4A7ZA

Complex of bifunctional aldos-2-ulose dehydratase with the reaction intermediate ascopyrone m
Total Genus 200
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
200
sequence length
887
structure length
881
Chain Sequence
EQPAALPLFQPQLVQGGRPDGYWVEAFPFRSDSSKCPNIIGYGLGTYDMKSDIQMLVNPYATTNNQSSSWTPVPLAKLDFPVAMHYADITKNGFNDVIITDQYGSSMDDIWAYGGRVSWLENPGELRDNWTMRTIGHSPGMHRLKAGHFTRTDRVQVVAVPIVVASSDLTTPADVIIFTAPDDPRSEQLWQRDVVGTRHLVHEVAIVPAAETDGEMRFDQIILAGRDGVDCLWYDGARWQRHLVGTGLPEERGDPYWGAGSAAVGRVGDDYAGYICSAEAFHGNTVSVYTKPAGSPTGIVRAEWTRHVLDVFGPLNGKHTGSIHQVVCADIDGDGEDEFLVAMMGADPPDFQRTGVWCYKLVDRTNMKFSKTKVSSVSAGRIATANFHSQGSEVDIATISYSVPGYFESPNPSINVFLSTGILAERLDEEVMLRVVRAGSTRFKTEMEFLDVAGKKLTLVVLPPFARLDVERNVSGVKVMAGTVCWADENGKHERVPATRPFGCESMIVSADYLESGEEGAILVLYKPSSTSGRPPFRSMDELVAHNLFPAYVPDSVRAMKFPWVRCADRPWAHGRFKDLDFFNLIGFHVNFADDSAAVLAHVQLWTAGIGVSAGFHNHVEASFCEIHACIANGTGRGGMRWATVPDANFNPDSPNLEDTELIVVPDMHEHGPLWRTRPDGHPLLRMNDTIDYPWHAWLAGAGNPSPQAFDVWVAFEFPGFETFSTPPPPRVLEPGRYAIRFGDPHQTASLALQKNDATDGTPVLALLDLDGGPSPQAWNISHVPGTDMYEIAHAKTGSLVCARWPPVKNQRVAGTHSPAAMGLTSRWAVTKNTKGQITFRLPEAPDHGPLFLSVSAIDAIPVIVQGDSIELSAWSLVPAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Lyase
molecule keywords ALDOS-2-ULOSE DEHYDRATASE
publication title Crystal Structure of Bifunctional Aldos-2-Ulose Dehydratase/Isomerase from Phanerochaete Chrysosporium with the Reaction Intermediate Ascopyrone M.
pubmed doi rcsb
source organism Phanerochaete chrysosporium
total genus 200
structure length 881
sequence length 887
ec nomenclature ec 4.2.1.110: Aldos-2-ulose dehydratase.
pdb deposition date 2011-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18056 PBP3 Penicillin Binding Protein 3 Domain
