4A7KA

Bifunctional aldos-2-ulose dehydratase
Total Genus 204
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
204
sequence length
885
structure length
879
Chain Sequence
QPAALPLFQPQLVQGGRPDGYWVEAFPFRSDSSKCPNIIGYGLGTYDMKSDIQMLVNPYATTNNQSSSWTPVPLAKLDFPVAMHYADITKNGFNDVIITDQYGSSMDDIWAYGGRVSWLENPGELRDNWTMRTIGHSPGMHRLKAGHFTRTDRVQVVAVPIVVASSDLTTPADVIIFTAPDDPRSEQLWQRDVVGTRHLVHEVAIVPAAETDGEMRFDQIILAGRDGVDCLWYDGARWQRHLVGTGLPEERGDPYWGAGSAAVGRVGDDYAGYICSAEAFHGNTVSVYTKPAGSPTGIVRAEWTRHVLDVFGPLNGKHTGSIHQVVCADIDGDGEDEFLVAMMGADPPDFQRTGVWCYKLVDRTNMKFSKTKVSSVSAGRIATANFHSQGSEVDIATISYSVPGYFESPNPSINVFLSTGILAERLDEEVMLRVVRAGSTRFKTEMEFLDVAGKKLTLVVLPPFARLDVERNVSGVKVMAGTVCWADENGKHERVPATRPFGCESMIVSADYLESGEEGAILVLYKPSSTSGRPPFRSMDELVAHNLFPAYVPDSVRAMKFPWVRCADRPWAHGRFKDLDFFNLIGFHVNFADDSAAVLAHVQLWTAGIGVSAGFHNHVEASFCEIHACIANGTGRGGMRWATVPDANFNPDSPNLEDTELIVVPDMHEHGPLWRTRPDGHPLLRMNDTIDYPWHAWLAGAGNPSPQAFDVWVAFEFPGFETFSTPPPPRVLEPGRYAIRFGDPHQTASLALQKNDATDGTPVLALLDLDGGPSPQAWNISHVPGTDMYEIAHAKTGSLVCARWPPVKNQRVAGTHSPAAMGLTSRWAVTKNTKGQITFRLPEAPDHGPLFLSVSAIDAIPVIVQGDSIELSAWSLVPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of Bifunctional Aldos-2-Ulose Dehydratase/Isomerase from Phanerochaete Chrysosporium with the Reaction Intermediate Ascopyrone M.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Phanerochaete chrysosporium
molecule keywords ALDOS-2-ULOSE DEHYDRATASE
total genus 204
structure length 879
sequence length 885
ec nomenclature ec 4.2.1.110: Aldos-2-ulose dehydratase.
pdb deposition date 2011-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18056 PBP3 Penicillin Binding Protein 3 Domain
A PF18637 AUDH_Cupin Aldos-2-ulose dehydratase/isomerase (AUDH) Cupin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.990 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4a7kA02
