3N7JA

Crystal structure of botulinum neurotoxin serotype d binding domain
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
415
structure length
405
Chain Sequence
NSINDSKILSLQNKKNALVDTSGYNAEVRVGDNVQLNTIYTNDFKLSSSGDKIIVNLNNNILIYENSSVSFWIKISKDLTNSHNEYTIINSIEQNSGWKLCIRNGNIEWILQDVNRKYKSLIFDYSESLSHTGYTNKWFFVTITNNIMGYMKLYINGELKQSQKIEDLDEVKLDKTIVFGIDENIDENQMLWIRDFNIFSKELSNEDINIVYEGQILRNVIKDYWGNPLKFDTEYYIINDNYIDRYIAPESNVLVLVQYPDRSKLYTGNPITIKSVSDKNPYSRILNGDNIILHMLYNSRKYMIIRDTDTIYAQNCVYALKLQSNLGNYGIGIFSIKNIVSKNKYCSQIFSSFRENTMLLADIYKPWRFSFKNAYTPVAVTNYETKLLSTSSFWKFISRDPGWVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Identification of a Unique Ganglioside Binding Loop within Botulinum Neurotoxins C and D-SA .
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type D
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 94
structure length 405
sequence length 415
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2010-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3n7jA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3n7jA02
2D6OX 4ZKTB 4YZ2A 1Q03A 4QO3A 2VY0A 4LO7C 5I1BA 4Y20A 3UJ0A 2X2SA 4C1XA 1Z0HA 4ZFUB 3IPVA 3UL2A 3AK0A 3WDYA 3NV4A 1FQ9A 1QMJA 2BQPA 1PUMB 3QLQA 1UMZA 1IHKA 2EXHA 1G9AA 1N1SA 4J23B 1EVTA 3O4DA 1FNYA 1TFMB 3M3OA 1YXWA 2P3JA 5JDBA 3O0VA 3WV6A 1I3HA 1C1LA 4I4SA 3CA6A 5T5JA 2A6ZA 1IRAX 4YFWA 4LO3A 1QQLA 1ULFA 5JLVA 3PUBA 4IZXA 2ZA9A 1MS1A 1BXHA 1YTOA 4YGDA 3NV3A 3H6SE 2A75A 2FDBM 1C1FA 3VUOA 1BZWA 3BX1C 3D5OA 4FPGA 1S0BA 4L4IA 5H9QA 4FPCA 2ZHMA 1BFFA 4XTMA 1R8OA 4FPOB 5IK5A 2D6PA 4BPZA 2NYYA 2AENA 3AYCA 1LTEA 4OZXA 1AVWB 1H30A 1W6OA 1DQ5A 1E0OA 1LOCA 4X38A 2ZGOA 4JRAA 1TEIA 5KXBA 2D3PA 5CBLA 2D43A 5AVAA 5JOXA 1DJSB 3ENRA 1N1VA 