4A7KA

Bifunctional aldos-2-ulose dehydratase
Total Genus 204
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
204
sequence length
885
structure length
879
Chain Sequence
QPAALPLFQPQLVQGGRPDGYWVEAFPFRSDSSKCPNIIGYGLGTYDMKSDIQMLVNPYATTNNQSSSWTPVPLAKLDFPVAMHYADITKNGFNDVIITDQYGSSMDDIWAYGGRVSWLENPGELRDNWTMRTIGHSPGMHRLKAGHFTRTDRVQVVAVPIVVASSDLTTPADVIIFTAPDDPRSEQLWQRDVVGTRHLVHEVAIVPAAETDGEMRFDQIILAGRDGVDCLWYDGARWQRHLVGTGLPEERGDPYWGAGSAAVGRVGDDYAGYICSAEAFHGNTVSVYTKPAGSPTGIVRAEWTRHVLDVFGPLNGKHTGSIHQVVCADIDGDGEDEFLVAMMGADPPDFQRTGVWCYKLVDRTNMKFSKTKVSSVSAGRIATANFHSQGSEVDIATISYSVPGYFESPNPSINVFLSTGILAERLDEEVMLRVVRAGSTRFKTEMEFLDVAGKKLTLVVLPPFARLDVERNVSGVKVMAGTVCWADENGKHERVPATRPFGCESMIVSADYLESGEEGAILVLYKPSSTSGRPPFRSMDELVAHNLFPAYVPDSVRAMKFPWVRCADRPWAHGRFKDLDFFNLIGFHVNFADDSAAVLAHVQLWTAGIGVSAGFHNHVEASFCEIHACIANGTGRGGMRWATVPDANFNPDSPNLEDTELIVVPDMHEHGPLWRTRPDGHPLLRMNDTIDYPWHAWLAGAGNPSPQAFDVWVAFEFPGFETFSTPPPPRVLEPGRYAIRFGDPHQTASLALQKNDATDGTPVLALLDLDGGPSPQAWNISHVPGTDMYEIAHAKTGSLVCARWPPVKNQRVAGTHSPAAMGLTSRWAVTKNTKGQITFRLPEAPDHGPLFLSVSAIDAIPVIVQGDSIELSAWSLVPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of Bifunctional Aldos-2-Ulose Dehydratase/Isomerase from Phanerochaete Chrysosporium with the Reaction Intermediate Ascopyrone M.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Phanerochaete chrysosporium
molecule keywords ALDOS-2-ULOSE DEHYDRATASE
total genus 204
structure length 879
sequence length 885
ec nomenclature ec 4.2.1.110: Aldos-2-ulose dehydratase.
pdb deposition date 2011-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18056 PBP3 Penicillin Binding Protein 3 Domain
A PF18637 AUDH_Cupin Aldos-2-ulose dehydratase/isomerase (AUDH) Cupin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.990 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4a7kA02
