4FVV | Genus

Total Genus 96

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	96
sequence length	421
structure length	412
Chain Sequence	SINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKLTGINFSKTITFQMNKIPSDNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFRLGGDWYRHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Botulinum neurotoxin serotype C associates with dual ganglioside receptors to facilitate cell entry. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Neurotoxin
molecule tags	Toxin
source organism	Clostridium botulinum
total genus	96
structure length	412
sequence length	421
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-06-29

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07951	Toxin_R_bind_C	Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A	PF07953	Toxin_R_bind_N	Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	4fvvA01
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	4fvvA02

1AVBA 4YW5A 1OFSA 4EB2B 2PHUA 1JW6A 1DZQA 1S0DA 1LGCA 1DYPA 2ZHMA 4CRQA 2CNAA 1J1TA 3V79C 3Q7YA 1JLXA 4I2SA 2OUHA 2P3IA 1WW7A 1E0OA 3NJ5A 4JPZA 3O5SA 1UKGA 3WO2A 2QYIB 3SNVA 4XMAA 3SNMA 3FGMA 2A3WA 4XTMA 2QN4A 1MS9A 4XFUA 3FJKA 5IK4A 2ZMLA 1H9PA 1W6OB 4WZFA 1OKQA 2WT1A 3QLQA 3A0KA 1LU2A 5DZFA 1KITA 4IQPA 4YZ5A 4Z8SB 5FZUA 4HL0A 2ENRA 2GMEA 1HKNA 3BRGC 1GANA 3PVEA 4XJ8A 5G00A 1QNWA 5EYYA 3PMEA 4AGRA 2DVGA 1YBIA 1FATA 1YIFA 2AH2A 4Y26A 1SCRA 4ZFYB 3T1LA 3NV1A 4LBKA 1QDCA 2OVUA 1V6OA 1W6NA 3HBWA 3KMVA 4GKYA 4IY8A 1C57A 3RSJA 1SBDA 4R9DA 4FPEA 3Q7WA 1ENRA 2PHRA 2HWMA 2FDBM 3D7WB 5T5PA 2AAIB 2FFVA 2WNEA 1HCDA 4XBNA 4NOTA 2D3RA 1LOBA 5DUXA 4I3NA 3FJDA 3WINA 1BJQA 2MLLB 2P2KA 4LO1C 3NWKA 1IHKA 1SZ6B 3ZXJA 4YZ4A 3WG2A 4GXLA 1IKQA 1V6IA 3PVOA 2NMNA 2UWAA 3IN9A 1LGNA 2UWBA 4OWJA 4YG0A 4OWKA 4XDQA 3AZZA 3AJ5A 1WLCA 2WT0A 3WHTA 1W3GA 4ZKTB 4QKSA 1HCEA 2NYYA 1TEIA 2PHFA 4EFRA 3IPVA 1MS8A 1JYIA 1UPSA 2JECA 5BP5C 1PWAA 1QXMA 2FFUA 3WVJA 2WRYA 4LBMA 1SLBA 1GZ9A 3CA3A 5CNAA 1SFYA 4NO4A 2DYCA 3FJCA 2BEAA 1BYHA 5HCFA 1JT7A 4LBQD 1Z78A 2IHOA 3ZSLA 3OY8B 4YZ3A 