4A7KA

Bifunctional aldos-2-ulose dehydratase
Total Genus 204
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
204
sequence length
885
structure length
879
Chain Sequence
QPAALPLFQPQLVQGGRPDGYWVEAFPFRSDSSKCPNIIGYGLGTYDMKSDIQMLVNPYATTNNQSSSWTPVPLAKLDFPVAMHYADITKNGFNDVIITDQYGSSMDDIWAYGGRVSWLENPGELRDNWTMRTIGHSPGMHRLKAGHFTRTDRVQVVAVPIVVASSDLTTPADVIIFTAPDDPRSEQLWQRDVVGTRHLVHEVAIVPAAETDGEMRFDQIILAGRDGVDCLWYDGARWQRHLVGTGLPEERGDPYWGAGSAAVGRVGDDYAGYICSAEAFHGNTVSVYTKPAGSPTGIVRAEWTRHVLDVFGPLNGKHTGSIHQVVCADIDGDGEDEFLVAMMGADPPDFQRTGVWCYKLVDRTNMKFSKTKVSSVSAGRIATANFHSQGSEVDIATISYSVPGYFESPNPSINVFLSTGILAERLDEEVMLRVVRAGSTRFKTEMEFLDVAGKKLTLVVLPPFARLDVERNVSGVKVMAGTVCWADENGKHERVPATRPFGCESMIVSADYLESGEEGAILVLYKPSSTSGRPPFRSMDELVAHNLFPAYVPDSVRAMKFPWVRCADRPWAHGRFKDLDFFNLIGFHVNFADDSAAVLAHVQLWTAGIGVSAGFHNHVEASFCEIHACIANGTGRGGMRWATVPDANFNPDSPNLEDTELIVVPDMHEHGPLWRTRPDGHPLLRMNDTIDYPWHAWLAGAGNPSPQAFDVWVAFEFPGFETFSTPPPPRVLEPGRYAIRFGDPHQTASLALQKNDATDGTPVLALLDLDGGPSPQAWNISHVPGTDMYEIAHAKTGSLVCARWPPVKNQRVAGTHSPAAMGLTSRWAVTKNTKGQITFRLPEAPDHGPLFLSVSAIDAIPVIVQGDSIELSAWSLVPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of Bifunctional Aldos-2-Ulose Dehydratase/Isomerase from Phanerochaete Chrysosporium with the Reaction Intermediate Ascopyrone M.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Phanerochaete chrysosporium
molecule keywords ALDOS-2-ULOSE DEHYDRATASE
total genus 204
structure length 879
sequence length 885
ec nomenclature ec 4.2.1.110: Aldos-2-ulose dehydratase.
pdb deposition date 2011-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18056 PBP3 Penicillin Binding Protein 3 Domain
A PF18637 AUDH_Cupin Aldos-2-ulose dehydratase/isomerase (AUDH) Cupin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.990 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4a7kA02
