4FVVA

Crystal structure of hcr/d-sa-gbl1/c
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
421
structure length
412
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKLTGINFSKTITFQMNKIPSDNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFRLGGDWYRHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin serotype C associates with dual ganglioside receptors to facilitate cell entry.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Neurotoxin
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 96
structure length 412
sequence length 421
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4fvvA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4fvvA02
1MZ6A 3H6RA 2E53A 2P39A 2W08A 1AX2A 3OJVA 1DGLA 3R4SA 1ITBA 1WLDA 3C2UA 1AFCA 1ULEA 1JLYA 1WW6A 1DYKA 1TEIA 4R6UB 4PBPA 1EYLA 3VKLA 5E89A 2VU9A 4M3CE 4RA0A 2V73A 3D7WB 5EYXA 4L8QA 3OBRA 5JOYA 5CAZA 3FJCA 3POSA 3UJ0A 2FMDA 1PZ9A 1MS4A 1GV9A 4I4SA 2Y9FA 2LTNA 1J1TA 1W6PB 3UD7A 3V79C 3OBTA 3ZC9A 2P34A 1YYNA 2NM1A 8I1BA 3HR9A 3USUA 2AUYA 2VSAA 1S0GA 3WCSA 2VXTI 3MW4A 1ONKB 1Z2VA 3LSDA 5HCBA 2P23A 5T5OA 3WO2A 1BLDA 2DREA 2BEAA 4L4HA 4D0ZA 2PHUA 3M3QA 3OPZA 2ZMNA 4I1BA 4M3CA 1NUNA 4I1EA 3UJ4A 3BAUA 3POYA 3JUTA 2DTWA 4AVVA 1I1EA 4SLIA 3M3OA 3O0WA 1FGAA 2TEPA 3WDYA 3BODA 4XYXA 5D61A 5FRAA 1IS6A 2CL2A 1EV2A 5DUYA 1KDMA 1AVWB 4M01A 2W68A 3I8TA 1JY0A 3BIWE 2D23A 1LECA 2P2KA 2D24A 4I7IA 1IKQA 4LO3C 1OQ1A 1Q8OA 4Y20A 4G6MA 2YROA 4X38A 1DIWA 1BJQA 3CA6A 5FNWA 5EXOA 4Q26A 2P3IA 4YW5A 1FV3A 2WSUA 3WDWA 1GYKA 4KEKA 4IONA 4QKRA 1AX1A 1DQ4A 4JQ0A 4AGVA 1IKPA 1VLNA 3AYEA 4ZKTB 3UL2A 5FZUA 4KEIA 3WG2A 2Q5TA 2DS0A 5D63A 3QR5A 1RY7A 4JPZA 1KITA 1S0EA 1WBLA 1V00A 4XZPA 3ZXEA 2ESUA 3O4BA 1YTOA 4P9WA 1H9WA 5EWSA 4YZ5A 1HCDA 4DPNA 4XJUA 3V0BB 5JOZA 1DHKB 3WHUA 2GNDA 4YGEA 3HSMA 3M1HA 3ZX7A 1O4ZA 3OJ2A 1BARA 1MC9A 1V6KA 4Y1YA 3OYWB 3T8SA 3MW3A 1XHBA 1C57A 4XIOA 5BOWA 2UWCA 1SZ6B 1G8WA 1WW5A 4K21A 2PHRA 3AK0A 1C1LA 2D7RA 3GNEA 3ZXLA 2KI4A 3OJMA 5DG2A 4AN7B 7I1BA 5E8AA 4I4UA 4ATFA 