4A7YA

Active site metal depleted aldos-2-ulose dehydratase
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
886
structure length
880
Chain Sequence
QPAALPLFQPQLVQGGRPDGYWVEAFPFRSDSSKCPNIIGYGLGTYDMKSDIQMLVNPYATTNNQSSSWTPVPLAKLDFPVAMHYADITKNGFNDVIITDQYGSSMDDIWAYGGRVSWLENPGELRDNWTMRTIGHSPGMHRLKAGHFTRTDRVQVVAVPIVVASSDLTTPADVIIFTAPDDPRSEQLWQRDVVGTRHLVHEVAIVPAAETDGEMRFDQIILAGRDGVDCLWYDGARWQRHLVGTGLPEERGDPYWGAGSAAVGRVGDDYAGYICSAEAFHGNTVSVYTKPAGSPTGIVRAEWTRHVLDVFGPLNGKHTGSIHQVVCADIDGDGEDEFLVAMMGADPPDFQRTGVWCYKLVDRTNMKFSKTKVSSVSAGRIATANFHSQGSEVDIATISYSVPGYFESPNPSINVFLSTGILAERLDEEVMLRVVRAGSTRFKTEMEFLDVAGKKLTLVVLPPFARLDVERNVSGVKVMAGTVCWADENGKHERVPATRPFGCESMIVSADYLESGEEGAILVLYKPSSTSGRPPFRSMDELVAHNLFPAYVPDSVRAMKFPWVRCADRPWAHGRFKDLDFFNLIGFHVNFADDSAAVLAHVQLWTAGIGVSAGFHNHVEASFCEIHACIANGTGRGGMRWATVPDANFNPDSPNLEDTELIVVPDMHEHGPLWRTRPDGHPLLRMNDTIDYPWHAWLAGAGNPSPQAFDVWVAFEFPGFETFSTPPPPRVLEPGRYAIRFGDPHQTASLALQKNDATDGTPVLALLDLDGGPSPQAWNISHVPGTDMYEIAHAKTGSLVCARWPPVKNQRVAGTHSPAAMGLTSRWAVTKNTKGQITFRLPEAPDHGPLFLSVSAIDAIPVIVQGDSIELSAWSLVPAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of Bifunctional Aldos-2-Ulose Dehydratase/Isomerase from Phanerochaete Chrysosporium with the Reaction Intermediate Ascopyrone M.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALDOS-2-ULOSE DEHYDRATASE
molecule tags Lyase
source organism Phanerochaete chrysosporium
total genus 196
structure length 880
sequence length 886
ec nomenclature ec 4.2.1.110: Aldos-2-ulose dehydratase.
pdb deposition date 2011-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18056 PBP3 Penicillin Binding Protein 3 Domain
A PF18637 AUDH_Cupin Aldos-2-ulose dehydratase/isomerase (AUDH) Cupin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.990 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4a7yA02