4X3AA 3BRDA 4K20A 5GZCA 2DYCA 2B7YA 3SNMA 1LHWA 4PCRA 1N1TA 5BVPI 2A3YA 3RG0A 1DQGA 5GZFA 3AJ6A 4ZA3B 4Y1UA 3WHTA 1DQ1A 1ONKB 2MLLB 2WT2A 1HLCA 1GANA 3IM7A 4FOVA 4TZDA 1ISVA 1FMMS 4AVSA 1SR4C 2Y9GA 3A0NA 1DZDA 2NP0A 1MS4A 1PUUB 4G6MA 3UJOA 2D24A 1G9FA 2K8RA 4LBQA 4YZ1A 3P6IA 4Q1PA 2D3RA 4FVVA 3V79C 3UJQA 4XJ9A 3FJ9A 4FOQA 4Y1XA 1HQLA 2OUHA 2QYIB 3CU1B 2AR6A 1RMLA 4IY9A 3NBEA 4FP3A 4P0KA 3VEQA 1S1AA 4Q2FA 3S8JA 1BJQA 1MS9A 1JN2P 4FPLA 3CNAA 1LGNA 3HALA 4W65A 3AZZA 3BODA 2PHXA 3WUDA 3M3EA 4AN7B 4Z9WB 2YROA 2GALA 1A3KA 1DQ0A 1K5VA 4JPZA 4EFRA 3AZVA 1JOJA 2DWRA 1LEMA 2PHFA 3WDUA 2DVFA 4R9BA 3WG4A 2D6KA 4YM0A 4LBNA 4LO8B 1GZCA 1LEDA 2DREA 3M2MA 2CNAA 4BOWA 1GZWA 3SLIA 2DVDA 3RMYA 2GMEA 2G4IA 5E24E 4GWMA 4DRVA 1MZ5A 3ILNA 4DS0A 2DRZA 3T2TA 3POWA 1ONAA 4I7IA 4I4UA 3TC2A 4ZOTA 1S0JA 1G9DA 4Q9PA 4XFTA 2GNBA 3BAOA 3POKA 5DZFA 3UD9A 1DZCA 1MR5A 3O4CA 1SFYA 1WW7A 3FJJA 5FZYA 3CRIA 4QD2B 4Y1VA 2WQZC 4IONA 3ZSLA 5BOWA 2P3KA 4FQZA 1WLWA 5EHAA 1KDKA 2D20A 7I1BA 1W6PA 2WKKA 4XJ8A 3D4KA 1MS5A 3CRGA 4LBQD 5DG1A 1SLIA 2DS0A 1SR4A 3FBYA 2OW4A 3M3CA 1KQRA 3MW2A 1DBNA 2ARXA 3FJIA 3I4IA 5T5LA 1ILR1 1V6UA 3ZXKA 4FGFA 5D62A 3NV2A 2UU8A 1VAMA 3OY8A 1O4ZA 4OEEA 1FYUA 1PZ7A 2A5ZA 1QOOA 1HIBA 4GWNA 1CIWA 2ZGKA 2C9AA 2NZ9A 3BA5A 3Q7XA 3ZC8A 3A22A 2A6WA 1BLAA 3IMNA 3RMXA 1TWEA 2ZGMA 5FNXA 2DU1A 4FPFA 2A6XA 4BLIA 5IUQA 3ZC9A 5F8YA 4R6UB 2KKIA 4IHZA 2E4MC 5CB7A 5SV8A 3V64A 1MZ6A 4I4RA 1MD6A 4XIKA 3RRDA 1JQZA 1ISXA 3BAHA 1S0IA 2UUSA 3USUA 1DFCA 2XB6C 5GAQA 4Q26A 1CVSA 4ZLBB 5GLVA 4PF5A 1M2TB 2CYFA 3WO4A 3VV1A 1JTCA 3A23A 3I29B 1AJOA 3UD7A 5L73A 3POYA 2Q5TA 2W68A 3N7JA 4L4HA 3ZSMA 1JW6A 5F8WA 2V5YA 4YZ3A 3FUQA 1BYHA 3O5SA 1AFCA 3HN1A 4M01A 3HR9A 5F8SA 3CA1A 5BYNA 4G9NA 1OQLB 1OFSA 4M00A 1QDOA 3Q7YA 