3N7MA

Crystal structure of w1252a mutant of hcr d/c vpi 5995
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
422
structure length
418
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNTGLITNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYAFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Identification of a Unique Ganglioside Binding Loop within Botulinum Neurotoxins C and D-SA .
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords Neurotoxin
total genus 94
structure length 418
sequence length 422
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3n7mA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3n7mA02
2CYFA 1LHNA 2YXSA 2A6WA 2WNEA 1BYHA 5BXRA 5H9SA 2G4IA 4YW1A 2Q5TA 1T4QA 1LECA 2VSAA 1W6OA 4UW4A 1ULFA 5GZGA 4Q2FA 2R1DA 1UN1A 3RMXA 4EFRA 4Q9PA 1V6MA 3I4IA 3I2XA 1KITA 2I1BA 1K5VA 1DBNA 5T54A 4M3CA 2LIEA 1W6OB 1GZ9A 1JN2P 2ZAAA 1O4ZA 5DUYA 2ZABA 3WHUA 2NP0A 3POSA 2VXRA 2VW1A 4XJ8A 3WUDA 4ENDA 3M3CA 4FPLA 4PCRA 4JKXB 1BFBA 4EEEB 4BPZA 2JE9A 1QOTA 2NMOA 4M3CB 2PHFA 2D3RA 4I4SA 1TWMA 3LCPA 5EXOA 4IY8A 1P63A 3UJ0A 4XJWA 4XTPA 2ARBA 3HN1A 2E4MC 5DUVA 3VEQA 2TEPA 1QOOA 1RG8A 3P6IA 3IKWA 4LBQD 4AN7B 4I1EA 5GLVA 3WG1A 5D62A 1D0HA 3O4BA 1O4YA 3CRGA 1JBCA 3OGFA 1DYPA 5KXCA 3PVNA 4HJJA 1GKBA 2YV8A 1AX1A 1AX0A 3CQAA 1ISXA 4GOYA 4XFUA 5EG6C 2P23A 2JKBA 1WW5A 1W6MA 4ZXKA 4ZOTA 1M16A 4IZEA 1AX2A 1PZ9A 5IK4A 2VLCA 4Q26A 1W3GA 3H6RA 1CR7A 3A23A 4U2AA 2WT0A 2ZZJA 2DU1A 5IUQA 4XBNA 4FPJA 2FFVA 1W6MB 3ZSKA 3WZ1A 4QKSA 5DVHA 2P3KA 3ILRA 5F90A 4R9DA 1GZWA 1GNZA 2PELA 3H6RB 4OWLA 4GAFA 2DVAA 2GN3A 1LGNA 2GDFA 4A7YA 1HKDA 4Y1YA 5LK5A 1H9PA 1GZWB 1S0FA 4P14A 1GV9A 2D24A 1LOGA 4AYUA 3ZXLA 3CA4A 4IQPA 2EAKA 3H6SE 4JP0A 4XE9A 1TTUA 3P6JA 1AJOA 2VW0A 4D69A 3L2YA 4DS0A 1RIRA 1JT5A 3FUQA 2ZHLA 1WW7A 4XDQA 2A71A 2R16A 1PWAA 3AKIA 1HDKA 3FJBA 3CNAA 3EF2A 4C1XA 1LULA 4YG6A 3DGTA 1T9FA 5DUUA 3VT1A 2P39A 2D6MA 2A3WA 1G86A 2ZHNA 1HIBA 1SZ6B 5E88A 1SBEA 3BAOA 4I4XA 1PZ7A 1W0PA 3M3OA 3BTAA 4KEIA 2UWAA 2HYKA 4J2XA 