4ISRA

Binding domain of botulinum neurotoxin dc in complex with rat synaptotagmin ii
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
422
structure length
414
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNDNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structures of Botulinum Neurotoxin DC in Complex with Its Protein Receptors Synaptotagmin I and II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Neurotoxin
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 94
structure length 414
sequence length 422
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4isrA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4isrA02
2CY6A 3O0VA 4I4RA 3I2AA 2V73A 1EPWA 3NV3A 5CA6A 5H9PA 4J2YA 1LHUA 2DRZA 1OKQA 1S0EA 3T8SA 4D0ZA 1WUVA 2ZGLA 1LENA 1PZ9A 1CJPA 4EFPA 1FMMS 1FV2A 3BAHA 3AP9A 4BLIA 3WHTA 2VW0A 1LGNA 1SBDA 3RMXA 1PWAA 3B9CA 2D7RA 4U2AA 4YM3A 4BM8A 3O4OA 5BOWA 1NXD1 1DFCA 3SH5A 1AXMA 3FLRA 4DRVA 3LSDA 1LESA 5G00A 2CL2A 1FQ9A 1AFCA 4IYBA 1G7YA 2W08A 4ENDA 2D6NA 4Y1VA 2JECA 3T1MA 4FPJA 5DZFA 1K5VA 2ERFA 2NYYA 2E6VA 1R8OA 1QQKA 1JXNA 2OVUA 3ZXDA 2RG9B 5HCAA 1KJRA 5DXDA 2Z49A 2DWRA 4AN6A 1W6NA 4K1YA 5T55A 4AGGA 3FJ9A 1BKZA 3NBDA 4I2SA 3PMEA 2AR6A 3ZVXA 4ZKTB 3VT1A 2R1DA 4LBQD 5FNXA 5DUVA 2Z48A 5D63A 3O4AA 1TTUA 1CQ9A 1IOAA 1SR4C 4QBVA 1HLCA 4ISRA 4JRAA 2AREA 1W6QA 4AN7B 1D2SA 3CAHA 4A7KA 4YW3A 1W6OA 3BX1C 3O12A 2WT1A 2D3RA 1Q8PA 3TB0A 1HCEA 4Q2FA 2AAIB 3I29B 1ENQA 3NV1A 2GN3A 4ISQA 2PHRA 4DCKC 3ATGA 2GALA 3OBTA 1HCDA 4LBKA 3QLQA 1JTCA 1W6MA 4G6JA 4YZ5A 3AKHA 1IJTA 2F2FA 4Q9GA 1WW7A 1JQZA 2ET2A 1CPNA 1Q03A 1BLAA 1A8DA 2D22A 1GV9A 4LO1A 1MS0A 2ZHNA 1JLXA 3WMUA 4LBLA 2X2SA 1WCSA 1VAMA 2ZMNA 4FGFA 1UAIA 1DHKB 2D3SA 1M2TB 2DS0A 4I96A 2EAKA 2UWBA 4I4QA 1CE7B 4LO3C 3O49A 2ZQNA 4YZ2A 2FMDA 1FNZA 4Y24A 2JE9A 3C9ZA 2VXTI 2DYCA 2KM2A 1G9FA 4NO4A 3PG0A 2TEPA 2SBAA 4LBJA 4GP0A 2J3PA 1N1YA 1TP0A 2JE7A 2ZGNA 1FV3A 1DZQA 5BP5C 1JYIA 1APNA 4Q1PA 2A6XA 2RSTA 3B00A 1YBIA 1UKGA 1GNZA 3V0AB 3M3QA 3M3CA 2W68A 4I30A 