3N7LA

Crystal structure of botulinum neurotoxin serotype d/c vpi 5993 binding domain
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
422
structure length
418
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNTGLITNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Identification of a Unique Ganglioside Binding Loop within Botulinum Neurotoxins C and D-SA .
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords Neurotoxin
total genus 96
structure length 418
sequence length 422
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3n7lA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3n7lA02
1W6QA 3VT1A 5DUVA 1GANA 3WG4A 4AYUA 1W3AA 1FYUA 4ZFWB 1LOBA 3KQRA 4HL0A 1JT5A 4GOYA 3ZSLA 1IOAA 4LBQB 2KH2A 4XJAA 1L2HA 5CNAA 4H04A 5HPZA 1ISWA 2CWSA 2QN4A 3AZVA 3QR5A 1DHKB 1Z4SA 4A7YA 4FQ4A 4CTEA 4USPA 1K5UA 4XJZA 4CZSA 3WO2A 2YV8A 2X2SA 3OY8B 3A07A 2A5ZA 1AXKA 2GN3A 5JMCA 4Q2FA 2OUHA 2ZR1B 5FNWA 4YOLA 4FOWA 1ITBA 4CJMA 3VEQA 4IZEA 2BFHA 2NYYA 5L73A 3AP5A 1LENA 4AGVA 1FMMS 4ATFA 4I4UA 1W0OA 5T50A 1O4ZA 3APBA 1W6NB 3TAYA 3M3QA 3AZYA 1CVNA 3CA4A 1R8NA 2NMOA 4XKIA 1ISYA 2VY0A 3B00A 4GALA 1YTOA 3AKIA 4P6AA 1HKDA 3NBCA 3BX1C 5GLZA 2JECA 3RMYA 2UWCA 1F5FA 2HYKA 2ZMNA 1NUNA 2W39A 3FJBA 3UK9A 3P6JA 1ONKB 4YGDA 1VIWB 2DRYA 4QBCA 2LTNA 3E8LC 2DRZA 1SBEA 2GALA 2AFGA 5EWSA 1VAMA 2B7YA 3IKWA 1LHVA 4Y26A 2ZMKA 4L8QA 1CESA 3IN9A 3BRFA 3S8KA 4JKXB 5JOWA 4OEGA 4EFQA 5EHAA 4LBQD 4ENDA 2ES3A 1LGCA 4IQPA 3BAQA 4XIKA 4Q1RA 4FPHA 2R49A 4I37A 1AVBA 3PJQA 3ENRA 2CNAA 2GNMA 4C1WA 3M3OA 3H0OA 1ONAA 1DQ5A 3ZXLA 4P0LA 3MEPA 1M2TB 3T1MA 3ZXFA 3D5OA 5CB7A 2I1BA 2BEBA 3ILNA 4LBLA 3BAHA 4OZXA 4ITCA 3FJIA 2E51A 1CPNA 3V0AB 3FUOA 2ZGPA 3LCPA 2ZGTA 4EB2B 3FJEA 1SLAA 1QQLA 2GMMA 3AH2A 4FP3A 5T54A 1N4KA 3UDAA 3TC2A 1I1BA 1JYCA 2DYCA 3SITA 4PQ9A 2DVFA 1JY0A 4I4RA 3OYWA 3NV3A 5JOZA 1XQNA 2HWAA 5BOWA 4QBVA 3OJBA 1ULGA 1MS4A 2DTYA 1KITA 1WW5A 1GNHA 3SISA 2ESUA 4BMBA 1QNYA 5DUXA 2ZHMA 4AN6A 1TWMA 3UD8A 4ZFYB 1N3QA 3Q7WA 2BEAA 3WVJA 3SH5A 