4A7KA

Bifunctional aldos-2-ulose dehydratase
Total Genus 204
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
204
sequence length
885
structure length
879
Chain Sequence
QPAALPLFQPQLVQGGRPDGYWVEAFPFRSDSSKCPNIIGYGLGTYDMKSDIQMLVNPYATTNNQSSSWTPVPLAKLDFPVAMHYADITKNGFNDVIITDQYGSSMDDIWAYGGRVSWLENPGELRDNWTMRTIGHSPGMHRLKAGHFTRTDRVQVVAVPIVVASSDLTTPADVIIFTAPDDPRSEQLWQRDVVGTRHLVHEVAIVPAAETDGEMRFDQIILAGRDGVDCLWYDGARWQRHLVGTGLPEERGDPYWGAGSAAVGRVGDDYAGYICSAEAFHGNTVSVYTKPAGSPTGIVRAEWTRHVLDVFGPLNGKHTGSIHQVVCADIDGDGEDEFLVAMMGADPPDFQRTGVWCYKLVDRTNMKFSKTKVSSVSAGRIATANFHSQGSEVDIATISYSVPGYFESPNPSINVFLSTGILAERLDEEVMLRVVRAGSTRFKTEMEFLDVAGKKLTLVVLPPFARLDVERNVSGVKVMAGTVCWADENGKHERVPATRPFGCESMIVSADYLESGEEGAILVLYKPSSTSGRPPFRSMDELVAHNLFPAYVPDSVRAMKFPWVRCADRPWAHGRFKDLDFFNLIGFHVNFADDSAAVLAHVQLWTAGIGVSAGFHNHVEASFCEIHACIANGTGRGGMRWATVPDANFNPDSPNLEDTELIVVPDMHEHGPLWRTRPDGHPLLRMNDTIDYPWHAWLAGAGNPSPQAFDVWVAFEFPGFETFSTPPPPRVLEPGRYAIRFGDPHQTASLALQKNDATDGTPVLALLDLDGGPSPQAWNISHVPGTDMYEIAHAKTGSLVCARWPPVKNQRVAGTHSPAAMGLTSRWAVTKNTKGQITFRLPEAPDHGPLFLSVSAIDAIPVIVQGDSIELSAWSLVPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Lyase
molecule keywords ALDOS-2-ULOSE DEHYDRATASE
publication title Crystal Structure of Bifunctional Aldos-2-Ulose Dehydratase/Isomerase from Phanerochaete Chrysosporium with the Reaction Intermediate Ascopyrone M.
pubmed doi rcsb
source organism Phanerochaete chrysosporium
total genus 204
structure length 879
sequence length 885
ec nomenclature ec 4.2.1.110: Aldos-2-ulose dehydratase.
pdb deposition date 2011-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18056 PBP3 Penicillin Binding Protein 3 Domain
A PF18637 AUDH_Cupin Aldos-2-ulose dehydratase/isomerase (AUDH) Cupin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.990 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4a7kA02
