3ZX7A

Complex of lysenin with phosphocholine
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
AEGYEQIEVDVVAVWKEGYVYENRGSTSVDQKITITKGMKNVNSETRTVTATHSIGSTISTGDAFEIGSVEVSYSHSHEESQVSMTETEVYESKVIEHTITIPPTSKFTRWQLNADVGGADIEYMYLIDEVTPIGGTQSIPQVITSRAKIIVGRQIILGKTEIRIKHAERKEYMTVVSRKSWPAATLGHSKLFKFVLYEDWGGFRIKTLNTMYSGYEYAYSSDQGGIYFDQGTDNPKQRWAINKSLPLRHGDVVTFMNKYFTRSGLCYDDGPATNVYCLDKREDKWILEVVGLVPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structures of Lysenin Reveal a Shared Evolutionary Origin for Pore-Forming Proteins and its Mode of Sphingomyelin Recognition.
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Eisenia fetida
molecule keywords LYSENIN
total genus 57
structure length 296
sequence length 296
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.980 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3zx7A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3zx7A02
1L2HA 4IHZA 2VLCA 4EKXB 4HJJA 1TWEA 3AJ6A 1XG6A 3H6QA 4QD2B 1FV2A 3F62B 3R4SA 3N7MA 3HMYA 4F34A 4CJMA 1NZKA 2D22A 4QBVA 4I4OA 4EB2B 2D24A 4L4HA 3AH1A 2VSEA 2D7IA 4ZLBB 2BEAA 1G9BA 5BQUC 3OBTA 3VT0A 4ZA3B 5FNWA 5F8YA 4G1RA 1YYNA 2F8XC 4P0JA 4TLPA 1M2TB 3Q7WA 3ILAA 3MALA 4EFRA 3VT2A 1A8DA 2F2FC 4JRAA 2Y9FA 3VUOA 2K4AB 1EYLA 1NUNA 4QKSA 4ZFUB 1I1EA 3PMEA 3FJ9A 2KLLA 2VSAA 2WBCA 3O4AA 3BADA 3O4DA 5E24E 1S0EA 3BA5A 4JPZA 1FGAA 4ISQA 4OWLA 3AKFA 3QYDA 4ZKTB 3ZXGA 2KKIA 3FJHA 2P23A 3C9ZA 3CRHA 3FGMA 4I7IA 1AXMA 2MLLB 4D8HA 1TWMA 4FVVA 3NBEA 3ZXDA 2Y9WC 1FWUA 4KEJA 3P53A 3S8JA 4G6JA 1S0BA 1HCDA 3FJDA 1W3FA 3PUBA 4LO2A 4I4UA 2WRYA 3FJCA 4A7KA 6I1BA 2ESUA 1BLDA 4A7YA 3CRIA 5BXRA 3HN1A 2KI6B 1MC9A 3AH4A 4I4QA 1V6VA 4J2KA 2R9KB 3VWCA 3W9TA 3NBDA 4KEIA 4IY9A 3EF2A 5DZUA 5HPZA 3AKHA 4A7ZA 3IIRA 2AAIB 1ABRB 2FGFA 4ISRA 5D61A 1IJTA 1V6UA 2HWAA 5BXTA 2X2SA 3CU1B 