A PF18637 AUDH_Cupin Aldos-2-ulose dehydratase/isomerase (AUDH) Cupin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.990 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4a7zA02
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4a7zA03
3BRFA 2Q9XA 4R6UB 1AVXB 2L5XA 2NP0A 1TWMA 8I1BA 4LO0C 1HIBA 5FZUA 1DZCA 3HOMA 4Z9WB 4EFQA 5EG6C 1IHKA 2AFGA 1JT3A 2P39A 1IJTA 2HZ9A 5D62A 1BARA 4ZGRB 21BIA 1J0SA 3FJCA 4A7YA 1DJSB 3O44A 4EB2B 3OBRA 4G9MA 4QKSA 3WINC 4QD2B 1FV3A 3B9UA 1BASA 1S0LA 5I1BA 4J2YA 3AKHA 3E8LC 3VUOA 3N7KA 3OGGA 2VLCA 1IRPA 3FJIA 3C9ZA 5JLVA 1Z2VA 4LO2A 2GO2A 1EVTA 4G6JA 2RQ9A 1KNMA 1TOOA 3VWCA 2HWMA 2P23A 4L4HA 3N7LA 1XZZA 4I37A 3RSJA 1AVAC 4OUJA 7I1BA 1DZDA 3JRRA 1QQKA 3VT1A 4QBVA 1Q04A 3V79C 1FN0A 4USPA 3RTJB 1S0FA 4GOYA 3HMYA 1BA7A 2D23A 3P53A 4X37A 2FDBM 3BX1C 3V0BA 1ISWA 4I4PA 4ZBVB 1RZOB 1FV2A 1V6VA 4I4XA 4LO2C 1JLYA 1TTUA 4J2KA 3MALA 2D22A 1V6WA 3I2AA 1PUMB 3AH1A 2FFVA 3BB2A 4IYBA 3VT2A 4I2SA 4I8MA 3CU1B 31BIA 2QYIB 4QBCA 4P0LA 3PG0A 4HJJA 2Y9XE 1W3FA 1YTOA 1G9BA 1CVSA 4J2SA 4LO3A 3BA5A 3O49A 1JT5A 4JP0A 5G00A 4CJMA 1EV2A 3CRGA 4ISQA 1PC8B 1G82A 4F83A 3V0AA 2K8RA 1PZZA 2VXRA 1WBAA 3IAGC 4GOVA 3JUTA 1FMZA 3Q7WA 4I4YA 1YBIA 3RMYA 5JMCA 1Q1UA 3FJJA 1W3AA 3FJ8A 4H04A 3CA6A 1IT0A 3CRIA 4HA2A 1K5UA 3NBEA 3UJ0A 1HWPB 1AXMA 1FWVA 3QR5A 3AJ5A 3O4DA 3UD8A 2XOAA 4II0A 3Q7XA 1F31A 2DRYA 3AKGA 4AN6A 4WBCA 1ILR1 2VSEA 3W9TA 2E4MA 3AJ6A 2D44A 3WA1A 3AZWA 2X2SA 4X39A 4EFRA 2KH2A 4IY9A 4I7IA 3KMVA 1S0GA 3FJ9A 5BXPA 3ZC8A 3BAHA 3V0BB 3A22A 2D43A 4GP3A 4OW4A 5BP5C 3HBWA 3ZX7A 2DS0A 4OWJA 4XKIA 5GAQA 3RTIB 3FUOA 4IHZA 3AZVA 1JTCA 4KEJA 3S8JA 4EEEB 1XYFA 1R8OA 3OBTA 2D24A 1G9DA 4FVVA 4D0TA 4ZOTA 1S0CA 1S0DA 4Q9GA 4ZFUB 3FJAA 4YOLA 3H6RA 2Y9WC 3BTAA 1RG8A 1RY7A 1DQGA 4I1EA 3NBDA 1AF9A 1S0BA 5HPZA 4I6IA 4IZEA 1ISYA 5BQUA 5BXRA 2ET2A 1I1BA 3AKIA 3V0AB 3PHZA 4I4RA 4X3AA 3OGFA 5F8WA 1W3GA 2KI4A 3BADA 4USOA 1Z0HA 3O5WB 3ZXGA 