4A7KA

Bifunctional aldos-2-ulose dehydratase
Total Genus 204
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
204
sequence length
885
structure length
879
Chain Sequence
QPAALPLFQPQLVQGGRPDGYWVEAFPFRSDSSKCPNIIGYGLGTYDMKSDIQMLVNPYATTNNQSSSWTPVPLAKLDFPVAMHYADITKNGFNDVIITDQYGSSMDDIWAYGGRVSWLENPGELRDNWTMRTIGHSPGMHRLKAGHFTRTDRVQVVAVPIVVASSDLTTPADVIIFTAPDDPRSEQLWQRDVVGTRHLVHEVAIVPAAETDGEMRFDQIILAGRDGVDCLWYDGARWQRHLVGTGLPEERGDPYWGAGSAAVGRVGDDYAGYICSAEAFHGNTVSVYTKPAGSPTGIVRAEWTRHVLDVFGPLNGKHTGSIHQVVCADIDGDGEDEFLVAMMGADPPDFQRTGVWCYKLVDRTNMKFSKTKVSSVSAGRIATANFHSQGSEVDIATISYSVPGYFESPNPSINVFLSTGILAERLDEEVMLRVVRAGSTRFKTEMEFLDVAGKKLTLVVLPPFARLDVERNVSGVKVMAGTVCWADENGKHERVPATRPFGCESMIVSADYLESGEEGAILVLYKPSSTSGRPPFRSMDELVAHNLFPAYVPDSVRAMKFPWVRCADRPWAHGRFKDLDFFNLIGFHVNFADDSAAVLAHVQLWTAGIGVSAGFHNHVEASFCEIHACIANGTGRGGMRWATVPDANFNPDSPNLEDTELIVVPDMHEHGPLWRTRPDGHPLLRMNDTIDYPWHAWLAGAGNPSPQAFDVWVAFEFPGFETFSTPPPPRVLEPGRYAIRFGDPHQTASLALQKNDATDGTPVLALLDLDGGPSPQAWNISHVPGTDMYEIAHAKTGSLVCARWPPVKNQRVAGTHSPAAMGLTSRWAVTKNTKGQITFRLPEAPDHGPLFLSVSAIDAIPVIVQGDSIELSAWSLVPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of Bifunctional Aldos-2-Ulose Dehydratase/Isomerase from Phanerochaete Chrysosporium with the Reaction Intermediate Ascopyrone M.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALDOS-2-ULOSE DEHYDRATASE
molecule tags Lyase
source organism Phanerochaete chrysosporium
total genus 204
structure length 879
sequence length 885
ec nomenclature ec 4.2.1.110: Aldos-2-ulose dehydratase.
pdb deposition date 2011-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18056 PBP3 Penicillin Binding Protein 3 Domain
A PF18637 AUDH_Cupin Aldos-2-ulose dehydratase/isomerase (AUDH) Cupin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.990 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4a7kA02
