3ZX7A

Complex of lysenin with phosphocholine
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
AEGYEQIEVDVVAVWKEGYVYENRGSTSVDQKITITKGMKNVNSETRTVTATHSIGSTISTGDAFEIGSVEVSYSHSHEESQVSMTETEVYESKVIEHTITIPPTSKFTRWQLNADVGGADIEYMYLIDEVTPIGGTQSIPQVITSRAKIIVGRQIILGKTEIRIKHAERKEYMTVVSRKSWPAATLGHSKLFKFVLYEDWGGFRIKTLNTMYSGYEYAYSSDQGGIYFDQGTDNPKQRWAINKSLPLRHGDVVTFMNKYFTRSGLCYDDGPATNVYCLDKREDKWILEVVGLVPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structures of Lysenin Reveal a Shared Evolutionary Origin for Pore-Forming Proteins and its Mode of Sphingomyelin Recognition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSENIN
molecule tags Toxin
source organism Eisenia fetida
total genus 57
structure length 296
sequence length 296
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.980 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3zx7A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3zx7A02
3T8SA 3QYDA 2UUSA 3O5WB 4LO1A 3IIRA 2F2FC 2D43A 4JQ0A 1S0FA 1BFCA 4J2YA 1QQLA 3O44A 3POKA 4II0A 4G9MA 1DFQA 2KKIA 4EFQA 4XFTA 1JT3A 4GOYA 1IJTA 3OBRA 3OJVA 3AH4A 3BX1C 1Q03A 3CA5A 3WINC 4Z9WB 1ISZA 3FJCA 1DLLA 2VXTI 3WO2A 3CA3A 4YOLA 4X38A 1AVAC 1G9AA 4G6MA 3WO4A 4D0TA 6I1BA 2FO1A 3N7MA 4LO7B 3BAVA 1RMLA 2AQZA 2Q9XA 4P0KA 1G9CA 4GP3A 3V0AA 3BAOA 3BA7A 5DSSB 2Y9WC 2ZQOA 1K5UA 2FGFA 3WINA 3N0KA 2QN4A 5F8WA 4ZFUB 1GGPB 4ISQA 3BTAA 2M49A 3IM6A 4KEJA 5I1BA 3OBTA 3FJKA 4X37A 3RMYA 3Q7WA 8I1BA 7I1BA 3RTIB 5D62A 5BXTA 1S0EA 2NP0A 3A23A 3C9ZA 2Q3NB 3FJAA 1JT7A 1DZCA 1DZDA 5GAQA 1FGAA 3IAGC 4LO2C 1DQOA 2LIEA 4GAIA 4LO3C 4OEFA 1PZZA 1BLDA 3A21A 4PC4A 1DJSB 4XFUA 3F62B 3JUTA 3BAHA 3FUQA 4EEEB 3PUBA 4J2KA 4WBCA 4OWKA 5BQUA 5EG6C 1AF9A 4I1BA 1ONKB 3R4SA 1CVSA 4D0ZA 4QO3A 2NYYA 9ILBA 1YF8B 4J2XA 5D63A 1OQLB 3KMVA 3P6JA 2MC2A 4XFSA 1IOBA 3A22A 4A7YA 