3N7LA

Crystal structure of botulinum neurotoxin serotype d/c vpi 5993 binding domain
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
422
structure length
418
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNTGLITNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Identification of a Unique Ganglioside Binding Loop within Botulinum Neurotoxins C and D-SA .
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords Neurotoxin
total genus 96
structure length 418
sequence length 422
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3n7lA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3n7lA02
1FWVA 3AK0A 3WDTA 1DQ5A 3AKHA 5F8SA 1N4KA 4XJAA 3POSA 2CL2A 3O0WA 2XOAA 2YZ4A 1W6PA 4RL7A 1UMZA 1AXKA 1I3HA 2WT0A 2WT1A 3HR9A 2HWAA 1S0LA 5GALA 1QNYA 1W6NB 1GZWB 2C9AA 3KQRA 3AKIA 5EG6C 4HANA 2A3WA 4XBLA 3N7MA 3WMVA 5FZYA 3WUDA 4XXPA 4II0A 2LIQA 1IRPA 2D6KA 2R0FA 3NBDA 1DYPA 1IRAX 2ZKNA 2ZHLA 1MS3A 4JRAA 4AVSA 1LOAA 4Q27A 3VT2A 1V6JA 2GMMA 3ZYRA 2VSEA 2DUPA 3VV1A 3UJOA 1PZ9A 2HWMA 5GZGA 3H0OA 1WBLA 4ITCA 3B9CA 3R4SA 3V0AA 2X2TA 5EHAA 2DRYA 2DVDA 1AVWB 1FGAA 2UU8A 4YGBA 4GOVA 4Y22B 2D7IA 1W0OA 5E89A 2DRZA 2DREA 1T9FA 8I1BA 3NJ5A 1A8DA 4CJMA 5B2HA 2DVFA 4I4PA 2QYIB 5HCAA 1LECA 1URXA 1AXYA 3B9UA 3WHUA 41BIA 1PUUB 4WVVA 4XKIA 4AN7B 1FN0A 2MIBA 4I4SA 3UD7A 1OFSA 4YM2A 4Z9WB 3ZSKA 3WG1A 2A75A 5GLVA 5BXRA 2D7FA 1PC8B 1ULFA 4WV8A 3ATGA 1LGBA 1UL9A 4LBMA 1S0BA 4FP3A 1HKNA 2Y9XE 2YY1A 3N0KA 5EYYA 1BFCA 5DZFA 3HALA 1WBCA 1LEMA 3P53A 3ILNA 3WZ1A 2NYYA 4Y1XA 2AFGA 4ZA3B 4OEEA 3A23A 5KXCA 2OW4A 4Q26A 1YRZA 4Q9GA 4GP0A 5JOYA 2ZR1B 2AXMA 4YW2A 3LSEA 1G9AA 4PF5A 1J1TA 3CA4A 4I3NA 3QLQA 1R8NA 3QCWA 1FMMS 2GNBA 3INAA 1WW4A 4M3CB 4TYSA 1C1FA 3BRDA 3V79C 1AZDA 3NV3A 1WLDA 2RG9B 2NP0A 4Y20A 1KDMA 2E51A 1ISYA 2RSTA 4GOYA 5BXTA 4K1ZA 1WW7A 2QN4A 4XBQA 5SV8A 4YZ5A 2M49A 4KEJA 5GJ6A 1BKZA 3DUIA 3MEPA 3BB2A 1N1VA 3JU9A 1W3FA 1A78A 2YV8A 1FAYA 4BPZA 1ISXA 4FQ4A 2A6YA 2HZ9A 4I8MA 1QDCA 4PC4A 5BP5A 3PUBA 5KXDA 2FGFA 5GLTA 1N3QA 