3HN1A

Crystal structure of hcr/t complexed with gt2 and lactose
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
450
structure length
442
Chain Sequence
NLDCWEDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Gangliosides as high affinity receptors for tetanus neurotoxin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium tetani
molecule keywords Tetanus toxin
total genus 118
structure length 442
sequence length 450
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 2009-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3hn1A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3hn1A02
5HCBA 1AVXB 4R9BA 2DURA 3AP9A 1HLCA 2ZZJA 4LBJA 1N3PA 3W9TA 3ZXGA 3MEPA 1TIEA 5GLWA 4YZ5A 1SBDA 4TYSA 3D4KA 2X2TA 2VH9A 2VXRA 2KH2A 1ENQA 4LO2C 4YGCA 1RY7A 1SLAA 3O4OA 5F8SA 4BOWA 4Q1PA 1EVTA 1LEDA 4XTMA 4ZFYB 3FFZA 3TB0A 2R1BA 4AVSA 2D6KA 1I3HA 2DVAA 2ZAAA 2GMPA 2ZKNA 3HR9A 4YG6A 1LU2A 1VLNA 5IK7A 4IY8A 5I1BA 1AVUA 4XFTA 3RSJA 3AZZA 2D6MA 2ZGKA 4NOTA 3AYCA 5LK5A 4XXPA 1YTOA 4OUJA 2GN3A 2W68A 2ZGUA 2ZMLA 3RQ0A 1TTUA 3BAGA 3VSZA 2AQZA 1TP0A 2AGSA 2JDZA 1W6PA 3AP7A 4XXAA 1DHKB 1AZDA 2A6XA 2AFGA 2F2FA 1G9FA 2A75A 6I1BA 3I2AA 3SNMA 2DS0A 1SLCA 1H9WA 4J23B 1GICA 3P6IA 4ZXKA 4KEJA 4EKXB 4YFZA 5FZUA 3ENRA 1T9FA 2FFVA 1C1FA 4PBPA 1QDOA 4I7IA 1Q8SA 4ATEA 3RG0A 1HKNA 1DQ4A 4J2YA 2CNAA 1UN1A 1ISYA 2ZGLA 5H9PA 4LO7B 1DGLA 4QBCA 3WMVA 2NP0A 4A7ZA 2UWAA 4ISRA 4OZXA 1W6PB 4HA2A 3UJ4A 5BOWA 4IQPA 4YW3A 2C5DA 1N1TA 1U0AA 1MS8A 2WT1A 4II0A 2ES3A 1FV3A 2ZGNA 1SLLA 2WKKA 1F9KA 1L2HA 1OFSA 2HWMA 3RRDA 1YO8A 1LHNA 4LBKA 4WV8A 1MS9A 1FWUA 4G9MA 4Q9GA 3QR5A 1YYNA 3WINA 31BIA 5DSSB 1B09A 1LGNA 2D6OX 4GP0A 2GMEA 2UU8A 2VLCA 3FJCA 2E7QA 3IIRA 1AJKA 3ZYRA 1SR4A 3UK9A 4FOYA 3FUOA 3Q7YA 4QKSA 1DZDA 3AP5A 1LCLA 3H6RA 2FGFA 4I4XA 4UW3A 3N36A 4Q9PA 1WD4A 2P37A 1KJRA 3WG2A 1DQGA 2MC2A 1PZ9A 1HCDA 2R0HA 3VUOA 5BP5C 3WUDA 3FJJA 1W0PA 1AVWB 3O3QA 1HWNB 2GALA 4F83A 1DQ5A 1Q56A 2E7TA 4XHBA 3ZYPA 3SITA 2DVDA 1M16A 2Z48A 2QN4A 1JQZA 1IOBA 2LIQA 