4A7YA

Active site metal depleted aldos-2-ulose dehydratase
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
886
structure length
880
Chain Sequence
QPAALPLFQPQLVQGGRPDGYWVEAFPFRSDSSKCPNIIGYGLGTYDMKSDIQMLVNPYATTNNQSSSWTPVPLAKLDFPVAMHYADITKNGFNDVIITDQYGSSMDDIWAYGGRVSWLENPGELRDNWTMRTIGHSPGMHRLKAGHFTRTDRVQVVAVPIVVASSDLTTPADVIIFTAPDDPRSEQLWQRDVVGTRHLVHEVAIVPAAETDGEMRFDQIILAGRDGVDCLWYDGARWQRHLVGTGLPEERGDPYWGAGSAAVGRVGDDYAGYICSAEAFHGNTVSVYTKPAGSPTGIVRAEWTRHVLDVFGPLNGKHTGSIHQVVCADIDGDGEDEFLVAMMGADPPDFQRTGVWCYKLVDRTNMKFSKTKVSSVSAGRIATANFHSQGSEVDIATISYSVPGYFESPNPSINVFLSTGILAERLDEEVMLRVVRAGSTRFKTEMEFLDVAGKKLTLVVLPPFARLDVERNVSGVKVMAGTVCWADENGKHERVPATRPFGCESMIVSADYLESGEEGAILVLYKPSSTSGRPPFRSMDELVAHNLFPAYVPDSVRAMKFPWVRCADRPWAHGRFKDLDFFNLIGFHVNFADDSAAVLAHVQLWTAGIGVSAGFHNHVEASFCEIHACIANGTGRGGMRWATVPDANFNPDSPNLEDTELIVVPDMHEHGPLWRTRPDGHPLLRMNDTIDYPWHAWLAGAGNPSPQAFDVWVAFEFPGFETFSTPPPPRVLEPGRYAIRFGDPHQTASLALQKNDATDGTPVLALLDLDGGPSPQAWNISHVPGTDMYEIAHAKTGSLVCARWPPVKNQRVAGTHSPAAMGLTSRWAVTKNTKGQITFRLPEAPDHGPLFLSVSAIDAIPVIVQGDSIELSAWSLVPAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Lyase
molecule keywords ALDOS-2-ULOSE DEHYDRATASE
publication title Crystal Structure of Bifunctional Aldos-2-Ulose Dehydratase/Isomerase from Phanerochaete Chrysosporium with the Reaction Intermediate Ascopyrone M.
pubmed doi rcsb
source organism Phanerochaete chrysosporium
total genus 196
structure length 880
sequence length 886
ec nomenclature ec 4.2.1.110: Aldos-2-ulose dehydratase.
pdb deposition date 2011-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18056 PBP3 Penicillin Binding Protein 3 Domain
A PF18637 AUDH_Cupin Aldos-2-ulose dehydratase/isomerase (AUDH) Cupin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.990 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4a7yA02