3LTQA 1HCDA 4I4SA 3UJ4A 2HW9A 3IM7A 1ISZA 4Q91A 3CA5A 41BIA 2KI6B 4IY8A 2GZBA 3UDAA 4EKXB 2Z49A 4ENDA 1WD4A 4OEFA 4FGFA 1FMMS 2I1BA 3BAGA 3WO4A 3F62B 1WBCA 3ILAA 3P6IA 4D0ZA 6I1BA 2HWAA 1L2HA 3EF2A 2Y9GA 3BRDA 3IM6A 1R8NA 1NUNA 2WRYA 4LO7B 5BQUC 2NM1A 1E0OA 1GGPB 5EHAA 1M16A 4A7KA 1BLAA 3AH2A 3WMVA 4I0YA 4ZFYB 2F2FA 3N7MA 2NTDA 1ISXA 4IZXA 3PUBA 2NVHA 3P6JA 1DFCA 2Z48A 4P0KA 3BA7A 1AVUA 3FGMA 2RSTA 5DSSB 3CA3A 2D7IA 3I29B 4QC4A 2KKIA 1DLLA 1JQZA 2Q3NB 3PMEA 2K4AB 3H6SE 4X38A 4GAFA 2ERMA 2ZR1B 2F2FC 4GP0A 1BFBA 4JAWA 3WMUA 2ZQNA 2VXTI 5BXTA 3HSMA 1OQLB 1ITBA 2FFUA 5E24E 1DIWA 4J23B 2BEBA 1S0EA 2AXMA 3H6RB 3CRHA 3NBCA 4LO3C 1TFMB 3WO3A 3VSFA 5FZYA 4AN7B 1VCLA 4PC4A 1JLXA 2YUGA 3FUQA 2Y9FA 1BFGA 1IRAX 3N0KA 4I1BA 4P0JA 1FQ9A 4JQ0A 3FJEA 4I4QA 3A21A 5BXSA 3IIRA 1YF8B 3H6QA 1IOBA 1BLDA 1AVWB 2FGFA 3ZC9A 3A07A 4GAIA 4DEPA 2NYYA 3Q7YA 4JKQA 3UD7A 3OJ2A 3F1RA 3ZXDA 4XFUA 4LO0A 2RG9B 4I4OA 3QYDA 5F90A 5F8YA 4KC3A 4OEGA 2M49A 1A8DA 4LO7C 2D7RA 4DCKC 4QO3A 1YXWA 5BVPI 1I1EA 1V6UA 3LLPA 2FO1A 4I4UA 2VUAA 4I4VA 3O4CA 1II4A 1MD6A 3BA4A 4P6AA 2E4MC 4ZLBB 1SZ6B 3UD9A 2ESUA 4LO1A 1EPWA 3FJBA 4F34A 3FJFA 2KLLA 1UPSA 3D7WB 1T4QA 4QKRA 2NZ9A 1P63A 1SR4A 3SNVA 4DENA 4KEKA 2QN4A 3FJKA 4XFSA 3BAVA 4I3NA 1HWOB 2MLLB 3RMXA 1HWNB 1CE7B 5D63A 4IONA 4LO1C 3O4OA 5FNXA 5DZUA 1G9AA 1JY0A 3BAUA 1EYLA 2LIEA 1ABRB 4JPZA 2D20A 2J3PA 1SR4C 1HCEA 3I2XA 2BEAA 3S8KA 3POKA 2ZQOA 1TIEA 4ZA3B 3MPPG 1Z4SA 9ILBA 4Z8SB 3BRGC 1FWUA 1BFFA 2DRZA 5D61A 4OEEA 3OJVA 3NBNA 4QALA 2K43A 1K5VA 3CQAA 1YYNA 1ISVA 1XHBA 2LIQA 3K1XA 3O4BA 4G1RA 1QQLA 2R9KB 3TC2A 3HN1A 4OWKA 1TWEA 3R4SA 2X2TA 5FZZA 3A23A 1G9CA 3VEQA 3WO2A 3VT0A 1PWAA 1TP0A 1XG6A 5BOWA 2D1ZA 4TLPA 4EFPA 4HR6C 3BAQA 1AFCA 1RMLA 3FJDA 2AQZA 3VSZA 4G9NA 4XFTA 3O4AA 2F8XC 2MC2A 3N7JA 4ISRA 4Q9PA 1Q03A 5DUYA 1WD3A 3CA4A 4JKXB 1T9FA 1HKNA 