3M1HA 4KC3A 1F31A 2P23A 5B2HA 1RIRA 4EFQA 3V0BA 2AGSA 4K21A 3B01A 4IYBA 3A0KA 4I3NA 2GMPA 5GM0A 3CA3A 1FX5A 1BFBA 1BQPA 3WMVA 3C9ZA 3OYWA 3WUCA 1LGBA 5BXTA 1SBEA 4XMIA 1N1YA 3OGFA 1WD4A 3N0KA 4YW3A 4TLPA 4D69A 3ASIA 3WLUA 1KRIA 2HWAA 2ERFA 3R4UA 5T55A 2QN4A 3O44A 1LHNA 5DVHA 3WG1A 3U4XA 3RTIB 1EYLA 4YLZA 1AVUA 2I1BA 2ARBA 4I30A 4WZFA 4ZFYB 1W6NA 2RQ9A 2ENRA 3ATGA 1VAVA 1UPSA 4AGRA 1LULA 3WG2A 1OKQA 2ZHKA 3ZVXA 1G8WA 1HCDA 3N7MA 3I8TA 1UKGA 2YUGA 3ILFA 1J0SA 2KLLA 2E4MA 3FJHA 1CN1A 1LGCA 5JOZA 4QC4A 2YXSA 1LECA 2SLIA 3FJEA 1GZ9A 2IWTB 4LO1A 1Q8SA 4G6JA 1W6MB 1ENQA 1N4KA 5D63A 3AYAA 3LCPA 1GV9A 4P14A 1WW6A 2CWSA 2ZABA 4WV8A 1WBCA 6I1BA 5E88A 1GBGA 5HPZA 4XDQA 4AVVA 5GZEA 1AJKA 3WO3A 4P0JA 1XG6A 2ZACA 4YM3A 2JJ6A 2FO1A 2TEPA 4USPA 1ISYA 2AFGA 1CPMA 1DQ6A 4UW4A 5DG2A 2WSUA 2YZ4A 1N3PA 5HCBA 3AJYA 4P9XA 5GZGA 2MC2A 1TOOA 1JLXA 1G86A 4JC1A 1HKNA 2X2TA 1Q1UA 3INAA 3V0AA 1WW4A 1VALA 3OBTA 1GNHA 1MACA 1WD3A 5EYYA 1FV3A 4M3CA 2A6YA 1AX2A 4XKIA 1RZOB 5FZUA 2W39A 1WBAA 5IT6A 4M3CF 4XBNA 3WINA 3JUTA 3HSMA 3O3QA 4OWJA 4ATFA 1GGPB 3ILAA 4U2AA 1MS8A 2GNMA 2UWCA 5FZZA 3RTJB 2WJSA 5T5PA 3PVOA 2ERMA 3AKFA 4LO7B 4ISRA 1YF8B 3A07A 4DEPA 1AX1A 2V73A 4LBQB 2ZGSA 4GP0A 3ZXLA 2P2KA 4DPNA 1LCLA 2MIBA 8I1BA 3W58A 2GN3A 4YG3A 1FMZA 4CZSA 1V6JA 3NBCA 1TIEA 3BADA 3O4BA 3LSEA 3PHZA 4J2YA 1VIWB 4F83A 3IM5A 2LALA 3SISA 2Y9XE 1LHOA 1SBDA 1JYCA 1Z2VA 1A78A 2ZMNA 4Q8KA 5H9PA 2RHPA 5GLUA 3APBA 5DUWA 1JT3A 4BMBA 4I4YA 5BQUA 2ZMKA 2UWAA 3H6RA 3N35A 2ZKNA 1I1EA 4AWDA 4BMEA 1GSLA 3QCWA 3LTQA 4GP3A 5EXOA 5EYXA 3AH2A 2HZ9A 2NTDA 1HDKA 4OWLA 3OPZA 2OVUA 4XHXA 1WLCA 5JOYA 4I4XA 3AXEA 3WDWA 1IRPA 3AYEA 3WO2A 3OJMA 1LHUA 1W0OA 3JU9A 4DFSA 1MS3A 1RG8A 1QKQA 2WBCA 5H9RA 5DXDA 1AF9A 1BARA 4Z8SB 3WDVA 3BA7A 