3R4SA

Cell entry of botulinum neurotoxin type c is dependent upon interaction with two ganglioside molecules
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
428
structure length
424
Chain Sequence
SMANINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTGDSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
publication title The biological activity of botulinum neurotoxin type C is dependent upon novel types of ganglioside binding sites.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 94
structure length 424
sequence length 428
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3r4sA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3r4sA02
3AH4A 3BAHA 4KEIA 2EXKA 1A8DA 2I1BA 2CWSA 3IIRA 2E51A 4XHXA 3IPVB 2MLLB 1DZDA 3AH2A 5DSSB 2M49A 2PHUA 1FX5A 3OJMA 2WT2A 2J3PA 3MW2A 2AUYA 1MD6A 2YY1A 3WMUA 2ZMKA 1W6QA 2P37A 3AK0A 4LBOA 2D3RA 2X2SA 3NBNA 4A7KA 1KITA 1PZ9A 2D20A 4NOTA 4KEKA 3BRDA 2DREA 3PVEA 4ITCA 4Q2FA 4P9XA 1ISZA 2FGFA 1SACA 4X38A 1VAMA 1VALA 1W6PB 2FFUA 3AYDA 4K20A 4ENDA 2VUAA 1SZ6B 1GSLA 3ZSJA 1DLLA 4IYBA 4ZBVB 2DYCA 2E7TA 2WT1A 5FZUA 3FBYA 4FP2A 1WLCA 3V64A 3U4XA 3B3QE 1FN0A 4XIKA 1LOEA 4IZXA 2AR6A 2ERFA 2GZBA 2ZHNA 2WT0A 4I7IA 4LBNA 2A3YA 4KEJA 1HQLA 4DPNA 1VIWB 1GZ9A 1EVTA 3AJ6A 2E4MC 2UWAA 3ZXKA 1LTEA 4I4XA 4ZKTB 3UJ4A 4ZA3B 5BXRA 3WA1A 5IUQA 4CTEA 3D5OA 3BA5A 1UZZA 3T8SA 4AN7B 1DFCA 1QQKA 3M3OA 1LHOA 3RSJA 4WZFA 3AKIA 4L4HA 2YROA 2EIGA 2BFHA 2PHFA 3FLRA 2D7IA 2E53A 4U2AA 3VT1A 4CZSA 5JOZA 2HW9A 3OJVA 2LALA 1GANA 1II4A 3A22A 3JU9A 1W0OA 4XMAA 4J2KA 2EAKA 2JKBA 2NP0A 4Y1XA 2D24A 5EYYA 2ERMA 1I1BA 3N35A 4SLIA 2SLIA 4M3CA 4KC3A 1MZ6A 3I2XA 4AN6A 3SLIA 5F8WA 4JPZA 4XFSA 4YM0A 1H9WA 1LHNA 4FPGA 2GMEA 3NV1A 2Y9GA 4XBQA 3VKMA 2P39A 3V79C 4I4QA 4LO3A 3WO2A 4I37A 2XOAA 2DU1A 3H6RA 1P63A 1N4KA 4TLPA 3BOPA 4J2YA 2OVUA 5BXPA 4Q9PA 3OY8A 2R49A 1ZA4A 3O5SA 4DFSA 3AP4A 4OWJA 1XZZA 3ZXLA 1R8NA 3B9CA 5FNXA 1S0CA 4QBVA 1S0GA 1HWPB 3ILFA 2BQPA 3SITA 1W3AA 4FPJA 1BYHA 3O12A 1H9PA 2JE9A 1S0IA 4I1EA 2A6YA 