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4a7kA03
3C9ZA 1BFBA 4EB2B 1EVTA 1ISWA 2HZ9A 2D22A 3BTAA 1AVXB 1N4KA 4JRAA 3P6IA 4I2SA 3CA6A 1FV3A 4JPZA 4Q9GA 4I7IA 3P53A 1OQLB 5D63A 3EF2A 2ESUA 4QD2B 4IQPA 2NZ9A 3AH4A 2VXRA 2VLCA 1DZCA 1AVAC 1V6VA 5F90A 1HKNA 1Z4SA 4OWKA 2KI4A 1II4A 2KKIA 2VSAA 3WA1A 1FWUA 3V0BA 1BARA 1I1EA 3PG0A 4I96A 1Z0HA 3NBNA 3JRRA 1SR4A 3POKA 1HCEA 4Q91A 3O49A 1P63A 1YBIA 3UD8A 1XZZA 4IZEA 4KEJA 3FJCA 1BLAA 4A7YA 1V6WA 3SNVA 3OJ2A 2XOAA 1DJSB 4G1RA 2NTDA 6I1BA 4AN6A 5FNXA 1HIBA 1AVUA 4PC4A 4D0TA 1R8NA 1W3GA 3T8SA 2HW9A 3FFZA 4ZFUB 2L5XA 3AH2A 3I2AA 4I8MA 4P0JA 1BLDA 3CA5A 1WD3A 1T4QA 1JLYA 5F8YA 4I0YA 3LLPA 3BRGC 3VT2A 3WO4A 1AF9A 3NBDA 1EYLA 4OEGA 4A7KA 1HWPB 4J2XA 3IM7A 3ZC8A 3FUOA 3QR5A 4USOA 1ITBA 3WO3A 4LO0C 5DZUA 3OBTA 3WMUA 1TOOA 1JLXA 4P0KA 1AXMA 1CVSA 1JT7A 1ISYA 1PZZA 4H9WA 2Y9GA 1K5VA 3ILAA 2Q3NB 1SZ6B 1AVWB 3N7LA 2RQ9A 4ZOTA 3A21A 1SR4C 2D43A 3AKHA 3W9TA 4GOVA 2D7RA 5JLVA 2DRYA 4GP0A 4GP3A 2QYIB 3NBEA 4OWLA 4IY9A 5JMCA 3AJ6A 2MC2A 1FQ9A 1JTCA 1BA7A 4EFPA 1IOBA 1M2TB 2NYYA 3Q7WA 1YYNA 1JY0A 1Q04A 1S0EA 4DEPA 3A07A 5F8SA 4ENDA 4LO1C 1JT3A 3IM5A 4IZXA 4L4IA 2D23A 1V6XA 4I4SA 1MC9A 1AFCA 4KEKA 5D61A 3OGFA 1XG6A 1HCDA 4OEEA 5EG6C 4GOYA 4KBBA 2D24A 3H6SE 3UD7A 2FO1A 2D1ZA 2VU9A 8I1BA 3I2XA 3VSZA 3KMVA 3FJAA 31BIA 4I3NA 4OEFA 4LO3C 1PC8B 3N7JA 1W3FA 3MPPG 2ZR1B 4OUJA 3UJ4A 1TFMB 3VWCA 4I4RA 2IWTB 2DS0A 4I6IA 3N7MA 4KEIA 2F2FA 3CRGA 1DFCA 5HPZA 2GZBA 3AKFA 2P23A 3FJIA 5GAQA 4I4QA 3HN1A 4ZA3B 3A23A 5FZUA 3FGMA 2UUSA 2YUGA 3O4CA 4XFTA 2FGFA 1VCLA 1Z2VA 2ERMA 3O5WB 4F34A 1G9AA 4JQ0A 3FJJA 3RTJB 3OGGA 3PHZA 1IJTA 2D7IA 3CAHA 2E4MA 3HOMA 3FJHA 4X39A 3FJKA 3F62B 1TP0A 3Q7XA 3OBRA 2FFVA 4QBVA 3BAVA 1G82A 5BP5A 5BXRA 1XHBA 1DZDA 4WBCA 3BA4A 3CRIA 4JP0A 1RMLA 1DLLA 