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4a7kA03
1DZDA 4XKIA 4I2SA 4ZFYB 1QQLA 4IHZA 1BFBA 4QALA 4QBVA 4KC3A 4J2XA 1ONKB 3HOMA 2ERMA 4J2SA 1S0CA 4GP3A 4PC4A 1AVXB 2IWTB 5BP5C 1V6VA 3NBEA 3WINC 1BFCA 3BRFA 4I4QA 4Q91A 3FJHA 5GAQA 4IY9A 2LIQA 2QYIB 1EVTA 3FJ8A 4JKQA 3HBWA 1BLAA 2ESUA 3O3QA 4LO7B 4X3AA 3BAUA 5HPZA 4J2KA 4ZOTA 3MPPG 3B9UA 2BFHA 3AJ5A 3O4BA 4H9WA 4EFPA 3FUOA 1XHBA 4I8MA 4OWKA 3VEQA 2KLLA 3AZVA 2MLLB 3FJIA 1ITBA 3I2XA 4AN6A 1FMZA 3RTJB 1JLYA 1Q03A 4I0YA 31BIA 4I4PA 3QR5A 3VT0A 3BX1C 3BAHA 4I1BA 4J2YA 3IM7A 1DLLA 4IZXA 3WMVA 1UPSA 4A7ZA 5BVPI 3AJ6A 1DJSB 3VT1A 2RG9B 4DCKC 1JT4A 4ZBVB 1S0BA 4I96A 5BP5A 3WINA 3V0BA 3P53A 4Q9PA 4OW4A 2LIEA 3VSFA 1HKNA 3H6RA 4JRAA 1S0GA 4CJMA 3CA0A 3AKGA 5DUYA 5BXSA 1TFMB 1TOOA 4LO8B 3VUOA 1JT3A 4ZA3B 1JQZA 3K1XA 3CRHA 2X2TA 2YUGA 1FWVA 4I37A 4G6JA 1YXWA 3LLPA 2Y9GA 1DQGA 2HWMA 3BB2A 4ISRA 2FO1A 4JQ0A 3SNVA 3OJMA 1ABRB 3A21A 2D7RA 4YOLA 3OGGA 1G9AA 8I1BA 3PHZA 1BA7A 1QXMA 4L4IA 1AVAC 4QKRA 4I7IA 2D24A 2IHOA 1DFCA 3I29B 3AKFA 2WRYA 4F83A 3BADA 5DVHA 2NVHA 4G6MA 4P0KA 1ISWA 4LO2A 2ZQNA 1BASA 9ILBA 4EEEB 5FZZA 2R9KB 3JRRA 2ZQOA 1OQLB 4KEIA 4XFUA 3ZXGA 2HWAA 1Q04A 4A7KA 3WA1A 4GAIA 2DRYA 1J0SA 5DSSB 4II0A 3S8JA 4KEJA 1NZKA 2BEBA 1XYFA 3BRGC 1YTOA 3IM5A 4ZKTB 3CA6A 3N7KA 1HWPB 2F2FA 1N4KA 3AH4A 3ILAA 4I4UA 4QO3A 2I1BA 4I4VA 1II4A 1ISYA 4WBCA 4QC4A 1L2HA 2X2SA 4GAFA 2FDBM 2NP0A 1A8DA 2D1ZA 3BAOA 3O4AA 4LO0A 2BEAA 3FJJA 1WD3A 2DS0A 3H6QA 3FUQA 2FGFA 4P0LA 4I4RA 1GGPB 2NM1A 1BLDA 1S0LA 3O4OA 3WO3A 1CE7B 1F31A 1RY7A 1EPWA 4G9NA 1MD6A 1BARA 5FNXA 5FNWA 2WBCA 2VU9A 3FJFA 3HALA 4J23B 1E0OA 1WBAA 4XFTA 3RSJA 1TP0A 2AQZA 3AH2A 3F62B 3HN1A 4D0ZA 3NBDA 3ZX7A 1JT5A 2VSAA 5F8SA 4EKXB 5JLVA 1JY0A 2P39A 1I1BA 5F90A 1K5VA 2VXTI 2ET2A 1V6XA 1Z2VA 4IZEA 1SZ6B 