3FJEA 1MS8A 3AP6A 1W3GA 1YIFA 4FVVA 2WKKA 4JC1A 5DVHA 5IK7A 4FOVA 2EXIA 2A3WA 3WINA 3WMVA 3HR9A 1WD4A 3WNXA 3SNVA 2GNMA 1LCLA 4EEEB 4H04A 3O5SA 1FX5A 1F9KA 2AQZA 1Z2VA 5F8SA 4D0TA 5FREA 4LO0A 3BB2A 2ZGSA 5BYNA 5E24E 5F8WA 3CQAA 3AP4A 3LSEA 3W58A 1AX2A 4P9XA 2KKIA 3KMVA 1JUIA 2KI6B 4DS0A 1QMJA 1EV2A 1ISWA 3CA4A 4OWJA 2VSEA 3UDAA 2VUAA 1IS3A 1RINA 2VY0A 4DFSA 4ATEA 3JUTA 3NV4A 3SLIA 3BAVA 1QOSA 1IRPA 4H9WA 2DVBA 2SLIA 1HWOB 4I1EA 1E0OA 1LGCA 1LHWA 3CA0A 1QDCA 1EYLA 5DUXA 1TEIA 2W39A 4GP3A 3BRDA 3UD7A 3WLUA 3AJYA 3F62B 2IHOA 2ZGKA 4XOGA 1ZA4A 1W3FA 2NVHA 4M00A 2GN7A 4NOTA 2CWMA 1GNHA 4PCRA 3WDTA 3WUDA 1CONA 5DZUA 1QXMA 2ZABA 1V6OA 2Y9WC 4L4HA 1TOOA 4R9AA 1JY0A 4FPYA 2WNEA 2JD4A 1M16A 5DZEA 4FQ4A 4Q1RA 4W65A 4FPKA 4M3CE 3BAGA 2WT2A 3INAA 1DZDA 4XYXA 1W3AA 1DYKA 2RHPA 1QU0A 2ZGRA 2P34A 1ULDA 3V79C 4ASMB 1VLNA 4I4YA 1V6MA 4IZEA 5GZGA 1II4A 3OPZA 4OEFA 1DBNA 1T9FA 1CR7A 1CIWA 4XDQA 2D6PA 3ZXEA 3D4KA 1IT0A 2GNBA 1AVAC 1FMZA 4ZFUB 1TWMA 3FJBA 3WHUA 1MS4A 2E51A 3C2UA 3K1XA 5BQUA 1OQLB 2Q5TA 1QKQA 1AJOA 3NWKA 1YTOA 1CPMA 1GGPB 1DFQA 4KEKA 1Z78A 4Y22A 2UURA 1IKPA 1LOGA 5IK8A 4OWKA 3FBYA 1SFYA 2P3KA 4P9WA 2YV8A 1G82A 1TWEA 3P53A 3V64A 3VSFA 3CA5A 4QALA 3NBCA 4YW4A 5GALA 2OUJA 3MEPA 4HANA 3Q7YA 2FO1A 1KRIA 4YFWA 1HIBA 4GXLA 3ZPYA 3B01A 1I1EA 5HCFA 1YI7A 1BXHA 4I0YA 3OY8A 5FZYA 1Q8VA 3QYDA 1GZ9A 3WCRA 4BQ1A 2E4MA 4GWMA 2NMOA 3NV2A 5DG1A 5HPZA 5GLUA 1H9PA 5T5PA 1K5UA 1RY7A 4FPEA 3BA7A 3CNAA 4DPNA 4Y20A 1QOTA 3W9TA 1SLLA 2EIGA 1DQ5A 1V6LA 2ZGPA 4F83A 2P3IA 3OYWB 1DJSB 1N4KA 1GZWB 4JKQA 5H9SA 4I7IA 4KEJA 3R4UA 2AENA 3VUOA 1LOCA 3PVOA 4P6AA 1PZ8A 4EB2B 3M3OA 21BIA 5IK4A 5IUQA 1HWMB 4G9NA 2GMPA 3V0BA 4XBQA 2R0HA 3BODA 2DU1A 3P6JA 3Q7WA 1W0PA 1EVTA 3A0NA 1MZ5A 1FNYA 2Y9GA 4XTMA 5GJ6A 5DG2A 3FJJA 2ZGTA 1MC9A 4YGBA 1UX6A 1W6PB 4RA0A 4ZXKA 1I3HA 4XXAA 3H0OA 1BFBA 3BTAA 2DTWA 3M2MA 3L2YA 4YGCA 1BA7A 1BYHA 4XILA 1Q8OA 1HWPB 4JQ0A 3AZYA 4XBNA 2GZBA 2V5YA 2AUYA 2VXRA 1SZ6B 3N3HA 3VKOA 3BAQA 2ZBJA 1JT4A 5KXDA 4I37A 1J0SA 4X39A 4H55A 1NLSA 