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4a7kA03
3BAGA 3V0BA 2K43A 2Z48A 3I2XA 2E4MC 4EFQA 1FV3A 2XOAA 3FJEA 1BA7A 3CRIA 3VT1A 3ZC9A 4GP3A 3FJDA 1JT4A 2J3PA 1P63A 2M49A 2VLCA 3CRGA 4J2XA 1SR4A 1S0CA 1DQOA 3CA3A 4L4HA 1NUNA 3PG0A 3AH2A 3IM5A 3UJ0A 3ZX7A 4A7YA 1BLDA 1ISYA 3FGMA 1HWOB 3AH4A 1BFFA 5BQUA 3OGGA 3BRGC 2Y9GA 3O4CA 3CA6A 2AFGA 3FJFA 3CA0A 2Z49A 4I2SA 3IIRA 2KKIA 2FGFA 4G6MA 3V0BB 5BXPA 3EF2A 1R8OA 2ET2A 3BA7A 3OJ2A 4F83A 3E8LC 3FFZA 4LO0C 1V6XA 4OEGA 3RTJB 3BADA 2K8RA 3VT0A 1WBCA 4EFPA 4I37A 4OUJA 3N7KA 1SR4C 5I1BA 1G9DA 5BVPI 4I4PA 4I3NA 3HMYA 3H6RA 3OBTA 1K5UA 4IHZA 4G9MA 5BP5A 3AH1A 3RTIB 3CA5A 4USOA 2D24A 5BQUC 3UD9A 3LTQA 5GAQA 4D0TA 2DRZA 2HW9A 2AXMA 2Y9WC 2D7RA 5EC5A 4AN6A 2Y9XE 4X39A 1J0SA 3NBDA 21BIA 2UUSA 2FFUA 1HCDA 2RSTA 2WRYA 1HWPB 31BIA 3FJ9A 4ZFWB 4D0ZA 5DUYA 5EHAA 3FJAA 4I4XA 4GAIA 1I1EA 2D22A 1JY0A 3SNVA 4QD2B 1IJTA 1TOOA 1AVXB 4QD2C 2GZBA 1BLAA 5D61A 3FJJA 1D0HA 1YTOA 3H6RB 4IONA 5HPZA 1HCEA 1PUMB 3AZVA 2DRYA 1ILR1 4QBCA 4AN7B 3CA1A 2Q3NB 3POKA 1RZOB 1DZDA 6I1BA 4EB2B 7I1BA 3H6SE 1K5VA 4QKSA 1ISVA 3A22A 4LO7B 2QN4A 1S0DA 4I4UA 4LO7C 2FDBM 4USPA 9ILBA 3BAQA 3Q7WA 4IY9A 2DS0A 3AKIA 4J23B 2AQZA 4LO1C 3UD7A 3S8KA 4P6AA 3B9UA 4F34A 1EYLA 4ZA3B 3BA4A 1KNMA 5D63A 1TWEA 1ITBA 1ISWA 4I1BA 5E24E 3CRHA 2LIQA 3HOMA 1UPSA 1AVWB 3JUTA 3O4DA 2IHOA 2X2SA 1W3FA 1YXWA 4A7ZA 1A8DA 1EPWA 1S0BA 1TTUA 5FZZA 3V79C 4JKXB 1JLXA 4KEIA 1Z0HA 1L2HA 4IZEA 1G9AA 4GAFA 4J2SA 5BXSA 3PMEA 4A7KA 3AJ6A 3IAGC 4ISQA 3WO3A 2YUGA 4LO3C 2BEBA 3N7MA 2DREA 3RSJA 4JQ0A 1TWMA 4I4OA 1PWAA 1N4KA 1FGAA 4DCKC 2VXRA 1IOBA 3PHZA 4I96A 3FJIA 3KMVA 3N0KA 5FNWA 5F90A 4J2KA 3ILAA 1MD6A 4PC4A 3UDAA 1FQ9A 4EKXB 3H6QA 4JKQA 3ZC8A 2D44A 5F8YA 2Q9XA 1IT0A 3C9ZA 3P6JA 4ZGRB 4IY8A 5G00A 3FJ8A 5JMCA 