4A7KA

Bifunctional aldos-2-ulose dehydratase
Total Genus 204
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
204
sequence length
885
structure length
879
Chain Sequence
QPAALPLFQPQLVQGGRPDGYWVEAFPFRSDSSKCPNIIGYGLGTYDMKSDIQMLVNPYATTNNQSSSWTPVPLAKLDFPVAMHYADITKNGFNDVIITDQYGSSMDDIWAYGGRVSWLENPGELRDNWTMRTIGHSPGMHRLKAGHFTRTDRVQVVAVPIVVASSDLTTPADVIIFTAPDDPRSEQLWQRDVVGTRHLVHEVAIVPAAETDGEMRFDQIILAGRDGVDCLWYDGARWQRHLVGTGLPEERGDPYWGAGSAAVGRVGDDYAGYICSAEAFHGNTVSVYTKPAGSPTGIVRAEWTRHVLDVFGPLNGKHTGSIHQVVCADIDGDGEDEFLVAMMGADPPDFQRTGVWCYKLVDRTNMKFSKTKVSSVSAGRIATANFHSQGSEVDIATISYSVPGYFESPNPSINVFLSTGILAERLDEEVMLRVVRAGSTRFKTEMEFLDVAGKKLTLVVLPPFARLDVERNVSGVKVMAGTVCWADENGKHERVPATRPFGCESMIVSADYLESGEEGAILVLYKPSSTSGRPPFRSMDELVAHNLFPAYVPDSVRAMKFPWVRCADRPWAHGRFKDLDFFNLIGFHVNFADDSAAVLAHVQLWTAGIGVSAGFHNHVEASFCEIHACIANGTGRGGMRWATVPDANFNPDSPNLEDTELIVVPDMHEHGPLWRTRPDGHPLLRMNDTIDYPWHAWLAGAGNPSPQAFDVWVAFEFPGFETFSTPPPPRVLEPGRYAIRFGDPHQTASLALQKNDATDGTPVLALLDLDGGPSPQAWNISHVPGTDMYEIAHAKTGSLVCARWPPVKNQRVAGTHSPAAMGLTSRWAVTKNTKGQITFRLPEAPDHGPLFLSVSAIDAIPVIVQGDSIELSAWSLVPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structure of Bifunctional Aldos-2-Ulose Dehydratase/Isomerase from Phanerochaete Chrysosporium with the Reaction Intermediate Ascopyrone M.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALDOS-2-ULOSE DEHYDRATASE
molecule tags Lyase
source organism Phanerochaete chrysosporium
total genus 204
structure length 879
sequence length 885
ec nomenclature ec 4.2.1.110: Aldos-2-ulose dehydratase.
pdb deposition date 2011-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18056 PBP3 Penicillin Binding Protein 3 Domain
A PF18637 AUDH_Cupin Aldos-2-ulose dehydratase/isomerase (AUDH) Cupin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.990 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4a7kA02