2HWAA 3P6IA 1MS1A 3M1HA 4I6IA 2EALA 1A78A 1GLHA 1IILA 4AWDA 1MVQA 1SLTA 1AXKA 2HWMA 1DQ6A 4DEPA 1ULEA 1VIWB 3AP7A 3VV1A 2HW9A 3BA4A 4P9YA 4X38A 1SLCA 4XJAA 1IHKA 2FFVA 1OFSA 4FOYA 2A3XA 3USUA 4AGRA 3ZXKA 4YG0A 2DREA 4LBQA 3QR5A 2H0BA 4ZOTA 1Q8QA 4ITCA 1MS3A 4AGVA 1WBAA 3NBEA 4LBMA 4Q8KA 4YW5A 2BFHA 1V6KA 3S8KA 1WD3A 3N0KA 1BLDA 4I1BA 3WG3A 1ONKB 4GKYA 1G9AA 2BEBA 1JT3A 4HA2A 2F8XC 4I4OA 2Q9XA 4UW4A 4MYEA 1LU1A 3I8TA 1OQ1A 4PBOA 2DU0A 4AVTA 1QNYA 4TLPA 2PHUA 3AKFA 4G1RA 4OEEA 2X2TA 3UK9A 2Y9XE 3CRHA 3R05A 4QC4A 2UWCA 5BXSA 1F5FA 5CNAA 4QO3A 4OWLA 2D24A 3FJ8A 1DYPA 2PELA 4DENA 1N47A 4Q8LA 4LO2C 5E89A 5DZGA 2DVFA 5T50A 3SH3A 1N1SA 4M3CA 4IONA 4IZXA 3UL2A 1G9BA 2ZGUA 1LULA 4Y1ZA 1F31A 3ZYRA 2E53A 1WW4A 3AKIA 3AZVA 1WLCA 3HSMA 3ENRA 2WBCA 1V6UA 1Z4SA 1BZWA 4X3AA 2YY1A 5H9QA 4J2SA 1SR4A 1JHNA 3E8LC 1ABRB 4U36A 2KI4A 3AJ6A 5LK5A 1NUNA 3JU9A 3N7KA 4LBOA 1UZZA 1ISXA 4ZFYB 3LTQA 4DRRA 5H9RA 4XFTA 4XIKA 2C5DA 3N35A 5D61A 3WO4A 1RIRA 2ZMKA 3RS6A 4QKRA 4FPHA 1LEMA 1IRAX 1KQRA 3VWCA 1DZCA 1ENSA 2CTVA 1SACA 2E7TA 1TIEA 3ASIA 4DQAA 4CZSA 3I4IA 4Y26A 3WZ1A 1AXYA 3BRGC 5EXOA 2FFUA 4XMIA 1XG6A 1P63A 1FWVA 3WDWA 1ZM1A 2LIQA 2GNTA 4BMEA 3A0KA 3H6RA 3IPVA 3R4SA 1GICA 4Y1XA 2ZGMA 4LO3A 3ILNA 5E88A 1UN1A 2FHRA 1JW6A 1LJ7A 1Z0HA 4YG3A 9ILBA 3OJMA 5IK5A 4PC4A 4LO7B 1IS6A 2ZQOA 5JLVA 1ISZA 1JOJA 4FPCA 1QDOA 3BA5A 4RL7A 2K8RA 2UU8A 5BP5A 2AXMA 3D6EA 2DUOA 1W6NB 3AYDA 4P0JA 2P23A 4XJ9A 5GLWA 5HCBA 2WJSA 3O4CA 5JMCA 4ZBVB 2XOAA 4QD2B 2DVAA 5AVAA 2NP0A 5JDBA 4I4VA 1W6QB 1ULGA 1W6OB 2ESUA 4XTPA 2DUPA 1HDKA 2NMNA 5BVPI 2FGFA 2Y9FA 4G6MA 3VKMA 3POWA 1S0BA 3UJOA 4R9CA 3H6QA 4QKSA 3N7JA 3MW3A 1PUMB 2Q3NB 4YW2A 4YM2A 1XYFA 3IAGC 1W6MB 1FWUA 4AVSA 5F8YA 3AYCA 4GKXA 1N3PA 3UJ0A 4GA9A 2JKBA 2D43A 3T1LA 4XJZA 3VT2A 1DQ2A 3HOMA 2K4AB 3UD8A 1DQ1A 2WLQA 1SLBA 3SNMA 3FUQA 3ZXFA 3AK0A 4YM1A 4P0LA 3UJQA 1LOFC 3QCWA 3AZWA 3AKGA 3FFZA 3AYAA 1AVXB 5T52A 1UPSA 3AZZA 5EWSA 4HR6C 4KBBA 5GZEA 5JOYA 2NM1A 2D1ZA 5FZZA 4YZ3A 1SCSA 2XB6C 2ZA9A 3ZC9A 3GNEA 2ZHMA 1V6WA 