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4a7yA03
3A21A 4ISRA 2R9KB 1Z2VA 2NZ9A 2K8RA 3N7MA 5FNWA 4EKXB 4USOA 4IQPA 3R4SA 5JMCA 1J0SA 1TWMA 4I7IA 4KEJA 1PWAA 1M16A 3FGMA 3O49A 5DVHA 1ITBA 1II4A 4J2XA 1ISXA 4JP0A 2Z49A 3OJVA 1DFCA 3N7JA 4D0ZA 1BFBA 2D7RA 2FFVA 3OBRA 3AJ6A 4EB2B 4A7KA 1Z0HA 2Y9WC 1FV3A 5DUYA 1NUNA 3FJCA 1T4QA 2VXRA 4LO2A 3CRHA 2WBCA 2DRYA 1V6UA 3CQAA 4I6IA 1Q1UA 1A8DA 3FJ9A 4LO7C 3AH1A 1ISZA 1IT0A 3BRDA 4QBCA 5JLVA 1AVXB 1TP0A 2E4MC 1AXMA 4EFPA 4USPA 4I96A 4Z8SB 3FFZA 4AN7B 4QKRA 5FNXA 3ILAA 4EFRA 4LO7B 1S0LA 1K5UA 1S0CA 4I8MA 2MIBA 4IYBA 4ZFYB 2P23A 4ZBVB 4KBBA 3RMXA 3NBEA 3O4AA 3H6SE 3PG0A 4JKQA 1PZZA 5BP5C 3C9ZA 5GAQA 3N0KA 1G9BA 4HA2A 2RSTA 1MD6A 1WD4A 2K43A 5F8WA 3T8SA 3FJBA 3O4BA 4WBCA 3CA4A 4L4IA 5HPZA 4OEFA 4P0JA 3IM6A 1JQZA 5BQUA 4LO0C 4XFTA 1JT3A 3AKIA 3B9UA 3VWCA 1T9FA 1XHBA 3WO4A 3AJ5A 4X3AA 2Z48A 3O4OA 3E8LC 4F83A 4A7ZA 3MALA 1L2HA 1BARA 2LIEA 3AKGA 2D1ZA 3FJJA 3V0BA 1PUMB 3PUBA 4G9MA 4J23B 3BAUA 3P6IA 5D62A 3BA4A 1IRAX 3FJAA 3ZC9A 3BRFA 3FJHA 2HWAA 4I4UA 2KI6B 4JKXB 3BAHA 1Q04A 1CE7B 1QXMA 1Q03A 1WD3A 2BEAA 3BTAA 4ISQA 3H6RA 1IRPA 3FJEA 3PHZA 2NYYA 3JRRA 2FDBM 1HWNB 3CRIA 1BA7A 1ISWA 2GZBA 4JAWA 1FV2A 3IM5A 3V0AA 2GO2A 3O5WB 1DQGA 2HWMA 4ENDA 4LO2C 6I1BA 4G6JA 4IY9A 3N7KA 2IHOA 4G6MA 2VSAA 3I2XA 1OQLB 3WMVA 3S8JA 3OGFA 1R8OA 3FUQA 3CA3A 2BFHA 2X2TA 4PC4A 3BA5A 3A23A 1BFFA 3R4UA 4XFUA 3HMYA 4QO3A 4I1BA 3LTQA 5I1BA 2KKIA 2NM1A 4FVVA 3BAGA 4II0A 2RG9B 3QYDA 2ZR1B 4J2SA 1ILR1 3Q7YA 1DZDA 3ZC8A 1IJTA 3AZWA 3HALA 4I4VA 2Y9FA 1FN0A 3OJ2A 3WA1A 1BLAA 2X2SA 3CA5A 3QR5A 1Z4SA 4YOLA 1WBAA 3BAQA 4GAFA 1ISYA 3RTJB 2FFUA 2FO1A 3UJ4A 1DLLA 4IZXA 1F31A 3ZX7A 5BQUC 1BFGA 2DRZA 1FQ9A 2D44A 4I4QA 1PC8B 1HCEA 3CA1A 5D63A 9ILBA 2WRYA 3RSJA 3VT2A 2D7IA 2KI4A 4I4XA 1HWOB 