4A7YA

Active site metal depleted aldos-2-ulose dehydratase
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
886
structure length
880
Chain Sequence
QPAALPLFQPQLVQGGRPDGYWVEAFPFRSDSSKCPNIIGYGLGTYDMKSDIQMLVNPYATTNNQSSSWTPVPLAKLDFPVAMHYADITKNGFNDVIITDQYGSSMDDIWAYGGRVSWLENPGELRDNWTMRTIGHSPGMHRLKAGHFTRTDRVQVVAVPIVVASSDLTTPADVIIFTAPDDPRSEQLWQRDVVGTRHLVHEVAIVPAAETDGEMRFDQIILAGRDGVDCLWYDGARWQRHLVGTGLPEERGDPYWGAGSAAVGRVGDDYAGYICSAEAFHGNTVSVYTKPAGSPTGIVRAEWTRHVLDVFGPLNGKHTGSIHQVVCADIDGDGEDEFLVAMMGADPPDFQRTGVWCYKLVDRTNMKFSKTKVSSVSAGRIATANFHSQGSEVDIATISYSVPGYFESPNPSINVFLSTGILAERLDEEVMLRVVRAGSTRFKTEMEFLDVAGKKLTLVVLPPFARLDVERNVSGVKVMAGTVCWADENGKHERVPATRPFGCESMIVSADYLESGEEGAILVLYKPSSTSGRPPFRSMDELVAHNLFPAYVPDSVRAMKFPWVRCADRPWAHGRFKDLDFFNLIGFHVNFADDSAAVLAHVQLWTAGIGVSAGFHNHVEASFCEIHACIANGTGRGGMRWATVPDANFNPDSPNLEDTELIVVPDMHEHGPLWRTRPDGHPLLRMNDTIDYPWHAWLAGAGNPSPQAFDVWVAFEFPGFETFSTPPPPRVLEPGRYAIRFGDPHQTASLALQKNDATDGTPVLALLDLDGGPSPQAWNISHVPGTDMYEIAHAKTGSLVCARWPPVKNQRVAGTHSPAAMGLTSRWAVTKNTKGQITFRLPEAPDHGPLFLSVSAIDAIPVIVQGDSIELSAWSLVPAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of Bifunctional Aldos-2-Ulose Dehydratase/Isomerase from Phanerochaete Chrysosporium with the Reaction Intermediate Ascopyrone M.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Phanerochaete chrysosporium
molecule keywords ALDOS-2-ULOSE DEHYDRATASE
total genus 196
structure length 880
sequence length 886
ec nomenclature ec 4.2.1.110: Aldos-2-ulose dehydratase.
pdb deposition date 2011-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18056 PBP3 Penicillin Binding Protein 3 Domain
A PF18637 AUDH_Cupin Aldos-2-ulose dehydratase/isomerase (AUDH) Cupin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.990 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4a7yA02