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4a7yA03
4L4IA 3WINC 1EVTA 3OJVA 4ENDA 5F8SA 3CA5A 3AKFA 3HOMA 3AH1A 1FWVA 4GOVA 1JT5A 4G9MA 1DFCA 3HMYA 4LO8B 4XFSA 2J3PA 2KI4A 3CA3A 3VT0A 4EB2B 3FJDA 1XG6A 2NM1A 1S0GA 1ITBA 3BAVA 3Q7XA 3RSJA 4KEKA 4GAIA 2DRYA 1XHBA 3EF2A 3WO4A 4I0YA 1JLYA 1FMMS 1ISYA 1AXMA 2RG9B 3BAOA 3V0AB 3I2XA 1L2HA 4ZFYB 1DFQA 4II0A 3ZC8A 2IHOA 4A7ZA 4Z8SB 1Z0HA 1NZKA 3C9ZA 4L4HA 41BIA 1FQ9A 31BIA 3AJ5A 3BRDA 4ZA3B 4QBCA 4GOYA 4Q9GA 4G1RA 2VSAA 4EEEB 4I7IA 3WA1A 2NVHA 1S0DA 3VSFA 4I4RA 1ABRB 1YYNA 4OWJA 4ZKTB 1MC9A 2Y9XE 3A22A 1BLAA 1PWAA 1ILR1 3BB2A 4I4VA 1D0HA 2E4MA 3IM6A 4EFQA 5JMCA 3V0BA 2DRZA 5FNXA 4EFPA 2D24A 2ZQNA 2BEAA 4Q91A 3T8SA 3CA1A 3MALA 1PC8B 4LO1C 1WD4A 1R8NA 5JLVA 3S8KA 2E4MC 1JTCA 1ONKB 3PUBA 2IWTB 1V6UA 2F8XC 3P6JA 1UPSA 3BA5A 3OGFA 1Q03A 2ESUA 2NTDA 4G6MA 4IONA 1BA7A 3AH4A 3FFZA 3FGMA 1BLDA 2KI6B 1J0SA 2K43A 1AVUA 3CA4A 4R6UB 3UD7A 3FJJA 1KNMA 4KC3A 5G00A 3HALA 3BADA 3P53A 3BAGA 2KH2A 4ZOTA 1QQKA 1DZDA 2D22A 1BASA 5F8WA 4EKXB 3QYDA 2D43A 2VU9A 3BTAA 1HKNA 3RMXA 3VSZA 1RMLA 5EG6C 2Y9WC 4AN7B 3F62B 5D61A 4P6AA 4G9NA 4I4UA 1G9DA 4HA2A 3I29B 4JRAA 2KKIA 1JQZA 4F34A 3RTJB 4ZLBB 1IILA 4FGFA 2WBCA 4LO3A 3UD9A 4QO3A 1NUNA 2D7RA 3RTIB 5I1BA 2VXRA 3H6RA 3N0KA 3H6SE 4J2SA 4JKXB 4FVVA 4JP0A 1S0LA 3VT2A 1BFCA 1FN0A 2GZBA 4I1EA 3IAGC 4OWKA 2D7IA 1FV2A 1DLLA 1DQOA 3MPPG 3N7LA 3O3QA 1TWMA 4LO3C 4IHZA 4F83A 1IRPA 2DREA 3AKHA 3FJBA 5FZUA 3O5WB 4QKRA 4KEIA 4QKSA 2NP0A 3BRFA 1TWEA 4IQPA 4IY8A 3NBDA 1PZZA 1TOOA 4D0ZA 1DZCA 3CA6A 3AKGA 3FJHA 1JY0A 4I3NA 5BXTA 4JPZA 1OQLB 2FFVA 4JQ0A 4AN6A 3FJAA 1I1BA 2R9KB 4D8HA 1ISXA 3FUQA 3BAQA 2HWMA 5DZUA 2DS0A 5D62A 3E8LC 1SR4A 3KMVA 1AF9A 1S0BA 3IM5A 3O44A 4LO7C 3AH2A 2Y9GA 2X2TA 2YUGA 5BQUA 1PUMB 5BXPA 4J2YA 3ZXDA 4DENA 3ZXGA 