4KBBA

Structure of botulinum neurotoxin b binding domain in complex with both synaptotagmin ii and gd1a
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
430
structure length
417
Chain Sequence
NNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of dual receptor binding to botulinum neurotoxin B.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
molecule tags Signaling protein/toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 103
structure length 417
sequence length 430
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2013-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4kbbA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4kbbA02
4EEEB 3SITA 3OBRA 1AVAC 1T4QA 3AX4A 4JRAA 4ZFYB 1N3PA 5GLTA 3BA7A 1FGAA 3AKFA 3AJ5A 3M1HA 4L4HA 5JOZA 4R9DA 3FLPA 3W58A 3MEPA 1CESA 4Z9WB 3ILAA 1IKPA 1SLCA 4K1YA 4YZ3A 4EB2B 3BRFA 3H6RA 2GZBA 2DREA 3OJ2A 1R8OA 1UAIA 4XOGA 3CRHA 3Q7XA 1MS9A 5GAQA 1YO8A 1JYIA 3VSZA 1WBFA 1BJQA 4GOVA 3MW2A 4HA2A 3ZX7A 1BA7A 1A78A 4USOA 1CPNA 2F2FA 1A8DA 1F5FA 2PHUA 1JT7A 1HCEA 4A7ZA 1MVQA 4ZFUB 5H9RA 3LSDA 2F2FC 4YW2A 2ZGUA 3FJEA 4Y1VA 2E6VA 4YM1A 3IAGC 3PVOA 2ZHKA 1SR4A 2VW2A 1I1BA 2RG9B 3OYWB 1K5UA 1QQLA 1VLNA 2ZACA 3ZXGA 2DYCA 1V6WA 3D7WB 1DQ5A 4KEKA 4IZEA 4BOWA 3NBDA 3CRGA 1V00A 1Q8VA 2WJSA 2NTDA 4XIKA 4OEFA 1O4YA 1TEIA 1S0LA 1QNYA 1WUVA 2LIQA 5DZGA 4U36A 1Y7BA 2A75A 4YZ5A 2DVGA 1Q04A 2D24A 3FBYA 1N3QA 4I4SA 4XMAA 1ISZA 3HR9A 1W3AA 3WG3A 4UW3A 4LO1A 1FAYA 1EV2A 5BYNA 3B3QE 1BZWA 3ZC9A 3V65A 1TTUA 4I4UA 3W9TA 2R49A 1LESA 3WG2A 1W6NA 3HMYA 2DU0A 4BM8A 1Z78A 4KEIA 4XJ8A 4W65A 1NLSA 1Q8SA 3WDXA 2XB6C 4LO1C 2A5ZA 3AH2A 1APNA 5F8WA 2JKBA 2YUGA 3ZVXA 5D61A 3AZWA 2E7TA 1DZCA 3NV3A 1LHOA 5BQUA 3B69A 1QGLA 2GNBA 3QYDA 3JU9A 5EXOA 1X50A 2CTVA 4ZA3B 1Q03A 4YZ1A 4ISRA 4PF5A 1ENRA 2M49A 3UJ4A 4PBOA 1BFCA 5HCBA 2D3PA 3VUOA 2PHXA 3I2XA 5CA6A 2SBAA 3P53A 3L2YA 4M01A 1JLXA 3AKIA 4R6UB 3OJMA 3OPZA 5AVAA 4X37A 1JN2P 5FNXA 1GGPB 1QOTA 1IOBA 3N7JA 4WZFA 1G9AA 2HWAA 1RIRA 5JMCA 1CE7B 3A4UA 1EPWA 