2HWMA 1GGPB 1WCSA 2WKKA 3CA5A 1UL9A 4Z9WB 1V6VA 4PBOA 1C1FA 4EFRA 3ZXJA 4KC3A 2DVAA 1PZ8A 5E24E 4USPA 1KQRA 3BAOA 2AXMA 2JE9A 4K20A 4GKYA 1QDOA 3AP6A 1JYCA 5CBLA 3WUDA 3FJAA 1LHUA 2UWBA 2AQZA 5DUUA 5E88A 5GZCA 1HIBA 3B00A 1JBCA 2OUHA 3ZXDA 1CONA 2ZBJA 3PMEA 1JHNA 4ZFUB 4Z8SB 4I3NA 4LBNA 4EEEB 3WDTA 3R05A 1AVBA 3OY8B 4GAFA 1MVQA 4ASMB 2DUQA 1QNYA 3ILRA 1WBAA 3FFZA 4QO3A 3V64A 1S0JA 2VLCA 5FREA 3BAVA 2HWAA 3D6EA 4GALA 2ZGLA 1G9FA 4BOWA 1ZA4A 4PQ9A 1BKZA 4P0LA 1W6QB 1V6OA 3N7JA 5H9SA 5JOWA 2ZAAA 4P9YA 4J2YA 2D6KA 2WNEA 5DVHA 2NVHA 4WZFA 1FWVA 3CA4A 2CYFA 4U2AA 3E8LC 31BIA 1L2HA 5DZGA 1M2TB 3N3HA 4AYUA 1LOFC 3ZPYA 2GMMA 1VIWB 5AVAA 2AYHA 3USUB 3I2XA 5LK5A 4DS0A 4QKSA 3POKA 1GKBA 2EAKA 2EXKA 2ZHKA 1PUMB 1SLCA 3WMUA 3ILFA 3PVOA 5HCAA 1JXNA 4EFQA 2HZ9A 4M3CB 1UMZA 1SR4C 3MALA 2CTVA 1Q8QA 2D3PA 4JRAA 2CWSA 1W6MB 2E4MA 1S0FA 2A70A 2CY6A 1CR7A 1YIFA 4Q2FA 5IK5A 4ZFWB 4MYEA 4QD2C 4FQ4A 4LO1A 1DZDA 1FMMS 1RITA 3TAYA 1BFBA 2AH2A 4YM1A 4M00A 4Q1PA 4PF5A 3CAHA 4Q9GA 2Z48A 3FGMA 1GLHA 2D6LX 4CJMA 4IYBA 1WW4A 5DG1A 2R1DA 1QU0A 4YW1A 4UW5A 3M3CA 3H0OA 1SBDA 1ENSA 1DYPA 1BFGA 2DUPA 4OZXA 4XJ8A 2HYKA 4F83A 1WW7A 5BXSA 4H04A 4ZGRB 4XJ9A 2FFUA 1G9CA 4BM8A 4LO8B 3W58A 1W6OB 5BVPI 3OYWA 2GZBA 1ULCA 2D43A 4YOLA 3O49A 1D2SA 5DSSB 4XMIA 1V6MA 3HN1A 1Z0HA 4FVVA 1MR5A 4XJZA 2GN3A 3ZSLA 2AAIB 4D8HA 5T50A 2VH9A 2AR6A 4OWKA 2ZABA 4FP2A 1GZCA 1JN2P 3IMNA 3V65A 3U4XA 1S0LA 5D62A 1O4YA 4XBQA 1DFCA 4XHXA 3OGGA 1S0IA 5T5LA 5HPZA 1WLCA 3A0NA 2BQPA 3N7KA 3C9ZA 3O12A 4LBMA 1WD3A 2ET2A 1ULGA 1CVNA 4AGGA 2HW9A 1DBNA 1LEMA 1BYHA 4LBQD 3IM6A 2Z42A 2AREA 2DU1A 2Y9WC 4FOVA 4AWDA 3O44A 2G4IA 3NBNA 3T1LA 1LOAA 3N0KA 4GAIA 1G7YA 2XB6C 3T1MA 1TOOA 2A3WA 2C5DA 3FJ8A 3TB0A 1Q8PA 1Y7BA 1V6WA 1QQKA 4IQPA 4U36A 4XE9A 5EHAA 3AFKA 2DVBA 2DYCA 2F8XC 1TTUA 3WINC 3D4KA 3VKFC 1T9FA 1Q03A 3WDUA 3ZVXA 1LENA 1AXYA 1DQ0A 4YFZA 5CNAA 2P3JA 3Q7XA 1UAIA 1A78A 3QCWA 3AKFA 2K4AB 3AH2A 3K1XA 4XIKA 4LO7C 4G1RA 1W6QA 2GMPA 3LCPA 2MIBA 1BQPA 1FNYA 3AX4A 1SBFA 5BXRA 3TC2A 3T2TA 4LO0C 3BAGA 