2NMOA 3OPZA 1T4QA 1B09A 4Y1ZA 2XB6C 3NV2A 1ONKB 1BFFA 4ZOTA 1M2TB 3LSEA 3W9TA 1K5UA 5DVHA 2ZGKA 5E89A 5F5QA 3ILNA 3USUA 5IT6A 4XTPA 4I4PA 3OYWB 4K21A 2DU0A 1LU1A 3AZVA 3O0VA 4YGBA 2AENA 5HCBA 1YI7A 4ZXKA 4D8HA 1I1BA 2R9KB 1LHWA 1U0AA 3RMXA 1CIWA 1W3FA 1ZA4A 3IAGC 3POKA 3P6JA 1LGBA 1HDKA 2ZGPA 1ZM1A 3FLRA 1ULGA 1YTOA 4XHXA 1T9FA 3FBYA 3CA0A 2SBAA 1ISXA 5EWSA 1VALA 3AP5A 3AKFA 1JYCA 1SBFA 2M49A 1DQOA 1NZKA 3WDTA 3ZXGA 3QR5A 2D44A 1TP0A 2P23A 1XQNA 2ZQOA 1KRIA 2WQZC 1ISWA 1S0CA 4WVVA 1FN0A 1PZ7A 1URXA 1LOGA 5JOZA 3CAHA 1W0OA 2KH2A 1IILA 2A6XA 3F1RA 9ILBA 4A7YA 3B69A 4FOYA 1JXNA 1G82A 4P6AA 2WT2A 3I2AA 2ZGLA 5GZCA 4G6MA 1AVAC 1IS5A 2DVAA 5JOYA 1MZ5A 2VW0A 4MYEA 4C1WA 2RQ9A 4IY9A 3N3HA 3D6EA 4G9MA 3RTJB 5T5JA 2CY6A 4FPJA 3AYCA 2LALA 5FREA 3MEPA 4WV8A 3CU1B 7I1BA 2E7TA 2D3SA 1W6QA 3KQRA 5DZGA 2DV9A 1CJPA 1LOFA 4YW1A 4IHZA 4X39A 3ZYRA 5H9PA 1ISYA 2CWMA 2DTWA 4LBQA 5FNXA 3WDWA 4ATFA 2GMPA 5F90A 4QD2B 2Y9WC 1LULA 3O12A 4HA2A 4M3CE 3AP9A 3A4UA 1VAVA 3IMNA 4XXPA 1KNMA 3CA4A 4XILA 4I4XA 4BQ1A 1J0SA 3OJBA 4YM1A 1V6LA 2A70A 4LBJA 1BLDA 1QDOA 2W08A 3N7LA 4R9AA 2A3XA 1LHOA 2W39A 4XJUA 2HW9A 1AXMA 1MVQA 2KI6B 2DUPA 4AYUA 1LESA 4PBPA 5D63A 3AJ6A 4PF5A 4G9NA 3IM6A 3V0BA 3CA1A 5JVVA 2ERMA 1L2HA 2WSVA 5LK5A 2X2TA 2JKBA 1JLYA 3AH2A 1F9KA 4D0ZA 4FPOB 5H9SA 3INAA 3CQAA 1YO8A 4LBLA 4KEKA 1A3KA 1KQRA 4YW2A 4D0TA 2PHXA 3FLPA 4ASMB 3B9CA 1GNHA 3R4UA 4Q8KA 3O4DA 4JRAA 1WW6A 3IM7A 3PUBA 4L4IA 1AXKA 3JUUA 4J2YA 1S0GA 2KI4A 2D6KA 5T50A 1CN1A 4LO2A 4XFSA 4WVWA 1WD3A 3P6IA 4WBCA 4P9WA 3AP6A 3RG0A 2DU1A 4EEEB 4XHBA 5DZEA 1G9BA 1CONA 1RMLA 4II0A 2E53A 4FPLA 1GKBA 1F5FA 3IKWA 1G9AA 5B2HA 1DBNA 4RA0A 4ZFWB 1W6OA 4R6UB 5DG2A 2YXSA 1DQGA 5EC5A 1LHVA 1UN1A 1G7YA 2TEPA 4LO8B 2GNDA 4PC4A 3WNXA 2C5DA 3AZWA 2Z48A 2R49A 4KEIA 4GOVA 2ERFA 3RMYA 2DURA 3UJ4A 3O4BA 1LHUA 4Q9GA 3PJQA 1DIWA 1MACA 2AGSA 4YG6A 2OUJA 3WZ1A 3VEQA 4Y20B 3NV3A 5DXDA 4I4YA 2AR6A 4AN7B 4GALA 3MW3A 1WW5A 1BZWA 1DLLA 3ENRA 1MS4A 3ILFA 1QGLA 4JKQA 2ZGNA 4ZGRB 4IZXA 1V6MA 2D7RA 5E24E 5DG1A 3EF2A 1V6WA 3OJ2A 3BAHA 4XJWA 5CBLA 5BXSA 5F8YA 3N7KA 1FAYA 4YM0A 