3ZX7A

Complex of lysenin with phosphocholine
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
AEGYEQIEVDVVAVWKEGYVYENRGSTSVDQKITITKGMKNVNSETRTVTATHSIGSTISTGDAFEIGSVEVSYSHSHEESQVSMTETEVYESKVIEHTITIPPTSKFTRWQLNADVGGADIEYMYLIDEVTPIGGTQSIPQVITSRAKIIVGRQIILGKTEIRIKHAERKEYMTVVSRKSWPAATLGHSKLFKFVLYEDWGGFRIKTLNTMYSGYEYAYSSDQGGIYFDQGTDNPKQRWAINKSLPLRHGDVVTFMNKYFTRSGLCYDDGPATNVYCLDKREDKWILEVVGLVPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Toxin
molecule keywords LYSENIN
publication title Structures of Lysenin Reveal a Shared Evolutionary Origin for Pore-Forming Proteins and its Mode of Sphingomyelin Recognition.
pubmed doi rcsb
source organism Eisenia fetida
total genus 57
structure length 296
sequence length 296
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.980 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3zx7A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3zx7A02
3BRFA 1JTCA 4ZKTB 1BARA 4IZXA 4IY9A 1RG8A 4J23B 5BXRA 3FJAA 2R9KB 4DEPA 1ISZA 1VCLA 1HWOB 3VT1A 3WA1A 4XFTA 4KEJA 4Z8SB 1FWUA 2AAIB 4QC4A 4Q91A 2ZQNA 1ILR1 3ILAA 4Z9WB 2DS0A 3FJFA 4D8HA 1DLLA 4R6UB 3V0AA 4KEKA 2VXTI 1T9FA 3BADA 3CA1A 1HIBA 2K8RA 1F31A 4EFPA 3PMEA 3AKFA 2ZQOA 1ISWA 3IM6A 1JT4A 4QALA 1S0EA 2KKIA 1NUNA 5E24E 5F8WA 1SR4C 2IWTB 3FJ8A 4HR6C 2K4AB 3MPPG 4JP0A 1PWAA 2FDBM 1IILA 2NTDA 2AFGA 3H6SE 4GP0A 1EVTA 1QXMA 4D0ZA 2D44A 2D22A 2FFUA 1ITBA 1R8OA 2VU9A 4LO0A 2WRYA 2FGFA 3P6IA 4QBVA 1G82A 4JRAA 3HALA 1HWNB 4LO2C 2D24A 3AKIA 3H6RB 3O3QA 4I1BA 1UPSA 3AH2A 5D63A 1BFFA 4Q9GA 1S0CA 4IY8A 1BASA 1CVSA 4G6JA 1Z2VA 1AFCA 4DCKC 5FNWA 3UD9A 4TLPA 4A7ZA 1IRPA 3O44A 2Y9GA 5F8SA 3B9UA 2I1BA 3FJDA 4II0A 4KEIA 3VSFA 1Q03A 2X2TA 3P53A 4P6AA 3FJEA 4L4HA 4LO1C 1XHBA 3CRIA 3N0KA 3CQAA 1E0OA 4FVVA 3FFZA 3OBTA 5BP5A 2QYIB 4DENA 1G9CA 5D62A 3R4SA 5BVPI 3AKGA 