3O4BA 3BAGA 4P0LA 3VT1A 1II4A 3BRGC 1VCLA 1Z2VA 3V0BB 7I1BA 3BAVA 4EFQA 3VEQA 3AH2A 4QALA 4ZFWB 2M49A 3Q7XA 1ISZA 3WO2A 3E8LC 1G9AA 5JMCA 1IRAX 3FJ8A 2FO1A 2HWMA 3FJJA 3BTAA 4XFSA 5BOWA 4X37A 1S0GA 4IYBA 1EVTA 3CA0A 1IT0A 4LO1A 4I4VA 3VSFA 4I96A 4HR6C 4JAWA 2Y9XE 1Q04A 1BFFA 1Z4SA 1JLYA 3OJVA 2DS0A 1P63A 1AF9A 3MPPG 4GOVA 3FJEA 2HW9A 4I8MA 2NTDA 5FNXA 4R6UB 2E4MA 5B2HA 2FFVA 1W3GA 2D43A 1AVWB 3CA6A 5EC5A 1EV2A 3O3QA 2AXMA 1K5VA 3BAUA 2BFHA 1PWAA 3RTIB 4GAIA 1SR4C 3JRRA 1WD4A 2LIQA 4LO0C 3UD9A 3H6RB 4OEEA 4X3AA 4LO3A 1HIBA 4D0TA 1BFBA 1I1BA 3WMUA 1JT4A 1BA7A 4OUJA 1PZZA 2D44A 4I4XA 2NYYA 3IM5A 4I4PA 1N4KA 4I6IA 4EEEB 3AKGA 2MC2A 3FFZA 1DZDA 4IQPA 2NZ9A 1Q03A 3BAOA 3KMVA 1SZ6B 4Z9WB 1QXMA 3FUQA 2K8RA 5DVHA 3B9UA 3PHZA 1QQLA 4AN7B 5F8SA 3A22A 3UD8A 3A23A 3FJBA 2Y9GA 1DLLA 4I3NA 3WINC 1YXWA 4II0A 3BA7A 1DJSB 3BAHA 3CA4A 1AFCA 1ITBA 3BRFA 3F1RA 4H04A 2D23A 4I4SA 5GAQA 1T4QA 3UJ4A 3BRDA 4G6MA 1IILA 1BFCA 1YTOA 2D1ZA 1GGPB 2X2TA 5BP5C 3JUTA 2RG9B 2DREA 4WBCA 3D7WB 4HA2A 3NBNA 5EG6C 1V6WA 9ILBA 2I1BA 2FDBM 1DIWA 1XYFA 2AFGA 1ISYA 2IWTB 4Q91A 5JLVA 5DUYA 1TTUA 5BXPA 4OWKA 4J2XA 4IZEA 4IONA 4G9NA 4J2SA 1FMZA 1ISXA 3AZWA 4XFTA 1AVXB 3OJMA 4X39A 3P6JA 4GP0A 1RG8A 4EFPA 1DQOA 3CRGA 1T9FA 1WBCA 2VXTI 4YOLA 2Q3NB 3V0AB 3V79C 4JKQA 3S8KA 1AVAC 2F2FA 2ZQNA 1S0LA 2RQ9A 3ZX7A 3QR5A 1PUUB 31BIA 1WD3A 1TOOA 1JLXA 4USOA 2ERMA 3O4CA 3N7JA 5I1BA 1IHKA 1PC8B 2D7RA 4DCKC 1E0OA 1PUMB 2NP0A 1YBIA 2BEBA 3I2XA 4KC3A 3PG0A 1HKNA 2GZBA 3A07A 2NM1A 2FFUA 1JQZA 2KI4A 4QBCA 4G9MA 2DRZA 4DEPA 3I2AA 3FJIA 4Z8SB 3SNVA 3IM7A 4QO3A 1KNMA 3V0BA 4Q9PA 4PC4A 3WO4A 1W3AA 1DZCA 2QYIB 21BIA 3N7KA 1R8NA 3BAQA 2HZ9A 1CE7B 2DRYA 2NVHA 4JP0A 3OGFA 4GAFA 3UJ0A 4ENDA 3O44A 3RTJB 1AVUA 3CA3A 3O49A 4P0KA 2GO2A 3ZC9A 4OEGA 3Q7YA 5FZZA 4LO2C 1S0CA 2RSTA 4KEKA 3RSJA 3WA1A 1ISWA 3AJ5A 3LLPA 