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4a7kA03
1PUUB 5D61A 4IY8A 1ABRB 3FJFA 1G82A 1QQLA 1WD3A 2VSAA 4Q91A 9ILBA 4EB2B 2D7IA 1RY7A 4Q9PA 3FJAA 3RTJB 2FFVA 1BA7A 3HMYA 2HZ9A 3FFZA 1XHBA 1YBIA 2D23A 5FNXA 2GZBA 4Z9WB 1S0DA 2Y9XE 2UUSA 3FJBA 2FO1A 1S0CA 4LO7B 1V6XA 3IIRA 1MC9A 1F31A 4I4UA 5DUYA 5FZYA 2AQZA 1A8DA 1AFCA 4EFPA 2MIBA 5E24E 1JY0A 2KI6B 3RMYA 3E8LC 1CE7B 1ILR1 4EFQA 5BOWA 3HOMA 3AH1A 3NBNA 3WINC 3AKGA 1ISWA 5BXPA 1DZCA 3VSZA 4EKXB 4OUJA 3CA0A 2D1ZA 1DQOA 2KKIA 4H04A 1II4A 4I4QA 3FJ8A 3BAOA 3RTIB 4ZA3B 1AVAC 1ISZA 1YTOA 4OEFA 2VUAA 3HALA 4I4XA 1J0SA 1BASA 4JPZA 2X2SA 4II0A 4OW4A 2ET2A 3CU1B 1HCDA 4ENDA 3BAUA 3O4CA 4YOLA 3R4SA 3WINA 1DIWA 1FWVA 1DFQA 1W3FA 3BA7A 3CA4A 3T8SA 3S8KA 2R9KB 5F8YA 2KH2A 2Z48A 1SR4A 1TWMA 3WO4A 2NM1A 2QYIB 4D0ZA 2BFHA 1DLLA 2E4MC 3O5WB 3A23A 4X3AA 3A21A 3P6JA 3IM6A 4IY9A 3CA5A 1DFCA 1XYFA 2Y9FA 3V0BA 3FJKA 2LIEA 1JT7A 3BAGA 4GOVA 4AN7B 2VSEA 1V6VA 4D8HA 1K5UA 3OJMA 3H6SE 3JRRA 1S0GA 4GP3A 4JAWA 2KLLA 4QALA 5D62A 3UJ4A 5DSSB 4H9WA 1EV2A 4XKIA 3AH2A 1ISVA 1T9FA 2NVHA 2DS0A 3AKFA 3N7KA 1I1EA 2FGFA 1PWAA 2D22A 2K43A 4PC4A 3D7WB 1FGAA 3O4DA 2ERMA 4GAFA 3UD9A 2AXMA 4ZGRB 3BB2A 5BXSA 3CA6A 5EHAA 2DREA 3C9ZA 4J2SA 4EEEB 2D20A 3PUBA 3BTAA 1Z2VA 4DENA 2QN4A 4P0KA 4USOA 1IOBA 2D24A 3CA3A 1PUMB 4I1BA 5BP5C 1AF9A 3CRGA 3H6RA 3WMVA 4J23B 2HWAA 3ZX7A 5BQUA 4IYBA 2VXTI 3HSMA 4LO8B 1AXMA 2J3PA 4ISRA 1Z0HA 4LO2C 1V6UA 3VT0A 3CA1A 3CQAA 5DZUA 1BFBA 1TIEA 3IM5A 1N4KA 2P39A 3VEQA 3A07A 1I1BA 4LO3C 1EYLA 3WO3A 3I2XA 3AZVA 2NYYA 3OGGA 1UPSA 1Q03A 2NZ9A 1QXMA 4HA2A 4LO2A 3O44A 2L5XA 1TWEA 4I3NA 4QBCA 3AJ5A 4I0YA 2KI4A 4JKQA 4X38A 3OJ2A 4OWJA 3FUQA 4J2KA 4LO7C 5DVHA 1BFGA 7I1BA 1Q04A 2IWTB 3AJ6A 1TTUA 4ZOTA 3IAGC 3FJIA 4QD2B 4G9MA 1SZ6B 2D7RA 4QD2C 4DEPA 