1LOEA 4AVTA 3SNVA 5BQUC 5GZDA 1WBLA 4A7YA 2A3XA 2D22A 4M3CE 2EALA 1UX6A 4LO3C 3AH2A 4Z9WB 2D6PA 1W6NA 3NV3A 4YZ3A 1J0SA 1Q8VA 4K1ZA 3V64A 3H6RB 3O44A 2P3IA 1AF9A 3AZVA 5T5LA 5BXPA 4I4SA 4XBQA 1V00A 1LOFC 2DTWA 2D7FA 4YGBA 1ISXA 4Y1VA 3MPPG 1LESA 1HWMB 3SH3A 3BX1C 3FJKA 3ZXEA 1SBEA 4LBQD 4JKXB 3A21A 4JPZA 1S0EA 3AJZA 2D7IA 4LBMA 4RA0A 2PHFA 3BAUA 3ZXJA 4ZBVB 2A6YA 1FWVA 4XHXA 2PHWA 3RMYA 3UL2A 3NBDA 1OQLB 1DYKA 1WW5A 3B9UA 3NBCA 1CJPA 4IHZA 3MW4A 4Y24A 2FHRA 5F8WA 3BIWE 1A3KA 1PZ7A 3WZ1A 3USUA 4XFUA 2D20A 2Z49A 1F31A 4Z8BA 2I2SA 3AFKA 2KM2A 3ZXKA 4CJMA 3M2MA 1KDMA 2KKIA 3ZC9A 1BLAA 3KQRA 1SCSA 1ISVA 1RG8A 1GBGA 1WW6A 2ZHKA 3WLUA 4XFSA 4M3CF 4YM2A 2JE7A 3TAYA 3LSDA 3C9ZA 1C57A 2B7YA 2LIEA 1FMZA 2K4AB 3KM5A 3WOGA 5T5PA 1JN2P 4BM8A 2EF6A 2IHOA 3D7WB 3MW2A 3BA7A 5E8AA 4LO0A 4OEFA 2WSUA 5JMCA 5JOYA 2A6WA 2VW1A 4BLIA 4KEIA 3USUB 2VU9A 1FX5A 4LBNA 1LOAA 2EXJA 1FAYA 1QGLA 3CRGA 1IJTA 3B01A 3NBNA 3R05A 1WLDA 4YZ2A 1CONA 2D3RA 3MALA 2GN7A 3LCPA 4D69A 5T52A 2W39A 2ZGQA 3LTQA 4LO1A 4FPEA 5GZFA 1GV9A 4EFQA 2R0FA 2L5XA 1DLLA 3ILFA 3I2XA 5SV8A 4EFPA 1APNA 4OW4A 4OWLA 1RZOB 2NYYA 3WDYA 4DS0A 2SLIA 4I4PA 3GNEA 3KMVA 3WMUA 3ZVXA 1SFYA 1FMMS 2AXMA 4JKQA 3AZXA 2IWTB 4FOQA 3BADA 2P3JA 3RS6A 5H9RA 2E53A 2HYKA 2A6ZA 3WUCA 1SACA 3WDVA 1HIBA 4L8QA 1VAMA 1QQLA 2KLLA 1ULCA 3PMEA 2A3WA 5GLUA 1DQ1A 1IT0A 1HQWA 4I4OA 4YM0A 4YZ4A 4I1BA 3OPZA 1Y7BA 3OYWA 1JLYA 2P23A 1ISZA 4X39A 3WO4A 4I3NA 2E4MA 1FNYA 4I4RA 4YM1A 4XE9A 1AX1A 3VKOA 4P9XA 4OEEA 3ZXDA 1JXNA 5GAQA 1A8DA 1DYPA 2P3KA 1BXHA 3ATGA 3AP6A 5CB7A 4KEKA 4FVVA 3I29B 3GALA 2NTDA 2OVUA 2WNEA 1VIWB 3CA5A 1S0LA 4SLIA 1LHOA 1MS0A 2I1BA 2A70A 4YLZA 5JOWA 3SLIA 4L4HA 1GZ9A 5H9QA 4ZLBB 4Y1YA 2ENRA 1N47A 4FPOB 5FNXA 4Y1ZA 1V6NA 4AGRA 3VKLA 5HCFA 1AXZA 3OGFA 2XB6C 3T1MA 1HCEA 4Q27A 3FJ8A 1PZ8A 2BEBA 2KI4A 3UD7A 1KQRA 3BOPA 3IM6A 1WW4A 1V6KA 4XTPA 1KITA 1S0JA 1BFGA 3M1HA 2JJ6A 5DZGA 3PVNA 4YZ1A 3AJYA 4I4UA 1RIRA 4JC1A 5EWSA 1QF3A 3FJFA 1BARA 4XJ8A 2V73A 2MLLB 4TLPA 3ZSMA 3CRHA 1UMZA 2ET2A 