4F83A

Crystal structure of the receptor binding domain of botulinum neurotoxin mosaic serotype c/d with a tetraethylene glycol molecule bound on the hcn sub-domain and a sulfate ion at the putative active site
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
416
structure length
413
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNALVDTSGYNAEVRLEGDVQVNTIYTNDFKLSSSGDKIIVNLNNNILYYENSSVSFWIKISKDLTNSHNEYTIINSIKQNSGWKLCIRNGNIEWILQDINRKYKSLIFDYSESLSHTGYTNKWFFVTITNNIMGYMKLYINGELKQSERIEDLDEVKLDKTIVFGIDENIDENQMLWIRDFNIFSKELSNEDINIVYEGQILRNVIKDYWGNPLKFDTEYYMINYNYIDRYIAPKNNILVLVQYSDISKLYTKNPITIKSAANKNPYSRILNGDDIMFHMLYDSREYMIIRDTDTIYATQGGQCSKNCVYALKLQSNLGNYGIGIFSIKNIVSQNKYCSQIFSSFMKNTMLLADIYKPWRFSFENAYTPVAVTNYETKLLSTSSFWKFISRDPGWVEHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural insights into the functional role of the Hcn sub-domain of the receptor-binding domain of the botulinum neurotoxin mosaic serotype C/D.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type C neurotoxin
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 109
structure length 413
sequence length 416
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4f83A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4f83A02
4JKXB 1CE7B 4CZSA 1FNYA 2DVAA 1ENSA 3RQ0A 1S0IA 1TWEA 3OJBA 4AN7B 1LECA 1Z0HA 2ZMNA 2AGSA 2B7YA 5JVVA 1Z2VA 2A71A 1T9FA 4CJMA 4XTMA 2ZMKA 5E88A 4YFZA 4H9WA 1GZ9A 3CRIA 4JQ0A 3HBWA 3AZVA 3QLQA 5H9RA 4LO8B 4ZGRB 5CBLA 4PF5A 5G00A 3R05A 3MW3A 1DQ0A 1I3HA 5D63A 1N1YA 4OEFA 3H6QA 4EKXB 2HWMA 3OJVA 1V6IA 4FPJA 3M3OA 1SLIA 4PBOA 4YM3A 2A5ZA 3I8TA 2D3RA 1QU0A 4XE9A 1UZYA 1MS3A 1GZCA 3CQAA 3UDAA 1H9WA 4UW4A 3IPVA 2NM1A 3TAYA 1KQRA 4RA0A 4FOQA 1C1LA 3AH4A 4LO1C 5FRAA 1G9CA 2GZBA 4Q26A 3MALA 4I4OA 