4P0JA 4F83A 3FGMA 1BFCA 1PC8B 1L2HA 4I3NA 4EFRA 3LTQA 5D61A 3CAHA 3W9TA 3POKA 1FMMS 1I1BA 2LIQA 4FGFA 3BAQA 4OWLA 4D0TA 4OEEA 2DRYA 4XFUA 4P0LA 1HWMB 1BLDA 2YUGA 3O49A 3OJVA 2VLCA 2AXMA 1DJSB 1K5VA 5FZZA 1FWVA 4QBCA 2K43A 2RQ9A 1TIEA 1JLXA 4I4SA 1IOBA 3FJCA 4I7IA 4I8MA 1YTOA 3S8JA 1W3GA 2NVHA 4I4OA 3VT2A 2FFVA 4JKQA 3OBRA 2MIBA 1V6VA 3BRGC 4GOYA 3HN1A 1XG6A 5B2HA 4X39A 7I1BA 5JMCA 3K1XA 3FJBA 1Q1UA 4X3AA 3BAVA 4EKXB 3I29B 1AVAC 4LO0C 1DFQA 1MD6A 1WD4A 3T8SA 3EF2A 1W3AA 4LO1A 3BTAA 2DRZA 4LO3A 1IJTA 2QN4A 3IM7A 3O4CA 3QYDA 5DUYA 3A07A 4I4YA 1EPWA 4I4RA 3VUOA 1V6UA 3BA5A 2NZ9A 2HW9A 3O4BA 4G1RA 4EEEB 3FJIA 3JRRA 4WBCA 4ZGRB 3CA3A 3Q7XA 1G9BA 4LO7C 1DZDA 1YXWA 3V0BA 2KI4A 5BP5C 3NBNA 4G9MA 2P39A 1DQOA 1AXMA 4YOLA 1I1EA 3E8LC 4ISRA 5GAQA 2L5XA 1HCEA 1V6XA 3FJJA 3VT0A 3OJMA 3HBWA 1IRAX 1WBCA 1JQZA 2BEAA 5BOWA 3D7WB 4ZOTA 3PG0A 3BAUA 1Q04A 3NBEA 3AKHA 2VSAA 1S0FA 2F2FC 21BIA 3IM5A 3PUBA 3BB2A 4I4PA 3WMVA 2D23A 3UD7A 3UDAA 1RY7A 2M49A 3UJ0A 1V6WA 3NJ5A 4KC3A 4J2YA 1HWPB 4I1EA 4IYBA 3AZWA 1PUMB 4X37A 1TOOA 3CRHA 4USPA 2NM1A 4A7YA 3BRDA 3OGFA 2ERMA 3AZVA 4XFSA 3ZC9A 3VEQA 3P6JA 4JKXB 2Y9XE 2DREA 1P63A 3IIRA 2P23A 1FMZA 1JY0A 1SZ6B 3O4DA 1JT5A 2D20A 4LO3C 4ZA3B 5F8YA 2D7RA 3CA5A 1BFBA 5FZYA 3A21A 4QD2C 3BAGA 3RTIB 3ZC8A 4QO3A 4I37A 1M2TB 4H9WA 5DVHA 3FJ9A 3CA4A 3WMUA 1FGAA 5JLVA 2AQZA 1YBIA 5DZUA 1DFCA 3A23A 4QKRA 4KBBA 3A22A 3RMYA 4I6IA 3H6RA 3N7JA 4HA2A 5EC5A 1FN0A 4EB2B 4AN7B 1ISXA 2F2FA 1ONKB 3AH4A 3N7MA 4G9NA 3IAGC 4PC4A 2Y9FA 3JUTA 1MC9A 3BA4A 1YYNA 1TP0A 3FJHA 4I4VA 4I0YA 4IQPA 3WO2A 1G9AA 3I2XA 4G6MA 2KLLA 3FUQA 3UD8A 2KI6B 1BFGA 2D1ZA 2D7IA 2WBCA 4QKSA 6I1BA 3TC2A 1J0SA 2RSTA 1JT7A 31BIA 1BA7A 1DIWA 1GGPB 4I96A 3H6QA 4I2SA 4P0KA 1OQLB 1WD3A 1ABRB 4GP3A 4XKIA 1JT3A 2ZR1B 1D0HA 3OJ2A 1DQGA 1RZOB 3AH1A 1AVXB 2E4MC 3BX1C 3CA0A 3KMVA 2HWAA 