4I4SA 4OEEA 2D20A 1PC8B 2F2FA 3HBWA 4I7IA 3WINA 4Q9PA 2I1BA 3RMYA 3BTAA 5B2HA 4ZKTB 3BB2A 3PUBA 1JLYA 2GO2A 2AAIB 2NTDA 3O4BA 3CA4A 5BOWA 3VSZA 3FUOA 3WMVA 2X2TA 1WD3A 2VSEA 2FO1A 1DQGA 3N7LA 4EEEB 4OWJA 3I2AA 2ZQNA 4P0KA 8I1BA 5DZUA 3VEQA 2ZR1B 1JT7A 3FJHA 1I1BA 4OEFA 3AZWA 4QKRA 4G6JA 3OJMA 4HA2A 1JT3A 4P0JA 1AF9A 2QYIB 3OJVA 4Q91A 3MPPG 1QXMA 2HZ9A 2NVHA 4X3AA 4X37A 1IILA 3AKFA 1E0OA 1G9BA 3VSFA 5D62A 3BX1C 3WINC 1ONKB 4WBCA 5BP5C 2ERMA 3CAHA 1HIBA 4II0A 4P0LA 2NM1A 4I4QA 1EVTA 5F8WA 4I6IA 1BARA 4DENA 1VCLA 4H04A 2KH2A 4XFSA 4GP0A 2ZQOA 4EFRA 4QALA 4G9NA 1IHKA 3O44A 2IWTB 4HR6C 4LO8B 3K1XA 1V6UA 2WBCA 2L5XA 3I29B 1II4A 3BA5A 3CQAA 3A21A 2D1ZA 1SZ6B 5BXTA 1R8NA 2KI4A 2MIBA 5FNXA 2D7IA 1AXMA 1T9FA 3F62B 4QO3A 1EV2A 1BASA 4XKIA 1JQZA 2F8XC 1CE7B 2MLLB 3TC2A 1WBAA 3IM6A 4JP0A 1CVSA 5FZUA 4I4YA 3WO2A 3NBEA 2FFVA 2MC2A 3O49A 2P23A 2K4AB 5EG6C 1HWMB 1XYFA 2R9KB 4I4RA 4G1RA 5JLVA 3WO4A 3FJCA 1RMLA 1FV2A 1V6WA 1MC9A 4H9WA 4ZBVB 2ESUA 3O5WB 1F31A 3BAVA 1FMMS 4LO2A 4IZXA 1FWUA 2HWAA 3Q7XA 3UJ4A 1QQKA 4DEPA 4HJJA 1M16A 4LO0A 1Q1UA 3V0AA 1BFBA 1TP0A 1M2TB 1PUUB 3VT2A 1AVAC 1S0FA 1TFMB 5F8SA 3AJ5A 1IRPA 4L4IA 1YYNA 5DSSB 3OGFA 3Q7YA 2P39A 4R6UB 2D23A 3FJBA 1Z2VA 4YOLA 3MALA 1JT5A 1GGPB 3IM7A 2D43A 41BIA 1DFCA 4ZFUB 4GOYA 4IYBA 1JTCA 3UD8A 2HWMA 4LO2C 1T4QA 3OBRA 3D7WB 4I4VA 4GOVA 4JAWA 3VWCA 3VUOA 3BRFA 1Q04A 1YBIA 1G82A 1DLLA 3V0AB 1S0GA 3NBCA 4KC3A 1V6VA 4QBVA 4Z8SB 3AKHA 3BAOA 4TLPA 1TIEA 1IRAX 4QC4A 3FJKA 4FGFA 3CU1B 3QYDA 2NP0A 1FWVA 3ZXDA 3A23A 1ISXA 4Q9GA 1NZKA 4XFTA 2RQ9A 1XZZA 2LIEA 3HSMA 2F2FC 1W3GA 1RY7A 1BFGA 1DFQA 3WMUA 2VXTI 1OQLB 5DVHA 1Z4SA 1FMZA 2NYYA 1HKNA 1S0EA 2BEAA 3N7JA 4KEKA 4JRAA 3P53A 5BXRA 3NJ5A 4ENDA 4ZOTA 4CJMA 1G9CA 4LO1A 2RG9B 4XFUA 2NZ9A 4X38A 3T8SA 3WA1A 3O4OA 2VSAA 3ZXGA 1RG8A 4JPZA 1ISZA 1QQLA 4Z9WB 