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4a7yA03
1G82A 2RSTA 2I1BA 3HN1A 1R8NA 3BA5A 4WBCA 2KI4A 3NBNA 5D63A 3FJFA 3BADA 4EFPA 3FJCA 3ZX7A 2FO1A 3OJ2A 1S0BA 3AH2A 1DQGA 2D7RA 5G00A 1FV2A 3IM7A 4Q91A 1YBIA 1RMLA 3A22A 1JLYA 3P53A 2ZQNA 3V0BA 4P0LA 2NTDA 4Q9GA 1FWVA 1HCEA 3FFZA 1SZ6B 4G6JA 4ZFUB 4Z8SB 1S0FA 2F2FA 1W3FA 4I4PA 4J23B 3BAQA 3T8SA 1TIEA 4LO7C 3CRIA 2ET2A 3AZWA 3A07A 3D7WB 3CAHA 4XFSA 4ZLBB 5F90A 3RTJB 3TC2A 2LIQA 1FQ9A 4USOA 4J2YA 1K5UA 4LO8B 2Q3NB 3WMUA 3A21A 4H04A 3VUOA 3CRGA 3FJ8A 2HWMA 1BA7A 1EYLA 2HWAA 2ZQOA 3H6RA 3WO3A 4QBCA 1VCLA 1K5VA 3PG0A 3ZXDA 3RSJA 2F2FC 1G9AA 5E24E 1FWUA 2Y9GA 3BTAA 2HZ9A 3FJEA 4ISRA 4QBVA 3FUQA 3IM6A 3OJVA 5F8YA 1G9DA 3FJJA 3K1XA 1I1BA 2D22A 1DFQA 4I4OA 3JUTA 2Z48A 3WINA 1D0HA 4HA2A 2KH2A 2FDBM 3R4UA 1XG6A 1QQLA 2WBCA 3CA0A 3WMVA 4I1EA 4I4UA 2ZR1B 4TLPA 1S0LA 5JMCA 4JRAA 4EFQA 4EB2B 1JQZA 1YYNA 3HOMA 4GAFA 4ZGRB 3BRDA 2D7IA 2Z49A 2AFGA 4ZFYB 2K8RA 3VT1A 1S0DA 1CE7B 3BAVA 3I2XA 4GP3A 1XHBA 5DUYA 5BQUA 1HCDA 3MALA 1M16A 4L4HA 4J2KA 1I1EA 3WA1A 3BAGA 1GGPB 4QALA 2DS0A 1JTCA 4XKIA 3VEQA 1II4A 5FZZA 4OEGA 3BAOA 2K43A 3SNVA 1PUMB 1YXWA 1BLDA 3HBWA 4OWLA 3O4OA 1V6UA 1R8OA 1JT5A 3O3QA 3RTIB 1IOBA 4I0YA 3UD7A 1N4KA 5BQUC 8I1BA 7I1BA 3O4BA 4X39A 2NP0A 1DQOA 3AJ6A 3AH4A 4Q9PA 2BFHA 1MD6A 3NBEA 2KI6B 2VU9A 3BA7A 3ZC8A 3I2AA 1JT4A 4F83A 5HPZA 1DJSB 3EF2A 5FNXA 2VUAA 4F34A 1ISXA 1EPWA 1DZCA 3ILAA 4QC4A 2LIEA 2MIBA 3QYDA 3UD8A 2D1ZA 2RQ9A 3OJMA 1S0CA 1KNMA 2VSAA 2AXMA 4J2XA 3IAGC 2KKIA 3NBCA 1AVWB 5D62A 3CQAA 3NJ5A 1WBCA 3FJKA 1BFBA 3KMVA 1YTOA 4P6AA 3RMXA 3Q7YA 4I6IA 2DREA 3V79C 2DRZA 1FMMS 3FJAA 4FGFA 1QQKA 6I1BA 3P6JA 4ISQA 3MPPG 4G6MA 3UJ4A 3RMYA 3OBRA 2KLLA 2QYIB 1HWMB 1Z2VA 1JLXA 2BEAA 4IONA 3O4CA 1AXMA 3AKGA 3UJ0A 5BOWA 4I4XA 3CRHA 3HALA 1EVTA 4YOLA 4ENDA 