1G9BA 2GMMA 2I2SA 2IHOA 3ZXEA 1FGAA 4G1RA 4ZBVB 3R4SA 1IS5A 2ES3A 3O12A 1URXA 1R8NA 1SCSA 5D61A 3ZXGA 2AH2A 4YFZA 1AVXB 4AYUA 2W08A 3NV1A 2LIEA 4UW6A 2RSTA 3WNXA 4USOA 4BM8A 3A4UA 4YG6A 5HCFA 1ABRB 2HYKA 4A7YA 3AKIA 2AXMA 4I1EA 1QQKA 1DFQA 2HW9A 2EAKA 1S0GA 2RG9B 1G9CA 2WSVA 4DENA 4RL7A 1SBFA 4YGCA 2A3WA 2DUQA 3FJCA 1LHVA 1UL9A 1JHNA 1LOAA 2J3PA 4FOYA 3I2AA 4GAFA 1DQ4A 3AP9A 4YGBA 1JT7A 3O4AA 1S0DA 3E8LC 1LOBA 3IM0A 3NWKA 1WW5A 1DHKB 1ISWA 3W59A 2D7RA 1UN1A 2HWMA 3VKFC 2ZBJA 4LBOA 5BXPA 1TWMA 3RQ0A 1XQNA 1V6XA 4I4PA 2K43A 1YO8A 1Q8QA 1LESA 3AJ5A 4XYXA 1PZ9A 1CESA 4FPKA 1LOGA 4JKQA 1ITBA 3AP6A 3UDAA 3KMVA 4SLIA 2D1ZA 4UW3A 2DUPA 4G9MA 1S0LA 4IY8A 4Y22A 4XJWA 2ZQOA 3K1XA 5CA6A 4XILA 3C2UA 2PHUA 1F5FA 4R9AA 1XHBA 2JKBA 3B3QE 5F90A 4YW5A 3FLRA 1C57A 4KEJA 5JMCA 2WRYA 4X37A 1DYKA 4HL0A 4QBVA 1D0HA 3F62B 4JKXB 1GNZA 1Q04A 2Z49A 2JD4A 2AYHA 2M49A 3D7WB 2E7TA 1UAIA 3WA1A 2VLCA 1NUNA 2Z48A 3AP4A 3CQAA 4PBPA 1JLYA 4XOGA 4WVVA 4DQAA 3AH1A 2F2FC 3OJBA 5T52A 4AGGA 3OBRA 2XOAA 1R1ZA 1Q8PA 2YY1A 2FFUA 2A70A 3V0BB 1HWNB 4KBBA 1FNZA 2VH9A 4YGEA 1QNWA 2VUAA 4WBCA 1WUVA 5KXCA 3VKMA 3SH5A 3CA5A 4LO1C 3WCSA 1JYIA 2D7FA 3L2YA 2H0BA 4L8QA 5GZDA 2ZHNA 1G82A 4P9YA 3VT2A 5JVVA 4I6IA 3MALA 4XFUA 1QGLA 3NBNA 1XYFA 1Y7BA 2K4AB 4FP2A 3ZXDA 1SLBA 1IS4A 3LLPA 2A3XA 3VKOA 1WBLA 4XJZA 1QOTA 1BA7A 4Q91A 3MW3A 5KXDA 1AXMA 1QOSA 1N3OA 1CQ9A 3N7KA 4XJAA 3GALA 2NM1A 1SLLA 3WMUA 1W0PA 4H9WA 3IN9A 3F1RA 4Q27A 3RSJA 4YZ4A 1OQ1A 1ENSA 2E53A 2L5XA 1LENA 2FGFA 5E89A 4LO0A 4DCKC 2R0FA 2GZBA 1WCSA 3VT1A 4XXAA 3NJ5A 1FWUA 1HKDA 3P6JA 1HWOB 1P63A 1W6QA 4ZGRB 2KH2A 3SNVA 4ITCA 3IM6A 1U0AA 5DUUA 2Y9WC 1IS6A 2CY6A 3N3HA 3ZPYA 3ZXFA 1GYKA 4PC4A 1BLDA 3WINC 2D44A 2JDZA 2DUOA 1MVQA 4OEFA 2ZGLA 1DGLA 4F34A 3TB0A 