1Z2VA 1DQ6A 3FJJA 3BA5A 5DSSB 2ZGSA 2D20A 4BM8A 2NTDA 4FQZA 1FX5A 1S0LA 3I29B 1LEMA 1IJTA 1S0BA 4GWNA 1UX6A 1DGLA 1UZYA 4FOWA 4PQ9A 3O4OA 5SV8A 3OGFA 3PG0A 1CR7A 1FYUA 4AN6A 1WW4A 1EVTA 2I1BA 1R8NA 5F8SA 1V00A 3AXDA 1LOFC 1BFCA 2YY1A 3M3CA 4XZPA 4M01A 2HZ9A 1GLHA 1QNYA 4JKXB 4YZ1A 3SISA 3AP4A 2UURA 3B3QE 3M3EA 3O0XA 4XIOA 3IM5A 2EXIA 1JT5A 2L5XA 1TTUA 3BAGA 3APBA 4QBVA 4F34A 1SLLA 1ISZA 4AGGA 2WJSA 4YW3A 1FQ9A 3H6SE 4DRRA 2R16A 4Q26A 2ZABA 1LTEA 3OYWA 4OUJA 3UDAA 3ZSMA 3WG3A 3BX1C 3WCRA 3O0WA 3WV6A 1YRZA 4YGCA 3M3QA 1PZZA 4AWDA 2FMDA 4UW4A 1W6PB 1A78A 2JDZA 2NZ9A 2AREA 2YZ4A 2YUGA 3OJVA 5JDBA 4BMEA 2UWCA 3BA4A 1HWNB 1LENA 4K20A 3LLPA 3A07A 2ES3A 1KDKA 5GZDA 3P53A 4Q27A 2LIQA 3N36A 3BADA 4OEEA 1DJSB 1D0HA 3SH5A 1IT0A 3RRDA 5EHAA 4ZLBB 1NXD1 2X2SA 3SLIA 4ENDA 3UL2A 5D62A 1UL9A 4ZA3B 5GLZA 2ZHNA 5KXBA 2D23A 4LO2C 2GMMA 1ILR1 1CESA 3ZSKA 4JAWA 5CB7A 2Q9XA 1A8DA 4K1YA 1N1VA 3O3QA 3BB2A 3UD7A 5GZGA 1GSLA 2D43A 3MALA 2K43A 5BXRA 3Q9OA 2FGFA 1DZCA 3CA6A 1AFCA 1R1ZA 1RINA 2WKKA 1GZCA 1AJOA 5EG6C 1Q8VA 3AZXA 4OWLA 1GV9A 4FPFA 4BPZA 1MR5A 2ZBJA 3ZXEA 1FV3A 3WDXA 2ZGQA 4H9WA 1YXWA 3WG4A 2DTYA 1HWMB 4FGFA 2D24A 3UJ0A 2E4MC 4HJJA 5AVAA 2DWRA 2NP0A 2GALA 3WUCA 3AYAA 3S8JA 5BQUC 3ATGA 3WDYA 3WO3A 4FP3A 1OQ1A 5IK8A 4CZSA 3BAOA 2UUSA 3WDVA 1FMZA 4Z8BA 3POSA 4I4UA 6I1BA 1DFQA 3AP7A 4LO3C 2D22A 1LECA 2JE7A 2RSTA 3T1MA 3MPPG 1IS6A 4FPYA 2AYHA 4DFSA 4RL7A 4BOWA 4P9XA 1V6UA 3H6QA 2EXJA 4UW5A 4M3CB 3FJAA 3AKHA 4I0YA 1FGAA 3QYDA 2AUYA 1MS5A 4XJZA 3FUQA 5GLTA 1AJKA 2AQZA 1DQ0A 2DUOA 1M16A 3TC2A 2Q3NB 3BTAA 4YM2A 2YV8A 1AVWB 4YFZA 4LO0A 4L8QA 4I4RA 2GN7A 4XKIA 1O4ZA 2PHTA 2VXTI 2V73A 2JJ6A 1N3QA 3BODA 1S0IA 1LHNA 1C1LA 2R0HA 3ILAA 1WLDA 1N3OA 4ITCA 2A7AA 1ONAA 3RTIB 1JBCA 3ZSJA 1HKDA 4UW6A 1WD4A 5DUYA 3HOMA 31BIA 1WBFA 3W58A 4L4HA 3E8LC 4PBOA 4Q91A 1DQ1A 3USUB 2CWSA 1G86A 1NUNA 1DQ4A 1KDMA 5IK5A 4M3CF 1ABRB 2WSUA 2ET2A 2D7IA 1Q8PA 1N1SA 1QKQA 4Y22A 4ZFUB 2ZGTA 3B01A 2A6YA 1VCLA 1N1TA 5KXDA 3IM0A 1S0FA 3H0OA 2SLIA 1Y7BA 5JMCA 3WMVA 1IS3A 3WUDA 2ZGRA 2AXMA 3HALA 2E51A 3C9ZA 1G9FA 2EXKA 2D6MA 4YOLA 