4F83A

Crystal structure of the receptor binding domain of botulinum neurotoxin mosaic serotype c/d with a tetraethylene glycol molecule bound on the hcn sub-domain and a sulfate ion at the putative active site
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
416
structure length
413
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNALVDTSGYNAEVRLEGDVQVNTIYTNDFKLSSSGDKIIVNLNNNILYYENSSVSFWIKISKDLTNSHNEYTIINSIKQNSGWKLCIRNGNIEWILQDINRKYKSLIFDYSESLSHTGYTNKWFFVTITNNIMGYMKLYINGELKQSERIEDLDEVKLDKTIVFGIDENIDENQMLWIRDFNIFSKELSNEDINIVYEGQILRNVIKDYWGNPLKFDTEYYMINYNYIDRYIAPKNNILVLVQYSDISKLYTKNPITIKSAANKNPYSRILNGDDIMFHMLYDSREYMIIRDTDTIYATQGGQCSKNCVYALKLQSNLGNYGIGIFSIKNIVSQNKYCSQIFSSFMKNTMLLADIYKPWRFSFENAYTPVAVTNYETKLLSTSSFWKFISRDPGWVEHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural insights into the functional role of the Hcn sub-domain of the receptor-binding domain of the botulinum neurotoxin mosaic serotype C/D.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type C neurotoxin
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 109
structure length 413
sequence length 416
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4f83A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4f83A02
1II4A 4I4XA 4I6IA 3AK0A 4I30A 1ONKB 4XIKA 1MZ5A 4UW3A 2YMZA 3FJ8A 2AR6A 3T1MA 2Z49A 2ZMKA 2WSUA 2W68A 4P0KA 3RS6A 4J23B 2D7IA 1KDKA 3HOMA 1LEMA 3O5WB 3PVEA 2X2SA 2M49A 1FMZA 4PBPA 21BIA 3L2YA 1FMMS 4LO7C 2TEPA 1X50A 5GJ6A 3ILRA 4M3CA 1W6OB 1ENQA 2FHRA 1RINA 3WG4A 4H9WA 3FFZA 2ARBA 4QBVA 4Q9GA 2GMEA 1G9AA 3IM7A 3WMUA 2VLCA 4XILA 1RZOB 4YZ3A 4YW3A 1Q03A 3P53A 2E4MA 2MC2A 1Z78A 3A0KA 2WSVA 3VUOA 3OJVA 1GZ9A 1XQNA 4HL0A 1RITA 1SACA 1AJKA 3K1XA 5EG6C 1GV9A 1S0FA 1CVSA 2CYFA 1ISVA 4EFQA 2W08A 