2X2TA 3A22A 2ZQNA 5GJ6A 1QOOA 4AVTA 3A07A 1XQNA 6I1BA 3WUDA 1UX6A 2R1DA 5DUVA 3FJAA 2EIGA 1SLBA 3HALA 3AYDA 3MW4A 1JQZA 3CA3A 5EHAA 2AFGA 2C5DA 2VSEA 3ZXJA 4XYXA 1DQ0A 4G9NA 3IM0A 2DUOA 4Y22A 3UD7A 1WW6A 1BKZA 2V5YA 2GO2A 1WCSA 2JE7A 2A3XA 4R9CA 4BQ1A 1XG6A 2DRZA 4C1WA 3AP7A 4EFRA 2VY0A 3O4CA 5T5OA 1LJ7A 1HWNB 3OY8A 1FNYA 3QCWA 2J3PA 4BPZA 1DQGA 1UPSA 4H04A 1HQLA 2C9AA 4FPJA 3FJCA 4P6AA 1AVUA 2LIEA 1CR7A 4Y26A 1KQRA 3M3QA 4Y20A 3O3QA 1MC9A 1DLLA 3FLTA 3IM6A 3ZYRA 4WVVA 1IS3A 3UL2A 1DIWA 5B2HA 2Z48A 1FN0A 5JDBA 2A3WA 3FJHA 1MS1A 1WW5A 5JOWA 3I4IA 3JUUA 2ZGQA 5E8AA 3D5OA 4OWKA 4IONA 1OFSA 1AX2A 3WHUA 1FV3A 2KM2A 4XFTA 4I96A 1FX5A 3BAHA 2GNMA 3KM5A 1HIBA 3VT1A 2AYHA 1LTEA 2Q9XA 4G1RA 3PG0A 4XXPA 4Q27A 2YV8A 5EYYA 2W39A 3R05A 2NZ9A 4ENDA 2R1BA 3VEQA 3UJQA 1QXMA 4HR6C 1XZZA 5BOWA 1FWVA 2ZGMA 21BIA 1LHUA 3IMNA 3CA4A 3LCPA 1CONA 3OBTA 1GNHA 3HBWA 1Q8OA 5T50A 1KDKA 4FPLA 3FJ8A 1DFCA 3O4DA 4GWMA 1AZDA 1SCRA 3FUQA 4ITCA 4Y1ZA 3IPVA 4XILA 3NJ5A 4PBPA 2ENRA 1K5VA 3BRDA 2A7AA 2D43A 2D6MA 3WNXA 3HOMA 1JBCA 2YZ4A 1WD3A 2P3IA 3BAVA 1KRIA 2K43A 1PZ8A 3VKLA 3FJBA 4FOWA 2WRYA 2RQ9A 1YBIA 3NBNA 1PUUB 3BB2A 1GLHA 2DVAA 1G86A 1DFQA 1P63A 4Q8LA 1C1LA 1LU1A 3N7KA 3CNAA 1QDCA 1Q8QA 3AYCA 4UW6A 4JQ0A 4ISQA 2MC2A 1UZZA 2CWMA 4EFPA 2P37A 1G9CA 1OQLB 1PZ9A 2OUJA 4Z8SB 2HZ9A 4P9WA 1QQKA 5GLVA 3GNEA 2VXRA 1UN1A 4AVVA 3MPPG 1KJLA 5JVVA 1JXNA 3WO3A 3RMYA 2ZHLA 2ZKNA 1I1EA 5JOYA 1V6KA 1WBCA 2YROA 1BLDA 5CNAA 7I1BA 4DS0A 2L5XA 2P39A 1W6NB 2XOAA 4I6IA 4FOVA 1RINA 2WQZC 4H9WA 4XBLA 1MS3A 3ZXKA 2NMNA 1QU0A 3WHTA 1AVXB 5EG6C 3EF2A 1AXZA 3LSEA 3UD8A 5H9PA 2ZGOA 5JLVA 3BAGA 5I1BA 4LBNA 3BADA 3IKWA 3ZSMA 5GZCA 1QKQA 3PMEA 2ZMNA 4Y1YA 1CVNA 1JY0A 4Q26A 3WINA 1LODA 4XJZA 2Y9XE 5F90A 1TOOA 5CB7A 4XFSA 1JW6A 5BXSA 3POKA 3O0WA 4P9YA 5F5QA 1TWMA 3WINC 4ZBVB 3VKNA 3ZC8A 3M3CA 1LENA 5CAZA 4AN6A 3LLPA 1MS0A 4Q91A 1C1FA 4USPA 1N1SA 4LO7C 1WLWA 3UJ0A 2CL2A 1CIWA 2AUYA 1BLAA 4IY9A 4R9BA 3B9CA 1S0GA 2D44A 4I4YA 2VU9A 2DUPA 1UZYA 2PHTA 8I1BA 3WV6A 1WW7A 2YMZA 5BP5C 1PC8B 