1LCLA 1JHNA 2D22A 1V00A 4ISRA 2QN4A 4GP3A 3FGMA 4Y22A 3Q7YA 1JN2P 1SLAA 2NYYA 3BODA 3ASIA 1N1VA 1J0SA 2A70A 2GN3A 1W6OB 1T9FA 5DZGA 4Z8SB 1LODA 4M00A 4LO3C 1V6KA 1HWOB 1VAVA 4QO3A 1DQ0A 5GZEA 3WO3A 4XILA 4PQ9A 3R05A 4XXPA 4ZFWB 4Q26A 1HWMB 1IKPA 3M3QA 3W9TA 3BAGA 1H30A 5GM0A 1JW6A 5DXDA 1LOCA 5T55A 2D44A 3E8LC 2DRZA 4J2SA 2F2FA 3A07A 4YLZA 1LECA 2ZHLA 5H9SA 5AVAA 2FO1A 4OWKA 2ZGKA 1ULFA 1LOGA 5BOWA 4JRAA 4FPCA 4YM2A 2KH2A 1YXWA 5DUXA 3BTAA 2NN8A 4XZPA 2A6VA 1V6UA 1IRAX 3O5WB 5IK8A 1FYUA 2VSAA 3WHUA 2SBAA 3AP7A 3NV3A 1Z2VA 2DRYA 3B69A 8I1BA 7I1BA 3ZSMA 2AGSA 2X2TA 3RG0A 2ZGLA 3ZSLA 5KXCA 2K4AB 2CTVA 5F5QA 4Q91A 1GZCA 2ZGTA 2GO2A 4C1XA 2D6LX 1BLAA 2R1DA 4DRVA 1U0AA 1DZQA 3ZSKA 1GBGA 2AQZA 3A21A 3O49A 4I4VA 1B09A 3CA0A 2AXMA 1Y7BA 1BFBA 4USOA 4PF5A 4AYUA 3AX4A 5SV8A 3FUQA 4M3CF 5FNWA 3AYCA 2F2FC 1IHKA 3OPZA 3VKFC 3OYWA 4EFQA 3ILAA 2WBCA 1V6OA 4YG6A 1KJRA 4XJUA 4I96A 1FNYA 3M3EA 5D63A 2ZAAA 4ZLBB 5GLWA 4LO1C 3BAUA 3FJBA 1BFGA 4YM3A 3N7LA 2YV8A 4ZOTA 3WOGA 1ULGA 2ZMLA 2ZGMA 4P6AA 3INAA 1DZCA 1LGNA 3FJ8A 4XJWA 4AVVA 4LBQB 1BFCA 2RQ9A 3O0XA 3T2TA 3LSEA 1A78A 4BMEA 2CYFA 3QLQA 3I29B 5DUYA 1BQPA 4KBBA 3POYA 1DQOA 3ZXFA 3L2YA 1QOOA 2P34A 3HBWA 3VWCA 3PMEA 3AH1A 4CRQA 3OBTA 1YYNA 3USUB 2GNBA 4BM8A 4OW4A 2GMPA 2A6WA 1N1SA 4XXAA 2A7AA 4FPFA 3IPVA 2GMMA 4I4PA 4XTPA 4MYEA 1FWUA 1JLYA 1AJOA 1DQ6A 4ATEA 3MALA 2ZHMA 4FOQA 4XBNA 2VXTI 3UDAA 2Q9XA 5DG1A 3PG0A 4CJMA 3VT2A 3DGTA 2VW2A 1Q8OA 4XJZA 4D69A 4YG0A 2AYHA 2ZACA 4QD2B 3TC2A 5FZZA 4I4SA 3CA3A 3WG1A 3O4BA 1UN1A 5T5OA 4QKRA 4FOVA 5FREA 3T1MA 3NBCA 4Y20B 1DYPA 4XFUA 4IY8A 4X39A 3WHTA 2NM1A 2YMZA 4OWLA 1BFFA 2WNEA 4DRRA 1FQ9A 3TAYA 4XKIA 4L8QA 1JYCA 2GNMA 4Y1UA 2PELA 3PUBA 3O0VA 4P0JA 5E24E 4GWNA 3KQRA 4I4YA 3LSDA 3ZC8A 5E8AA 1CONA 1RG8A 2DTWA 2UU8A 1AVWB 1SBDA 3O3QA 1V6VA 1ISXA 4JCKA 1JLXA 4LO0A 1EPWA 4FP3A 3SH4A 1AX2A 3CA5A 1YIFA 2CNAA 3B9UA 1QNYA 3P53A 3P6IA 2W39A 2AENA 1ISWA 2MIBA 3OGFA 1D2SA 1BJQA 5LK5A 3I8TA 4I4OA 3N7MA 2KKIA 3KMVA 3ILNA 1J1TA 5T54A 4FPLA 1HLCA 1FV3A 3H6SE 1FGAA 