4LO0C 4I4QA 2AFGA 5BVPI 2ERMA 4PC4A 3SNVA 1IT0A 3FJKA 5F8YA 2AQZA 1K5UA 3H6RB 1JT7A 3ZX7A 2M49A 3JRRA 2XOAA 1SR4C 1RZOB 5GAQA 3CU1B 3V79C 1DJSB 1IOBA 1V6VA 1DQGA 3CRIA 5EC5A 9ILBA 3LLPA 2D20A 2MLLB 5BQUC 1T9FA 4I4PA 3FJEA 4H04A 4LO1A 5BXSA 4IZEA 3B9UA 1S0EA 5DSSB 2HZ9A 4OUJA 4LO7B 1G82A 2F2FC 3N7KA 1AVAC 3O4AA 1JT3A 2VLCA 3CRHA 1EPWA 3UJ4A 4USOA 3RMYA 6I1BA 3Q7WA 1ISWA 1EV2A 3D7WB 3BA7A 4HR6C 1CVSA 1BFFA 1N4KA 1WBCA 1II4A 4A7KA 1T4QA 1FMZA 2AXMA 4XFTA 1BARA 3CRGA 1FWUA 1XYFA 4I1BA 1HCEA 4X38A 5FZZA 2P39A 1YTOA 4P0KA 1BFBA 1V6XA 4I2SA 1G9AA 4XKIA 2Z48A 4KBBA 1QQLA 3CQAA 1K5VA 1IRAX 4JAWA 1DIWA 1HWNB 3BAUA 5EHAA 2MC2A 2AAIB 5BP5A 1S0FA 4CJMA 4KEJA 1AFCA 2BFHA 3I2AA 2K8RA 1RG8A 3POKA 1EYLA 3TC2A 3WMVA 4X37A 2Q9XA 1AVWB 4G6JA 1FV3A 3JUTA 1TP0A 1A8DA 5BP5C 3HSMA 4J2KA 1M2TB 7I1BA 4X39A 4OWLA 3O4BA 3CA0A 3LTQA 2HW9A 2LIQA 1YXWA 3FJFA 3P6IA 2BEBA 1HIBA 4LO2C 3A07A 2FGFA 3UJ0A 4I4SA 1YBIA 3WO3A 2QYIB 4QD2B 4I8MA 1Z4SA 1RY7A 4GP0A 1SZ6B 3FUOA 3NJ5A 3HN1A 2FO1A 1JLXA 1HWOB 4A7YA 4IY9A 3FJ9A 3NBEA 1V6WA 5F90A 4LO0A 1HWMB 3HBWA 3AKIA 2ZQOA 2RQ9A 1S0CA 4OEEA 2Q3NB 4QC4A 1IJTA 4YOLA 2I1BA 3OGGA 4X3AA 3VT1A 3H6QA 3OJMA 4DCKC 3BX1C 4Z9WB 5FZYA 4QBVA 1MD6A 2VXTI 4OW4A 1XZZA 4I37A 1G9BA 4WBCA 2L5XA 4D0TA 3O4DA 4I4YA 1GGPB 2KLLA 5D63A 3OBTA 4Q9PA 2Z49A 2F2FA 2ZR1B 2UUSA 2VSEA 1Z2VA 3A21A 4QALA 4ZGRB 4IZXA 4ZBVB 3OBRA 4TLPA 4J2XA 3QR5A 1P63A 3UD8A 3S8JA 5BXRA 3CAHA 2D23A 3PG0A 1W3FA 4JKQA 4OEFA 3FJ8A 3K1XA 2MIBA 2QN4A 3IM7A 2HWAA 2P23A 4OEGA 1YF8B 8I1BA 4J23B 3PMEA 2GO2A 4ZFWB 3VEQA 2D44A 21BIA 3NBCA 3N7MA 3FJIA 2LIEA 1W3GA 2NYYA 4HJJA 3UDAA 1F31A 1HWPB 1PUUB 3O49A 4ZFUB 4XFUA 4USPA 2NZ9A 3R4UA 4I4OA 4IYBA 5BOWA 5HPZA 1HCDA 4H9WA 3NBNA 4I96A 2WRYA 3BAHA 3ILAA 4EFRA 4ISRA 3BA4A 3AZVA 3AJ6A 3AZWA 4QD2C 3OJ2A 3Q7YA 1CE7B 5DVHA 1Q1UA 1ISZA 1M16A 