2WSVA 1SLTA 4XTMA 4F34A 5BP5C 2GMEA 1HKDA 1VCLA 2K43A 5JOWA 4ATFA 3WDXA 1FNYA 4WVWA 3I2XA 1NXD1 3WMUA 2D43A 4ZOTA 3POKA 3WVJA 3FUQA 3ZXLA 21BIA 4OWKA 1JY0A 2ZA9A 1WBAA 5DG2A 1KRIA 1XQNA 4R9DA 1APNA 4HA2A 1WW5A 2Q9XA 3CRGA 4A7ZA 5DG1A 1BFGA 4Y1ZA 2DTYA 3BAUA 2CWSA 3SH5A 3R05A 1MS1A 2EIGA 4ZXKA 1QQLA 3HSMA 2GO2A 2R1DA 1AF9A 1KNMA 4J2YA 5F9TA 1JYCA 4G9NA 2WQZC 1HWMB 1AVBA 5IK8A 5CA6A 3HN1A 4IY9A 3AH1A 2G4IA 1ONAA 2ZQOA 4Q2FA 2YXSA 3CA5A 3V65A 4GP3A 4K1YA 4AN6A 1QQKA 1JT4A 4YM3A 1I1BA 4XDQA 1BQPA 4J2KA 1IHKA 2SLIA 1RITA 3N7LA 4P9XA 4YG6A 4XBNA 2WSUA 2OVUA 1DQ1A 3CRHA 2OUHA 3O4DA 3CAHA 4IZXA 4H9WA 4I7IA 2KKIA 3KMVA 3BAQA 2A6XA 3SISA 4Z8SB 1W6MB 3F62B 3S8KA 1EPWA 2A7AA 3AP9A 3A07A 1S0DA 3N35A 2ERFA 1SBEA 2X2SA 1E0OA 1XYFA 1MVEA 1HWNB 4I4VA 1W6OB 1F9KA 4ATEA 4D0ZA 1TIEA 1ULGA 4QO3A 1JBCA 2ZHKA 4XILA 2CNAA 1GBGA 1C1LA 3AH4A 1ISZA 2DS0A 5T5PA 2D3SA 2GNTA 1EYLA 5IK7A 2R49A 1ZA4A 5IUQA 1XZZA 2JE9A 1S0EA 5GLZA 5DZEA 2VLCA 1QKQA 7I1BA 4UW5A 1LENA 3B3QE 1BARA 1SLIA 1LHNA 4AGVA 3CU1B 4XIKA 4Y1UA 2NVHA 3WG4A 3RQ0A 2D20A 4JC1A 1V6VA 1VIWB 3MALA 1RG8A 4I30A 4FPHA 3IIRA 1DZDA 5GLWA 3O3QA 1HDKA 3AZWA 3BTAA 1WD4A 2DUOA 4ZGRB 2Q5TA 1SR4A 4EEEB 4Y1YA 1FQ9A 2EXHA 4OEGA 4I4YA 1CR7A 3USUB 5EYXA 2AAIB 1LODA 3IM5A 3UD8A 1WD3A 2PHUA 4FPGA 4CZSA 4L8QA 3NWKA 5GLUA 3H6RB 2P2KA 1MD6A 4SLIA 2D6LX 2FMDA 4J2SA 5JLVA 5CBLA 4GWNA 4KC3A 1FX5A 2Q3NB 3BADA 1LU1A 3F1RA 3N7KA 1ULEA 1SLCA 4WZFA 2P37A 1NZKA 2R1BA 5F90A 1H9WA 4I4QA 1WLCA 3WDUA 3RTJB 2VXRA 4XHXA 5FZZA 4UW4A 3BOPA 3POWA 5BVPI 1DYKA 1SFYA 1Z4SA 4FPEA 3D7WB 2YUGA 4I4OA 1X50A 1V6IA 2DVBA 4MYEA 5T52A 4A7KA 2EF6A 3IM6A 1DFQA 1CVSA 4YGCA 1Q8PA 2PHTA 3WO2A 2FDBM 3CA1A 3PMEA 1QNWA 1DGLA 3LTQA 1V6NA 1BASA 2CY6A 5H9QA 1LOEA 1G86A 4YZ4A 3E8LC 2RQ9A 2P23A 5GAQA 3M3QA 1F5FA 1BLAA 1JYIA 1UZYA 1N47A 1UAIA 3FJFA 3BAVA 2KLLA 5FNXA 1JTCA 1CVNA 3AYAA 1WCSA 2LALA 3ZVXA 2GZBA 1V6OA 2D1ZA 3IPVA 3FJ8A 4YFZA 1FNZA 1HQLA 3QR5A 1Q56A 1S1AA 5HCFA 2D23A 1TEIA 3V0BA 2ZGKA 2WNEA 1I1EA 2CYFA 4UW3A 3UL2A 2NMOA 1AX1A 