3VT1A 1QQLA 5BXPA 4G6MA 4ZFWB 2NM1A 1D0HA 3FJFA 3K1XA 4J2SA 3E8LC 3WMVA 3F1RA 1V6UA 3TC2A 1JQZA 41BIA 1A8DA 5I1BA 2WRYA 4G9MA 3FJDA 4X3AA 4I4UA 1TTUA 3RTIB 3HMYA 4D8HA 3AH1A 3JUTA 3O3QA 3O44A 1JT4A 2J3PA 3UJ0A 2HWAA 3D7WB 2VUAA 3BAQA 4Q9PA 3IAGC 3B9UA 2AAIB 3I29B 1FMZA 2QN4A 4IYBA 4FVVA 1RZOB 4TLPA 2E4MC 4F83A 4X38A 2FDBM 3NBCA 1FV2A 4QKSA 1IILA 3ZXGA 4QALA 3BRFA 3FJBA 2NP0A 4ISRA 1S0LA 1ISXA 4JKXB 3VEQA 5BQUA 4I4YA 3AZWA 2Y9WC 4D0ZA 2RG9B 3RMYA 3O4DA 3BA5A 4J23B 3WINA 4JAWA 3O4OA 3V0AB 1IRAX 3A22A 4EFQA 1BFGA 2K43A 5BXTA 2I1BA 1EPWA 4ZLBB 4Z9WB 1J0SA 1HWOB 1ISVA 3VT0A 3VUOA 5B2HA 1RG8A 3AJ5A 3AKIA 1R8OA 1JT5A 4QKRA 3ZX7A 1FN0A 4J2YA 1NZKA 4II0A 4G9NA 3HALA 3CQAA 1M16A 2DREA 3CA0A 3R4UA 2Q9XA 1YF8B 4XFUA 4LO7B 9ILBA 1EV2A 1BFFA 4HR6C 5BVPI 3V79C 2Y9FA 21BIA 2KI6B 3BAUA 1ILR1 1UPSA 2HWMA 2AFGA 1CE7B 2ZQOA 2IHOA 3H6RB 1YXWA 1G9DA 3S8KA 1DQGA 2BEAA 4A7ZA 4ZFYB 2D20A 3AZVA 2NVHA 1S0GA 4I4OA 3N0KA 5BQUC 4LO2A 2AXMA 4EEEB 1MD6A 1ONKB 4I37A 3MALA 1TWMA 4EFRA 2K8RA 3BAOA 3WINC 4QD2C 4QC4A 4CJMA 5EC5A 2X2TA 2M49A 2MLLB 2VSEA 2FFUA 4OWJA 3BA7A 4DCKC 1DFQA 4LO0A 3P6JA 1DQOA 1FWVA 5F8WA 1E0OA 4JKQA 2K4AB 3BADA 1HWMB 3FJ8A 1KNMA 2AQZA 4FGFA 5FZZA 3BAGA 3QYDA 4ZBVB 3N7KA 1S0CA 4P0LA 1TIEA 4AN7B 1WBCA 4DENA 1RY7A 3CU1B 3AKGA 3NJ5A 3ZC9A 3HSMA 3OJVA 3R4SA 1HWNB 1QXMA 4I4VA 3LTQA 2F2FC 2BFHA 4XFSA 1YTOA 2P39A 3H6QA 3V0AA 1L2HA 2DRZA 4P6AA 3HBWA 2RSTA 4I4XA 2ET2A 4X37A 4Z8SB 3UD9A 4LO2C 3FUQA 1S0FA 2R9KB 2LIQA 3CRHA 4HA2A 3PMEA 2D44A 4LO1A 1PWAA 1I1BA 4I1BA 5E24E 2Y9XE 2KH2A 2Z48A 1WD4A 3CA4A 2X2SA 5EHAA 2LIEA 4G6JA 4ISQA 2GO2A 1G9BA 3V0BB 1GGPB 5BP5C 1T9FA 1PUUB 3BRDA 3BAHA 1BFCA 1QQKA 4LO3A 3H6RA 5DSSB 5G00A 4QBCA 3UDAA 4R6UB 5FZYA 1ISZA 3IM6A 1F31A 1DIWA 4IONA 4YOLA 1FMMS 1IHKA 4KC3A 2ZQNA 4GAIA 3OJMA 3FJ9A 1FGAA 4ZKTB 1K5UA 3VSFA 1PUMB 