4XXPA 2D6LX 3N36A 3ZXJA 31BIA 4C1WA 5T54A 3W9TA 1V6MA 5G00A 4Y20B 1O4YA 4I0YA 3IPVB 2R1BA 1PC8B 1H9WA 3FFZA 1DQ2A 2FMDA 1QXMA 3BAUA 1ULDA 4OUJA 3Q7WA 2ET2A 2D23A 1YIFA 2KI4A 4XJUA 3B9UA 2DVBA 2ZAAA 3T1MA 3FJAA 2F2FA 2AREA 2EXIA 1TTUA 1N47A 3CAHA 3WG3A 2KI6B 3BAGA 1ZA4A 1FWVA 5BQUC 3AZXA 2D6MA 4I37A 1APNA 3SH4A 1X50A 1BASA 3UK9A 3FJ8A 3B00A 3OJVA 4OWKA 5DZEA 5E8AA 3O49A 3BOPA 1GICA 4RA0A 1IT0A 1HWMB 1Z4SA 4FPYA 2Q9XA 3ZYRA 4YZ5A 1BKZA 2DV9A 4AGVA 3ILRA 3PVNA 2VSAA 3AX4A 1W6OB 1QF3A 3P53A 3N7LA 3RS6A 2UWBA 1YYNA 5F9TA 3AKHA 2E51A 2JE9A 3WCRA 5HCAA 4Z8BA 4D0ZA 4XIOA 4LO2A 1WBFA 1QU0A 2YMZA 5IK7A 3VSZA 1F9KA 3O5WB 4EKXB 3B69A 3FJDA 2ZHLA 4XZPA 4GOVA 4QALA 5JOWA 3H6RB 1ULCA 5FRAA 1IOBA 4ZFWB 2R16A 3D6EA 1B09A 1DQOA 4P9WA 1XZZA 3KM5A 3KQRA 1AXYA 1UZZA 2A71A 4XMAA 1AXZA 4Y26A 4OEGA 1JT5A 3GNEA 2P37A 1W6MA 2NMOA 4GAIA 4LBKA 4XHBA 4I4VA 5GLWA 2GDFA 1EV2A 2C5DA 3SITA 4YM1A 3BTAA 2DRYA 2DTYA 4HR6C 4Y24A 4LBMA 4J2XA 2E6VA 3UJ4A 4ENDA 3POSA 3IIRA 2R1DA 5FNWA 2D22A 2GNTA 5IK4A 1DIWA 4UW5A 1G7YA 2VU9A 4FPHA 4CRQA 3Q9OA 4JQ0A 5GLTA 1NLSA 1T4QA 5BXRA 1DLLA 2ZGTA 2VXTI 5GJ6A 3WZ1A 1I1BA 1IOAA 4HANA 2UURA 4JP0A 3IAGC 1II4A 2NN8A 21BIA 2CL2A 1JBCA 2D7IA 1RITA 1CR7A 4R9CA 1DYPA 3AFKA 4FOWA 2VSEA 1ULGA 4GXLA 4I1BA 2EXKA 3M3QA 2JE7A 1S0CA 1ULEA 2ZMLA 2ZR1B 5KXEA 4GA9A 1AVAC 2PHTA 4H55A 4KEKA 2D3SA 1RY7A 3HOMA 4Q9GA 3H0OA 1AXKA 2LTNA 4LBLA 1GZWB 2ZGPA 4K1ZA 1PZZA 1FV2A 2PELA 2EIGA 1CVNA 4KEIA 2F8XC 2GN7A 4CTEA 3NBDA 3HBWA 4YW4A 3AZWA 2ZZJA 1BFGA 1Z78A 1LOEA 1L2HA 2YV8A 3T1LA 3PMEA 1FN0A 1S0FA 1SLCA 1DZQA 2E7QA 1W3FA 3T8SA 1KJLA 2DTWA 1AZDA 4WVWA 2BEBA 1CONA 4Y22B 1MVEA 3DGTA 4CJMA 3ZYPA 1KDMA 4X39A 1LOFC 1W6PB 4ATEA 2ZGQA 5IK8A 3FGMA 1FATA 5DUXA 3B9CA 3PVEA 4QKRA 1BFCA 2AAIB 3VWCA 