1IRPA 1DQGA 2IHOA 3HBWA 4JQ0A 4D0ZA 3IM6A 1F31A 1Q1UA 3OGGA 3FJAA 3CAHA 5FZYA 8I1BA 2D20A 1G9DA 1CVSA 2Z48A 1G9CA 1FMMS 3VSZA 4I1EA 4I2SA 4I0YA 4GP3A 4P6AA 4ZGRB 1M16A 1HWPB 1Z0HA 1BASA 1K5UA 3POKA 3FUOA 4L4IA 2AQZA 3TC2A 4I1BA 5F90A 1FWVA 5D63A 1IOBA 1OQLB 1JT7A 1XHBA 3FJKA 4J2YA 3HOMA 3H6RA 4ZOTA 4XKIA 4QKRA 1ONKB 4GOYA 1ISVA 4OEFA 2VU9A 3NBCA 1BARA 3CA1A 3OBRA 4FGFA 4LO1C 4QC4A 3IAGC 1HCEA 5BXSA 3RMXA 1JTCA 1SR4A 4IZXA 4LO0A 2Q9XA 3BX1C 1DFQA 1HWOB 2K43A 1BLAA 1RZOB 41BIA 2E4MC 3FJFA 3A21A 1WBAA 1UPSA 4J23B 2L5XA 5BQUA 3AKIA 1YF8B 2XOAA 5EHAA 3N7LA 1R8OA 4USPA 4I4YA 4LO3C 3NJ5A 3BA4A 1TP0A 4H9WA 1S0FA 1D0HA 2MIBA 1MD6A 3WMVA 1HWMB 3H6SE 3OJ2A 5G00A 3WINA 4JKXB 3P6IA 3ZC8A 3I29B 2KH2A 1ILR1 4OW4A 3O5WB 3UD7A 4KBBA 1XZZA 1S0DA 4X38A 4F83A 1FN0A 2P39A 2ZQOA 3LTQA 5BVPI 1DFCA 4XFUA 1FV3A 3CQAA 4LO7C 3T8SA 4I4RA 4AN6A 4OWJA 2ZR1B 3O4OA 2UUSA 5D62A 3BB2A 1RMLA 5DSSB 5BP5A 1FQ9A 1JT3A 2YUGA 3K1XA 3WO3A 3HSMA 4LO8B 4DENA 3UDAA 2LIEA 1HWNB 2Z49A 1G82A 4QD2C 4I37A 1JY0A 3N0KA 4LO7B 4ZFYB 1JT5A 2ET2A 1QQKA 3V0AA 3R4UA 1EPWA 3RMYA 2QN4A 1TFMB 4Q9GA 1RY7A 2VXRA 4ZBVB 3CA5A 1BFGA 2VUAA 1J0SA 1V6XA 2J3PA 1TIEA 5F8WA 3HALA 4IY8A 3AZVA 5FZUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2J1VA 4IHZA 1R1A1 2VLCA 4EKXB 5EC5A 3I97A 5K0UB 3RZHA 1AYN2 1TWEA 1XG6A 4QHBA 3H6QA 1MEC1 1GOFA 1HRV2 2V72A 5FUPA 4YZ2A 3ZR5A 4CJMA 2XB6C 4LK6A 4I4OA 1YFWA 2AUYA 2BWCA 5DAVA 1PK6A 3ZYBA 2D24A 1PX3A 1ZBA1 1D4M1 4YZ3A 1RUH2 4I02A 3ILNA 3MI8A 2D7IA 4CRQA 1U5IA 3CF6E 2W39A 3CA3A 4ZLBB 2FQPA 2A7AA 5T52A 1W0OA 2EIBA 1MS9A 3JCIA 4LPLA 1RUJ1 2ETEA 3RQ0A 2VD7A 3M3QA 5F8YA 1YYNA 4AQ6A 3LDRA 1JUHA 2R0HA 4P0JA 4ES8A 1VIWB 2ET1A 1FI2A 4WBBA 5FZHA 3WF2A 4H7MA 5KC5A 2UYAA 1O8SA 4F3JA 4XJ9A 4NIAA 5EHDA 2VOKA 3GHMA 2VMDA 1GP4A 3FLRA 2F2FC 3SKVA 5FYZA 5SV8A 4OHYA 4YFWA 2P37A 