1DZCA 3VWCA 1DIWA 3V79C 3A23A 1PUMB 5BQUA 5DZUA 5BXTA 1G9BA 2E4MA 4G1RA 4ZLBB 4EFRA 3D7WB 4LO2C 1G82A 4JAWA 3RTIB 1RMLA 1JLXA 4I3NA 1HCEA 1EV2A 4Q9GA 3OJ2A 2D7IA 3AH1A 4DEPA 4LO7C 4GP0A 3FJAA 3FJEA 1V6WA 2D43A 3T8SA 3IM6A 1JT7A 1S0FA 1WD4A 1Z0HA 3PG0A 3BA4A 3C9ZA 3Q7XA 4Z8SB 2KH2A 3IAGC 3CAHA 41BIA 5D62A 5FZYA 3RMYA 1DQOA 2NZ9A 2ZR1B 3V0AB 3CA5A 2F2FC 3TC2A 4ZFUB 3BTAA 3I2AA 3BA7A 2HW9A 3FJ9A 3IIRA 1TTUA 2D20A 3UD8A 1HCDA 2RSTA 1Z4SA 1I1EA 4LO3A 1T4QA 5D61A 2K43A 1FN0A 4X37A 4P0JA 4I6IA 1SR4C 3FJKA 4QD2B 4LO0C 4ZFWB 3ZC9A 1ISVA 4P6AA 3BAGA 1PUUB 2M49A 3O44A 4H04A 1MC9A 1TWMA 4JPZA 2K4AB 2GZBA 4JKXB 3OBTA 1PWAA 3ZXDA 2D44A 4OWJA 2DRZA 4Z9WB 2VLCA 3BAQA 4HJJA 2VXRA 1AF9A 2KI6B 1YBIA 1IJTA 2VUAA 4XFSA 21BIA 1RG8A 3OJVA 4TLPA 4USPA 4KBBA 2FFUA 3EF2A 5EG6C 1QQKA 3E8LC 2KI4A 5I1BA 3BA5A 3KMVA 5BXRA 4OWLA 2K8RA 3FFZA 4USOA 1AXMA 3CRIA 4GOYA 5BQUC 7I1BA 1EYLA 1FMMS 2E4MC 3HMYA 2D22A 4IQPA 3P6IA 1HIBA 4A7YA 1V6UA 1W3GA 2HZ9A 4ENDA 1W3FA 3CRGA 1AVWB 1FWUA 1T9FA 3NBNA 2Y9WC 3CA4A 1XG6A 1IT0A 3RMXA 1SR4A 3CA3A 1RZOB 1FGAA 2Z48A 3Q7WA 4OEGA 4IYBA 1FV3A 2MIBA 1IILA 2RQ9A 3W9TA 1FV2A 4HA2A 3OGFA 3FGMA 4I4YA 1D0HA 4I4SA 4I1EA 3OBRA 1AVUA 2Y9XE 4QBCA 3S8KA 1CVSA 1P63A 1IOBA 4G9MA 2AAIB 1K5UA 2DREA 3ZC8A 1ISXA 1FQ9A 4LO3C 3AKHA 5D63A 2L5XA 4DENA 3V0AA 5FZUA 4R6UB 1PC8B 1S0EA 2F8XC 4FVVA 4X38A 4FGFA 1ILR1 3WO4A 1HWMB 3FJCA 2D23A 5B2HA 3FJDA 2Y9FA 4I4XA 3N7JA 5JMCA 4LO1A 1HWOB 3O4DA 3UDAA 4QKSA 6I1BA 1IRPA 1M2TB 2GO2A 2VSEA 3QYDA 2AFGA 3NJ5A 1G9DA 5E24E 2J3PA 4OUJA 2FFVA 3BRDA 3MALA 3P6JA 1PZZA 3POKA 1G9CA 4KEKA 1BFFA 5F8WA 1WBCA 2UUSA 2Q3NB 4EFQA 4IONA 1YF8B 3A22A 3N7MA 3AZWA 1BFGA 2P23A 1KNMA 4OEEA 3VT2A 5G00A 3UD9A 4X39A 4IY8A 1W3AA 1VCLA 3O49A 3O4CA 1R8OA 1JTCA 2NTDA 3UJ4A 3UD7A 3R4SA 1XZZA 3LTQA 1NUNA 5BOWA 1M16A 4ZGRB 3PMEA 3N7LA 5BXPA 