4JRAA

Crystal structure of the botulinum neurotoxin a receptor-binding domain in complex with the luminal domain of sv2c
Total Genus 93

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
421
structure length
416
Chain Sequence
TSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
publication title Structural basis for recognition of synaptic vesicle protein 2C by botulinum neurotoxin A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
total genus 93
structure length 416
sequence length 421
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2013-03-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4jraA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4jraA02
2ZGLA 3P53A 2XG3A 4I4OA 1LODA 3NBNA 3UDAA 5E24E 2GNTA 4L4HA 3M3EA 3FLRA 2DS0A 1YIFA 4M3CB 3CA3A 5DUUA 3ILRA 1DQ6A 2P39A 4XFTA 1DQGA 1GYKA 1C1FA 1W6QB 3Q7WA 2R1DA 1HQWA 3O0XA 2E51A 1HDKA 1SLTA 2FMDA 4F83A 2A6VA 4DRRA 2E6VA 3ZYPA 4GA9A 4Y20A 3U4XA 5D62A 2R0FA 4XTMA 5BXTA 4ZBVB 3AZZA 1VALA 2A7AA 2UWAA 2P3JA 4UW4A 1NLSA 4XTPA 4I4VA 2VSEA 1UX6A 2VW1A 2WSUA 3CU1B 3QR5A 3WDWA 1LHUA 3N3HA 1WW5A 4YZ3A 5GLZA 3AXDA 2DWRA 1N1TA 4G9MA 2PELA 3I8TA 3AH4A 4IZXA 1V6VA 1TFMB 3PHZA 4ATEA 5HCBA 3VKNA 3BAQA 4IYBA 3C9ZA 5T5JA 5G00A 1HIBA 2SBAA 1AXMA 1SBEA 1NZKA 3BA5A 1FYUA 2VXRA 2AGSA 5EYXA 2X2TA 4ASMB 2RSTA 1HQLA 1RZOB 4YLZA 4ITCA 1V6OA 2V5YA 2VU9A 3JU9A 3A23A 3AZWA 4J2XA 3NV3A 4ZOTA 3S8JA 4Q9PA 1BA7A 3H6RA 4QC4A 3SITA 2GN7A 1LHWA 2CNAA 3BAVA 1Q8SA 5F90A 5DUVA 3O4CA 2WT2A 1ABRB 3ZXDA 4YGCA 3OGGA 4M3CF 3BA7A 1RY7A 3VSZA 1LU1A 5GJ6A 2D6MA 4IHZA 3O0WA 4FPLA 1JBCA 1ONKB 4M00A 2GN3A 4M3CA 2E4MA 1WUVA 2RG9B 2JE9A 4LBQD 1WBLA 4PC4A 2Z42A 2ZHLA 3OJBA 2ERMA 5FREA 1YXWA 4Y22A 1A78A 4G6JA 1GZWB 3IPVB 3FJDA 3ZSMA 4QKSA 2F8XC 5B2HA 2QYIB 2EXKA 2R9KB 9ILBA 1N1YA 4D8HA 4D69A 5GZEA 1UN1A 4OUJA 5BYNA 3BRDA 4XJZA 4I2SA 3BRFA 2QN4A 2RHPA 1QOOA 4JP0A 5GLVA 1HKNA 5BP5C 3H6SE 4XJAA 1FQ9A 4Q9GA 1UZYA 4YW2A 2R49A 1RITA 1XYFA 4JPZA 3VKOA 1EV2A 4UW3A 2SLIA 4QALA 4YGBA 3AJ5A 2ZGSA 5H9RA 1UAIA 