4FPEA 4EFRA 4X38A 2NVHA 2A75A 5DG1A 1AF9A 1QDCA 1ONKB 4OWLA 2WRYA 1W6NB 4TZDA 2ZHMA 31BIA 1IJTA 4L4HA 5GJ6A 4P9YA 2DUQA 4GP0A 1S0DA 2VSAA 5CB7A 1ISYA 1H9PA 3BRFA 4I2SA 3PUBA 1N1VA 3B01A 3NV1A 1WD3A 3KQRA 5T54A 3OBRA 1DZQA 1LOAA 4I4VA 3V0BA 3WCRA 2PHFA 3AJYA 2JD4A 3USUB 1V6WA 1L2HA 1GNZA 3VEQA 4L8QA 5FNXA 5HCFA 3IN9A 1FWVA 3O3QA 4XIOA 2GNBA 3T1MA 4GKXA 1V6UA 3BB2A 4J2KA 4XILA 1JYIA 3BRGC 4CTEA 2FFUA 4XIKA 2E6VA 4BQ1A 3O4CA 1EYLA 1N3OA 2F2FC 4P0KA 5GLVA 4YG6A 4M01A 3BAOA 4OWJA 1FYUA 1YIFA 3VKFC 2WSVA 1RMLA 4J2SA 1J1TA 1GZWB 3WMVA 4XYXA 1G9DA 4J2XA 2DS0A 1ZM1A 5DSSB 3AH2A 2OUJA 3GNEA 3H6RB 3V79C 3N3HA 1ISVA 3VSFA 1QNWA 3A22A 1OFSA 1DQ4A 2P23A 3ZSKA 1LU1A 4XJ8A 4YGCA 1G82A 2D6OX 4G1RA 4XXAA 4ZFUB 1D0HA 5GLUA 1KITA 3TB0A 5F8WA 4YGBA 4KEJA 3ILRA 3QCWA 1AVXB 1RZOB 1LOCA 3WG2A 1GYKA 1N3QA 3O0XA 3CA5A 3RRDA 2GN3A 2YZ4A 2P37A 3PVNA 1DLLA 4G6MA 2OVUA 3UD7A 1MD6A 4LO2A 4I8MA 3R4UA 3AYEA 1N4KA 3O44A 4LO7C 1JY0A 1PZZA 3LTQA 1II4A 3AXEA 3SH3A 2VXRA 4XJUA 3D7WB 4FGFA 3M1HA 4PC4A 5BP5A 1EV2A 2R1BA 5SV8A 3WHUA 2GALA 2CY6A 1AX1A 2G4IA 1MR5A 4I1EA 3SH5A 1BKZA 1PC8B 2Q9XA 3NJ5A 2WQZC 2FGFA 2VXTI 1RG8A 4EB2B 2DUPA 3ZXKA 4LO0C 1JT4A 4P9WA 5FZYA 4XHBA 5F5QA 3VKMA 4XDQA 3UJ0A 1CPNA 1GSLA 3A23A 5IK8A 1DQGA 1AVWB 3D6EA 3AX4A 1FX5A 3LSEA 1DQ2A 4K1ZA 5BQUC 2PHUA 4KC3A 1SR4A 4JCKA 4RL7A 4Z9WB 3BX1C 1S0CA 3UJOA 1UX6A 2TEPA 1APNA 4OW4A 4R9AA 4ZLBB 4USOA 2VSEA 1C4RA 2ZGTA 4FPFA 1SLLA 4LBQB 4XBQA 4LBOA 2P34A 3HN1A 4QBCA 4ITCA 3NV3A 1QF3A 3FJ9A 1HCDA 3R4SA 3OYWB 3CAHA 2DUOA 3CRGA 2RHPA 1Z78A 1LOBA 4IHZA 1IKPA 2V5YA 3WMUA 3BAQA 1S0EA 3POWA 1W6MA 1M16A 2VW2A 2DYCA 4I3NA 2C5DA 3IPVB 2D3PA 3B9CA 2Z48A 4G6JA 1F5FA 3SNVA 1U0AA 5KXDA 1YXWA 2ZACA 3F62B 5AVAA 2AXMA 2YY1A 5IUQA 2GNMA 4XJZA 3H6RA 2D24A 3T1LA 4GA9A 3BOPA 1W6OB 1AVAC 