4GOYA 4P0JA 3QYDA 3CAHA 3N7MA 1FWUA 3CRHA 3UJ0A 1E0OA 2ESUA 1M2TB 1DJSB 3EF2A 4G6MA 3BRGC 1HKNA 3VUOA 3N0KA 1QQKA 2NP0A 1HWMB 4OWLA 1PC8B 4Z8SB 1EPWA 4A7KA 1JQZA 3BAHA 2F2FC 5EG6C 3UD7A 5BXRA 3ZC8A 1ISXA 1L2HA 3POKA 3ZXGA 1DZDA 2M49A 1G9BA 3BA5A 4I4VA 4LO0C 1BFCA 3HBWA 4J2YA 4G1RA 3Q7WA 2RG9B 4A7YA 3FJHA 4F34A 4I4YA 3V0BB 4KC3A 4HJJA 4L4HA 2Q9XA 4JKXB 4JP0A 5FZUA 5B2HA 1AVWB 3FJDA 4J2XA 2Y9GA 2F2FA 1JT4A 4I4OA 2WRYA 2E4MA 4IONA 1CVSA 1FV2A 4DCKC 4FVVA 41BIA 8I1BA 1V6WA 4XFTA 4KBBA 2AAIB 1S0FA 3F62B 5HPZA 3O4OA 4XFUA 3WMUA 6I1BA 3VT1A 4LO1C 1PZZA 4I4RA 3O4AA 4X37A 1MD6A 2F8XC 4G6JA 3RMXA 5JMCA 3O4BA 5G00A 5F8SA 1TP0A 4QBVA 4OEGA 2ZQNA 4KEIA 2DRZA 3H6RB 3PHZA 2DRYA 3NBEA 5EC5A 3FUOA 1IILA 3OBTA 2D44A 4HR6C 4I8MA 4QO3A 1IRAX 4X39A 4ZKTB 2FFUA 2I1BA 3BRFA 4JRAA 4QKRA 3VT2A 1FMZA 3VWCA 3V79C 3BX1C 1EVTA 3K1XA 5BP5A 3TC2A 1HIBA 3SNVA 4XFSA 1BLAA 3BRDA 1Q1UA 3RSJA 3V0AA 1BFFA 3BAQA 3OGFA 1FV3A 5FNWA 1G9DA 2MLLB 4OEEA 2BEBA 4ZFYB 1BARA 1FMMS 2GO2A 3F1RA 4KEJA 2FDBM 4GP0A 2AFGA 4P0LA 1P63A 3A22A 2VU9A 5JLVA 3JUTA 3Q7XA 3PG0A 1IT0A 1R8OA 1WBCA 1IHKA 2ZR1B 4LO3A 3P53A 3QR5A 3FGMA 1T4QA 4ISQA 3H6QA 4CJMA 1DQGA 3LTQA 1G9CA 4FGFA 3BAVA 3ZC9A 2LIQA 3NJ5A 4I4PA 4JQ0A 1JT3A 1NZKA 4ZBVB 1ISYA 1BLDA 5F8WA 2XOAA 3AZWA 4AN6A 3FJJA 4G9NA 1IRPA 3FJ9A 3BADA 1YYNA 2RQ9A 3O3QA 3ZXDA 1KNMA 3BA4A 4IHZA 3AKHA 4QC4A 3CRIA 4WBCA 1HCEA 1R8NA 4L4IA 3VSFA 4A7ZA 3OJVA 3WO2A 3HN1A 1SR4C 1G9AA 4ZFWB 1NUNA 4I1EA 4I2SA 5BVPI 4USPA 1WBAA 1ONKB 2IHOA 4P6AA 2Z49A 3AKIA 4I37A 4Q9GA 1WD4A 3MALA 1AVXB 4ZFUB 3FJEA 1YXWA 1S0EA 2D43A 3LLPA 1FN0A 1GGPB 5FZZA 2P23A 4IZEA 4R6UB 4LO0A 1FQ9A 3UDAA 4OWKA 3I2AA 21BIA 4D0TA 2VLCA 3PMEA 4I6IA 2Y9WC 3KMVA 4I4SA 2K8RA 3R4UA 2MC2A 1JLYA 5GAQA 1YF8B 4F83A 3Q7YA 3O49A 3S8JA 3WA1A 2HWMA 2RSTA 3W9TA 3AH4A 2NTDA 1M16A 3N7LA 4I96A 3OBRA 1S0BA 