1JUIA 1C1FA 1N4KA 3WINC 2AFGA 4QALA 3POYA 4P9YA 1SR4A 4U2AA 4D69A 3ZXDA 5GM0A 5EXOA 3VWCA 5BXTA 5GZFA 3JU9A 4LO7C 4FP2A 5FZYA 4GAIA 4K1ZA 2D6LX 3L2YA 1W6MB 2C9AA 3NV4A 2W52A 1BFBA 3UK9A 1YF8B 4Y24A 4P0LA 3O44A 1HQLA 5F9TA 1QMJA 2A3YA 2BFHA 4X37A 2WLQA 3MW2A 4DS0A 5FZZA 5T52A 4HANA 4Y20A 2GO2A 4I4SA 1W0PA 2ZMKA 5GAQA 5BXPA 1LCLA 4CTEA 1HIBA 1CVNA 1DHKB 2K8RA 1BASA 5IK7A 3VV1A 4YW4A 3WO4A 2CYFA 4EFPA 5GLUA 1LOAA 4J2KA 2VW2A 1BKZA 2Z49A 4H04A 1LEDA 1R8OA 1QOOA 1MS1A 1Q8OA 4I96A 4H55A 1GICA 3QCWA 1GGPB 2VY0A 1S1AA 2I2SA 1SACA 4XOGA 4XYXA 2A6ZA 3V0AB 2D7FA 4DENA 1LODA 4EKXB 2D3PA 3R05A 4GP0A 3N0KA 5T5OA 3FJBA 1MC9A 2ZA9A 4X3AA 3WLUA 1X50A 2ZAAA 1ULEA 1VAMA 4FPCA 2WBCA 1JOJA 1MZ6A 4G6JA 2IWTB 2HYKA 1SLCA 1PZ9A 1CVSA 1GNZA 1FV2A 4Q1RA 1SLIA 2UU8A 5HPZA 2LIEA 4QD2C 2GDFA 4DCKC 3AJZA 3V0BB 3ZXFA 4R9CA 4USOA 2ARBA 2W68A 1K5VA 1WBLA 2ESUA 3BIWE 5GLVA 3O4CA 2A6VA 1RY7A 3UD9A 2VUAA 2ZZJA 1RIRA 3V64A 1TOOA 3NBNA 3VKLA 1QU0A 3HR9A 2A75A 2ZHLA 2ZQNA 2ZMNA 2GNTA 3H6RB 1QOSA 1Q56A 4HR6C 3FUOA 1Q1UA 1YYNA 4FOQA 4GKXA 4ISRA 4P14A 1FWVA 1VLNA 3ASIA 3A22A 1I3HA 2DRZA 1AXYA 3AH1A 1Z0HA 4KBBA 4OZXA 1AX0A 3FJHA 4LO0C 5F8WA 1RZOB 2D6PA 2DRYA 1WCSA 2DREA 2BQPA 1XYFA 4AVSA 1Q03A 2YROA 3B9UA 1SLTA 5GALA 2KKIA 3FJEA 41BIA 1HWOB 4QC4A 1MD6A 3F62B 2P39A 4XMIA 3AZYA 4UW3A 1DZDA 3FJFA 5DUWA 1BLAA 1EPWA 2Y9GA 3O49A 1DQ2A 4A7ZA 3D5OA 1SLAA 4W65A 3W59A 4DRVA 4Q8LA 3OY8A 8I1BA 1OQLB 3ZYPA 1MS3A 3I4IA 1AVXB 1BFGA 3KM5A 1W3AA 4TLPA 4IYBA 4FQ4A 3LTQA 3POWA 1PUUB 1IOAA 1FMMS 3V65A 1S0JA 3NBDA 2Q5TA 5BVPI 4YGEA 3AXEA 2DVFA 4Y1UA 4FPGA 3FJ9A 1Z4SA 1XHBA 5BOWA 4TYSA 2CTVA 1N3PA 3R4SA 3SITA 3U4XA 1SR4C 5JLVA 4SLIA 4YFWA 2DS0A 1GZWB 2Y9FA 3N7JA 1IKPA 2P34A 3VKFC 1MVEA 1H30A 4GA9A 2VSEA 4FPHA 2EAKA 3NBCA 3TAYA 3M1HA 3GNEA 1IRPA 4I6IA 1TWMA 4YM3A 1JHNA 5KXEA 3BA7A 3BAVA 3HSMA 1GYKA 4EFQA 5JOWA 1KJRA 4Y1XA 1ULFA 4P0KA 3D4KA 1ULCA 1AXZA 3K1XA 2A6WA 1TFMB 2HWAA 1BA7A 5DZUA 1S0EA 3VKMA 4LBNA 1C4RA 2KM2A 1CQ9A 4IONA 4Q1PA 3CRHA 4J2XA 2ZGUA 1UMZA 3OGGA 3ZXKA 2MIBA 4IZEA 3Q7XA 1LOCA 4YG3A 2EF6A 3T8SA 1DQ5A 4M3CA 4R9BA 1Q8SA 1F31A 