1SCRA 4EFQA 1LJ7A 3WZ1A 3WG4A 3ZC9A 1HWPB 3ENRA 4IQPA 2K4AB 3POSA 3VT1A 1Z4SA 2X2TA 3N7KA 3MEPA 4WVVA 3WINA 3ZXDA 2AQZA 4NO4A 4Q27A 1QNYA 1IS5A 4LO3A 4ZOTA 2BEBA 4FPCA 4XMAA 4GAIA 4I1BA 1N47A 5GALA 2GN7A 1LOFC 3O5WB 4DCKC 1RY7A 5DZUA 4Q8LA 3M3EA 3MW2A 4U36A 4IZXA 4YM2A 1CN1A 5BXPA 2OW4A 4NOTA 1MS5A 1QQLA 1CVNA 1YI7A 3WG3A 1OKQA 4P0JA 2GMEA 4FQ4A 5DUXA 4USPA 3HOMA 1YTOA 1UAIA 4BMEA 1HCEA 3MPPG 2DU0A 3WVJA 3CA1A 1Q8SA 1S0LA 2A6ZA 1HWOB 2KM2A 2AR6A 1JUIA 3VV1A 3FJFA 3O49A 2QYIB 1DIWA 1MZ6A 2LALA 2UU8A 4XMIA 4PQ9A 3I4IA 2R0HA 1JLYA 3GALA 2FHRA 4I4XA 3AYCA 1B09A 3IM0A 4YW1A 2EAKA 4I4QA 5HCBA 2ZGNA 3N7LA 4BOWA 3SISA 1KJLA 3IIRA 4OWKA 5BVPI 4LBNA 1ULCA 4P9XA 4FOWA 1SLTA 4XXPA 1IKQA 4M3CA 5IK5A 1TP0A 4QC4A 1V6VA 1RITA 1HLCA 4H04A 5T5LA 5F8YA 2A6XA 4P0LA 3BAGA 1W6PB 2MLLB 5BXTA 4XBNA 3AZZA 5T55A 1Q56A 1K5UA 4Q91A 1BLDA 2UWBA 4K1YA 1MZ5A 4LBQA 1J0SA 1JYCA 2ZMLA 3M3QA 1CPMA 1A78A 2CWSA 4LO1A 4R6UB 3B9UA 4ZXKA 4KBBA 3AP7A 4YGEA 1BFCA 3N0KA 1NXD1 1T4QA 2HW9A 3OYWA 1ISXA 1FNZA 4BPZA 4YZ5A 2ENRA 2ES3A 2HYKA 2ARBA 3OJ2A 1W0OA 1QOOA 1KDKA 3PG0A 3N7JA 2D7IA 2DRYA 1SBDA 4G9NA 4PCRA 1ULEA 1AZDA 2A3XA 4GKYA 2ZGKA 1MVEA 1A3KA 3FGMA 4II0A 4R9DA 5EXOA 3UK9A 3AZWA 3O4AA 3RG0A 1QDOA 4Y1VA 3VKOA 1URXA 1LGCA 1W6OA 4YFWA 5F8SA 1JLXA 3P6JA 3FJEA 4XFUA 4DPNA 1MC9A 4JC1A 1K5VA 2YXSA 4SLIA 3H0OA 3SLIA 3O0WA 5DZFA 4YZ4A 2Y9XE 3FJCA 2EXHA 5D61A 4Y20A 5GZGA 3OGFA 2LTNA 5CAZA 1R8NA 5GZEA 1V6MA 1CVSA 3KM5A 4FOYA 4AGGA 3AP4A 1LENA 4IZEA 3N7MA 1MS4A 1GLHA 4R9CA 5GLTA 2CYFA 4P6AA 3H6SE 5T50A 1TIEA 2ZQNA 5L73A 2NMOA 2ESUA 3AFKA 1PWAA 4LBMA 2AAIB 2LIQA 1FAYA 5FNWA 2C9AA 1W6MB 4XHXA 1W6QA 4ZKTB 4GWMA 1FMMS 5IK4A 4FVVA 2DTYA 4ZFWB 3E8LC 5H9SA 1SBEA 5CA6A 3HALA 4D69A 3DGTA 3I2XA 3OJMA 1GKBA 3IM6A 3B69A 5GZFA 1VIWB 3ZSLA 2DREA 2JECA 