2LIEA 3QR5A 3WO4A 3V0AB 1HCDA 2J3PA 2NP0A 1T4QA 2GZBA 2Q9XA 5BXPA 4ZBVB 3F62B 3ZXDA 2HWMA 1FV2A 5HPZA 1FV3A 4ENDA 1CE7B 3RTJB 2XOAA 4JAWA 2ET2A 3NBCA 5I1BA 4I4XA 4X38A 1AVUA 8I1BA 3AJ5A 3FJKA 3BAHA 4JQ0A 4OUJA 5EHAA 2IHOA 4OWJA 1S0LA 2UUSA 2D43A 1AVWB 2VXRA 4HJJA 1JLYA 2GO2A 4J2SA 2NYYA 3VWCA 2F8XC 1FQ9A 4H04A 4IZEA 3CA6A 1DZCA 2BEBA 4EFQA 1EV2A 1NZKA 2MLLB 4ZFYB 4GAFA 2FO1A 4ISQA 2KH2A 3R4UA 3BAOA 3N7KA 3ZX7A 4GOVA 5FZUA 2VSEA 2VUAA 3HOMA 2BFHA 3CRGA 1TWEA 1QQLA 1TFMB 1PZZA 3WO3A 3AJ6A 2E4MA 1KNMA 1YF8B 1HKNA 5BQUC 3SNVA 1ISYA 4CJMA 1K5UA 1N4KA 4LO7B 3BA7A 4OWKA 3RMXA 2HZ9A 1RMLA 1IHKA 4F34A 1AF9A 2MC2A 5FNXA 4IHZA 2Z49A 3WINC 5BXTA 1TTUA 4ZFWB 3F1RA 2RG9B 3I2AA 4A7KA 9ILBA 3HMYA 3O4AA 3RSJA 5EG6C 1XYFA 1W3FA 4OW4A 3N7LA 5F90A 4GAIA 1IT0A 1G9DA 3O5WB 1ISVA 4LO8B 3Q7YA 3C9ZA 1PUUB 3FUOA 5G00A 4I4QA 2ESUA 4I4UA 4L4IA 3HSMA 1Z0HA 4ZFUB 4OEFA 4IONA 3PHZA 4ZLBB 5BXSA 1II4A 2Y9WC 1S0DA 3LLPA 1XZZA 1SR4A 5BQUA 3CU1B 4JPZA 2X2SA 3NBDA 4OEGA 1BLAA 1Z4SA 1EYLA 3OGGA 4QD2B 3UJ4A 3VSZA 3ZXGA 41BIA 2Z48A 4USOA 1WBAA 4J2XA 1M16A 1TWMA 3Q7WA 5DSSB 3WINA 3V79C 4J2KA 4Q9PA 1S0GA 1S0BA 1R8NA 4LO2A 2Q3NB 3V0BB 3MALA 3S8KA 3O4OA 1A8DA 4AN6A 1QQKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TOJA 3WG1A 5AFEA 1C3HA 2MHFA 1V6JA 3ACLA 4IV1B 4NO4A 4Y5TA 4AI0A 1ND2A 4A4AA 4XMAA 5FUNA 3UYJA 3ZC9A 5F8PA 1Q43A 2E7TA 1RG8A 2W08A 3QCWA 4CUBA 5JCTA 2R9KB 4DEPA 2XMLA 3NNJA 5J98B 3WA1A 4YARA 5KC6A 4Q4V1 4UI9L 1H0BA 1MZFA 3S6PA 3C7EA 3VBOB 1DGWA 1AR62 5T3NA 1W6NB 5IFTA 1H8VA 2OS2A 3W20A 5DZGA 3AZZA 4CU8A 2AAIB 3AXEA 3RJRA 2VPVA 1CZTA 4M0HA 3UKTA 4QC4A 3ILAA 1KD7A 1KFUL 1LOAA 3LA3A 4V2VA 1IG0A 3VD7A 4LBMA 1EAH3 1XPWA 3P3PA 3M2MA 4Y5Z0 5EIYB 2VM9A 4AW7A 4OHWA 2DTWA 4Q1PA 3W58A 2QQNA 4HG6B 5F5IA 3ELNA 3V65A 1XNTA 3BADA 1HRV3 2QDNA 2R30A 3LEKA 1RUG3 3TNQA 4CCKA 