P6IA 5JLVA 3FJ9A 2YY1A 3ZXKA 3ZXLA 1CJPA 4JC1A 4G1RA 1FMMS 3HMYA 2GNTA 4A7ZA 5GLUA 3QR5A 1NUNA 4AWDA 3BTAA 2A71A 5FREA 3WO3A 2D3SA 3UD8A 4ENDA 3O3QA 4LO8B 4XTPA 3Q7XA 4IY8A 1V6MA 2NM1A 4LBMA 4ZGRB 1TIEA 1XG6A 1Q8PA 4I4QA 1TOOA 3TC2A 4YW5A 1JOJA 1DQ5A 4YZ1A 5DUWA 3CAHA 5DXDA 3VEQA 2ZHKA 3M3QA 2V5YA 1EYLA 4Y20B 1LOGA 4Q8LA 2ZMKA 3AJ5A 1SCRA 4DEPA 3IN9A 2EAKA 4XFSA 4PQ9A 3I2XA 4EKXB 3JUUA 2DUQA 4ISRA 2ZHNA 2BFHA 2FO1A 4ZXKA 3RRDA 4ZFWB 2KM2A 2D7IA 1DYKA 4QKSA 1FV2A 2Z42A 4LBNA 4J2KA 1GICA 4XMAA 1QOSA 5IK7A 1BXHA 2GALA 3FJHA 3S8JA 2E7TA 1B09A 3WG2A 3FUQA 3NBEA 4X38A 5F8YA 2D3RA 3RTJB 1WW5A 3VT2A 2DTWA 4FOYA 1AJOA 1AVBA 3AJ6A 1WBAA 3FJAA 1MS3A 2D6KA 3KM5A 4XXAA 1W6PA 1W6NB 1GBGA 4ATFA 2R16A 4UW3A 1MVQA 1DZDA 3AH2A 3AZYA 3WDYA 4P0KA 1DHKB 4Y1UA 1HKDA 3WMUA 3UJ0A 2VLCA 2NMOA 4R9DA 2ZGQA 1AXKA 1JLYA 1X50A 2A6ZA 2ZHLA 1SLIA 1MZ6A 3H6RA 1HIBA 1LESA 2AAIB 5GLVA 1BA7A 5GZGA 1RG8A 2G4IA 4A7YA 3BAUA 4QO3A 2CTVA 1DQOA 2K8RA 3APBA 4YGCA 3VT1A 2Y9WC 3IAGC 5DG1A 2AUYA 5H9PA 1WLDA 1C1FA 3DUIA 3I29B 2WNEA 2PHFA 1N4KA 3W9TA 5BXRA 4Q91A 4L4IA 3UD7A 3NBCA 3WA1A 5JOYA 5GZEA 3BAGA 2DS0A 2ZGPA 1HCEA 1AJKA 4XFUA 4EFRA 4XJWA 3ZXDA 1SBFA 4YM1A 1CE7B 4PBPA 4UW6A 3R05A 2NTDA 3IPVA 5I1BA 5DZEA 2LIEA 1JW6A 3SNMA 4GOVA 4CZSA 1W6OB 3FJEA 1W3FA 2PHRA 1A78A 1DZQA 2WT0A 1HWMB 2X2TA 2GMPA 1G9DA 1PZ8A 1VLNA 1UKGA 1APNA 1BQPA 3AYDA 1RINA 3AH1A 3ZYRA 2F8XC 1FN0A 4DRVA 5T55A 4DFSA 2GNDA 6I1BA 4OWJA 2ZQNA 4GAIA 2WQZC 1N1YA 2GMEA 1MS0A 4XJ9A 1WCSA 2ZAAA 2YUGA 2JKBA 1G9AA 4I8MA 3VKLA 1OKQA 4NOTA 4FPYA 1IRAX 3HSMA 5FZZA 2V73A 4PBOA 2KKIA 1V6XA 4WVWA 3BRDA 3U4XA 1P63A 3ZPYA 2WSVA 1LEMA 2D7FA 2GDFA 2NYYA 1ITBA 3WOGA 4I4XA 5CA6A 4J2YA 4LO2C 1R1ZA 1UAIA 4YZ2A 1LHOA 4X37A 4GKYA 4I96A 3ZSLA 1CVSA 2MC2A 5HPZA 1LOAA 2FDBM 3RS6A 1JT4A 4P9WA 4PF5A 4LO1A 1QMJA 5E88A 1V6IA 4XHBA 2WRYA 2WSUA 4LBOA 3A4UA 4AVSA 1BASA 1GZWB 1GZCA 4IHZA 2P3JA 4XDQA 5KXEA 5DUXA 1BLDA 3IM0A 2YXSA 4RL7A 3ZC8A 4USOA 2CYFA 