1M2TB 3CA1A 1NZKA 3IM5A 4KBBA 4G6MA 1FGAA 1MC9A 3HALA 1N4KA 3OJMA 4QD2C 3R4UA 1BFCA 3CA0A 1QXMA 2DREA 2VU9A 1JT7A 3O3QA 4LO8B 5EC5A 4ZKTB 3CAHA 4IQPA 4A7ZA 2IHOA 4JRAA 1DQOA 2WBCA 1DFQA 1ONKB 2BFHA 4OWLA 5B2HA 3FJHA 5DVHA 1IILA 1D0HA 2AAIB 1JT4A 2VSAA 4KEIA 5BP5A 4J2XA 2IWTB 5F8SA 2UUSA 3NJ5A 4I96A 3AH4A 5FNWA 4ZFWB 3AKFA 4D8HA 4H9WA 2MIBA 3BAOA 3WINA 3FFZA 3T8SA 4L4IA 1PUUB 1HWMB 1V6XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4K9SA 3OSDA 3BRFA 2BZDA 3VKFC 5FZ7A 2TEPA 3ZFFA 4LK6A 3WF1A 1XC6A 1DG6A 1FYUA 2L5XA 4GWJA 2WAAA 5FZUA 2AACA 1BVP1 2QQMA 5FYUA 3KHCA 1AUYA 3B9CA 3LPGA 3VHOA 1VMHA 3CZJA 1SPPA 3CF6E 2AFGA 2XL7A 3KF3A 4LPLA 1IKPA 1E5IA 1IJTA 4OULA 2RS13 1BARA 1W8WA 2BUKA 2P4EA 3R0RA 4ASLA 1W3VA 1XXNA 3IBMA 2P3JA 3KGZA 2YUEA 1MVQA 1GZWB 4LJHA 5FZEA 4EB2B 1QIQA 1VBE2 1ZZ7A 2D6PA 4XHBA 5FZBA 1DP0A 4YLZA 1AXKA 3M3EA 3B9UA 1V00A 3ZLIA 4ATFA 1S0LA 4MZFB 2WZPP 2QQIA 4ONUA 3LA2A 4CEYA 1GZCA 3VUOA 4KG0A 1EUTA 2VLCA 1PM7A 2GC0A 4FTSA 3FJIA 3C9ZA 2J7MA 1WLWA 2X8KA 5FUIA 5LBEA 2D7FA 4OHYA 2P17A 5A3PA 2P6CA 4SBVA 5FKCA 3MDPA 2PHFA 1KNMA 2ENRA 2NPIA 3AK0A 1C8M1 3N7LA 3N9OA 2DTWA 5FZOA 4NPLA 1X8EA 4AWDA 1H9PA 1FAYA 1WCSA 3P3NA 3LQCA 3NNGA 1H6XA 4HL0A 4L97A 4Q4W2 4QPIB 3KV5A 4UY4A 4YZ4A 3V79C 4GOYA 5FP9A 4ZONA 3AVSA 5GZFA 3AKSA 4E4SA 5LA1A 2D23A 3OEBA 4N53B 4X37A 2RMU1 1JUIA 4JTOA 1GP4A 1BXHA 1Q8OA 2Y6GA 3L9JT 5JAXA 3NRUA 4FCAA 1ULGA 3ZXAC 4XJ8A 3FX3A 3VKMA 4ZBVB 3ME2A 1YO8A 1W9YA 2XGXA 3VBUA 1LOBA 1G8WA 1R64A 2YU2A 1LOCA 1Q5OA 5FCCA 4J2KA 3VZNA 3ZXEA 2D22A 2VG9A 5F6KA 4XFBA 1PUMB 1ZBE3 2HWD3 2EA7A 5JR7B 1GMMA 3H8OA 3MW2A 1RUE3 2GNBA 5A6QA 3VT2A 2JICA 4CTEA 1ZRRA 4QX1A 1TME3 1POQA 2C9AA 4I8MA 3CU1B 5ACA2 4DINB 1OVPA 1A6CA 1QJX2 4C91A 5A3NA 1PM4A 1RUC2 4W6YA 5E6HA 5JSRA 3OB8A 1V6NA 3VKNA 3KM5A 4AFBA 2FQPA 4JQTA 4Y5TA 2UWAA 2ZMLA 5DXDA 4J2SA 