1IILA 5BVPI 3R4UA 1S0DA 4Y1VA 3FJDA 1XHBA 1Q1UA 1TOOA 3MEPA 2ZGPA 1HKDA 1WUVA 3FJ9A 2KM2A 2ZQNA 2D1ZA 4XTMA 4IZEA 2UUSA 2D6KA 1WBFA 4AGVA 4OZXA 4GAFA 1WD3A 2ARBA 2LIEA 2R16A 2GALA 1KDMA 1SBEA 1BXHA 3HSMA 4I4UA 1FMMS 1Z0HA 1CVNA 2DWRA 1UKGA 1LESA 4UW5A 4R6UB 3VSFA 1UX6A 2E7QA 1MS3A 3ZXDA 1F5FA 4JQ0A 3BB2A 4AVTA 2ZGNA 2F8XC 1WW7A 2ZA9A 2DVGA 3O4CA 1Q8PA 4YM1A 1G86A 3CU1B 4XJ9A 3VUOA 3V0BB 2WJSA 5D62A 2VW0A 4I30A 2E6VA 4XOGA 4P0KA 3SNMA 2GN7A 1PUUB 2W52A 3SISA 3VT0A 4ZFUB 4Y1YA 3POWA 3D4KA 2R0HA 3WNXA 3RRDA 3UL2A 1PZZA 4P9YA 2OUHA 3N3HA 3WV6A 5T5JA 1L2HA 1WLWA 4Y24A 1RY7A 4GKXA 3IMNA 3P6JA 3N7KA 1S1AA 4I1BA 2JE7A 4YFWA 4Y1ZA 1W6QB 1PWAA 3M2MA 4G9MA 5FRAA 1N1YA 1NXD1 3C9ZA 1Z4SA 3WDUA 4EKXB 5H9RA 4LBMA 3ZVXA 2CL2A 4DCKC 1K5UA 2DUPA 5DG2A 3A0KA 1DQ1A 3NWKA 1ILR1 1DQ5A 5GZFA 2IWTB 2RSTA 2NMOA 1ULEA 3FJHA 4FQZA 4LBLA 2P3JA 4G6MA 5KXEA 4WVWA 3ZPYA 3NBEA 2XG3A 1LGCA 3RQ0A 2QYIB 2RHPA 1XQNA 5CAZA 1WBLA 4XJAA 31BIA 4LBKA 4HANA 2NVHA 1YF8B 4TZDA 3B01A 3ZC9A 3POSA 2CWMA 5DZFA 1ABRB 1X50A 2HWAA 1G7YA 1VLNA 3WG3A 3AJYA 4BMBA 1HWNB 3V0AA 1WW6A 4D0TA 2A3XA 2WRYA 5BXSA 2DU0A 2ZGRA 4YW5A 3K1XA 4FGFA 3UJ0A 3VV1A 3UD8A 1SLTA 3AKFA 3S8KA 5EG6C 3UJQA 5KXDA 3WUDA 1IS4A 3D7WB 1N3OA 4I0YA 1OQLB 2VXRA 3RMYA 9ILBA 1JY0A 2R1BA 1TWEA 3AZVA 2V73A 2AFGA 2PHXA 3OJBA 1QOTA 41BIA 3FJCA 1W6MB 3SH5A 2ZGSA 1JYIA 1DQ2A 3QYDA 5DUVA 1BLDA 2WLQA 3T1LA 1DYKA 1QF3A 1GICA 3R4SA 4C1WA 1CJPA 1ENRA 5DZEA 4WBCA 5JOYA 3N36A 1BASA 2DTYA 2ZGOA 1PUMB 4JKQA 2D6MA 1IS5A 4M3CE 1OKQA 5GLUA 4YGCA 3WG4A 5GLTA 2NTDA 1SLIA 3H6RB 4UW4A 2A71A 4YZ5A 4OUJA 4Q1RA 2WSUA 4LBQA 3WCRA 1KJLA 1ULCA 3TB0A 2ET2A 4I4RA 3PVNA 1O4ZA 4YFZA 1AVXB 1YO8A 3Q7WA 3AJ5A 2ESUA 3Q7XA 1SCRA 2LTNA 1LOFA 5DVHA 2EALA 4FPEA 3ZYPA 3A23A 2JDZA 1YTOA 1F31A 2L5XA 3LTQA 1GLHA 1QU0A 1LHWA 1C4RA 2P2KA 4PBOA 1E0OA 4GOVA 1RIRA 1R8OA 2WKKA 4AWDA 4BOWA 1Q8SA 2K43A 1A3KA 4AVSA 4ZGRB 3AJZA 5IK7A 2P23A 1FV2A 2ZGQA 4Y22B 2R0FA 1FWVA 4YW4A 3HALA 3N7JA 3V65A 1GV9A 4R9CA 4XE9A 3ATGA 1N3PA 2ARXA 4HA2A 3O4DA 3BAVA 4G9NA 