5FZUA 2NN8A 5IT6A 2YUGA 1VCLA 4YW4A 1LTEA 3ZXJA 1XQNA 3RS6A 2A3YA 2FO1A 4ISRA 1W3FA 3WUDA 4K21A 1S0GA 3O4DA 1WBFA 3OY8A 4J2YA 2EF6A 1HDKA 1LU2A 3ZYPA 3BA4A 3VSZA 1YRZA 1W6PA 1QKQA 1ISWA 1BA7A 1JW6A 3PMEA 2HZ9A 3ZSJA 1ABRB 4F83A 2A6VA 3P6IA 3JUUA 3CA3A 4LO0A 1DFQA 3HMYA 4OUJA 4HA2A 4J23B 1DYKA 3OGGA 7I1BA 1PZ9A 1R8OA 1I1BA 1HIBA 2P3IA 1WW7A 4FQZA 2DVDA 2JKBA 2QN4A 3W9TA 1WCSA 1Q8PA 5EHAA 3CRHA 1DZCA 3BIWE 4YZ1A 4Y24A 4D8HA 2ZA9A 1F9KA 3AP9A 1MS0A 4XKIA 4QD2B 2E53A 3UD8A 1BFBA 1SACA 2E4MC 3ASIA 3VT2A 1AFCA 1G8WA 4ENDA 4I4YA 1YYNA 2YMZA 3WOGA 4LBQD 1HQWA 1GICA 2D6NA 1LHOA 2PHXA 4FPOB 2FDBM 3RTIB 1DQ6A 1PZ7A 4HANA 2ZGSA 2VU9A 3WDYA 1CIWA 4W65A 1GNHA 5LK5A 1IS3A 2A3WA 2D22A 4QALA 2V73A 5DG2A 2RQ9A 2VH9A 4LO2C 1AX2A 4M3CB 3WLUA 1A8DA 1M2TB 2BFHA 4I4RA 3V65A 4FP3A 3ZX7A 3CNAA 1SBFA 2Y9FA 3AZYA 5BP5C 1FMZA 4Y1UA 1XHBA 4D0TA 1G86A 2YROA 3POKA 3CA4A 2WT2A 4BM8A 2FFVA 4OZXA 4ZA3B 3O4BA 5CNAA 5T5JA 4DS0A 1BQPA 4GOVA 3WHTA 3AKFA 4GXLA 1MVQA 2EXIA 4YM0A 3ZXFA 1LESA 1D2SA 2PELA 1S1AA 1IOAA 3ZXLA 1SLBA 5DUUA 4X37A 4D0ZA 4YM1A 4Y26A 3AXDA 2DWRA 3AYAA 3IKWA 1E0OA 2X2SA 1W0PA 1N1TA 3LCPA 1ONAA 2ZHLA 1SR4C 3AJ5A 4JAWA 2WBCA 4Q2FA 1AXMA 3Q7YA 1DGLA 4XZPA 1LOFA 5EYXA 1BFFA 3WO4A 2ARXA 2VLCA 1WW5A 1QGLA 4QO3A 5GM0A 3TC2A 3VUOA 3NWKA 2R49A 1QMJA 2LIEA 3A0NA 3WUCA 4FOVA 4C1XA 2D6KA 4Q1PA 4A7YA 3IAGC 2YV8A 2PHWA 3PHZA 4AN6A 3RSJA 2DVBA 5E24E 1BASA 2OUHA 1TOOA 4A7ZA 3BODA 4Y20B 3JUTA 4HL0A 3O4OA 3ZXGA 1LEMA 1SLAA 2ET2A 1QXMA 2D43A 2WKKA 5FZZA 4XJAA 2E7QA 3A0KA 3WCSA 4Z8SB 3A21A 3WO3A 5DUYA 2W08A 4XOGA 1Y7BA 1UN1A 4UW5A 1W3GA 1WLDA 3WO2A 2GMMA 2W68A 4BLIA 3IM5A 4BMBA 2CWMA 2VY0A 1ISZA 2XB6C 3P53A 4TLPA 5BXRA 1ULFA 1G9FA 1HKNA 3VWCA 1GBGA 2J3PA 5DUWA 2ZGLA 4YG0A 1HQLA 1F31A 1W6QB 1DQOA 1MACA 1Q04A 1GV9A 3JU9A 2UURA 