3F1RA 3RMXA 3LLPA 4J2YA 3S8JA 1XHBA 3FUQA 3NBNA 2E4MA 3O3QA 4I0YA 1YF8B 1FN0A 3HN1A 2KI6B 3AKGA 3BAUA 1BFCA 4KBBA 1WD4A 4FVVA 1Q03A 1S0LA 2VU9A 4D8HA 2BFHA 3W9TA 4LO3A 4IQPA 3HALA 3O4AA 1PZZA 3R4UA 1DJSB 2Y9FA 3P6IA 1HWNB 1AVUA 3QR5A 5FZYA 1ABRB 4I1EA 4KEJA 4I8MA 4OWLA 2VUAA 1W3AA 2KLLA 4OWKA 4ZLBB 3BRDA 3BAHA 1DZCA 4ISRA 4OW4A 3JRRA 1XG6A 3R4SA 4ZFYB 1AFCA 1DIWA 3A07A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I0SA 3BAGA 5A33B 5C3SA 3GBWA 3RRDA 1HQNA 5FK8A 5LWBA 2E4MC 2JDMA 2DBNA 2RM23 1VBB3 5CISA 3AB0A 2RMU2 2JDPA 5J1XA 1ULDA 2Y6FA 3N9QA 2JB8A 1BVVA 4D7TA 4DB5A 1AYM3 1EV13 2B42B 4FPKA 2M49A 2VLCA 3CRGA 4J2XA 4A6OA 2WZEA 2OKXA 4QQPA 1PZ8A 5DG2A 2AACA 1UYYA 1LU1A 1O8PA 4EE2A 1WMDA 2D93A 3WQ0A 3ZX7A 3IM5A 3VBRA 4A7YA 1QMJA 2FCVA 4NHLA 2PLV2 4QQLA 1LHVA 2ZGTA 5A3UA 1RUJ2 5BQUA 3BRGC 5H9RA 2YB7A 4MV2A 3GALA 1QJY1 3CA6A 3JCIA 4Q4X3 2GMMA 2XJPA 3AFKA 3G6JB 1AX0A 1U5XA 4GJZA 5DG1A 3IIRA 2KKIA 5KHIA 2P6HA 2WZR3 3PUHA 1QF3A 2XHKA 4R4XA 2VOWA 4CCMA 1OOPB 4IUGA 2WA4A 3R6SA 1OOPC 2Q8DA 3ACFA 4CEWC 2ET2A 3BA7A 4F83A 4MZGB 4P9WA 1KXGA 3FFZA 1ONAA 4PCRA 1RMU3 4Y1XA 4BCUA 4K3UA 5KBFA 1RUNA 5A70A 1VBA1 1OVSA 3JZVA 1C8M1 4XAEA 1MS9A 1WBCA 4QD2A 5A7PA 3IMMA 4I37A 2WFF2 4OUJA 2WT2A 1PZ9A 4LKSA 5BXXA 3UKTA 5FZGA 1NCRB 4M01A 3U11A 5I1BA 1G9DA 2ZACA 1NCRC 5LBFA 3WHUA 5FP7A 2VMHA 4P08A 1LB2A 4GD4A 1LOEA 1YHFA 4XBNA 3BU7A 1LAJA 3IDBB 3VBFB 4J1WA 3H8UA 5CBLA 2W1UA 2VZOA 2PXJA 3NJVA 4PT6A 4YM0A 3VBFC 1JH5A 4QHOA 5BP5A 2Q8CA 1AYN2 2EIGA 5A7NA 4HMZA 4JAAA 1J3QA 2D24A 3ZIWA 3H1MA 4WZFA 3BTYA 1J1LA 4S2GA 2ZX2A 3ES1A 4V1PA 2LW8A 1HV0A 2HW9A 1JU3A 1W6PB 4AFDA 3TEZA 4P9JA 4FP3A 4HK9A 1OLME 1RL3A 3I59A 2Q8OA 2DURA 3LFIA 1P8JA 1REFA 2NMOA 2OPWA 4LO7A 4N7UA 5ACA2 1J0SA 1ODMA 4EJRA 2MHFA 3U07A 5BNQA 1XPWA 1Q56A 4NIHA 1HCDA 2RSTA 5KHKA 1WCKA 2WRYA 4KWLA 31BIA 