3V65A 4QD2C 9ILBA 4LBJA 2AUYA 2EF6A 4JCKA 1C4RA 3FUOA 3VKLA 1V6NA 1Q8OA 4XFSA 5DUVA 1T9FA 1WLDA 2ZGNA 4GKYA 1V6LA 3OY8B 3AYDA 1AVBA 3QR5A 4TYSA 4HA2A 3BA4A 4FPJA 1GLHA 1M16A 5DSSB 4HJJA 2DURA 4PQ9A 1V6IA 4A7KA 3BRFA 4A7ZA 4LO0C 4Q1RA 4AN6A 2Z42A 4JAWA 1CE7B 5DZUA 1V00A 4I96A 1W3GA 1MS0A 4FPEA 3R05A 3TAYA 1LU1A 2Y9FA 3WDXA 3FLPA 4YG0A 2EALA 2XG3A 3VKNA 3IKWA 3I2XA 3USUB 4D8HA 2DU0A 2FHRA 1NZKA 5BP5C 2FFVA 2P39A 1MC9A 2R49A 1UZYA 3AJZA 1LODA 3ZX7A 1HQWA 1S0EA 2WLQA 2KM2A 2VW1A 4AVTA 3AH4A 4QKSA 1JT4A 3AP7A 5DZGA 3WVJA 1AX0A 4DRRA 4Q8LA 4YM2A 1EPWA 1K5UA 4J2KA 1LJ7A 1YRZA 5EWSA 2WNEA 1CPNA 2R0HA 1Q8VA 1W6QB 4U36A 3OGGA 2ZGRA 3AP5A 2AQZA 1J1TA 2A7AA 2VXRA 1SLAA 3FJKA 1ZM1A 1LOFA 4ZXKA 4BLJA 2LIQA 3S8KA 1SACA 4XE9A 1KITA 4ASMB 3OYWB 4P0LA 1IILA 4I4QA 1IKPA 3AKGA 1PZ8A 2SBAA 1IKQA 4OW4A 3JUUA 3CA4A 2D6NA 2WT0A 5EC5A 4M3CE 3WDTA 3O0XA 1JUIA 2DVAA 3PG0A 1Q56A 4H04A 3LSDA 3OJ2A 5CNAA 1YBIA 1V6OA 4YOLA 3MW4A 1UX6A 2P34A 3FLTA 4QBCA 4I8MA 1NXD1 2WT1A 3PJQA 3DUIA 5EG6C 2VW2A 3HMYA 1W3AA 4IQPA 3BAQA 2GO2A 3SH3A 1W6NB 4XTPA 1KNMA 2BFHA 1QNYA 1LU2A 3H6QA 4LO2C 4NO4A 5F5QA 3EF2A 4YW2A 4R9DA 3VSFA 3JRRA 2VW0A 4GOYA 2EXJA 4II0A 5T5OA 1IS3A 4PBOA 3CRHA 2ZQNA 2BEAA 4J2SA 5FREA 1PWAA 4XBLA 1GKBA 2PHRA 3CA0A 5H9SA 1JY0A 5DUYA 3BB2A 1RINA 4LO3C 5BP5A 1FAYA 3MPPG 1V6KA 2NMNA 4EFPA 4ISQA 2OUJA 4EB2B 4K1YA 5CAZA 2PHWA 2DVGA 3WOGA 5GLZA 3AZYA 2Q3NB 1QDCA 1H9PA 3QYDA 3AXDA 1YI7A 3BIWE 4IZEA 4FQ4A 5T50A 2JECA 4XBQA 1IJTA 4I4OA 2CTVA 1N3QA 4I2SA 1JXNA 1ENRA 5BXSA 3FJFA 3ZSJA 1SCRA 2CWMA 1A8DA 3V0AB 4GALA 4MYEA 41BIA 4NOTA 1V6VA 2NVHA 4M3CB 4YW1A 3VT0A 1CJPA 3ZSKA 2R9KB 3O0WA 2A6VA 3MEPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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