4ZLBB 1D0HA 1W3AA 31BIA 1VCLA 4LO1A 2YUGA 3IM7A 4IZXA 1S0LA 4EFRA 3NBDA 5I1BA 2X2TA 2ZQOA 4KEKA 1RZOB 5BQUC 4QKSA 3MPPG 2WBCA 2K4AB 1AVUA 2Q3NB 5D63A 3P6IA 3UD8A 1HWNB 1XZZA 3ILAA 1RMLA 1ITBA 1OQLB 4IQPA 4GAIA 3FJCA 1HWOB 3B9UA 5BXTA 3NBCA 3V0AB 2BEAA 2HW9A 3I29B 2VXRA 1TFMB 3N7JA 4I7IA 1K5VA 1XG6A 5F90A 1HWPB 1TOOA 1JT5A 1JLXA 1JTCA 4TLPA 1RG8A 1W3GA 1Z4SA 1IJTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CKHA 1JZ3A 4URAA 1WLTA 3BN6A 1O5LA 4L11A 4JGYC 5FFOC 4Z2WA 2YFUA 5EQUA 4LORA 1FMD1 3Q8EA 1YQ6A 3WW2A 1G82A 1WD3A 3RPQA 1OUSA 5FZ6A 1UPIA 1D4M1 3ZN6A 1PIV3 2VCBA 1DZQA 5EYXA 1RMU3 3IN9A 4LKSA 1VE0A 5EJ3A 1VP6A 1PMHX 4AQ6A 1HV1A 1WW4A 3JB8A 3WDWA 3LFIA 5GLUA 2FFVA 1GP5A 4R52A 2Y6HA 3HMYA 1QJEA 1FYUA 2BW8A 1K45A 1X9PA 3PU3A 1CQ9A 3K46A 4M0HA 1BJQA 2DTWA 4N43C 3I54A 4NO4A 3SMHA 1ZVFA 3UESA 1XHBA 4DMIA 4A42A 3ZOIA 1TEIA 3HQRA 4MGYE 4Z9WB 3ACGA 1APNA 5FZ3A 1HJFA 2YGLA 3JU9A 4MGTA 3FJBA 2FO1A 1JI6A 1S0CA 3KGLA 4LITA 3IIRA 1MC9A 1CZVA 1F31A 5DUYA 5FZYA 3J7LA 1NXD1 1ULOA 2D98A 2W47A 3W21A 2AQZA 4M3CE 4EFPA 3WDTA 4KL1A 2VM9A 2BBVA 4DFSA 5IFPA 4WM7C 1JZ5A 2WN2A 1NE4A 4C90A 3E8LC 1CE7B 4NPLA 2FHRA 5AVPA 4GIQA 5FIXA 4N43A 1QXJA 4KH9A 5FY4A 3E6CC 5BOWA 1W06A 4RHV1 2ID4A 2CAUA 4QT6A 5JWPA 1ISWA 5FY1A 1DZCA 1UOGA 3TEYA 5FYIA 3EYPA 1WCDJ 5BXTA 1RUG1 4YG3A 4XFIA 1DQOA 2QZ2A 4I4QA 1K5MB 4IEVA 4CDUA 1UWWA 2R1DA 2PHRA 4LO6B 1K5MC 1R091 1RHI3 1TNRA 3ATGA 4W6WA 1JHNA 3DKQA 3NAPA 4JPZA 4OW4A 5LATA 4UFLA 3SKVA 1S0JA 1V70A 3AZYA 3WDYA 1NLRA 5BNPB 3NNMA 4NROA 2D6OX 2D7FA 1COV1 2QKDA 2VCCA 4ENDA 1B35C 4D3WA 3O4CA 1DIWA 3OPTA 1MZ6A 1NOVA 5IATA 5FLJA 1X8EA 3PURA 3ZYGA 1W3FA 1V6NA 1BMV1 4QXCA 4Y20B 5F3CA 4MX3A 4NHMA 3WDXA 5J96B 1SR4A 1TWMA 4QPGA 5DPNA 4BXFA 3BOPA 5A3TA 1JZ4A 3ROUA 1RXFA 3O14A 3IDEA 1RJ8A 3H8XA 4CEWB 3MICA 1AL23 4S2FA 4UY4A 3J7MA 