2YXSA 1YI7A 1W6QA 4HANA 2PHXA 4M00A 2P39A 1UAIA 3NBEA 4J2SA 1Q8OA 2DU0A 3H0OA 4LO7C 3PG0A 3BODA 4YG3A 5FREA 4ASMB 3AKIA 1ULGA 2QYIB 2VXTI 4KC3A 4ATFA 4X3AA 5GALA 4K21A 4PF5A 3D5OA 3N7JA 4C1WA 2DUQA 5D63A 3OJVA 1OKQA 2PHRA 1CPNA 4YW2A 2F2FC 3CA1A 4QO3A 1GGPB 2DUPA 2GMMA 2ZACA 1OQ1A 1TOOA 1WD3A 5FRAA 1FV2A 3K1XA 3IM7A 4AGVA 4XMIA 4XOGA 1W6QB 3H6SE 1W3GA 3T8SA 3HN1A 4QKRA 5HCAA 4A7KA 1Q04A 4G1RA 1I1BA 5KXEA 3SH5A 3UJQA 3OBRA 4FGFA 1MZ5A 1WLCA 2Q9XA 2VSAA 3QCWA 2PELA 3FBYA 1W6MA 4Y1XA 4J2KA 1IS6A 2CTVA 1FN0A 1J1TA 2H0BA 4BQ1A 5F9TA 5IUQA 4AGGA 1AFCA 1N1VA 2NZ9A 3NWKA 1PUUB 3WG3A 7I1BA 3WINC 2K43A 1IHKA 4R9DA 4OWKA 4XMAA 5F5QA 1KNMA 4P14A 2YZ4A 3E8LC 1AVBA 4QD2C 3I4IA 1MS4A 1UKGA 3QYDA 1KJLA 2UWCA 1SR4C 1A78A 1H9PA 4XDQA 4KBBA 1TWMA 5D61A 3AK0A 1FQ9A 2YROA 1GANA 2VW2A 4CZSA 3N7LA 4FPFA 3IM5A 4FPCA 3QLQA 1XG6A 4LO8B 4DCKC 4CTEA 1W6MB 3L2YA 2D3SA 1K5UA 3SISA 1AX2A 4Q2FA 4P9YA 2R16A 3B00A 2DV9A 2OUJA 1Q03A 4EB2B 2G4IA 1V6LA 3T1LA 1N1YA 4GOYA 4ZFWB 4DQAA 1WW7A 3BAQA 1VALA 3ZSJA 4XJ9A 5T5JA 1BA7A 1JT4A 3F62B 1Z0HA 1ABRB 1ONKB 2NM1A 3LSEA 2J3PA 1LGCA 9ILBA 3HOMA 5GJ6A 4K20A 1II4A 2ZMKA 1MVQA 1LOGA 2YMZA 4QD2B 4GP3A 1XHBA 3AJ5A 5CA6A 2PHTA 3NV1A 3PHZA 3V65A 5GLVA 2AUYA 2DYCA 3FJEA 21BIA 1R1ZA 2VY0A 3N7MA 3APBA 4PCRA 4GKXA 5KXCA 2BFHA 1AJOA 2JE9A 1EV2A 3AKHA 5BXSA 3CAHA 3AKGA 2FMDA 1YBIA 2JD4A 2BQPA 2ARBA 1S0CA 1AX0A 1CPMA 3R4UA 2CWSA 1IKPA 1GZCA 1IOAA 4PQ9A 1S1AA 1JW6A 5DZUA 3IN9A 4XJAA 1URXA 5IK4A 3O12A 3AJ6A 3HALA 2YY1A 1PUMB 3ZXLA 3M3CA 4XBLA 1Q8QA 1LGBA 3VKFC 4BMBA 2WT0A 3FJHA 1QOOA 3DUIA 3NV4A 1HQLA 1W6NB 2NMOA 1VAVA 5F90A 4G6MA 3CU1B 1JYCA 2WRYA 2ERFA 4DENA 5EYXA 1QXMA 3WCSA 1QKQA 4H04A 1R8NA 1UZZA 4MYEA 3WA1A 4XYXA 1IS5A 3JUTA 3VWCA 4LO0C 1AVAC 1FNZA 3V0BA 3FJ9A 2WLQA 1ISWA 4BPZA 1LECA 3UD9A 2D44A 3FUQA 4ZKTB 1CQ9A 1JLXA 4YGDA 2D3PA 3WO3A 2AYHA 8I1BA 1N3QA 5GZCA 1IILA 2TEPA 3PVOA 2UUSA 4P6AA 2D7RA 1LULA 5BXRA 4Q8LA 2AENA 3WDUA 5BYNA 3AX4A 4LO1C 1ILR1 1IS3A 3ZSKA 2DWRA 5DUWA 3H6QA 1MS5A 2WT2A 3PJQA 1JT3A 3N35A 