4IZXA 4ZOTA 1ABRB 3PUBA 4LO2C 3BRFA 2AQZA 1IHKA 1NUNA 4G1RA 4Z9WB 3O4DA 4A7YA 4JP0A 2BEBA 1ISYA 3V0BB 3O44A 1WD4A 31BIA 2M49A 21BIA 4IY9A 4ZKTB 3F1RA 1BLAA 1XZZA 3WO4A 1WD3A 1Z0HA 1BFGA 1Q1UA 1S0EA 1HIBA 3VSZA 5I1BA 1CVSA 3CU1B 3BX1C 4I8MA 4KBBA 3O4AA 3AJ5A 2NZ9A 5DSSB 4DENA 3BB2A 4JPZA 4GP0A 3OGGA 4L4IA 1DIWA 2ERMA 2D20A 1AVXB 9ILBA 4EEEB 1ITBA 4I7IA 5BP5A 3PHZA 3IM5A 4G9MA 3H6RB 3N7LA 2Y9FA 3NBDA 5D61A 1A8DA 1IRPA 3PMEA 1Q03A 1PZZA 2NM1A 1E0OA 1IJTA 3H6QA 4KEIA 4X37A 4OWKA 1ISWA 2E4MC 3Q7XA 3V0AB 2VXRA 1IRAX 4I4VA 1V6WA 3W9TA 1TOOA 4JAWA 3FJHA 5BXRA 3JRRA 2QN4A 3ZC9A 2R9KB 5BP5C 4IY8A 2VSEA 3FJIA 1TFMB 3N7KA 1QXMA 4QKRA 2Q9XA 2J3PA 4KC3A 3LLPA 1W3GA 3OBTA 1SR4C 4AN6A 5BVPI 4QD2B 3FJBA 41BIA 3HMYA 1G9CA 4HR6C 2GZBA 3AZVA 1AF9A 4AN7B 4EKXB 1HWOB 4ZA3B 4IQPA 2Y9WC 1UPSA 4X3AA 1OQLB 1F31A 4USPA 1PUUB 2FFVA 1ISVA 2AAIB 3AKFA 1JT7A 1T9FA 3Q7WA 4KEKA 4P0JA 1TWEA 3VT0A 4GAIA 1HKNA 4QKSA 3VT2A 1RY7A 4D8HA 3A23A 4IZEA 2XOAA 3I29B 2F8XC 3ZXGA 1FN0A 4LO3A 4A7KA 4LO2A 4X38A 3N0KA 1L2HA 4QO3A 1JT3A 3BAHA 1G9BA 2MC2A 4LO1A 3VWCA 4H9WA 4ZFWB 2X2TA 4XFUA 1HWPB 3OGFA 1J0SA 2HW9A 4DCKC 1WBAA 3LTQA 5DVHA 1T4QA 2D44A 4OUJA 1AFCA 4I4RA 3BA4A 5B2HA 1DFCA 4HJJA 1FMZA 3CA3A 2L5XA 3HSMA 4XFTA 2K4AB 4LO3C 4II0A 1DZDA 4R6UB 4GOVA 4LO7B 5EHAA 1XYFA 3O5WB 4LO1C 2NVHA 2P39A 4D0TA 5F8WA 1ISZA 4IHZA 4IYBA 3FGMA 1TWMA 5F8SA 4KEJA 1RG8A 3AH1A 4LO0A 1AVAC 1RZOB 1P63A 1TTUA 5BXTA 2X2SA 3N7JA 3N7MA 4OW4A 3FJ9A 1PWAA 3S8JA 1TP0A 4EFRA 3FUOA 3V0AA 2WRYA 2RG9B 4P0KA 2E4MA 1JY0A 1HWNB 2IWTB 5DZUA 1W3AA 1EV2A 1BASA 1BFCA 1Z4SA 1S0GA 4J2SA 1IT0A 1FGAA 3AKIA 3CA4A 4I3NA 2YUGA 5BXPA 4ZBVB 2GO2A 4I96A 4LO0C 2FGFA 3QR5A 2IHOA 3S8KA 3R4SA 2NYYA 2D24A 5JLVA 1SR4A 3CA5A 3CA6A 5EG6C 4JQ0A 3CA1A 4CJMA 1V6XA 4I4QA 5FZUA 5EC5A 3FJDA 1V6VA 4OEFA 3P6IA 2VLCA 1FV3A 4D0ZA 