1KJLA 2ZGSA 5DUXA 4GP0A 1PUUB 5GLVA 4A7YA 3IAGC 4BLJA 4HANA 3INAA 1YF8B 3OGFA 1XQNA 4QBCA 4CZSA 1QKQA 6I1BA 2GALA 3UDAA 2ARBA 1Z78A 4EFPA 3AJ6A 2RQ9A 3FJBA 4K1YA 3B9CA 2EXHA 2YY1A 2A6XA 2CWMA 3FJHA 1CPNA 2IHOA 2DRYA 3O4DA 1UZZA 3VKNA 1QNWA 4LBKA 5GZDA 5GZFA 3SNMA 3P6JA 3RTIB 1DQ1A 1H9PA 4FPFA 1BXHA 1Q04A 3WOGA 1CN1A 1BFFA 1RINA 4IZEA 4XKIA 1UX6A 1N3OA 1W6MA 3NV1A 1HDKA 4IHZA 4YM3A 2ARXA 1JT3A 4FPKA 1LGBA 3UD8A 4FPJA 5F8SA 2E7QA 4JAWA 2ZHNA 3NJ5A 1JOJA 5JDBA 1SBEA 4GP3A 2B7YA 4R9AA 3SH3A 1FN0A 1ENRA 4XJWA 2ZR1B 3QYDA 2A6WA 1LJ7A 1IS3A 3NBCA 4XFTA 1UPSA 3AP7A 3MPPG 2ZGPA 3I4IA 2A7AA 3A4UA 3ZSKA 2MLLB 5IK7A 4XXAA 4R9DA 3BA7A 5FZZA 4BLIA 4Q8KA 1ISYA 3VKOA 2A75A 3FJKA 2KM2A 1RIRA 5GZEA 4HJJA 3Q7WA 1SFYA 1W6OA 3N35A 2VY0A 1DQ2A 5DZUA 3AYCA 1LESA 1WUVA 1QDCA 1DFQA 1MZ5A 4TLPA 3CRHA 2ZGNA 1LOBA 1JUIA 1UZYA 4XOGA 3R4UA 2PELA 3RTJB 2QYIB 3SH4A 1AVUA 2YV8A 2ZGUA 1CESA 3FJDA 3B3QE 2F2FC 3UJOA 3HALA 1AF9A 1DZQA 1MD6A 2UURA 3RQ0A 4XTPA 3AYAA 5T5JA 4LO2C 2ENRA 2GN7A 2DWRA 1K5VA 4XDQA 2D6PA 1I3HA 1AVXB 3PUBA 4CRQA 4LBLA 1BZWA 1CJPA 1FV2A 1M16A 2E6VA 5DUWA 1MS9A 1V6XA 3ZSMA 3ZXKA 5IK4A 4C1WA 3BRGC 1LEDA 1R8OA 21BIA 2PHXA 3VSFA 2D6NA 1ISWA 4OUJA 3GALA 4I4OA 5BP5C 2ZKNA 5DXDA 3VV1A 4FPYA 3F1RA 3IIRA 3AP5A 2E7TA 1N47A 2FFVA 5F8WA 1LGNA 1YI7A 4LO3A 1YXWA 3F62B 1LODA 4Y26A 4OEGA 4JKQA 4P14A 3AZVA 1Q8SA 1HQLA 5GLTA 3ZYPA 4DRVA 4I4RA 5H9PA 2Q9XA 3JUUA 3RMYA 1IRPA 2YZ4A 5H9RA 4RL7A 4Y22B 3IKWA 2ZA9A 5BYNA 4I96A 2JKBA 2WT0A 3AP4A 2ZQOA 4YG6A 4DFSA 2DU0A 4I0YA 4QD2B 1JQZA 1QOTA 1N1VA 1W3GA 1TFMB 4X3AA 3NV3A 3AZZA 4UW6A 4FQZA 4WBCA 5BQUC 4WVVA 2RHPA 3AJYA 3FLTA 1OKQA 1WBCA 5JVVA 4OEFA 1LULA 3FJJA 1OFSA 3P53A 2D44A 2RSTA 4I4YA 1HLCA 2R9KB 3JU9A 1MS8A 5CA6A 2ZGOA 5JLVA 4A7ZA 1KNMA 1Z4SA 1N3QA 3WNXA 3VT0A 2YXSA 1IHKA 3WMVA 4XMAA 3ILAA 5IUQA 5F5QA 2ZGQA 3IN9A 3AZWA 4XTMA 1GICA 2NTDA 1BA7A 4JCKA 2WLQA 4FPHA 1UKGA 4YG3A 1JT5A 3W59A 4XXPA 2VW0A 4AN6A 1AZDA 3V0AA 1VALA 5GAQA 4QBVA 2KKIA 2WBCA 3FJEA 1YBIA 1PC8B 1DQOA 1URXA 1VCLA 3WO3A 3WG3A 2VUAA 3WLUA 