4HANA 2FO1A 1WLCA 3CNAA 2DVGA 2Y9GA 4L4HA 2P39A 3BA4A 4JP0A 4ZXKA 1N3PA 2A6XA 3UJ0A 3B69A 1GV9A 1QMJA 4CRQA 1RIRA 5T5LA 1SZ6B 3R4UA 4DQAA 1OKQA 1QOSA 3AKGA 5F8WA 5GLVA 2A3WA 3RQ0A 3NV1A 1GZWB 4D69A 3V64A 4ZLBB 3FLRA 2VUAA 4I3NA 5AVAA 2V5YA 3AP4A 1IS6A 3KM5A 1W6QB 4HR6C 1HKNA 2MIBA 4M3CF 1JLYA 3I4IA 3O49A 1AJOA 2LIEA 4JAWA 1NLSA 4D8HA 2A3YA 5GZDA 2DU0A 4I4VA 1MZ6A 4P0KA 1UAIA 5BXPA 4YW5A 2E53A 4I1EA 4LBJA 4HA2A 1AJKA 1DQ2A 3N7JA 4Q1PA 1H9PA 4YM2A 3BA5A 4JQ0A 4XZPA 1GGPB 4P9XA 4QKRA 3FJAA 5D62A 1F9KA 4GKYA 1RY7A 5BQUC 3O5WB 4XILA 3CRIA 1MZ5A 3PG0A 4I0YA 4FPYA 4UW4A 31BIA 1V6XA 2JD4A 3ZC8A 3UJQA 1Q56A 2GNTA 1FX5A 3O0VA 2D3PA 4IHZA 4DRRA 3B9UA 4ASMB 2WJSA 1QOTA 1V6VA 3WG1A 4I4XA 3WG3A 1XYFA 3M2MA 3RG0A 3I8TA 2GMEA 4K20A 1V6LA 4XJ8A 4Y1UA 3WHTA 2IWTB 4XJ9A 1FQ9A 2A71A 3IPVB 1FATA 2ZGNA 1AXMA 4A7ZA 8I1BA 2FDBM 5KXCA 3O44A 2V73A 3ILFA 2Y9WC 3A22A 4LO3C 2AR6A 1HCDA 3USUA 1G86A 3VKFC 1ISVA 1DQ4A 2DS0A 1Q8OA 2OW4A 2EIGA 3AP7A 1HQLA 4WZFA 3SNMA 2A6WA 3O4DA 4FP2A 4FPOB 3F1RA 1H9WA 2ZAAA 1SLIA 4AVVA 4QD2C 5DG2A 5BXSA 2A6YA 9ILBA 5JOXA 4W65A 1GKBA 5BP5A 1EYLA 5HCAA 2RQ9A 1Z2VA 4FGFA 3R4SA 4OUJA 4KEIA 4AVSA 5CA6A 5DUWA 3AJYA 3FJ9A 1URXA 3O4BA 1WBLA 4X39A 2ARBA 1I3HA 1WBAA 4X38A 1GZCA 1IILA 1LOFC 1E0OA 3IAGC 3T2TA 4FOYA 5EC5A 5DUYA 1JN2P 1CONA 1LULA 4GWMA 4WVVA 3N0KA 4QD2B 1GSLA 3QYDA 1SACA 3O4OA 1VCLA 1MS9A 5SV8A 3OPZA 3FGMA 4YFZA 5GJ6A 2CTVA 3ZXDA 4GOVA 3OYWB 2RSTA 3O4AA 1JHNA 3AP9A 2KM2A 1BLAA 3CA3A 5T5OA 1CPMA 4TYSA 4FPKA 2WT0A 1AVAC 4YGBA 4LBKA 2FMDA 4JCKA 1LOEA 1BXHA 4Z8SB 2CL2A 2HWMA 1BZWA 4I4PA 4U2AA 1Q8SA 2AREA 3JRRA 1WW7A 1QKQA 4FOVA 4ZKTB 1DFQA 1MS1A 4RA0A 4GP3A 2DV9A 1KDKA 3ZSJA 1PUUB 2PHFA 41BIA 2F2FA 3AK0A 1QOOA 4I7IA 4YM0A 4G6MA 4XXAA 1MS5A 1DZDA 4DEPA 3DGTA 5LK5A 4XHXA 2AGSA 1BFBA 3BRGC 4XFUA 4P9YA 4X3AA 4TLPA 1WLWA 2D3SA 3BADA 1TP0A 21BIA 1S0BA 1N47A 3V0BA 1VAVA 1G9FA 1TFMB 3VT0A 2GN7A 1AXZA 2E7QA 3BAOA 1HWOB 4JPZA 3HN1A 1IT0A 3AYDA 4H55A 3WDYA 1DYKA 2DU1A 1HWPB 1LECA 1ULFA 2KI6B 1FV3A 3FLTA 1DZCA 1G7YA 