2D3SA 1V6JA 1JBCA 4OEEA 5FZYA 1V6WA 2ZBJA 4Y20A 5T52A 1CN1A 1LOBA 1UMZA 2YUGA 4U36A 4YG3A 2DV9A 4PBPA 5HCBA 1G9FA 3PJQA 1LOFC 2D43A 1MS0A 4R9BA 3RTIB 4Z8BA 1AVBA 2C5DA 3FJEA 4AGGA 1F9KA 1MR5A 4JP0A 4YW3A 3H0OA 3WDYA 3O4OA 4D8HA 3OJ2A 4PC4A 1AX1A 3WDVA 1AZDA 1PZ8A 5T50A 1DFQA 1CR7A 2VW1A 2VU9A 1RMLA 4GAIA 1NUNA 1Q03A 1AXZA 1CIWA 4GP0A 1OQ1A 1MS1A 1HCDA 2Y9XE 1GZWB 2G4IA 2YXSA 2BEAA 1LJ7A 4K21A 5E88A 1OFSA 2Z42A 2EXHA 5GZDA 2GDFA 3H6QA 1MS5A 1CESA 4Q8KA 4DENA 3FJFA 1ENSA 3OBRA 2AH2A 3OGGA 5H9QA 1DGLA 2YZ4A 3SNVA 1HQWA 3WINA 1SR4A 1S0BA 1W0PA 1LEDA 2AREA 1MS4A 2B7YA 4IY9A 1ONAA 4EFPA 1W6PA 3AXEA 3IN9A 3ZXJA 2OW4A 1K5VA 4A7ZA 2PHWA 2JJ6A 1LEMA 4YZ3A 5KXBA 4ATFA 4UW3A 2PHRA 3AYEA 5EXOA 4YGEA 1W3FA 5CB7A 4JAWA 2ZQOA 1WD4A 3FUOA 4QKSA 4FPOB 3IAGC 2Y9WC 1N47A 3AFKA 1Q8VA 2W08A 1QQLA 4EB2B 1FAYA 3HMYA 4USPA 2MC2A 1ISVA 4YOLA 4LO7C 4A7YA 3BAQA 3NBDA 2A75A 5GALA 4QBCA 4L4IA 4QALA 3UJOA 1GNHA 4JC1A 2WSVA 3O44A 4GWMA 1M2TB 2GNDA 3WINC 3VEQA 1IS3A 4M01A 1YI7A 1ENQA 3V0BA 1S0LA 2JD4A 4R9DA 3FLPA 2D23A 3Q9OA 2ZKNA 2DURA 1EYLA 1AXYA 2E4MA 4DS0A 2LIQA 4GXLA 1EV2A 5EC5A 3QCWA 1Q8QA 3AKGA 1TTUA 4J2XA 1WLDA 3BRFA 1S0EA 1I3HA 1SCSA 1MVEA 3WG2A 1ZM1A 2VY0A 4I6IA 4X3AA 3PVOA 3S8JA 4FPHA 1G82A 2ZR1B 5I1BA 3N0KA 3NV4A 1APNA 3IM5A 3BA7A 5JDBA 2IHOA 5B2HA 4XMIA 2ZHKA 1LHVA 4LO8B 1CPMA 2EF6A 3CRIA 3ZXEA 2DVDA 2VLCA 3UD7A 5CNAA 3JUTA 3VSZA 1W6NB 1Z78A 1SFYA 4LO0C 3O4AA 3B00A 1JXNA 2Y9FA 1JUIA 2FHRA 3DUIA 1YRZA 4FOWA 3HR9A 4H04A 1IOBA 4HL0A 4F83A 4Q1PA 2R9KB 3WDXA 5F90A 1IRPA 4P9WA 2A3WA 4XBLA 2GNTA 4Q27A 5EWSA 3POKA 2DUOA 1S0JA 1W6OA 1ISYA 1CPNA 1JT3A 1G8WA 1MVQA 1SLLA 4I3NA 2ENRA 4BLIA 2WQZC 1QGLA 1W6MA 1V6XA 4W65A 3AZWA 5H9PA 5BP5A 2NZ9A 2VH9A 1IT0A 4OEGA 1QDOA 2BEBA 4X37A 4PCRA 3C2UA 2ZMNA 1WW5A 5JVVA 4QC4A 4FPKA 3FJJA 1BA7A 4I2SA 21BIA 2HYKA 2DVFA 4GA9A 5GLZA 5CBLA 3I2AA 1KQRA 5JOWA 3WDTA 1ITBA 1RZOB 1SBFA 4BLJA 3BADA 1AJKA 1LULA 1WCSA 4YGBA 1JQZA 4ASMB 2KI4A 1SLBA 1HKNA 4RA0A 3QR5A 2D6NA 1SLCA 4DQAA 3APBA 1LU2A 3AZXA 1DJSB 1RITA 2XB6C 3WO4A 