1VAMA 3FUOA 1ISZA 5KXCA 4II0A 3A21A 1D0HA 1FNZA 1GNHA 3RRDA 4I37A 1N1YA 2AFGA 4GWNA 3S8KA 3IM0A 3BADA 1NXD1 4FPOB 4YFWA 3RSJA 1EPWA 1S0BA 2NMNA 2L5XA 1IOBA 4HA2A 3WV6A 3PG0A 1FAYA 1K5UA 2A3XA 2R1BA 2LALA 4J2XA 2PHFA 2JD4A 2DURA 4GOYA 4I6IA 3B69A 5HCFA 3CA0A 2SBAA 3DGTA 4Q1RA 4Z8BA 4P9XA 5BXPA 4I4XA 2ES3A 3EF2A 1S0DA 4D0TA 5GM0A 3LLPA 3BA4A 1YRZA 2X2TA 1SLTA 5SV8A 3KM5A 2R0HA 4XBLA 4FP3A 1V6NA 1KJRA 4J2KA 3ILNA 2EALA 3O5WB 1LOFA 1LU2A 2UWAA 1V6LA 1QF3A 4FPLA 4XJAA 1GNZA 4H9WA 4R9CA 3HBWA 4GWMA 1ENQA 4ISQA 1F5FA 2JDZA 4FGFA 1SLBA 1RG8A 1DQ5A 1MS0A 3M2MA 4P0KA 3DUIA 2JE7A 3N7LA 4YZ4A 1E0OA 3O3QA 2M49A 4FOQA 1N1SA 1G9BA 1V6IA 4USOA 1SCRA 3AJ5A 3PHZA 4TYSA 3HOMA 4Y22A 1SR4A 2P3KA 4GXLA 3FUQA 1BASA 3BOPA 1W6NB 3WHTA 1LGCA 2D7FA 1QOOA 1ULDA 4Q91A 2NN8A 3CRIA 2D20A 4LBJA 2UU8A 4DCKC 5F90A 1SLAA 2J3PA 1AX0A 3M3EA 4ISRA 4NOTA 1PZZA 3B01A 1JLXA 2X2SA 5IT6A 1PZ7A 1ILR1 1TIEA 1N3PA 1DQ6A 3VT2A 4PCRA 5T55A 3Q7YA 4HL0A 3HMYA 1W3FA 5FZYA 1QXMA 3KQRA 3JRRA 2AENA 3PVEA 4OWLA 1G86A 2EIGA 3P6IA 2PHWA 3IPVB 2XG3A 3WG1A 3FLPA 2GNTA 3AKHA 3SH5A 2K43A 1HWMB 1AXKA 9ILBA 4I4QA 3WDXA 1NLSA 3Q9OA 4P6AA 2NP0A 1FYUA 1A8DA 4Y1VA 4XFUA 5G00A 1JW6A 2R0FA 2FO1A 4YG0A 3ZXFA 1LU1A 5GJ6A 3MEPA 4JP0A 4YZ1A 2W39A 4YLZA 4WV8A 1W0PA 3H6SE 3CA3A 4KBBA 1JT4A 2LIQA 1P63A 1KRIA 2ZHLA 4OEEA 4A7KA 3WDVA 3A07A 2ERFA 3AYDA 4I4VA 1ONAA 2LIEA 1CIWA 5L73A 3AH4A 1ISXA 3ZXGA 3NBEA 5EC5A 3N7MA 2A6ZA 5GLUA 4ENDA 2A6VA 3ZSJA 2EF6A 4YGBA 2VSEA 3WO4A 3UK9A 3CU1B 1I1BA 4LBQA 3QLQA 4Y1ZA 4YGCA 4CTEA 4YGDA 2AGSA 3VKMA 2DVGA 4KEJA 3BB2A 4LBOA 3AKIA 3V0AB 2P37A 1DQGA 1OQLB 3FLRA 4FPEA 1SCSA 1FWUA 2Y9GA 3OJBA 2ZMLA 4JKXB 2GNBA 1VAVA 3WINA 1SLIA 2FGFA 3I29B 1R8NA 2OVUA 3RG0A 4QALA 4YM0A 1AXZA 4ITCA 1IS4A 2ZMKA 1QQLA 2D3RA 4YZ2A 2MC2A 2A6YA 4WVWA 1LTEA 1N4KA 4Q27A 3ENRA 4YM2A 4D69A 3WG4A 1FATA 1R1ZA 5JMCA 4LO0A 2ZZJA 4FPCA 3VUOA 2D1ZA 3BAHA 2ZGRA 2E51A 2DVFA 1IOAA 5T52A 1MS5A 3NWKA 5T54A 4G9MA 1HQWA 5GLZA 3VSZA 1FMZA 3MW2A 4OW4A 3N36A 1ABRB 2GDFA 2GMEA 4J2SA 1U0AA 3O4CA 4NO4A 1G9DA 