2X2SA 1V6WA 1Q8PA 2E6VA 3AH4A 4R9AA 5GZGA 1WBFA 1D0HA 2BEAA 1UPSA 1T4QA 4Z8SB 4XBNA 1SCRA 2LTNA 2R49A 3WG4A 1KDKA 2HZ9A 5DZFA 4GWMA 4LBQA 1SLIA 5DG2A 3WHUA 4H55A 4FPJA 1ZA4A 3WHTA 1HWOB 1LTEA 5FNWA 5T55A 1BQPA 2ZGTA 1C1LA 4GAFA 2XOAA 1BFCA 2AREA 4I6IA 1W3AA 1CN1A 5IK5A 1TWEA 3N3HA 5DVHA 3CA4A 2E4MC 5IK8A 1EPWA 4DRVA 4XJWA 1ITBA 2EXIA 1TFMB 3I8TA 2VUAA 5T54A 3AYEA 5JDBA 2YV8A 4LBQB 2K8RA 1S0BA 1GLHA 1QMJA 1BJQA 1IRPA 3WG1A 2D23A 4HR6C 3S8KA 1BYHA 3AYAA 1GZWA 4AVVA 3VT2A 3A23A 3M3OA 2MIBA 5D62A 3U4XA 1DFQA 2HWAA 4JRAA 2DVFA 2ZQOA 1S0FA 4G6JA 3T2TA 1GYKA 4XZPA 2Z42A 4P0KA 1HDKA 5CAZA 1HWPB 2WBCA 2Q3NB 1MD6A 1MACA 2EAKA 3P6JA 1GSLA 1JT5A 1PZZA 1DBNA 4X38A 3ZC8A 1EYLA 3OYWB 3AZWA 4U2AA 3WO2A 2D24A 4UW4A 4Y26A 4EEEB 2GZBA 1ENRA 3VT0A 3ZPYA 1O4YA 1DZCA 1G9CA 3VSFA 2ZHLA 1WBCA 4IY9A 4XKIA 2EXKA 4QBVA 1BFFA 1GZWB 4GKYA 2GO2A 3WVJA 5EG6C 4UW6A 3VEQA 1D2SA 1AXYA 3B9CA 3FJBA 4I4YA 1DQ2A 5H9SA 4IYBA 5DUYA 4PC4A 2V5YA 4XIKA 4DFSA 1YF8B 2ESUA 2DREA 1I1EA 1JBCA 3AH1A 3JUUA 4WZFA 1DQOA 3FJDA 4I4VA 1P63A 3FJIA 4M01A 2WSVA 4GALA 4Q1RA 3VKMA 3WV6A 3WDWA 3O0XA 3O49A 2GNBA 2SBAA 3FLTA 4RL7A 4GOVA 2AH2A 4AYUA 3JRRA 3BA5A 1CESA 4LO2A 1ONAA 5KXDA 3AXEA 2R1DA 1JTCA 1V6OA 3O4DA 2YUGA 5IT6A 2ERMA 2E51A 4YGEA 4Y20A 3ILAA 2CWMA 3Q7WA 1JHNA 5DXDA 3HMYA 3POKA 2JECA 5B2HA 4ZGRB 5BVPI 2CY6A 5E24E 4ITCA 4YW5A 4W65A 2LALA 2RG9B 1BZWA 4YG0A 4ISQA 4I4QA 1RINA 4Q91A 1UL9A 3INAA 3ILNA 2AR6A 2VW0A 1MC9A 1G7YA 1HKDA 3CNAA 1BKZA 1W3FA 2Y9WC 4Y22A 4I1EA 3AKFA 1H30A 3IPVA 2JKBA 4QALA 1BASA 1JYIA 4EFRA 2DU1A 2A6VA 2CYFA 3FLPA 3O5WB 3BAVA 5DUVA 3P53A 4Y20B 2ZMNA 5CBLA 4G9NA 2DRZA 5GM0A 5CNAA 3AP4A 5T50A 3RTIB 3FLRA 1MZ6A 2ZABA 4IZEA 41BIA 1LHUA 2A3YA 2P34A 3OJ2A 4I30A 3A4UA 1N1SA 1LODA 2UWBA 1UZYA 1WCSA 3OGGA 1IS4A 3CRIA 1YRZA 4H9WA 4JQ0A 3WDTA 2DVGA 1WLWA 4ZFUB 2HW9A 4C1XA 1QNYA 1SLTA 2GNDA 4OEGA 4Y22B 4GAIA 3IPVB 2F8XC 4GWNA 1YXWA 4D0ZA 3DGTA 3ZSLA 1LENA 1XZZA 5DG1A 2NN8A 2KI6B 1LEMA 3O0WA 5JOZA 4P0JA 4NO4A 3BRGC 1MVEA 1LOCA 3W58A 1XQNA 3VT1A 2OUHA 