1V6VA 4XFSA 1AZDA 2ZHLA 1RITA 4YW1A 1BFCA 3ZC8A 1BQPA 1AVUA 1DQOA 4OW4A 2ARBA 3ZXGA 5EC5A 1FGAA 1DQ0A 1QF3A 1C1LA 1KDKA 2D3PA 1X50A 4EKXB 2UUSA 1V00A 2P37A 3N36A 4YZ1A 4WV8A 1KITA 1YXWA 5F5QA 2WSVA 1SLIA 4ZLBB 3D5OA 4M01A 1SCRA 5BXTA 3NBNA 2MLLB 1SLAA 4R6UB 1BFFA 3IM6A 2VH9A 3O5WB 4D69A 1QGLA 1RG8A 3FJKA 3WDYA 3ILFA 3FLTA 3PVEA 4WVWA 4JCKA 1O4YA 2NN8A 2VW2A 1H30A 4ZA3B 3MW4A 4YG6A 2A3YA 4XIOA 1S0CA 3N7MA 1HQLA 4IY8A 3HALA 1CVNA 2PHXA 3TC2A 3AFKA 2NZ9A 3EF2A 1FAYA 5GZDA 1N1TA 2ARXA 3OJ2A 3VEQA 4JAWA 3AH1A 1RZOB 1MS5A 3WVJA 1LU2A 2R9KB 5T5JA 2WQZC 4L4IA 4Q9PA 5GZFA 1LHVA 1Y7BA 2AGSA 3UJ4A 3BRFA 1S0GA 1JT7A 3N7LA 1V6NA 1LOBA 4WBCA 3ZSJA 4A7ZA 5EYYA 1GYKA 1HKDA 3MALA 3WO2A 3OGFA 3VKLA 4GWNA 3B69A 2FDBM 2VW1A 4JP0A 4KEIA 3MW2A 3AXDA 3A23A 5F90A 4I4UA 5KXCA 5GAQA 1HQWA 4XBLA 3POKA 4YOLA 1YYNA 5EHAA 5FZUA 1PZ7A 3V65A 5CB7A 3H6SE 1LEDA 4C1WA 4UW6A 5D62A 2Z42A 2R0FA 3WCSA 3CRIA 4LO7C 1G8WA 1S0JA 4HL0A 2D6KA 3O4BA 5BXPA 4BLJA 1LHOA 3A4UA 3FJIA 8I1BA 1AJKA 1BJQA 4YFZA 3F1RA 4R9BA 4F34A 2A7AA 2ZKNA 1UMZA 1MZ6A 1S0DA 1UZYA 2A5ZA 1V6JA 3AYEA 1WBLA 1S0LA 2I2SA 2A75A 3POSA 1N1VA 3V0AA 1MS9A 1GANA 2D6LX 4FQZA 2R16A 5GLVA 4QD2C 2EXJA 3FGMA 7I1BA 1DQGA 3JRRA 2GO2A 3T2TA 1BARA 3ILAA 4IQPA 3WDVA 4HJJA 1N3QA 1JBCA 5GLTA 3MPPG 5SV8A 3PVNA 2PHWA 2L5XA 5GZCA 4GOYA 2EXKA 4OZXA 4Y22B 4KC3A 1WLWA 1TFMB 1BASA 4AVVA 1ILR1 5F9TA 4P0KA 3RG0A 3O0WA 5DUWA 4FPGA 4A7YA 5KXBA 1QOOA 4L8QA 2R49A 5T54A 4K21A 4YGDA 3NJ5A 2CNAA 2F2FC 3LLPA 3WG1A 2DTYA 3ZSKA 5GLZA 4R9DA 1ULCA 4LO1C 2ENRA 4J2KA 2ZAAA 3DGTA 4WVVA 3OY8B 3HMYA 5DUUA 4PF5A 2LTNA 2CWSA 1C1FA 2LALA 2P39A 3IKWA 1LHNA 2XG3A 1MACA 1WBCA 2QN4A 3BAUA 3WDUA 4I8MA 1PUUB 1AX1A 3SISA 4Y20B 4UW5A 2D20A 4K1ZA 1QQLA 1QNWA 4I4SA 3RSJA 1AF9A 2BEAA 3IM5A 1LOAA 4OEGA 2P2KA 5FNWA 1XHBA 5B2HA 2KLLA 3VT0A 2VLCA 2ZGOA 4LO8B 1DLLA 1IOBA 3BIWE 3BAOA 2G4IA 5JOZA 5IT6A 1VAVA 4JKXB 1URXA 3VSZA 1IS5A 5JOWA 3V0BB 4GAIA 4BMBA 5CBLA 2M49A 1LODA 3WINC 3CA6A 4Y1UA 3AP5A 1S0FA 2DV9A 4M3CF 4FPLA 4IY9A 1MR5A 2DUQA 4Z8SB 4LO0C 