1F31A 1MS0A 3PU3A 4YW3A 3DKQA 4XFCA 5C9AC 3IMMA 1CAUA 4IE7A 2X10A 4IEYA 2ZQOA 5FZMA 4FPJA 3JZVA 4GULA 4COZA 3TB0A 3ZXFA 3WQ1A 3IM6A 4N43B 1PM4A 1ST8A 1S0EA 2XJUA 4AYUA 1NUNA 2JE7A 2KKIA 3G7DA 2ID4A 5A6QA 2K46A 4FOYA 3JB8A 3HT1A 2EF6A 1GU3A 5AC93 3MPPG 4LPLA 1VAMA 2Z42A 4FO9A 4BQ5A 4N53A 2IXIA 4QKNA 4JP0A 1KEXA 4QXBA 1IILA 2A71A 5I91A 4PI0A 2R041 1XNKA 3F2ZA 4IE6A 3NAPB 5L19A 1JZ7A 2BRTA 2WN3A 4K20A 1AX0A 1CJDA 4P02B 3WSOA 5LRSA 4P14A 1QXMA 4D0ZA 4BQ1A 4XJ9A 3S5QA 2D22A 3H7JA 5FO7B 1O59A 2W9XA 3DEMA 3PUHA 4L99A 4QDRA 2VU9A 4DXZA 1ITBA 2ZGRA 3ZVXA 4I02A 2W1QA 4AEMA 2YU2A 3K3NA 4CDWA 3IAQA 2JIJA 3VV1A 1RUJ1 1LODA 1EYBA 1D4M3 5IHRA 1BBT2 1VBD2 1W99A 5DZFA 2VZ1A 5C5UA 4D69A 2CHHA 2XL9A 5FZ9A 5ISLA 1HWNB 4TWTA 2D24A 1UPSA 2E26A 4KI5M 5FJKA 1JYIA 1S0CA 3M3QA 1RMU3 2QTWB 3OY8A 1OQ1A 4G6JA 1FNYA 4DCKC 4A7ZA 4XF4A 5E88A 2FZ2A 4LTAA 5EFUA 4XJZA 3SCGA 1WGPA 5GLUA 1UY3A 3LIGA 1OD5A 2X2TA 3WV6A 5BNNA 1N1TA 4P6AA 1UF2C 1XNCA 1XHBA 3CRIA 1E0OA 1URXA 2ZEWA 3FFZA 4FVVA 1IKQA 5BP5A 4RHV1 4FOQA 2DUOA 3GNEA 4NHYA 3RDIA 4YG6A 5BVPI 1QJX2 2PHFA 3VHOA 3AKGA 4F83A 2WS93 5J09A 4JC1A 3UKNA 3FGMA 4GALA 4COVA 2CWSA 5A3LA 3I2OA 5ERLA 1AJOA 3UETA 3LTQA 1K5MC 4D6RA 1Z7S1 3POWA 4FPEA 2GC0A 4GWNA 3O0WA 3CAHA 1JOPA 5FUIA 2PHLA 2UY8A 4YGEA 2YROA 5IK7A 1AR92 1I1BA 3AP5A 5F3IA 1N3OA 5A7WA 2J1TA 2BERA 4MHRA 2B42B 2DRYA 4XJUA 4HMZA 1LOGA 4Z1VA 3A0KA 1VMJA 2EIDA 4LBOA 3B9IA 2VMEA 1R083 4OI4A 5F2SA 5FQ0A 4DOUA 2VQAA 1ASJ3 1GFF2 4IV1C 5I8YA 2VLCA 2G19A 1K5VA 4MOAA 1VMFA 2XDVA 4H7MA 1SFYA 1HB1A 1ZNPA 2AEZA 4LLFA 5CVRA 2VG9A 3WP5A 4I4SA 4L8QA 1IOBA 4AHZA 3U10A 1OD3A 4HN0A 3K48A 3FJCA 1LHWA 4I7IA 1WW7A 3S8JA 1X82A 3JXSA 5CAZA 2UU8A 2NVHA 1UXXX 2FFVA 3M1HA 2XBO3 4N53C 2DCZA 2MIBA 4XUPA 4A44A 5IVCA 3HN1A 2ZX0A 4WVMA 4ZXKA 4IETA 4OHYA 4OHZA 3AYAA 3PNAA 5B2HA 1SLLA 4KQ7A 5I8TA 1OLQA 