2VSEA 3CNAA 1AX0A 3FLTA 3AYAA 4GOYA 2V5YA 1R1ZA 3I4IA 1JTCA 2D6OX 4ZFYB 5IK5A 4R9AA 5CA6A 2UWCA 2K8RA 1JT7A 1MC9A 1IKQA 2UWBA 1PC8B 3BA4A 4F34A 3ZX7A 1DQ4A 3UD9A 4WVVA 3JRRA 3LLPA 3MPPG 1URXA 1V6NA 4UW6A 1IJTA 1DQGA 2P3KA 5BP5C 1GYKA 1C1FA 1YBIA 4ISQA 3KM5A 4XFTA 2AAIB 5G00A 2Q3NB 1O4YA 3M3CA 3F1RA 1V6LA 1T4QA 3MW4A 3LCPA 5BQUA 2FMDA 1M16A 1DHKB 1JOJA 3IM0A 3RMXA 1MACA 4BQ1A 5F8YA 2A6XA 3AKHA 1C57A 4G6JA 4TYSA 1QNWA 4JKXB 5BXTA 2ZZJA 4M3CB 1C1LA 4YGDA 1TP0A 5GZGA 1DBNA 3AP5A 5GJ6A 4HR6C 1AVAC 3CA6A 1FMZA 3ILRA 1G9BA 3NV2A 3ZYRA 4XIOA 1LU1A 4FPYA 3EF2A 4XHBA 1CVSA 3WMVA 1JT5A 1QDCA 5E89A 1TEIA 4HJJA 3OY8B 3AZZA 4NO4A 3FJIA 1IOAA 2W68A 3CRGA 4FOYA 4IQPA 1TWMA 1HDKA 2NMNA 4LO1A 1XYFA 3RTJB 3WDWA 3USUA 6I1BA 3O0WA 3ENRA 3IM7A 1QXMA 1N3QA 4YZ1A 5D61A 1GZWA 3UK9A 3IM6A 4GKYA 5BQUC 1MS9A 1ONKB 3WVJA 5DUUA 2D3PA 4P0LA 2HZ9A 4BPZA 3V0AB 3F62B 4YW2A 5BYNA 1VCLA 4Q8LA 4XDQA 4OEFA 3CQAA 1JT4A 3NJ5A 2KLLA 1FATA 1MS8A 1TIEA 1IS6A 2ZGUA 2Z48A 5JOXA 5IT6A 3RS6A 4K1ZA 1I1EA 3FJKA 1LGBA 1N1TA 1BZWA 5EYXA 3CA4A 1TFMB 4II0A 2FDBM 5JLVA 3MW3A 2EXIA 1GGPB 3W59A 5L73A 3PHZA 2ZABA 2Q5TA 3WUCA 1AXMA 1DIWA 3VKLA 1UAIA 4WV8A 5T5PA 2DUQA 1Q56A 5GAQA 2D7FA 1CQ9A 3HN1A 1G9DA 5IK4A 1QMJA 2D7RA 4XJ8A 4Z9WB 5EHAA 2H0BA 3FFZA 3CRHA 4EFRA 5DUWA 2FFVA 4AGRA 3SH3A 1W3GA 3FJAA 2RG9B 3VKNA 1D0HA 1GNZA 1CE7B 1AFCA 1G9CA 4RL7A 2DVAA 4J23B 3A0NA 1BARA 3CAHA 2CY6A 5T5LA 4H55A 4YZ2A 1QOSA 2UURA 1LENA 4Y26A 4EEEB 3BX1C 4LBJA 1QKQA 2HWMA 4I8MA 2P3IA 2PHTA 1NZKA 4D0ZA 4QD2C 3GNEA 3BIWE 4LO2A 2A5ZA 1WBAA 3WCSA 1S0FA 2EXJA 1GKBA 1AVUA 1V6MA 4FVVA 4IONA 3WLUA 1KDKA 3BRGC 1BKZA 1UPSA 5HPZA 4P14A 2I2SA 3CA1A 3AZYA 2KI6B 4GALA 5GZCA 4LBQD 4ZXKA 1PZ7A 4YZ4A 1FNZA 1NLSA 5HCAA 2A6ZA 4H9WA 5JMCA 2ES3A 3OYWB 5DZUA 3M1HA 3AP6A 3A4UA 1WBCA 1HCEA 1Q04A 1MZ5A 4G1RA 1G9AA 3IKWA 1ULDA 4DEPA 3VKOA 2JECA 4K1YA 5F8SA 1UZYA 1RINA 3ZXGA 1XG6A 2DS0A 3W58A 2Z49A 2D6PA 3AXDA 2DVBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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