2ESUA 4GKYA 4RA0A 3CA4A 2A75A 2I1BA 1LCLA 3VKMA 4D0TA 3VT1A 4GP3A 4LBQA 1GNZA 3POKA 1PUMB 1SBFA 2YZ4A 2GNDA 1AVAC 4I96A 1QXMA 4BPZA 5GLTA 4LO8B 3WMVA 3WG4A 4FPOB 3WUDA 2WRYA 2DV9A 2D20A 1LGNA 3ASIA 2WKKA 1QDCA 2OW4A 4IY8A 3WO2A 1IS5A 4FPEA 1Q8PA 3O4OA 2ZQOA 1VIWB 3CRHA 4FVVA 4EFRA 1QU0A 4I8MA 3WDVA 4P9YA 3UK9A 3A07A 4BQ1A 1ISZA 1NUNA 1GV9A 3FUOA 4R6UB 3SNMA 4LO1A 2D3RA 3R4UA 4YG6A 2M49A 4K20A 3N7JA 1EVTA 2C5DA 3ZXJA 1W6NA 4LO3C 1V6IA 2A70A 5BXSA 3AP5A 1SCRA 4FPKA 4AN6A 2VW2A 3BODA 2Y9FA 1WBCA 5DZGA 2W52A 4I4RA 3ATGA 1IOBA 3S8KA 3HN1A 3V0AB 5KXCA 3O4DA 4GXLA 1G9BA 3B01A 5GZDA 1GZWA 1ISXA 1VCLA 4ZFWB 1SLIA 3L2YA 3FJCA 4GAFA 4EB2B 4DRVA 1GBGA 3RTIB 3I4IA 3UJOA 1Z4SA 2ZGTA 3I29B 1UKGA 2W08A 3FBYA 4YZ5A 1Z2VA 3WOGA 3OJMA 4WVWA 2ZZJA 2A6XA 1BLAA 5DZFA 3VEQA 1O4ZA 1PC8B 1MACA 2HZ9A 3V79C 3FJEA 1Q8VA 3T1LA 2EF6A 1FNZA 5GALA 3T8SA 1AZDA 2YY1A 1LESA 2ZKNA 3FJ9A 5BQUA 1ULCA 3B69A 1QDOA 4GKXA 4XZPA 2P3KA 1FN0A 3UD8A 1KJLA 5CA6A 2D44A 3HSMA 4I4PA 2A6WA 1E0OA 3FFZA 1ULEA 3Q7XA 1W6MB 1MS1A 1AXZA 5CNAA 5F5QA 1AJKA 2ZAAA 4TYSA 3OJ2A 3FJIA 1S0JA 5EXOA 4I0YA 4X39A 1HWNB 2P37A 2AQZA 4FP3A 3O49A 1SLLA 4FOQA 2OUHA 5DVHA 4DS0A 4GWMA 2ZMLA 3V0BA 3GALA 1LOBA 2ZGMA 3OPZA 4R9BA 1FWUA 1SR4A 4YZ4A 1V6UA 1BJQA 3M2MA 1S0GA 2I2SA 2ZABA 1ZM1A 5T5LA 2GO2A 5BVPI 1DQ4A 4IQPA 1KDMA 3R05A 3ZXKA 4FOYA 5D61A 4P6AA 4ZKTB 2D22A 2YMZA 2VW0A 3D5OA 1AF9A 5H9PA 2ARXA 5IK7A 5FZYA 1OQ1A 2ES3A 4Y20B 5EWSA 1AVWB 3FLPA 4BLJA 5KXBA 2D6LX 3BAUA 4YM2A 1V6NA 4R9DA 2WT1A 2D6NA 2HW9A 2ERFA 4XHBA 5CBLA 2G4IA 5EC5A 2A3WA 3AKFA 1Q1UA 3WG2A 4LO0A 1N1VA 3POWA 5E88A 3K1XA 1XQNA 2P3IA 3FJKA 1WD4A 1UMZA 4P0KA 3POYA 3CQAA 1YBIA 5HPZA 5GLUA 3AYCA 1IJTA 3AKHA 3P6JA 3WHTA 1IS3A 1N1SA 3N0KA 2JECA 1ILR1 3NV1A 1C57A 3H6QA 2D24A 4Q1PA 1HCEA 2ZGNA 1AVUA 4OW4A 3INAA 4OWLA 3IMNA 4DFSA 3OBTA 2AREA 2EXHA 3ZSLA 2DTYA 1HKDA 3VUOA 4LBLA 1ENSA 1DYKA 3POSA 3ILAA 1PZ8A 2WNEA 5JDBA 1IILA 2CTVA 5BXRA 3O4AA 3RMYA 4YOLA 3SNVA 4MYEA 3D7WB 3CRGA 1YI7A 3H6RB 3AK0A 1Q03A 4J2SA 1W6MA 4ISRA 3OBRA 3D4KA 1R8NA 