1FWVA 4DEPA 3P53A 4I4YA 2AQZA 5F8YA 1AVUA 4HJJA 3A07A 3FUOA 2ERMA 3OGGA 4R6UB 4I4SA 2D43A 2MC2A 1EPWA 1JT5A 4EEEB 3NBNA 3HOMA 1DQOA 3A22A 3CRGA 1I1EA 4G9NA 1ONKB 2VU9A 3NBCA 4FGFA 3AKFA 3W9TA 4Q9PA 1JY0A 1AVAC 3N7LA 3V0BB 2QN4A 1V6XA 4LO1A 3AKHA 3CA0A 3WO2A 2QYIB 2F2FA 4GP3A 5DZUA 2RQ9A 1RY7A 1I1BA 4H04A 4J2KA 1IOBA 4LO3A 3VEQA 2F8XC 3FJFA 1JT4A 1BASA 3FJIA 3BAOA 4OWKA 5FZUA 4DCKC 1FWUA 2ET2A 1FGAA 3OJMA 4G1RA 3VT1A 3JUTA 1S0GA 1G82A 3KMVA 2LIQA 1DFQA 3AH2A 4OW4A 3UD7A 8I1BA 3V0AB 1BLDA 4QKSA 4ZOTA 4I4RA 5EC5A 2AFGA 3CAHA 1W3AA 1HKNA 4GOVA 1JLXA 1S0FA 3CU1B 5BXRA 4XKIA 2ZQNA 3VSFA 4J2YA 3LLPA 2Y9XE 3D7WB 5F90A 4OWLA 4GOYA 2NP0A 4Q91A 4F34A 3H6QA 3V79C 4I1EA 4A7YA 2D20A 4JRAA 4X38A 4KEIA 4JQ0A 2J3PA 4L4HA 1W3GA 1P63A 2HZ9A 1ISVA 3O4CA 4QC4A 5G00A 1SZ6B 1S0EA 1MC9A 4ZA3B 1G9CA 1XYFA 1TTUA 5FZZA 2XOAA 1TFMB 3Q7XA 4ZFUB 7I1BA 1JTCA 2BEBA 3NBDA 2DS0A 1RG8A 2P39A 3WINA 4KEKA 5BVPI 3RTIB 3BX1C 2Q3NB 1EYLA 5FZYA 1SR4A 3UJ0A 1HWPB 4P6AA 1QQKA 3BADA 2YUGA 1JLYA 2KLLA 3UD9A 1HIBA 3SNVA 4I4PA 2VUAA 3P6JA 3TC2A 1HWMB 31BIA 4OUJA 5EG6C 1D0HA 3O44A 1S0DA 4ZLBB 1V6WA 3IAGC 2KH2A 3ZXDA 2NVHA 3BRGC 3NJ5A 4I2SA 1JT7A 1G9DA 2Q9XA 1EVTA 5EHAA 3FJKA 3VSZA 3HBWA 3AH4A 4XFSA 1YF8B 3BA7A 3Q7WA 4I0YA 3CA6A 1TWEA 2VSEA 4LO8B 4LO1C 3BAVA 1NZKA 1YBIA 2IWTB 4X37A 2F2FC 5D61A 1PUUB 4IONA 1DJSB 4OEGA 4ZGRB 4I3NA 2HW9A 4LO3C 3ZXGA 4P0KA 3MPPG 1CVSA 3O3QA 4Q9GA 1FMZA 1AF9A 21BIA 1XG6A 4Z9WB 4DENA 3K1XA 1HCDA 1YYNA 4OEEA 4EFQA 4ZKTB 2VXTI 5B2HA 1UPSA 4QD2C 2MLLB 3F62B 3I2AA 4I4OA 1AVWB 1KNMA 1N4KA 3S8KA 2E4MA 1E0OA 4HR6C 1K5VA 2VLCA 2ZQOA 4IY8A 3H6RB 3UD8A 2M49A 1RZOB 3O4DA 4JPZA 1XZZA 2D22A 3VUOA 1AFCA 2ESUA 1ABRB 4H9WA 4QD2B 2D24A 3BB2A 4IHZA 4OWJA 1DIWA 1S0BA 5DSSB 1IHKA 4TLPA 1R8NA 5BOWA 2AXMA 1TOOA 4IZEA 1WBCA 4GP0A 5BP5A 5F8SA 5BXPA 2L5XA 2K4AB 4GAIA 