3O4BA 4OW4A 1Q03A 5DUYA 1W3AA 4L4HA 1G9CA 4IHZA 5BXSA 4LO8B 2KLLA 4H04A 1XYFA 5DVHA 5D62A 3IIRA 3BB2A 2F8XC 3BX1C 1WBAA 5FNWA 3PUBA 4QO3A 4ZGRB 1NUNA 2MIBA 4XKIA 1IRPA 4I4PA 3CA3A 3O4AA 2BEBA 3CA1A 3FJEA 3WO2A 2Z49A 3RMXA 4GAFA 4J2KA 1S0BA 4IY8A 1IT0A 1ABRB 4LO7C 3S8JA 2WBCA 2VXTI 3Q7YA 3ZXDA 5BOWA 4I1EA 3RSJA 4EKXB 4USPA 4HJJA 7I1BA 1BASA 1TWEA 1S0DA 1Q1UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QHZA 1W8UA 2WZR2 5LBFA 3O1OA 3C9ZA 2Q30A 1JOJA 3F2ZA 1EVTA 4EB2B 4RS5C 3ZSLA 1RMU2 4Q0PA 1GYKA 1HB4A 1RUE1 3BIWE 1RUI1 5HV0A 2BV4A 2WWUA 2WYSA 3FBMA 3WD5A 1TNFA 2PXJA 3EB7A 2PAEA 3HOBA 3OGSA 4FT8A 4XBNA 1AVXB 3VDCA 5G04L 3GDBA 3I2IA 1FV3A 3VD4A 4JPZA 4LKFA 4NHMA 3P53A 2WZ8A 1AL23 1ENXA 3EBRA 3P3PA 1OF3A 3EO6A 3NQHA 4I02A 3M3IA 4NPRA 3KCXA 3I2FA 2P4EA 5FZ3A 3OSDA 4LO4B 1ZZ6A 3R05A 2P1BA 1OLMA 3MBWA 4DRVA 1OKOA 3PHMA 4DUWA 3THCA 4HKLA 2BFUL 2BWCA 1K5JA 2QE3A 1PNGA 3I2DA 2KKIA 1QQP3 2ZX3A 3WA1A 2Q1MA 4GWMA 4DOUA 5FCCA 3PG0A 3T0BA 4I96A 1Z0HA 2VNGA 4COUA 4ZU5A 5BNOB 4ZPIA 1C3HA 2Y38A 4QQHA 3QOPA 3K4ZA 3S6PA 4IEXA 3I97A 3E6BA 4ATFA 2YXSA 2DBNA 2ZEXA 2ZKLA 5LEKA 4YM1A 1VPHA 1Q8QA 3LKJA 1ZZCA 1XZZA 4IZEA 4AEDC 4A7YA 4KEJA 3TEWA 2J1TA 4QXBA 3ZPOA 4S2FA 5GLVA 5K4LA 5IVVA 2HEVF 1JZ3A 4A4AA 3AMMA 4YGDA 3VBFA 4GALA 4AHZA 5FUIA 4QGMA 3QBQA 1FX5A 1H2NA 6I1BA 2R0FA 4NOTA 5KXCA 2DVFA 4AHYA 3ES1A 3L2HA 3UJ4A 4AN6A 3JD73 2R32A 3I3BA 4HETA 3ZDVA 1CZVA 2VBDA 3VGIA 3T8SA 4BQXA 4D0TA 1AXZA 2B9UA 4HG6B 1W6OA 1EAH1 3WG3A 3WCRA 1BLDA 5B4NA 3UGGA 4UF0A 1JYTA 2B5HA 1VBA1 3UGFA 5FR3A 5DAQA 1W06A 1JLYA 3CA5A 3LLPA 5EPAA 3BRGC 4XJZA 4HKWA 1XC6A 3RRDA 2PQSA 3E5QA 4JCKA 4R52A 5F5AA 2R043 4J2XA 3IM7A 1QJX2 1XYPA 4OULA 3FUOA 5J37A 3WO3A 1JZ4A 3WF2A 2IVIB 5DZUA 2P3YA 2VZ1A 4FFFA 3VBHB 4QPIB 3CMGA 4CDQC 1Q8VA 2RM23 1J59A 1X8EA 1AXMA 1FMD2 1ISYA 1DQ4A 