4K1YA 3NV2A 4I0YA 4Q26A 4XJUA 1V6IA 3SH4A 1N4KA 3PVEA 3BB2A 2A7AA 4YOLA 1JUIA 3V79C 4DPNA 1DIWA 4USOA 4FOVA 2RHPA 1JT7A 2FDBM 1QOTA 1CE7B 4FPKA 3CA6A 3POSA 3WDXA 5FZZA 1Q1UA 1CR7A 4I8MA 2DTYA 4AN7B 4P9WA 1G9BA 3AXDA 1V6VA 4X37A 1PWAA 4D8HA 4M3CA 1DFCA 3PUBA 5JVVA 1V6MA 2W08A 2PHUA 1G86A 3WNXA 5BP5A 2Q5TA 2WJSA 1W6OA 2GDFA 4JCKA 4DRRA 5L73A 1LU1A 2Y9FA 3HBWA 1MS1A 2AAIB 4XILA 4FQ4A 3O4BA 5BXTA 2RSTA 1MR5A 1QU0A 3BRDA 3W59A 3CA0A 1S0IA 2ZHNA 5BQUA 4ZOTA 3ZXFA 1CIWA 1N3OA 1GKBA 4LO3A 4FOWA 5EC5A 1C4RA 4F34A 4YW1A 4L4IA 1IRAX 3C2UA 4GXLA 1FATA 4CRQA 2D6LX 1Z78A 1S0DA 3BTAA 3A0KA 4M3CB 1BFBA 4FPYA 1LOFA 1MS3A 1PC8B 1V6XA 3V0AA 1KRIA 2DRYA 4J2XA 1W6OB 3CA3A 4R6UB 1CVSA 4I96A 2RQ9A 1G8WA 2NMNA 4FP3A 4Y1UA 1V6JA 2CL2A 4I37A 1QNWA 1LHVA 3A0NA 5G00A 4ENDA 3F1RA 2OW4A 3BAOA 4DEPA 3BAHA 5AVAA 4IZXA 3JU9A 3TC2A 1TEIA 4XIOA 1DQ0A 4BMEA 3OY8A 3VV1A 2DVBA 2XG3A 3A07A 2D6NA 3Q7XA 3RTJB 4Q8KA 1RMLA 1QOSA 3IKWA 3HSMA 2A71A 2D1ZA 1SZ6B 3OJBA 3AZYA 1X50A 2D43A 3BRFA 4I2SA 3ILRA 3O4CA 3UJ0A 1V6UA 3V0AB 1FGAA 3M3QA 1QDCA 3Q9OA 3FGMA 5EHAA 2DUOA 1W0OA 4BLJA 2ZGOA 1QQKA 2ZHMA 4ZA3B 3A22A 1R8OA 1DQ6A 4FPHA 1JY0A 4P0LA 1LOBA 4WVWA 3POWA 2W52A 5E88A 1G82A 3CQAA 3OY8B 1ULFA 2ZGRA 3ZX7A 1DJSB 4HJJA 1LHWA 3V0BB 4R9CA 1Z2VA 3O0VA 1F5FA 4JAWA 2P2KA 3UJOA 3B3QE 1XYFA 1NLSA 4AN6A 1JOJA 4GA9A 2WQZC 1S0GA 4WBCA 2EIGA 1AXKA 2VSEA 3R4SA 2FFUA 5EYYA 3NJ5A 4D0TA 1WUVA 5JLVA 3WCRA 4WVVA 2GNMA 4AWDA 3MW3A 1CVNA 3IM0A 5E89A 4YFWA 2ARXA 3S8JA 3POYA 2R9KB 3O5SA 5DZEA 4YM3A 3AYDA 2Y9XE 3LLPA 2ZBJA 1M2TB 2A5ZA 3B69A 5GLZA 2ZR1B 3EF2A 4HL0A 1RITA 4IONA 3BA4A 1IKQA 4LBLA 3OJMA 2EXHA 1O4ZA 2ZGSA 2M49A 5T5OA 4USPA 4XJZA 2ZA9A 1DZQA 1YIFA 5F8YA 5KXBA 2C9AA 2GNTA 2NVHA 4YW4A 4FQZA 4PBOA 1K5VA 1GNZA 1GNHA 3UDAA 1Z4SA 4JP0A 1WBAA 3RMXA 3ASIA 3VKNA 5FZYA 2Y9GA 1FYUA 3N7KA 4U36A 1VCLA 1BLDA 3D6EA 2ZGPA 1AXMA 1G9AA 4FPLA 5GLTA 2UURA 1E0OA 5HPZA 1ENSA 4LBOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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