3R4UA 4EB2B 1YTOA 3O4DA 1PWAA 3BAQA 1W3FA 4IY8A 3V0BB 3ZX7A 1BFBA 3H6RB 1WD4A 3FJ8A 5FNXA 4ZFWB 1Z4SA 4L4HA 2NVHA 3LLPA 1K5VA 1PC8B 1HWPB 4I37A 2WRYA 5EHAA 1JT4A 3I29B 2HW9A 1S0BA 4IZXA 4I4PA 2BEBA 1ISXA 4OEGA 3RTJB 3VT2A 3CA6A 2D24A 1JY0A 2NM1A 1T4QA 2AXMA 1W3AA 3CA1A 3FJDA 1P63A 4XKIA 2Y9FA 1DIWA 4ZBVB 5F8SA 1ISVA 2F8XC 1RY7A 4USOA 3VSZA 1AVWB 1HCEA 4I0YA 4ENDA 4HA2A 5D61A 1XZZA 1AFCA 3V79C 1ITBA 1YBIA 3IM5A 3WA1A 1EPWA 3AJ6A 3OJ2A 1BARA 2GO2A 3UJ4A 3K1XA 1FV3A 3NJ5A 4ZLBB 4QD2C 2VXRA 3N7JA 1JLXA 3VEQA 2AAIB 4QKRA 1Z2VA 2NTDA 1XYFA 4I96A 3TC2A 4AN6A 1FN0A 1UPSA 2VSEA 3FJHA 3P53A 1MD6A 4DEPA 1IILA 4I6IA 5B2HA 31BIA 1MC9A 3O4BA 3O4CA 1M2TB 3FJIA 1IRAX 3HMYA 4I4VA 1I1BA 1NUNA 3UDAA 5FZUA 5JMCA 1FV2A 4JKQA 3FJ9A 1D0HA 5BP5A 1M16A 2ERMA 3ZXDA 4KC3A 5BXPA 3AKHA 3WMUA 4A7ZA 4EKXB 4KEKA 1HWMB 2GZBA 1S0LA 4D8HA 2E4MA 3CU1B 3A07A 1E0OA 2AFGA 1L2HA 1CE7B 4I2SA 3OGGA 3O4AA 5BQUC 41BIA 2Z48A 1Q04A 3H6SE 2R9KB 4GOVA 2IWTB 4FVVA 1EV2A 1W3GA 3BRFA 4P6AA 5F90A 4A7KA 2Y9XE 2D1ZA 3VT0A 2DRYA 3IM7A 1TWMA 1BFGA 3BRGC 1PUMB 3UJ0A 1TTUA 4OWJA 1IHKA 3CRHA 3Q7XA 2IHOA 1DFCA 4EFPA 3MPPG 3H6RA 1BASA 4ZFYB 1WD3A 1HWOB 3VSFA 1N4KA 4I4SA 2D22A 3BAGA 4QKSA 1V6XA 4JAWA 1DQGA 2BEAA 1T9FA 3HN1A 3LTQA 1V6UA 4ISRA 1VCLA 1PUUB 2ZR1B 1Q1UA 3H6QA 3CRIA 2Z49A 2WBCA 3CA4A 4IHZA 3RMXA 4I4OA 3HALA 1ABRB 4IONA 3ZC9A 4JPZA 1HCDA 2X2SA 1TOOA 1S0GA 1G9BA 2LIQA 4I4RA 1R8OA 4HR6C 4I4YA 3ZXGA 1FMZA 3FJEA 1G9DA 1II4A 5FZZA 4IQPA 2FDBM 2BFHA 3VT1A 3S8KA 4R6UB 1WBAA 2KI6B 1JTCA 3UD8A 1TIEA 4I1EA 1SR4A 3S8JA 3NBCA 3CA0A 4QBVA 3VWCA 2FFVA 1SZ6B 4LO7C 4Z8SB 3ZC8A 1FWUA 2P39A 2D23A 5FZYA 4F83A 5BXSA 1AVUA 1ISWA 4LO0A 2ZQNA 4GP0A 3CRGA 1A8DA 21BIA 1QXMA 2YUGA 1EYLA 3FGMA 3PMEA 1YXWA 1AVXB 4OWLA 4TLPA 3N7LA 2NZ9A 2D44A 3BADA 2HZ9A 2XOAA 3OGFA 2D7RA 3FFZA 3BA5A 1FQ9A 3B9UA 4CJMA 2K43A 2KLLA 