3VT1A 1QOOA 1ULCA 2NTDA 3RS6A 4EFQA 2Y9FA 4K20A 3FLRA 1R8OA 3AYCA 4JPZA 3AZZA 4M01A 4ZFUB 1DIWA 1Z2VA 5T55A 5F8YA 3DGTA 1GGPB 5D62A 5KXEA 3ZYPA 3D5OA 4Q1PA 4BLIA 3SNVA 1QGLA 3FJCA 1UZZA 3M1HA 4IZEA 2FHRA 1MR5A 3M3EA 4R9AA 4AGRA 3AJYA 2JDZA 2WKKA 3OJBA 1W6QB 3M3OA 4XOGA 3I29B 1LEDA 3RMYA 4U36A 4I1BA 3MW4A 3ENRA 1AXMA 3ZXJA 2VSAA 2P3KA 2A6VA 4USOA 3AJ5A 3ZX7A 1W6NA 1GZWA 3ZPYA 1P63A 3FFZA 2AH2A 6I1BA 2A5ZA 3FJKA 2KI4A 4CTEA 1R1ZA 1GLHA 2ZGMA 2UUSA 4D69A 2XB6C 3RG0A 3OYWB 1TOOA 5GZDA 4X3AA 3ILRA 3TAYA 2DYCA 4OWLA 2PHXA 2SBAA 2ZQNA 2ZHNA 3U4XA 1G9CA 1ULDA 1YO8A 4WBCA 4TLPA 1F31A 4XJ8A 4DPNA 4I4UA 2TEPA 2A6ZA 1CQ9A 2VW2A 5GZFA 2D6NA 4XE9A 4H55A 4Y22A 2RHPA 1SBDA 4XHBA 1WUVA 5DZUA 2XG3A 4XXAA 3PHZA 5CAZA 1LHOA 1LGNA 4P9WA 4L4HA 3APBA 2Y9GA 4EFRA 2WBCA 3W58A 2DURA 3AKGA 4YW3A 3FJEA 2AGSA 4LO0A 3B00A 2DV9A 2VY0A 3AP7A 2D22A 4LO0C 3OGGA 3BA7A 3PG0A 1OQ1A 1AJOA 4LBLA 3A0KA 1JW6A 4ZFYB 4R6UB 2R9KB 4BM8A 1N1TA 5GZCA 4HR6C 5CB7A 2ARBA 2AENA 2ZZJA 1V6UA 1KQRA 1MS9A 1LHUA 2EAKA 3TC2A 2E4MA 3H6SE 1WBFA 1J0SA 3RMXA 5LK5A 3SH3A 1G9DA 3NBNA 2FFVA 1BFFA 2EALA 5CNAA 1S0JA 3FGMA 4NO4A 3IM7A 4Y1VA 1CESA 1ENSA 1M2TB 2WT2A 5DUXA 3AX4A 1GZ9A 3OBTA 4M3CA 3WO3A 5DSSB 3JRRA 1RY7A 1DLLA 1GSLA 2BEAA 4LO7B 4W65A 3V64A 1V6MA 2I2SA 3H6QA 1Q03A 4DCKC 4JKQA 1YIFA 2D6PA 1TWEA 3IM0A 1GV9A 3WA1A 1G7YA 3WCRA 2W68A 4EFPA 3VSFA 2KM2A 2AREA 2DTWA 2ZACA 4P14A 1LTEA 1GYKA 3ZXKA 1ZM1A 4XZPA 2K8RA 3OJMA 1L2HA 3K1XA 4QD2B 4PBPA 3IAGC 1HWPB 4FOWA 1CPMA 1DJSB 1JT5A 4LO1A 4XJZA 4DRRA 1V6WA 1DZCA 4L4IA 4I0YA 4FQZA 4LO1C 1MZ6A 2V5YA 2EXKA 5JOZA 3I8TA 3LLPA 4XJ9A 4R9CA 5E24E 2FFUA 4BMEA 4RA0A 4JQ0A 3B01A 4LBQD 2E6VA 3VUOA 3WOGA 1XHBA 3AP5A 3OJ2A 2PHRA 4AWDA 4XYXA 4D8HA 1BXHA 1VAVA 1ILR1 1S0GA 2ET2A 1JHNA 3ZC8A 2UURA 4ZBVB 2D6MA 3WHTA 2HW9A 2B7YA 1YF8B 1S0CA 5T5LA 2ZMLA 2LTNA 1HQWA 3NV2A 5IT6A 2MC2A 2DU0A 5JMCA 1AFCA 3QYDA 4M00A 3BODA 4ZKTB 4GALA 4IYBA 2BQPA 4OW4A 2YROA 4IY8A 3B69A 3ZSMA 4OEFA 1BA7A 1AXZA 4X38A 3AJZA 4GKXA 3O4OA 5F5QA 3VT0A 3WG3A 3O4CA 4P6AA 