4FQZA 4U36A 3AYDA 2A3YA 4XDQA 3POKA 1ABRB 1SR4C 2ZGNA 3VEQA 1PC8B 5GLZA 1J0SA 2F2FC 2Q3NB 3FJCA 3OY8A 1QOOA 4FPLA 2WBCA 3NBEA 2EAKA 3FGMA 4I4YA 1AX2A 3BA7A 1ZA4A 1JYCA 1ISYA 3ZC8A 3ZXGA 2R49A 2OUHA 3SH3A 4YG3A 3FJAA 1QNYA 4J2YA 1DGLA 1L2HA 3FJFA 4P0LA 2ZAAA 2UU8A 1HWMB 5G00A 1CIWA 4CRQA 1H9PA 2EXJA 2R0FA 1BFCA 4F34A 2AH2A 4Q1PA 4YGBA 2WRYA 2DVBA 2E53A 3RMXA 2HYKA 2CNAA 4KEKA 4GOVA 2FDBM 2ZMNA 1V6XA 2BEAA 1WLDA 1W6OA 4YZ4A 1PUUB 2R9KB 1S1AA 2JD4A 1LGCA 3KQRA 5CB7A 3VSFA 4X38A 3H6RB 2UWBA 4X39A 3SH5A 3WHUA 2ZGMA 3AH2A 4LBLA 3CA1A 3FUQA 5JDBA 1FAYA 3IIRA 3JU9A 3BX1C 3SITA 1A8DA 2Z48A 3O3QA 4FPCA 3ZSJA 3S8JA 4D69A 1W0PA 5GZCA 3AJZA 3T2TA 2CY6A 4Y24A 1Z2VA 4ZLBB 2BEBA 4IZXA 1GNZA 2K43A 3O4DA 3B00A 1FV2A 3UDAA 2R1BA 3IM5A 4EB2B 1TWEA 1OKQA 5IK4A 1PZZA 3WG2A 3V79C 3BODA 3AKHA 4DS0A 2YROA 4XJZA 2J3PA 1CN1A 2A6VA 4XXPA 1SBDA 2WLQA 1Y7BA 3JRRA 4TZDA 3ILNA 4XOGA 4GAIA 4YFWA 3ZC9A 4YGCA 1Z0HA 5DUYA 3W58A 3MEPA 3LSEA 2WQZC 5JMCA 2D43A 1MS1A 1HLCA 2DRZA 1BFFA 1NZKA 3OYWB 4GXLA 3V0BB 2SBAA 4IY9A 1PZ9A 1FYUA 4YGEA 1BZWA 4GA9A 3WO4A 3CA5A 3RSJA 1BXHA 2NMOA 3AP4A 3H6RA 1SFYA 2AQZA 2KM2A 2P23A 4LO3A 3A07A 1TWMA 4ATFA 4A7KA 2ZA9A 1IOAA 5JOWA 5BXRA 1AXKA 1HQWA 4WZFA 1WW5A 3WUCA 1SBFA 1UZZA 4P9XA 5GLTA 4YM3A 3AP9A 2D7RA 3ZPYA 3T1LA 4L4HA 3FJBA 3N35A 3ZVXA 1R8NA 4YG0A 3WUDA 4CJMA 1V00A 1LOGA 2VXTI 3QR5A 1ENRA 2E51A 1LJ7A 1FATA 1U0AA 1Q8PA 3A23A 3KM5A 1V6IA 4DQAA 4Q9PA 3QYDA 4A7YA 4YZ1A 1EPWA 3WCRA 1F5FA 4BOWA 4EFRA 2AFGA 3N7MA 4Q2FA 3B01A 1JT7A 1DYKA 2NYYA 5BP5A 2WKKA 2D6MA 1IILA 4K1YA 5FREA 4FP3A 3M3CA 1LCLA 1UAIA 1T9FA 3HMYA 1JT4A 1FNZA 4XMIA 2JE7A 3O4CA 4PC4A 3OPZA 1S0JA 3GALA 3OYWA 3V0BA 3ENRA 3H0OA 3WDYA 2EXHA 1IT0A 1RIRA 2HWMA 4MYEA 1LU2A 4AVVA 3RTIB 1ULCA 4L8QA 4II0A 2CWSA 1F9KA 1GYKA 2GZBA 1J1TA 4XTPA 