2A71A 5IK8A 3NV2A 3H6QA 1TWEA 3LTQA 3VEQA 5KXDA 2ZACA 4DEPA 1DJSB 4YW3A 3O0VA 3BAQA 3UJQA 1TWMA 4OWJA 2DUOA 4JC1A 4H55A 3W9TA 4Q8LA 4J23B 1XYFA 2I1BA 4GKXA 1W6NA 5T5PA 1SACA 3CRGA 2WSVA 1G82A 3UD9A 3WUCA 5DUVA 1LCLA 3O4OA 2DRZA 4XILA 1HCEA 3O4AA 1B09A 2VW1A 2NYYA 1S1AA 2D22A 1JTCA 1GZWB 2EXJA 5BXTA 3ASIA 1IRAX 1TP0A 4UW3A 1Q56A 3KMVA 1QGLA 3IM7A 2BFHA 1W3AA 1XG6A 3IPVA 1RZOB 1HWOB 3A22A 1HKNA 3L2YA 1XZZA 3FJFA 1MS1A 4YW4A 2E4MC 3ZYRA 3CQAA 5FNXA 4YW2A 3SITA 1LHVA 1NZKA 2WT1A 4LO1C 4ZLBB 3VT1A 1GSLA 1WD4A 1AXMA 4ZFYB 2ERMA 2ZGKA 1CPMA 2GNMA 1GBGA 2XOAA 1W6PA 1SLLA 4UW4A 3WA1A 2GO2A 4YZ3A 4BMEA 3H6RB 5KXEA 1LOGA 3O5SA 2W52A 2A5ZA 1JYIA 5CB7A 4C1XA 2F2FA 1HWPB 1LHNA 2NZ9A 2YMZA 1ISVA 4X37A 2ZHMA 1V6JA 3APBA 1BFCA 4HR6C 3SLIA 3ZC8A 1IS5A 5GLWA 4LO2A 2K8RA 4XFSA 5JOXA 4PC4A 1AJOA 4ZA3B 3WVJA 1G9AA 1LOEA 3PJQA 2OUJA 1H30A 1MS3A 41BIA 1C4RA 1YO8A 2SLIA 3S8JA 1HKDA 3WCRA 1GZ9A 4XHBA 1IJTA 2BEBA 2KLLA 2Q3NB 2PHTA 2ZQNA 1IILA 3BTAA 3BA5A 2WQZC 1APNA 3D5OA 4F34A 3SISA 4QC4A 1GANA 5BP5A 1WLWA 4EB2B 2Z49A 3AZYA 2QN4A 1PWAA 3PVNA 2UUSA 1MACA 5KXBA 4I4PA 4Q9PA 2FHRA 4FPGA 3NV4A 1CVSA 4Y24A 4DENA 1Q1UA 3AXEA 2A3YA 4EKXB 1DZCA 2FDBM 2CNAA 4R9BA 4FOWA 2RG9B 4LBQB 3A23A 2IWTB 2WJSA 4Y1UA 4DRRA 4AVTA 4AGRA 4DQAA 3RMXA 5EG6C 4G9NA 1QMJA 1HWNB 1WBFA 1EVTA 1LHWA 1F9KA 4L4IA 1JT7A 4I8MA 3POWA 3BRFA 2C9AA 2D3SA 4P0JA 2DTYA 2KH2A 2JECA 2DV9A 3RS6A 1FX5A 2R16A 5BQUA 5H9QA 2DVDA 4X39A 1AVAC 1ULFA 4Y20B 1X50A 2EXIA 1F31A 5F8YA 3V0BA 1LOCA 2NMOA 5I1BA 1CQ9A 5B2HA 3NBDA 4LO7B 1T4QA 2ZGMA 4FOYA 4I2SA 3LSEA 1KDKA 4I30A 3WZ1A 4TZDA 4ZXKA 3FBYA 3VWCA 2VXRA 1ZM1A 3IM5A 2OW4A 1RMLA 4Y1XA 2Y9XE 4GA9A 3AXDA 3FJIA 2D7IA 3AZXA 4M3CF 4BMBA 1CE7B 3AP9A 4IZXA 3ATGA 1V6UA 2WRYA 1QOSA 1Q8VA 2I2SA 2V5YA 1GZWA 5F9TA 1FQ9A 4BPZA 4IY9A 4W65A 2H0BA 1MVEA 2YUGA 3AKGA 5DZFA 2KI6B 4BQ1A 4ZOTA 4AVSA 5GZGA 4ZBVB 1W0OA 3AJZA 3B9UA 2WT2A 1UN1A 5EYYA 1IT0A 1BLAA 2JJ6A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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