1VR3A 3OYWA 4NRPA 5T50A 3KQRA 3LOBA 2X53S 4P9GA 3BAVA 4XTMA 4O61A 1DFQA 1AR83 1OVPA 1O4YA 1WLCA 3CEWA 1MD6A 5K0UB 5C4WB 2E63A 5TSWA 5CISA 3HVDA 5JZGB 2HWB2 1TMF1 3BTAA 5IVJA 2BNMA 4L11A 3G6JB 2QN4A 3DF0A 1RUD1 3NO8A 2OUJA 2FMYA 1ONAA 3KCYA 5KC5A 1RUI1 5GZCA 5ANQA 3VUOA 4QALA 1X33A 4GMP3 3VB9A 3EYPA 4D3WA 1V6UA 2YBKA 3BA5A 3LFIA 2HW9A 4HJJA 3TEXA 2N7GA 3LKJA 2L9LA 3KT4A 3FJIA 4WBCA 3POSA 2VZRA 2ZCWA 5A80A 5LW9A 5K4LA 3B5LB 2PN5A 4A3XA 3ZDSA 4A6OA 1V6OA 1YXWA 2ZGUA 2UWCA 5BP5C 4RGAA 5FZLA 2ET7A 3CO2A 3AKTA 3NAPC 4PT6A 4CPBA 3A0NA 4MGIE 2P39A 3I97A 1CAWA 1JBCA 1AXMA 1TZOA 4OLLA 2WFF1 3TBDA 1I1EA 2W2IA 3OSDA 3E8LC 4ISRA 5GAQA 3U11A 3PTRB 4XFFA 5LZ6A 1O8PA 1NOVA 2VXJA 2JECA 1CN1A 3J7LA 4CDQA 2RDSA 2RJLA 1XRUA 2VZ3A 3WQBA 5KHIA 1V6XA 3OJMA 2CY6A 2PFWA 3JD71 3HBWA 5A1LA 5CFCA 3JBG1 2BEAA 4DUXA 5JWPA 3D7WB 3BAUA 1W3XA 5FPXA 2FDKA 1IG3A 1NXMA 3M3IA 3TN92 2F2FC 2Y60A 3PUBA 1V6MA 2FBEA 4XBQA 3BB2A 1WKYA 5A3WA 2D5FA 3UKVA 1FOD1 4AEDA 2D23A 5LA9A 5C8CB 3UDAA 1XE7A 4C0HA 2M49A 4BK4A 1W8TA 2VR4A 1JYXA 3NJ5A 5CA6A 1JZ8A 4BXFA 4J2YA 3AZWA 1PUMB 1ZBA1 5ABJB 2WLPA 2BP6A 2DDUA 4TLFA 1PO13 2P34A 1TOOA 1UMZA 2RM21 1F5FA 5FWJA 3BODA 2NM1A 4D94A 5FZIA 3RJ2X 1NE6A 3D4KA 4Q4Y2 1T6BX 3ZN4A 2WO2A 2PA7A 3AZVA 5AC92 3KHCA 1X50A 4XFSA 2YZ4A 4WM8A 2GN3A 3P6JA 4JKXB 4QGMA 3SKVA 3WDYA 2DREA 1E5SA 3IIRA 4HONA 4Q4V2 2XVKA 5CFDB 2AEYA 3H8RA 2XQXA 4GB33 1FMZA 4IYBA 3T2TA 1SZ6B 3SCFA 1UZVA 1JT5A 5A7QA 1ZBE1 3O4DA 4SBVA 1NCRA 3AM2A 3C2UA 1OA3A 4IESA 5FY9A 4ZA3B 4C91A 3POIA 5FZYA 2WWJA 4UFHA 5FXZA 3VL8A 4PIYA 2UY9A 4BISA 4EN0A 3RTIB 1L7RA 2BJSA 1MS1A 3APBA 3LD8A 4OULA 4QX3A 1YUDA 3M3EA 4RS5A 4I37A 3D6EA 1D4M2 3KHBA 3VBSA 1AVBA 3HAGA 1PVC1 1TG7A 2UYAA 2Q8OA 5DDJ1 1YBIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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