2XG3A 2JJ6A 3Q7XA 4I37A 2GMPA 3K1XA 1V6NA 2ZKNA 2D1ZA 3O12A 4JRAA 1DHKB 1X50A 2A6YA 1WW4A 2KLLA 2IHOA 4LO3C 1VAMA 4ZFYB 2DV9A 2UWAA 2EALA 2P39A 1FWUA 1LHNA 3NBEA 4LO7B 2NTDA 5FREA 3AZXA 3NBNA 1SLCA 1ULGA 1WLWA 1WLCA 1LHWA 1OQLB 3ZC8A 4YGDA 4DQAA 2JE9A 4M00A 3OY8B 2D7FA 5E89A 1QOTA 3INAA 1Q03A 3FJAA 1ULDA 3V0AA 2I1BA 2VW0A 2UUSA 5HCAA 2CL2A 1SFYA 3IMNA 1AVUA 2CNAA 3FJDA 1CONA 2GDFA 2ZGUA 2EIGA 1UMZA 1KRIA 1V6KA 2SBAA 4YW2A 1WUVA 1LGNA 2ZGOA 2NP0A 4FPLA 1FV3A 3WDTA 1WD4A 3RMXA 3EF2A 2D6PA 2Y9GA 4TYSA 2BEAA 2KKIA 4AWDA 3Q9OA 2BQPA 4KEIA 1WBCA 3W58A 2ZZJA 4I6IA 5EYYA 2EXJA 3POYA 3FJ8A 1AXKA 4FP2A 3AK0A 4AVSA 2DU1A 1FATA 5IK7A 1JOJA 4FPKA 4ISQA 5KXCA 3QYDA 5I1BA 1QOSA 2M49A 2ZR1B 4IYBA 2ERFA 1EVTA 1LHVA 4UW6A 4Y1ZA 2ZAAA 1ILR1 1DJSB 1BZWA 3RTJB 1PUUB 4DRRA 3WNXA 1ITBA 4MYEA 5GZCA 3B00A 3FFZA 2W52A 3LSDA 5H9PA 4WZFA 1TWMA 1V6OA 1JTCA 3ZPYA 4AYUA 1BLAA 1DQ5A 2D7RA 3WDUA 1WBAA 2AFGA 4YW5A 2W39A 3NV4A 3FJHA 1V6LA 3VT0A 2SLIA 3CU1B 2DVGA 2R16A 4ASMB 3S8KA 3VKLA 3MW4A 2P3KA 1R1ZA 3M2MA 1NLSA 3UD9A 2R0FA 1CJPA 2F2FA 1H30A 1ENRA 4AGRA 1JN2P 4H55A 5BXSA 2MC2A 4LBLA 3ATGA 3SITA 2DVFA 1JT5A 3RMYA 4Q9PA 4DEPA 2ZGRA 1BXHA 2F8XC 2R9KB 4Q1RA 1XYFA 3SH4A 4DRVA 1GANA 2A6WA 3AYDA 1G9AA 3V64A 3AJZA 3AJ6A 1FV2A 3JRRA 4QBVA 3PVEA 2UWCA 2XOAA 4XTPA 2D44A 3ILNA 1AJKA 1V00A 5EC5A 3CA6A 2GNTA 4QKSA 4I7IA 1QQKA 2WSUA 4Q8KA 1IILA 3L2YA 2DURA 1XZZA 3BAVA 1PZ8A 1I1EA 3KMVA 1VLNA 1YF8B 4GP3A 4Y22A 1AX0A 2I2SA 1KJRA 3PJQA 3ILAA 1O4ZA 4I0YA 4M3CE 1P63A 1G7YA 5F9TA 3M3CA 2D6MA 1FGAA 5T5PA 3WG1A 1KDMA 1BARA 2K43A 2Q5TA 4BLJA 3BTAA 3F1RA 1VALA 2E51A 3Q7WA 2A70A 4JKQA 1MS8A 4I96A 5F90A 2AH2A 2KI4A 6I1BA 1LGBA 1NUNA 3FUOA 2E4MA 2WJSA 4PBPA 4YG3A 3DUIA 4I4PA 3D4KA 2R1DA 4I30A 1JT3A 4GWNA 3UJ4A 2FMDA 3FLPA 4YZ2A 4L4IA 4IY9A 