1HKNA 5JDBA 5EC5A 2GO2A 3FJAA 1WD3A 3O5WB 2A7AA 5CBLA 1AVXB 4EFPA 2ZGKA 3INAA 2GMPA 1BLDA 3ZXKA 3LTQA 1OKQA 3F62B 1QDCA 2AREA 4PBPA 2E7QA 1Q8QA 1W3FA 4QBCA 2FDBM 1DQ4A 1SFYA 3JUTA 3VT0A 1Q1UA 4XJ9A 3FLTA 4P0JA 2DUPA 2XB6C 3WO3A 2NVHA 4D0TA 4M3CF 3B3QE 5BP5A 2DVGA 1GGPB 4LO7C 1ISVA 4Y26A 3ZXJA 1J1TA 5IK8A 4OUJA 4YGEA 4LBKA 1MS9A 5HCBA 2D7IA 3HBWA 4YM3A 4JC1A 21BIA 3W9TA 4GXLA 3RTJB 3MALA 1YXWA 3M2MA 4BMEA 4JRAA 1W6PA 3N35A 3AZWA 2A3XA 3D6EA 3QR5A 1SBFA 1W6QA 3N7KA 1TEIA 3IM5A 4J2YA 2OUJA 3AP7A 1B09A 3TB0A 3ZVXA 3I2AA 2DRYA 5EHAA 1Q04A 1S1AA 3VKLA 3SH5A 2YUGA 2D23A 3ZXEA 5CNAA 1VAVA 2ZACA 1MC9A 3ENRA 1PUMB 1SLAA 3USUB 4FQZA 1YF8B 4XBQA 1UMZA 1RITA 1WLDA 4IY9A 4I4PA 1JYCA 4YM2A 3R4UA 1ABRB 1SLCA 4NO4A 5BP5C 2ZGNA 1MZ5A 1QQKA 1Q03A 4YZ5A 2IWTB 3IN9A 2FO1A 3WDTA 3JU9A 3N7MA 2UWBA 1IT0A 2CL2A 4GA9A 1BQPA 2F8XC 3DUIA 1QNWA 3AH4A 5HPZA 1W3AA 2ET2A 1WLWA 2DREA 7I1BA 1LODA 1Z0HA 2FHRA 3A07A 2I2SA 1DHKB 1XG6A 2XOAA 1SCSA 2YZ4A 1IS4A 4KBBA 1TP0A 3O44A 5CA6A 1CE7B 2W08A 4HR6C 4G6MA 4Q8KA 2F2FA 4OW4A 2JJ6A 2W68A 2JE7A 4FOVA 3BAQA 2ESUA 1V6UA 1AVUA 1PZZA 3O3QA 1MS8A 1N3OA 2P37A 1MR5A 2EIGA 1URXA 4P9WA 3MW2A 2CWSA 5EYXA 3ASIA 5I1BA 2AGSA 3Q9OA 1WW4A 3N7JA 5EWSA 2AENA 2EXKA 4CRQA 4YZ3A 1JW6A 2AR6A 5BXPA 4XHXA 1AXKA 4HL0A 3VKMA 3FGMA 1D2SA 3NBDA 3AYEA 4YW3A 4GP3A 4I4RA 5GJ6A 1CONA 1PUUB 4QO3A 1H9WA 2DUQA 1DQGA 1BXHA 1OQ1A 4USOA 4DRRA 1G7YA 2JECA 4YW5A 3OYWB 1JT7A 4BQ1A 5F5QA 4ZLBB 3P53A 3POKA 3AKFA 1RY7A 4LO8B 4LBNA 2NM1A 3RQ0A 1C57A 1SR4A 5FNWA 2Y9XE 2VW2A 2EXJA 2F2FC 1W6NB 3NJ5A 1N3PA 1AXZA 1LEMA 3GNEA 3OJ2A 2E4MA 1SACA 1FMMS 1GICA 5H9QA 1ULEA 3R05A 5CB7A 1IS6A 4ATFA 1AJKA 5G00A 4W65A 3WG3A 2AH2A 1RZOB 2WKKA 4X3AA 3HALA 3BRGC 3AZXA 1FYUA 2HW9A 3FJ9A 3WO2A 4EFQA 4Y20A 2Z48A 3TAYA 3JRRA 3AJ6A 1DLLA 1QMJA 4F34A 5B2HA 4FOYA 2V73A 3CAHA 2D20A 4FPOB 3AFKA 2GNBA 2CTVA 1JLXA 3K1XA 1AXYA 4XXAA 5EYYA 2R0HA 3FJCA 1HWNB 3O0XA 4Y20B 2GMEA 3AZZA 4I30A 2JD4A 2E6VA 4DRVA 1S0JA 4GAIA 4AGRA 1HQWA 2ZGUA 1MS0A 1KDMA 5DSSB 3FJDA 2PHXA 4I4QA 3UDAA 