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4a7kA03
2M49A 3UD7A 1TP0A 4G6JA 1BFGA 5F8YA 3HN1A 2RQ9A 4XKIA 3WINA 1MC9A 1V6WA 4LO0C 3NBNA 1SZ6B 1WD3A 3VSZA 3OJVA 2QYIB 1XYFA 1QQLA 4QD2C 4QC4A 1J0SA 3D7WB 4EEEB 3N7MA 3CRGA 2FO1A 4I8MA 2F2FC 2NM1A 4I4UA 4QO3A 4I4QA 1FQ9A 3A21A 4H9WA 4EFRA 2NVHA 1FMMS 5BP5A 2DREA 1N4KA 3FJFA 1XHBA 4JKQA 5E24E 1YXWA 3JRRA 1DQOA 4I4XA 1BFFA 3FJ8A 2FDBM 1IRAX 4P0KA 3AJ6A 1DJSB 3O4OA 3SNVA 4KEJA 4ZOTA 3BAHA 3BTAA 4QBCA 3VSFA 1DFCA 1AFCA 3OGGA 4I7IA 2HZ9A 4GAIA 4ZGRB 4A7YA 1YBIA 4Z8SB 3BAOA 3I2AA 3IIRA 4IZEA 1IILA 4QALA 1RZOB 2GZBA 3FJBA 1K5VA 3O4BA 3UD9A 5BXPA 3Q7XA 1BFCA 2DRYA 3ZXGA 1GGPB 2X2SA 1JQZA 3RSJA 1DZDA 31BIA 1BARA 4AN7B 3K1XA 3H6QA 4OUJA 1V6XA 1ILR1 3BRGC 3UDAA 3FJKA 2D1ZA 1EYLA 1SR4C 2I1BA 2HW9A 5FZUA 1WBAA 4QKSA 4QBVA 4GP3A 1EVTA 5JLVA 4X39A 1FWVA 1EV2A 4XFTA 1ISVA 3CA6A 4LO2A 2IHOA 3RMXA 2R9KB 2Q9XA 1HWMB 3IM5A 3QR5A 5BOWA 1W3GA 4OEFA 2BEBA 3P6JA 3FFZA 3AJ5A 3O5WB 4KC3A 3VWCA 1HIBA 3FJIA 3BA4A 1FV3A 3AH2A 1E0OA 3AKFA 4JP0A 1V6VA 4WBCA 3FJAA 1JT3A 1IT0A 1FV2A 4A7ZA 4OEEA 1ISXA 3BADA 1Q04A 1S0CA 4QKRA 2X2TA 1D0HA 2D20A 2E4MC 1Q03A 5BQUA 2HWMA 1S0LA 2FFVA 1OQLB 1V6UA 4I1BA 3WA1A 1HCDA 3F1RA 1YTOA 3B9UA 3VT1A 3R4UA 2VUAA 3FGMA 1YYNA 3FJJA 1XZZA 4JQ0A 4USPA 1WBCA 3N7KA 5D62A 3BRFA 1RY7A 3H6RB 4ZBVB 2IWTB 3CA4A 4D0ZA 2KI6B 4I2SA 1ONKB 4I0YA 4IZXA 1JTCA 4FVVA 5FZZA 5EHAA 8I1BA 3P53A 4PC4A 2F8XC 3S8KA 2UUSA 5JMCA 2K8RA 4JKXB 4OWKA 4J23B 1G9DA 4XFUA 3H6RA 2LIEA 1FN0A 3FJEA 1TFMB 4I4SA 9ILBA 3V0AB 2MC2A 4I3NA 1DIWA 4LO8B 3HSMA 4II0A 4LO2C 2XOAA 4DEPA 4J2XA 3NBEA 1W3FA 5D61A 4IQPA 3OBTA 5BXSA 3Q7YA 1PZZA 3N7LA 3O4AA 4LO7B 4Z9WB 2D7RA 3WO4A 4HR6C 2FFUA 3RMYA 1MD6A 3V0AA 3IM6A 3WMUA 3AZWA 2BFHA 3WO2A 4HJJA 1HCEA 2GO2A 4AN6A 3BX1C 2ZQNA 3NBDA 3PHZA 2VSAA 