2VU9A 4KEIA 5BP5C 3MALA 3PG0A 3I2XA 2Y9GA 2D7IA 1QQKA 3O3QA 2E4MC 4OW4A 1G82A 3AZWA 1XG6A 2HWAA 3E8LC 3VUOA 3F1RA 1KNMA 2F2FA 3BA4A 4QALA 1BFFA 2RSTA 3AH2A 4G1RA 4JRAA 4OUJA 4ZKTB 4IY9A 3N7KA 2DREA 4I4UA 3AJ5A 2DS0A 4EFRA 2K4AB 4L4IA 3BB2A 3NBDA 5E24E 1WBCA 2KH2A 5DZUA 5G00A 4QD2B 4AN7B 4H9WA 3FJFA 3JRRA 3V0AB 3W9TA 1NZKA 4X3AA 4LO8B 1IRPA 1TWEA 1JLYA 4QC4A 4JP0A 1S0DA 1FWVA 5FNWA 4QBCA 1F31A 4KBBA 3I2AA 4DCKC 5BXRA 4H04A 1R8NA 3ILAA 1RG8A 3V0BA 3OJMA 3P6IA 4ZA3B 1FMMS 4J23B 3BAUA 4USPA 4IZEA 2VUAA 3SNVA 5F8YA 4F34A 4Q91A 1I1EA 2KI4A 4P0LA 1J0SA 4GAFA 4JKXB 2VLCA 4Q9PA 4LO2A 1HKNA 3AH1A 4LO3A 4FGFA 2RG9B 3NBEA 4G9NA 1EVTA 1BLAA 1V6WA 5BOWA 3AKGA 3BRDA 3Q7YA 5JLVA 1SR4C 5HPZA 2L5XA 1TFMB 1Z0HA 2DRZA 2ET2A 5BVPI 5EC5A 3QR5A 3HOMA 2J3PA 2MLLB 3AZVA 4HJJA 2X2TA 3O4OA 1YYNA 2RQ9A 1IT0A 4I7IA 3UD7A 2D20A 4ZGRB 4LO0C 4IYBA 2I1BA 1JQZA 4I8MA 2FFUA 4Q9GA 4DENA 5DVHA 4J2SA 4I4XA 2QYIB 3CAHA 4OEEA 3WO3A 4ZOTA 4I4QA 3NBNA 1ISYA 3HBWA 3AKFA 1AXMA 2K8RA 3CQAA 3FJJA 4X39A 3FUOA 2MIBA 4LO1C 3FJBA 3WMVA 1RZOB 1JT5A 3HSMA 3EF2A 1ILR1 1V6VA 1S0CA 3RSJA 1XHBA 3D7WB 1HWNB 1BA7A 4I3NA 2HWMA 2ESUA 2VSAA 4P0JA 3PHZA 1HIBA 2P23A 3AKIA 5DUYA 1TP0A 3O49A 4G6JA 3UD9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RE9A 3M8LA 2QQPA 2BGOA 2Y6JA 1Y9QA 3T8SA 5KXDA 1FPN1 4AI3A 2VECA 4YM3A 2ZKLA 3WW3A 5JPMB 1IRAX 3H3LA 4FO9A 1S0FA 3S57A 4J2YA 4Q4W2 1DF0A 1DFQA 2VZOA 3TN92 3AKRA 1LOFA 1JTZX 4Q4V1 1QJY2 3PIGA 1FMD3 3OBRA 1OSGA 3F95A 1VPHA 5C4WB 1UIKA 3VBHA 1O8PA 3MIDA 3AH4A 1RITA 1POV3 2BFUL 1HQWA 1OLQA 2OPKA 1Q03A 1LODA 3KQ4B 1Z7S1 1CIYA 4GB32 1XPWA 2I45A 3HNYM 2BGCA 3PU8A 1F35A 2IXHA 4BIOA 2ESUA 1HV0A 1C1FA 4D0TA 4B7EA 5K0UB 1L7QA 4QD2A 4E4ZA 3BAVA 1ONAA 4M0NA 1FAYA 1UMHA 5C8CA 1G9CA 1UAIA 5E16A 3V0AA 4P0KA 1D4M3 1W05A 4XF4A 3TNPB 1S4CA 4LO8A 3GXUA 4Y1YA 4LBJA 1OA2A 