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4a7kA03
3WA1A 4LO8B 4HA2A 3CA1A 2HZ9A 3O5WB 1DJSB 4GAIA 1S0EA 4QO3A 4D8HA 1WD3A 3OJMA 2LIQA 1S0CA 3I29B 1BASA 4I4PA 3S8KA 4LO3C 1BFGA 1EV2A 1M16A 2FDBM 1KNMA 3CA0A 1E0OA 1HCEA 1W3AA 1J0SA 4IY8A 2KH2A 3O4DA 2WRYA 3OJ2A 2DRZA 2HWMA 4F83A 4X3AA 4EFRA 1RY7A 4DEPA 1DQOA 1UPSA 1G82A 2RSTA 2NZ9A 5DVHA 3FJHA 4Z9WB 5GAQA 3BA7A 3P53A 5FZZA 4ZFYB 4I4SA 3W9TA 3VT0A 3BA4A 3F62B 3BRDA 4P0KA 4ENDA 4FVVA 4I37A 1FQ9A 2F2FA 4ZOTA 1IHKA 3CRGA 3NJ5A 3POKA 1QXMA 1PC8B 3BX1C 3FGMA 1OQLB 3OGGA 4EB2B 4ZBVB 4ZGRB 2M49A 5BXPA 3AH4A 4I4RA 4ZKTB 1BLDA 1K5VA 1IRAX 1I1BA 3O49A 3B9UA 5JMCA 3VSFA 4I96A 3WMUA 4I4XA 3BAHA 1S0FA 3K1XA 4D0ZA 3FUOA 4G6JA 2KLLA 1PUMB 2Y9WC 2ESUA 4KC3A 4LO0C 2MIBA 1JLYA 1VCLA 4IHZA 2F8XC 4A7ZA 4OEEA 2Z49A 2HWAA 3O4BA 3MPPG 2D1ZA 3OJVA 4IY9A 3CRIA 3PMEA 2ZQOA 3VT1A 1T4QA 3OGFA 3RSJA 1ABRB 1D0HA 2ZQNA 1AVAC 4X37A 3BAOA 5F8YA 1GGPB 1BFFA 2NP0A 2QYIB 1Q03A 2BEBA 2ERMA 5EG6C 2K4AB 5D62A 5F8SA 3V79C 3LTQA 1L2HA 4QC4A 2KKIA 1MD6A 3Q7WA 4I7IA 4J23B 2WBCA 1FWUA 4P0LA 3KMVA 4OWJA 4AN7B 4JRAA 3UJ4A 1S0GA 3BAGA 3FJKA 3HN1A 2P23A 3FJAA 4HR6C 4Z8SB 2D43A 2J3PA 2X2SA 21BIA 3CU1B 1ISYA 3FJ8A 3R4SA 3FJCA 4OWKA 3BAUA 4I4QA 2VSEA 4I0YA 3ZX7A 3WO4A 1S0BA 1DZDA 1FV3A 3I2XA 3CA5A 4JPZA 3FJEA 4EEEB 1S0LA 3IM5A 2IHOA 3V0AA 1CE7B 3TC2A 3S8JA 4I8MA 1FWVA 3NBDA 3H6SE 1HCDA 2LIEA 4I3NA 1ISXA 1DLLA 4J2XA 3CAHA 2FO1A 5D61A 1AF9A 2D44A 3Q7XA 4QALA 3FUQA 1DQGA 4DENA 7I1BA 2D7RA 4JP0A 3ZXGA 3AJ6A 3FJBA 2E4MC 3AKFA 3AKHA 3SNVA 2DRYA 4ISRA 3BTAA 3HBWA 4LO1C 4GOYA 3UJ0A 3WMVA 2FGFA 2L5XA 4OEFA 4ZFUB 1WBAA 1TFMB 4IONA 1ILR1 3CQAA 4USOA 2MC2A 1ITBA 2D7IA 1AXMA 8I1BA 4FGFA 3VSZA 3RMYA 4G6MA 3BADA 3V0AB 2X2TA 3H6RA 5FNXA 2D20A 3BB2A 1Z4SA 3N7JA 3WO2A 1FMZA 1HKNA 