1W3AA 4ISQA 2Y9FA 1BFGA 3VUOA 2FFUA 2VUAA 3WMUA 1R8OA 2RSTA 3VWCA 3W9TA 1TTUA 4I4XA 5FNWA 4LO2A 1G9CA 3V0AA 3PHZA 3FJCA 2ET2A 3N7JA 1AVXB 2K4AB 4GP3A 4P0JA 1TIEA 3ZC9A 1E0OA 1TFMB 2FDBM 3O4OA 1JT4A 3WINA 1WD3A 1FGAA 3WO2A 1I1EA 2X2SA 1Q04A 1IHKA 3V0BB 1QXMA 1WBAA 3R4SA 1ISVA 3F1RA 1VCLA 3O4CA 5E24E 3BRGC 5B2HA 2D1ZA 4I6IA 5DUYA 4GAFA 4P0LA 4DEPA 3A23A 3IIRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4L4IA 4CXXA 1EVTA 3KGLA 4QM9A 3WVJA 1SLCA 2ZZQA 4AI1A 3CJIB 3FBYA 3H8UA 5DZFA 4ZXEA 1BHGA 1MS8A 4V1PA 4GOVA 5DUVA 1UY2A 5FJKA 4CDXA 4G9MA 2X09A 4LXLA 2P3YA 4LO8B 3H7YA 4ONUA 5LY1A 3LB9A 2J3PA 1ZA7A 2ZAAA 5C6CA 5T5OA 1XG6A 2PHUA 2NM1A 1QQP2 1HQLA 3ZMOA 3BAVA 1SCRA 2CV6A 1W2AX 4UW5A 3WUDA 5JR7B 3ETQA 4XDPA 1H9WA 2GZWA 2VO5A 2DRYA 4Z92B 5F9TA 4PLMA 4GAIA 3RDIA 4NIDA 5GLTA 5ABJB 4I0YA 1I3HA 2N7GA 1C3HA 4CDXC 1CD3G 1KFUL 2G9ZA 2CGOA 4Q2FA 4D6QA 3AL5A 4QPGB 1ISYA 4OZXA 4RHV1 2LM3A 1PNFA 2VCMA 2LS6A 3I2XA 2R072 3QACA 1L2HA 3IDBB 1AYN1 2HWB1 3OGJA 5HBAA 1JZ8A 3OSDA 3PVBB 4R9BA 3ZKYA 5FYBA 4CTEA 4Z8SB 1NZKA 4DRVA 1UX6A 3MUY1 3N4MA 4NPRA 4UXAA 5F5CA 4EN6B 4L4HA 3LOIA 3OUIA 1QJX3 2EXJA 1JHJA 5FUIA 1J3RA 1LHVA 1RVF3 1QJFA 2ES3A 3BRDA 1GNHA 2D5HA 4AWDA 5IK4A 2HLEA 4ZA3B 1UOBA 2YFUA 1CESA 2OZJA 1H1AA 2RJKA 4Q4Y2 4MGZE 1KDMA 5AVAA 4EWDA 3UESA 2VUDA 2VSAA 5HCBA 5FTTC 4I7IA 1LAJA 1E5SA 2VUJA 3O0WA 2NVHA 2CWSA 5GALA 1S0DA 4YVWB 4CYDA 3VSFA 1DQ4A 4R9AA 4YW7A 5DAQA 2B45X 1MC9A 1RUD3 4AHYA 2QQMA 1RVF2 1MZFA 1YI9A 5KXBA 1BLAA 3H8XA 4CDXB 5FLIA 1RHI1 1ILR1 2E4MA 1YCIA 3EB7A 3THDA 3BKZA 5JOXA 5AC92 4IEYA 3W5NA 1GV9A 1JYWA 2V5DA 1UQXA 3AKSA 3ZFFA 2BNOA 2WO2A 3LQCA 4KWLA 3WF4A 3AK0A 3ZN4A 1RITA 4OI0A 1LOBA 2AEZA 5A1LA 2C0ZA 5T54A 3MALA 5D2AA 2BFUS 5C33A 1WD4A 3UJQA 4OQ8A 1R8NA 5JLVA 3GNEA 4L97A 2E4MC 3S8KA 1IKQA 1L7QA 1JU3A 2OIIA 3K4AA 3PUBA 