2Y9XE 3O4DA 3A22A 4I1EA 4F83A 2KLLA 3HBWA 5BQUC 1TWMA 3LTQA 1NUNA 3O44A 2DRZA 4G9NA 2FGFA 4I4RA 4GOYA 1T9FA 5DVHA 2BEAA 1HWPB 3MALA 1ISYA 1M16A 1FMZA 1NZKA 2P39A 3P6IA 1FWUA 4DENA 3CA5A 3WINC 2AXMA 4I4VA 1DZCA 3KMVA 1BFBA 4D8HA 5B2HA 1TTUA 3BAVA 3HMYA 3RTIB 3TC2A 3BAGA 1BA7A 2YUGA 1T4QA 3BA7A 1A8DA 3HOMA 1F31A 1AF9A 1WD4A 1PUMB 2ZR1B 1TIEA 1PUUB 3FJ9A 3CU1B 3MPPG 2D43A 3Q7WA 3E8LC 4Q9PA 2KH2A 1IRPA 1TOOA 5BP5C 3O3QA 1I1EA 3IAGC 1JLYA 4IHZA 4DCKC 3PG0A 1M2TB 4LO1A 4YOLA 1RG8A 4I4PA 4A7KA 1ABRB 1DFQA 5FNXA 2ESUA 2D24A 4IY8A 4ZFYB 1JT7A 1Q1UA 4OEGA 4FGFA 1JY0A 4P0JA 3FJHA 4OWLA 2MIBA 3UD8A 1QXMA 1II4A 4I96A 4J2SA 4G6MA 4I4OA 1L2HA 3S8JA 3N0KA 2VSEA 1IHKA 5DZUA 1DLLA 4GAFA 4X37A 1W3AA 4LO7C 4F34A 4HA2A 2KKIA 4I37A 4R6UB 1ITBA 4XFSA 3WMVA 4TLPA 1BLAA 3AKHA 3V0BB 1G82A 1XG6A 4ZA3B 4LO3A 3CA1A 4GP0A 4Q91A 4G9MA 1CVSA 2VLCA 5GAQA 2Y9GA 1HWOB 1AVUA 1UPSA 2RSTA 4P0LA 5D63A 5F8SA 4I6IA 3V0BA 2Q3NB 3C9ZA 4EB2B 3ZXDA 3AZVA 3ZX7A 2K4AB 4USOA 3VUOA 3JUTA 1HWNB 2D44A 1QQKA 3VT2A 3WO3A 7I1BA 41BIA 1PC8B 1R8NA 4J2YA 3BAQA 2J3PA 3IM7A 4KEIA 1CE7B 2ERMA 2Z49A 3FUQA 4ENDA 4IY9A 1S0FA 4IONA 1JT5A 1K5UA 2HWAA 2AFGA 3CRHA 2NP0A 3A07A 3CAHA 3H6SE 2DS0A 4Q9GA 3AH1A 6I1BA 4X38A 3HALA 4J2KA 2L5XA 3UJ4A 4LO1C 5FZYA 4D0TA 3AKGA 1S0GA 3R4SA 4JAWA 2KI4A 2VU9A 4ZLBB 2RG9B 3T8SA 2Z48A 3QYDA 1G9AA 4CJMA 5F8WA 4KBBA 4ISRA 3VT0A 1KNMA 5EC5A 1S0DA 5DUYA 3FJCA 2D23A 2E4MA 1YF8B 2MLLB 3FUOA 1AVXB 2P23A 1S0EA 3O49A 2D22A 21BIA 3N7JA 4I4YA 4L4IA 1I1BA 3OJ2A 1R8OA 4QD2B 5F90A 1PWAA 4LO3C 4P6AA 3PMEA 3A23A 4KEKA 4LO0A 1G9CA 1Z0HA 2NYYA 4ISQA 1BLDA 3O4CA 3ZC9A 3CA3A 1JLXA 5DSSB 2NTDA 1ISWA 3NBCA 4L4HA 2F2FA 2QN4A 1G9BA 3OBRA 1AVWB 2WRYA 3BAUA 3AKIA 4JRAA 4OW4A 4EFPA 3LLPA 1BASA 5BXRA 3BRDA 1FGAA 4ZFWB 3CQAA 3F62B 1P63A 3CRIA 2VXRA 3UJ0A 2WBCA 5BVPI 3EF2A 4ZKTB 1JT4A 