2VSAA 4P0LA 2FFUA 4DQAA 4KC3A 1AX1A 4FQ4A 3ILFA 4BMBA 1SLAA 2W08A 2WLQA 3FJDA 4P0JA 3F1RA 4JPZA 4WVWA 4LO0A 3AH1A 4I4OA 1GICA 4Y22B 2ZHNA 3IIRA 1QNWA 3WMVA 2ZGLA 1AJKA 3APBA 5KXCA 4BLIA 1DZQA 3ZXLA 4JC1A 4OZXA 1IHKA 4LO0C 3M3EA 3N36A 1DQ1A 4OEGA 1XYFA 3WO2A 2GMPA 2LTNA 1IRPA 4F83A 4SLIA 4QKRA 3POWA 2A6YA 1J1TA 4ZOTA 4XTMA 4OW4A 3HN1A 4YW3A 4BLJA 5DUYA 4X39A 3OY8B 1TFMB 2BEBA 3SH4A 1WLCA 1ISYA 4K20A 4FOQA 3ASIA 41BIA 3U4XA 3MALA 3QLQA 2IHOA 5GZDA 1G7YA 4Y20B 2VXTI 4OWLA 4FGFA 1S0IA 1ILR1 3WO4A 4LBLA 2EXJA 1Z0HA 1LOFA 1YTOA 1LGCA 1VIWB 4YGDA 2AQZA 2IWTB 4XZPA 5BXRA 1V6LA 2D7IA 1LOFC 2PELA 1R8NA 3CRIA 4XFUA 1V6XA 4A7KA 3QR5A 1YI7A 4FVVA 4AGVA 1H9WA 2JE9A 1AXKA 4GAFA 1ISVA 4CTEA 4ATEA 3T1MA 1AXYA 3O44A 4KEJA 4G6JA 4NOTA 4I1BA 3TAYA 4Q1PA 4HJJA 3UJOA 4QBVA 1SLIA 3I29B 1II4A 4M3CF 1V6MA 1BFBA 5DG2A 2MIBA 1LULA 5KXDA 1W0PA 4XJWA 1JYCA 2R16A 2D6NA 4TZDA 1W6OB 2LALA 2D22A 1AVWB 4Y1XA 4QKSA 2ZAAA 1SLTA 2P23A 3I8TA 3FJIA 1SACA 4CJMA 4FPYA 1GKBA 2A70A 1VCLA 2ESUA 3FJ9A 3IPVB 5E88A 2UWAA 2VLCA 1IS5A 4IZXA 3POYA 3BA4A 2D7FA 3AK0A 1DQOA 2ZGRA 2ES3A 1GYKA 3O12A 1EVTA 4ZKTB 3OGGA 2BFHA 5IK4A 1H30A 4FQZA 5DXDA 4GKYA 3O49A 4GWNA 4QD2C 3RTJB 4M3CE 4ZXKA 3AH4A 2ZBJA 4UW4A 1SBFA 4D8HA 2DURA 1D0HA 1LOCA 2D6LX 1AXMA 2D3SA 3B9UA 1ULCA 2JJ6A 1S0DA 4OWJA 2GNTA 4LBQA 5H9QA 4U2AA 4X3AA 1YRZA 2D7RA 3E8LC 3NV1A 2KH2A 1JLYA 5T55A 3Q7YA 1PWAA 1S0FA 5DUWA 1N3OA 3SNVA 2I1BA 2KKIA 1LECA 1WLDA 2R9KB 4OUJA 1HKNA 3BX1C 1MVEA 2ZMLA 4I4PA 2ARBA 5BXTA 1W3GA 2NP0A 3VKFC 4FPHA 3A21A 4J23B 1DZDA 4YG6A 3SISA 3ZXFA 3I2AA 1IJTA 5E24E 4LBQD 3ZPYA 2DVBA 4XKIA 1LHWA 3CA6A 4C1XA 3WCRA 2ZA9A 1RZOB 2R0FA 4XE9A 1W6QB 4YG0A 2EXHA 1YXWA 4DEPA 1IS6A 4KBBA 2JD4A 1CVSA 2EALA 1Z4SA 5FNWA 3FJJA 4P9XA 2A3YA 4ATFA 4YGEA 4NO4A 2X2SA 1HWPB 1HKDA 1MZ6A 3SLIA 1V6JA 1CN1A 2CWSA 4FP3A 2E53A 3AJ6A 1JT5A 1S0BA 2ZABA 4UW5A 1OKQA 4YM2A 4RA0A 2Q5TA 3VWCA 3D4KA 2TEPA 2P3JA 4PQ9A 2W52A 3V0BA 3JUTA 2CYFA 2KI6B 2ARXA 1RG8A 4DENA 1ZM1A 2ZHMA 1ULDA 4LO3A 4D69A 3CA0A 1W6OA 3IM7A 2Y9GA 3AFKA 