1ILR1 3UDAA 4A7ZA 3WINC 1NZKA 1DLLA 2D23A 2P23A 3IIRA 3UD9A 2UUSA 3H6SE 5FZYA 4PC4A 1M2TB 1PC8B 2Y9XE 1AVUA 3E8LC 4GOYA 4OWJA 5GAQA 3BRGC 1Q04A 2FFUA 4DEPA 2ESUA 5BXSA 3BAUA 4QD2C 1YF8B 1IILA 3WO2A 2MLLB 2D43A 4I37A 2DRYA 3B9UA 4JKXB 1BARA 1MC9A 4FVVA 3C9ZA 4I4SA 1BFFA 3O49A 4I1BA 5FNWA 4OEEA 4I4YA 2VXTI 3F62B 1ONKB 4JKQA 3AKHA 4G9NA 3VSFA 3POKA 4I2SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1G82A 3CU7A 4M4RA 3U10A 1UY2A 4LQRA 2ZZJA 3NKGA 4K9SA 1R8NA 1RJ8A 4WBCA 2E31A 2GNBA 3OTFA 2QVSB 5FZIA 3BADA 2CHHA 3FWEA 2O14A 3LWCA 4HANA 4OHXA 5F5AA 2Q8DA 4BIOA 3VKLA 2QFEA 3ZX7A 4QDQA 5BNNB 1IS4A 2X8KA 4LO7A 3LAGA 4JQTA 3AH2A 4PQ9A 1DQGA 1HB2A 1S2EA 3VBFB 1TNFA 3IM7A 1D2QA 2RM22 4RR3A 3RI8A 4AAXA 3RZMA 2RS33 5J7MA 5FPAA 4OI1A 4LO7C 3J4UH 5FY8A 1SDWA 4P0LA 4Q1RA 2NTDA 1QJU2 1HKDA 4EN6B 4Q9GA 3UYJA 5DZFA 4DQAA 1JZ6A 5DQ0A 4GMP0 5FK8A 3ME2A 3WG2A 3C8XA 3I2IA 3M3IA 4BJ0A 1W3FA 2B8MA 2DCYA 4MV2A 5FO9B 3IDAA 4SLIA 3E5UA 5JCTA 1OT5A 2C1FA 2W1WA 2WWSA 2Y8KA 4GAZA 2PA7A 1LOBA 1PIV1 1VALA 2VUDA 2VUJA 3GBFA 4JDOA 3AZWA 5A1FA 4A3XA 4QXHA 4DZGA 2ET2A 1S1AA 3WLUA 2XWBB 4YWAA 1L7QA 4YVSA 4UFKA 3NV2A 4XJZA 2WT0A 4RR3C 1R091 2Y0OA 3BI3A 4QGMA 3ILRA 3BOWA 2VJXA 4AG4A 2Q3NB 3M3EA 4H04A 1AR81 1LHNA 2BDRA 5F37A 4RYDA 3S7EA 1QNWA 3VKNA 3VUOA 2VQUA 2OUJA 1NUKA 1W8WA 4QGNA 5JPMB 4CEYB 1GZCA 1RUC1 4QBCA 4HETA 5JI9A 1VCLA 1HN1A 3WUCA 3X29B 5CAZA 1CQ9A 3RSJA 5DAPA 2F17A 3ZLIA 4LA3A 4K7JA 2SBAA 2MNGA 3TN91 1G9AA 2F2FC 2Q4SA 4JAAA 4ZS3A 5FZ9A 1HN0A 4FBFA 1LKNA 3WEZA 2K46A 3T1LA 4YPJA 4OVEA 2D93A 4OCTA 3OJVA 1LRHA 1G9DA 4CP9B 3KF3A 1I1BA 2JG8A 3K1XA 1PMJX 4RQPB 2Y0IA 2HWC1 3HOBA 4AHWA 4YM1A 4GQ7A 2BBVA 2Z48A 2OUHA 3GDBA 3B69A 4E4ZA 1OF4A 1JHNA 3S57A 1PZ9A 1BEV1 1J1LA 1U0AA 4Z82A 1MS1A 2VOWA 2WN2A 4FPGA 2R6QA 4LHKA 3WHUA 2B45X 5DAVA 2XLGA 1A3KA 3KV9A 