2AQZA 4G1RA 3CA0A 5EG6C 5HPZA 4IYBA 3RTJB 1AXMA 3POKA 3ILAA 3OJMA 2ET2A 1Z4SA 1IJTA 3W9TA 1Z2VA 2ZQOA 3ZC8A 3OGFA 1RMLA 2NZ9A 3BA5A 2Y9FA 4X3AA 4EFQA 1HKNA 3AH4A 2D7IA 1VCLA 2LIQA 5I1BA 3FJDA 4JPZA 2Y9WC 1IOBA 3VEQA 3NJ5A 1ISZA 2AAIB 2VXTI 3PUBA 4H04A 4GOVA 1S0BA 1TWEA 5G00A 3V79C 4ZFUB 1AVAC 4OWJA 1DQGA 5FNWA 4EKXB 3I2XA 1SR4A 2K43A 1EPWA 3I29B 3BB2A 5BXTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YHJA 2GNBA 1RUG3 2OYZA 4QQLA 1AR72 3VD4A 5F8YA 1AL21 3KCYA 1OSGA 4NJ4A 2KXLA 5JXHA 1XYPA 4D7SA 1DGRA 1MC9A 1V6WA 5FZ9A 1RUF1 4LO0C 3WINA 2CL2A 2G9ZA 3K51A 1TEIA 4Y22B 1OLQA 2W5FA 5FY4A 4ZZ8A 3POIA 1UMHA 4AR2A 4AVVA 5FOBB 3GALA 4WZFA 5ABJB 4QC4A 1J0SA 1GKBA 5ACA3 2WKKA 5B4XA 3E5QA 1ACCA 1YIFA 2CV6A 2QBXA 4QXKA 5D21A 2FO1A 2VMEA 4QX2A 2NM1A 1SBEA 4I4UA 2Y6JA 4I4QA 5I0UA 2DCTA 2BV4A 3IM0A 2W1UA 4UF0A 4W50A 2W2IA 4Q8KA 1VMJA 5A33B 5DZEA 2XOMA 1NQJA 1RMU2 4EFRA 2OXBA 5IK7A 5F6LB 2WFPA 3G6JB 5J37A 1V6LA 5BP5A 2HWF3 4CVUA 5FY7A 2WZR3 3VZOA 1J58A 2VH9A 3DN7A 1ULOA 2FDHA 4I4XA 3I59B 1BFFA 4RYDA 2VVDA 1IPJA 1IPKA 2VO5A 5J98B 2IXCA 4Q4W3 1KXGA 4AVSA 2XJVA 4Z2WA 1XU2A 5A33A 3VD5A 4AFMA 5KXEA 5DPNA 3AJ6A 4ES9A 1CX1A 3O4OA 3ETQA 1VBD2 5C9AC 3BTAA 4J1XA 4COWA 1CAUA 2EIEA 2XJRA 1AR61 2WSUA 5FZ3A 2FQPA 3BB6A 2QQUA 3HT2A 5FZFA 3BYWA 1VRH2 3I59A 4EN9B 1UZ0A 4CDWB 4I2OA 3VBSB 1CAXB 3BAOA 4IZEA 4QALA 1JYNA 3KT7A 2VBDA 1IILA 1NG0A 4NUBA 1DGWA 1JZ7A 3HEIA 4F8AA 3IDEA 2WYFA 4XCAA 3KV4A 1K5VA 1NA1C 2QTWB 1H1MA 1R082 2P4EA 5GKAC 3P3PA 5B4NA 1REFA 4LKFA 1NE4A 1UY0A 3SNVA 3RG0A 2WZ8A 3FHAA 4NN0A 2Y8KA 3K4AA 3O1TA 5I0DA 4OHYA 2HWD2 4JCKA 1GGPB 1JQZA 1P8JA 2X2SA 3SISA 2DVBA 1ALYA 2Z79A 4IE6A 4CDWA 5CFCB 4HN0A 1PO21 1CAXA 1IKQA 2YPDA 3OPWA 5JIUA 1V6XA 1OURA 1W8NA 4XYXA 4B4QA 4NIHA 2HWC3 1QJZA 1UY2A 2D1ZA 2Y6FA 2YB7A 1J1TA 3MF9A 4CA9A 4DZGA 4EN8B 