2I2SA 5E89A 3AKGA 2CNAA 1MS8A 4BMEA 5GLWA 2BEAA 1KITA 4LO3C 1LOEA 3T8SA 5BXPA 2EXKA 1BYHA 2P34A 1IT0A 5DZUA 2D6KA 3AZVA 2AREA 3CA1A 4J2YA 1YF8B 2ZQOA 2GMEA 4YW4A 4GXLA 1A3KA 1NUNA 4FPCA 3R4UA 1N1VA 3D6EA 3VV1A 4FPKA 4L4IA 3AZZA 1TP0A 4IYBA 3USUA 4MYEA 3P6JA 3O5SA 2D23A 4ASMB 4P0KA 1F9KA 1GV9A 2DUQA 1AFCA 1ULGA 1OQ1A 3O0VA 1QMJA 2AENA 3BAOA 1V6OA 1KNMA 1LHNA 3WLUA 1URXA 1DQ6A 5T5JA 1C4RA 1JTCA 1I3HA 1N4KA 2FDBM 4EFQA 3OGFA 5GLUA 1V6VA 3HSMA 5GZFA 2DTYA 3RSJA 3FJKA 5D63A 4DRRA 3WMUA 4Q2FA 2MLLB 3ZSKA 3AZXA 2UWCA 3FFZA 2NMOA 1LOBA 3H0OA 3WDYA 1GSLA 5GLZA 1ONKB 4I0YA 4WV8A 4OEEA 4YM3A 4G9MA 5HCAA 1PZ7A 4K21A 4GA9A 5GZGA 4I7IA 4Y24A 1G9DA 5BVPI 1FMMS 3V79C 1ONAA 2BQPA 2FGFA 2A6VA 5DG1A 1JT3A 3VT2A 3VT0A 3WZ1A 2OVUA 3NV2A 3ENRA 4TYSA 3IN9A 1LGNA 4AYUA 2Z49A 4YW1A 3ZSJA 3SH3A 1T9FA 2DVDA 4PC4A 2Q3NB 2JECA 1SCSA 3ATGA 3OJVA 4Q1RA 1BFGA 3UD9A 4XBQA 2OUHA 1U0AA 5GALA 1ENSA 3PUBA 1W6QA 3AYEA 1WBAA 2ZGSA 3OJBA 3FJFA 2A6WA 2Z42A 3A0NA 3N3HA 1VALA 3NWKA 4DCKC 2H0BA 2E4MA 1AX0A 5LK5A 5T5PA 4XJAA 3FLRA 4J2SA 5T5LA 4DFSA 4P14A 2CY6A 5HPZA 3FUOA 1JHNA 2E4MC 5FREA 5BP5A 2FMDA 2HYKA 5GM0A 5CBLA 3R4SA 4YW5A 2YXSA 3K1XA 3JRRA 5HCFA 1RY7A 3H6QA 4JKQA 5H9SA 1MACA 1UL9A 1LOGA 1HWOB 4GKXA 1LCLA 4G6MA 1WW4A 3CQAA 1W6MA 4LBQB 3ILNA 3CAHA 1SBDA 3ILRA 3LTQA 4ZFWB 4M00A 2DRYA 4DPNA 4AN7B 1FQ9A 4GOYA 1ULEA 4ZGRB 3UDAA 4XJ9A 4LBMA 1MR5A 4IHZA 3WCSA 3WUCA 1PZZA 1MZ5A 2WNEA 1HCDA 2D6OX 4QC4A 3O0XA 3RQ0A 2K8RA 4FPEA 1Q56A 4XHBA 1DYPA 4YOLA 2D6PA 3N35A 4GP0A 3WDVA 4JCKA 1FNZA 4TLPA 1HDKA 2E51A 3NV4A 1SBEA 2DVFA 2GDFA 2NYYA 4IQPA 3WOGA 1W0OA 3O4AA 3DGTA 1NXD1 2ET2A 2JDZA 2WBCA 1G82A 1S0EA 4Q9PA 3BAUA 4YFZA 4HL0A 2HWMA 1LGBA 1DQ4A 1RITA 1KJRA 5SV8A 3N7LA 2ERMA 3AP6A 3WG1A 2WT2A 4I8MA 1SR4C 4M3CA 1Q1UA 5EC5A 4XMIA 1MD6A 2UWBA 3CU1B 4PCRA 4FOYA 2NM1A 4Z8BA 2PHFA 1J0SA 1DHKB 4AVSA 2AGSA 3WA1A 1FMZA 1GANA 2ZGTA 2VUAA 5DZFA 2WT1A 1EYLA 2PHWA 3V0AB 3UK9A 3PVNA 4I37A 1MS4A 5F8SA 4LBOA 3O5WB 4D0ZA 2ZGPA 2D3RA 2V73A 1W6PA 1XHBA 2A71A 5FZUA 4FP2A 2D20A 3V0BB 5D62A 