2Q9XA 3CU1B 3NBCA 2MC2A 3HSMA 4ISQA 1DFQA 4EB2B 2QN4A 3WMUA 3O5WB 3FJBA 3H6SE 3CQAA 3N0KA 1IRAX 1Q1UA 2AXMA 3BAVA 4I4OA 3UJ0A 4D0TA 3WO2A 3V0BB 5EHAA 3PUBA 4L4HA 2Z49A 3A07A 4F34A 1TWEA 3R4UA 3CA1A 1HWNB 4AN7B 1IHKA 3H6RB 3JUTA 4HR6C 1S0DA 2NYYA 1ISZA 5EC5A 1YYNA 4JP0A 1R8NA 5F8YA 3F1RA 3AKIA 2KKIA 4LO1C 4QD2C 2XOAA 3Q7YA 4D8HA 1AFCA 1TIEA 4OEFA 4GOVA 3VSZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DVGA 4XKIA 3KV9A 1EP0A 4XUTA 3H42B 5FYIA 5DAVA 4AI3A 2D3PA 2RS13 3AFKA 1DYPA 1Q5OA 1O8PA 3FX3A 3HOMA 4QALA 1UMIA 4P9WA 4P9LA 1UX7A 2WNVC 5IYYA 4GP3A 4JGZB 2V5DA 4PC4A 1AVXB 4QKBA 2PLV2 5BP5C 3I97A 5I0DA 4ZY9A 2XL7A 3Q9OA 4NIDA 3NNJA 3OEBA 1F5JA 4ZFUB 1X50A 2PTMA 3I2JA 4P9GA 4CSWA 3BRFA 5GAQA 2WQ4A 4KWLA 3PVNA 1W0PA 4TYSA 3WD5A 1PVC3 5CFDB 1EVTA 2QYIB 4UW5A 4JKQA 4G9SB 5LEKA 4F8AA 2JDYA 4BQ2A 3LPFA 1BBT3 3SH3A 3SCHA 2XJVA 3NV2A 4LXLA 3PU8A 3O3QA 1SPPB 3DCQA 3WT3A 1AX1A 3C8XA 3BAUA 1W6MB 4D7YA 2ZGRA 2QTWB 1CAWB 2WNUB 3ACFA 4W6YA 3ZSLA 4ZOTA 1VAKA 2DCJA 2GP3A 1D4M1 4CDXB 4E4SA 1YHFA 1QDOA 1MQTA 4FP2A 2BFHA 1W2NA 2JG8C 3RDIA 1QH7A 2FCUA 3QBQA 5F5CA 1DHKB 2G9FA 4RR3B 4CCNA 1UZZA 4QD2A 2I2SA 2Q1MA 4OWKA 3EBRA 2WYFA 3ACLA 4NUBA 2C1FA 2R7EB 4Q0VA 1LHUA 4L11A 1PIV1 4H55A 3P1IA 4LIVA 2DCYA 4PF1A 3VD5A 1GP6A 2RS12 3C7HA 4AN6A 5CFCC 1JYTA 4QPGB 3T1LA 3BTYA 3SC7X 4P5YA 3H0OA 3OD4A 3LIHA 1HJFA 4P14A 3MEPA 5K8SA 3VT0A 1FMD3 1JOPA 1YQ5A 3JD73 1L3JA 4HETA 4HONA 2BNNA 1NLRA 1ZRRA 4XURA 4A7ZA 3GF6A 1YRZA 2OVUA 3AM2A 3AJ6A 1ONAA 2VZTA 4NROA 1CWPA 1NXMA 3ZO0B 4W4ZA 2J1VA 3V0BA 1CAUA 2J42A 3K3OA 3P53A 1UOGA 2PLV1 4HKWA 1V9U2 1W05A 2JG9B 4NPLA 4Q9PA 5T5PA 3M70A 4GB33 4RL7A 3VSFA 1HV1A 1VLNA 2PYTA 5I91A 4YYOA 4AR2A 3CKHA 3J9SA 2BEOA 1ZZ6A 4WZCA 3LEMA 5F5QA 4QDSA 3ZFEB 4BWOA 1WLWA 3JCIA 5FPUA 1FPN2 3AKPA 1GR3A 1QJX3 1UX6A 4KGGA 1X8MA 2J1EA 