3H0OA 3BX1C 2LTNA 2KLLA 2AYHA 4ZFWB 1SR4C 3WG4A 3D4KA 1VAMA 1FWUA 4WBCA 3FJKA 2D6LX 3WDWA 1LEDA 4WZFA 2EALA 1V6NA 1JLYA 5L73A 3SNMA 4IYBA 3ZYRA 1LOFA 1LOCA 2ZGPA 5FZUA 1MS4A 1DQOA 1QU0A 1BLAA 1DQ6A 3BA5A 4ISQA 1TWEA 1R8OA 3MPPG 2A6ZA 4BLIA 3Q7XA 2ZHKA 4AVVA 4X39A 5T5JA 1CQ9A 3FJEA 4D0ZA 1IHKA 3V79C 3T1LA 1CPNA 5H9PA 4A7KA 4G9MA 4FQ4A 3R4SA 5F8WA 3WVJA 2AXMA 3ZC8A 2WBCA 2WT1A 1QKQA 4LO1A 4OWKA 2W39A 1WBAA 5IK5A 1ULDA 2ZGOA 4WVWA 2WRYA 1LENA 4Z9WB 1MD6A 1HCEA 3B00A 2ZMKA 3A4UA 2P2KA 3WUCA 2GALA 5KXDA 3O0WA 4YFZA 3C9ZA 4II0A 4QD2C 3CA5A 4BLJA 3AKGA 5E89A 1NUNA 3QCWA 31BIA 3PMEA 3VV1A 4XJUA 1YBIA 1AVWB 3FJJA 1ENQA 4DEPA 4BM8A 4SLIA 3ZC9A 3OJVA 3RS6A 1MS5A 3E8LC 2DRZA 1AVAC 2Y9GA 3AYAA 1LOFC 4Q27A 5T50A 3F1RA 1VALA 2RSTA 3NWKA 1I1BA 4P9XA 3BAVA 1N1SA 3O4CA 5GZDA 5SV8A 3OJMA 3VUOA 3ILAA 2NTDA 3V64A 2SBAA 4LBOA 1I3HA 2KH2A 4RL7A 3SH3A 2ENRA 1HWMB 1BJQA 4LO1C 3BB2A 3N0KA 3A0NA 1R8NA 2P3IA 1JUIA 2YMZA 1GLHA 1LU1A 1ULCA 2D6PA 3HR9A 1II4A 1SLLA 3BOPA 4YW2A 4LO7B 3AZVA 3OBTA 2ZGTA 4YZ1A 3H6QA 4XXPA 1WBCA 4L4IA 5T5PA 3W58A 4I7IA 4PC4A 4FP2A 5GAQA 1BKZA 3VSZA 4OEEA 4L4HA 2DUOA 4DFSA 4JKQA 2C5DA 4FPEA 5FZYA 1DZQA 5GLUA 1IRAX 1YIFA 3O0VA 3FJHA 2L5XA 5GZCA 2EXIA 1XYFA 4R6UB 3O4DA 5T52A 4C1WA 2ZMNA 3AH2A 3WG2A 4D8HA 4Y1XA 4G6JA 2D7RA 4X37A 1BA7A 1FQ9A 3MW4A 3ILNA 5DUXA 1Q8OA 5BXSA 3WDYA 3RSJA 1CVSA 2NYYA 3ZSMA 1RINA 4Q9GA 1EV2A 5T5LA 3WDUA 4I0YA 4JPZA 2A6YA 1ZM1A 1HCDA 4NOTA 2WJSA 5T5OA 4USPA 4FOWA 4HANA 3O4OA 2RQ9A 3V0AA 1TFMB 3UK9A 2ZA9A 4YGBA 5E8AA 1JT4A 1IS5A 4ZKTB 1FV3A 1N1YA 1G9AA 3D7WB 5JOXA 1LESA 3RRDA 1LTEA 1OFSA 3ZPYA 3BRFA 5GM0A 1YYNA 3UD9A 4UW5A 3JUUA 3AXDA 1W6PB 1JTCA 3CA1A 4XMAA 2DYCA 3O4AA 4M01A 1W6QB 1DQ1A 4UW3A 4CZSA 2DVBA 1LOAA 4P6AA 3WINA 1V6OA 2XG3A 1PC8B 2D6NA 3AJZA 1J0SA 2DS0A 5F9TA 4GALA 4ZA3B 1WUVA 4G9NA 3BA7A 3UJQA 1LHOA 3IM6A 2OUHA 1Y7BA 3IAGC 1BARA 4Z8SB 2ZHMA 5HCFA 5IK7A 4LO2A 4FPGA 4AGGA 1FN0A 1DZDA 4P0KA 4LBJA 1BASA 1MVEA 3AKHA 2HZ9A 1SBDA 2D7FA 4YM1A 3HSMA 4LBQA 3B01A 5HCAA 1DYKA 2E51A 4I96A 5FNXA 