4Q0VA 5BV6A 2XDVA 3FBYA 3J8F1 3ZFEA 1LAJA 4TLPA 3LEGA 4E4DX 5A1AA 1SLCA 2Y34A 4I0BA 4BYYA 3SKJE 2JICA 5C9AA 3AKSA 2ADDA 3MV11 4KNCA 3I7DA 4D3WA 4NR1A 3UJOA 4GAFA 2FZ2A 2Z49A 3BRDA 5EZWA 4ZFYB 3T08A 1DLCA 1UY0A 1FI2A 1RUF3 2K8RA 3AL5A 1O4TA 2BBAA 1W6PB 3OPTA 4U2AA 2W0XA 1COV3 4K21A 5DUUA 4OI0A 5BQUA 2W94A 1S0JA 3SITA 5A6ZA 4XZPA 3MALA 3K4ZA 1EUUA 3KCXA 4YNIA 3KWVA 4OI4A 5BNQA 4LULA 2EAKA 1I1EA 4J2KA 2OZ6A 1GGPB 4QALA 4A41A 2BRTA 3VEQA 3ACHA 1RUG1 1YI7A 3DECA 3ETQA 4TN7A 3ZFEC 1II4A 4XAEA 4CVUA 4OEGA 5FZZA 3NKTA 4XF9A 2WA4A 3LA3A 2DVBA 1PUMB 3MV01 1BLDA 4I0AA 3ELNA 2R30A 1ZZCA 2YXSA 4O61A 1LJ7A 1JHJA 4S2GA 4TSVA 3O4OA 1ZRCA 4WVWA 1DZQA 1F5FA 1PO12 5HCHA 1IOBA 4I0YA 3UD7A 2DCJA 2MHFA 2VZSA 1N4KA 1WCQA 1EAH1 3NMBA 5BQUC 1BQPA 3B93A 1W2AX 4IUGA 4LBKA 3MIFA 4CUBA 1EV13 4LO5B 4J25A 2EIBA 3ZN6B 1YQCA 5DDJ2 1DQOA 3VBOC 1LTEA 4XETA 1W9YA 1C8M1 2JIGA 2R062 3FLRA 3VBOB 3WVJA 4CCNA 4R8HA 3AH4A 3OEBA 2WFF1 2XOMA 4S2FA 1MD6A 3NBEA 2VU9A 3OUIA 1VBD2 4MGTA 1I9RA 4FO9A 1Q8QA 2W2IA 4F83A 1RUI3 3MUZ1 2W9XA 4MZUA 1ACCA 5FNXA 5FZMA 3I2HA 1ISXA 5BNPA 4HPKA 1MQTC 3WOGA 3RZZA 1DZCA 3AKRA 4YW7A 1PM4A 1QJY1 3U78A 3H42B 2X5IC 3NWKA 5CKNA 2MIBA 1DDLA 1TG7A 2DVFA 2X5IB 3UD8A 2D1ZA 4CDXA 3OGJA 5IK4A 5BPXA 4Q27A 3SEEA 2RQ9A 3OJMA 3IDCB 1WLWA 2PN5A 5F2WA 4DUVA 3VD9A 4J2XA 3IKWA 2HWD2 1LR5A 4AFDA 1JU4A 5D62A 2Z69A 1WCDJ 3WDTA 5A3PA 4XBNA 2FCVA 4XCAA 1RMU2 1UO9A 3O0WA 1SCSA 2CDOA 3INAA 2R32A 2ZMNA 2IXHA 3WQBA 2GC1A 3Q7YA 1E57A 1V6NA 1SPPB 2J1RA 2ZX3A 2JKXA 3H1WA 5BNPC 1STMA 1URXA 1C1FA 1NXMA 1MS0A 2WZR1 2XJQA 5T50A 4PF1A 1MS8A 3WR0A 3ZFFA 3KVBA 3WDVA 5FUNA 4EJRA 5FY7A 4KMQA 1J58A 3SEPA 1OVSA 1AJOA 1LECA 4MGKE 4CDXC 1O4ZA 1UYYA 2W39A 3F2ZA 3OUJA 4O9EA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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