3OGVA 1M4WA 1U5IA 3GBWA 1GSLA 4DZGA 4X3AA 5A3NA 1URXA 3B7MA 4D8MA 2GNTA 4CEWC 3I3QA 1KJLA 4LA2A 5CG8A 4LLFA 1AX0A 5D2AA 3CA5A 2E33A 1DFCA 1SG3A 2FDKA 1OD5A 4XDQA 2LIEA 3NV4A 2JDKA 1JT7A 4I2OA 3IWZA 3LSDA 4E2SA 5CZKA 2HBUA 4GB32 2V73A 1NA1C 1UYXA 4O9GA 4GP3A 2JG9B 3MIDA 4FPEA 3N9MA 4YM0A 4QB2A 2E9QA 2RDNA 5HBAA 3UJ4A 4PBPA 1H8TB 4UW5A 4XDPA 3AL5A 4XXPA 3L2YA 2CGPA 2WA4A 1H8TC 1PIV2 5EP9A 3J26N 3VD3A 1RMU2 2MNGA 3NO8A 4NHKA 5F5QA 4NRPA 1GWMA 3IMNA 1UO9A 3O4DA 4QQ2A 3WG3A 2VAUA 3UKVA 2OQ7A 2R043 5FLIA 3BB2A 3CA6A 2VD7A 4FTBA 4TSVA 2E63A 1UZVA 4MO3M 4CU6A 3A4UA 4MHUA 2D20A 5FZFA 3PUBA 4XF4A 4XQWA 5IVYA 4NHLA 5LK5A 3TWIA 2QN4A 4P0KA 2IXLA 3WP6A 4AF9A 1Y9GA 4INDA 1REFA 3PUHA 4FO9A 3GJBA 4CPBD 3RFRA 1FX5A 2WC2A 3W5MA 4I1BA 1JZ2A 1Y9QA 1AF9A 4PLMA 4K6BA 3UJQA 3CRGA 3H6RA 3MO4A 2RJLA 5FXZA 4J23B 1YJLA 2W68A 3VDDA 3Q8AA 2DFCA 3ZX7A 5FQ0A 3VD7A 1LOEA 3GYDA 5T3NA 2JEMA 2JDUA 2XJVA 2X29A 1H6XA 4LO8B 4W6XA 4HT1T 5KWRA 3NQHA 2XQXA 4KMQA 1RITA 5E89A 5FPUA 2UU8A 1LCLA 1H9PA 4K7JA 1QMJA 3CQAA 4GJZA 4YVSB 2C9AA 2XR4A 1DGLA 2QZ3A 5FZCA 3HD8B 3S7IA 4XYXA 2WNUC 1OQEA 2W3JA 3UNPA 4B4PA 3ZFGB 3VEQA 1BK0A 1UYZA 3KVBA 5FRAA 4LO3C 2X5IA 3FE5A 5J36A 1JN2P 1NE6A 5FPVA 3OPWA 1XRUA 1K42A 3WO3A 2ZEYA 1UKRA 2E53A 3OGGA 5HPOA 4EN6B 2WQ4A 2JG8B 3FLTA 3S57A 3AJZA 1TG7A 4DXSA 5C8WA 1QXMA 1AL22 4LBOA 1TWEA 4BQ2A 3ACFA 2JG8C 4YM2A 4ZZ8A 1NCRA 1E5IA 4MHRA 3OB8A 4QB6A 4EN7B 4QBCA 1W8NA 4I0YA 2WNVA 4KBZA 2HKXA 5E88A 3T2TA 1W6NA 4LO7C 4XFFA 1CZTA 4NRMA 5GZCA 4K1ZA 2BPA2 1Z7S3 2B9VA 2ORZA 4RGAA 1OLME 2GC1A 2H0VA 3RRDA 1GFF2 1I5PA 2P2KA 4KWKA 3FJIA 4QD2B 2GMMA 4GB31 1QJZA 4FOVA 3U11A 3WCSA 3RQ0A 4NAOA 4LK6A 1NZCA 2D6NA 4AI9A 4QD2C 1VR3A 2C24A 1D7PM 2GAUA 2PFWA 3ZFEC 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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