1SLTA 1NXD1 1V6MA 4SLIA 1MR5A 2EXKA 3CA1A 2D22A 1N1TA 3FLPA 4ZGRB 1RZOB 2ARXA 5T5JA 3RS6A 1LOCA 2AXMA 3EF2A 2UWAA 3LSEA 2ZGUA 5JVVA 4USOA 3I29B 3WUCA 3W58A 3WMVA 2ZQOA 2NZ9A 5CBLA 4YZ2A 2E6VA 3RSJA 3FJ8A 3AZXA 5KXBA 2ZHLA 5GLUA 4BMEA 4FPCA 1PC8B 4YM3A 3WUDA 2Y9FA 3H6QA 2VH9A 4LO0C 5G00A 1IS4A 3WZ1A 3RMXA 4KBBA 3WO3A 5BQUA 2YUGA 3WA1A 2D6MA 4TZDA 1XHBA 3OJ2A 4YW2A 5BP5C 2SBAA 3USUB 2UU8A 2A70A 4ISRA 2FFUA 4LO2A 4Q26A 3AP6A 4GP0A 3ZXGA 5D63A 5DVHA 3UD9A 1Q8VA 4GAFA 4II0A 1MACA 3D4KA 1QU0A 5JDBA 1W6PA 2W52A 2C5DA 3POSA 4ISQA 3VSZA 2NMNA 3ZSKA 3N7MA 2PHXA 3HOMA 1JT7A 4ZOTA 5DZFA 2R0FA 1LJ7A 3NV4A 1H30A 2D7IA 4XMIA 2LIQA 4MYEA 1FWVA 4I8MA 1WD3A 2VU9A 4LO3A 5D61A 3BAVA 4JC1A 1W0PA 3HR9A 3AFKA 1CIWA 2NM1A 2VSAA 1G9CA 3NBNA 4M00A 3MW3A 1EPWA 2W08A 4YZ5A 1A3KA 2BQPA 2D6NA 4P9WA 1DLLA 2DVDA 1DFCA 4XBQA 1V00A 1N3OA 1AZDA 1HWNB 1LGNA 2K43A 2MLLB 1TWEA 5DZGA 1YO8A 2P3IA 2F2FC 4PBPA 3B3QE 4DS0A 2AH2A 3CA5A 3VUOA 3A0NA 4DPNA 3N3HA 7I1BA 4OWLA 5KXDA 5IK8A 1U0AA 2C9AA 1LOFA 4M01A 3NBEA 2ZGQA 2D24A 1Q1UA 2ZHKA 3SH3A 5IK7A 2ZKNA 1LODA 3ZPYA 4G9NA 3VV1A 1YIFA 2A3XA 3MW4A 2E7TA 4QALA 5FREA 4OEEA 5EXOA 1P63A 5GLWA 1IKQA 3O4CA 3VT2A 3IM6A 3OBRA 1N1YA 1G9DA 4EKXB 1NZKA 4OWKA 3OJMA 4LO8B 3FFZA 3WMUA 1BLDA 5DSSB 4IYBA 1QXMA 1WD4A 1R1ZA 3V0BB 4EEEB 2D23A 3LLPA 4DFSA 3B01A 4BQ1A 2ZMLA 2NVHA 1ULCA 4DRVA 4PCRA 1WCSA 2P37A 3CA0A 2GO2A 2XB6C 1WUVA 2ZQNA 4I4YA 2GNDA 2EXJA 1KJLA 2PHUA 3IMNA 5DXDA 1SLBA 4XJUA 3L2YA 4D0ZA 3OJVA 3Q7XA 1UZZA 2EXIA 1VALA 1DIWA 2FHRA 1V6NA 1QNWA 4WVWA 5F8SA 3VKLA 3FJJA 5E8AA 1OQLB 3N35A 5GZFA 1CQ9A 4YW4A 2Y9XE 1YF8B 1LEMA 3UJOA 1Y7BA 3CU1B 1FWUA 2DVAA 1X50A 4LO1C 1HLCA 3RTIB 3WCSA 2VSEA 2KKIA 3WG2A 1RINA 3KMVA 2D6KA 1UL9A 3V65A 1PZ8A 4XFTA 4LO2C 3FBYA 4I30A 1JW6A 3WLUA 5IK4A 2GNBA 4Q9PA 1JYIA 1N1SA 1LHUA 4Q9GA 4AWDA 1SBFA 3BOPA 4XXPA 1LGBA 4D0TA 2Z42A 4FPJA 1WLDA 2ZZJA 4Y1ZA 1MD6A 3BIWE 1DQ6A 4XOGA 2AAIB 2TEPA 1A8DA 4XDQA 5GM0A 2NN8A 1QF3A 3DUIA 4J2XA 5EYYA 3PMEA 3FJDA 3POYA 4PC4A 1JXNA 5FZUA 4JKQA 4LO7C 4QC4A 