3WMUA 3AZVA 3I29B 4CJMA 2I1BA 1DZCA 4QBVA 4P0LA 1VCLA 1RMLA 2DREA 1YXWA 4I37A 1BFCA 4X39A 1G9AA 1TIEA 3EF2A 41BIA 5E24E 4AN6A 3WINC 3IM7A 3RMYA 5BXTA 1W3FA 1SR4C 2Y9GA 3WO3A 1YTOA 2UUSA 1V6VA 2FGFA 3POKA 4QALA 4D0TA 4D8HA 1IILA 3HN1A 3VT0A 1QQLA 4LO0A 1GGPB 3HSMA 3PMEA 2AAIB 3F1RA 4ZFWB 3OBTA 1EV2A 3FJ8A 3FJDA 3IIRA 3UDAA 5BXSA 2NTDA 4KC3A 2D23A 1M2TB 1FMMS
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Q5TA 3ZOIA 4QX1A 1GBGA 1XSQA 1CQ9A 1X7NA 1VBC3 2UU8A 1E5SA 2E32A 2IC1A 2JE9A 4ISRA 2DCZA 4XQDA 4XMIA 1LOGA 5E88A 2TBVA 5I93A 1HN1A 2P37A 2TEPA 3PVEA 2YXSA 4EKXB 3KCYA 4XC9A 1UMHA 3E6BA 3AJYA 2P3KA 5CIRA 1HX6A 4Q4W2 3OUIA 1O59A 2WWUA 3AX4A 5A7NA 1JHNA 4HG6B 3IDEA 5JR2A 4TWTA 1LHWA 1VE0A 3ORJA 1JH5A 5JOXA 3FGMA 1Q8PA 3NMBA 2WKKA 2F6BA 4AHWA 4P08A 4BQ3A 2VR4A 1ISXA 2Z49A 1PK6C 4LKDA 4S2FA 4XPVA 4J2XA 2PXJA 2W95A 3ZXLA 1BYHA 2Z4FA 4WVMB 1RUG1 4N43B 1MVEA 1WCKA 1AYN2 2CSGA 2EXKA 3OSDA 2BGCA 1VAVA 2FFVA 2DBIA 3LWCA 5FOJB 1W06A 4ONUA 3CF6E 3OBRA 4QB6A 1UOJA 1H0BA 4P14A 1QNWA 2I07B 1OLMA 3I8TA 1OVPA 3UYJA 3ZIXA 2K2SA 4C0BA 3ITQA 2WZ8A 3N9LA 2P5BA 2WLQA 4NUBA 4RR3B 2Y9WC 1BMV1 3WZ1A 2P4EA 3NV3A 1ZREA 3FJCA 1T4QA 2B8MA 1R082 2H0VA 3LIHA 4LO2A 2PN5A 5CVRA 4DMIA 1F35A 4HKLA 2WBCA 1UNBA 4QPGB 3SNMA 1V6UA 5D8AA 5FMOL 3HVDA 3MW4A 5IJRA 1B09A 1ULEA 1ND3A 2A6VA 2C6SA 5DQ0A 3VD3A 4FPEA 5GZEA 1XU2A 1BFBA 4XTMA 2DU1A 1REEA 2WNVC 2Z79A 1LOFA 1GANA 1LCLA 1SACA 2V09A 4CU6A 5C4WC 1H4GA 1TP0A 2ET1A 4Y26A 1UZYA 2J42A 4YW7A 3ZYHA 3AP5A 4XDPA 3SCHA 5FK7A 5FZ8A 2NPIA 1Z7S1 3R05A 4JDNA 3LDKA 1NA1A 1QJU2 3K48A 4XCBA 3KB5A 2D5HA 4P5HA 5F2SA 3FFZA 3NQHA 4EFRA 2IXCA 4Q0UA 2PMWB 1YNAA 2HYXA 3D8CA 4AFDA 1S0LA 2I45A 1NCRC 1RUC3 1W28A 1V00A 2MIBA 2R32A 2VY0A 2P23A 1YJKA 4CDXA 2JD9A 1ULGA 2K46A 3QCWA 1ZVFA 1ST8A 3D0SA 3NV1A 4YVWC 4LT5A 3PG0A 1QIQA 5GAQA 