5IK5A 4M3CF 3ZXEA 1FYUA 3EF2A 5HCBA 2VW0A 1LCLA 2ERMA 2LIEA 1AVUA 1NUNA 2FO1A 3M2MA 1VALA 3BA5A 3I4IA 1QMJA 2ZMNA 3WG2A 4Y26A 1K5UA 2GN7A 3T2TA 4D0TA 3NV1A 4I6IA 2DWRA 2DUQA 3O5WB 1BJQA 3O44A 4LBNA 3OY8B 4QKSA 3POYA 1W3AA 1ISVA 1U0AA 1GZCA 2ARXA 5DUYA 3UJQA 4P0JA 5DXDA 2VW1A 5FZUA 3BRGC 4BMBA 2EXJA 1W6MA 3WDYA 1LULA 1NLSA 3Q7XA 5JDBA 5FRAA 2NMNA 4ZLBB 4JKXB 3BA4A 1IILA 4P9YA 1SR4C 1ONKB 1W6OA 3AYEA 4XTPA 1HCDA 3ZSLA 3A21A 1YYNA 4KBBA 1YI7A 1GANA 1CONA 1HCEA 1Z0HA 1MACA 5T50A 4AVTA 1AVAC 5T54A 5BXSA 1DQGA 3AFKA 5HPZA 4FPLA 4G6JA 2L5XA 1T4QA 1JT7A 4X37A 4XJUA 3WUCA 4IHZA 1MS8A 3OBRA 4Z8BA 3BAOA 1XG6A 3SITA 4FOVA 1N1YA 2F2FA 1Q8VA 1Y7BA 2IHOA 3CRIA 3IMNA 4J23B 4I96A 3ZXDA 1YXWA 3UJ4A 2AUYA 3L2YA 1FMZA 2F2FC 3FJHA 1N1SA 3O4BA 1AX2A 2PELA 3AZYA 4FOYA 4DEPA 4Q91A 1EV2A 3KM5A 2JD4A 1S0IA 1O4ZA 3RTIB 3NBEA 2DU1A 2D3PA 1FWUA 2KI6B 3MW2A 1GKBA 1C4RA 4LO3A 3GALA 4YW5A 4LO2A 4XFTA 3USUA 5JVVA 4GWMA 4QBVA 3FJDA 4G9MA 3ZXGA 1G9BA 1BYHA 2Z48A 1CJPA 2GNMA 4LO2C 2ZGSA 3OJVA 1UKGA 3H6RA 4U2AA 3WNXA 3AXEA 1UN1A 2F8XC 1SCSA 1GICA 4GXLA 2JE7A 4YZ3A 1D0HA 3V0AB 1LOFA 1LJ7A 5L73A 2D6OX 3BAGA 4PQ9A 4XFUA 2ZHMA 1LOFC 4OUJA 4AYUA 1ENRA 5JOXA 4Q9PA 1DHKB 2AQZA 4FPYA 4ENDA 1MVQA 1JLYA 2GALA 1EVTA 2WRYA 3HOMA 4YW1A 1DQ4A 2CWMA 4DFSA 2CTVA 4FPKA 4HJJA 4QBCA 1BZWA 3AKFA 1QXMA 3NBCA 1C57A 2Z42A 4K21A 3VKNA 2BEBA 1IS4A 4Q8LA 4XMAA 1JQZA 1LOBA 1QU0A 3BIWE 4G1RA 4ZFWB 1CE7B 3AXDA 1Q8OA 4H04A 1IOBA 1G9FA 3ILFA 2JECA 5FNWA 2C5DA 9ILBA 3P6IA 4CRQA 5BQUA 1CIWA 1IJTA 4IONA 3SLIA 2NZ9A 2V73A 1SZ6B 5KXBA 2ZGUA 3FJIA 5DZGA 5BQUC 1SACA 3O0VA 4DRVA 1V00A 2ZGRA 1HWOB 2Z49A 1DFCA 4ASMB 1QOSA 2P3JA 3LCPA 5FREA 4P0LA 1PZ7A 3AYDA 3Q9OA 4A7YA 4X39A 1G82A 5H9SA 2A6WA 5E8AA 5F8WA 5D63A 4LBKA 4OWJA 3VSZA 3O49A 3RRDA 1RINA 4YZ1A 2BFHA 5T5JA 3CA6A 3AP4A 1N3PA 4I2SA 3P6JA 2UWCA 2GNDA 4YM0A 4YG3A 3T1LA 3AZXA 2AR6A 4Y20B 5DVHA 1JN2P 1SLAA 4BLJA 3ILAA 1V6KA 4IQPA 3N36A 2E7TA 1LHWA 4P0KA 1JUIA 4EB2B 2P34A 1DQ2A 2ZGPA 1BLDA 1Z78A 4XIOA 1W6QA 5GZEA 2A3XA 3VWCA 1Q8QA 