2ZHMA 3WG3A 3A4UA 2ZZJA 4YG6A 1ISWA 1WD3A 3FJHA 3M3OA 1RMLA 2A6ZA 1LOBA 3I2AA 3FJEA 1JUIA 1XYFA 3A0NA 4IHZA 1LOFA 4Z8BA 4I96A 4DEPA 1V6LA 3FJDA 1QDOA 1GICA 1VLNA 3Q9OA 2AXMA 2AYHA 3ZSKA 1HWOB 1GSLA 4FOYA 1QGLA 1S0GA 3GNEA 3D6EA 3CRIA 3ZXFA 3E8LC 4ZFUB 2KLLA 2ZGSA 1H30A 4HJJA 3O5SA 2D23A 1C1FA 1N3PA 5BYNA 2WT0A 2JJ6A 1Q04A 2NZ9A 1DFCA 3F62B 4LO2C 3B3QE 3PVNA 1IS3A 2OUJA 3VT0A 2D6OX 5L73A 1UN1A 2GALA 2R0HA 2A7AA 4USOA 1YF8B 4JKXB 3CRGA 3QCWA 4AN6A 1QXMA 5D63A 2R16A 4LBNA 1SLTA 3FLTA 2GO2A 1CPNA 2ZGLA 3ZSLA 4QKRA 1AZDA 3VKLA 2A6WA 3BAUA 5HPZA 1MS0A 2DWRA 3VKFC 1LESA 2PHFA 3A21A 1HWPB 2ZACA 1XZZA 3AZYA 2C9AA 2A6YA 3PG0A 3SISA 1IJTA 5T52A 1IRPA 2DVAA 3IN9A 2AAIB 1B09A 4ZOTA 4XJWA 4FPKA 3RMYA 4YW1A 3FLPA 1WBAA 3BOPA 1PZ7A 3AZZA 4KEJA 3AJYA 2VW1A 3OJMA 1W6NB 4GKYA 2DRYA 4RL7A 1KITA 3AKIA 1JT5A 2RHPA 1VIWB 1JY0A 1S0IA 3ZXDA 3O0VA 1KNMA 4K1ZA 3M3QA 1HIBA 3BAHA 4QD2C 4LO0C 3OJ2A 3LCPA 4G9NA 4Y22A 3U4XA 1AXMA 2DUQA 5F9TA 4CTEA 4G6JA 3P6JA 1GBGA 1IKQA 3SNMA 4YM1A 2ARXA 3UK9A 1ULDA 3RTJB 3B69A 3MW2A 2I1BA 3O12A 1ISZA 4Z9WB 2P3JA 3VSZA 3H6QA 3BA4A 1Q1UA 1I1BA 3TB0A 3H6SE 4CZSA 4JKQA 1DIWA 1CESA 1S0LA 3UJ4A 3BIWE 4FVVA 3LSDA 1YYNA 2EALA 2DTWA 1A78A 2DUOA 2GNMA 3PVOA 2DYCA 3C2UA 4P9YA 5IT6A 3POYA 5T5OA 2VH9A 1LULA 2C5DA 4Y20B 4I4SA 1LHVA 4ZFWB 1PZ8A 1DQ0A 3R05A 3AH4A 3ASIA 3VV1A 2LIEA 5AVAA 1LOEA 1UKGA 3PJQA 1N1VA 1TTUA 1JN2P 4XMAA 4FPYA 5DUUA 4FPJA 1HQLA 4A7ZA 5DXDA 4FPFA 4QO3A 4AGGA 2NN8A 2ZKNA 1W6NA 1ZM1A 5CA6A 4Z8SB 4SLIA 3WZ1A 2I2SA 4JC1A 1AXYA 3WINC 5GLWA 2H0BA 3SLIA 4LO7B 1OQLB 3ZYPA 3AP5A 5BQUA 1APNA 5LK5A 1JLXA 2YUGA 1IS4A 4YZ2A 2DS0A 1BFBA 1JQZA 5GLVA 4YM0A 1N1TA 4EFPA 1MS8A 5GAQA 5D62A 1M16A 5JOZA 4FOWA 3CU1B 1AVUA 1V6MA 1S0CA 1W3GA 1AX0A 4BPZA 1LHWA 3BAQA 1KQRA 1XHBA 2G4IA 1BLDA 4NOTA 4F83A 