4A7ZA

Complex of bifunctional aldos-2-ulose dehydratase with the reaction intermediate ascopyrone m
Total Genus 200
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
200
sequence length
887
structure length
881
Chain Sequence
EQPAALPLFQPQLVQGGRPDGYWVEAFPFRSDSSKCPNIIGYGLGTYDMKSDIQMLVNPYATTNNQSSSWTPVPLAKLDFPVAMHYADITKNGFNDVIITDQYGSSMDDIWAYGGRVSWLENPGELRDNWTMRTIGHSPGMHRLKAGHFTRTDRVQVVAVPIVVASSDLTTPADVIIFTAPDDPRSEQLWQRDVVGTRHLVHEVAIVPAAETDGEMRFDQIILAGRDGVDCLWYDGARWQRHLVGTGLPEERGDPYWGAGSAAVGRVGDDYAGYICSAEAFHGNTVSVYTKPAGSPTGIVRAEWTRHVLDVFGPLNGKHTGSIHQVVCADIDGDGEDEFLVAMMGADPPDFQRTGVWCYKLVDRTNMKFSKTKVSSVSAGRIATANFHSQGSEVDIATISYSVPGYFESPNPSINVFLSTGILAERLDEEVMLRVVRAGSTRFKTEMEFLDVAGKKLTLVVLPPFARLDVERNVSGVKVMAGTVCWADENGKHERVPATRPFGCESMIVSADYLESGEEGAILVLYKPSSTSGRPPFRSMDELVAHNLFPAYVPDSVRAMKFPWVRCADRPWAHGRFKDLDFFNLIGFHVNFADDSAAVLAHVQLWTAGIGVSAGFHNHVEASFCEIHACIANGTGRGGMRWATVPDANFNPDSPNLEDTELIVVPDMHEHGPLWRTRPDGHPLLRMNDTIDYPWHAWLAGAGNPSPQAFDVWVAFEFPGFETFSTPPPPRVLEPGRYAIRFGDPHQTASLALQKNDATDGTPVLALLDLDGGPSPQAWNISHVPGTDMYEIAHAKTGSLVCARWPPVKNQRVAGTHSPAAMGLTSRWAVTKNTKGQITFRLPEAPDHGPLFLSVSAIDAIPVIVQGDSIELSAWSLVPAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of Bifunctional Aldos-2-Ulose Dehydratase/Isomerase from Phanerochaete Chrysosporium with the Reaction Intermediate Ascopyrone M.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Phanerochaete chrysosporium
molecule keywords ALDOS-2-ULOSE DEHYDRATASE
total genus 200
structure length 881
sequence length 887
ec nomenclature ec 4.2.1.110: Aldos-2-ulose dehydratase.
pdb deposition date 2011-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18056 PBP3 Penicillin Binding Protein 3 Domain
A PF18637 AUDH_Cupin Aldos-2-ulose dehydratase/isomerase (AUDH) Cupin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.990 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4a7zA02