1CPNA 3LCPA 3I2XA 2NVHA 1JQZA 4I8MA 1ENQA 5KXCA 1V6VA 1G8WA 5T55A 2OW4A 1DFCA 5D61A 3C2UA 3GALA 4X38A 1NLSA 2R1DA 1D2SA 4Q9PA 1V6NA 1W6NB 3BRFA 4Y1VA 2KLLA 1LJ7A 5HCAA 4I7IA 1SBEA 4I4VA 1II4A 3BRDA 4P0JA 1WBAA 2BEBA 3AH4A 2K4AB 4YZ2A 1AVUA 2MC2A 5T54A 1AX2A 3CNAA 4F83A 4XJ9A 3MW4A 4YGDA 3BOPA 1G9DA 1EV2A 3CRIA 1APNA 3SH3A 1IOBA 3VT2A 4LO7B 4J23B 1O4YA 1BARA 1AZDA 3ZVXA 1TWEA 2F8XC 2GN3A 1KJLA 4KEJA 4AVTA 3NBEA 1JY0A 3T2TA 4XIKA 4C1XA 2F2FA 3VT0A 2GZBA 1HLCA 3M3OA 3DGTA 3IPVB 4GAFA 4USPA 2G4IA 1P63A 2DVDA 1TIEA 1HWPB 2EXHA 3OBRA 4DPNA 3OJMA 2Z42A 1BXHA 4U36A 1PZ8A 4BMBA 2VLCA 4XBLA 4XE9A 1V6XA 4Z9WB 2ZGMA 1W6MA 4OEGA 4QO3A 4XFTA 5DUUA 3OBTA 4ISQA 2ZKNA 1IS4A 4JC1A 1GBGA 1LOEA 2R0FA 4GP3A 5GZEA 5GLWA 3AX4A 5BYNA 4FVVA 1AF9A 5E88A 2VW1A 2P3JA 3JUTA 3CA5A 4M00A 2FHRA 3VSFA 1JT3A 2J3PA 4BLIA 1N1YA 3WCSA 3AK0A 3N35A 4Q2FA 2GNBA 1PUMB 3FJIA 1CPMA 5I1BA 3UJOA 2DUQA 1ITBA 2B7YA 2VH9A 4AGVA 3WA1A 2A71A 21BIA 3FFZA 1WUVA 3FLTA 5H9QA 5DUVA 1ULDA 2DVBA 2XOAA 3M2MA 1JN2P 1QQKA 3V0AA 4OEFA 1UZZA 2YMZA 4TZDA 3ZC9A 1JTCA 5JOXA 1WBCA 3VKNA 2ZGOA 4DEPA 2ZACA 5E8AA 1G9CA 4FPKA 4XBQA 4JP0A 5L73A 3N7MA 3BAUA 1PC8B 3VKOA 2ZHKA 3BAQA 3HMYA 4ATEA 4I1EA 1QF3A 2A5ZA 1XG6A 3AYDA 3AKGA 2NM1A 4QBCA 2CL2A 2EALA 4LO1A 3O5WB 3HN1A 3ZX7A 1CE7B 4PCRA 4I4QA 2P37A 3B00A 1DYKA 5CA6A 2XG3A 3ZXLA 3ILRA 3WHUA 2FO1A 5EYXA 1AX1A 3SH4A 3I8TA 1Q8QA 1WLWA 2VXRA 2VU9A 3VT1A 2NN8A 3UD8A 2D6OX 3WG1A 2D6NA 3A0NA 3TB0A 2JD4A 3H6RA 3S8KA 2JE9A 3UJQA 1V6KA 1BQPA 1Q04A 4JQ0A 5BP5A 2ARXA 1W6QB 2LTNA 3A23A 3CRGA 3VUOA 4YLZA 2P3KA 4J2SA 1RG8A 4ZBVB 3PVNA 2PHWA 2RG9B 2D1ZA 4Y22B 4LBQB 3LSDA 3RS6A 2VSAA 1I1EA 1MS0A 1EYLA 1FNZA 1QQLA 3FJ8A 3O4AA 4GOYA 4QKRA 4I30A 5T5LA 1XZZA 5FNWA 2Y9XE 3RQ0A 2V5YA 1V6JA 3JRRA 4CJMA 4OW4A 4Y1YA 1ISVA 4I1BA 1IRAX 3WDUA 5GJ6A 1HQWA 2ZR1B 1N47A 4A7KA 3AJYA 3ZPYA 2RHPA 3DUIA 1RITA 1JT4A 2E6VA 3AKIA 1QOTA 2R1BA 2E4MA 5H9RA 3WMUA 4LBOA 4JCKA 3IIRA 3PHZA 4BLJA 2EIGA 4XXAA 5BQUA 3AYEA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4FVVA

Total Genus

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