4LO3A 2EIDA 4MXWB 5LA9A 1UNBA 2W52A 5FO8B 4YW2A 5A3MA 5G00A 4CJMA 1LU2A 4G4FA 1JYNA 1OQ1A 2MHFA 4ISQA 3NJZA 2A71A 3ES4A 3GF6A 4WVWA 1FPN3 5GZDA 1U5YA 4RN5A 3K3OA 3ACFA 3MEPA 3VKLA 2ZHMA 4LBJA 4Y3OA 4CP9B 5JMCA 3VBSB 4LHLA 4CDXA 1HB1A 3UJQA 3DYMA 3GGLA 4XJAA 3FJJA 3VDAA 1FNZA 1TNFA 3I3QA 3MICA 3WDUA 3ZFEA 2CYFA 3OD4A 1F5JA 3MIFA 1ZVFA 5FZ4A 2C0ZA 1IS6A 1J3QA 1VALA 1DQ2A 2B7YA 2RV9A 5FKBA 1IT0A 1K5UA 1LHUA 2XBO1 5GM0A 3NBEA 4M3CB 2OX0A 4LO7A 5IVEA 3QR5A 1ZNPA 4LULA 4QB6A 4BQ4A 4Z2WA 2P5BA 2JDKA 4QWNA 3IN9A 4XW3A 1EPZA 2G19A 2LW8A 2FZ1A 1UZZA 2RHPA 2R0HA 3H3UA 4LLFA 4RD7A 4BXSV 5C6CA 4SLIA 5IFPA 1QH7A 1LGCA 3AKGA 4AN6A 2WQ4A 1GFF2 1ILR1 2VSEA 2BP6A 1O5UA 1JH5A 3HQXA 2XB6C 2DCJA 4LBOA 4RSUA 1QHDA 2E53A 2JG8B 4CDXC 4BQXA 3WT3A 4Q4W3 5CU1A 5BNQA 1TMF2 2IXJA 5HBAA 3ZFEC 5CG9A 1RMU2 1IPKA 4R52A 3ZYGA 1BEV2 3ZN6A 2W1QA 4BYYA 4I7IA 2AC1A 4XDOA 3VD7A 4CCDA 1XYPA 4LO4B 1AL0G 5EWSA 3FJ9A 5BXPA 4MHRA 1ULPA 5FXXA 1AYM1 1LODA 4LBMA 1UWWA 2QZ2A 2GN3A 1V6MA 2KD7A 1NXMA 1PO12 1WW4A 3ZX7A 1RUF1 3HBWA 2BOJA 5BNNB 4HG6B 3O1PA 4AGGA 2J1UA 1XYFA 4AW7A 2HWC2 1NLSA 3Q9OA 1G9DA 3VV1A 2LS6A 5A7OA 1W8NA 2C6SA 3A7QA 4XIKA 3ZMNA 1S0DA 5BYNA 4ZFUB 3DCQA 3I2GA 1WA6X 3H6RA 2WNVA 4RQPB 4XJWA 5ACA3 2QYIB 3ILFA 4JHTA 5LEJA 2MEV1 2G9ZA 5E8AA 1DQGA 1DU3D 4PLOA 1YRZA 2R0FA 4I1EA 4JHZA 4NOTA 1Z7S1 3ZSEA 3NBDA 3WR0A 2BWCA 1UO9A 1HDKA 3GZTB 3BIEA 2E6VA 3EYPA 4EQVA 3GHNA 3HBKA 4D7TA 2E7AA 4GKXA 5AFEA 1W2AX 4KH9A 4IZEA 5A33A 5FJHA 4M01A 5BQUA 5BXRA 1K45A 1W99A 3GBGA 3ES1A 3M2MA 2E32A 5IK7A 5IW0A 1I1BA 1ENXA 4NIAA 2DUPA 5A80A 4BM8A 3I8TA 4IXLA 1YI9A 1R082 1UYZA 2JG8A 5EQUA 5K4LA 2WLPA 3SEPA 1Q43A 3ZXGA 2D98A 4FAGA 2ILMA 2VO5A 2IVJA 5A7PA 3UJ4A 4CU9A 5FZ3A 3TEWA 3IM7A 1VBA1 2WNVC 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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