2LIQA 4I7IA 1AJOA 5FZZA 4Q8KA 5EC5A 5T55A 2Y9FA 1LODA 1ISXA 1WBFA 4WBCA 4OEFA 4JQ0A 2ZGOA 1FN0A 1ULFA 4R9BA 1IKPA 1N3QA 3WA1A 4BLJA 3RQ0A 2VSEA 1KDMA 5IK7A 4EEEB 3UD8A 2ZGKA 1QQLA 5F90A 3NV2A 2DV9A 4GWNA 5EYXA 3I4IA 4Y20A 2EF6A 1CE7B 1CQ9A 3NWKA 3CAHA 3BAVA 5KXCA 1MVQA 1G9FA 2ZHNA 4XHXA 3BTAA 4Q1RA 2UWAA 2D6NA 4GKXA 2PHRA 1F31A 3LLPA 1WUVA 1ULEA 1NXD1 4XFSA 3WDWA 5BP5C 4W65A 3WO3A 5F8WA 5FZUA 2JECA 2DTYA 5BXTA 3USUB 3BRDA 3Q7YA 3DUIA 5FZYA 1JOJA 1R1ZA 3O0WA 4C1WA 2Q9XA 2FFVA 2YV8A 5H9PA 2FFUA 1MS3A 4U2AA 4YGDA 3F1RA 5JOYA 1GANA 1AVAC 1NUNA 2K8RA 1C1LA 2A5ZA 1DQ6A 3ILAA 4XBLA 4I4UA 2HW9A 2CWMA 2XG3A 1MR5A 2GN3A 5GLUA 4BMBA 3VWCA 4XFUA 3FJIA 1UZYA 4M00A 1HDKA 5BOWA 4XJ9A 1BJQA 3ZX7A 4XZPA 2JE9A 2VW2A 1TOOA 1MS5A 1W6MB 2EXKA 4GALA 31BIA 5KXEA 1JBCA 1OQ1A 4P9WA 4Y1XA 3AJ5A 3KMVA 2VY0A 1SR4A 3R4SA 2ESUA 1SCSA 4BMEA 1Q8VA 5T5LA 3AKGA 1EYLA 4ZGRB 1Q8SA 5E24E 4GP3A 4QKSA 4K21A 4D0ZA 4GP0A 1G86A 8I1BA 4WVWA 5EXOA 1DQOA 2DUPA 1N4KA 2GNDA 4YFZA 1UX6A 6I1BA 2W39A 1CVNA 1QKQA 3PUBA 3AZVA 2EIGA 2ZMLA 5HCBA 3USUA 5F8YA 4LBJA 3BRGC 3APBA 1QF3A 1LOAA 1ENSA 5GM0A 2P39A 5GZDA 2A3WA 2GDFA 1DQ4A 3WVJA 2YXSA 2NTDA 3O44A 2QYIB 1BKZA 3O49A 1PUMB 2P34A 3B9CA 3FJ9A 4FP2A 1QDCA 2AENA 3TC2A 1UL9A 1YI7A 4DFSA 4ASMB 1MS4A 3HSMA 4PQ9A 4R9DA 1W6MA 3RRDA 2ZHKA 3WNXA 1AFCA 4OWLA 3C9ZA 3NV1A 3CNAA 3BAGA 2NM1A 4I8MA 4BLIA 1GLHA 2F8XC 1BARA 5H9RA 1V6JA 4R6UB 5T5PA 4LO1C 1QQKA 4OW4A 5SV8A 3BA5A 3WDVA 1HKNA 4IQPA 5FRAA 1YTOA 1AVBA 2YZ4A 4R9CA 1LU1A 1G9DA 1DZCA 1BLAA 1FNYA 2CL2A 3AKFA 1JT3A 2B7YA 4Q26A 1TFMB 3INAA 4LBQD 1IOBA 1UPSA 3HR9A 5IUQA 1QU0A 1DZDA 1Q8OA 1FQ9A 3NV4A 3MW3A 2ES3A 3I2XA 4ZA3B 1DLLA 4UW6A 3AX4A 3RG0A 4XHBA 4ITCA 1SLLA 4EKXB 1W3FA 3I29B 4FGFA 1MACA 4WVVA 3S8KA 3W59A 4I4QA 2RG9B 1FWVA 2E4MC 5GZGA 2HWAA 4IONA 