1HWPB 1AFCA 2ET2A 1S0DA 4PC4A 1XHBA 5I1BA 1WD4A 1NZKA 1FN0A 3NBNA 3BRGC 3HOMA 5FNWA 5E24E 3CA4A 4I1EA 1N4KA 4YOLA 1DIWA 2AAIB 2AFGA 4QKRA 1DZCA 5B2HA 4HJJA 9ILBA 5EC5A 4WBCA 2E4MA 1HWOB 4QD2C 1DFCA 4GOVA 1YXWA 1G9BA 2FFVA 4LO1A 2Y9GA 3UD7A 2KI6B 3N7KA 5G00A 1JQZA 3H6RB 1II4A 1YTOA 1AVXB 3FJFA 2XOAA 3N7LA 4IQPA 1Z2VA 3H6QA 4KEJA 3WINA 1Q04A 4LO7C 4OWLA 1EVTA 1W3GA 4LO2C 3I2AA 4KBBA 3BA5A 1WBCA 2VXTI 1Z0HA 3AJ5A 3O44A 5FZUA 5BXSA 3VUOA 1P63A 4F34A 4JQ0A 4ZFWB 3LLPA 1SR4A 2FFUA 1TWEA 1Q1UA 3QR5A 3AH1A 4I6IA 4XFUA 4X38A 1IT0A 3A07A 1PWAA 31BIA 2BFHA 4XFSA 4R6UB 1R8NA 4G9NA 1YYNA 3D7WB 1TIEA 2NM1A 3AKGA 4J2YA 2IWTB 4P6AA 6I1BA 3HMYA 3Q7YA 2Z48A 4L4IA 1PZZA 4GP0A 4XKIA 2NVHA 3A21A 3NBCA 4G9MA 5D63A 1DFQA 5F90A 2R9KB 3FJIA 1TP0A 3O4CA 3RTJB 2VLCA 1SZ6B 3JUTA 1NUNA 1JT7A 3WO3A 3BAQA 3FJDA 4LO2A 2QN4A 5DSSB 2HW9A 3RTIB 4J2SA 3ZC9A 1BFBA 3C9ZA 4Q9GA 4JKXB 1FV2A 1V6XA 2DS0A 1V6WA 3JRRA 1PUUB 4KEKA 4QBVA 4QD2B 1IILA 3E8LC 2VU9A 5F8WA 4ZLBB 4IYBA 4XFTA 41BIA 1BA7A 3T8SA 1JY0A 4A7YA 1XZZA 3PHZA 3HALA 3VWCA 3PG0A 2Q9XA 3ILAA 5DZUA 3VT2A 1G9AA 3FJJA 1ISWA 1TWMA 4LO7B 2BEAA 3WINC 1XYFA 3CRHA 4EFPA 4OEGA 2ZR1B 1T9FA 3AZWA 1FMMS 2AXMA 2VSAA 5DUYA 1G9CA 3AH2A 1BARA 3RMXA 2KI4A 4KEIA 3BAVA 2DREA 3ZC8A 1BLAA 1AVWB 1SR4C 2NTDA 3HSMA 3VEQA 4EFQA 5JLVA 1JT3A 1M2TB 1IJTA 3OBRA 1JTCA 5BP5A 1HIBA 3UD9A 5BQUA 5EHAA 4I4UA 4CJMA 1RG8A 3N0KA 1TTUA 1HWNB 2Q3NB 4I4VA 4ZA3B 1EYLA 2YUGA 2MLLB 2GZBA 3CA6A 3P6JA 4GP3A 1JT4A 2D22A 1JLXA 1CVSA 2I1BA 4I4OA 1IRPA 4LO3A 4QKSA 1AVUA 2UUSA 3ZXDA 1EPWA 1YF8B 5BOWA 2RG9B 1TOOA 4ISQA 4P0JA 3PUBA 3FJ9A 3O4OA 3QYDA 3V0BA 2AQZA 1I1EA 3NBEA 3IAGC 2GO2A 1RZOB 2K43A 1RMLA 1XG6A 4L4HA 3P6IA 1JT5A 3R4UA 3IM7A 2D23A 3IIRA 4TLPA 1ISVA 1W3FA 1YBIA 4JKQA 1R8OA 3UDAA 2Y9XE 4G1RA 3A22A 4DCKC 4D0TA 2Y9FA 1K5UA 4IZEA 3BRFA 4GAFA 2K8RA 2VUAA 