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4a7zA03
2HWAA 4DENA 4LO7B 5BVPI 1V6VA 2ZQNA 1FN0A 1HIBA 3OGFA 3VT0A 5BQUA 4ZFUB 3AJ5A 4JPZA 3O5WB 5F8WA 3H6QA 2ESUA 1G9CA 1D0HA 1XHBA 4EKXB 4P6AA 3UD8A 3Q7YA 3H6RB 1JLYA 1JQZA 3OGGA 3I2XA 4IZXA 2FO1A 3BAGA 4OWLA 5BXRA 2DRZA 1DFQA 1WD4A 1Z0HA 3S8JA 1IILA 4GOYA 5BOWA 4ISRA 1BA7A 3WMVA 2L5XA 2ERMA 2Y9XE 2DS0A 2VUAA 1CE7B 4F83A 4GP3A 4X3AA 2HW9A 1W3FA 5GAQA 1G9DA 3UD7A 1AF9A 1II4A 1ISZA 1DZDA 2MIBA 1YYNA 1R8NA 3BA7A 4P0LA 2AAIB 4G6JA 3FJDA 2BEAA 4XFSA 3V0AA 3IM6A 4Z8SB 3O4OA 3SNVA 3V0BA 3ZXDA 3EF2A 2D24A 2K8RA 3OBTA 1G9BA 1IRPA 1IHKA 4I2SA 2J3PA 1ONKB 3ZX7A 1FWVA 3UJ0A 1FV2A 2D22A 3FGMA 3KMVA 4Q9GA 1GGPB 2QN4A 4I1BA 4H04A 3BRGC 1G9AA 1OQLB 3E8LC 1TP0A 2UUSA 2RQ9A 3BAVA 1ABRB 2K43A 4I8MA 1TOOA 5G00A 2RSTA 3TC2A 1W3GA 3CRIA 3C9ZA 5BP5A 4XKIA 1DZCA 5F8YA 3O44A 3IAGC 2LIQA 1DLLA 2D23A 3VSFA 2KKIA 1TIEA 3LLPA 3CA0A 5DZUA 4LO7C 3WINC 1DJSB 3ZC8A 3BRDA 3AH1A 1EV2A 5DVHA 4G9MA 1JLXA 3FJFA 1DIWA 1IJTA 3H6SE 1JY0A 4LO0A 1S0FA 4FGFA 1EPWA 2HZ9A 4HJJA 4QBVA 3FJAA 3BAOA 3NBEA 3CA3A 4I4RA 4OWKA 1BFBA 4KEKA 4YOLA 5D62A 2BEBA 5D63A 2AFGA 3O49A 1TWMA 4USPA 4DCKC 1G82A 3FUQA 2D43A 3HN1A 3OBRA 1W3AA 1MC9A 3WMUA 1TFMB 3BB2A 4J2YA 5FNWA 1MD6A 4LO2C 3A22A 2P23A 1BASA 2GZBA 3BTAA 3P6JA 4A7YA 1AVWB 3N7KA 3HBWA 4XFTA 5EC5A 1NUNA 1N4KA 3N0KA 1E0OA 1WD3A 3BAHA 3P6IA 4LO2A 8I1BA 4IHZA 1HWMB 2Z48A 2NYYA 2FGFA 3POKA 4OUJA 4G1RA 9ILBA 3CRHA 2GO2A 3CU1B 4GAFA 4I4QA 4LO1C 3NBCA 3FJJA 4I4XA 1V6WA 3CAHA 3HOMA 1FQ9A 1YF8B 4ENDA 3BX1C 1VCLA 3PMEA 3LTQA 3N7MA 4J2SA 5DSSB 5DUYA 4EFPA 1ISVA 3FJ8A 3CA6A 5HPZA 2AXMA 2VLCA 3UDAA 1S0BA 3JUTA 4TLPA 5F8SA 1IRAX 3FJHA 4HA2A 4OEFA 2KLLA 4Q9PA 4P0JA 7I1BA 1ISWA 3ILAA 1DQGA 1BARA 4I4SA 3T8SA 41BIA 1RG8A 