3AFKA 5F8SA 5DZUA 1JXNA 2AREA 2FGFA 2Y9XE 3AYEA 5E88A 3NBCA 1M2TB 3N0KA 5EWSA 4FPEA 4PBOA 2NP0A 3IPVB 1IS6A 1JLYA 3VKOA 4X37A 2A71A 4JRAA 2IHOA 2DU1A 1FX5A 1DQ2A 3OGGA 1URXA 3V0AB 1CJPA 3R4UA 2ZGUA 2D3RA 3QLQA 4AYUA 4QBCA 1N47A 1SBEA 2PELA 1JHNA 3PMEA 1QOTA 2KI4A 4M3CF 1EVTA 3FLRA 2ZQOA 4AVTA 1MZ6A 2D1ZA 4ZFYB 4ATEA 2ZGPA 3CA4A 3WDUA 3FBYA 2VXRA 3N7KA 5DZEA 4AWDA 2D3PA 2ZGTA 1D0HA 4TYSA 4QC4A 2BFHA 5E8AA 3OBTA 2DVGA 3NV3A 4KEIA 2D6KA 5H9QA 4Y1VA 2GNBA 1AXZA 4YLZA 4YM2A 4H04A 3ZYRA 4Q8LA 4YW2A 1WW6A 1S0BA 5T54A 1W3AA 1S0EA 3UL2A 1WD4A 3V64A 1YRZA 3VKMA 4D0TA 3CQAA 1Q8QA 1TP0A 3WLUA 3M1HA 1Z4SA 1OFSA 4AVSA 3D5OA 1DYPA 1G8WA 3OJBA 1KRIA 4RA0A 2GNTA 4QD2B 3WV6A 3WO2A 1IRAX 3VT2A 4XBQA 3IPVA 5DZFA 2D44A 3P6IA 1TEIA 2JKBA 4I4RA 2A75A 3AYAA 4L4IA 1E0OA 1G9CA 1DQ5A 1VALA 4YW4A 5CAZA 1IS5A 4UW5A 1JTCA 4LO2A 5JLVA 1SLIA 4KC3A 4XJAA 3V0AA 2Q5TA 2ZQNA 4XYXA 2P2KA 5EHAA 1FV3A 3ILFA 2MIBA 2WT2A 2XB6C 1DBNA 3WDTA 1LHOA 2FMDA 1LHUA 4LBMA 2UWCA 3SNVA 1WBLA 3N36A 4OUJA 4AGVA 2ENRA 1SLCA 5IK5A 1IHKA 3AZWA 3WDXA 4XBNA 1TIEA 1W6QB 2SLIA 2LALA 4XIOA 4ISQA 4Y1ZA 2DREA 5BXSA 4I4OA 2XOAA 1N1SA 2D6PA 4XJUA 3WOGA 1CR7A 1A3KA 4IYBA 4I1EA 4M01A 4LO3C 3WG1A 1G82A 4FPOB 1HCEA 1C4RA 4LBOA 3AXEA 1YO8A 3AZXA 5EYYA 1JW6A 2VW0A 3MW4A 3N7JA 5I1BA 1SLBA 4XXAA 2UUSA 2AGSA 1ITBA 4I2SA 4J2XA 4I1BA 1LEDA 3POSA 2PHWA 1WBCA 4YZ5A 1VCLA 3HBWA 2OW4A 4Q91A 1V6UA 2ZGRA 3M2MA 4FQ4A 4LO0A 1KJLA 2WJSA 3NBDA 5T50A 2ZHLA 1EV2A 2D22A 4PF5A 1R8OA 1QNWA 4DPNA 3MALA 3BADA 4ISRA 3ATGA 1HWNB 5GALA 1T4QA 4ZKTB 2D6LX 3AXDA 4WV8A 1P63A 3AH1A 4XJ8A 3UD7A 3WMVA 3A22A 4P0JA 3W9TA 1V6OA 4D8HA 1BQPA 5HCAA 4P6AA 4X3AA 5FNXA 2VUAA 4OEEA 1DFQA 1W6QA 1LHNA 2DVFA 5DUWA 1WCSA 1V6WA 3BB2A 1FWUA 4GOYA 2GMMA 4JPZA 1GNHA 1GZWB 3OBRA 5GZEA 1I1EA 4G1RA 4USPA 