3B3QE 5H9QA 5E8AA 1PZ7A 1YTOA 2BEAA 4LBMA 1DZDA 1ENQA 1UL9A 1AX1A 4GAIA 3CAHA 3A22A 3LLPA 1W3GA 1Q8OA 2BQPA 3ZVXA 1H30A 4Y22B 1YF8B 1A8DA 1DQ1A 1LOFC 1JHNA 5JLVA 1B09A 1DJSB 1LHNA 1ULGA 3PJQA 5GLWA 1IRAX 1QF3A 2KKIA 4WV8A 3AH2A 3BAOA 3A0NA 2ZR1B 4XDQA 3BAHA 1MS8A 1IT0A 1AXYA 4KEIA 1G9DA 2AXMA 3FGMA 1I3HA 4C1XA 3M3OA 1BXHA 2E7QA 1QMJA 1S0DA 3UJ0A 5AVAA 1BKZA 2WBCA 2KH2A 2Q5TA 1TTUA 4Z8BA 1XG6A 4Q8KA 1FV2A 4XIOA 1ULFA 2VH9A 1NXD1 2OUJA 1AX0A 1W6OA 3RS6A 5JOXA 1DQ0A 1Q56A 1SBDA 1CVSA 3W9TA 3AZVA 4Q8LA 4I37A 4USOA 3M3QA 2VY0A 4LBQB 7I1BA 2IHOA 4X37A 1VLNA 1GSLA 3F1RA 1SLBA 3AYAA 1KNMA 3LCPA 2WLQA 1V6LA 3RSJA 5GZCA 1LGBA 1MS9A 1VAMA 1DIWA 2NN8A 4FOVA 2W68A 5JMCA 2B7YA 4HR6C 1D2SA 3OGFA 1KQRA 1N3QA 4JQ0A 3ZC8A 3HR9A 2MIBA 2DURA 1PWAA 3WNXA 4HL0A 4WVVA 2LIEA 2CWMA 4EEEB 1K5UA 5FNXA 4CZSA 5IK5A 1FGAA 1W6NB 2VXTI 4I4SA 2A6YA 1JT5A 2ZACA 2A5ZA 3A0KA 4G6MA 2EALA 3I2XA 3KQRA 4I4XA 3O5SA 4LBKA 2NMOA 4Q26A 3PVOA 4YW1A 3OY8A 4LO7C 2CL2A 3CRIA 3ZXGA 3IN9A 1QGLA 1G9FA 3AYEA 2WSVA 1FATA 2OVUA 4JKXB 4LO3A 1F9KA 1ISVA 2AH2A 4YM1A 3IIRA 1S1AA 2A71A 5T52A 1X50A 3WDTA 4ZXKA 4I7IA 3WO3A 2HYKA 3OYWB 1EPWA 4K1YA 1GICA 3FJBA 4AN7B 21BIA 2VUAA 2CYFA 3NBDA 3ZXFA 1ONAA 1OFSA 4OEGA 1W6PB 1W3AA 4LBNA 1FX5A 4HJJA 4AVVA 3QLQA 4Q27A 3AH1A 4OWKA 4YM3A 2ZMKA 2IWTB 2TEPA 5DZUA 2BEBA 4YZ1A 2Z48A 4HA2A 2KI4A 2NM1A 5BXPA 1C1LA 1W0PA 1BFBA 3N7KA 3EF2A 4I6IA 4I3NA 4H55A 1S0BA 4GOVA 1LTEA 1RG8A 3WHUA 3SH5A 4OZXA 2JE7A 3IKWA 4AVSA 4QD2C 2GMEA 4XMAA 1IKQA 2H0BA 3V0BB 3AJYA 3B00A 1JW6A 1HWOB 3FLTA 1G86A 5HCAA 4I4YA 2D43A 2A3YA 2ZGKA 5IUQA 2GNBA 2D1ZA 4YFZA 3RG0A 31BIA 1YYNA 1R8OA 5HCFA 4XFSA 2PHUA 2BFHA 4YGEA 3UJ4A 3N36A 1AVXB 1ITBA 3APBA 5F8SA 4EKXB 5JOYA 4I1BA 1CN1A 4Y1VA 2FFUA 4FPYA 2PHRA 4L8QA 1IRPA 1TOOA 3TAYA 2DTWA 3ENRA 5SV8A 5T55A 3IM6A 8I1BA 1JY0A 2ET2A 4FGFA 2D3PA 3BTAA 3VKLA 1IS4A 3UJQA 1KJRA 3V65A 1MZ5A 1GZCA 4XJUA 1V00A 2DVFA 2ZGOA 3VWCA 3BIWE 4L4IA 1CJPA 4XILA 3PMEA 3NV4A 1M16A 1DHKB 3ZXEA 1QQLA 2F2FC 1VAVA 4OWJA 5JOZA 3OYWA 3O44A 3WINA 1KRIA 3WUCA 