1P63A 4I4YA 3OJVA 1FGAA 2NTDA 2K4AB 4XFUA 3WO2A 3WO3A 2X2SA 4J2KA 3NBDA 3HMYA 1KNMA 1XZZA 4GAIA 3RTJB 3W9TA 5EHAA 1JTCA 1BFCA 1HWOB 3O4AA 1AVUA 4P0KA 3F62B 2HWMA 5BXTA 4ZKTB 3AKFA 1TWEA 1ISXA 3P53A 3O4DA 2KH2A 1JT4A 4X38A 5D61A 3UJ4A 3FJBA 2ZQOA 3V79C 2D1ZA 6I1BA 4A7ZA 1JT3A 1I1EA 1CVSA 4IY8A 3AJ6A 2BFHA 4F34A 4QC4A 4ZA3B 4L4IA 1XG6A 3OJMA 1HWNB 2X2TA 4QKSA 5I1BA 1S0EA 1YBIA 4I37A 2RG9B 4QALA 4A7KA 4D0TA 4GOVA 31BIA 1FMZA 3IM7A 1Z2VA 4I3NA 4Z9WB 4OEEA 3FUOA 4G6MA 4QBCA 5JMCA 3VT2A 3BAQA 1QQKA 2M49A 3A21A 2DREA 3V0AB 3ZC9A 4QD2B 4ZFYB 1T9FA 4OW4A 3O4BA 3WINA 3V0BB 4CJMA 3A07A 3WO4A 3MALA 2P39A 4QKRA 1PWAA 3AKGA 3QYDA 1V6XA 3CRGA 2FFVA 3PG0A 2Y9WC 3RTIB 1ISYA 1RZOB 1UPSA 1ITBA 1BFFA 1ILR1 1YXWA 3H6RA 5E24E 4R6UB 4IZEA 4J2XA 1BFGA 4G9NA 1Q03A 1EVTA 4JKXB 2D7IA 3CQAA 3BRFA 2DRYA 3A23A 2NM1A 1I1BA 4IQPA 3IM5A 4EEEB 2R9KB 1S0CA 1A8DA 3F1RA 1JT5A 4FVVA 1RY7A 2XOAA 1Q04A 1QQLA 1Z4SA 4ZBVB 3FJ9A 1Q1UA 21BIA 3S8KA 3RSJA 1EYLA 4KBBA 3UD9A 3AZVA 2VU9A 1SR4C 4LO1A 2Z49A 3O3QA 1IOBA 2Q3NB 3PHZA 1RMLA 3AH4A 1M2TB 4KC3A 4OWJA 3HALA 5FZYA 3I2AA 2NP0A 1IT0A 1SR4A 1SZ6B 5FNXA 4JP0A 3BADA 3AKIA 4H9WA 3JRRA 4D8HA 4DEPA 4ZFWB 3BA4A 1V6UA 1PUUB 3N7LA 2YUGA 4I6IA 5FZZA 3R4SA 4ISQA 2WRYA 4AN6A 4KEJA 4EFQA 2QYIB 3CA5A 2MC2A 3VEQA 3CA1A 4USOA 1DQOA 4IONA 2WBCA 4X37A 3NJ5A 3WA1A 2KI6B 4X39A 4I7IA 1HWPB 3RMYA 3FJCA 1BLAA 2ET2A 1S0LA 4EFRA 5EG6C 4QD2C 1S0GA 3I29B 4IYBA 3BA5A 1L2HA 4ZGRB 1R8OA 2F2FC 3PUBA 1T4QA 3VT1A 2Q9XA 3FJIA 1YTOA 1WBAA 1K5VA 3D7WB 4EB2B 2VSAA 5BXSA 1F31A 3FJEA 4QO3A 3FFZA 4I0YA 4II0A 2F2FA 2I1BA 2VSEA 4I4VA 3AH2A 3OJ2A 4AN7B 2Y9FA 2LIEA 1M16A 2KI4A 3AKHA 1PUMB 4Q91A 2VXRA 1HCDA 4D0ZA 2NVHA 3VWCA 1K5UA 5BP5C 3O4CA 4JQ0A 1AXMA 3NBNA 1FWUA 1PZZA 3R4UA 4J23B 4ZOTA 5BXPA 1J0SA 3HSMA 1NZKA 3IIRA 1HKNA 3Q7WA 1DFCA 3QR5A 3ZXGA 4I4PA 3AZWA 1TTUA 4I96A 