2OQ6A 1SR4C 3WT3A 1UQXA 4XJZA 4QKSA 4QBVA 2EAKA 3ZR5A 5CFCA 4H9WA 1OD5A 1I6XA 4AGGA 5LB6A 1S4CA 5LK7B 2P37A 2EXIA 2VZVA 2UWAA 3CBNA 3JBG1 5F3IA 1Q8SA 2E7AA 2LS6A 2VCBA 4IERA 4S2GA 3O1RA 2WL1A 1W9SA 1H8TB 1UOJA 2O8QA 4ATFA 4GJYA 1GNYA 3GJBA 3WG2A 3RI8A 2D6LX 1W04A 3CKHA 3IM5A 3OB8A 1GR3A 1OOPB 4J1WA 1OKOA 4AZZA 2DWRA 5AVAA 3B93A 3SCGA 2W87A 2O14A 1BCXA 3FJIA 3CF6E 3DKQA 1N3QA 4RFRB 4XDQA 1UXXX 2F4PA 3O0VA 3RDIA 1QNYA 3AH2A 2RM23 4JP0A 1H8TA 1SQ4A 2HWE3 2VCAA 5BNNB 4LT5A 4Y5Z0 2OZ6A 4FSJA 4OEEA 4QM9A 3SEEA 2RMU3 1O59A 1SCRA 1H4HA 5SV5A 3BADA 1OOPA 4I0WB 1U0AA 4IDZA 2W91A 2Y0IA 3MIFA 1MVEA 2A6YA 2J1SA 2PQQA 1OA2A 3LA2A 3WZ1A 3RZJA 1RUOA 1Q04A 5L7OC 4WM7B 1H2MA 4AL9A 3R05A 1EUUA 4QQOA 4CCKA 1D0HA 4CDQB 1RUD3 1Q03A 3WVJA 5BNNA 3W21A 1STMA 2HWMA 1RJ7A 2EAAA 1DQ5A 1MS9A 2ZX0A 4W8JA 3THTA 5FZGA 5FMCA 1V6UA 1UD1A 1W2AX 3WW3A 4I1BA 1GWLA 4Q1RA 4LE3A 1CGPA 3R0RA 4AHYA 4XJ9A 3O14A 1UOGA 4IEYA 4LITA 5IAXA 3R4UA 5FKCA 4BK4A 4WM7A 1RUJ3 1BVP1 1Y9GA 2JG8C 1AJOA 1VB4A 3T2TA 4MZHA 4CDQA 1CIWA 4USPA 5F5CA 3PURA 4QQ2A 4ZONA 3JD72 1SCSA 1VPHA 3G7DA 3TEXA 2ZEZA 1OHFA 5AC92 5D62A 1HQLA 4XF4A 4NMIA 4AEKA 1RUE2 1RY7A 3ZKYA 5IT6A 3NV4A 3EHKA 5CBLA 5E1RA 3HQXA 4IE7A 4E4ZA 3N4MA 4HOOA 2IWTB 1CZTA 1GNHA 4D0ZA 2JB4A 5FBJA 4I2SA 3KQ4B 1YWKA 1APNA 4FVVA 1JTCA 2RS13 3GBGA 4X6RB 3O1SA 4PC4A 2W46A 3PVNA 2HEYF 2J1AA 5DZFA 2FZ2A 1JZ6A 2UUSA 2YUEA 1NOVA 1ULGA 5FZEA 3ZYIB 1G9DA 4XFUA 1ENSA 3IB3A 3POJA 5IK4A 1HJGA 1ZRDA 4PDWB 4NRMA 1WMXA 3MIEA 4XURA 4AQTA 3DF0A 3V0AB 2HWB2 9ILBA 4QHOA 5IATA 4Q4V1 5CZKA 5FMBA 4TXWA 1RUI2 1OFNA 2C5DA 3HSMA 1NCRC 1RUH1 2JXAA 2R071 4MGSA 3Q8EA 2VG9A 5BNPC 3HPNA 4A6SA 1ENQA 2PHLA 4GH4B 1GOGA 4GMP0 3TNPB 1OUXA 3OBTA 5BXSA 4YWAA 1PZZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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