3JRRA 4II0A 3HALA 2GDFA 1W6PA 1V6WA 1AX2A 3ZXLA 4YW5A 2LIQA 3I2AA 3JUUA 2Z49A 2EAKA 1TIEA 4FPCA 2R16A 3V64A 2ENRA 2P34A 3WA1A 2JD4A 4G1RA 2JKBA 1D0HA 4PQ9A 1IOAA 1PUUB 1SFYA 3E8LC 1FWVA 4FPJA 5T5OA 2ZGRA 5EYYA 5BOWA 1U0AA 4KEKA 4ZA3B 4I1EA 4KBBA 3W59A 2Y9WC 1LOEA 1FMZA 1IKPA 3ZX7A 4LO1C 4XFUA 4DPNA 4ISQA 1LEMA 2NVHA 3FJJA 1S0CA 1JLYA 2Q3NB 2Y9GA 4GALA 1IHKA 1K5VA 2RQ9A 2D6OX 4ZGRB 1LOGA 4FPHA 3WLUA 1KITA 2A3XA 4YFWA 1Z0HA 4FQZA 4XXPA 3RTJB 3W58A 1SZ6B 1LGCA 3O3QA 3AFKA 1MC9A 4BOWA 4Y1UA 5EHAA 2HWAA 3NWKA 2W39A 4CRQA 1LENA 5DUYA 2P2KA 4XE9A 1GNHA 1WW7A 4U36A 1LEDA 1W6OB 41BIA 2MLLB 3H0OA 4AWDA 5GZGA 1TEIA 3GNEA 4KEJA 2ZGQA 1S0EA 1L2HA 1CVNA 2GNMA 3B9UA 2WJSA 2PHXA 3LSEA 3AP7A 4M01A 1V6XA 5I1BA 4BMEA 1DQOA 4DEPA 2YROA 3IM7A 1DLLA 2HWMA 1TWEA 3FJHA 2Q9XA 5BQUC 1WLWA 3BRGC 2ARBA 4PF5A 1XHBA 5FNWA 3JUTA 1S0LA 4D0ZA 4X38A 1MS0A 4LO2C 3MPPG 4PBPA 4H9WA 3UD7A 1DGLA 3ZYRA 1N3OA 4AGVA 4BMBA 2EXIA 1Z78A 3USUA 4GWNA 3WDXA 1SCSA 1GZ9A 2ZMNA 5JVVA 5F9TA 5T50A 1AFCA 4XBLA 3VT0A 4QKRA 3PG0A 1DZQA 1LULA 3Q7YA 2ZA9A 2DUQA 1HCDA 5DG2A 2X2SA 1APNA 3AZXA 1SR4C 2YV8A 1JT7A 3OY8B 3VSFA 2AFGA 1LJ7A 4ENDA 4P9WA 4CJMA 4A7KA 2KLLA 5LK5A 1MZ6A 1R1ZA 1LOCA 5DUWA 2D3SA 4NO4A 1SLCA 3AYDA 2UU8A 3HBWA 3MW4A 4YW3A 4LBOA 3WDUA 1G9AA 1G7YA 2ZHKA 1J0SA 4DCKC 1TP0A 4LO0C 5F8YA 6I1BA 4OEFA 3MW3A 2JJ6A 1JXNA 3CA6A 3D6EA 4NOTA 2GMMA 3PVEA 5KXDA 1DBNA 5F8WA 1FNYA 4CTEA 2NTDA 3R4SA 2R0HA 5IK8A 1LU2A 1MS3A 1ENRA 1YO8A 2E53A 4FOWA 2C9AA 1DFCA 4M3CE 5BP5A 4AGGA 4DQAA 5IT6A 2D6KA 2DVAA 2PHWA 3CA1A 4QO3A 2K43A 3FJFA 3CA0A 1S0FA 1FAYA 1Q8QA 3F62B 1N4KA 4XJWA 1RIRA 2V73A 2YXSA 3FJ8A 3O4BA 2D7IA 4XIKA 4IY9A 1KDKA 3DGTA 4R9CA 1M2TB 4YW4A 3AJ6A 4XKIA 1JYIA 4XJ8A 1JN2P 1QOTA 2D6PA 1PZ9A 3WCSA 4ZLBB 1QNYA 5JOWA 4K1ZA 2VSAA 1ISWA 3IAGC 3ZSKA 2DREA 1OQLB 2VLCA 4USPA 5GAQA 4ZFYB 5D63A 3T2TA 1HWMB 1CR7A 4JRAA 2DU1A 4XOGA 1WCSA 1WLCA 5E89A 1F31A 2UWBA 3QCWA 1IS6A 1WW4A 1O4YA 4Z9WB 3ILNA 3O5WB 1A3KA 2FDBM 3PVNA 4TZDA 4J23B 3UL2A 3BOPA 3BAGA 1GANA 4IONA 3M1HA 3WMUA 3VV1A 1W3FA 