4J2KA 3AKIA 3AZVA 3OBTA 4OUJA 1MC9A 4II0A 3O3QA 5HPZA 2P39A 4EKXB 2VXRA 1IOBA 3N7MA 4I1BA 4QBCA 4Q91A 5FZYA 4H04A 3EF2A 3V0BB 5BXRA 1QQLA 1BFCA 3CA3A 4H9WA 4Q9PA 4I2SA 4IZXA 4JAWA 4LO0A 1V6VA 2RQ9A 1A8DA 2D24A 3F1RA 1FGAA 2NYYA 3FFZA 4A7KA 1F31A 5BXTA 1ISZA 5BVPI 1G9DA 5BP5C 4I4YA 3A23A 4USPA 1V6UA 3MALA 1ONKB 5BQUC 3O4AA 2F2FC 4OW4A 3IM6A 4AN6A 4X39A 1HWMB 1QQKA 3UD8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2WO1A 3IB3A 5JWPA 3WA1A 1HJFA 1T6BX 2IXKA 5F39A 2Q8EA 2VMGA 2CYFA 4Z8BA 4FFIA 3PVNA 4XFHA 4XFAA 4QQPA 5JR2A 1REFA 4LO8B 3O5WB 3PIGA 2QQKA 5I0TA 4BQ5A 3VZMA 4BQWA 1WD3A 4QX8A 2O8OA 2V73A 4K20A 1AYN2 4I4PA 1QQP2 1SCRA 3ZFFA 5HI0A 1TG7A 2CGNA 2XWJB 1WA6X 3DEMA 3IWZA 4LJHA 4E9KA 5A1FA 3O1SA 1RUE1 1E0OA 3UYJA 3POFA 1H4GA 4UOJA 1OOPB 3AJYA 4HVOA 2K0GA 3A4UA 4XQWA 3T1MA 1PO13 3EJKA 4P00B 5C3RA 1PVC2 5FPLA 2HWMA 4KMQA 4A44A 4GZ9A 4X3AA 2JDYA 4IDZA 1XBFA 1XE8A 1QJY2 1QOTA 2AUYA 3OUJA 1UPSA 2IVJA 5DDJ2 3TOJA 2GN7A 3FJHA 4Z9WB 1ND2C 3D0JA 3BA7A 2PYTA 3OG2A 5LA2A 2CU5A 3E97A 4ZFYB 3D6EA 5FK8A 4B7KA 5JVVA 4EN8B 3RZJA 4AEDC 3BOWA 4ZZ5A 1HIXA 2BNOA 4CZSA 3W9TA 5SV8A 2ZKLA 1DZRA 3U0ZA 2JIGA 2R30A 1WMXA 2VQTA 1W9TA 4QU2A 1PGW1 3VDCA 3O0WA 1V6MA 2ZMKA 4N90A 4RD7A 4XEZA 4Q4V3 1FPN2 4LE4A 3LIGA 3POKA 1KGYA 3I4IA 4KG0A 2VMCA 1PC8B 3BX1C 1GZTA 1CAWB 1R093 3FGMA 3IDAA 3N35A 3VB9A 4JC1A 1YJKA 2VAUA 3LA7A 5FZBA 3KCCA 4AQ2A 1VALA 4ZGRB 4E2QA 1KFXL 2FQPA 4Y33A 4U2AA 5LBCA 5FYSA 2WNVA 3AH4A 1OA3A 1VE0A 1BLDA 1NE4A 1K5VA 3MIBA 2ERFA 2WZPP 3O49A 5FPXA 5L9VA 1ZVFA 2J42A 2PLV2 4IE5A 1SQ4A 1HKDA 4I4XA 2OT7A 1C8M1 4QT6A 2YC0A 1GP5A 1OOPC 1KITA 1QKQA 4HKLA 4NIIA 5CADA 4D0ZA 4D7TA 4GB32 2ZGQA 1LOFA 2PELA 4FQZA 1O8SA 2XLAA 3UT0A 4LA3A 4BHPA 1JYNA 2F4LA 4A6SA 5JZGB 1VCLA 3KB5A 3SMHA 3ELNA 4KH9A 4M01A 1J1LA 5J48A 1ND2A 4LORA 1WKYA 4DXZA 1FXZA 4Q4Y3 4UW4A 