3HAGA 1W8WA 1SZBA 1MZFA 2OPWA 4FPCA 3N0KA 5F8WA 1RUG2 2CHHA 2EVXA 3H0OA 4MADA 4Z82A 3POGA 1AXZA 3SEEA 3WNMA 1W90A 3CBNA 4LORA 4K8RB 4WZFA 4WM8C 2X5IB 4EE2A 2JXAA 1ULGA 3VD5A 2PHFA 4NWWA 4GAZA 5EFUA 4X37A 2AZ5A 5FQ0A 2Q30A 2Q8DA 8I1BA 7I1BA 3CJIA 5D62A 4YVWC 4Z2WA 2CDPA 5ACA2 3RTIB 1IKQA 1IPJA 1EV11 1QWRA 3SH4A 4WM7A 2WL1A 3C9ZA 1CAXB 4COVA 5IK7A 2Q3NB 1OUXA 5D8AA 3POJA 4JDMA 4QDQA 5FLHA 5LRRA 1NQJA 1SBEA 3MO4A 1D4VB 5GAQA 2GC0A 2PAMA 3OPWA 4QQHA 4V1PA 4LQRA 4I30A 3MF6A 2PHXA 2XLGA 1HXS3 2R063 4KWLA 4LO3C 1MS3A 2QE3A 3PIJA 4UF0B 3VBFA 5AC91 3WY6A 1WCQA 2VPVA 2KXLA 1BLDA 4NVPA 3A21A 4FPYA 2K43A 2YFUA 4PC4A 1AX0A 2WQZC 1LHNA 1DQ6A 1SLBA 5LA9A 3T2QA 3WD5A 3FFQA 2X8KA 3G7DA 1XYNA 4QQLA 2P37A 3R4DB 4S2FA 4UFLA 2C4XA 2NMNA 3UV9A 4XXPA 3ZR5A 3JUTA 1VBC1 4XAEA 1FNYA 5BQUA 3SCHA 4WBCA 4CDXB 2W1SA 1AR71 1DHKB 4I1BA 4PDWC 1CVSA 4QPGC 4QO3A 1YIFA 2NYYA 2VW2A 1A3KA 4I2OA 1QJU2 1YQ5A 2W47A 4CDWB 2W91A 4NROA 3KMVA 1C5IA 4NRQA 2YPJA 4IERA 4OQ9A 4MZFB 4D7TA 1K42A 1UZVA 1HRV2 3LCPA 3A22A 4A7YA 4EZHA 1H2KA 3POBA 5E6HA 1O3RA 4J6GA 4EB2B 4UW5A 1NT0A 2X53S 1AR92 1V6KA 5C6CA 5CG9A 3WDWA 4QMAA 3SQOA 2CAVA 2D98A 3DYPA 2W68A 3NNMA 4GKXA 3BAQA 4CEWC 3WF0A 1MS0A 1WW4A 2VUDA 3KT4A 1WD4A 5FNXA 5FZMA 3NV4A 3CMGA 3BOPA 5FJHA 1V9U1 2JJ6A 3TYJA 2VO5A 3LEKA 3ME2A 2NVHA 3LLPA 4L4HA 1Q8SA 2DCKA 5FYCA 2VMCA 2FD8A 4XYXA 4ARXA 3IAPA 3W21A 1MS8A 4GWMA 1W6NA 4JCKA 4BIFA 4Y4RA 2PHUA 3WR0A 4I01A 1JYNA 3ZFFA 1ND2A 3VT2A 4JGZA 1DGRN 3L9JT 3VB9A 4Q4Y1 2PMWB 5CISA 1K5MB 1MS5A 2ORZA 3POIA 2BGPA 4CCOA 4MZHA 4XKIA 2Y9FA 2OW4A 4OI1A 2G4IA 5CYYA 4BA6A 4XFGA 2FCUA 3LPFA 1CZVA 3JB8A 1PM7A 2X05A 3VKMA 3KF5A 4NPLA 1LOFC 3RYPA 1RY7A 1TME1 5F5QA 5FZKA 4X6QB 2ZMLA 3VBHC 5FAXA 4CUGA 4HSLA 2JICA 3ZM8A 4GMP3 1HKDA 4BPZA 4YSFA 4E8CA 4HA2A 4I0YA 2FCTA 4HVOA 3WP3A 3WP4A 1ZRFA 3WZ1A 5D61A 2LM3A 1NLRA 