4QKRA 2DVAA 1DBNA 5T5OA 2D7RA 1K5VA 1RZOB 2P3IA 1GNZA 4FPFA 3UD9A 3O5SA 3BX1C 5G00A 1VLNA 2R16A 1V6XA 1W3GA 1O4YA 2JJ6A 5DUUA 3OYWA 4Y24A 3Q7WA 2ENRA 3WINA 3CA3A 1V6LA 1H30A 1SLLA 3WINC 1IT0A 3WV6A 3A4UA 3M3CA 4FPCA 3AJ6A 1PUMB 3IN9A 2A70A 3UJ0A 2ESUA 5E88A 4FOQA 4XMIA 5DUWA 3N7JA 1HLCA 1SCRA 1FV3A 1YTOA 4QALA 4KEIA 4I1EA 3I2AA 4EKXB 2E4MC 2GMPA 3NV4A 5I1BA 3SNMA 2ES3A 4XJWA 3VKLA 1FATA 3TB0A 1ISWA 1M16A 4FPOB 4BOWA 1B09A 3HBWA 2JKBA 2GDFA 3UDAA 2A71A 2D3RA 1Q1UA 3AH2A 1TTUA 1DQ0A 3FLTA 4YGDA 2ZGQA 4LO8B 1JXNA 1SBFA 3R4UA 3W9TA 2OUJA 4AVVA 3CNAA 4YOLA 5H9PA 1LHVA 2MLLB 4YW4A 2W52A 1IS3A 3ZSJA 3OGFA 3VKMA 4BQ1A 3D6EA 1JT3A 4DQAA 3FUOA 1ITBA 3T8SA 4LBOA 5EXOA 4NOTA 3PVOA 2ZGTA 1LU2A 3RSJA 3VKOA 4GAIA 4YLZA 1UX6A 1ABRB 4ISQA 2NN8A 3A0NA 3Q7YA 4I4RA 3VEQA 3BRFA 4USPA 1AVXB 4LO7C 2ZBJA 2J3PA 2K4AB 4GAFA 4J2XA 1QDOA 3T1MA 5EWSA 1IOAA 3AP6A 3S8JA 3FJJA 3FJ9A 3JUTA 3PVNA 1AX0A 4QD2C 1KJLA 4ISRA 2WJSA 1CPNA 1IKPA 4DENA 1IS5A 5D61A 4LBQB 2PHFA 3N3HA 1N3OA 5BOWA 3A22A 1RIRA 1YBIA 2DVGA 2GN3A 3O4AA 3ZXFA 2E7QA 3C9ZA 1LOCA 1CN1A 1QF3A 2I1BA 2UWBA 1RMLA 3MPPG 1A3KA 2VH9A 1BFBA 4F83A 3FJAA 1QOTA 1TP0A 4UW6A 4KEKA 4JCKA 1FV2A 3WCSA 3WLUA 3WO4A 4PBOA 3ZC9A 2H0BA 1UPSA 3PJQA 1KITA 1PZ8A 2W08A 1MC9A 3WDWA 3VKFC 2ZGOA 3FLPA 3BAHA 1DQOA 5BXPA 4FGFA 5EC5A 1AJKA 1LESA 2EXIA 3IKWA 4HL0A 1WW6A 1DQ6A 1W0PA 1TWMA 2D44A 2KH2A 5DUVA 4AGGA 2UWAA 4Q1RA 2ZAAA 2D24A 4LBQA 3FJBA 4FPJA 2VXTI 1SLBA 31BIA 1OQLB 1Q8SA 2ZABA 4M3CE 4GA9A 3CQAA 1IKQA 4XFSA 3D4KA 2P39A 4DS0A 4GKYA 4C1WA 3AZVA 1JLXA 1H9PA 4I4XA 4YGEA 2ZGLA 1PWAA 4LBJA 4R9BA 4YZ2A 3PVEA 2YMZA 4G6MA 2W39A 3FBYA 3OY8A 5H9RA 2E53A 3OPZA 2A3YA 1W6PB 4YG0A 3IPVB 3HMYA 3UK9A 3MW3A 1MZ5A 1KJRA 1MS0A 2NM1A 5GM0A 1HIBA 3V0BB 3GNEA 3O12A 1IS6A 3CA0A 2WLQA 4I37A 1LOGA 2R0HA 1OKQA 1GNHA 4FP2A 4JAWA 3LSDA 1ENQA 1VAMA 1KDKA 3ASIA 4YFWA 5IK4A 3W59A 4Q8KA 1D2SA 1II4A 1G8WA 2ZMKA 4JP0A 1MS4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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