2ZGOA 2DURA 1IHKA 1CE7B 3UJ4A 1W6PB 3VKMA 4AN7B 1GICA 4WBCA 4K1YA 2DTWA 3ILAA 2IHOA 4J2KA 1BKZA 3MALA 4Z9WB 4LO0A 5BYNA 3VKOA 1IRAX 3C9ZA 2EALA 2R1BA 3ZYRA 1T9FA 3BRDA 5F90A 1IS3A 2ZGLA 4UW3A 3AH4A 4LO7B 1V6JA 2AYHA 1AXYA 3BAUA 1LCLA 3GNEA 5JOYA 4IONA 3QCWA 4YLZA 3A4UA 2I2SA 4JRAA 3F62B 1JLXA 5H9QA 3PVNA 1A78A 1Z0HA 1QDCA 2ZGRA 2ZACA 3VSFA 3AJZA 1TEIA 4WV8A 1ZM1A 4RL7A 4XIOA 2R9KB 3MW2A 5F8YA 3AXDA 1KJRA 1LU2A 2P3KA 4BM8A 1PZ9A 4K21A 1Q8QA 1DZQA 3AH1A 1KQRA 1G9BA 1D2SA 1KNMA 1BYHA 4BOWA 2CWMA 3A21A 3RRDA 3ATGA 3TB0A 1CR7A 3FJHA 1Q04A 2NP0A 4KEKA 1ISXA 2DVBA 1FGAA 4BLJA 1BQPA 5GAQA 1S0LA 4A7KA 3O0XA 3JUUA 5IK5A 2DREA 4QKSA 3RTJB 2OUJA 1CN1A 4F83A 3WDTA 3I2AA 3NBDA 1V6IA 4LBOA 1QDOA 4XTMA 2R0HA 5H9RA 3T1LA 4M3CA 1ENQA 3O5SA 3K1XA 1JOJA 3MPPG 1JTCA 5T55A 3ZC9A 1YBIA 1APNA 1SR4C 5DG1A 4YG6A 1DQGA 4KC3A 1II4A 3LSDA 3H6RA 4ATEA 3T8SA 2H0BA 3P6IA 6I1BA 5KXEA 1QQKA 3ZXKA 4UW5A 2DUOA 1JT4A 4H9WA 2ENRA 4I2SA 4XJWA 5DUUA 4Q91A 2YROA 2P34A 2WT1A 1MVQA 1UKGA 3WV6A 1LHNA 5DZUA 1ISZA 1TTUA 2FFVA 3WINA 4IY8A 3LTQA 2F8XC 4BPZA 2MC2A 5FRAA 4X37A 4YZ1A 4YFWA 1AVXB 1SBDA 1F31A 3IIRA 3HALA 1C4RA 1ULEA 2D43A 4FPGA 1DJSB 1RITA 1UMZA 1GZ9A 3WCRA 1DQ0A 2ZGMA 1Z78A 1S1AA 3IM0A 4FQZA 2JE7A 1FNYA 1DQOA 4R9CA 4M3CE 1AVWB 4YM1A 2D20A 1UN1A 1YYNA 5CAZA 3AJ5A 4YW1A 4AGGA 1W6MA 5EG6C 4YZ4A 1EVTA 3NV2A 3POWA 1PZ7A 4I4OA 1S0GA 2EXHA 5BXRA 3AKHA 1T4QA 3WDVA 1LOGA 2WKKA 2Q5TA 4LO1A 2GDFA 2QYIB 3JU9A 1W3FA 4Y1YA 4Y24A 3M3EA 3AYAA 2ET2A 2GZBA 1SFYA 3VKNA 3U4XA 2UURA 3INAA 3JUTA 2WNEA 3PVOA 1KDMA 5IT6A 2VW2A 2YXSA 3N7LA 1V6UA 1ENRA 1S0DA 1FMZA 4LBMA 3NJ5A 4AGRA 3S8JA 3WDWA 4Q27A 4I6IA 5T5PA 2W68A 4YG3A 2EF6A 3IPVA 3UL2A 4OW4A 2JJ6A 4ZBVB 4P0JA 1BASA 1S0CA 1C1LA 2FGFA 1S0IA 5I1BA 1XZZA 1UPSA 3QLQA 3BB2A 2VW1A 2UWBA 3ZX7A 2ERFA 1DQ1A 3H6SE 4Y22A 2ZGKA 1BJQA 2Q3NB 4XBLA 1AX1A 2YMZA 5B2HA 3FJFA 4IZXA 1W6OA 5GALA 2XG3A 3FJKA 4LBNA 2VXTI 1MC9A 2ERMA 1Q8PA 4OEFA 2VXRA 3B9CA 3FJCA 1DBNA 4XTPA 1GBGA 2OVUA 4G6JA 1SCSA 4GKXA 4XE9A 3ZXEA 3D7WB 4K1ZA 2ZBJA 