1Y4WA 4O7XA 1STMA 3U0ZA 1UOFA 5EHAA 1GU3A 4I4XA 1JY0A 5CFDB 4KGQA 5FXWA 5CFDC 5E1RA 1TMF2 3ZN4A 1TOOA 1AVXB 3OEAA 4EQVA 1WMXA 3LEMA 2W39A 5LK5A 5K4LA 5D61A 1C3HA 3JD71 1D0HA 2HEYF 1GOGA 2YMZA 2ET1A 3A0KA 5HPZA 1CJPA 3KHCA 3KZ4C 3KV9A 1PO22 3CJIA 1HW5A 3SCHA 1DGWA 1QGLA 3CA1A 2G1MA 4XF9A 3BI3A 2D3PA 2PHWA 3PUAA 5DZEA 4NIAA 1YQ6A 1KDKA 2O1QA 4QQOA 2XHNA 2HJIA 2RDSA 4NN0A 5FZOB 4EB2B 7I1BA 1JU4A 4PDWC 1QJU3 1GBGA 2DU0A 4HVQA 1CONA 5FUIA 5C8CA 4K21A 2ZX3A 3DPRA 3A22A 3I3DA 1ISVA 3I2KA 1OI6A 2Q1MA 3S7IA 2LALA 1CR7A 4AXOA 4XEZA 3BAQA 4HPKA 2GH2A 1W8ZA 2QTWB 4IY9A 4CEYB 4JGYA 2EXKA 1RUE2 4CEYC 4HXCA 3MW3A 3OUHA 3T2PA 2ILMA 4UW3A 3W5MA 4EWDA 2UWAA 1J84A 3UJOA 4ZA3B 3Q8EA 2FQPA 3J7NA 2K2SA 4RHV3 4QHZA 4ZONA 2JG8B 4MGQA 4ZHNA 3EO6A 2JG8C 3HNMA 3NO8A 1SLBA 2LIQA 3CRHA 1AVWB 5KXDA 2X29A 1DF0A 1ND2C 2X2SA 3AP7A 1BMV1 3T2TA 1PX3A 1EPWA 2EXIA 1LR5A 4CDWC 4TSVA 2AREA 1DGRA 4UF0A 4D7YA 3FLTA 4Z82A 1TTUA 2VMGA 3S57A 5EHDA 5C3OA 1HN1A 1W2NA 1Z0HA 2QQNA 5CYYA 4QX7A 5EJZB 1H8TB 4YGEA 5T3NA 3GHMA 3WSOA 4YFZA 4GAFA 4OHZA 1NCQA 3ZYRA 1ST8A 3AKSA 2VOKA 5FY0A 4YRDA 4M0NA 5JSPA 2Y6HA 1OBNA 2DREA 4N7IA 2R6QA 5FBJA 1RUD1 4I01A 4BHPA 2GMEA 1EAH2 3LIGA 1ZRFA 4BIFA 3S0MA 2EVXA 2G9FA 4FPEA 3ZYPA 4DCKC 1E57A 2VXRA 1MEC1 2QE3A 2RS31 4N43A 1W3XA 4NOTA 3OJBA 3LOBA 1IOBA 4I96A 5EPAA 2A6VA 1VBC1 5FP3A 3N0KA 3FZ3A 4GMP3 1GZCA 4OI2A 4D94A 5EJ3A 4KWJA 4CDXB 1U5IA 1UF2C 2XQXA 1UU6A 4CDXC 3AJYA 3CEWA 3MUZ1 1QJFA 3AMHA 3K2OA 4D8MA 1H2KA 1E5SA 4IEYA 4OI0A 4R9BA 4YVWB 3ZC8A 5E16A 4YVWC 1W0OA 2D44A 1ASJ2 3LZZA 1RB8G 1FMD2 3K75B 3C9ZA 4NR1A 4RS5A 5G04L 4Q4W1 4NUBA 3O1VA 2RS11 4NRMA 3ZXFA 2HBTA 4COVA 5GALA 5JMOA 5JWPA 4W6YA 2D20A 1ZBE1 5AFBA 2D6OX 3OD4A 4P00B 1JN2P 2VH9A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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