1JOBA 2VVDA 3JUUA 3UETA 2A75A 1HXS3 2RSTA 5FJKA 4KG0A 2AYHA 2CY6A 2PQSA 5A3PA 2K43A 2HBTA 4K3UA 4SBVA 4LKEA 5FLIA 1OUSA 2DFCA 3AMPA 5FZHA 3RRDA 3ZYGA 4BQ1A 1FXZA 4FXGB 2YBSA 3LSEA 4QPIA 4QGNA 4FPFA 5CFCC 2JDUA 4WBCA 2E9QA 5D2AA 3KD4A 3AKRA 4W65A 4CDQA 3IDCB 2DVFA 1HRI1 4L4IA 5I0UA 5HPZA 1W9SA 3IB3A 2R1DA 5C8CC 5IFPA 1FMD1 4OEFA 4P0JA 3IM6A 3U0ZA 4TZDA 4TTGA 5BUVA 5JXIA 5DABA 4U36A 3VBOA 1H2LA 4H75A 1S2EA 3AKSA 2VUJA 4QXHA 2XWJB 4XQWA 2PELA 4Q1PA 5BV6A 2YHJA 3AJ5A 4FOVA 4D0QA 2AEZA 4IEPA 4MUVA 4GD4A 1QQP1 3OEAA 4Q2FA 2ZX1A 2EIDA 5FPLA 3VGIA 3RG0A 2Q1MA 1SQ4A 4Y1UA 3OJVA 1X36A 1O4YA 4OYUA 2YC4A 1L2HA 4U2AA 1JYNA 5FZGA 2D1ZA 3FJJA 4Y1VA 4COUA 2JX9A 3OB8A 4Q4X3 2E53A 4IV3C 4YFZA 4G9MA 3BAUA 1NQDA 4DUWA 3AMQA 1RUC2 5D62A 4LOSA 2WFF3 4BZ4A 4CDUA 4P02B 3MDPA 1OH3A 3MFCA 3WLUA 2V72A 1V6MA 3BAHA 4LOTA 3E97A 3UKNA 4D8MA 5IATA 1BBT1 3GM8A 5EWSA 3CZUA 3TYJA 3PHZA 3RZGA 1COV2 1UOBA 5I8YA 4ASMB 1HXS2 4KQ7A 5DXDA 3F2ZA 5I0DA 2DUOA 2D5FA 3JRRA 1BK1A 4NHXA 1HWNB 3AL5A 4KL1A 4HANA 5HCFA 4OVEA 1R1ZA 5T55A 2FDBM 3E5XA 2ES3A 3AB0A 3CRIA 4IUGA 4QHBA 3LEGA 5C3QA 4HKOA 3ZFEC 1ISWA 1FV2A 1TZOA 3V0AA 3I2HA 1WBFA 4UF0A 3K46A 6I1BA 4JQRA 4IV1B 4LE3A 3ZXAC 4KBZA 3KS7A 2VSAA 1C8M2 5FWJA 1WGPA 4LTAA 1PO22 3BN6A 3H0OA 4B1MA 2TNFA 3WMVA 3LD8A 3ZSMA 1JYIA 4V1PA 2ZGNA 1R8OA 3FUQA 2JDNA 1H9WA 2VNOA 5M0TA 1TG7A 2C24A 4MXWB 4ATEA 1GWMA 2B9VA 5ACA1 2X2TA 1C3HA 2EAKA 3KMHA 4CA9A 4IE0A 1YQ2A 2WS92 1IKQA 3R0RA 2XVKA 3HMYA 1I5PA 2ARBA 2HYKA 4CCKA 5GZFA 2P34A 1VBB2 2D6KA 5FY8A 1FMD2 1QEXA 2BVVA 2VOTA 1GKBA 3OGJA 4R52A 5FQ0B 3TEZA 4OCTA 5FZ0A 1DGRA 3M8LA 2VZ1A 4YGEA 4A45A 2W91A 4D94A 4BWOA 2IVJA 5LK7B 3JQXA 1RHI3 4RS5A 1EV12 3PURA 5FRAA 2JICA 1MS5A 1U5XA 4META 3HALA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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