5T5JA 2VAUA 2IWTB 4I09A 5EFUA 3ETPA 3SMHA 3P6JA 2F8XC 1X9PA 2VCBA 1Q03A 3FMGA 3I2GA 2PAKA 3ZFFC 2NTDA 1F2NA 4YM0A 4YW6A 1UZ0A 3OGVA 4AQTA 4TWTA 1LR5A 3L2YA 5DDJ1 4Q4W2 3DYPA 1NYWA 3FGMA 4BB3A 2KI6B 1LKNA 3H9AA 1VBB3 2VOKA 3ZR5A 5FYVA 3ZXKA 1UO9A 2HWC3 3WQBA 3PUQA 4IEZA 1MS9A 1KNMA 3ROUA 5CG9A 3WDUA 4NIHA 4H14A 3P53A 1K45A 4LUKA 4C0BA 3VBRB 3OPWA 4IEWA 4RL7A 4XETA 3C7OA 2KH2A 4ZOTA 4FXKB 3DGTA 3MLKA 1SACA 2PQSA 2PHDA 3PIGA 1ASJ1 1HRI1 5I0RA 4EKXB 1HKNA 2XWBB 5KR7A 1RMLA 3VSZA 5EG6C 3OBZA 1SLTA 2P17A 3MFAA 5EJZB 1YFUA 2XB6C 4I02A 4Y1YA 1YO8A 2K9ZA 2YDEA 3F62B 3MIGA 4I4UA 2HWC2 4HA2A 4M4RA 2P2KA 1JQZA 3B3QE 5F2SA 1AXKA 2MNGA 2ZPXA 2B5HA 5FY7A 1NCQA 4XQDA 5FXWA 1ALYA 5CADA 1WBFA 2HWF2 2FBEA 2QQUA 3JBG1 2A75A 1W06A 2WWUA 3FC0A 4LOSA 5FQ0B 5FZGA 2GN7A 4XDOA 3ME2A 5LASA 3KWVA 4RYDA 3BTZA 3N0KA 4BWOA 4J2SA 3BU7A 5DG1A 1E5RA 4FVVA 4GMP3 4LE3A 5LWBA 1BFCA 3JQXA 5K4LA 4HN0A 2AUYA 2BVVA 5B4XA 5LBCA 4AVCA 2QQPA 1H2LA 2JB4A 3NKTA 4GALA 3WR0A 1J58A 1R083 2BYVE 3RI8A 3N9NA 1DLLA 2VMGA 2JG8A 1NCQC 3MPPG 5KXEA 2PMWB 2VMDA 1VAVA 3CLPA 5FMBA 1YWKA 3HD8B 2VH9A 4UFIA 2V4AA 3A0NA 4QX0A 1C1LA 3CU7A 3I3QA 5FZUA 3O5WB 2QZ3A 3D0JA 3OUJA 4XURA 1PZ9A 1IHMA 3RJ2X 3SCHA 3FL7A 5DQ0A 4AI0A 4MADA 4QQOA 3LDBA 4E27A 5BY5A 2GC3A 3O1TA 4IY8A 4JTNA 1CAVB 5IFPA 1PGL1 3WNNA 3DECA 3OG2A 2JG8C 1ND3B 3AXEA 5FZEA 4OFGA 1IG0A 1GYKA 5A6XA 2YC0A 1ODMA 2WKKA 3AP9A 3SCFA 2GC2A 1ZVFA 3HWJA 1O3QA 4JQ0A 4AN6A 4Q0SA 4C91A 1UYPA 2W9XA 2BPA2 3WNXA 1JYTA 3ZO0B 2J1TA 3T30A 1K12A 1N3QA 2HWMA 3DN7A 2PN5A 1ZBE2 1RUI3 1OQDA 3MLJA 4FSJA 3KMVA 2XJPA 1S0BA 3RPQA 3OGSA 4LKFA 2EXIA 4Q0PA 2HWD3 5IUQA 4IEXA 2Y9GA 3I8TA 3GDBA 1FPN1 2YUGA 5BQUA 5IFTA 4YW2A 1PUMB 5BXPA 1TME2 4AVTA 1HJGA 1DCSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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