1FV3A 3RMXA 2VXTI 3B9UA 4LO0C 4JKQA 1AVAC 2FFUA 1BLDA 1JT7A 4L4HA 2IWTB 5JLVA 2F8XC 4JRAA 3K1XA 3FJKA 1HCEA 2AQZA 4LO3C 2FDBM 4GP0A 1FMMS 2ZR1B 3Q7XA 4I1EA 2IHOA 5B2HA 3CA4A 4LO8B 4PC4A 4KEIA 2E4MC 4JAWA 4I4OA 1PC8B 2Y9GA 2D7RA 4LO3A 3VUOA 1S0DA 2NZ9A 1AFCA 1AVXB 4OEGA 4IY9A 2MLLB 4HR6C 1XYFA 2E4MA 2D20A 4WBCA 3VSZA 2D44A 3MPPG 3BAUA 3N7JA 4ZLBB 5BQUC 5FZUA 4I4UA 5F90A 1WBCA 1QXMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O8QA 4DENA 4UBGA 1BVVA 3GXUA 3POFA 3RYKA 5A7PA 4QB6A 1FN0A 1HIBA 2N7GA 4GWMA 5DQ0A 2XJRA 2PLV3 4HLTA 4YPJA 3KCCA 5BQUA 4IEOA 1X36A 4E4HA 3PIGA 4OVEA 4GQ7A 4XDQA 2MNGA 1W2AX 2C0ZA 3OUIA 3I49A 4R9CA 4B1LA 5C9AA 5FBJA 4M0NA 1D0HA 2JIJA 4CYDA 2L9LA 2Q8EA 4IEQA 3B00A 1XHBA 4EKXB 5FZ1A 1IS6A 2WC2A 3O1UA 1RUF2 2WO3A 4DINB 4IZXA 1GNHA 3OGGA 3TBDA 4OWLA 4YWAA 1SFYA 3JCIA 1QJX2 5BXRA 1HLCA 1SLCA 2RS33 5I0UA 3WDVA 5IK4A 2DRZA 4BM8A 3S8JA 4GOYA 1HIXA 2PHLA 2CGOA 5L9BA 2HWB2 2VNVA 4IE0A 2R32A 3MUZ1 1RUE2 3ZXJA 2Y9XE 1QJEA 1BK1A 3O12A 3QLQA 4N43A 2V4VA 4X3AA 1JYWA 2Y8KA 4XPVA 1AJKA 1DGLA 2AACA 2FMDA 2EF6A 4DPNA 5KHKA 3VHRA 3UD7A 1W2NA 5A6ZA 1ISZA 1MEC1 2GC1A 2ZA9A 5F2SA 3OEBA 4AAPA 5LA2A 3UGHA 4CP2A 3MLKA 1R8NA 3FZ3A 2BDRA 1W04A 4XFAA 5LK7B 2RM22 2W46A 4CUGA 4P0LA 1AX2A 4W65A 2R6QA 4PJYA 5FP7A 2WS91 4XFSA 3MW2A 2PLV1 4LOTA 3VBFA 3MIHA 3IM6A 4Y5Z0 1DYPA 5C8CB 3T2PA 3BGAA 1LEDA 5FYVA 4OYUA 2OA2A 3VDAA 2FDIA 2PHFA 3SNVA 4C90A 4Q4Y2 1Y4WA 3OD0A 3WY6A 1W0PA 1OLQA 3OPWA 3OGRA 3EF2A 4N9HA 3TEZA 2D24A 4FXGB 3OPTA 1K5JA 3IPVA 1GQPA 1Q5OA 1H2LA 1IRPA 1S55A 4QKBA 5EWSA 4CDQC 4I2SA 3AVRA 1U5IA 1FX5A 1WMFA 1OD3A 4QQLA 3OYWA 1ONKB 2RS31 4RS5C 4M3CE 1LJ7A 4TLGA 3GZAA 5J96B 1FWVA 3BPZA 1FV2A 1TMF3 4CUAA 1F2NA 2W08A 4LBQB 2YV8A 4GH4B 5DAXA 1ALYA 5SV5A 5DUXA 3WW2A 3I8TA 1OOPC 4Y1UA 5BNPA 3BRGC 4TLFA 1X8MA 3B9IA 4LK7A 1TP0A 1B35C 2OZJA 