4JAWA 4IZEA 1BFCA 1T9FA 2D23A 2Y9XE 1JOJA 1W6QA 3ZSJA 4Z8SB 1MR5A 1BFFA 3RQ0A 1BLDA 3VKFC 3NJ5A 1JUIA 5KXEA 2D7FA 1JYCA 1WLDA 1EYLA 3A21A 3WDYA 3IM5A 4BLIA 2AR6A 2YUGA 3BX1C 4GP0A 4A7YA 2F2FA 1CE7B 3SISA 4KC3A 3AKGA 4XHXA 1CIWA 3B9CA 2DUOA 3T1MA 2DRZA 3ZPYA 3MALA 2WT0A 2EXJA 2P23A 1GKBA 4FPFA 3QYDA 2UURA 3UD9A 2NP0A 4WBCA 4Q1RA 1QQKA 1HWPB 4C1WA 2UUSA 4ZFUB 3TB0A 2LTNA 3AXEA 1H9PA 1FV3A 4HANA 4I4UA 1OKQA 4FPGA 3SH4A 3HMYA 1CESA 3P6IA 1G8WA 3IM0A 2FHRA 5FRAA 4P9XA 3M3CA 5CB7A 2FO1A 3N7LA 1CPNA 1JLXA 4YG3A 2ZBJA 1N3PA 5CAZA 3WCRA 1H9WA 2NZ9A 3FJAA 3HOMA 4XJ9A 2E4MC 1BQPA 4RL7A 1MS5A 4P14A 5T54A 3KM5A 1WD3A 4PCRA 1YRZA 2AENA 4X3AA 1JT3A 3BB2A 1N47A 2NYYA 4TLPA 1WBAA 1BYHA 2DYCA 3RRDA 1MVEA 1MVQA 1WW6A 4WZFA 3CNAA 3AP9A 2FFVA 3AKIA 1JT4A 1UZZA 4J2YA 5EG6C 3IPVA 1GLHA 1DQ2A 1CQ9A 2CY6A 4JC1A 4Y1YA 1S0IA 3WZ1A 3VT2A 4Y26A 1BZWA 3BA4A 2JDZA 3O12A 2ZHNA 4I30A 4YM0A 1Y7BA 4QBCA 4BM8A 4A7ZA 4FQ4A 4XBNA 4U2AA 1MD6A 4JCKA 1FMMS 3SLIA 2J3PA 1DYPA 4YZ2A 3C2UA 5DXDA 4GOYA 3USUB 2AYHA 1CPMA 4H04A 1UPSA 2CWSA 2UWCA 3A4UA 4SLIA 2A6ZA 4LO2A 3BADA 3LSDA 4XYXA 3ZC9A 2D7RA 1V6KA 4XXAA 1I1EA 1LECA 2ZGPA 2DRYA 4J2KA 1LHOA 1QKQA 4Y1XA 1QNWA 2NMNA 1F5FA 1LOAA 1ZA4A 1WBFA 3PUBA 1G9CA 4JKQA 3NV2A 1DFQA 3Q9OA 5GZFA 1BARA 2E7TA 3LTQA 4FP2A 3WO4A 5FZUA 3N35A 4OEEA 5IK4A 4G9NA 3AP4A 4K21A 2DU0A 1AJOA 1V6MA 1Q04A 3TC2A 4Q91A 1PZZA 2PHFA 5DUXA 2KM2A 1BASA 4UW5A 3RMXA 5H9SA 4W65A 2ZQNA 2GZBA 4LO7B 4XBQA 1SLAA 5L73A 1TWMA 1G82A 3WG1A 4Y1ZA 2L5XA 2EIGA 4Q2FA 1LOFA 3N7MA 2GMPA 2ZGUA 1ULDA 1MS4A 1DZCA 3FUQA 2R1BA 1W0OA 1I1BA 5FZZA 3SH3A 2WQZC 1URXA 1GGPB 1LHVA 4XMIA 1JTCA 4AGRA 1J1TA 4I4QA 4AYUA 3NBCA 3V0AA 1JQZA 3AP6A 3DUIA 4F34A 1SACA 3WINC 4LBJA 3AZYA 5DG1A 1HLCA 4P0LA 2KI6B 1AVBA 2XB6C 4R9AA 3MW2A 4EFPA 4YGDA 1C4RA 4QBVA 4Y24A 3WV6A 1XZZA 4YG0A 2DVDA 3MEPA 5GM0A 1DQ5A 1T4QA 2LALA 3OJVA 1RINA 3AX4A 2GALA 2AAIB 2DVGA 1RMLA 3CA5A 4EFQA 5DZEA 2K4AB 3KMVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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