2WQZC 2JKBA 4ZFUB 3CRHA 5H9SA 1RMLA 1PUMB 2PHWA 4YG0A 5DZEA 4DENA 3HMYA 1AX0A 1S0FA 3NWKA 4G9MA 1YRZA 3AX4A 1RG8A 3WDUA 1LHOA 4M3CB 4R9AA 2LALA 1S0JA 3IM7A 3W9TA 1HQWA 4Y20A 1GYKA 1V6KA 1WBFA 2GMPA 3WINC 4GA9A 2JE9A 2ZGSA 2PELA 2VLCA 4I4SA 1J1TA 3H6RB 3AXEA 4Y1VA 2PHRA 1AX2A 3O0WA 1V6WA 1JT3A 2A6VA 3AZZA 5FZZA 1LTEA 2D3RA 4XBNA 5E89A 3AYEA 5GZEA 3O3QA 4G1RA 1K5VA 1B09A 1GLHA 2A75A 1WW4A 4R9DA 3ZSMA 5E24E 1I1EA 3CA6A 1ULDA 1BFCA 3AJ6A 3PUBA 4XMAA 3CRGA 4XFSA 2UUSA 1SR4A 4FPLA 2Z48A 1YXWA 2EAKA 1HCEA 4I1BA 1UZYA 1MS3A 5F5QA 3BAGA 2YZ4A 2D44A 5HCFA 4NO4A 5HCBA 3D6EA 1BFFA 2KI4A 2WRYA 3O12A 1PWAA 4QO3A 1LEDA 1FAYA 2DWRA 2VW0A 1MS0A 4LBQA 5T52A 1DGLA 5GLTA 1W6MB 4DCKC 3V79C 3R05A 3PHZA 3Q7YA 2D6OX 2E4MA 2HW9A 1ZA4A 3OY8A 1R8OA 5IUQA 5BXTA 1TOOA 4KEJA 3C2UA 2A7AA 3M1HA 1FN0A 2K8RA 2WLQA 4J2SA 3FUQA 1LHWA 2WSVA 4FPFA 1V6OA 1HWMB 4R6UB 1J0SA 3WO4A 2M49A 2P2KA 5H9PA 2D7RA 2DUQA 1W6NA 1BA7A 2AQZA 2WT2A 4FVVA 3WOGA 3ZXJA 1GNZA 1OFSA 5JLVA 3WDXA 3ZYPA 3OGGA 2G4IA 1EV2A 2WBCA 4U36A 4Q8KA 4PBOA 5GZCA 3BODA 1IS5A 1YI7A 4C1XA 4I96A 1AVUA 2Z49A 4EFRA 1LU1A 4EFPA 3WNXA 3SH4A 1HDKA 2ZABA 4F34A 1FV2A 2ZHNA 3HBWA 1SLLA 4XHBA 1WW6A 2DUPA 1ILR1 2L5XA 2WSUA 3GALA 2AUYA 3OBTA 2D1ZA 1IOBA 1LOAA 1IKPA 2NTDA 1WBCA 1UX6A 1M16A 2P3JA 4Y22B 1O4YA 3BA7A 1G82A 1ABRB 1QGLA 3ASIA 3IM5A 1W6OB 1JBCA 4XYXA 1IJTA 1CVSA 1MVEA 4NOTA 3VWCA 2CYFA 3A0KA 1SCRA 1JQZA 1W3GA 4YW3A 2RG9B 3N7KA 4Q8LA 4FOQA 4GXLA 1PZZA 2J3PA 4J2YA 2D7FA 3M3CA 3CQAA 2ZA9A 2PHTA 1DYPA 4OWJA 3V0AA 1S0EA 4YGCA 3PVEA 1AF9A 3AZWA 1Q03A 2Q9XA 3A23A 3Q9OA 5FNXA 5BVPI 2AENA 3AYCA 2XOAA 4PF5A 5FZYA 4GWNA 3BTAA 1BFGA 1HIBA 2YY1A 3OGFA 2SLIA 1G8WA 2P23A 3ILRA 5EYXA 4Y20B 3N36A 4L4IA 2D6PA 1FNZA 1C57A 4BLIA 2R1DA 4YZ3A 1BARA 1ENSA 1CJPA 4FPEA 2HZ9A 4YGEA 3SNVA 1KRIA 1MS8A 1AFCA 2RHPA 3UD7A 3POKA 4ZA3B 2X2TA 5F9TA 1OQ1A 4Z8BA 3SLIA 5E88A 2KLLA 2CY6A 4Y1XA 1JUIA 4J23B 2D6LX 4I4QA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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