3NNFA 5A7OA 4TZDA 3I2GA 1BMV2 4LO5B 3HWJA 4OQ8A 3IN9A 5GLUA 1COV2 1SCRA 3GYDA 3WV6A 2RSTA 4AQTA 2WYFA 5G00A 1W3GA 1GV9A 3AKQA 3IMMA 3ZXAC 3WD5A 2QQVA 3A7QA 3K3OA 2BBVA 2RDQA 4JHTA 3IAGC 1VRH2 3LAGA 1SPPB 2I74A 4J1WA 3H42B 4XTPA 4A42A 5BNNC 2E32A 4QMAA 5LRSA 4LT5A 2BBAA 3ZSMA 5FZBA 1F35A 5FRAA 3ZFFB 1A8MA 1LU2A 5DZUA 5B4NA 3NKTA 3SH3A 3ZC8A 3FL7A 4RHV3 5CFCA 2RR12 1F4AA 3BRDA 2C24A 3ALQA 2IXKA 1UN1A 4XUOA 4YVWB 2JG9A 3VN4A 4CRQA 1QGLA 2IWGB 2JDNA 4KI5M 5I8SA 1JLXA 2NLRA 3FJFA 4G9MA 4LLFA 1AX1A 1UU6A 4AVTA 3H6SE 5EJ1B 1PM4A 1GICA 4CEWC 4OHZA 4FQZA 4FGFA 1EPWA 4RN5A 4QBVA 3PTRB 1ULFA 2BFUL 2VTXA 3CA3A 3ZFEB 5BY5A 3GGLA 3WUCA 4E27A 3IAPA 4Y5SA 4I0AA 5D62A 2QQLA 1H1IA 3C7OA 4I02A 3PVBB 3ZXEA 2BEBA 5D63A 1KFUL 1TMF1 1HJFA 1H6YA 3FUQA 3IDCB 1IS3A 1W3AA 2VMFA 1VAMA 1RJ7A 4M0HA 5D8AA 4DRRA 3BB2A 1NCQB 3D0JA 3LD8A 2ZGSA 2NPIA 4S2DA 1MD6A 1UOGA 1W8FA 4NHKA 4QXCA 5CKMA 3A22A 3I2IA 3VKFC 2Y34A 1F5JA 2BU9A 4LO6B 4PDWC 1M06G 3WLUA 1N1SA 1TME2 1YWKA 5C33A 2GZBA 1YC61 1VBD2 4QPIC 2ET7A 1VBC1 3PUAA 5DG2A 2IZWA 1BJQA 3GJAA 1CD3G 4A7YA 3LDKA 4NIDA 3MW4A 1MVEA 1C8M3 1G7YA 1GWLA 1VBE3 2YPJA 3AJYA 4BQ5A 4H2AA 1E0OA 3BAHA 2E9QA 2ZGTA 1JI6A 1PO12 2IC1A 8I1BA 1EUTA 3B69A 3POKA 4G1RA 4QPWA 1ND2C 1XXNA 1K42A 1UY1A 2GO2A 4GAFA 1PGW1 4FPEA 4EZ4A 3URFA 1N3QA 1OSGA 1N47A 2XHNA 1FQ9A 2NN8A 5T5PA 5C3QA 2GNBA 3M1HA 3D3AA 3WHUA 4BQ2A 1ISVA 4CDUB 4D6SA 5HPZA 3RG0A 5AFBA 4YGDA 4WVZA 3T0DA 4LJHA 4AFMA 1BBT3 2XKPA 1S0BA 3HOBA 2W2IA 3BTYA 2WDBA 4LOSA 2LW8A 1J3PA 4A2UA 4AI2A 4OEFA 5C71A 2IFWA 3WNMA 3K51A 3WP3A 2WO7A 1Q8VA 4LBMA 1MQTC 2JDPA 5F1RA 2VULA 1DQGA 3ROUA 3MGUA 4UAPA 3VHNA 1KDKA 41BIA 4WM7B 1LHVA 3RI9A 4YSFA 2BVBA 4CU9A 3WX5A 4GXLA 1CIYA 5DAWA 4KGQA 3JBG1 3MLLA 4Z1VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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