1F31A 3FUOA 1QNYA 1QDOA 2H0BA 3VKOA 2D6OX 3VWCA 2QYIB 3OY8A 3SH4A 4I4YA 3UJ4A 4LBQB 4YW4A 4ASMB 3LLPA 3QYDA 4XJZA 5F8YA 3NBEA 3ATGA 3ZYPA 1S0GA 1V6VA 5BQUA 4YGDA 1C4RA 3AP6A 3WINC 5GZFA 1S0LA 6I1BA 5FREA 1E0OA 1S0CA 4FPYA 2DVFA 3UD7A 4I4VA 4ZGRB 3QLQA 2BEBA 2WSUA 3POWA 4KEKA 1LJ7A 3RG0A 1EYLA 4TYSA 2PHUA 2DVDA 4R9BA 5KXBA 2OVUA 2MC2A 4LO2C 4Y24A 1FATA 3WMUA 1QF3A 2ZMLA 5DZEA 3AH1A 4I6IA 4H9WA 3AP9A 3S8KA 3SITA 2NMNA 4YFWA 3WOGA 4GP0A 4DENA 3N7LA 1HLCA 2AQZA 1WD4A 2R9KB 4OZXA 2HWMA 4LO0A 5DXDA 1M2TB 2M49A 1Q56A 1SLTA 1MACA 2PHWA 3N3HA 4I2SA 3CRHA 4GKXA 3B69A 2AFGA 2NZ9A 1FX5A 1BFGA 1HQLA 1BZWA 2ZR1B 1IKQA 3NV3A 5BXTA 5GLZA 4XYXA 4R9AA 4RA0A 3FJ8A 4J2SA 3WCRA 5BQUC 1G9FA 2V5YA 1IJTA 3WMVA 3AJYA 3AJ5A 1UZYA 1ONKB 1DIWA 4WV8A 1U0AA 3OJBA 3WCSA 4PBOA 2WLQA 3BIWE 2VY0A 4QC4A 5DG1A 3IIRA 4ATEA 2A5ZA 3FLPA 4K1YA 3GALA 3V65A 2DWRA 1FGAA 3FFZA 4Y22A 4FPCA 4XIOA 5DZGA 4YM0A 1UZZA 3A21A 1Z4SA 3UJOA 4A7ZA 3IM0A 1GANA 2BEAA 2WSVA 4I4UA 2GNDA 1UKGA 2PHRA 3OPZA 1F5FA 2ERMA 2VU9A 1GNHA 3CU1B 4R9CA 4Y22B 4LO0C 3M1HA 4XBLA 3MW3A 2FGFA 2D22A 1Q8SA 1ULGA 5BOWA 4AVTA 1LGCA 1WW6A 3TC2A 3IM7A 1NXD1 5AVAA 1CN1A 3VKNA 3ZXGA 5JVVA 1BFCA 4MYEA 1IOAA 1QXMA 1X50A 4LBLA 1ILR1 1G8WA 3MEPA 1UPSA 5BYNA 1V00A 4XHBA 5CAZA 2PHTA 2GMMA 4I3NA 1N1VA 4I8MA 4CTEA 1WCSA 5FRAA 3B9UA 4P9YA 1PZ8A 4QD2B 3A0KA 4JAWA 1APNA 4K20A 1A3KA 4FPFA 1NZKA 3BA4A 1IKPA 2R0FA 4DPNA 1HWPB 2UWCA 2GNTA 4OEFA 1S0IA 4XIKA 2ZGLA 2W52A 5JOYA 3ZSLA 1OQLB 1V6XA 1MZ6A 3WDVA 4JCKA 1AVBA 4UW6A 4LBMA 1DQ5A 5GLWA 2VXTI 4ZFYB 2D44A 3T8SA 4DQAA 3PUBA 2ZGSA 2ES3A 4FPKA 3SISA 4AGVA 3O49A 3FJFA 1N4KA 5JMCA 2KKIA 4J23B 1CVNA 3AX4A 4KC3A 3O5SA 1Q8PA 1FAYA 3AP5A 2DTYA 3LSDA 3NV2A 1GZCA 2UURA 3VKFC 4EB2B 2VUAA 2A70A 1V6LA 3WO4A 4QKRA 4FP3A 4XJAA 1NLSA 1G9DA 1JQZA 2YY1A 4EKXB 1QQLA 5GALA 4M3CE 2ZQOA 1XQNA 4Z8BA 2DURA 2D1ZA 4BMBA 1HWOB 3AZYA 3FLRA 4YGCA 1ITBA 2K8RA 4ZFUB 3T1MA 2R1BA 5DZUA 2DTWA 2ZGMA 4GKYA 1YTOA 1QGLA 1V6IA 1VLNA 4G1RA 1DFQA 4ITCA 4XOGA 2GNMA 4FGFA 4XFTA 4XMIA 1IS3A 4AWDA 4FOQA 