3AYAA 3NMBA 3PURA 4Q0SA 2D3SA 1H1MA 1F9KA 4B1MA 2ZGKA 2W39A 2YC4A 1TFMB 3QACA 1TOOA 3AJ5A 3AZYA 4XXAA 1JT3A 1JN2P 1XJAA 4LBQD 1JQZA 1FWVA 2HWC1 4NRQA 4Q27A 4HXCA 4MGKE 4U2AA 5BNPC 1BEV3 4QX3A 4YZ3A 2DU0A 2EVXA 1AR81 2HWMA 1HLCA 2ZZQA 2UURA 3DYOA 4JQ0A 1DQ0A 3ZFGC 4QGLA 5FV3A 3L2YA 4E8CA 4LBQB 4WM8A 2JE9A 4KG8A 3VBSB 2RS11 1MS1A 4XHXA 4Q4W2 4L92A 5EYYA 1PGL2 2HWB3 3PU3A 3AKFA 3WDUA 1CZTA 4YW1A 3SQOA 1C4RA 4IEUA 1AL0G 3BADA 4KWUA 2Y6LA 4G6MA 4P0KA 2VJXA 2F4PA 4JKLA 5FZ8A 3WX5A 2E31A 1K5MB 9ILBA 4EEEB 3GJAA 3JBG1 4PIZA 1Q56A 2R9KB 4GB32 2B9UA 5I8SA 3D3AA 2CGNA 1V00A 4L8QA 3GBGA 5FY0A 3AMPA 4CUAA 5DAXA 2ZX0A 5A7WA 1PVC1 5F32A 1KEXA 4KEIA 3FC0A 4LO7A 2HWAA 1BBT1 4COZA 1R093 4XFCA 4B3NA 4CDWA 1SLLA 5DSSB 4II0A 3OY8B 3MW4A 3S8JA 4KEJA 2VZPA 5EJ3A 4MH0E 5FZ6A 2JDKA 3BRGC 4FOQA 4Q4X3 1VE0A 4DPNA 4I3GA 1OOPA 2BFUL 2VM9A 2WZR3 3AVSA 4P5HA 3IM5A 3O1UA 2WA4A 3N7KA 5HV0A 2PHDA 3J8F2 1BEV2 1N4KA 3ILAA 2A3WA 3W9AA 4Z92B 5FP4A 1ACCA 1GOGA 1YC61 4QO3A 5CA6A 2TEPA 2UWBA 1MS5A 1V6NA 3NJVA 4I4VA 4H2AA 4J25A 2WR9A 4FAGA 5LEJA 2QVSB 5C4WC 2ZMLA 2QQIA 2DURA 5LK7B 1QNWA 4OYUA 2XOMA 4QKDA 2FDBM 4HK8A 3U11A 5E88A 2GMPA 1OKOA 5C5UA 1OLQA 4FPOB 3E6CC 1GZWB 2D1ZA 3J7LA 5KR7A 3RYKA 1BXHA 1FMD1 2UY9A 2ZGUA 3JD71 5C9AB 2YPDA 1WW4A 2D40A 1UD1A 2A73B 1SACA 5FP8A 3H6QA 1OD3A 1VBC3 3H7JA 4CXWA 3H8XA 3KHCA 1RUNA 1PVXA 3P3NA 4P0LA 3HQUA 1GGPB 2BWAA 1UXXX 2OW4A 5A7OA 4IW3A 3TEWA 1CE7B 3LA2A 2OPKA 4LNVA 4LEJA 2Q8DA 1PM7A 5DABA 1PZ9A 3LDBA 5HCFA 1R092 5FNXA 2CTVA 1E5SA 2NQYA 3EMRA 1DG6A 5I0UA 1E0OA 2JB4A 4XFTA 2VH9A 3B5LB 3AH2A 3ZVXA 4YM0A 1B35C 4Q4X2 1JT5A 3KHBA 4CEYC 4AHZA 2WZR2 4BIFA 1BQPA 4C0HA 2DTYA 1FGAA 2W9XA 5IVJA 2YC0A 1QJX1 2XVKA 2F17A 4AEDB 4Q5OA 5JLVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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