3DL3A 5LY2A 3IBMA 4H9WA 5H9RA 1RUI2 3K4AA 2ZS6B 3LWCA 3ILAA 2GZWA 4J1XA 1AUYA 4LLOA 1WBFA 2BGOA 4Q4W3 4GH4B 4CP2A 2XJRA 5C4WB 1MZ6A 4N9HA 4AFCA 3LDBA 4ORFA 3QLQA 4XQWA 1MQTC 1G6NA 1UW8A 1TMF1 1POV3 2RV9A 1SR4C 4CTEA 1UYZA 4HOOA 1RVF3 3C2UA 4CUBA 4B7KA 4BQ1A 2JB8A 1LOBA 2C4XA 4X8NA 3RWKX 3BU0A 3PUAA 3LPGA 1XU1A 3MFCA 1YFXA 3KWVA 4QKBA 4LT5A 4MVTA 1AR92 4GP0A 3UT0A 5FYHA 1UL9A 1LKNA 3BOPA 1PZ9A 3AVRA 4RA0A 2JDHA 3TNQA 1G8WA 1GR3A 2VVDA 2WQ4A 4OI1A 5JMCA 4IY9A 5L9BA 3B94A 4JGZA 1AR71 4MG2A 1ZA7A 1BA7A 1IOBA 1VBC1 2JD9A 4LOSA 2NYYA 4HVRA 4MGIE 1A34A 1NLQA 1ZBE2 2Q8CA 3TN93 3Q7WA 5CVRA 1JYIA 3ZXAC 4QM8A 4MZGB 1S0EA 4DEPA 3W5NA 1RUOA 1KS5A 2W9XA 4QGLA 1RITA 4BA6A 1O8SA 3LGRA 1DF0A 3NW4A 4N9IA 3ZFGC 4LO1C 4Q29A 5A7QA 2ZAHA 1MC9A 3HNMA 3KCYA 1V0AA 2DV9A 4K1YA 3BTXA 4D69A 1UU5A 1DYOA 3VBRB 1XG6A 2LS6A 5KHKA 5FO7B 4GOYA 1AR62 4KBBA 4N53A 4BMBA 2D24A 3H6SE 1NYWA 3WQBA 3UD7A 2L9LA 2WNOA 3DYMA 4Y1XA 5H9QA 4DUXA 3I2XA 3RQ0A 4WVZA 1ND2B 1YLLA 2DVGA 1J83A 1W04A 1YEWA 4CU9A 4COWA 2CL2A 1QJY1 5LK7B 4LBQD 3N7JA 3OBZA 1RUD3 4J6GA 4KI5M 3N4MA 3AKPA 4RR3C 2UYAA 3JUUA 4LXLA 5FZEA 4QX0A 1Q3EA 3J7MA 3X29B 2KR2A 3ZO0B 1RUG3 2A71A 4I4RA 4W65A 3DPRC 2IWTB 2DS0A 1OFNA 3SH4A 1GNYA 3BALA 4QMAA 2V72A 3TNPB 3AM2A 2XB6C 1OXCA 2QQMA 2I74A 4GKYA 4K3UA 2DWRA 3J7LA 4Y4YA 1DFCA 2YC2A 4CDUC 3AKFA 4U36A 4NN0A 4CZSA 4KEIA 4Q4X2 4V1PA 2IXIA 3FJIA 1OLRA 2GC2A 5GAQA 1FPN3 5D8AA 3FGMA 1YIFA 4JRLA 3ZR6A 2UUSA 2YUGA 1I5ZA 2G19A 2JDAA 4RN5A 2RMU1 1Q8SA 4YG6A 1G9AA 2XVLA 1Z2VA 1V6IA 5G05L 3BTZA 3FJJA 5C9AC 5JSOA 3ZYJB 3RTJB 4EJRA 1D4M1 4FPCA 5FZCA 2D7IA 2RVAA 5HCAA 3O1SA 3PVOA 1W28A 3BTYA 2A7AA 2X53S 1NCRA 1W3XA 1HX6A 3ES4A 5LA9A 2ERFA 4AVVA 3OBRA 4C8DA 1NE4A 3OUJA 4UFMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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