9ILBA 2GNDA 3AKHA 3B00A 2KLLA 2GN7A 5DUUA 3F62B 2XG3A 1NZKA 3NBCA 1AVBA 1CQ9A 1R1ZA 1WBLA 2UU8A 3A0KA 3BA5A 3BRGC 4YGCA 1ISWA 3VKOA 2WSVA 2ZGKA 2DU1A 4LBJA 1B09A 1V6UA 1DGLA 5BQUC 2P3KA 2DV9A 5G00A 2EAKA 2RSTA 3IM5A 2WT0A 3M2MA 3V64A 5IUQA 5FRAA 3USUB 1V6IA 1ABRB 1N47A 5EYXA 5DSSB 2NVHA 1IILA 3AZYA 3AJYA 1WD4A 5T54A 3C9ZA 2UUSA 1ENQA 1Z2VA 2D1ZA 2VW0A 2B7YA 4YZ2A 4XIOA 1IOAA 1HQWA 2R0HA 5IK5A 1PUMB 4Q9GA 2DS0A 3TC2A 1SFYA 5JOXA 1JT4A 4ZLBB 3RTIB 1H9PA 1TWEA 1FYUA 4YZ4A 1YYNA 3RMXA 2AH2A 2EF6A 3ZXDA 3KQRA 4LO2A 3AP5A 4XHXA 1TIEA 5T52A 3H6SE 1YIFA 3ZYPA 3ZXEA 1ZA4A 1IKQA 1JUIA 1LEDA 4LO2C 3N0KA 2K4AB 1S0CA 1LOAA 4FPFA 2GMMA 4I3NA 1GZWB 1M16A 4I1EA 1LU2A 2UURA 4D0TA 4F34A 5IT6A 3NBEA 3VKMA 2ZR1B 3M3OA 2ZGNA 1N1TA 1SZ6B 3BODA 3T2TA 3OYWA 3WDTA 4Y1UA 1D2SA 4I30A 1FWUA 3B01A 4YM0A 3W59A 4Q8KA 4AWDA 4XDQA 5GZEA 3WDWA 4A7YA 4K1ZA 1RMLA 4LO7B 1DJSB 1BASA 2WKKA 2VH9A 3SH5A 2YY1A 3V0AA 1ISXA 1DYKA 1FATA 2EXIA 3PHZA 4YLZA 4XTPA 4FPOB 1QOSA 1BARA 4J2XA 2DWRA 3CA5A 4LO8B 1BXHA 3AP4A 2W68A 1E0OA 4XJUA 3WVJA 1GNZA 1S1AA 3POSA 4EKXB 1DBNA 4YG3A 2ZZJA 1M2TB 1QDOA 3RRDA 1VAVA 1N1YA 1W6MB 4JAWA 2ZMKA 2HW9A 3TB0A 2A6XA 1IRAX 3ZSLA 1G8WA 1VAMA 3H6RB 4WBCA 4I2SA 1L2HA 3T1LA 2RHPA 3BIWE 2WSUA 2DTWA 31BIA 2GN3A 3DUIA 2KI4A 1G9FA 3GALA 5EWSA 4JP0A 4X38A 4LBKA 3WDUA 1UMZA 3PVEA 5IK8A 4GAIA 3INAA 4H55A 3RG0A 2Y9FA 4II0A 4XBNA 4JKXB 4QALA 5L73A 1F31A 1V6NA 3N7MA 4J2KA 4QBCA 1GZ9A 4CZSA 5F8YA 4IY8A 5FZYA 4I4QA 1SLLA 1MS5A 1G9BA 1QF3A 3C2UA 1C57A 3S8JA 2QYIB 4CRQA 5FZZA 2AXMA 1IS4A 1BQPA 3BTAA 2PHRA 3KMVA 5DZEA 1ITBA 2G4IA 3RS6A 2GALA 2VW1A 4I4RA 3AYAA 2AAIB 4YFWA 1W3FA 3MW3A 4M3CB 5DVHA 2ERFA 2QN4A 3AXEA 1DQ2A 3S8KA 1S0JA 2F8XC 3Q7WA 4XXAA 3P6IA 2P2KA 3PJQA 3BOPA 4YGBA 1BFFA 4RL7A 3AXDA 2E7QA 2AR6A 4QO3A 1GZWA 1W6PB 4AGRA 2NN8A 1LEMA 1AF9A 4AGGA 4GALA 5KXBA 3A23A 3O4OA 1Q8PA 3BAQA 2FFVA 2FHRA 4FPGA 5F9TA 1UKGA 2OW4A 3VSFA 1ULFA 1GZCA 2A6ZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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