2VZTA 3OJVA 1SEFA 1LHNA 1DF0A 4EN9B 2OZ6A 2WRAA 3LZZA 3S6PA 3DKWA 2XVGA 1U5XA 3S5QA 2P37A 4S2HA 1D0HA 1SHWB 3ZDSA 2ZQNA 5H9QA 4X37A 3BAOA 3F95A 2WT2A 4LNVA 2MHFA 1W6QB 4XZUG 1BYHA 2J1TA 2XVLA 4Q4W1 4QX7A 3JBG1 4IEVA 1Q03A 4EROA 2A6VA 2VCAA 2WSUA 3MLKA 4WM7B 1X9TA 4Z2WA 5D62A 2A1XA 3BODA 4YM2A 3RZZA 4A41A 4SLIA 3ZXFA 3O1PA 2VQAA 3K3OA 5T50A 2JE8A 1FOD3 3MF9A 3E1F1 1SLCA 5ACA3 1CGPA 3W59A 3UJ4A 3GGLA 4UFMA 1OOPA 5FP7A 3AMMA 3LSEA 3W9AA 4BQ2A 4G3YC 3PL0A 3BAGA 2XJUA 3IN9A 1YEWA 2Y60A 1UY4A 2HEVF 2DVFA 2B39A 1Z7S1 2V72A 3LGRA 1UCXA 4OZOA 4QM9A 5FZIA 2G9GA 4NIDA 2J3PA 4Z8SB 3SXWA 3VBRB 1CN1A 1JOJA 5JZGC 1RUJ1 1GV9A 21BIA 1C28A 5FZEA 1JOPA 1J1TA 1PX4A 1U12A 4WM8B 3WQ1A 5FZOA 1MS3A 2DF7A 5JOYA 1S0BA 4R52A 1N1TA 2MEV3 2PHTA 3PURA 4IEYA 4YSFA 3I2XA 3CQOA 3KVBA 1DZDA 4BXFA 5FPAA 3U4XA 4XQ4A 3AFGA 1ZZBA 1C5HA 5A6YA 4AVBA 1VBA3 2FCTA 5J7MA 4O61A 4I0AA 4YWAA 3JU9A 2GNBA 3AP4A 3J8F1 3IDEA 3TC2A 3IIIA 3WCSA 1UNBA 4AEJA 3BTXA 1FWVA 3T0AA 4WM7C 4I3NA 1CAWA 3KLSA 5FK7A 1UWWA 2YBKA 3LOBA 4OUEA 5CEHA 2Z2SB 2CAUA 4J2XA 1JMUB 1FNZA 1GR3A 5H9SA 1A78A 5D61A 2D44A 5DAVA 3WUDA 4QALA 1GFF2 3FUQA 3I3DA 4XZPA 4ZY9A 5IVFA 3LEGA 4AVTA 2VZ3A 3BTZA 3RYPA 3AJ6A 1KXGA 3KHCA 1J3PA 3AKFA 4FSJA 2JDNA 1OF4A 1XSRA 2C0ZA 4ISRA 3WNPA 1C57A 3MW2A 1BMV2 2ZCWA 4LBNA 5A7NA 4R9DA 4CCLA 5A7WA 1WBAA 4ZFUB 2G9ZA 1GU3A 1K45A 1VBB1 1ENSA 4OVEA 1QMJA 3CDZB 5LCWL 3R6SA 2UYAA 4N7IA 3VBRC 2MC2A 1W28A 1AXMA 1GKBA 3WV6A 2YPJA 5F3EA 3RMYA 5C8CB 2TNFA 2VPVA 4CSWA 1XU1A 1ZREA 2WN2A 4OQ9A 4WM8C 1RTVA 1VR3A 1VP6A 5FNXA 2YPDA 4LO5B 2D20A 4IUGA 2I07B 3N7JA 3QH6A 3UKVA 1TMF3 1FMZA 3CZUA 4I0BA 4W6WA 5SV5A 4CDWB 5DUWA 3USSA 3I3QA 4ORFA 4PC4A 5IFPA 2VTFA 4P9WA 1WD4A 1XNDA 5DAQA 3OOXA 4I09A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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