2UWBA 1W9SA 3NAPA 4I3PA 4CCEA 5LBEA 2K4AB 2R043 3NV4A 4L9BA 2OZJA 3J8F2 3PMEA 3AMPA 3BPZA 4GULA 4C0BA 4WVMA 3LOBA 2PAKA 3O4AA 1LESA 2BERA 1AR81 3IM0A 2WZ8A 3T2TA 4BQ5A 3LFMA 2WFF2 3PVBB 4COVA 1WLCA 1LGBA 3FHIB 1EY2A 1GZCA 3BA5A 4JPZA 1FGAA 3PUIA 4ISQA 1I6XA 5C4WA 4OWLA 2JG9A 3AKFA 2QQLA 3ON7A 3ZXJA 2RS53 4RHV1 1VBE3 1J3RA 2A3XA 2ZX2A 1IPSA 2W92A 4Y1YA 1SG3A 5C8CA 2VTXJ 4L0PA 1MQTA 4G6JA 1BBT2 1GQPA 1VBC1 2VNRA 4Y5SA 3HJRA 2DUQA 4CDWB 1I5PA 1SEFA 2E7QA 4OFGA 1S2KA 3FJDA 1LOAA 2GC2A 1XU2A 2VQAA 1WZXA 3MV11 5A7OA 3GZUC 4J1WA 1TMF3 3ZN6B 4A7KA 5C3OA 6I1BA 2MLLB 1FAYA 2AH2A 4QKBA 2DBIA 5C9AA 4NVPA 1YUDA 2IXLA 2JB4A 3AJYA 3B02A 3HN1A 3UYJA 1MC9A 1V6VA 4I4QA 3W9TA 5JXGA 1YNAA 4OULA 4QQ2A 5FYTA 3TWIA 5DDJ2 3EF2A 4N90A 5EWSA 4Y26A 4FPFA 2ZHLA 3D5OA 4M4RA 3JD73 1SFYA 5DAPA 3CU1B 4EE2A 4P0LA 3VT1A 2BNOA 5K4LA 2XJTA 4MXVA 1Z2VA 3VBHB 3B00A 3KVAA 1RUI2 4ORFA 3VEQA 1HW5A 2TEPA 4NIDA 1OQDA 1COV3 1QNWA 2X53S 1W9YA 4DB5A 3AH2A 4QALA 1C57A 5LBBA 2Q8EA 3WW4A 5FWEA 3HQRA 4ES9A 1X9PA 3EB7A 1YC61 3WINE 1IRAX 1EAH2 4KG0A 2MEV2 3MLJA 3RGBA 2FO1A 2WNUC 3FJJA 2EVXA 3GDBA 1FYUA 5CZKA 2ZEXA 3KHCA 1ZRDA 1VMFA 3WW1A 5IAXA 2XL9A 1A8MA 2AACA 2WRAA 3NNLA 4L99A 3T4VA 4X37A 2JD9A 4OQ9A 4JQTA 1ENQA 3BN6A 4LQRA 4META 3T1MA 4XUOA 4B1MA 4B3NA 4RGKA 3EO6A 1R092 3M4FA 2Y9XE 1OLQA 1QJX3 4K8RB 4UW5A 4BH9A 5CFCC 1D4VB 3PVEA 3UGGA 1UL9A 3ZN6A 1U5ZA 4N7UA 1BCXA 4ZONA 2LM3A 3D4KA 1D2SA 2E31A 3I2IA 1IKQA 4M00A 3T4HB 2NS2A 4CCNA 2CNAA 5A6XA 1W99A 5G05L 5A3UA 3UETA 4GOVA 2JKBA 1CONA 3AP7A 2OPKA 1XBFA 4AI9A 1AXYA 5FNXA 2OKXA 5A7PA 2E4MA 4R6UB 3I8TA 2OQ7A 4HFSA 4S2FA 3JU9A 2VMHA 3ZPYA 3W58A 5HXMA 3KD4A 4AFMA 4AI0A 4AOCA 4WM8A 2A75A 2ZGLA 5GLZA 3BUCA 1CGPA 3NNMA 5LY1A 1EV2A 1J3QA 4QB6A 1K5VA 2E7TA 1DYKA 2BFHA 5FYSA 5FPLA 4GAIA 4R4XA 4XBQA 4AF9A 5FV3A 1QQP3 1SACA 5A33B 1O3TA 2LIQA 4LO0C 