5DUWA 1E5IA 3AYDA 2P2KA 5EQUA 3RRDA 4BQ1A 5JSPA 1EPWA 3IIAA 2YC0A 3T1MA 4DY5A 2QCSB 3U10A 3OJ2A 2EIGA 1O59A 2Q8OA 4CUAA 2W46A 2ET2A 5APAA 2VSAA 4QD2C 2VUJA 1NKGA 3N7JA 1ALYA 1V70A 4Q29A 5C8CC 3M7AA 5DABA 1JBCA 3THPA 5LA0A 4XBLA 4HKOA 3GCXA 5JXIA 1Z2VA 3B00A 1W2UA 1ENXA 2OKXA 4URAA 1W9FA 2XHNA 1KS5A 4AR2A 2WAAA 5FTTC 2J1EA 1ULCA 4NIHA 1UOBA 2D6KA 1UX6A 1OLME 5CKNA 1JU3A 2VZVA 3ES4A 1US3A 1YO8A 4I02A 3ZFGA 4OHYA 5C3OA 4R9CA 2VVFA 4J25A 2J42A 5E88A 2EALA 2E7AA 2ID4A 5FV3A 1WCUA 3IKWA 3ZOIA 3WDVA 3CJIC 4NMIA 1DYKA 3KM5A 1WMFA 1JXNA 4TLFA 3O4CA 4WM7C 1BEV3 1GP6A 2QJVA 4LO6B 1RZOB 3GALA 4XF0A 4AI2A 4XF9A 5D8AC 3HMYA 1I1BA 4IXLA 3UDAA 2W1UA 5FZUA 1RUC1 4IE0A 2VMEA 3WVJA 1IQDC 1FV2A 3E6BA 2QQNA 5JOZA 3VD9A 3JBG1 3PNAA 5BP5A 3MFCA 3UT0A 3ZXDA 3BIWE 2ZHLA 3VBFC 4KEKA 4MGZE 4ONUA 2JB4A 4AHWA 3HQXA 2RJ2A 1S0LA 5EIYB 3VZJA 4IEYA 5I8SA 3A07A 3DCQA 4IE7A 2RS51 4IESA 4JGYB 4CCMA 3OGGA 1UMZA 3D4KA 4UF0A 3WNLA 3O4AA 3AZXA 5BQUC 2GN7A 2XWJB 2D5FA 5IWFA 2HJIA 3IWZA 1OQ1A 4BYYA 2WLQA 4O9GA 1PGSA 1UY4A 2CGNA 5F5AA 3H7YA 5SV8A 3VBRB 5C9AA 2ZKNA 1I3HA 1NZIA 2ADEA 5DAQA 3SISA 1SBDA 3OJBA 2WN3A 4YZ2A 5ISLA 1ZREA 1S2BA 5FP3A 3H6SE 4GIQA 1PX4A 4CDXA 5JMOA 4BCUA 4GOVA 1EV2A 2D6LX 4PCRA 4MXVA 5CA6A 4K21A 3BRFA 4OUEA 3I3EA 4INDA 4P6AA 4Q0SA 4AGGA 4ZPIA 3QBQA 4CDWA 5FPUA 3VT0A 3AZZA 2FCVA 2DRYA 3KGLA 3IM7A 2ZX2A 3I59B 1C8NA 2PN5A 4P02B 1LB2A 2ZGPA 4Q4W1 4EZ4A 1OOPB 3VZNA 3TN91 4Q0QA 1IG0A 1JI6A 2E33A 2LS6A 3PLQA 1PZ9A 1DZTA 4PLOA 1QJY1 4XQWA 1IHKA 3CRHA 5BNPA 2R49A 4CCLA 2IHOA 5DZEA 5FKBA 4AFBA 2VBDA 3OD0A 4ZFYB 4AEDA 4PIZA 1WD3A 4JAAA 3CEWA 4GB31 1KS4A 3DKQA 5G05L 1XC6A 4LE4A 4GWJA 4QKSA 2ZGOA 4FTSA 5JZGB 3BAGA 4RL7A 2G9GA 2BEAA 1RUJ3 1ND2C 3ZFFC 2EXIA 3I3DA 2DCYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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