3A4UA 2GNDA 1SZ6B 4GALA 3WDXA 2Y9WC 2ZBJA 1OQ1A 1JQZA 4DFSA 3APBA 8I1BA 1JBCA 5BQUA 4X39A 1LODA 4WV8A 3O5SA 2KH2A 3C2UA 3ZYRA 4XFSA 5KXEA 1IHKA 1S0JA 1G9BA 1DYPA 1KNMA 1UL9A 1FQ9A 3FBYA 5DXDA 3AKHA 5KXBA 5DVHA 4XJWA 1TFMB 2ZQOA 2WNEA 2L5XA 3HSMA 5D62A 3ZSMA 1UPSA 1N1SA 1IOBA 3S8JA 5T52A 3PVOA 2AYHA 4C1WA 2IWTB 1UKGA 1LOGA 2KI6B 2AUYA 4DENA 4Y1XA 1O4YA 1JXNA 2JDZA 2Z49A 4G9MA 5EWSA 4OEGA 1Q8OA 1WBLA 3NBCA 3A07A 3ZVXA 1YBIA 1EPWA 3OBTA 2NMNA 3FJIA 1V6XA 5T5OA 1TEIA 4AGVA 2ZHKA 2VW1A 3HR9A 3T2TA 3UL2A 3WDVA 3V0AB 1LHUA 4XFTA 1DFCA 1DZDA 3I29B 3FJKA 4ZBVB 1AJOA 1S0BA 1W6NA 4Z8BA 1BFGA 1IS4A 3OPZA 1IRPA 1XG6A 9ILBA 1LULA 2CTVA 2WT1A 4GAFA 2D23A 4M3CF 1FN0A 1N3PA 2JE7A 3N36A 3VKNA 2AENA 4Y1YA 2D3SA 4OEEA 3IM7A 2MIBA 1BJQA 1C1FA 2WLQA 3USUA 4K20A 3C9ZA 1AXYA 5JDBA 4QKRA 1Q1UA 1DQ1A 2D6LX 3FLTA 2DTWA 5DZEA 2ERMA 2RG9B 5HPZA 2E7TA 2K8RA 5GAQA 4WBCA 2HWAA 1S0FA 1JT7A 5DUVA 4YLZA 1WW6A 1YO8A 1CQ9A 1CESA 4AVTA 2EXKA 3T8SA 1HKDA 3NV2A 3O0VA 2Z42A 1DBNA 5JOXA 3QR5A 2PHRA 5BYNA 1LCLA 1GZWA 2ZHNA 4HR6C 4I4SA 1PUMB 3AP5A 2DRZA 4LBKA 3D5OA 2ZGPA 4UW3A 5JOWA 3ZXEA 4HJJA 1VAVA 5BOWA 41BIA 4CRQA 2D20A 2H0BA 5JMCA 1HWMB 4IONA 3N35A 4XBLA 3U4XA 4EEEB 2P2KA 1JHNA 3FJJA 2NYYA 1IS6A 1TTUA 1HWNB 3WV6A 5GZDA 1V6JA 1UZZA 4A7KA 1SCSA 2AREA 4FPYA 3B3QE 2GO2A 4Q9GA 4R9BA 3V0BB 3BAHA 5JOZA 4P14A 3WDWA 4YOLA 1C57A 2VUAA 1LEDA 3BA5A 2WT0A 5E8AA 1GGPB 4KEKA 3NBDA 3BADA 4U2AA 4ATEA 1AVBA 1AXZA 21BIA 3WINC 4Y22B 2NZ9A 1IT0A 4FPHA 3FJBA 2PHTA 1RINA 1RIRA 4GOYA 5EG6C 3ILFA 1BYHA 3AKIA 3AH1A 4YZ3A 4I4UA 2Q3NB 3FLRA 2ZGMA 1ENQA 2A7AA 5GLZA 3LLPA 4XJ9A 2RSTA 2P3JA 3FUQA 4WVWA 3SNMA 4ATFA 3W59A 5H9QA 4X3AA 3UJQA 3AP6A 1MS9A 1MS1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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