5F1RA 4ASMB 4X3AA 1IKPA 4MGIE 4LR4A 2C5DA 4ZU5A 2DF7A 2K46A 3ZSJA 1HIBA 2NLRA 5I91A 4XFHA 2IXCA 3I2HA 4CP9B 2W0XA 2WA3A 1OC1A 2AYHA 2R042 4IL7A 4E4SA 2YFZA 1BA7A 2D44A 2A3WA 4QKNA 4H2AA 4LUMA 3IM5A 3SXWA 1VR3A 4I6IA 4EEEB 2AREA 4XF3A 3AKQA 3V56A 3FLPA 4AEMA 1W03A 1QJY1 3M3CA 3C2UA 4YZ4A 1LU2A 4LUKA 3FFZA 1DQ5A 2HJIA 4M3CF 1PZ9A 2JXAA 2XLAA 4DXTA 4OMCA 4MXWB 1OURA 3HBKA 3ZPOA 1QJZA 4XDPA 5DVHA 1ULEA 4JGYC 1LECA 1OF4A 1W8UA 5DN2A 2D5FA 3PIJA 3A0KA 3B9UA 5A80A 2Z42A 4AN7B 3WZ1A 2DTWA 3AXDA 1JYNA 1SCSA 3IB3A 4LO7A 3VD9A 4XF0A 3LA2A 3FJBA 2Y9GA 5CFDA 4I3NA 1O7FA 2CWSA 1MZ6A 4II0A 2BNNA 2YXSA 1JZ2A 1OBNA 5CG9A 2GN3A 4BIOA 3H8OA 1RVF2 4AGRA 1AXKA 3GJAA 1AFCA 2PA7A 5A6QA 3P6BA 1A78A 4TWTA 5A33A 3F1RA 3AMQA 4JGYB 5FK7A 2D3RA 2SLIA 3Q8EA 3APBA 4BQ2A 1ONAA 4QD2A 3WCRA 1UO9A 5GAQA 4RS5C 1SLLA 3C7OA 3VL8A 2XUEA 2VL4A 4LOSA 4YM0A 4TSVA 4C0HA 2WDBA 1UY2A 4AEDA 4ZU4A 4Z8BA 1COV2 1BFCA 4XILA 1NY72 4XF9A 5E88A 5EV7A 2CTVA 2I45A 1GGPB 1AR91 2VM9A 3VBSA 2DU0A 4FTBA 2HYXA 4IV3A 1DGWA 2VY0A 5EXOA 1UYYA 3ZFGA 5EG6C 1SLCA 1V6WA 5JAXA 4ASKA 3ETQA 3HN3A 2AFGA 3SCHA 4RS5B 4AVVA 3NNGA 2VQTA 2D7FA 3O7OA 5GZDA 1AL0G 3WUDA 5FPZA 3KQ4B 1DQ0A 1UIKA 3LA3A 4U36A 2Y0OA 5EYXA 3RRDA 1F35A 1QJX2 2DVAA 4GB33 4N8MA 2P5BA 1PO23 2GP3A 4OYUA 4QX1A 4J1XA 3WG4A 1JOBA 3W20A 4FBFA 4IONA 4G9NA 4AAXA 1WCKA 5FLHA 2PHXA 5HPOA 3S5QA 3N9QA 1ISXA 1F5FA 2JD4A 1AZDA 2RDSA 4JGZC 1SCRA 4K1ZA 2IFRA 3CL1A 2VMCA 3OUHA 3P6JA 4AZZA 3HBZA 3GCXA 4Q4W1 3UKTA 2FDGA 1RUG1 5T3NA 5A7WA 1DQOA 1GP5A 1SHWB 1ULOA 2RMU1 2W1SA 3KQRA 3HEIA 3MLLA 4Q8KA 4K40A 3POIA 3MYXA 1JU3A 4QX3A 4YOLA 3V79C 1SBFA 5FP3A 1EP0A 2D5HA 2HWF2 1R1A3 4F34A 3K4ZA 2ZQNA 1S0LA 3ACFA 2CL2A 2YGMA 3PJYA 5HV4A 1TOOA 1MEC3 1YIFA 1JLXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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