4I4VA 3T8SA 1QOOA 1ONAA 1DBNA 2HW9A 2D1ZA 5HCAA 4R6UB 1N1SA 4D8HA 3WHUA 2DRZA 3V65A 3MW4A 1Z78A 4HA2A 2P34A 4OZXA 1SFYA 3AZXA 4LO0A 4OWLA 1HWPB 4W65A 5T5LA 1U0AA 3D6EA 3WVJA 1F9KA 2VXTI 4OWKA 4LBQB 4FOWA 1XZZA 2HYKA 4YLZA 1BFBA 3N7LA 1ENRA 2OW4A 2HWAA 1S0CA 2ZACA 2DTYA 2CWMA 1Z0HA 1QNYA 4JKQA 5DZGA 1WBFA 4Q9PA 4YGBA 1ISZA 1ENQA 2EXKA 1M2TB 5JOWA 4P0JA 2E6VA 4FPCA 3D7WB 2FFUA 3POKA 2VSAA 5JDBA 4IQPA 3LLPA 2ARBA 2RQ9A 1LHUA 3IM7A 2ZGOA 1DFCA 4YW1A 1N1VA 4I4SA 1WBCA 2ET2A 3BAHA 1AF9A 4LO3C 2VW1A 2ZBJA 2DURA 1DYPA 5FZYA 2KI6B 5F8WA 2DVBA 3TB0A 2VW2A 4LBJA 3HR9A 3FLPA 2DRYA 2D23A 2DWRA 4YW2A 3WDXA 4U2AA 31BIA 4YM3A 2L5XA 9ILBA 5EC5A 1SR4C 4D69A 1N1TA 3VKMA 2P3KA 4XILA 2TEPA 4GWMA 4P9XA 1GGPB 2LALA 3OJVA 1MS4A 2NVHA 1BZWA 4J23B 3AKHA 2NP0A 3WZ1A 3D5OA 3NWKA 1SBDA 2P39A 1DZCA 5HCBA 5LK5A 5BXPA 2A6XA 1MC9A 4J2SA 4ZKTB 1LU2A 1S0JA 5GM0A 3B9UA 3AKIA 3SLIA 2P2KA 4GP3A 1IS4A 1VALA 3USUA 2ZMNA 1Q04A 1A8DA 1DLLA 1NXD1 3HALA 2GNMA 1ABRB 3RQ0A 1GV9A 1AXMA 3AZVA 2BQPA 4ISQA 3WINA 3A07A 4JKXB 3V0BB 1KQRA 5BYNA 1HKNA 4IZXA 3C9ZA 3FLRA 1SLCA 2SBAA 2D44A 5T54A 2C5DA 2CWSA 3CRGA 2A5ZA 1QXMA 5DUYA 4R9AA 4XZPA 1MACA 4YW3A 3AP6A 3AZZA 4OW4A 1A3KA 3FJ8A 3IIRA 3W59A 2JDZA 3H6QA 1L2HA 1MD6A 1TFMB 2ZGLA 4JAWA 5E24E 1E0OA 2W08A 3OJMA 1NZKA 2ZGUA 1VIWB 4TYSA 3LSDA 4DS0A 4Y22A 1KDMA 3P53A 1W6MB 3O4BA 2KLLA 3H6SE 2AR6A 5EHAA 1WW6A 4D0ZA 1AVUA 5G00A 1N47A 2EXIA 3M1HA 1FMZA 3SISA 1LHWA 2DVDA 3PVEA 3V79C 1CPMA 2NN8A 3O0XA 1ZM1A 4AN6A 3EF2A 4P14A 3WLUA 3N7KA 3FJBA 2A3XA 5DG2A 4LBQA 2R1BA 1AX1A 1HWOB 2GO2A 1UZZA 8I1BA 1G9FA 2ERMA 4XJAA 1II4A 1SCSA 4HL0A 4QD2B 1PZ7A 1LGNA 3A0KA 2ZR1B 1VAVA 2ERFA 3AP5A 1GANA 4Y24A 4AGGA 3FJJA 5F90A 2UWCA 3CRHA 1OQLB 1Q8OA 3NBNA 1UX6A 1Y7BA 2UU8A 2D43A 4FGFA 1R8NA 3L2YA 1TTUA 1IJTA 1Q03A 3ILFA 4G9MA 4R9BA 1SLBA 3BADA 1JHNA 1SLLA 3SH5A 3VT0A 2NMNA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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