3LTQA 4FPHA 1ILR1 1V6NA 2NMNA 2V5YA 2DVDA 2MLLB 1AX1A 2VU9A 1UMZA 1O4YA 5T5JA 3VKNA 1LTEA 3CA3A 5DSSB 2R1DA 4Y1YA 1G7YA 3JUTA 1JYIA 4BQ1A 3NJ5A 1V6VA 4OZXA 3WINA 2L5XA 4Y26A 1K5VA 1LOFC 3AP7A 1O4ZA 4Q27A 3FJKA 5KXDA 2IWTB 3EF2A 1HCDA 2K4AB 4IY8A 2KH2A 2F2FA 2D7FA 4ZXKA 1WW4A 1RG8A 1YXWA 3ZXEA 1RY7A 3HALA 2QN4A 2AUYA 4AN7B 4LBKA 1ONAA 1YBIA 1CPMA 1GKBA 4QALA 1SCRA 2E7QA 4I3NA 3IAGC 3POWA 2VSAA 2WNEA 2RSTA 5FNWA 1MC9A 5JVVA 2PHUA 3AJ6A 5DVHA 3BRFA 4LBQB 5GZFA 5CBLA 1WLCA 3IMNA 3VT1A 4FPGA 3NBNA 1FGAA 3IM0A 2ERFA 3UJQA 3O4BA 1H9WA 1BYHA 4PCRA 4OEGA 4FOVA 2EXIA 3BAOA 5DG2A 4DENA 3WCSA 1KJRA 5DG1A 1PWAA 7I1BA 3Q7WA 2KKIA 2A70A 1BFGA 1W6PB 1GZWA 1ULGA 4HA2A 4K20A 2DU0A 3WHTA 2PHTA 4J2KA 2Y9WC 5BXPA 1LGBA 3Q7XA 2FO1A 4ZBVB 1AVXB 5BVPI 4I37A 1LOCA 3TAYA 2BQPA 2P3IA 4KBBA 1WW7A 1DHKB 2HZ9A 4G9MA 3D7WB 1QOSA 1BA7A 3DGTA 3SH4A 2YY1A 2P37A 4C1XA 5JOXA 1V6KA 1MS9A 2ZBJA 3OGFA 1C57A 2NVHA 3FUOA 3CRHA 1I3HA 2E6VA 3M3EA 5D61A 2LTNA 3CA6A 5DUVA 1XG6A 3I8TA 1CONA 1VAMA 3IM6A 1GGPB 4DRVA 2ZGQA 2Z42A 1NLSA 1AF9A 4FOQA 3CA0A 4JP0A 1S0DA 1LECA 4LBQA 4HR6C 2PHXA 5DZGA 4LO8B 1G9BA 2KI6B 3FJJA 2D20A 2CTVA 1DJSB 1W0OA 2D24A 3IKWA 3AYCA 5E89A 4XFTA 2X2TA 3UJOA 1LGNA 3V65A 4XKIA 1Q56A 2ET2A 4BM8A 4J2SA 1W6PA 4Y22B 2JDZA 2Y9GA 3UJ0A 3D4KA 1GZCA 5HCFA 3PHZA 4Y1UA 3N7LA 4OWJA 2E7TA 1VAVA 4YW5A 5KXBA 2ERMA 4ENDA 2WT1A 3B9UA 3O4AA 4XTMA 5F5QA 1SLAA 3HN1A 3T8SA 3ZSMA 4XE9A 3ZXJA 1K5UA 41BIA 1MVEA 2A3XA 2GN7A 4M3CE 4H55A 1BASA 1N3OA 3N3HA 5CNAA 2A6XA 4M3CB 5BQUC 2V73A 3UD9A 3ZXLA 2DURA 1AVWB 2P3KA 9ILBA 2ZR1B 2UURA 5H9SA 3MPPG 1HKDA 4R9AA 3O0XA 3ZXKA 1DQ1A 1QMJA 4GWMA 1N1YA 3AP6A 2GMPA 4OWKA 4I4PA 2D3SA 4JAWA 4GAFA 4UW4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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