2Y9FA 2JDZA 4YZ2A 2IHOA 5DZFA 3PJQA 4GWMA 1ISZA 5KXEA 4CJMA 3PG0A 2SLIA 3KMVA 1JHNA 3APBA 4XILA 2Q9XA 1GSLA 5T55A 2DV9A 1KNMA 1FV2A 4YZ4A 1LU2A 2A75A 3NV1A 2Z42A 1IILA 1YO8A 2ZGRA 2KI6B 1JT3A 1WLCA 4TZDA 2C9AA 3ILFA 4Q1RA 2HWAA 1UX6A 3RMYA 4YG3A 3O12A 4AN6A 2UU8A 1EPWA 1V6JA 4J2KA 3ZX7A 2A3YA 2ZBJA 2A6XA 3N36A 3BAGA 2BQPA 2FMDA 3BAHA 2B7YA 1N1TA 1JY0A 4Y1UA 2BFHA 1IRPA 3M3EA 3WLUA 1K5UA 3A22A 3Q7YA 1C1LA 4Q1PA 3AYDA 1YRZA 4YLZA 1UL9A 4YOLA 3SNVA 1G9CA 1G9BA 1DQ2A 1Z78A 3AK0A 4Q91A 3PVOA 1CESA 3CA6A 4I37A 3OBRA 4M00A 5JOZA 2ARXA 1IOBA 5BVPI 2LIQA 1S0EA 4Q8LA 1ENSA 2K4AB 3VSFA 2P34A 4Y1ZA 1RMLA 4Y1VA 2K43A 4KEJA 5FZZA 5E24E 4GWNA 3FBYA 1YI7A 3SLIA 1SLBA 41BIA 2YROA 1MVQA 3IMNA 1KJLA 4X38A 2EXHA 3T2TA 5D63A 2UUSA 2CNAA 1TIEA 2AAIB 3M3QA 4ZBVB 4FPHA 2D6KA 1XHBA 4K21A 2MLLB 2Y9WC 3I8TA 2GZBA 3Q7WA 3BAUA 3HOMA 2NN8A 1AZDA 4LO3A 1UAIA 1Z2VA 1LOBA 4OEGA 3V0AB 4XTMA 1DQ0A 3RTIB 2MIBA 2QN4A 4F83A 3KM5A 2OW4A 1Q8VA 3ZXDA 4IZXA 3USUA 2D3SA 2KM2A 2X2TA 2EF6A 1VIWB 3NV4A 1KRIA 3CRIA 4H55A 4L8QA 4XKIA 4BOWA 1FMZA 1FNZA 4YG0A 3B9CA 4DCKC 1LGBA 3ZSJA 1L2HA 4I4OA 3U4XA 3UL2A 1EVTA 3ZXFA 4H04A 1CPMA 3BRDA 1DJSB 4AVSA 4FVVA 2CY6A 1R1ZA 4XZPA 5IT6A 4IHZA 3S8JA 3NBNA 3UD8A 1ISYA 4TLPA 1LOEA 3D5OA 1LHUA 1VCLA 2GN7A 2ZQNA 3NBCA 3IPVA 1ENRA 4QBVA 2D43A 2AUYA 1DFCA 1TOOA 1F9KA 2CWMA 3KQRA 4OWJA 4LO3C 1MS3A 5F8SA 1DGLA 2Z49A 1DZCA 3OY8B 3AXEA 1S0DA 1ONAA 5DUWA 3IPVB 2J3PA 1AFCA 5JLVA 1CJPA 4ISRA 4HA2A 3V0BA 9ILBA 3OGGA 4GOVA 2WT2A 4XFSA 1A78A 2WQZC 3VT2A 5JOWA 2KI4A 1WBLA 4JQ0A 2X2SA 1MS1A 2VSEA 3V0BB 2ZGQA 2ZKNA 3WNXA 2LALA 1V6WA 4P0LA 3FJIA 1JXNA 1C1FA 2P3JA 3BODA 3CA0A 2VH9A 1CIWA 1JOJA 1SCRA 1AF9A 3WA1A 5H9RA 1I1EA 1KQRA 3WV6A 4IONA 4PQ9A 3CA3A 1H30A 2DU0A 1FNYA 4WVVA 2D3PA 2R49A 3OYWA 2E53A 3PHZA 5GLTA 2RG9B 1LCLA 2RHPA 3BADA 1N3QA 3POYA 1LHVA 1BFFA 1W0OA 1FWVA 1ZA4A 1LHWA 3I29B 1JYIA 3C2UA 3PVEA 2FFUA 1S0BA 4QALA 1AXMA 1W6NA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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