2D23A 3PUBA 1LTEA 1DGLA 3BADA 4X37A 1SBEA 2YUGA 2DURA 1D0HA 1JN2P 3A22A 3S8JA 1YF8B 2PHTA 5T5OA 3O3QA 1GZCA 2W52A 1G9CA 4LO2A 3ZX7A 2A70A 2GMEA 5FRAA 3W59A 4K20A 4FPFA 1MD6A 5E8AA 4P14A 2YZ4A 3B9UA 2D7FA 1PZZA 1I1BA 1IS4A 3FJDA 3I2XA 2DRYA 1WBFA 1IKQA 5BXRA 1VCLA 3ZXLA 2YMZA 5EYXA 4PQ9A 41BIA 4C1XA 3OJVA 4XJUA 3RMYA 1LOEA 2YXSA 5I1BA 3O0XA 4XFUA 4XZPA 1GBGA 1DIWA 1ULFA 2PHFA 3AXEA 2GDFA 2E7QA 2ZGQA 2ZACA 3AX4A 1HKNA 2A6ZA 1BFGA 3OGGA 3FJFA 1N3OA 3USUB 2B7YA 2ZMLA 3SH4A 3LCPA 1U0AA 3AH2A 2UWAA 4UW3A 4LBQB 4FOWA 1KNMA 3HN1A 2ZR1B 3CRGA 1KJLA 3ZXJA 2D7IA 2RQ9A 1C57A 4XJWA 4XHBA 5DSSB 3WO3A 4ZGRB 1AVWB 1W0OA 1J1TA 3IN9A 3OYWA 1NZKA 1GZWA 2LIEA 4QBCA 1Q8SA 2QYIB 2OUHA 4FOQA 1UL9A 3CA1A 1G9DA 3IMNA 2EXHA 4Z9WB 1GKBA 3FJCA 4GALA 2IWTB 3AJZA 4EFRA 4USPA 1CESA 2VU9A 2D44A 3BOPA 4CTEA 1JYCA 2A6VA 3A07A 2ERMA 4XJ8A 5T5LA 1V6XA 6I1BA 2YROA 1V6IA 3FJHA 1S1AA 3GALA 4Y1YA 5BQUC 2JDZA 4M3CB 1WW6A 3RQ0A 2R1BA 1S0IA 4PBPA 1L2HA 1LGBA 1W6PA 2GMMA 2EF6A 2A6YA 2A6WA 1ISVA 3O4DA 2A71A 2MIBA 4II0A 3WV6A 1ONAA 5L73A 1A3KA 3IIRA 1FYUA 2C9AA 1XQNA 3M3EA 3Q7XA 3RTJB 2AFGA 1GSLA 1FATA 1Q1UA 31BIA 1WLDA 4D8HA 4FPOB 1R8NA 4YM0A 2BQPA 2ZZJA 2AH2A 4SLIA 2HZ9A 3PHZA 3VKFC 4WZFA 3AH4A 4GOVA 3ILRA 3ZSLA 1KDMA 4BPZA 1AX0A 3SITA 4YGEA 2E4MC 2WSUA 4CRQA 2WRYA 4LBNA 1ENRA 4USOA 1XZZA 4CJMA 4I3NA 4I4PA 4XMAA 4ZFWB 3AJ5A 1AVBA 3CA3A 3Q9OA 3UD9A 1WW5A 3B3QE 3OJBA 2K43A 1YRZA 2I1BA 1LOFA 4GAFA 2GNDA 3RTIB 3U4XA 2NTDA 3WG4A 4TZDA 3H6RB 1G86A 2OW4A 3IPVB 3VKNA 4EFQA 5CAZA 1SBFA 4TYSA 3KQRA 3FJAA 2WT0A 3FUOA 4J2XA 1ISYA 1H9WA 3OBRA 1Q56A 3FLPA 2DVDA 4AYUA 3IM0A 4Q26A 1B09A 1PC8B 3A21A 3WUCA 5KXEA 1YO8A 2D6MA 4Q91A 1DQ4A 3O44A 3POYA 5DUYA 2ES3A 4ATFA 1R1ZA 2KH2A 4FP3A 2HYKA 2JJ6A 4J23B 2D6OX 3AZXA 4XHXA 1T4QA 3JUUA 4XXPA 3APBA 3D7WB 1LECA 2MC2A 3IM7A 5EG6C 4YLZA 4G9MA 3WDXA 5JOXA 4XE9A 3CU1B 3WA1A 2VSAA 4FP2A 3HBWA 1CN1A 4IHZA 1RMLA 2AYHA 1JT5A 2CYFA 2DVGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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